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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI027553 | Chr3 | 24982852;25004014 | 24987052;25008201 | + | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI027553.m1 | 35 | 75 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 42.1 | 8.70E-11 |
| LITCHI027553.m1 | 105 | 164 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.8 | 1.70E-06 |
| LITCHI027553.m1 | 105 | 143 | PF12799.10 | LRR_4 | Repeat | 27.1 | 4.20E-06 |
| LITCHI027553.m1 | 128 | 188 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 33.8 | 2.30E-08 |
| LITCHI027553.m1 | 128 | 147 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.9 | 0.3 |
| LITCHI027553.m1 | 225 | 247 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.5 | 1.9 |
| LITCHI027553.m1 | 297 | 356 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.3 | 2.40E-06 |
| LITCHI027553.m1 | 297 | 319 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.2 | 0.25 |
| LITCHI027553.m1 | 397 | 416 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9 | 1.8 |
| LITCHI027553.m1 | 469 | 528 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28 | 1.40E-06 |
| LITCHI027553.m1 | 469 | 491 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.4 | 0.43 |
| LITCHI027553.m1 | 493 | 552 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.5 | 1.10E-06 |
| LITCHI027553.m1 | 698 | 965 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 140.7 | 5.50E-41 |
| LITCHI027553.m1 | 699 | 962 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 138.4 | 3.00E-40 |
| LITCHI027553.m2 | 35 | 75 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 42.1 | 8.70E-11 |
| LITCHI027553.m2 | 105 | 164 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.8 | 1.70E-06 |
| LITCHI027553.m2 | 105 | 143 | PF12799.10 | LRR_4 | Repeat | 27.1 | 4.20E-06 |
| LITCHI027553.m2 | 128 | 188 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 33.8 | 2.30E-08 |
| LITCHI027553.m2 | 128 | 147 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.9 | 0.3 |
| LITCHI027553.m2 | 225 | 247 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.5 | 1.9 |
| LITCHI027553.m2 | 297 | 356 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.3 | 2.40E-06 |
| LITCHI027553.m2 | 297 | 319 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.2 | 0.25 |
| LITCHI027553.m2 | 397 | 416 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9 | 1.8 |
| LITCHI027553.m2 | 469 | 528 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28 | 1.40E-06 |
| LITCHI027553.m2 | 469 | 491 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.4 | 0.43 |
| LITCHI027553.m2 | 493 | 552 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.5 | 1.10E-06 |
| LITCHI027553.m2 | 698 | 965 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 140.7 | 5.50E-41 |
| LITCHI027553.m2 | 699 | 962 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 138.4 | 3.00E-40 |
| LITCHI027553.m3 | 35 | 75 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 42.1 | 8.70E-11 |
| LITCHI027553.m3 | 128 | 147 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.6 | 1.7 |
| LITCHI027553.m3 | 225 | 247 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.5 | 1.9 |
| LITCHI027553.m3 | 297 | 356 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.2 | 2.70E-06 |
| LITCHI027553.m3 | 297 | 319 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.2 | 0.25 |
| LITCHI027553.m3 | 397 | 416 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9 | 1.8 |
| LITCHI027553.m3 | 469 | 528 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28 | 1.40E-06 |
| LITCHI027553.m3 | 469 | 491 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.4 | 0.43 |
| LITCHI027553.m3 | 493 | 552 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.5 | 1.10E-06 |
| LITCHI027553.m3 | 698 | 965 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 140.7 | 5.50E-41 |
| LITCHI027553.m3 | 699 | 962 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 138.4 | 3.00E-40 |
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>LITCHI027553.m1 ATGGGTGTCGTGTTAAAGACAAAAGCTCGAACCTTGTTGGTGGGTCTGTTCACATTTCTG GTTCTGGCTCCGGTTCTCACAAGATCTCTCACTCCATCTCTAAACGACGACGTTTTGGGG CTGATAGTGTTCAAAGCAGACATTCAAGATCCTAACCAGAAGCTTGCGTCGTGGAATGAA GACGATGACAGTCCCTGCAACAACTGGGTTGGTGTCAAATGCAACCCGAGATCCAACCGG GTCACAGAGCTCACTCTTGACGGGTTGTCTCTCTCGGGCCGGATCGGGCGTGGCCTCTTG CAGCTCCGGTTCCTGAGAAAACTCTCTCTTTCAAGTAACAATCTAACTGGAAACATTAGT CCTAATCTTGCAAAGCTTGAAAATTTGAGAATTATTGATTTGAGTGGCAATAGCTTATCT GGGTCGATTCCTGATGACTTTTTCAAACAATGTGGGTCACTTAGAGTCATATCTTTAGCT AGAAACAAGTTTTCAGGGAAGATACCAAGTAGTTTGAGTTTGTGTTCTACTCTTGCTACT ATTGACTTGTCATCTAACCGGTTTTCAGGGGCTTTACCGTTGGGTATCTGGGGTTTGAAT GCACTTAGATCACTTGATTTGTCTGATAATTTGTTGGAGGGTGAGATTCCTAAAGGTGTT GAGAGTTTGAACAATTTGAGGGAGATTAATTTGAGTAAAAATAGGTTTTCCGGGTTGGTT CCAGATGGGATTGGGAGCTGTTTGTTGTTGAGGATTATTGATTTTAGTGAGAATTCATTC TCTGGGAACTTACCGGAGACAATGAGGAAGCTTGGGTTGTGTAGTTTGATGAATATGAGG AAGAATTCGTTTTCTGGGGAAGTTCCTAAGTGGATTGGAGAAATGAAGAGTCTTGAAAGT TTGGATCTTTCGGGGAATAAGTTTTCTGGAGGGGTGCCTGATTCGATTGGGAATCTTCAG 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ACTGTCCTCAATCTCCGTGTGCGATCATCGGCTTCTCGATCTGCAGCAGCCCTCACATTG TCAGCTGGGGAGGACTACAGCTGTTCACCCACCACAGATGCCAACTCTGGCAAACTTGTC TTGTTTTCAGGTGATCCTGACTTCAGCACAGGAGCACATGCATTGCTCAACAAGGATTGT GAGCTTGGGCGTGGTGGGTTTGGAGCTGTTTATCGGACAGTCCTACGAGATGGGCGTTCA GTTGCAATAAAAAAACTCACTGTCTCAAGTCTTGTGAAGTCTCAAGAAGAATTCGAAAGG GAAGTCAAGAAACTTGGAAAGGTCAGGCATCCTAATACTGTGGCACTTGATGGTTATTAC TGGACTCAGTCATTGCAACTTCTCATTTATGAATTCGTCTCTGGTGGAAGTTTGTATAAA CATCTCCATGAAAAATCAGGTGGAAATTTCCTTTCATGGAATGAGAGGTTCAATATAATT CTGGGAACAGCAAAGAGCCTGGCTCATTTGCACCAATCAAACATTATTCACTACAACATA AAATCAAGTAACGTGTTGATAGACGGCTCTGGTGAACCTAAAGTGGGAGACTATGGCTTA GCGAGGTTGTTGCCAATGCTAGATCGATATGTTTTAAGCAGCAAGATTCAGAGTGCACTT GGCTACATGGCACCCGAGTTTGCCTGCAGAACAGTGAAGATCACCGAGAAGTGTGATGTG TATGGGTTTGGTGTTTTAGTTCTAGAGGTTGTTACCGGGAAAAGGCCTGTTGAGTACATG GAAGATGACGTGGTGGTACTTTGCGACATGGTTAGAGGAGCATTGGAAGAAGGAAGAGTT GAGGAATGTGTCGATGAGAGGTTGCAAGGTAAATTTCCGGTAGAGGAGGCGATACCAGTA ATGAAACTAGGCTTGATCTGCATGTCACAAGTGCCATCAAACCGACCAGACATGGCAGAG GTTGTTAATATATTGGAACTGATCAGATGCCCTTCAGAAGGGCAAGAGGAGTTGGGATAA >LITCHI027553.m2 ATGGGTGTCGTGTTAAAGACAAAAGCTCGAACCTTGTTGGTGGGTCTGTTCACATTTCTG GTTCTGGCTCCGGTTCTCACAAGATCTCTCACTCCATCTCTAAACGACGACGTTTTGGGG CTGATAGTGTTCAAAGCAGACATTCAAGATCCTAACCAGAAGCTTGCGTCGTGGAATGAA GACGATGACAGTCCCTGCAACAACTGGGTTGGTGTCAAATGCAACCCGAGATCCAACCGG GTCACAGAGCTCACTCTTGACGGGTTGTCTCTCTCGGGCCGGATCGGGCGTGGCCTCTTG CAGCTCCGGTTCCTGAGAAAACTCTCTCTTTCAAGTAACAATCTAACTGGAAACATTAGT CCTAATCTTGCAAAGCTTGAAAATTTGAGAATTATTGATTTGAGTGGCAATAGCTTATCT GGGTCGATTCCTGATGACTTTTTCAAACAATGTGGGTCACTTAGAGTCATATCTTTAGCT AGAAACAAGTTTTCAGGGAAGATACCAAGTAGTTTGAGTTTGTGTTCTACTCTTGCTACT ATTGACTTGTCATCTAACCGGTTTTCAGGGGCTTTACCGTTGGGTATCTGGGGTTTGAAT GCACTTAGATCACTTGATTTGTCTGATAATTTGTTGGAGGGTGAGATTCCTAAAGGTGTT GAGAGTTTGAACAATTTGAGGGAGATTAATTTGAGTAAAAATAGGTTTTCCGGGTTGGTT CCAGATGGGATTGGGAGCTGTTTGTTGTTGAGGATTATTGATTTTAGTGAGAATTCATTC TCTGGGAACTTACCGGAGACAATGAGGAAGCTTGGGTTGTGTAGTTTGATGAATATGAGG AAGAATTCGTTTTCTGGGGAAGTTCCTAAGTGGATTGGAGAAATGAAGAGTCTTGAAAGT TTGGATCTTTCGGGGAATAAGTTTTCTGGAGGGGTGCCTGATTCGATTGGGAATCTTCAG GTGCTAAAGGTGTTGAATTTTTCTGCGAATGGGTTAACGGGGAGCTTGCCAGAGTCTATG ATCAATTGTGCAAGCCTTGTGGTGTTGGATTTTAGCCAGAATCTGATAAAGGGTGATCTT CCTCGATGGATTTTCGACTCGAGCTTGAAGAAAGTTTCTCTCTCAGAGAAGAAAGTTGGT GCGAAGATGAATGGTCCTTTTGCTTCTTCGATGGTGAACTCATTCGAAAAGCTTCAAGTC TTGGATTTGTCTCGTAATCAGTTTTCTGGTGAAATTGGTTCTGGCATTGGGGATTTAAGC AGCTTGCAGCAGCTGAATCTGTCGAGCAACTCACTTGTGGGTCCTATTCCAGCGACAGTC GGAGAGTTGAAGGCCTTGAATGTTCTTGATTTGAGTGTGAATTGGTTGAACGGAAGCATT CGCATGGAAATTGGTGGAGCTTATTCTCTGAAGGAGCTGAGACTGGAGGGCAACTTTTTG GCTGGGAAAATTCCGACTTCGATTGAGAACTGTTCTTCACTCTCAACTTTGATACTATCA AAGAACAACTTGACTGGTCCAATACCAGCGGCAGTAGCAAAACTTACAAACCTACAAAAT GTGGACTTGTCTTTTAACGGTCTCACTGGAAGTCTACCAAAACAATTGGCCAATCTTGTC CACCTTGTATCTTTCAACATATCACACAACCATCTCCAAGGCGAACTACCTGCCGGTGTG TTTTTTAACACCATATCACCTTCTTCTGTCTCTGGGAATCCATCTCTCTGTGGCGCTGCA GTCAATAAGTCCTGCCCTGCGGTCCTTCCGAAACCTATTGTCCTCAATCCGAACTCTTCG TCCGACTCCACAGCTGGTTCTGTGCCTCCAACTCTTGGTCACAAGAGAATCATCCTCAGC ATATCTGCTCTCATTGCCATTGGTGCAGCTGCTGTTATTGTGGTTGGTGTGATTGCCATC ACTGTCCTCAATCTCCGTGTGCGATCATCGGCTTCTCAATCTGCAGCAGCCCTCACATTG TCAGCTGGGGAGGACTACAGCTGTTCACCCACCACAGATGCCAACTCTGGCAAACTTGTC TTGTTTTCAGGTGATCCTGACTTCAGCACAGGAGCACATGCATTGCTCAACAAGGATTGT GAGCTTGGGCGTGGTGGGTTTGGAGCTGTTTATCGGACAGTCCTACGAGATGGGCGTTCA GTTGCAATAAAAAAACTCACTGTCTCAAGTCTTGTGAAGTCTCAAGAAGAATTCGAAAGG GAAGTCAAGAAACTTGGAAAGGTCAGGCATCCTAATACTGTGGCACTTGATGGTTATTAC TGGACTCAGTCATTGCAACTTCTCATTTATGAATTCGTCTCTGGTGGAAGTTTGTATAAA CATCTCCATGAAAAATCAGGTGGAAATTTCCTTTCATGGAATGAGAGGTTCAATATAATT CTGGGAACAGCAAAGAGCCTGGCTCATTTGCACCAATCAAACATTATTCACTACAACATA AAATCAAGTAACGTGTTGATAGACGGCTCTGGTGAACCTAAAGTGGGAGACTATGGCTTA GCGAGGTTGTTGCCAATGCTAGATCGATATGTTTTAAGCAGCAAGATTCAGAGTGCACTT GGCTACATGGCACCTGAGTTTGCCTGCAGAACAGTGAAGATCACCGAGAAGTGTGATGTG TATGGGTTTGGTGTTTTAGTTCTAGAGGTTGTTACCGGGAAAAGGCCTGTTGAGTACATG GAAGATGACGTGGTGGTACTTTGCGACATGGTTAGAGGAGCATTGGAAGAAGGAAGAGTT GAGGAATGTGTCGATGAGAGGTTGCAAGGTAAATTTCCGGTAGAGGAGGCGATACCAGTA ATGAAACTAGGCTTGATCTGCATGTCACAAGTGCCATCAAACCGACCAGACATGGCAGAG GTTGTTAATATATTGGAACTGATCAGATGCCCTTCAGAAGGGCAAGAGGAGTTGGGATAA >LITCHI027553.m3 ATGGGTGTCGTGTTAAAGACAAAAGCTCGAACCTTGTTGGTGGGTCTGTTCACATTTCTG GTTCTGGCTCCGGTTCTCACAAGATCTCTCACTCCATCTCTAAACGACGACGTTTTGGGG CTGATAGTGTTCAAAGCAGACATTCAAGATCCAAACCAGAAGCTTGCGTCGTGGAATGAA GACGATGACAGTCCCTGCAACAACTGGGTTGGTGTCAAATGCAACCCGAGATCCAACCGG GTCACAGAGCTCACTCTTGACGGGTTGTCTCTCACGGGCCGGATCGGGCGTGGCCTCTTG CAGCTCCGGTTCCTGAGAAAACTCTCTCTTTCAAGTAACAATCTAACTGGAAACATTAGT CCTAATCTTGCAAAGCTTGAGAATTTGAGAATGATTGATTTGAGTGGCAATAGCTTATCT GGGTCGATTCCTGATGACTTTTTCAAACAATGTGGGTCACTTAGAGTCATATCTTTAGCT AGAAACAAGTTTTCAGGGAAGATACCAAGTAGTTTGAGTTTGTGTTCTACTCTTGCTACC ATTGACTTGTCATCTAACCGGTTTTCAGGGGCTTTACCGTTGGGTATCTGGGGTTTGAAT GCACTTAGATCACTTGATTTGTCTGATAATTTGTTGGAGGGTGAGATTCCTAAAGGTGTT GAGAGTTTGAACAATTTGAGGGAGATTAATTTGAGTAAAAATAGGTTTTCCGGGTTGGTT CCAGATGGGATTGGGAGCTGTTTGTTGTTGAGGATTATTGATTTTAGTGAGAATTCATTC TCTGGGAACTTACCGGAGACAATGAGGAAGCTTGGGTTGTGTAGTTTGATGAATATGAGG 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