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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI027606 | Chr3 | 25426550 | 25431356 | + | Transcription factor MYB1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI027606.m1 | 46 | 92 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 48.7 | 6.80E-13 |
LITCHI027606.m1 | 49 | 106 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 47.5 | 1.70E-12 |
LITCHI027606.m1 | 98 | 142 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 56.7 | 2.20E-15 |
LITCHI027606.m1 | 101 | 146 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 35.1 | 1.30E-08 |
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>LITCHI027606.m1 ATGAACGAGAACGGTGACAGAGAAGAAGATAACGGTAACGGTGACGGTGAGGCGGCGGCG GCGGCAGAGGCGGTAGTAGTGGAGGAGGAGTCTGCCGGTGGTGGTGGTGGTAGTCGGAAT GGTAACAGTAGAGTGAAGGGGCCGTGGTCGCCGGAGGAGGACTCGGTGCTGAGTCGGTTG GTGAGTCAGTTCGGGGCGAGGAACTGGGGGATGATCGCGCGAGGAATTCCAGGTCGGTCG GGGAAATCGTGCCGACTCCGGTGGTGTAATCAGCTCGACCCTTGCCTCAAGCGCAAGCCT TTCACTGAAGAAGAAGATCGTATCATAATTGCGGCCCATCAAGTCCACGGGAACAAATGG GCAGCAATTGCAAGACTCCTGCCAGGCAGAACAGATAATGCGATCAAGAACCATTGGAAC TCTACTCTAAGGCGCAGATATATGACACTAGGGAGGTTTAACCCAGGGCCCAGCAACATG ATGGAAGATGGGAGGTTTAACCCAGGGCCTAGCAACATAATGGAAGATGGGAGCCTTGAC AGAACAAAAGCATCCTCAGAAGAGACCCTATCTGTTGGAGATGTTAATTCCTTCAAGCCA TCAGAAGCAGGAGATACCATGATGGATGATAGACACAACCAGCTTGAAGATATAGTTCAC TCTGCTTCTGGACCACAACAGCCTCCTTCCATTTCATGTCTGGTAGGCGATATCAATTCA ATGAAGCCCTCAGAACAAAGAGATGTCAGGATGGATGACAGAATTAACCAACATGAAGAC ATATCTCAAAGAAAAGAAATTGAATTTGCTGCTGCAGCAAGGCCACGTCCTACACTTTCA CGTCCAGTTGCACGTGTTAGTGCTTTTAGTGTTTATAACCCCCTGGGTAGCACAGCTATC GGTTCTGGAATTCCAAGGACAACCCCAACTCGACCTTTGGTTCAAGCATTTGGACCAGAC TCTGGAATCTTCAAATTCCTAGAAGATGATAATAGTGACCCCATTATTCCTTCACGATGT GGGTATGGTTGCTGTGCTTCTATATCAGGACATTATTCACATAACTCGTTATTGGGACCT GAATTCATTGACCATGAGGAGTCACCTACTTTCTCTAGTCATGAATTGATTTCCATAGCT ACAGATTTGAACAACATTGCATGGATTAAGAGTGGCCTTAAAAATAGCAGCACCAGCCAA CCAGACAATGCAGCAAACCAGAGAATGTCTCATGTAACTGCTGCTGGTGCACAAATGGGA ATACCAGAACCAAGTGTGAGGAAAGATATGCGATTTGAAGATGGACGAAACAAGTTCATA GGGATGATGAACGATGTTATATCCTCCCAGGTACCCAGACAAACTTTTGCAATGCGAGCT GAAGTCGAGAGTTTGAGCTAA
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>LITCHI027606.m1 MNENGDREEDNGNGDGEAAAAAEAVVVEEESAGGGGGSRNGNSRVKGPWSPEEDSVLSRL VSQFGARNWGMIARGIPGRSGKSCRLRWCNQLDPCLKRKPFTEEEDRIIIAAHQVHGNKW AAIARLLPGRTDNAIKNHWNSTLRRRYMTLGRFNPGPSNMMEDGRFNPGPSNIMEDGSLD RTKASSEETLSVGDVNSFKPSEAGDTMMDDRHNQLEDIVHSASGPQQPPSISCLVGDINS MKPSEQRDVRMDDRINQHEDISQRKEIEFAAAARPRPTLSRPVARVSAFSVYNPLGSTAI GSGIPRTTPTRPLVQAFGPDSGIFKFLEDDNSDPIIPSRCGYGCCASISGHYSHNSLLGP EFIDHEESPTFSSHELISIATDLNNIAWIKSGLKNSSTSQPDNAANQRMSHVTAAGAQMG IPEPSVRKDMRFEDGRNKFIGMMNDVISSQVPRQTFAMRAEVESLS.
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>LITCHI027606.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCATCAAATGCTAACCACTGCAAGCTTGTTGCTAATGATCCGGTCATCCTCACCCCATAT GATAAGTGTCTTCTGCTGCACCTGCAGAGCATATCAGTAAGTAGCTTGAAAAAGAGAATC AATATTTCTGAAATTTAATTGGAAACTTGGACTAGACTGAAAATCATGTTAACACAATAT AATTACAGCTGCTGAAAGAACTACATAAAAAATTTCAAACAATTTTCTTTGAGTATATCA TGAAGAAAAATTCAAGTCCAGATGATTTTCACCAACATGTACACAGACATGAACGACTAC AACTTTTTTAAACTTCAAAAACTTTACTTGCTTAAACCCTTTTTCTGGATAATGTACTTC AGTTTATCATATGCTCATATGTGTGTATGTATTGCAAGGCGAACTTTCTAATTTATACTC CTAAAATATTATTTTTTCAACCTCCAAACAATCCACAACTCTTAACAAACATCCCAAATT TATCCTGTATCAATAACTTGTCTTCCATGAGGTGTTTTCTAAGTATTTGTTAGACCATAA ACTATTTTACCTATTTCACTGAAATAACTTTAATTAAAATAAATCTAATTTAAGGGTAAT AAATATTATAAAATAAGCTCAACACAAGTCAAGGGAGCCATGCCAGTAGTAAAAGCAGAA TCAATTTCATTTCACATCCTTCAAACCTACGCAACGCTAGTTTCCAAAACAAACAAACCC AACAAATTTGTTTAGATTAATTGAGCAAATACAAAAACATTCAGCTTACCTGACGCGAAA CCGTGACTGTCGAAGATGAATATGTGACCGTGTCGTGTGGCCGCTGCTACTGTCGAAGAT GAATATGAGATCTGAGCTGGGTACTGTGGGAGCTCGGAGATGAAAGAGATGATGAAGTTG TGGAGCTGGCTGTTGAAGATGTAGGAGACGAGATCTGAGCTGGTTGAGCGAGCAGATGAG CAAGATGAAGGTCACGCCTCACGGTCAAGCACAGAGTGTCTGACGAGTCACGCCTCACGG TCAAGCACTGCTGTCGAAGTGGAAGAAGGGTGCTGTTCGAAATCGAATGCAGTCTGCAGT GTGTGGGTGTGGGCAGTGGGTTGTGCGGCTAGGGCTGGTTTGTGAAGAAAAAAAAGTATA TATAGTACCATTGAAATTACATCAATACCCCTGTAAATATAAAATTACGTTTTTACCCTC ACTAACGGGTCAACCCGTAACACGATTCAAGAAACACGAACCCGACACGATAAGCTAACG GGTTAAACGGGTTGACCCGTTAATTTACCCAACCCGTTAATATTCAACCCTAACCCGTAA TTTTCGTGTCGGGTTCGTGTCGACCCATCGTGTCGGGTTCCGAATTGCCACCCCTAGATG AGAGGTAATTGAGTCTTTTCTATTTGCTTCATTTGGTTTGATCATGAGTTCCCTGATAAT TTAGAGTTTTTAAAAAAATTAGAGAGGGTAAAAATTATTTTTAAAAGAGTTTTTAAAATA TGATGTTTTTAAAAATCTCAACCATTACAATCAAATCTCCTCTTAACACTGCAACGTGGT TTATTTGGCTTTGGTCTACCAAACCAATAACAGAACGTCCCTATCATCATCAATTACCCC TAAAAAGCCCACACATTTACAACGCTATCCCCACACACATCTCCGTAAATATTGTGAAAA CCAGGGGCAAAGAATCTGACAGACACTAGCCTCACTTTCAAACCATGGTCTTTTTCCCCA ACTGCCCAAAGTCACTGCCACATCGAGTCAACAAAGTCAAAACCTCATACACCTAATAAA AACGGCACCGTTTGACAGCCTCTAACTTAATAACGGCGTCGTTTTATAGGGACATCGTCG TCATTTTAAAAAAACCGCCTGACAAAATAGTAATTGCGTCAAAGAATCCAAAACATTCGC TTCCCATAAATCGCTCACCATTTTGCAGTTAGAGGCAGGTAGGTACTCTTAACAAACACA AAAAAAAAGCAACTGATACA
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>LITCHI027606.m1 GenomeSequence + GTCTTTTTCCCCAACTGCCCAAAGTCACTGCCACATCGAGTCAACAAAGTCAAAACCTCA TACACCTAATAAAAACGGCACCGTTTGACAGCCTCTAACTTAATAACGGCGTCGTTTTAT AGGGACATCGTCGTCATTTTAAAAAAACCGCCTGACAAAATAGTAATTGCGTCAAAGAAT CCAAAACATTCGCTTCCCATAAATCGCTCACCATTTTGCAGTTAGAGGCAGGTAGGTACT CTTAACAAACACAAAAAAAAAGCAACTGATACAATGAACGAGAACGGTGACAGAGAAGAA GATAACGGTAACGGTGACGGTGAGGCGGCGGCGGCGGCAGAGGCGGTAGTAGTGGAGGAG GAGTCTGCCGGTGGTGGTGGTGGTAGTCGGAATGGTAACAGTAGAGTGAAGGGGCCGTGG TCGCCGGAGGAGGACTCGGTGCTGAGTCGGTTGGTGAGTCAGTTCGGGGCGAGGAACTGG GGGATGATCGCGCGAGGAATTCCAGGTCGGTCGGGGAAATCGTGCCGACTCCGGTGGTGT AATCAGCTCGACCCTTGCCTCAAGCGCAAGCCTTTCACTGGTAACTACACCTACCTCTCT CTCTCTCTCGCTCGCTGTTTGGATATGTGTTTTGTTTGTTGACTGTCAAAAAAGAAGTGA TTTTGAGGTTGTTTATGCATTGTTTTGGAGAAAAAGTTGGTGCCTTCGTGGTGGTATTGT TTGGAGAAATTTGAAATCGTGTCGGATTTCGCTTGATTTGCCTTCTTGTTGTTTGGATTA AGATTTTGATTTCTTTGATTGTTGGAACCTGCATTCATTGGTTTGATGTCTTGTTTCGTT TTAATTGAAATTTTAGACTGCTGATTTGGTCAAATATTTAGTTTCTGGTTTGTTCTTGGA GCTTTACAGTTTAAGTATTGAGTTGGAATATTGAGTATGAATTATGATCATTATTCATTA GCGCATGTGTTTTTTTGTACGCGATAAGTGATCGCAAGCTGTAAGTAATTTGACGAATCA TTATGATAGTGTCATTGTAAAACATATCATGTCTAGAGGTTAATAGTTTTGAAGGGAGAA GTGTAAAACGATGGTTTAATTGTAGGGGATTTGTTTTAGCTAAGTTGTACTTACATTATG CTTTTTTTATATACCTTTGCTCTGTGTCTCATTATTAATGTATCTTTTATTTCACATGTG AGACAAAATTGTTGTAATTCAGTAGAGGTATCCAGTCGCTAATGTTGTAAAGAAAGAACA AGTGCAAATGTGCAATGCTAGAATGAATCAGATTTTCAAGGTATTAGGATGTTGGTGATT TTGTATGTTATGTTTTGAGATTGGTTTTTTGGATTTAAGCGTGGTTTTTATGGTTTTTGT TTTTGTTTTATGTTATTGGATGATTCTTGTCTTGCTGAGAACAACCACGTAGGAAGTGTA TTTGTATATTTTCCTAATTCATTTTACATGAAGTGAATATAACTACTACATGTGTTTCAA TAAAATAAGGAAGCTGGATGACTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACATGAGTGAT CATAATTGATTTTGTTCTCAGTGATAGTTACATTACATATAGGTTCTTTTGAATATATAA AAAAGAATAATCCTTGTAATAATAAAGATTGTGGCAGGTACTTAATTGAAAAACAAATCA ATTGTGATTTTCTGAATAATGCATTAAATTAGCATGATAATTTAATGCATTATTTTTTGC TCTGTATTATTTTCCTATTGGTGTTCTTTTGATATTTTCAGTTCCATAATAGTATGTGCA GTTATCTTTTATTGCAATAAATTTGTTTCGCTTGAATCAGTATTATCATTGACTTTGTTG GATCTATGTCCTTATATTCATTTTTCTTTCCTTGTCTAGGCAAAGTGTTGTGTCAGGGAT GAAAGTGTCATCTTCTTTGAAATATGGGTTGGGATGTATTTGTGAAGAATACTTTGATAC TACATGTTTAATTTCTGTTTTCTACTTTATTCTTCCAAGCTCAAGCAGTCAAACTATGGT TGGTTTATCCAGACTTCAGAATTTTCTTTGAAAGATTAGCTAGTCAGTTCCATTTTTAGT TCAAAAGTTTAATGTAAATTATTTTTATAAGTTCTATCTCTGTTTAAATTAACTTCATAA TGCAGCAGCCTGAGATGGTTTTGGTTGTTAATATAGAATATAGACTGAAAATGGTCAGAA TTTGAGTTGATAATCAACTAATGTATGAATGCCTAGTCCATAGCATTTCAGATTTGTGAT CACTGTATTAATTATAAGACACCTGACTTAAGTTCTTTTATTAGTAGGATTATCTTGCAT TCTGGAGGCTGTGAGTAGAGTTTTGTTCGACATTTTTGAGGCATGAATGTGAGAGAGTAC TCAGTTTATTTCAGGGAGAAATGCGATGTTTGAAGTGTTTTGACATGGTAAAAGACATGT TAGCAATATAATTACTCTCATAAGAATTTGTCATCTATTATCTATCTCAATTGATAATCT TTGACTCAATTACATTTATTGTAGAAGTTGAACCATGAAACGGCTTAAATCTTGAGACTT GATTGCTGACTCTGCAGCATCTTGTAGACCTTTTGAGTTACGAACTAACTATTTGCTGAA CAGACCTTTTTAGTTGAGAACTAAATATTTGCTGAGCAGACCTTTTTAGTTAAGAACTAA CTATTTGCTGAACAGATTTTCTGCATATAACCTGAATCAGACTCACAATCTTCTATTTGA TGCTTACTATATAATTATTAATGCGATGCATATGTGGGAAATCTATTGAAATTATTTGTA TTTGAATTGTTGCAGAAGAAGAAGATCGTATCATAATTGCGGCCCATCAAGTCCACGGGA ACAAATGGGCAGCAATTGCAAGACTCCTGCCAGGCAGAACAGATAATGCGATCAAGAACC ATTGGAACTCTACTCTAAGGCGCAGATATATGACACTAGGGAGGTTTAACCCAGGGCCCA GCAACATGATGGAAGATGGGAGGTTTAACCCAGGGCCTAGCAACATAATGGAAGATGGGA GCCTTGACAGAACAAAAGCATCCTCAGAAGAGACCCTATCTGTTGGAGATGTTAATTCCT TCAAGCCATCAGAAGCAGGAGATACCATGATGGATGATAGACACAACCAGCTTGAAGATA TAGTTCACTCTGCTTCTGGACCACAACAGCCTCCTTCCATTTCATGTCTGGTAGGCGATA TCAATTCAATGAAGCCCTCAGAACAAAGAGATGTCAGGATGGATGACAGAATTAACCAAC ATGAAGACATATCTCAAAGAAAAGAAATTGAATTTGCTGCTGCAGCAAGGCCACGTCCTA CACTTTCACGTCCAGTTGCACGTGTTAGTGCTTTTAGTGTTTATAACCCCCTGGGTAGCA CAGCTATCGGTTCTGGAATTCCAAGGACAACCCCAACTCGACCTTTGGTTCAAGCATTTG GACCAGACTCTGGAATCTTCAAATTCCTAGAAGATGATAATAGTGACCCCATTATTCCTT CACGATGTGGGTATGGTTGCTGTGCTTCTATATCAGGACATTATTCACATAACTCGTTAT TGGGACCTGAATTCATTGACCATGAGGAGTCACCTACTTTCTCTAGTCATGAATTGATTT CCATAGCTACAGATTTGAACAACATTGCATGGATTAAGAGTGGCCTTAAAAATAGCAGCA CCAGCCAACCAGACAATGCAGCAAACCAGAGAATGTCTCATGTAACTGCTGCTGGTGCAC AAATGGGAATACCAGAACCAAGTGTGAGGAAAGATATGCGATTTGAAGATGGACGAAACA AGTTCATAGGGATGATGAACGATGTTATATCCTCCCAGGTACCCAGACAAACTTTTGCAA TGCGAGCTGAAGTCGAGAGTTTGAGCTAAAAACTAGTGGTGAGTTACTCCTCATCGAAGT CAAAATGGCTTAGTTGGACGGTATAGAATCAAAGTTATTGAGTTGCCTGAGTCATATCTT ATTCTGATTATGGAAGGCAGGAACTTGAATTTGTGAAAAGGCTCTTTATTCAAGCATAGA GATGATGACATTTGATTGAGTATACAGATTTAACATATGTTTTTGAATATATATTTAGAT CCTCGTCCGGTTTATTGAATGAAACCTTTTTAAATCTTCAATCATAATGATTATGCTTTG TCAATTCATGACTTACGAGTTACAAAGCTCATTTCGTGATCAATCATGACGCAGGAGGCT GGATATTTTCTAAAGTTTCTTATGTTACACTAATGACCTTACTATATCTTTATCAAAGGA TTATACAATAAAGATACTCTTTCATAGCTAGTGTCGGATTTTTGTACATATAAGTATCAA TGCAAATTTGCTCAAGTGGAGTGACACAATGGTAGCACTTCCATCTGTCTCTGCTTCAAA TCGCAGCTTCAGCACAACAATGTCCCCCCTTTATATAAAAAGTGTGGGTAGCTCTTTCTC CCTACTAGAGAGTATTAATTTGAGCCGTGTTATTAGAGTTTCATCTGAATTAGTTTTGAT AGTTCTCTTACTTTGAAAATATATTAGGAAATAAATAAATATATATTAATGCAAACCATA TAGATGATCAAAAGAGAGAGTTATACTAATGCCAACCATATGGATGAATAGATGATCAAA AGAGAGAGTTTGTAAGAGTCAACTCAAACCATATGGATAATGATCAAAAGCGAGCAAGTG TGAATCGTCCATTGGAAGTTGAAAAAGAAACAAACCAATGAAGATTAGGATGGTGGTGAG CGGTGAC