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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI027330 | Chr3 | 22458226 | 22472348 | - | PHD finger protein ALFIN-LIKE 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI027330.m1 | 10 | 136 | PF12165.11 | Alfin | Family | 208.5 | 2.40E-62 |
| LITCHI027330.m1 | 189 | 237 | PF00628.32 | PHD | Domain | 40.3 | 2.40E-10 |
| LITCHI027330.m2 | 11 | 104 | PF12165.11 | Alfin | Family | 156.5 | 2.80E-46 |
| LITCHI027330.m2 | 157 | 205 | PF00628.32 | PHD | Domain | 40.6 | 1.90E-10 |
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>LITCHI027330.m1 ATGGCTAGTGCTTCTTCGAGTCCTCGGTCGGTGGAAGAGATCTTCAAGGACTTCAGCGCC CGTCGCTCCGCTCTCTTGCGCGCTCTCACTTCCGAGGTGGATCAGTTCTACTTGTTCTGC GATCCTGAGAAGGAGAATTTGTCATTGTATGGACACCCGAACGAGGTGTGGGAGGTGGCG CCGCCTCCGGAGGAGGTTCCACCGGAGCTTCCGGAGCCTGCATTGGGCATCAATTTTGCG AGGGATGGCATGCTCCGCAAAGACTGGCTGTCTCTTGTTGCCGTGCATAGCGATTGTTGG CTGCTCTCTGTCGCCTTCTACTTTGGTGCTCGCCTTACTCACAACGATAGGAAGCGTCTA TTTAGCCTAACGAATGATCTTCCCACCCTTTATGAAGTTGTAACCGGAAGGAAGCCTATG AAAGATAAGCCCAATGTGGATGGCAGAAGCAAATCCCGAAACAGCTCTAAGAGATCCATC ACTGGACAGTCAAGGAGCAATAGTAATACCAAGTTACTGGAGGCAAGTTACGAGGAGGAT GAAGATAGTGAGCACAATACTCTTTGTGGCGCCTGTGGACTAAATTACAACGCTGATGAG TTTTGGATTGGTTGTGACATTTGTGAACAGTGGTACCATGGCAAGTGCGTCAAGATAACA CCAGCTAAAGCAGAAACCATCAGGCAGTACAAATGTCCTTCATGCAGCTTCAAGAAGGGA AGGCAGTAG >LITCHI027330.m2 ATGAGTGTTGACTTGTTTGTTGTTGTTGTAGAGAAGGAGAATTTGTCATTGTATGGACAC CCGAACGAGGTGTGGGAGGTGGCGCCGCCTCCGGAGGAGGTTCCACCGGAGCTTCCGGAG CCTGCATTGGGCATCAATTTTGCGAGGGATGGCATGCTCCGCAAAGACTGGCTGTCTCTT GTTGCCGTGCATAGCGATTGTTGGCTGCTCTCTGTCGCCTTCTACTTTGGTGCTCGCCTT ACTCACAACGATAGGAAGCGTCTATTTAGCCTAACGAATGATCTTCCCACCCTTTATGAA GTTGTAACCGGAAGGAAGCCTATGAAAGATAAGCCCAATGTGGATGGCAGAAGCAAATCC CGAAACAGCTCTAAGAGATCCATCACTGGACAGTCAAGGAGCAATAGTAATACCAAGTTA CTGGAGGCAAGTTACGAGGAGGATGAAGATAGTGAGCACAATACTCTTTGTGGCGCCTGT GGACTAAATTACAACGCTGATGAGTTTTGGATTGGTTGTGACATTTGTGAACAGTGGTAC CATGGCAAGTGCGTCAAGATAACACCAGCTAAAGCAGAAACCATCAGGCAGTACAAATGT CCTTCATGCAGCTTCAAGAAGGGAAGGCAGTAG
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>LITCHI027330.m2 - Up_Stream_Len 2000 TCGTTGAAGTTTGTGAGAGGTACAACCTCACTTCTCATTCCATCGTAAAACTCATCACTT GTTTGGATCATTTTGTTGAACAACCAACAACAGGAGTTTGTCTTCCTCCAAAAATCGTCC TGAGTTAATATATATATCTTCTTAGAAAAAAGACTAGTCCTGTAGTTAGATGTATAATGT AGCAGTTTAGCAACTAGTAACCCTTGTTTTAGCCTGTTAATCCCGAAATTTCCTGGGCAG GTTAGGTTTGTCTATTACATGTAATCTATTATAGCAAAAATGTGCTTGTGTGATATATTC TCTATGTACTGAACATTGAAATATCTGATTTTTGTTCCCTGATTTTGATTGTTTACACTG ATGTACATACACTTTCGCTTTTCATTTTGTCAGTAAAGTTGAGAATATTGTAGCATTCTA TTGCCTTCTTGTTCTTGTAAATTTTTGGAATATTATCTTTACAAAAATTGTATGCATTGG ATTTTTTAGACCATTCTCTCTCAAGTGTTTACTAAATTCTGTATTTGTTGGCTGCATTTC TCTCTAGTCATAAAAAGATTGTTACAGAGCGCCCAAGATGTGTATCTTTTGCTAAGAATC TAGAAATATTGGCTGAAGAAATAGAAGCACAGTTTTGCTTCGAAGTTATTTTCTGGGTTT GAAGCTAAAATAATGAAGGATTTTTTGATTCTGTAATCTAAAACTAATACAAAATCCAAA TATATTTCGACGACCAACGACCGAAAGACCAAACAAGAAAGATGGAAAAAATCTACATAC AAGAACTTATACACTAATCCCTAACTTAAAAAGTAAGGTAATTTAGTTTAGACCACTATT ATTTCCTTTTTGGTATGAATTGACTTGATTAATGTAGAGTCTAACTACTGTTAGATTCAT TTGCTTCTATTTAATGAGCGTTTCATAAGTTTTATTTTGAATTCAAGAACTGAAGAGGGT TAAGGGAACATTTCCATCCAAAAAACGATATCATTTAATTCGGTTTTTCTATTTTCTATT CTCTTTATTCCTTAAAAACAATAAAATATTATGTTATAAATCTCTCATTTCTGTTGGACT AAGTGGTTGCATTTATAGCAATGTGAAGCCATAAAAAAAAGGAAAGTTCTATCCATACTA AAACTGTTTTATCCCCATATGCTCATTTGGTCGAACTGTTGGTTTTACTCACAGAATAGA TATGGGAACAATTATTGCATTACGTTTTAAAAAGAAATCCACTTGTGGTTTGGGCAACTA CGCTTAGGTCACCGGTTCTCACAATTTGTTGGTCTTACTCCCACCTGCTATGGGCTGCCT ATCTATTTAATATGGGTTACTTCCTCTCATTATTTAGGAGTTGCTTTATCTTATTTTTTG GGAGTTAATATCTAAGCCGTCCTATAAGTTTATCTCGTTTAGTCTTGACCATCTCTTGAG TAAGTATTAGTACTAAAAAATAATGTATTTATTTGGGCCGGGCCGGGCCAACCCAAAGGC GGAATAGCAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAGGGTGCGATCGAGCAAGAAACGATGTGTGA TTTTGTGAATCAGCGTAGAGAGGGAGGGAGGAGTGAGAGCGAGTAAAGAAAAGCCGTAGA ATCCAAAATCAATGTTGTGGTGGTGGTGGTGGATTTCTCTCGCCATGGTATCACTATAAA AGGTACGCAGACACTCCCAATACGTAGGCTTTGGTATAGTATAGTAGTGTTAGATGCAAT AATGGCTAGTGCTTCTTCGAGTCCTCGGTCGGTGGAAGAGATCTTCAAGGACTTCAGCGC CCGTCGCTCCGCTCTCTTGCGCGCTCTCACTTCCGGTGAAACCCTACCCTACCTTTTTAT TTGGAAATGGTTTGTTGCGATTTGGCTGACGTTTGCTTTTGTTTGCAGAGGTGGATCAGT TCTACTTGTTCTGCGATCCTGGTGTCTCTCTTCTCTTTGCTTTCACTTTCTCGGTTACAT TTTAACAAAATCAAGTTTCA >LITCHI027330.m1 - Up_Stream_Len 2000 TCCACCGAGAGCTCCAAGTCATGGTTACAGGATTTCTATGATCAGAAGGTTGAAACTGTG GTTTTCAAGCAGTTTGATTTTGACCTACTCGCCGAGAAAATTTTTAAAGATATCAATGAG AGCTTCCACAAGATTGTTGGCCCATTATGTTCACTTGAGATCGACACAAAAGTCATGGAG CAATTACTTGCAGCTGCCTATCTATCAGACGAGAAAAGAGTGGTAGAAATTTGGTTGGAG AACGTTCTCAGCAGGGAATTCGTTGAAGTTTGTGAGAGGTACAACCTCACTTCTCATTCC ATCGTAAAACTCATCACTTGTTTGGATCATTTTGTTGAACAACCAACAACAGGAGTTTGT CTTCCTCCAAAAATCGTCCTGAGTTAATATATATATCTTCTTAGAAAAAAGACTAGTCCT GTAGTTAGATGTATAATGTAGCAGTTTAGCAACTAGTAACCCTTGTTTTAGCCTGTTAAT CCCGAAATTTCCTGGGCAGGTTAGGTTTGTCTATTACATGTAATCTATTATAGCAAAAAT GTGCTTGTGTGATATATTCTCTATGTACTGAACATTGAAATATCTGATTTTTGTTCCCTG ATTTTGATTGTTTACACTGATGTACATACACTTTCGCTTTTCATTTTGTCAGTAAAGTTG AGAATATTGTAGCATTCTATTGCCTTCTTGTTCTTGTAAATTTTTGGAATATTATCTTTA CAAAAATTGTATGCATTGGATTTTTTAGACCATTCTCTCTCAAGTGTTTACTAAATTCTG TATTTGTTGGCTGCATTTCTCTCTAGTCATAAAAAGATTGTTACAGAGCGCCCAAGATGT GTATCTTTTGCTAAGAATCTAGAAATATTGGCTGAAGAAATAGAAGCACAGTTTTGCTTC GAAGTTATTTTCTGGGTTTGAAGCTAAAATAATGAAGGATTTTTTGATTCTGTAATCTAA AACTAATACAAAATCCAAATATATTTCGACGACCAACGACCGAAAGACCAAACAAGAAAG ATGGAAAAAATCTACATACAAGAACTTATACACTAATCCCTAACTTAAAAAGTAAGGTAA TTTAGTTTAGACCACTATTATTTCCTTTTTGGTATGAATTGACTTGATTAATGTAGAGTC TAACTACTGTTAGATTCATTTGCTTCTATTTAATGAGCGTTTCATAAGTTTTATTTTGAA TTCAAGAACTGAAGAGGGTTAAGGGAACATTTCCATCCAAAAAACGATATCATTTAATTC GGTTTTTCTATTTTCTATTCTCTTTATTCCTTAAAAACAATAAAATATTATGTTATAAAT CTCTCATTTCTGTTGGACTAAGTGGTTGCATTTATAGCAATGTGAAGCCATAAAAAAAAG GAAAGTTCTATCCATACTAAAACTGTTTTATCCCCATATGCTCATTTGGTCGAACTGTTG GTTTTACTCACAGAATAGATATGGGAACAATTATTGCATTACGTTTTAAAAAGAAATCCA CTTGTGGTTTGGGCAACTACGCTTAGGTCACCGGTTCTCACAATTTGTTGGTCTTACTCC CACCTGCTATGGGCTGCCTATCTATTTAATATGGGTTACTTCCTCTCATTATTTAGGAGT TGCTTTATCTTATTTTTTGGGAGTTAATATCTAAGCCGTCCTATAAGTTTATCTCGTTTA GTCTTGACCATCTCTTGAGTAAGTATTAGTACTAAAAAATAATGTATTTATTTGGGCCGG GCCGGGCCAACCCAAAGGCGGAATAGCAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAGGGTGCGATCG AGCAAGAAACGATGTGTGATTTTGTGAATCAGCGTAGAGAGGGAGGGAGGAGTGAGAGCG AGTAAAGAAAAGCCGTAGAATCCAAAATCAATGTTGTGGTGGTGGTGGTGGATTTCTCTC GCCATGGTATCACTATAAAAGGTACGCAGACACTCCCAATACGTAGGCTTTGGTATAGTA TAGTAGTGTTAGATGCAATA
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>LITCHI027330.m2 GenomeSequence - GTGCGATCGAGCAAGAAACGATGTGTGATTTTGTGAATCAGCGTAGAGAGGGAGGGAGGA GTGAGAGCGAGTAAAGAAAAGCCGTAGAATCCAAAATCAATGTTGTGGTGGTGGTGGTGG ATTTCTCTCGCCATGGTATCACTATAAAAGGTACGCAGACACTCCCAATACGTAGGCTTT GGTATAGTATAGTAGTGTTAGATGCAATAATGGCTAGTGCTTCTTCGAGTCCTCGGTCGG TGGAAGAGATCTTCAAGGACTTCAGCGCCCGTCGCTCCGCTCTCTTGCGCGCTCTCACTT CCGGTGAAACCCTACCCTACCTTTTTATTTGGAAATGGTTTGTTGCGATTTGGCTGACGT TTGCTTTTGTTTGCAGAGGTGGATCAGTTCTACTTGTTCTGCGATCCTGGTGTCTCTCTT CTCTTTGCTTTCACTTTCTCGGTTACATTTTAACAAAATCAAGTTTCAATGAGTGTTGAC TTGTTTGTTGTTGTTGTAGAGAAGGAGAATTTGTCATTGTATGGACACCCGAACGAGGTG TGGGAGGTGGCGCCGCCTCCGGAGGAGGTTCCACCGGAGCTTCCGGAGCCTGCATTGGGC ATCAATTTTGCGAGGGATGGCATGCTCCGCAAAGACTGGCTGTCTCTTGTTGCCGTGCAT AGCGATTGTTGGCTGCTCTCTGTCGCCTTCTACTTTGGTGCTCGCCTTACTCACAACGAT AGGTACCATTACCTCATCATCTTCTACGTTACCTGTGTTGGAGAAATTGGGCCTCTCTTT TGAAAGATGCATATGTTTCCATTCCAACATTAGCTAGGCTATTGTAAAGGATTTGCCTTT GCATTTATTCTTTGCTATATAAAATTTGTTCCATTGGACGTCGCATTTAGTTTTGTTGTT 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