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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI027515 | Chr3 | 24546557 | 24548649 | + | Transcription factor DIVARICATA |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI027515.m1 | 26 | 70 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 29.8 | 5.60E-07 |
LITCHI027515.m1 | 125 | 170 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 40.6 | 2.40E-10 |
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>LITCHI027515.m1 ATGGAGACTCTATATCCGACCTCATACATGTCGAATTCAAATTTGTTTCTGCAAGAGAGT ACTCAGAGCTCAATCTGGACTAAAGAGGAGAACAAGAGGTTTGAGAGTGCTCTTGCTTTA TATGGTGAGAGCACTCCCGATAGGTGGATAAAGGTGGCGGCCATGATTCCAGGGAAAACA GTGTTTGATGTGATCAAACAATACAGAGAATTGGAAGAGGATGTTAGTGATATTGAAGCT GGAAAAGTTCCAATTCCAGGCTATCTTGGTTCATCTTTTACATTGGAATGGGTCTCAGAA CGCGACTTTGATGGTAATAGGAAGAGATCTTTGGGGGCTAAAAGCTCAGATCAGGAAAGG AAGAAGGGCGTGCCGTGGACTGAAGAAGAACACAGGAGGTTTCTGTTGGGACTAATTAAG TATGGTAAAGGAGATTGGAGAAACATTTCTAGGAACTATGTGATCTCAAAGACACCAACT CAAGTGGCAAGCCATGCTCAGAAGTACTTTATAAGGCAGCTTTCAGGAGGGAAAGACAAG AGGAGACCAAGCATCCATGACATCACAACTGTCAATCTCACCAACAACACACCCCCATCA GAGAGTCCCAAAGCTTCTTCATTCGATCAGCCTAACGCGCTTCCATTACAGCAGAAGTGT TCAAGCATGCCAAAAGTAGGCCTGGAATGGAGTGACTCAAATGATGGTGGAGCAGCAATG GTTTTCGGTTCGAATTCTGGTAATCTCTTTATACCATCTGCTTATGAGATTGGTTCCAAT GGTCTGAAACTTCAGGGGCAAAATCTGTATGCAACTGCTTATCATGGAGCTCAATTTAGA CCCCGAAATTCAGTGTTCTAA
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>LITCHI027515.m1 ACAAATCATAATCAAAAACTCTATAATAAGAAGGCAACCACTTTCAAAGTGTCAGACACC ATTCACAACAAGACACCTCCCTCTAGTCTTCTTTGTACAGCTCTACTCTATCCAACTCTT CTCTCCTTCTTCTTCCTCCTTTTGAAACTGTTTGTTTCACAGTTCCACAACCACTACTAG CTACCACCTCCATGTTCTTTTATATATATAAATTTTTTTGTTCTACATATATAATCTGAT AACATATATCCAACTTTTCTCTCTCTTCTCTTCAAAAAAAAAAAAAACCAGAAAAGTAGT TACTTTCCCGCCTCTTTTCTCAACCAACTCTAGCTCTTCATTTCCTCATGTTTTTGTGTT TGGTTTTTTTTTAATGGTTTTTAAACAGTTTTTAAGTAGTAGTATAAATTATAATCTTAG TTTTGGCGTTGGTTGTGTTTCTATGTGTCTAGTTCTATAAAGGGTTGGTTGCATGATCAG ATTTTTTCTTGTATTATTAGGATTCTTTTTTATTCTTCAAAGGTGGGTGGGTTAGTCTGT CTTTTTAAGATTCTTCAGTTTATGCTGTTAAGAAAAGGAGATTCTTGATTCCCCAGAAAA TGATTCCATAAAAATTTGCTTCCTTTTTAATCATTCTCACAACCCCACTTTGATATATAA GCTTTGAAACCATATCATGAGCTTGTGAGTTTTTTTCAAGTATGGAGACTCTATATCCGA CCTCATACATGTCGAATTCAAATTTGTTTCTGCAAGAGAGTACTCAGAGCTCAATCTGGA CTAAAGAGGAGAACAAGAGGTTTGAGAGTGCTCTTGCTTTATATGGTGAGAGCACTCCCG ATAGGTGGATAAAGGTGGCGGCCATGATTCCAGGGAAAACAGTGTTTGATGTGATCAAAC AATACAGAGAATTGGAAGAGGATGTTAGTGATATTGAAGCTGGAAAAGTTCCAATTCCAG GCTATCTTGGTTCATCTTTTACATTGGAATGGGTCTCAGAACGCGACTTTGATGGTAATA GGAAGAGATCTTTGGGGGCTAAAAGCTCAGATCAGGAAAGGAAGAAGGGCGTGCCGTGGA CTGAAGAAGAACACAGGAGGTTTCTGTTGGGACTAATTAAGTATGGTAAAGGAGATTGGA GAAACATTTCTAGGAACTATGTGATCTCAAAGACACCAACTCAAGTGGCAAGCCATGCTC AGAAGTACTTTATAAGGCAGCTTTCAGGAGGGAAAGACAAGAGGAGACCAAGCATCCATG ACATCACAACTGTCAATCTCACCAACAACACACCCCCATCAGAGAGTCCCAAAGCTTCTT CATTCGATCAGCCTAACGCGCTTCCATTACAGCAGAAGTGTTCAAGCATGCCAAAAGTAG GCCTGGAATGGAGTGACTCAAATGATGGTGGAGCAGCAATGGTTTTCGGTTCGAATTCTG GTAATCTCTTTATACCATCTGCTTATGAGATTGGTTCCAATGGTCTGAAACTTCAGGGGC AAAATCTGTATGCAACTGCTTATCATGGAGCTCAATTTAGACCCCGAAATTCAGTGTTCT AATCCGAATCCGAAAAGATATCAAATATAGATGTTGATGAGATCTCAACAATTGTGTTCT CTTGTACTCACGGATTGAAATCCTAAATCTCTTTTGTATCTCTTAAAAATTCCAGTTGTA TTGTTGTTGTCCTGTTTGTCAGCTTACATAAAAAAAGGCATGAGATGGTTTTGTACATAA TCTTTGGCTTTTAAAGTAAGCAGATATAAGCATGTCAATGATTACTTCAAAAGACAAAAA AAAAAGCATGTCAATGATGTACATGGTAATTTCCCTCTTTTAAAATTTTTTTGTACATAG AATTCGATCCTATGTGCAAAAAATTCACTCAATGGGA
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>LITCHI027515.m1 + Up_Stream_Len 2000 TAAAGGATGTTATATGATGTGGGTATATGGTAACATTATTATTTGTTTTTATGCAATTGA AACAGCGACATTTTGATATGGCTCCAAAATTTTCATAATCAATCGATTTGGTCCCTTTGA TAGTAACTTCAATGAAGTATAAGCAACGTCAAAGACTTTTATAACCAATCAATTTGGTCC CTCTAATAAAAACTTCAACGAAAATTTTAGCGCGCCAGATAGGGGTCGAACCTATGACCT TCTGCTTAGGAAACAGACGCTCTATCCACTGAGCTACAGGCGCTTTGTTGTTCTTGGTAT AGCAAACATTATTATATGAAGTTAAAAAATTAAGATGCTATCTAGAGCTAGACTACTAAT TTTTTTTTTTTGGAACACTAAACTAGTATAATATTGGGGTGGAATGAAGATGTACTTTAA CTCATAAACCCATTAACATGAGTCGGGGAGATTTAGCATTAGATTATCTCAATTTAAGAA TTAAGAAAAAATAATATAATTCAATCTTATAATTTCATTGATAAGCAGATGTAAAAACTT TTATTAGACTACCTTAACTTCTATCAAACGTATCTACTGAGTGAGATATTTACTTAAAAC CTTATTCAGATAAATTTGATAGTTCATAACAGTCTCATTAATATGGGTGTGGGAAACTTA TCATTGAACTATCTGAACTTAAATGTTGGAGAGAAAAACATATTCAATAGTTTGATTGAC ATATAGGTACTAGAATTTCTGTTAGGGCTATCTTAACTTCCATTAAATATGTTGGGAGAG AGACATACTAACCTAAAGTTACAATCTTGTCAAGATAAGCATTGAGAGTATATAATTGCA TCACCTCAATTTTATTCCTACAACATGTTTCAAAGATCAAATTTATATTTACATTGACAT ATGGCATGTCTCTTTCTATTTTATCTTAAATGTAACTACAGAGCAACAATAGAGCACTAC TAATAATAATATAAATTTTTTCTTACATGCATCCTAAAATTTTACCTACTTTCAATGATA AAATAAATACTTTATTTTATTACGGCGCGAAATGACTGACATAAATTTAAATTCCAATTA ATCACTCACTTTTTAATCTAAGTGGCTATAACTAATCTTAGTATCCATTTGTCCTTATAT TAAGTGTTTCGAGCTTTTTAAAAAATTAAAAAGGAAAATCATAGATGATAATTGTTGAAT GATGATAAGGCTCTAAGTGTAACTTTTTCTTTTATATTATTAAGACTCCATGGGGAGGTT AAAGTAAAGTGAAAGGTTAAAAAACCAATAAAGATTCAGACAAATCATAATCAAAAACTC TATAATAAGAAGGCAACCACTTTCAAAGTGTCAGACACCATTCACAACAAGACACCTCCC TCTAGTCTTCTTTGTACAGCTCTACTCTATCCAACTCTTCTCTCCTTCTTCTTCCTCCTT TTGAAACTGTTTGTTTCACAGTTCCACAACCACTACTAGCTACCACCTCCATGTTCTTTT ATATATATAAATTTTTTTGTTCTACATATATAATCTGATAACATATATCCAACTTTTCTC TCTCTTCTCTTCAAAAAAAAAAAAAACCAGAAAAGTAGTTACTTTCCCGCCTCTTTTCTC AACCAACTCTAGCTCTTCATTTCCTCATGTTTTTGTGTTTGGTTTTTTTTTAATGGTTTT TAAACAGTTTTTAAGTAGTAGTATAAATTATAATCTTAGTTTTGGCGTTGGTTGTGTTTC TATGTGTCTAGTTCTATAAAGGGTTGGTTGCATGATCAGATTTTTTCTTGTATTATTAGG ATTCTTTTTTATTCTTCAAAGGTGGGTGGGTTAGTCTGTCTTTTTAAGATTCTTCAGTTT ATGCTGTTAAGAAAAGGAGATTCTTGATTCCCCAGAAAATGATTCCATAAAAATTTGCTT CCTTTTTAATCATTCTCACAACCCCACTTTGATATATAAGCTTTGAAACCATATCATGAG CTTGTGAGTTTTTTTCAAGT
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>LITCHI027515.m1 GenomeSequence + ACAAATCATAATCAAAAACTCTATAATAAGAAGGCAACCACTTTCAAAGTGTCAGACACC ATTCACAACAAGACACCTCCCTCTAGTCTTCTTTGTACAGCTCTACTCTATCCAACTCTT CTCTCCTTCTTCTTCCTCCTTTTGAAACTGTTTGTTTCACAGTTCCACAACCACTACTAG CTACCACCTCCATGTTCTTTTATATATATAAATTTTTTTGTTCTACATATATAATCTGAT AACATATATCCAACTTTTCTCTCTCTTCTCTTCAAAAAAAAAAAAAACCAGAAAAGTAGT TACTTTCCCGCCTCTTTTCTCAACCAACTCTAGCTCTTCATTTCCTCATGTTTTTGTGTT TGGTTTTTTTTTAATGGTTTTTAAACAGTTTTTAAGTAGTAGTATAAATTATAATCTTAG TTTTGGCGTTGGTTGTGTTTCTATGTGTCTAGTTCTATAAAGGGTTGGTTGCATGATCAG ATTTTTTCTTGTATTATTAGGATTCTTTTTTATTCTTCAAAGGTGGGTGGGTTAGTCTGT CTTTTTAAGATTCTTCAGTTTATGCTGTTAAGAAAAGGAGATTCTTGATTCCCCAGAAAA TGATTCCATAAAAATTTGCTTCCTTTTTAATCATTCTCACAACCCCACTTTGATATATAA GCTTTGAAACCATATCATGAGCTTGTGAGTTTTTTTCAAGTATGGAGACTCTATATCCGA CCTCATACATGTCGAATTCAAATTTGTTTCTGCAAGAGAGTACTCAGAGCTCAATCTGGA CTAAAGAGGAGAACAAGAGGTTTGAGAGTGCTCTTGCTTTATATGGTGAGAGCACTCCCG ATAGGTGGATAAAGGTGGCGGCCATGATTCCAGGGAAAACAGTGTTTGATGTGATCAAAC AATACAGAGAATTGGAAGAGGATGTTAGTGATATTGAAGCTGGAAAAGTTCCAATTCCAG GCTATCTTGGTTCATCTTTTACATTGGAATGGGTCTCAGAACGCGACTTTGATGGTAATA GGAAGAGATCTTTGGGGGCTAAAAGCTCAGATCAGGAAAGGAAGAAGGGCGTGCCGTGGA CTGAAGAAGAACACAGGTGACTTCTCTTCAAAATTTTCCTGTCAAAATGTTACTTTTTAG TGAAGCTATATCATGAGTTTTATGTCTAGTTACATGATTTTGTACTATTTAGTTTAGTTA ATTTTAGCCTATGATTATCTTGTGTGATTTGCAATTTATATGATCTTGATTTTGTGTTTG ACATTGGTTTTTTTTATCTCGAATTACGATAGGAGGTTTCTGTTGGGACTAATTAAGTAT GGTAAAGGAGATTGGAGAAACATTTCTAGGAACTATGTGATCTCAAAGACACCAACTCAA GTGGCAAGCCATGCTCAGAAGTACTTTATAAGGCAGCTTTCAGGAGGGAAAGACAAGAGG AGACCAAGCATCCATGACATCACAACTGTCAATCTCACCAACAACACACCCCCATCAGAG AGTCCCAAAGCTTCTTCATTCGATCAGCCTAACGCGCTTCCATTACAGCAGAAGTGTTCA AGCATGCCAAAAGTAGGCCTGGAATGGAGTGACTCAAATGATGGTGGAGCAGCAATGGTT TTCGGTTCGAATTCTGGTAATCTCTTTATACCATCTGCTTATGAGATTGGTTCCAATGGT CTGAAACTTCAGGGGCAAAATCTGTATGCAACTGCTTATCATGGAGCTCAATTTAGACCC CGAAATTCAGTGTTCTAATCCGAATCCGAAAAGATATCAAATATAGATGTTGATGAGATC TCAACAATTGTGTTCTCTTGTACTCACGGATTGAAATCCTAAATCTCTTTTGTATCTCTT AAAAATTCCAGTTGTATTGTTGTTGTCCTGTTTGTCAGCTTACATAAAAAAAGGCATGAG ATGGTTTTGTACATAATCTTTGGCTTTTAAAGTAAGCAGATATAAGCATGTCAATGATTA CTTCAAAAGACAAAAAAAAAAGCATGTCAATGATGTACATGGTAATTTCCCTCTTTTAAA ATTTTTTTGTACATAGAATTCGATCCTATGTGCAAAAAATTCACTCAATGGGA