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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI027050 | Chr3 | 16459442 | 16465948 | + | Calcium-dependent protein kinase 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI027050.m1 | 126 | 384 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 247.2 | 1.90E-73 |
LITCHI027050.m1 | 128 | 378 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 90.8 | 9.20E-26 |
LITCHI027050.m1 | 419 | 457 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 16.5 | 0.006 |
LITCHI027050.m1 | 432 | 458 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 32.6 | 3.30E-08 |
LITCHI027050.m1 | 432 | 492 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 44.2 | 2.10E-11 |
LITCHI027050.m1 | 432 | 458 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 26.7 | 3.20E-06 |
LITCHI027050.m1 | 432 | 454 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 24 | 1.90E-05 |
LITCHI027050.m1 | 444 | 494 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 34.8 | 1.10E-08 |
LITCHI027050.m1 | 469 | 488 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 14.8 | 0.016 |
LITCHI027050.m1 | 502 | 563 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 52.4 | 5.90E-14 |
LITCHI027050.m1 | 504 | 530 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 29.8 | 3.10E-07 |
LITCHI027050.m1 | 505 | 529 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 27.2 | 1.80E-06 |
LITCHI027050.m1 | 507 | 526 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 22.3 | 6.60E-05 |
LITCHI027050.m1 | 516 | 564 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 37.5 | 1.60E-09 |
LITCHI027050.m1 | 538 | 564 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 34.9 | 6.20E-09 |
LITCHI027050.m1 | 538 | 562 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 17.3 | 0.0026 |
LITCHI027050.m2 | 126 | 384 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 247.4 | 1.70E-73 |
LITCHI027050.m2 | 128 | 378 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 91 | 8.20E-26 |
LITCHI027050.m2 | 419 | 457 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 16.6 | 0.0056 |
LITCHI027050.m2 | 432 | 458 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 32.7 | 3.10E-08 |
LITCHI027050.m2 | 432 | 492 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 44.3 | 2.00E-11 |
LITCHI027050.m2 | 432 | 458 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 26.7 | 3.00E-06 |
LITCHI027050.m2 | 432 | 454 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 24.1 | 1.80E-05 |
LITCHI027050.m2 | 444 | 494 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 34.9 | 1.10E-08 |
LITCHI027050.m2 | 469 | 488 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 14.9 | 0.015 |
LITCHI027050.m2 | 504 | 530 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 29.9 | 3.00E-07 |
LITCHI027050.m2 | 505 | 529 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 27.3 | 1.70E-06 |
LITCHI027050.m2 | 507 | 526 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 22.4 | 6.20E-05 |
LITCHI027050.m3 | 126 | 379 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 240.3 | 2.40E-71 |
LITCHI027050.m3 | 128 | 379 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 92.6 | 2.60E-26 |
LITCHI027050.m4 | 126 | 379 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 240.3 | 2.40E-71 |
LITCHI027050.m4 | 128 | 379 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 92.6 | 2.60E-26 |
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>LITCHI027050.m1 ATGGGAAATACTTGTGTTGGACCGAGCATTACGAAGAATGGATTTTTTCAATCGGTTTCT GCTGCAATGTGGCGATCCCGATCACCTGGTGACTCTGTTTCTCCTAGCACACGTGCAGAT GTGGATAGTGTCTGTGAGTCAATAACGAAAGAACCCGAATCGCCTTTGCCTGTTCAAGAC AAACCCCCAGAACATGTGACGATGCCTAAACCAGAGGCTAGTCGGGAAAGCAAACCAGCT CCAAAACCAAAACCAGAACCAGAACCAGAACATCCTACAAAACCCAAGAAACCGCCTCAA ATGAAGAGGGTGCCTAGTGCAGGACTAAGAACCGAATCAGTTTTACAGACGAAAACTGGT AACTTCAAGGAATTTTACAGTTTGGGGAGGAAACTTGGACAAGGGCAGTTTGGGACGACG TTCCTTTGTGTTGAGAAGGCAACTGGGCAAGAATATGCGTGTAAATCAATTGCGAAGAGG AAGTTATTAACTGATGATGATGTGGAGGATGTACGAAGGGAGATTCAGATAATGCACCAC TTGGCTGGGCATCCCAATGTCATATCTATAAATGGGGCTTATGAGGATGCGATGGCAGTT CATGTTGTAATGGAGTTATGTGCAGGTGGGGAGCTCTTTGATAGGATTATTCAGCGTGGA CACTATACAGAAAGAAAGGCAGCTGACCTTACTAGGACTATTGTTGGGGTTGTGGAAGCT TGTCACTCTTTGGGAGTGATGCATCGTGACCTTAAGCCTGAAAATTTTCTTTTTATTAGT CAGGAGGAAGATTCACTTCTCAAGACAATCGACTTTGGATTATCAATATTCTTTAAACCA GGCGAAAAGTTTTCTGATGTGGTTGGCAGCCCATATTATGTTGCTCCGGAAGTTCTTAAA AAGCGTTATGGTCCAGAAGCAGATGTTTGGAGCGCTGGTGTGATCCTTTACATTCTGTTA AGTGGAGTGCCTCCCTTTTGGGCAGAAACCGAGCAAGGGATATTTGAACAGGTCCTCCAT GGCGATCTTGACTTTTCATCTGACCCTTGGCCCAGTATTTCTGAAAGTGCGAAAGATTTA GTGAGAAGAATGCTTGTTCGAGACCCCAGAAGGCGTCTAACTGCACATGAAGTTTTGTGT CACCCTTGGGTACAAGTTGATGGTGTGGCCCCTGACAAACCTCTTGATTCAGCAGTCCTG AGTCGCCTGAAGCAATTTTCTGCTATGAATAAGCTCAAGAAGATGGCACTTATAGTGATT GCAGAGAGCCTATCTGAAGAAGAGATAGCTGGCCTGAAAGAAATGTTCAAGATGATAGAT GCAGATAACAGTGGTCAAATTACTTATGAAGAACTTAAGGCTGGATTAAAAAGAGTTGGA GCTAACCTTAAGGAATCTGAAATTTATGATCTTATGCAAGCAGCTGATGTAGATAATAGC GGAACAATTGACTATGGTGAATTTATAGCTGCAACATTGCATCTAAACAAAATTGAGAGA GAAGATCATCTGTTTGCTGCCTTTTCTTATTTTGACAAGGATGGAAGTGGCTATATTACT CCAGATGAGCTTCAACAAGCTTGTGAAGAATTTGGCATTGAGGATGTTCGCCTGGAAGAA ATGATTCGAGAAGTTGATCAAGACAATGATGGACGCATAGATTACAATGAATTTGTGGCG ATGATGCAAAAGGGAAATGCTGCAGGCCCTGCTGTGAAGGGTCTTGAAAACAGTCTCAGC ATTGGATTTAGAGAAGCTCTAAAACTTTAG >LITCHI027050.m2 ATGGGAAATACTTGTGTTGGACCGAGCATTACGAAGAATGGATTTTTTCAATCGGTTTCT GCTGCAATGTGGCGATCCCGATCACCTGGTGACTCTGTTTCTCCTAGCACACGTGCAGAT 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GTGAGAAGAATGCTTGTTCGAGACCCCAGAAGGCGTCTAACTGCACATGAAGTTTTGTGT CACCCTTGGGTACAAGTTGATGGTGTGGCCCCTGACAAACCTCTTGATTCAGCAGTCCTG AGTCGCCTGAAGCAATTTTCTGCTATGAATAAGCTCAAGAAGATGGCACTTATAGTGATT GCAGAGAGCCTATCTGAAGAAGAGATAGCTGGCCTGAAAGAAATGTTCAAGATGATAGAT GCAGATAACAGTGGTCAAATTACTTATGAAGAACTTAAGGCTGGATTAAAAAGAGTTGGA GCTAACCTTAAGGAATCTGAAATTTATGATCTTATGCAAGCAGCTGATGTAGATAATAGC GGAACAATTGACTATGGTGAATTTATAGCTGCAACATTGCATCTAAACAAAATTGAGAGA GAAGATCATCTGTTTGCTGCCTTTTCTTATTTTGACAAGGATGGAAGTGGCTATATTACT CCAGATGAGCTTCAACAAGCTTGTGAAGAATTTGGCATTGAGGATGTTCGCCTGGAAGAA ATGATTCGAGAAGTTGATCAAGACAATGTAAGTGATGACACTCTTCTTAATAACACGTTC AGCTAA >LITCHI027050.m3 ATGGGAAATACTTGTGTTGGACCGAGCATTACGAAGAATGGATTTTTTCAATCGGTTTCT GCTGCAATGTGGCGATCCCGATCACCTGGTGACTCTGTTTCTCCTAGCACACGTGCAGAT GTGGATAGTGTCTGTGAGTCAATAACGAAAGAACCCGAATCGCCTTTGCCTGTTCAAGAC AAACCCCCAGAACATGTGACGATGCCTAAACCAGAGGCTAGTCGGGAAAGCAAACCAGCT CCAAAACCAAAACCAGAACCAGAACCAGAACATCCTACAAAACCCAAGAAACCGCCTCAA ATGAAGAGGGTGCCTAGTGCAGGACTAAGAACCGAATCAGTTTTACAGACGAAAACTGGT 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GTGGATAGTGTCTGTGAGTCAATAACGAAAGAACCCGAATCGCCTTTGCCTGTTCAAGAC AAACCCCCAGAACATGTGACGATGCCTAAACCAGAGGCTAGTCGGGAAAGCAAACCAGCT CCAAAACCAAAACCAGAACCAGAACCAGAACATCCTACAAAACCCAAGAAACCGCCTCAA ATGAAGAGGGTGCCTAGTGCAGGACTAAGAACCGAATCAGTTTTACAGACGAAAACTGGT AACTTCAAGGAATTTTACAGTTTGGGGAGGAAACTTGGACAAGGGCAGTTTGGGACGACG TTCCTTTGTGTTGAGAAGGCAACTGGGCAAGAATATGCGTGTAAATCAATTGCGAAGAGG AAGTTATTAACTGATGATGATGTGGAGGATGTACGAAGGGAGATTCAGATAATGCACCAC TTGGCTGGGCATCCCAATGTCATATCTATAAATGGGGCTTATGAGGATGCGATGGCAGTT CATGTTGTAATGGAGTTATGTGCAGGTGGGGAGCTCTTTGATAGGATTATTCAGCGTGGA CACTATACAGAAAGAAAGGCAGCTGACCTTACTAGGACTATTGTTGGGGTTGTGGAAGCT TGTCACTCTTTGGGAGTGATGCATCGTGACCTTAAGCCTGAAAATTTTCTTTTTATTAGT CAGGAGGAAGATTCACTTCTCAAGACAATCGACTTTGGATTATCAATATTCTTTAAACCA GGCGAAAAGTTTTCTGATGTGGTTGGCAGCCCATATTATGTTGCTCCGGAAGTTCTTAAA AAGCGTTATGGTCCAGAAGCAGATGTTTGGAGCGCTGGTGTGATCCTTTACATTCTGTTA AGTGGAGTGCCTCCCTTTTGGGCAGAAACCGAGCAAGGGATATTTGAACAGGTCCTCCAT GGCGATCTTGACTTTTCATCTGACCCTTGGCCCAGTATTTCTGAAAGTGCGAAAGATTTA 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>LITCHI027050.m4 GGCCTCGCTGACTAAAACCAAGCGAAAACTCCGGAGATTGTAATATCCACCAAACCGAAC AAAACGCGTTTTGTGGTGCCATCTGCTTGAAACCGCACCAATATCCATTATAAAATTCTT ACCATCCTGGCTTTTCAGATATTAACTATGGCCCCATCACTCTGCACACACACCCTCCTT ATTACATGTAGCTAAAAAACACCAACACAACCAACAAAGTCAAACCCAACCCAAACTAAC CTCTTCTTCTCTTCAAGATCTCCATGTTTCTTCATTTTACCCATCTGGGTATTCCTGGTT CTTGTTCTTTTCTCAGCTTTTGAGTTTTGTTTTATTTATTTGTTTCTATTGCTTTTTAGT GATTGTTTAGGAGTTGGTTAATCTTTAGATGTTGTTGTTGATGAAGTAGTAGAATGGATA GATAGATTTAATCACTGATCAAAGACTGAGTTGACTTTTTTTTTTTGGCTTCTTTACTTG TTGTATTTTGTTGAATACATGCACTAAAGTCAATTGTTGTTATCATTTTGGTAACCTTGT ATCTGAATTGCTATATTTTGGCGATGATCATTTCTGCTTGTTGATTTTATTAAGTTACTA TTTAAGCTCTGAGGTGTGTTTATGAGTAAGATGTAGGGGGAGTCTCGGATGTCTTTTAAC ATAGTGTTGAGAGCGTTTGAAGTCAGATCTATAATATGTTGTGTTAACTAGACTGAATAG AGTTCAATTTTTTATGCTGGTGGAAGTGTTTCGGACATTATTGAAGGTACGGTGAAATGG GAAATACTTGTGTTGGACCGAGCATTACGAAGAATGGATTTTTTCAATCGGTTTCTGCTG CAATGTGGCGATCCCGATCACCTGGTGACTCTGTTTCTCCTAGCACACGTGCAGATGTGG ATAGTGTCTGTGAGTCAATAACGAAAGAACCCGAATCGCCTTTGCCTGTTCAAGACAAAC CCCCAGAACATGTGACGATGCCTAAACCAGAGGCTAGTCGGGAAAGCAAACCAGCTCCAA AACCAAAACCAGAACCAGAACCAGAACATCCTACAAAACCCAAGAAACCGCCTCAAATGA AGAGGGTGCCTAGTGCAGGACTAAGAACCGAATCAGTTTTACAGACGAAAACTGGTAACT TCAAGGAATTTTACAGTTTGGGGAGGAAACTTGGACAAGGGCAGTTTGGGACGACGTTCC TTTGTGTTGAGAAGGCAACTGGGCAAGAATATGCGTGTAAATCAATTGCGAAGAGGAAGT TATTAACTGATGATGATGTGGAGGATGTACGAAGGGAGATTCAGATAATGCACCACTTGG CTGGGCATCCCAATGTCATATCTATAAATGGGGCTTATGAGGATGCGATGGCAGTTCATG TTGTAATGGAGTTATGTGCAGGTGGGGAGCTCTTTGATAGGATTATTCAGCGTGGACACT ATACAGAAAGAAAGGCAGCTGACCTTACTAGGACTATTGTTGGGGTTGTGGAAGCTTGTC ACTCTTTGGGAGTGATGCATCGTGACCTTAAGCCTGAAAATTTTCTTTTTATTAGTCAGG AGGAAGATTCACTTCTCAAGACAATCGACTTTGGATTATCAATATTCTTTAAACCAGGCG AAAAGTTTTCTGATGTGGTTGGCAGCCCATATTATGTTGCTCCGGAAGTTCTTAAAAAGC GTTATGGTCCAGAAGCAGATGTTTGGAGCGCTGGTGTGATCCTTTACATTCTGTTAAGTG GAGTGCCTCCCTTTTGGGCAGAAACCGAGCAAGGGATATTTGAACAGGTCCTCCATGGCG ATCTTGACTTTTCATCTGACCCTTGGCCCAGTATTTCTGAAAGTGCGAAAGATTTAGTGA GAAGAATGCTTGTTCGAGACCCCAGAAGGCGTCTAACTGCACATGAAGTTTTGTGTGAGT 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