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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI027158 | Chr3 | 18134513 | 18138641 | - | Trihelix transcription factor PTL |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI027158.m1 | 115 | 202 | PF13837.9 | Myb_DNA-bind_4 | Domain | 71.2 | 7.70E-20 |
| LITCHI027158.m1 | 404 | 472 | PF13837.9 | Myb_DNA-bind_4 | Domain | 53.1 | 3.40E-14 |
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>LITCHI027158.m1 ATGACTGACCAGTACGGCCTGCCCGATGAATACAGCCTCCAGCAGCCTGACTTCCGGCAG CTCATGACCGGAAGAAACCATTTCCCGGTCAACACACAAGCCTCTGAGTCATACTTTTTC CACAGAAATGTTGCACCATTGCCTCAGCATGACACAATCATGGTTGGGGAGGTGGTTCTT CCTAGTGGTGGTGGTGGGGGGTTGGTTCGGTTTGGTCGTGATCACCATCATCATCATCAT AGTAATACTAGTACTCCAGCTGTTTCTACTACAGCCACAAGCAGGCAACAGTTTGCTATG GAGATGGAGAGTGGATGGAATTTTGGAAACGAAGGTGGGAATTCAAGGTGGCCGAGACAG GAGACTCTCACTCTTCTTGAGATCAGATCTCGACTTGATTCTAAGTTCAAGGAAGCTAAT CAGAAAAAACCCTTATGGGATGAAGTTTCTAGGATAATGGCTGAGGAACATGGATACTAC AGAAGTGAGAAAAAATGCAGAGAGAAGTTTGAGAATTTGTACAAGTACTATAAGAAAACT AAGGAAGGTAAAGCTGGGAGGCAGGATGGGAAGCATTATAGATTCTTTCGCCAACTTGAA GCTCTCTATGGAGAAACAAGCAATAATAATAATAATCAAATTTCAGCCTCAGAATCTCAT CCTCATCATCAAATCACTACTCTTCATTACCAAAATCCAAGCCAAATAGAAAATCAGGAA ATCAACCAAGAAGCCTTGATGCATGATCACCAGAAGCTAAGTGAGAGTCTAAGTGTCTCC AACACATCTGAATTCGAAACCGCATCTTCGGAAAACAACAATATGGATCATGATGATCTA TCAGCCATTGCTTTTATGATGAACCAAAAATCAAGGGAAAGGCAGAAAAGGATGAATGAG AGCCAAAGAGATCATACAAGGGCAAAAAGGAATTGGAAAGCAAAGGTTAGGGACTATATG GACTCACAAATGAGGAGGATAATGGAGTCACAAGAGGCCTGGATGGAAAGAATGTTGAAA ACTATTGAGGATAGAGAGCAAGAGAGGTTGCTCAAAGAAGAGGAATGGAGGCAGCAGGAA ATGGCTCGGTTCGATCGAGAACATCAGTTTTGGGCTAAGGAAAGGGTTCGGATTGAAGCT CGAGATTCTGCTTTAATGGAGACTTTGCAGATATTCACAGGGAGAGGCCAAAATGATATC AACTACAGTGTCTGGACTGAACCCGAGACTTCAAGCTTGATACTGATTATAACTAGCTTG GAACCACAATTCCAGGACAATATCATTTGGGAGGAGATATCAGAAAAGATGGCTAGTTTG GGGTATTACAAGAGTGCTATTGAGTGTAAAGAGAAATGGGAAAACATGCAAATGTATTTT AGCATGGCAACAGAGCGTAACAAGAAGCACAAACAAACTACTCTTGAGAGCATGGAATTA TCACCTCCTAACTTTCTGATAAATGAAGAAAAGCACTTCTGGGAGAAGGGAAAGAATAAG CAGGTTTAG
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>LITCHI027158.m1 MTDQYGLPDEYSLQQPDFRQLMTGRNHFPVNTQASESYFFHRNVAPLPQHDTIMVGEVVL PSGGGGGLVRFGRDHHHHHHSNTSTPAVSTTATSRQQFAMEMESGWNFGNEGGNSRWPRQ ETLTLLEIRSRLDSKFKEANQKKPLWDEVSRIMAEEHGYYRSEKKCREKFENLYKYYKKT KEGKAGRQDGKHYRFFRQLEALYGETSNNNNNQISASESHPHHQITTLHYQNPSQIENQE INQEALMHDHQKLSESLSVSNTSEFETASSENNNMDHDDLSAIAFMMNQKSRERQKRMNE SQRDHTRAKRNWKAKVRDYMDSQMRRIMESQEAWMERMLKTIEDREQERLLKEEEWRQQE MARFDREHQFWAKERVRIEARDSALMETLQIFTGRGQNDINYSVWTEPETSSLILIITSL EPQFQDNIIWEEISEKMASLGYYKSAIECKEKWENMQMYFSMATERNKKHKQTTLESMEL SPPNFLINEEKHFWEKGKNKQV.
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>LITCHI027158.m1 - Up_Stream_Len 2000 CTCTCTTTCATTTTCTTTAAACACAAATTATCTTATCACATTTTAAAATTTAATATAAAT TAGGATATATATATATATTCAACGTGTCTTATCCATTAAGTGTGCATGTTTGATTGAATT TTAATGATTTAATGTGCATTATTCAACTCTACACAATTCGTAAAATATAGAGCTACTAAT CTTACTTACTAATCCTTATATTTTACAACAAAATTCCATCTCTAGCTGTTTATTCTTTCT TGGTTTACGCAAACATTATTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTAAAAG AAATTCTAAATGCGTTTGCTAGTTAATATCTACACATTTAATTTAATATGCAAAGACGTC GTATCGCATCTACTGTATAAAGCAAGACAAAAAATTATCAGCACTGGAATTTGTCTTTTA CGAACAATTAATCACATACTAAAATCCTAGAAGCATTCTTCCTTCCAACTTTCAACACAT TGACAAAATTTCTTTCGGATATTTGACCAAATGATGCGGCCATATTCTGATATACATATA GCTGTACACGTGTGTATTGTCTTTGGCTTTTCTCTCGGTATTCTTCAGAGACACTTATGT CAAAAAAAAATTATCGGTAAGCATTATTTAAGATCAATTATTACAATTTCAAGCTAATGT TCATTACAACTCTTATCTATTTAAGTCTTTAACTTATTTGTAAGATAAATCTTAACATAA TCCCTTGGTTTTTTTTTTTTTTAACTGATTGTAATAAAATTCAATCCTGACATCCTGCGG AATTCCACTGTAATTCAAGCCACAGAATTATACATAACCATGGACAGGATTTAGAAAGAC ACTATCGTGACAAGAGATGTAAACACTAAAAATTAAGAATGAGATTATTCAATATATCTC AATATAGATGAAATCCATTGGATAGATACATGTTGGTATTAACTATTTAACCCAAAAGTT TGGGCTAGCAGGTAAGAGGTTCTCCAAATATAATATTTAAGATATAAACTAATGAGATTT AAAATACGTTAATGTATTCTTTTATGTGTAATGTTGATAGATGATATATGCTAGATACAT ATTAAATGCTTCTAACTACCTTCTAATATGATCTATGAACAAGAAATTCATATACCAGGG CTTTGAATTCAAACTCGAGATCTTTATCTCTAATATCAAATCATTAGTCATTTAACTCAA ACTAATTACTAATCACCTAACTATATACATATAGATATTTTCTTTTACAAGAATGCGTAG ATTCTAGAATTATCAATTTCAAGTTTATGGGCTCTTAGATGCATCATACATTGACTTTTT ATAATTAACATTTGTCATTATTTATTTATGTTTTTCAATAACATGTGATCTTAGAATTGA TAACTATCATAGTAATGAAAAAAAAAGAAAGAATATTTGTACAAAAGTTTAAATATATAT CTGATAGGAATTGAACCTTTATCTCTAAACAGGGAGGTGCAACATATAGGAGGAAGTGAA TCCAAGTATAATATTAAGCCATAAGTCGATTAGAGAATTCTTTAACACACATAATATGAA CATTGTATGTTTATATACATGTGGACTCGTGCGTACGAGACAAATCGAGAAAGGAGTGAG CCAATGGAGCCAAGCGTGTTAGCTGCCAACAAAAATGGTACAAGGACAGAGTCGGTCAAA AGTTAAAAAGGTTACATCGAGAGCACTGTACACGCGTCATCTAATCAGTGTTGCGATGGA TTATAATCCTCGTGTAATGCTCCGACATTTGTCAAACGCTCATTGGTTCATCGTATACGT ACACCAAAAATTTTCTACCAGAGAGAGAGAGAGCGTGAGGGAGTGATGGAAGAGTGATGA AAGTTGCGGTAGACTCGGATCCTGTCTCCCAAGAAAAAGGTCCAATTTGTACAGACAAAC CTCCCTTTAATGCCATACAATATTTGACTCTCACACCACTTTCTCTCACTCTCTCTTACA CACTCAAAAAACCTACTAAA
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>LITCHI027158.m1 GenomeSequence - GTTGCGGTAGACTCGGATCCTGTCTCCCAAGAAAAAGGTCCAATTTGTACAGACAAACCT CCCTTTAATGCCATACAATATTTGACTCTCACACCACTTTCTCTCACTCTCTCTTACACA CTCAAAAAACCTACTAAAATGACTGACCAGTACGGCCTGCCCGATGAATACAGCCTCCAG CAGCCTGACTTCCGGCAGCTCATGACCGGAAGAAACCATTTCCCGGTCAACACACAAGCC TCTGAGTCATACTTTTTCCACAGAAATGTTGCACCATTGCCTCAGCATGACACAATCATG GTTGGGGAGGTGGTTCTTCCTAGTGGTGGTGGTGGGGGGTTGGTTCGGTTTGGTCGTGAT CACCATCATCATCATCATAGTAATACTAGTACTCCAGCTGTTTCTACTACAGCCACAAGC AGGCAACAGTTTGCTATGGAGATGGAGAGTGGATGGAATTTTGGAAACGAAGGTGGGAAT TCAAGGTGGCCGAGACAGGAGACTCTCACTCTTCTTGAGATCAGATCTCGACTTGATTCT AAGTTCAAGGAAGCTAATCAGAAAAAACCCTTATGGGATGAAGTTTCTAGGTATATATTC CCCTCACTATATTGCACCCTTGTCATTTTATGTATTGAGCATTGATCTAGGTGTCTTTTC ATTTTCAATTTGCTTTCATTAAAACTGGACAAAAAACCCTATTTGAAATTCGTGTAGTGA AGATGCTTTTGTGTGTTTCTAGCTTAGCTATTCCCATGAAAATGACAACCATCCTTTCAG TTTAGCAGAGACACCAGAGGGGTGTTATTGTATCTTAATGGTTATGTTTTGAGTGCAAAA ATGGTAGAACGGTAGTTTCTTTTATGAAGAAAATGATTGTTAAGGAATCTTTCTCTAAAA ACCTATCTTTCAACATTGTGTCATTTATGGAATCAACTCGATTTGAATAAAAAATGAAAT TTAGTTGATGGCATCTTTCTTTGTATATATTCTATTTATAAGAATGTTGCTTTGAAAATT TCAATATATGTACCATTTTGATTACTTAAATTGCCTGCTATAGTTTGGATACAGTTAGTG AAGAAGTATCTAATTTATTATTTTAATAATCATCAAGTCGGCTTAATCGATGTTCTTTGA GGCTGGCTAGCAAAAGGCACCTAATATATAGGGGTTGTCCTATGTTTCTCAGCAATTATG TCTGCAGTAATAATGTATATGCTATTTATTTTTGCTATAATTGTGTAGTTAATTTGTACA GGATAATGGCTGAGGAACATGGATACTACAGAAGTGAGAAAAAATGCAGAGAGAAGTTTG AGAATTTGTACAAGTACTATAAGAAAACTAAGGAAGGTAAAGCTGGGAGGCAGGATGGGA AGCATTATAGATTCTTTCGCCAACTTGAAGCTCTCTATGGAGAAACAAGCAATAATAATA ATAATCAAATTTCAGCCTCAGAATCTCATCCTCATCATCAAATCACTACTCTTCATTACC AAAATCCAAGCCAAATAGAAAATCAGGAAATCAACCAAGAAGCCTTGATGCATGATCACC AGAAGCTAAGTGAGAGTCTAAGTGTCTCCAACACATCTGAATTCGAAACCGCATCTTCGG AAAACAACAATATGGATCATGATGATCTATCAGCCATTGCTTTTATGATGAACCAAAAAT CAAGGGAAAGGCAGAAAAGGATGAATGAGAGCCAAAGAGATCATACAAGGGCAAAAAGGA ATTGGAAAGCAAAGGTTAGGGACTATATGGACTCACAAATGAGGAGGATAATGGAGTCAC AAGAGGCCTGGATGGAAAGAATGTTGAAAACTATTGAGGATAGAGAGCAAGAGAGGTTGC TCAAAGAAGAGGAATGGAGGCAGCAGGAAATGGCTCGGTTCGATCGAGAACATCAGTTTT GGGCTAAGGAAAGGGTTCGGATTGAAGCTCGAGATTCTGCTTTAATGGAGACTTTGCAGA TATTCACAGGGAGAGGCCAAAATGATATCAACTACAGTGTCTGGACTGAACCCGAGACTT CAAGCTTGATACTGATTATAACTAGCTTGGAACCACAATTCCAGGACAATATCATTTGGG AGGAGATATCAGAAAAGATGGCTAGTTTGGGGTATTACAAGAGTGCTATTGAGTGTAAAG AGAAATGGGAAAACATGCAAATGTATTTTAGCATGGCAACAGAGCGTAACAAGAAGCACA AACAAACTACTCTTGAGAGCATGGAATTATCACCTCCTAACTTTCTGATAAATGAAGAAA AGCACTTCTGGGAGAAGGGAAAGAATAAGCAGGTTTAGCAGAAGAAAGTGAGAGGGAATT TGGGCTTAAATAATTGATATTCTTGTTAGTGGTGTAGGGTTTTAACTTCTTTGAGAAGGT AAGTAGTAGTTAATGGTGATGATCATGATTTGTGTAAAACTTGGGTGGAGATTGGTTTAA GTAAAGCATGCACTGACTAGGAAATTTTGTGACAAACTGATTAGTTCTTGAGTGCAAGAA AGCCCTAAATAGCTATGGCTGACTTCATTGGTCTCCATAGGGTTTCAGGGTTTCCAACAC ATGATTAATTAGAGGGCTATGCTTGTGACCTTTGGTTCATAAAAATAATTAGCTAGCTAG CTAGCTAGGTTTGGTGTTGTTGGTTTAATTCTTTTAATTGTTTTTGCTGGAAGTTTCCTG TGTAGAAATTAAAAATTGCAATATTGGTGCTTTCAATTTGTGGTCTCTCTCAAAGACTCA AGTGAAATCATAAAGATTCATTCTCAACATCTACACTTTATTTTGATGTGCACCTGTTGG TTAAGGGATTACTTATCTGGGTCATAGGACTCGACAAAAAGTCAGCAGACGATTCATACA AGAGAATTTTCATGAGCATAAAAGGTATTTTACTTCTCTTATTATTTATTTTTTTATTCC ATAGTTTCTACAAAAATACATATAGTTCCGAACTGGGTAAGGAGTCAGTTTTTCCACCTT ACAGTGCCCTGAAGGACGAGGAGAAAAATTATTGAGATTTTATATCTTTGTTTAATTTCT ATCTTATAAAGTAATATATATTCCTAATAATTTTGAATGGCTTTTGAATAATACTTTGTA GTATTTCCTAGACAATATATAAGCAAAAAATATATATATATATTTTTTGACATTAAAAAC TATTAAGTGTTTTCAACTTATTTATTGTATAAGGTTATCTATTAGTAACAGTTACTGAAT TACTAATGGTAGTTATTGAAGAATTTTTAAAGGATGTTTATTGATAGATAACTTTAGTTA ATTAATAAGACAACTAAATCCTTTTTTAAATACTTATGTAAAAACTGTTTTTTCAAATCA TTTAAAAACCAAAAAATATATATATTTTAAATATGTAATTTATTATATACAAAAAGAATG TACATTTGTTTTGGGGAATGCTTTTAAGGATTTTGGTAAAAGGAGATATATATGTATATA TATATATATACATATTAGTGAAAGCTCTAATTTCTGTAACACTTTCTTGAATTTGGATTC TTTACTGATTTTCTTCTATGTTAAGCTATGCTTGATTTTTTTAGAAAATGAAAGTCTCAA TAGTCTATTTTATCATTTACTATGTTCCTTTAAAGTTCAACACAGCTCAATCACAGATTT CATCTTTCTTTTTTTAATTTAAGAGATATGATATGACTTTAACTCACAACTTGGCAATCT CGCAATCTCACAATCTCATCCACATGGACAATCTTCATGGATGTATTAAACTGTTATTTC GGACCTACACTATTATTAATTACTAAATAAATGATCTCAACACAAAAAGGAATCGAGTAA CGACAAACGTTTTTAAGACCCTGGTCAACTTGATTTGTTTGATATATGCCATAGGAAAAA TGTTCATTTGTAGTTTTGTACCAACAAGTATGACTGTTGCATTTACAGCATCTACAGGTT GAGGGAATATGCCACAGTTCATAGACTGATCAGAATTGAATGAGTTAGCAACACGGCGTA TTCATAATGCTGCTGTGTGACCCTGCAGCTTATATATCGAGTAAAACTGTTAGATTTATG TGTAATTGGTTTCTGTTACGTAATTGCTTAGTGTTAAACTTTTTGGAAC