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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI027336 | Chr3 | 22550561 | 22556533 | - | NF-X1-type zinc finger protein NFXL2 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI027336.m1 | 184 | 201 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 17.3 | 0.004 |
| LITCHI027336.m1 | 236 | 254 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 20.6 | 0.00036 |
| LITCHI027336.m1 | 289 | 307 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 10.4 | 0.58 |
| LITCHI027336.m1 | 343 | 361 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 14.9 | 0.023 |
| LITCHI027336.m1 | 396 | 414 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 20.4 | 0.00042 |
| LITCHI027336.m1 | 417 | 441 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 17.6 | 0.0032 |
| LITCHI027336.m1 | 490 | 500 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 7.2 | 5.7 |
| LITCHI027336.m1 | 509 | 518 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 3.3 | 96 |
| LITCHI027336.m1 | 591 | 601 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 12 | 0.18 |
| LITCHI027336.m1 | 636 | 651 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 10 | 0.8 |
| LITCHI027336.m1 | 698 | 713 | PF01422.20 | zf-NF-X1 | Family | 6.1 | 13 |
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>LITCHI027336.m1 ATGTCGAAAATGCCCCCTACCGCCATAACCGAGCCTCTCCTATCGGACTCCGACGCCGAC TCCGACAGCGGCCAGACCGACCTCTATCCAGACCTCTCCAACTCCATTTTCAAACCCTAC TTAGAATCCACCAATCAATCATCTCTTGGCAGCTCAGACCTCTCGAAGATCAAATCTTTC CTGGCATCATCGTCGTCCGGCGGGCTCTCGTGCCTCATCTGCCTCGAACGGATCCGACCG GCCGACCCCACTTGGCACTGCTCCTCCCTCTGCTTCTCCATCTTCCACCTCCTCTGCATC CAGTCATGGGCCCGCCAAGCCTCCGATCTCTCCGCCGCACGTGCCGCCTCCCGCCTACCC ATCTCCGCCGCTAAAGCCGATGGCTTTTCGACCTGGAACTGCCCAAAATGCCGCTTCCAG TACTCAAAATCTCAACTTCCAAAGAGATATGTCTGCTTTTGTGGAAAACTAGAAAACCCT TTTAGTGAAGACCCGTGGATTTTACCACACTCGTGTGGGGAGGTGTGTGGTAGAGCTTTG AGTGACAATTGTGGGCATTTTTGTCTGCTTTTGTGCCATCCAGGTCCCTGCCCCTCTTGT CCAAAGCTGGTTTCTTCCTCTTGTTTTTGTGGGAAAGTTGAAGATGTTCGTCGTTGTGGA TTCAAAGCGTTTTCTTGCAGGAAAACGTGTTGGAAGATGTTGGATTGTAATATGCATAAG TGTGTGGAAACATGCCATGATGGTGCCTGCCCGCCTTGCAAGGCGAGGGGGGTGTATAAG TGTCAATGTGGGAAGGTTGAGGAGGAGAGGGAGTGTTGTGAGAGGGATTTTAGGTGTGAT AATAGGTGTGAGAATGTGCTTGGGTGTGGGAAGCATGTGTGTGAGAGAGGGTGCCATTTG GGGGAGTGTGGTGGGTGCCCTCTTCAGGGGAAGAGGACTTGTCCCTGTGGGAAGAAGGTT TATGATGGTATGCCTTGTGACGTTGATGTGCCCCTTTGTGGTGCTACTTGTGATAAGATA TTGAGTTGTGGCCTGCATAGGTGTCCTGAGAGGTGCCATCGTGGAGCCTGTATTGAGACT TGCAGGACTGTTATTACTAAGCCGTGTAGATGCAGGAGCTTTAAGAAAGAGGTTCCTTGC TATCAAGATTTGGCATGTGAAAGGAAATGTCAAAGAGTGAGGGACTGTGGGCGGCATGCA TGTAAGCGTCGTTGTTGTGATGGGGATTGCCCCCCTTGTTCAGAGATTTGTGGCAAGAGG CTTAGGTGTAAGAACCACAAATGCCCATCCCCATGTCATCGAGGTCCCTGTGCTCCATGC CCTTTGATGGTAACTATTTCATGTGCCTGTGGGGAAACACACTTTGAGGTTCCCTGTGGT ACTGAGAAGGATCAAAAGCCTCCCAGATGTCGAAAATTGTGCCGTATAACTCCTTTATGT AGGCATGCATCTATTTCCAAGCCTCATAAATGCCATTATGGAGCTTGCCCCACATGCCGG CTAATCTGTGAGGAAGAATACACATGTGGCCATAAGTGCAAATTAAGGTGCCATGGCCCT AGACCTCCCCCTAATCCAGAATTCACATTAAAACCAAAAAAAAAGAAGTCAAATCATCTG AGTGAACTTACTCCTGGTTCTCCATGCCCTCCCTGCCCTGAGCTTGTTTGGAGGTCATGT TTTGGCCAGCACATTGGTGCAGAAAGGATGATGGTTTGCTCAGATAGAACACAATTTTCC TGTGAAAATTTGTGTGGAAATCCTCTTTCTTGTGGTAATCACTATTGTACGAAAACTTGC CATGCCCTAAAGAACCAGTCTTCATCATCAGTTGAAGAGAGAAGCAAGGAATCTTGTGAA GAGTGTAATCTTCCTTGCCAAAAGGAGAGAATGCCTTCTTGTCCTCATCCCTGCCCGAAG CCATGTCATCCAGGAGAATGCCCACCTTGCAAAGTGCTTATAAAACGATCTTGTCATTGC GGTGCAATGGTGCATGTTTTTGAGTGCATATATTACAATACCTTGCCTGAGAAGGAGCAA ATAACTGTTCGCACATGTGGGGGACCCTGCCATAGAAAGTTGCCCAACTGTACACATCTA TGCCCAGAGCTGTGCCATCCTGGTCCATGCCCATCGCCCGAAAAGTGCTGCAAAAAGGTT ACCGTTCGCTGTGGGTGCCAGACCTTGAAGAAGGAATGGCTATGTCAAGATGTTCAAGCG GCCTATCGAAAAACTAGTTGCGAACCAAAAGACATATCTAAAAATCGGTTTGGACTTGGA CTTCTGCCTTGCAATTCCGATTGCAAGAGTAAGATAGAGGTTGTTCATGCAGAGTTACAG TCCCGTAAACCTAAAGTTTCAGAGGAAAGGGAGACAGATACTGAGAAGCATGTACCAAAG CGCAAGAAAAGACGTGAACGTGTTCAAGAAGTGAGGCAAGTCTCAAGACTGCAGAAAATT ATCACCACCGCAAAGTGGCTGCTTCTATGCATCGCCCTTGTGGTAGCCATAATCTCAACT TCATATTATGGCTATAAAGGCCTTTTGAAGCTCTCCGATTGGATGAATGAAGTGGAAGAA CAAAGACAAAGAAAACAGTATCTGCGAATGTAG
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>LITCHI027336.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTGATATATTGGAGGGGGCACGTCTAACCATGGGTTCATTCCATTTCCAGCTGGTGTGCT AGTACTGGCCTCTTGTATTTCAATATAACCATTCAAATGTCTTTTGTTGTATCATATTTT GTTCATGTACTATGCCAGAATATATGTTCTTGATTCTCGAGATGCAAATTTTTTGACTCT CATGATTGGCGTACTACAGGTTTACCCAGCGGAATATACTGAGGGTATATCCGAAGGGTA TACGTGTTGACTCGTCAAATTACAATCCACTAATCGCATGGTCACATGGAGCTCAAATGG TTGCATTCAATATGCAGGTTCATTAATTTGATCTATATCCAAATTGGGATTTCTTATTTT CCAACTTGTGTTTTGCCATTTTAGAACTTTCAGTGACCATTAAATCAAGAAAGTGGTTCA CTTTTACAGGGACATGGGAGATCTCTCTGGTTGATGCAGGGAATGTTCAGGGCCAATGGT GGGTGTGGCTATGTTAAAAAGCCAGAGTTTCTGTTGAAGGCTGGTCCTCATAACGAAGTC TTTGATCCTAGAGTTAAGTTGCCAGTGAGAAAAACTTTGAAGGTGAATACTTTATTGCCA TAGCTCTCTACTATCTTTGTTGTTCTATATTTCCTTTAAGCATTTCAATATATTGCATCT TTAACTTATAATTTTTATCCCACATAAGTTGATGTATGATTTGTTTTCCGTTTTTATTAA TAAGGTGACTGTATTTATGGGAGAAGGATGGTATTTTGATTTTCATCACACTCACTTTGA TGCATATTCCCCTCCGGACTTTTACACAAGGGTATGTCAATCTAAGCTAATATGGTTTTA TGGATATTAACATGCGACATATGGGATAATTTGTCATTCTATTATATGTTCTTCAACGGG TATTAAATTTGTTAACTTGTGTGTAGGTTGGGATTGCTGGAGTTCCAGCTGATACTATAA TGAAGAAAACAAAGACACTAGAGGATAATTGGATACCCGCTTGGAACGAGGAATTTGAGT TCCCATTAACTGTTCCAGAACTTGCTCTTCTTCGGATTGAAGTTCACGAGTATGATATGT CTGAAACGGATGACTTTGGAGGCCAAACATGCTTACCTGTTTCAGAACTAAGAAGCGGGA TCCGTGCAGTTCCTCTTCACGACCGCAAGGGAGAGAAGTACAAATCCGTAAAGCTACTTA TGCACTTCGAATGGGCATAATCTTATGATATGATTAGCATTTTCCATGCTGAGGGAAAGA TACGTACGAATTTGTGAAGCCTGCCAGTTTTGAATTTGTTTGCTGCTGTTGTGAGCTTGT GTGTATGTAATGTATGTAATACAGGTCGTGAGACAAAATAACACTGCTCTGCAGTTGTAA GCATTGCAGTTTTTGTGTTGGAACCAGCAAACCTTTATATAATCTTATACTATTAATGTG AGTATTGAAATTACTTTGCTTTAGTGAAGTGATAGATAAATCTTTGCTGCCACTATCATA AGATATAGATGTACCATCCTTAAATTCATGTGAATTTGGTGATTGTTTAGATAAGTAGAT TCTACTCGTGGCATGTTAGTAAAAAGGCTTGTTAGTGGTTTATTTGTATATGAATCCATG TAGTTTATTTCCTGTAAATAAGAATTTCCTGTCATTTTTTTTTATTAAGCTTTTGAAGTT TATGAAATACATCTTTTCAATATTGTAGAAGTATTATTTAATCTCGGTAAATTCATTTTT GTATTGTGAAAGTAATTATGAAATTATACTAATAATAGGAGGCTTTCTCAAATTCTATGA TAATAGTAATTAGTCTTGTTAAGCTCGATGCTAACCATATATGATCTCAACAGTTTTGAT ATCTTTGTACAACTTACCCGCAAACGAAGATGGGTATAATTGTAATTTGAAACATCTGCC ACGTGCAAAGTCACGTGACTAAACAACACTCTCAACATAAACCAACAAAACTGGGAAGTC CTCACACACATATTTCCAAA
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>LITCHI027336.m1 GenomeSequence - ACTAAACAACACTCTCAACATAAACCAACAAAACTGGGAAGTCCTCACACACATATTTCC AAAATGTCGAAAATGCCCCCTACCGCCATAACCGAGCCTCTCCTATCGGACTCCGACGCC GACTCCGACAGCGGCCAGACCGACCTCTATCCAGACCTCTCCAACTCCATTTTCAAACCC TACTTAGAATCCACCAATCAATCATCTCTTGGCAGCTCAGACCTCTCGAAGATCAAATCT TTCCTGGCATCATCGTCGTCCGGCGGGCTCTCGTGCCTCATCTGCCTCGAACGGATCCGA CCGGCCGACCCCACTTGGCACTGCTCCTCCCTCTGCTTCTCCATCTTCCACCTCCTCTGC ATCCAGTCATGGGCCCGCCAAGCCTCCGATCTCTCCGCCGCACGTGCCGCCTCCCGCCTA CCCATCTCCGCCGCTAAAGCCGATGGCTTTTCGACCTGGAACTGCCCAAAATGCCGCTTC CAGTACTCAAAATCTCAACTTCCAAAGAGATATGTCTGCTTTTGTGGAAAACTAGAAAAC CCTTTTAGTGAAGACCCGTGGATTTTACCACACTCGTGTGGGGAGGTGTGTGGTAGAGCT TTGAGTGACAATTGTGGGCATTTTTGTCTGCTTTTGTGCCATCCAGGTCCCTGCCCCTCT TGTCCAAAGCTGGTTTCTTCCTCTTGTTTTTGTGGGAAAGTTGAAGATGTTCGTCGTTGT GGATTCAAAGCGTTTTCTTGCAGGAAAACGTGTTGGAAGATGTTGGATTGTAATATGCAT AAGTGTGTGGAAACATGCCATGATGGTGCCTGCCCGCCTTGCAAGGCGAGGGGGGTGTAT AAGTGTCAATGTGGGAAGGTTGAGGAGGAGAGGGAGTGTTGTGAGAGGGATTTTAGGTGT 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