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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI027330 | Chr3 | 22458226 | 22472348 | - | PHD finger protein ALFIN-LIKE 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI027330.m1 | 10 | 136 | PF12165.11 | Alfin | Family | 208.5 | 2.40E-62 |
| LITCHI027330.m1 | 189 | 237 | PF00628.32 | PHD | Domain | 40.3 | 2.40E-10 |
| LITCHI027330.m2 | 11 | 104 | PF12165.11 | Alfin | Family | 156.5 | 2.80E-46 |
| LITCHI027330.m2 | 157 | 205 | PF00628.32 | PHD | Domain | 40.6 | 1.90E-10 |
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>LITCHI027330.m1 ATGGCTAGTGCTTCTTCGAGTCCTCGGTCGGTGGAAGAGATCTTCAAGGACTTCAGCGCC CGTCGCTCCGCTCTCTTGCGCGCTCTCACTTCCGAGGTGGATCAGTTCTACTTGTTCTGC GATCCTGAGAAGGAGAATTTGTCATTGTATGGACACCCGAACGAGGTGTGGGAGGTGGCG CCGCCTCCGGAGGAGGTTCCACCGGAGCTTCCGGAGCCTGCATTGGGCATCAATTTTGCG AGGGATGGCATGCTCCGCAAAGACTGGCTGTCTCTTGTTGCCGTGCATAGCGATTGTTGG CTGCTCTCTGTCGCCTTCTACTTTGGTGCTCGCCTTACTCACAACGATAGGAAGCGTCTA TTTAGCCTAACGAATGATCTTCCCACCCTTTATGAAGTTGTAACCGGAAGGAAGCCTATG AAAGATAAGCCCAATGTGGATGGCAGAAGCAAATCCCGAAACAGCTCTAAGAGATCCATC ACTGGACAGTCAAGGAGCAATAGTAATACCAAGTTACTGGAGGCAAGTTACGAGGAGGAT GAAGATAGTGAGCACAATACTCTTTGTGGCGCCTGTGGACTAAATTACAACGCTGATGAG TTTTGGATTGGTTGTGACATTTGTGAACAGTGGTACCATGGCAAGTGCGTCAAGATAACA CCAGCTAAAGCAGAAACCATCAGGCAGTACAAATGTCCTTCATGCAGCTTCAAGAAGGGA AGGCAGTAG >LITCHI027330.m2 ATGAGTGTTGACTTGTTTGTTGTTGTTGTAGAGAAGGAGAATTTGTCATTGTATGGACAC CCGAACGAGGTGTGGGAGGTGGCGCCGCCTCCGGAGGAGGTTCCACCGGAGCTTCCGGAG CCTGCATTGGGCATCAATTTTGCGAGGGATGGCATGCTCCGCAAAGACTGGCTGTCTCTT GTTGCCGTGCATAGCGATTGTTGGCTGCTCTCTGTCGCCTTCTACTTTGGTGCTCGCCTT ACTCACAACGATAGGAAGCGTCTATTTAGCCTAACGAATGATCTTCCCACCCTTTATGAA GTTGTAACCGGAAGGAAGCCTATGAAAGATAAGCCCAATGTGGATGGCAGAAGCAAATCC CGAAACAGCTCTAAGAGATCCATCACTGGACAGTCAAGGAGCAATAGTAATACCAAGTTA CTGGAGGCAAGTTACGAGGAGGATGAAGATAGTGAGCACAATACTCTTTGTGGCGCCTGT GGACTAAATTACAACGCTGATGAGTTTTGGATTGGTTGTGACATTTGTGAACAGTGGTAC CATGGCAAGTGCGTCAAGATAACACCAGCTAAAGCAGAAACCATCAGGCAGTACAAATGT CCTTCATGCAGCTTCAAGAAGGGAAGGCAGTAG
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>LITCHI020970.m2 - Up_Stream_Len 2000 GTCATCAAGGAGTAAGGATTGTTTGCTAGATTATTGTTTTTACCAAACTTTTTGTAATAG GAGTTTAAACTTAAGTTACGTATGAAAGAAAACAATATACAAGTTTTGATCATCTATTAT TTTTTTTGTTGATGTGTCATTAGACTATCAAAAGTCTAGTCAAAAAAAATAAAAAATGAC TCGCCATCACAAGGGTGGCTTTGTTACGTGTGAAGATTCAATTTTCATAGAAAGAAAGAT CTCCTCCACATATGGAGGAGACCTATTCACCCTTTTGATTGGAGGTCCAACATTTTCCCT CCAAAGTATAGGAGATTCAATAAGACTACTCCATAAGGAAGAGATCATCCACCTCTCCGC TGTGTTCTTATTCATCTTCTTCCATTTCTTTTCAGATTTAAATCCAATTTTGGTTTCTGA TTTTTTAATTAATTAACATAATTAGATTTTTTTTTTAATTATCGGGACTAATTCAGAGGA CTATCAGGACGAAATGGAATGAGACACTTGTTGTACGATCCGAAGAGTAGCTCTCATAAG AAAAAACTCCACTCACACGAAGATAAGAGGATGACCCACACAAGGTGGGATAAGACAGCC ATATAGAGGTTGTACTGCTTAGTGTCAAACCCAAATTCACATGAAAGTTAGGGGTGCTGC CAACCACTTTGGCAAAAACCAATGACTAATATAATTATATTTTAATATTGTAATTAAATT GTAATTTGATTGATTTTTTTTAATTGAAATATCTCATTATTTGGGGCATTTTCAACTTTC AAATTTTTCATCCAATCAATGGTTTAAAGTAGCCATGGTCAACATTTATCCGCATAGTTA ATGCATAAGTTGCATATACATGCAATGGGGCCAAAATTTAGGAATATTCGTACAATTTGT CCCTTTATTTAAATGTCCAAAGATAAAAGTTTGTAACTTCCCCGGTTTAATAAAAATAAG ACCTAAGCTTCACAGGTTAATTGTGTACTCGCAATTACTTTTCCTCCGCCGACTTAGCAA TCTGTAAAAGGTTGAATTAAACCTGGATTGAATTTTAAGTTACAATTTTAATTAATTGAT TATCAATGTAAATATATATGTAGTTAAATACCATAGTCCACTATGACATATTAATAGAGA ACACTCTCTGATAATATATGATATCTGAATCATTACACGTGATTTTTGAGATACTATCTT CAATGTGGATTACTCAAATCTAGAATATTATCAAGTTTGATGATATTTCAATCACTAAAC TATACGTGACGGTGATTGTTATATGTAGTTGATATTAAAAATACCATTTGTGGTACAATG ATTGGAATATTATAGTATCTAACTGGAATATTATAGTGTGCAGTTTTTACCATCGATTCA CATTGAATAGTGGTAAAATTGGGCTAAAATTGTATAATCTTGTTTTTATTGTCATACCAA TTCATAATGCAACTCAGCAATCCCTCCTGTCACACTTGATTTTTCAACATCCCAATCAAC CTTGATATCTAACAAGATTTGGTAATTACAATTTAATAAATAAGAAAATCTAGATTTGTT ACCTATAAAACATAGATACATTTCTTTATTATACATATTTTTAATATACATTAACTTATA TAAATCTCTTGAAGGCTCTTATTATTCTTGTGATCTACCAAAACCCTAATCAACTCTCCC CAGAAACCATTGTTTTTATATACACTGACAATCTTTCCGTGCACTCTAGCTAGACAAAGA TCTTTTGCTATTCATCATCTTCTTGCTTTCCATATTATTTATACAAACATCCCCTTTTCG TTCTCATCCAAAAAAATCTTCATATAAGGTTTGTATCTTACTCTAGTTCGATTTCTCCCA CTAATTTCTATTTTACTTGCGTCATAGTGATTTGTATATGGTGTGATAACTTTTGTTAAC AATATAGACAAAGTTGGTGCTATTATTGTTATTGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTA TATATACAATTGGTCTTAGG >LITCHI020970.m1 - Up_Stream_Len 2000 GTCATCAAGGAGTAAGGATTGTTTGCTAGATTATTGTTTTTACCAAACTTTTTGTAATAG GAGTTTAAACTTAAGTTACGTATGAAAGAAAACAATATACAAGTTTTGATCATCTATTAT TTTTTTTGTTGATGTGTCATTAGACTATCAAAAGTCTAGTCAAAAAAAATAAAAAATGAC TCGCCATCACAAGGGTGGCTTTGTTACGTGTGAAGATTCAATTTTCATAGAAAGAAAGAT CTCCTCCACATATGGAGGAGACCTATTCACCCTTTTGATTGGAGGTCCAACATTTTCCCT CCAAAGTATAGGAGATTCAATAAGACTACTCCATAAGGAAGAGATCATCCACCTCTCCGC TGTGTTCTTATTCATCTTCTTCCATTTCTTTTCAGATTTAAATCCAATTTTGGTTTCTGA TTTTTTAATTAATTAACATAATTAGATTTTTTTTTTAATTATCGGGACTAATTCAGAGGA CTATCAGGACGAAATGGAATGAGACACTTGTTGTACGATCCGAAGAGTAGCTCTCATAAG AAAAAACTCCACTCACACGAAGATAAGAGGATGACCCACACAAGGTGGGATAAGACAGCC ATATAGAGGTTGTACTGCTTAGTGTCAAACCCAAATTCACATGAAAGTTAGGGGTGCTGC CAACCACTTTGGCAAAAACCAATGACTAATATAATTATATTTTAATATTGTAATTAAATT GTAATTTGATTGATTTTTTTTAATTGAAATATCTCATTATTTGGGGCATTTTCAACTTTC AAATTTTTCATCCAATCAATGGTTTAAAGTAGCCATGGTCAACATTTATCCGCATAGTTA ATGCATAAGTTGCATATACATGCAATGGGGCCAAAATTTAGGAATATTCGTACAATTTGT CCCTTTATTTAAATGTCCAAAGATAAAAGTTTGTAACTTCCCCGGTTTAATAAAAATAAG ACCTAAGCTTCACAGGTTAATTGTGTACTCGCAATTACTTTTCCTCCGCCGACTTAGCAA TCTGTAAAAGGTTGAATTAAACCTGGATTGAATTTTAAGTTACAATTTTAATTAATTGAT TATCAATGTAAATATATATGTAGTTAAATACCATAGTCCACTATGACATATTAATAGAGA ACACTCTCTGATAATATATGATATCTGAATCATTACACGTGATTTTTGAGATACTATCTT CAATGTGGATTACTCAAATCTAGAATATTATCAAGTTTGATGATATTTCAATCACTAAAC TATACGTGACGGTGATTGTTATATGTAGTTGATATTAAAAATACCATTTGTGGTACAATG ATTGGAATATTATAGTATCTAACTGGAATATTATAGTGTGCAGTTTTTACCATCGATTCA CATTGAATAGTGGTAAAATTGGGCTAAAATTGTATAATCTTGTTTTTATTGTCATACCAA TTCATAATGCAACTCAGCAATCCCTCCTGTCACACTTGATTTTTCAACATCCCAATCAAC CTTGATATCTAACAAGATTTGGTAATTACAATTTAATAAATAAGAAAATCTAGATTTGTT ACCTATAAAACATAGATACATTTCTTTATTATACATATTTTTAATATACATTAACTTATA TAAATCTCTTGAAGGCTCTTATTATTCTTGTGATCTACCAAAACCCTAATCAACTCTCCC CAGAAACCATTGTTTTTATATACACTGACAATCTTTCCGTGCACTCTAGCTAGACAAAGA TCTTTTGCTATTCATCATCTTCTTGCTTTCCATATTATTTATACAAACATCCCCTTTTCG TTCTCATCCAAAAAAATCTTCATATAAGGTTTGTATCTTACTCTAGTTCGATTTCTCCCA CTAATTTCTATTTTACTTGCGTCATAGTGATTTGTATATGGTGTGATAACTTTTGTTAAC AATATAGACAAAGTTGGTGCTATTATTGTTATTGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTA TATATACAATTGGTCTTAGG
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>LITCHI020970.m2 GenomeSequence - TATAAATCTCTTGAAGGCTCTTATTATTCTTGTGATCTACCAAAACCCTAATCAACTCTC CCCAGAAACCATTGTTTTTATATACACTGACAATCTTTCCGTGCACTCTAGCTAGACAAA GATCTTTTGCTATTCATCATCTTCTTGCTTTCCATATTATTTATACAAACATCCCCTTTT CGTTCTCATCCAAAAAAATCTTCATATAAGGTTTGTATCTTACTCTAGTTCGATTTCTCC CACTAATTTCTATTTTACTTGCGTCATAGTGATTTGTATATGGTGTGATAACTTTTGTTA ACAATATAGACAAAGTTGGTGCTATTATTGTTATTGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTGTT TATATATACAATTGGTCTTAGGATGGAAAGGAATATCAACAACAACAGTGCGCATCCAGC ATGCGCTGCATGCAAGCATCAAAGGAAAAAATGCAGTAATGAATGCATACTTGCACAGTA TTTTCCAGCCACCAGAACCCGAGAATTTCAGGCTGTTCACAAGGTATTCGGCGTCAGTAA CGTGACAAAGATAGTCCGCAATGCCAGGGTAGAAGATAGACACAAAGTCGCAGATTCTCT AATCTGGGAGGCCCTTTGCAGGCAAAAAGATCCTATTCTAGGTTCATATGGGGAGTATAA GAGAATATATGAAGAGCTTAAGTTGTACAAAAGTCAAGGACAAGGACTGATGCAACTTCA AAATCAAAATTATCAATTGGGGCAGTTGCCAGGACAAGGAGGGATGGCTTATATACCTGG ACAGCCTAATTTATTGGGATGGAACACTGACGATGGTTTTGTTAACAATATTAACAACGG ATTGAGTTATAATAATAATCATGATCATGATGGGAATTCGATTGTTGATTCGGATAGTTA TTGTTACTCTTCACAGTTTGTGCAAAGTCCAAGGAAATTGAAGCACGAAATTAGAGAAGT TGGTTCAGCTGTTATTCCATTGCAGCAGCAACAACCCATCAATAGGTTCAGCCAGCAATA CTACAATATTCCGGGTAACTTAGTTAATTACTTAATTTAGCGGAAGACTTCTTATATTGG GATATGCCTTTAGAATTATTATTTTTATCATTATTATGATTTTGAAATATAATTTGTGAT AAAATAATTCGAATTATGTCATTGTTGAATTGAATAAACACTAATAGTTATGATGCCTTT AGAATTATTATTTTTTAAACCTTTAGAAGTTTTTTTGACAGATGCTTATATGTTTGTTTT ATCACAAAGGGGCCCTTTATTTTCTTTCTTTAATCATAAATCTAATGAAAAATTCTCTTA TTTCTTATATATATTTTAGGTCAATTCAATTAAATCGATGGCAAGATGATGGAAAGCAGA ATATGGATAGAGAAAGCATGGTTCCTTAACTTTTTTGATTGAAGGCTCTCATCTTCATAG TTGTCATCCTCCTTCTCCTCTTGTATGGAAGGCATATATACAATAATTTATTTTGTTTTT GTCTGAAGGGGAATTATAAAATTCATTGCTCTTTTTTTTTATTTCTTCGCATTTCTCACT TGAATCATAATTATTATTAATAATATGGTCCGCTTTTGCTTCACAAGTTAATTAGTTTGG AATCTGTCTGAACGAGCTTTATTCCCA >LITCHI020970.m1 GenomeSequence - TATAAATCTCTTGAAGGCTCTTATTATTCTTGTGATCTACCAAAACCCTAATCAACTCTC CCCAGAAACCATTGTTTTTATATACACTGACAATCTTTCCGTGCACTCTAGCTAGACAAA GATCTTTTGCTATTCATCATCTTCTTGCTTTCCATATTATTTATACAAACATCCCCTTTT CGTTCTCATCCAAAAAAATCTTCATATAAGGTTTGTATCTTACTCTAGTTCGATTTCTCC CACTAATTTCTATTTTACTTGCGTCATAGTGATTTGTATATGGTGTGATAACTTTTGTTA ACAATATAGACAAAGTTGGTGCTATTATTGTTATTGTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTGTT TATATATACAATTGGTCTTAGGATGGAAAGGAATATCAACAACAACAGTGCGCATCCAGC ATGCGCTGCATGCAAGCATCAAAGGAAAAAATGCAGTAATGAATGCATACTTGCACAGTA TTTTCCAGCCACCAGAACCCGAGAATTTCAGGCTGTTCACAAGGTATTCGGCGTCAGTAA CGTGACAAAGATAGTCCGCAATGCCAGGGTAGAAGATAGACACAAAGTCGCAGATTCTCT AATCTGGGAGGCCCTTTGCAGGCAAAAAGATCCTATTCTAGGTTCATATGGGGAGTATAA GAGAATATATGAAGAGCTTAAGTTGTACAAAAGTCAAGGACAAGGACTGATGCAACTTCA AAATCAAAATTATCAATTGGGGCAGTTGCCAGGACAAGGAGGGATGGCTTATATACCTGG ACAGCCTAATTTATTGGGATGGAACACTGACGATGGTTTTGTTAACAATATTAACAACGG ATTGAGTTATAATAATAATCATGATCATGATGGGAATTCGATTGTTGATTCGGATAGTTA TTGTTACTCTTCACAGTTTGTGCAAAGTCCAAGGAAATTGAAGCACGAAATTAGAGAAGT TGGTTCAGCTGTTATTCCATTGCAGCAGCAACAACCCATCAATAGGTTCAGCCAGCAATA CTACAATATTCCGGGTAACTTAGTTAATTACTTAATTTAGCGGAAGACTTCTTATATTGG GATATGCCTTTAGAATTATTATTTTTATCATTATTATGATTTTGAAATATAATTTGTGAT AAAATAATTCGAATTATGTCATTGTTGAATTGAATAAACACTAATAGTTATGATGCCTTT AGAATTATTATTTTTTAAACCTTTAGAAGTTTTTTTGACAGATGCTTATATGTTTGTTTT ATCACAAAGGGGCCCTTTATTTTCTTTCTTTAATCATAAATCTAATGAAAAATTCTCTTA TTTCTTATATATATTTTAGGTCAATTCAATTAAATCGATGGCAAGATGATGGAAAGCAGA ATATGGATAGAGAAAGCATGGTTCCTTAACTTTTTTGATTGAAGGCTCTCATCTTCATAG TTGTCATCCTCCTTCTCCTCTTGTATGGAAGGCATATATACAATAATTTATTTTGTTTTT GTCTGAAGGGGAATTATAAAATTCATTGCTCTTTTTTTTTATTTCTTCGCATTTCTCACT TGAATCATAATTATTATTAATAATATGGTCCGCTTTTGCTTCACAAGTTAATTAGTTTGG AATCTGTCTGAACGAGCTTTATTCCCA