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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI027327 | Chr3 | 22410739 | 22413091 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 29 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI027327.m1 | 82 | 182 | PF12796.10 | Ank_2 | Repeat | 38.1 | 1.90E-09 |
LITCHI027327.m1 | 115 | 167 | PF13637.9 | Ank_4 | Repeat | 26.1 | 1.00E-05 |
LITCHI027327.m1 | 149 | 183 | PF00023.33 | Ank | Repeat | 19.2 | 0.0013 |
LITCHI027327.m1 | 305 | 325 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 24.3 | 2.30E-05 |
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>LITCHI027327.m1 ATGTTGTTTGTTCATGTTGTTTTAGTTGGTTTCTATGTTTCTCTGCTGGCTTTTCATTGG TTTGTAACATGGGGTTGGTTAGAGTCGCTTAAGATTGGTAAAGTCGGAGTTGGTGTGTGC AGTGGTTCAAGCTGTGAACTTTGCACCTCAGATTCGCTCATGGAAGGTGAATCTATCAAC ATAAATGGTGGTTTGTATAAAAAATGCTCTCTTTTGCTTGAATTGTCAGCCTCTGATGAT GTTGAGTCATTCAAGAGTGTAATAGAAGAAAAGGGTTTTGATGTTGATGAGGCTAGCTTG TGGTATGGTAGGAGATTTGGGTCGAAAAAGATGGGGTTTGACGAGAGAACCCCACTTATG ATAGCTGCCATCTTTGGTAGTAGAAGGGTTTTGAAGTATATTATTGGAAGTGGTAAGGTA GATGTGAATAGGGCCTGTGGTTGTGATGGAGTCACTGCACTGCACTGTGCTGTTGCTGGT GGCGCCATCTCTTCGGTTGAGGCCGTCAAGCTGTTGCTTGATGCCTCTGCTGATGCTAAT TGTGTTGATGCTAGTGGGAATAAGCCGATTGATCTTGTTGCTGTCTCGATGAAATCGCCA CGAATTGGTGGGAAAAGGGCAATTGAGTTGTTGTTGAAAGGTGATCAATCTGTGATTGTA GAGGAAGAATTGGAGAAACTGAAGATGCCTCAGTTGTCAAAAGAAGGGCTAGAGAAGAAA GAGTATCCAATTGATGTCTCTTTGCCTGACATAAATAACGGGATATATGGTTCCGATGAG TTTAGGATGTACACATTCAAGGTCAAGCCTTGCTCGAGGGCTTATTCGCATGATTGGACT GAGTGTCCCTTTGTTCACCCTGGTGAGAACGCCAGGAGGAGAGACCCTAGGAAGTACCCT TACAGCTGTGTCCCTTGCCCTGAGTTTCGCAGGGGTTCGTGCCCCAAAGGGGATGCTTGT GAGTATGCACACGGTGTGTTTGAGTCCTGGTTGCATCCTGCTCAGTACAGAACCCGGCTT TGCAAGGATGAGGTTGGTTGCACACGCAAAGTTTGTTTCTTTGCACACAAACCTGAAGAG TTGCGCCCTGTGTATGCATCCACTGGCTCAGCTATGCCTTCACCAAGCTCTATTGCCGCC AGTGCTGTAGATATAGGGACTTTGAGTCCGTTGTCGCTTGGTTCAGTATCTTTACCGTTG CCCACTACTTCGACACCACCAATGTCTCCGTTGGCCACTGCCTCGTCTCCAAAGAGTGCA AGCTTGTGGCAGAACAAAGTCAATCTCACCCCACCTGCCTTGCAGTTGTCCGGTAGCCGG TTGAAGACTGCTGTCAATGCTAGAGACTTGGACATGGAGATGGAATTGCTTGGGCTAGAA AACTATGCTAACAATTTGCAGCTGCAGCAGCAATTAATGGAGGAGATATCAAGCCTCCCG TCACCATCTCGTTGGAGCAATGAATATGCCAGACTCGGAGATTTGAAGCGCACGAATGGT GAAGATGTTCTGGAGTCTCTTGATTCCTCCATGTTGTCTCAACTTCAGGGGATGTCACTA AAACAATCAACACCAACTCAGTTGCAATGTCCAACCGGGCATCAAATTCGTCAAAGCACG AACCAACTTCGCGCAGGTTACCCCGGTGCCAACCTCTCATCCTCTCCTGTTAGGAAGCCC TCATCATTCGGGTATGATTCATCTGCTGCGGTGGCAGCTGCAGTTATGAATTCAAGGTCG TCTGCCTTTGCAAAGCGAAGCCAGAGTTTCATTGACCGTGGAGCCGTGACAAGTCGTGCT GGCCTTACTGCAACTACCAATTCTGCGTCTGTGATGTGTTCCGACCTATCAGGTTGGGGC TCTCCTAGTGGGAAAGTGGATTGGGGAATTCAGGGAGACGAGCTGACCAAGCTTAAGAAG TCTGCTTCATTCGGGTTTCGAAGCAACAATCTAACTAAAACACCATCACCACCAACAGCA AACTATATGGCATCAACAAATGTTGATGAGCCAGATGTGTCCTGGGTTAATTCCTTGGTG AGAGATGTTCCTCCAGTTGGAGCTGGCCTTTTCGGTTCGGAGAAGCAGCAATATAGTCCA TGGGGGGAGCAACTGTACATAGAACAGAAGCAGATGGTGGCCTAA
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>LITCHI027327.m1 - Up_Stream_Len 2000 TGGATGTGAAACCATTGCATAACATAAATTTATCTAGTGAACATAAGATGAATGAGCAAC GTGAACAAATTGCAATTCTTCTTATGCATCGAAATTAATTAGTTTATGTTATTTGTATTA ATTTTCAATTGGAAGAATTTTGTTATTGTTATACTTTGAGTTTTTGGTATTTTATTTGAA AATACTTTCATTTTATAATATTTTGTAATTTTTTTAATTATAAATATAGTATTTTCTCAA ATATTAGTTTATAATATTTTATTTTATTTTAAATGTTATTTTTGATAATTTTATAACTTA ATTTTAAATATAATATAATTAAACGATCTATAATTTTTAAAAAATTATAATTTAAAAGAG TTTTTTTTTAATTAATAATCAAACGATTAATAATATATTTTTAAAAGCCTTATTAATAAA AGCTTACTTATAAAAGATATATTTATAAGAAGCCATACTACTTGTAGTATCTAGCATGAT TTAAATTAGTTTTTATTGGCCGTCAGTCTATGTTGTCAAAGACATGCATGTAGTATGTTT GGTCCTCCGATTAATGACTTGGTAGGTTTGATAGGTTAGGAATTGAAAATATTATTGAGG GAAAGGCAAGGTCAACATTTTTGGTGCGAGAAAATACAAAAGAAGTGGACAAACAAAACA GAGAGAGAGAGAGAGACTAACTAAAGTGAGAGCTGAGAAGACGGAGAAGAATGGTCCATA GTGGAGGGCTGAGTGGGGCATATCCTGTCACCCACCTAGTTTCCTATTATCACAACGCGT TTTGCTTCTTCTTCCTGTTCACTTCGTTTTACACTTTCTCAACTCTCCACTCTCACCCCA ATGCGCGTCTACTGACCACCCAACCAATTTCACCCCTTTGTTCTTGGTAACATACACGTT AGAGTATAAATATCTAAAATAGGTGTCATTATTTATCGGTTGAGGTTACAATTTTACTCT TTCAATTCATTATCCAATTTATAAAGTTAGAGAGTTAGACAGCGGTTAACAATATTTCAT TTAATACCTTTATGATATAAGAGAAAAATTATTTCTATTATCAATTTATCTCTCATTATT AATAATAATAATAAATTAATTAAAATAAAAATTTATATAATGAAGATCTTCTCCTAATGT TCATTCTTTTTTCTCTTTTCTAGATTATTTTGTAATTTAAGAATACAGTTTAATATTAAC TTATTTAGATATAATCACATTTGTTTAAATTTATAATTTGTTATATATAATGTTTAATAA TAAAATTCTTCTTATTTAAAAAAAAAAAAGAAGAAACACATACAGTCTGATTCAGCCATT ATTACCACTAGACTTCTAACCTAGCAGCTGCATTTAACATTTATATAAATCTACGTGTCA ATCTTGATTCTTCATAATCGTTAAACTACGTCGAGTTTGGATAAAAAAATCCAAAGAATT CAACCGGCAATATTAAAGTGATGGTGAGTGAGAGAGAAGCGCGTCAACAGAGGGATTCAC GCATGACTGACAACCCATCAACACGGAACCAGTAACATATATCTGAAAAAAAGTGGGGTC CCCAAAAGTTTAACTCTCCAAGACCAAACCAGTCGAGTTTAAGATTCCAGAAATGTAGTT CATTTGCATGTGCATGTCATTTGAGTTTCATTTCTCAAAACTTGTTCAGGGAAGAGAAGT GTCTCTGTCTTCCCTTGCTTTGAAGTTTTGACTTTGACCCACTAAATTAAAAAACAAAGA AGACCAAAGAAACTGAGACGAAGAAAAGTCTCACTTTCCTTCCACCTTCTTCTTCTACTA TCCAAAGAAGCTCATAAAAACCCCCCCTCAACTCCCCTTCTCGCTGCATATTCAAACCTC ACACCCACCTTCCTGACTTGGGTTCCCTTTTTCTCTTACTCTTTAAATAAAAAAACGAAA GCACACATCTTCTCTACCTCTCTTACAAGTCTTTGATATTCACAAGGTACTTTTTATTTT TCGCTTCAAGGGGTTCACAG
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>LITCHI027327.m1 GenomeSequence - ATGTTGTTTGTTCATGTTGTTTTAGTTGGTTTCTATGTTTCTCTGCTGGCTTTTCATTGG TTTGTAACATGGGGTTGGTTAGAGTCGCTTAAGATTGGTAAAGTCGGTTAGCTTTGAATG TTTGATGCTTTCAACTTTCAAAGCTGGTTAAATTTAGTTACTTTTTAGTCGATTTCTATG TTCTGTTCTTAAAAGTTGATATATATAAAATATATATATTTTTCATGTGTGAGTATGCAT CTGTGATTTTTTGTCGATGGTTTGTTTTGGATATGGTGGTTATATTGAATTTTCTGTTGT TTGTGGATGTGCAGGAGTTGGTGTGTGCAGTGGTTCAAGCTGTGAACTTTGCACCTCAGA TTCGCTCATGGAAGGTGAATCTATCAACATAAATGGTGGTTTGTATAAAAAATGCTCTCT TTTGCTTGAATTGTCAGCCTCTGATGATGTTGAGTCATTCAAGAGTGTAATAGAAGAAAA GGGTTTTGATGTTGATGAGGCTAGCTTGTGGTATGGTAGGAGATTTGGGTCGAAAAAGAT GGGGTTTGACGAGAGAACCCCACTTATGATAGCTGCCATCTTTGGTAGTAGAAGGGTTTT GAAGTATATTATTGGAAGTGGTAAGGTAGATGTGAATAGGGCCTGTGGTTGTGATGGAGT CACTGCACTGCACTGTGCTGTTGCTGGTGGCGCCATCTCTTCGGTTGAGGCCGTCAAGCT GTTGCTTGATGCCTCTGCTGATGCTAATTGTGTTGATGCTAGTGGGAATAAGCCGATTGA TCTTGTTGCTGTCTCGATGAAATCGCCACGAATTGGTGGGAAAAGGGCAATTGAGTTGTT GTTGAAAGGTGATCAATCTGTGATTGTAGAGGAAGAATTGGAGAAACTGAAGATGCCTCA GTTGTCAAAAGAAGGGCTAGAGAAGAAAGAGTATCCAATTGATGTCTCTTTGCCTGACAT AAATAACGGGATATATGGTTCCGATGAGTTTAGGATGTACACATTCAAGGTCAAGCCTTG CTCGAGGGCTTATTCGCATGATTGGACTGAGTGTCCCTTTGTTCACCCTGGTGAGAACGC CAGGAGGAGAGACCCTAGGAAGTACCCTTACAGCTGTGTCCCTTGCCCTGAGTTTCGCAG GGGTTCGTGCCCCAAAGGGGATGCTTGTGAGTATGCACACGGTGTGTTTGAGTCCTGGTT GCATCCTGCTCAGTACAGAACCCGGCTTTGCAAGGATGAGGTTGGTTGCACACGCAAAGT TTGTTTCTTTGCACACAAACCTGAAGAGTTGCGCCCTGTGTATGCATCCACTGGCTCAGC TATGCCTTCACCAAGCTCTATTGCCGCCAGTGCTGTAGATATAGGGACTTTGAGTCCGTT GTCGCTTGGTTCAGTATCTTTACCGTTGCCCACTACTTCGACACCACCAATGTCTCCGTT GGCCACTGCCTCGTCTCCAAAGAGTGCAAGCTTGTGGCAGAACAAAGTCAATCTCACCCC ACCTGCCTTGCAGTTGTCCGGTAGCCGGTTGAAGACTGCTGTCAATGCTAGAGACTTGGA CATGGAGATGGAATTGCTTGGGCTAGAAAACTATGCTAACAATTTGCAGCTGCAGCAGCA ATTAATGGAGGAGATATCAAGCCTCCCGTCACCATCTCGTTGGAGCAATGAATATGCCAG ACTCGGAGATTTGAAGCGCACGAATGGTGAAGATGTTCTGGAGTCTCTTGATTCCTCCAT GTTGTCTCAACTTCAGGGGATGTCACTAAAACAATCAACACCAACTCAGTTGCAATGTCC AACCGGGCATCAAATTCGTCAAAGCACGAACCAACTTCGCGCAGGTTACCCCGGTGCCAA CCTCTCATCCTCTCCTGTTAGGAAGCCCTCATCATTCGGGTATGATTCATCTGCTGCGGT GGCAGCTGCAGTTATGAATTCAAGGTCGTCTGCCTTTGCAAAGCGAAGCCAGAGTTTCAT TGACCGTGGAGCCGTGACAAGTCGTGCTGGCCTTACTGCAACTACCAATTCTGCGTCTGT GATGTGTTCCGACCTATCAGGTTGGGGCTCTCCTAGTGGGAAAGTGGATTGGGGAATTCA GGGAGACGAGCTGACCAAGCTTAAGAAGTCTGCTTCATTCGGGTTTCGAAGCAACAATCT AACTAAAACACCATCACCACCAACAGCAAACTATATGGCATCAACAAATGTTGATGAGCC AGATGTGTCCTGGGTTAATTCCTTGGTGAGAGATGTTCCTCCAGTTGGAGCTGGCCTTTT CGGTTCGGAGAAGCAGCAATATAGTCCATGGGGGGAGCAACTGTACATAGAACAGAAGCA GATGGTGGCCTAA