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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI027239 | Chr3 | 20071113 | 20076065 | - | NAC domain containing protein 52 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI027239.m1 | 26 | 166 | PF02365.18 | NAM | Family | 141.5 | 2.10E-41 |
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>LITCHI027239.m1 ATGGATTGTGAAACTCTTCCATCCAAAAGCACCCTTAAAACAATCCAACCAAACGCCACA ACAACAGCACTTGCACCTGGGTTTCGATTCCACCCAACTGATGAGGAGCTAGTAAGCTAT TACTTGAAGAGGAAAATCACTAACAAAGCTTTTCACTTCGATGCCATTGCAGAAGTTGAT ATCTATAAAAATGAGCCATGGGACCTCGCTGGGTTGCATCTGAATTTGATACTTTGTTTG TTTATGGGTGTTGAAGCTTATTCAAGGTTGAAGACCAAGGATCAAGTGTGGTACGTTTTC AATGCATTAGATAAGAAGTTCAAAAGTGGGGCAAGAATGAATAGGACAACAGGTACAGGG TATTGGAAATCAACAGGGAAGGATCATGAGATTCGCCATAATACACAACTTGTTGGAATG AAAAAAACCCTTGTATTCCATAATAGGCATGTTTCAGATAAGCAACGGACCAATTGGGTT ATGCATGAATATCGTCTTGTTGATGAGGAAAACGACAAAATTCAGGTCGGACAGGATACA TATACACTATGCAGAGTGTTTCACAAGACCAATAGAAGTGCATTATATGCACCATTTAAC GAAGAGGAATGGGATGACGGCAACGCAACTTTTCCAGGAGAAGATGCCAAAGATGATCTA GTTGCTAGTGATGATGCATATGTTGAAATGAATGGTGTTGAAACCGTGAATGATGATCAG AAGTTTTCTTCATCAAATGTCACTCAGCATTCTGAATGCATGAATAAGGATCCTCCATTG CAGACTTCTGAGCCAAAGAATAAGGAAATTCTGAACATTAATGAACTTCCAACAGATGCT CAGGCTCCTCTTCCTCTTCTCCAATACAAGAGAAGGAGGCAAAACGACTCAGGGTACATT CAATCCTATGTTCCGGGAAACTCAAGTGGGACTGGTCAGGATCCTTCCTCTGCAGAAAAA ACAATGTCTACTTCAGCAACAACGACAGTATCGCTGGAGTTCCCTCTGTCAGAGCCTATT CTGACCAAGGACAGCGTTCGACTTTTCGGGGTTACGTTAGCTAACCATAGTGATTCGTCA GTGTCCCCTAGGTATGTCAAACTGATCGATGATTTGAAGAAACAGATGGACAAAGTTACT GCTGAGAGAGAGACATTGAATCTTGAAGTGAAGAGCGCTCAAGCCATGATTAACGTCCTC CAGTCGCGAATTGATTCCCTGAGCAAGGCAAACGAGGATTTGAAGAAGGCTGGAAACGCC TAG
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>LITCHI027239.m1 MDCETLPSKSTLKTIQPNATTTALAPGFRFHPTDEELVSYYLKRKITNKAFHFDAIAEVD IYKNEPWDLAGLHLNLILCLFMGVEAYSRLKTKDQVWYVFNALDKKFKSGARMNRTTGTG YWKSTGKDHEIRHNTQLVGMKKTLVFHNRHVSDKQRTNWVMHEYRLVDEENDKIQVGQDT YTLCRVFHKTNRSALYAPFNEEEWDDGNATFPGEDAKDDLVASDDAYVEMNGVETVNDDQ KFSSSNVTQHSECMNKDPPLQTSEPKNKEILNINELPTDAQAPLPLLQYKRRRQNDSGYI QSYVPGNSSGTGQDPSSAEKTMSTSATTTVSLEFPLSEPILTKDSVRLFGVTLANHSDSS VSPRYVKLIDDLKKQMDKVTAERETLNLEVKSAQAMINVLQSRIDSLSKANEDLKKAGNA .
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>LITCHI027239.m1 - Up_Stream_Len 2000 TAAGGTTTAAAGAAGATGTTAACCAGTAATCATACTCTGATGTTCAAGTTAGGCCGAGGG TAGTGTAGAGAAAAGAATGTCGAAAAAACTTCAGCTTAAGGAATTAAAAAAAAAAAAAAA AAAGTCTTCCTCTAAAAATGTTTATATTGCCTTTTATAAATGCATTTTCGAGTACCTATC AAAGCACGATGCGCAAAAAGAAGACTGCTATCATTATAATATTCTCTTCTTATAGCCAAT ACAACACCTTTTTTGCCTAATGCTATGTGCCATTTGGATTCCACGAAGCCTTAGCTATCA CAATTCAATTAGCTCTATGATGGCTAGTTGTCTATCAATTAGTCTAATTGTTAAGTTTTA CTTTCATTTGCTATAAAAATGTGCTTCCCTCAAGGCGGGAGTTGCTCTAATCATCCCAGT GAATTTCAAGGCTGTCTTACCTCCTTATTATTCTTTTTGGGTCATTTTTATGCATTCTTT CTTGTTTATCATCATGTGTCTTTCTTTTTCTGCTTCTTTTTGCTATTCTTATAGCATGTT GATTGACTATGCTTTAATCCTGCATTTGGTCATCTTTGCCCTTTTTGTTTGCTGGCTTGA TAGGCAAATTTGCTTTATATGTTTCATGAATGGATTGTTTTGTATCTCCATCATGTCTTT CCTTAACATCTGACTTGAGATAACTTCATCACTAACAATCGTAGGAGGTAAAGAAGTACT TCCGATATAAATCTCACTTTTATCTGGTTGATTGACCTTACGTTCCTTTTGCTTGCTTTA TTTGCTTTACAAGAGGTACTCATGTCCAGTAGCCATTTGTTGGCTCAATTACATTCTTTC ATTAACAATTAATAAAAGTCCTGTTGGATCAAATATTTTCTTTTGTTAACAATTAATAAA ACTTTCTTAATTACAATTCTTAATAAGTAAAAACGTTCTTACTGTAAATAATTCATTAAC AAAATTTTAAAATAGTTATTCATTCAATACAATGAGGATATTACCTTATAAAATTTGTTT TGTTAAACTTTCTGAATGAAATGTTTAATGTTTTTTTCAATTATGAATTTGAGAGTTGAG AGATAAGGCATCAATTCATACTTTCATTATTACGATGCAAAATCCTTATTGGGTCACCTC TAATTTTGTCATTTAAAGTTCAACTTTGAACTTCACAAATACTAGAATAACCCGGATGTT ACTTGCTAAATACCAGTATCACATATGCAAGACAATCTAAATAGAAATATCTTTTGAACA AAAAGACTATTACCACAAGACTTGCTTTAAGATATAGAAAGCTCATGTCACTGTGCAAAG TTTATATTTGATTCATTAAATTTTCATTCAACTTTATTAATTTAGTGTATAATATGCTTA TTAATGCATAACTTGTGAATTTATTGCCAATTTGTAAAATTGAACATGAGTTTTGTCTTA TACTTTAATTAATGTGCATATCCCATTCCATATCTGTAGATATCTTTCCAACTATGAATT TTGATATCCAATCTACTCATTTAATATTTGATTTTGGTAGGCTCAGACTATTTAATGTTA TCTTTATTTAAGAATATAATTAAAAAAAAAAAAAAGACAAATATACTCAGTTTACATGTT TGGTGGTCCAATTTTGTTTTTCAATCAAAGGAAAAAGTTTTATAACGTATGAGAACAAAT TACCATATAAACCTTGATTTTAATTACTAGTTTCGGAATTTAGTAAATTACCATATAAAC CTTCAAATACAACTTGTACCACAATCAATACAGTTTCCATTTCAGTATTGAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAACACTTGACACAATTTTTAGCCTACGAAGAAAAACTAAAAGTTAAAAA AGCTCAACAAACTTCTTGTATTTGAAGGTACCAACCCCAGTTACTTCCCTACCAATCAAT CCCAATCTCCACCATTTCTTTTGTCTTTCAAAACCATAATCAATACCAAAATCCACACAT TCCAGAACCTAATCTCTCTG
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>LITCHI027239.m1 GenomeSequence - ATGGATTGTGAAACTCTTCCATCCAAAAGCACCCTTAAAACAATCCAACCAAACGCCACA ACAACAGCACTTGCACCTGGGTTTCGATTCCACCCAACTGATGAGGAGCTAGTAAGCTAT TACTTGAAGAGGAAAATCACTAACAAAGCTTTTCACTTCGATGCCATTGCAGAAGTTGAT ATCTATAAAAATGAGCCATGGGACCTCGCTGGTTGATATTCTTTTGACTTTTTTGTTTTT TCCTCACTATATCTCAATCAGCTATTAGCTATTTGTTATCTCTAAGGTTGATAGGGTTTT TTTATTTTAATTTTCTTTTCCATATTGTTTATATATAGTGTTTAAAGTAGGCATTTTTTT TTTCTCTTTTTAATTTCTTTTTTGCTTTATGTTTATATTAGTTGCTGGTTAAATTAGGTT TCAAAAGGGATTTACATAGCTATTTTTAGTTTTTGGGGCTTTATTTTTCGCTCTAAGTGC ATTCTGAGTTCATTTATTTACATGTTTTTTTTTATTTTTTTTTTCACGTAGTGTCACAAT ATGTTGATTAATCTTGTTTTTCCTAGGTAGCATTTGTAATGTCAATGGGTTCTATATATC TTTTTGTTTTGGTTTTAGGGTTGCATCTGAATTTGATACTTTGTTTGTTTATGGGTGTTG AAGCTTATTCAAGGTTGAAGACCAAGGATCAAGTGTGGTACGTTTTCAATGCATTAGATA AGAAGTTCAAAAGTGGGGCAAGAATGAATAGGACAACAGGTACAGGGTATTGGAAATCAA CAGGGAAGGATCATGAGATTCGCCATAATACACAACTTGTTGGAATGAAAAAAACCCTTG TATTCCATAATAGGCATGTTTCAGATAAGCAACGGACCAATTGGGTTATGCATGAATATC 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