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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI027028Chr316195697;16199282;1619972616204228+Calcium and calcium/calmodulin-dependent serine/threonine-protein kinase

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI027028.m112295PF00069.28PkinaseDomain2067.20E-61
LITCHI027028.m117291PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain115.92.00E-33
LITCHI027028.m1397453PF13499.9EF-hand_7Domain34.22.80E-08
LITCHI027028.m1398413PF13202.9EF-hand_5Domain13.50.042
LITCHI027028.m1428497PF13499.9EF-hand_7Domain53.13.60E-14
LITCHI027028.m1430456PF13405.9EF-hand_6Domain24.51.50E-05
LITCHI027028.m1432450PF13202.9EF-hand_5Domain16.40.005
LITCHI027028.m1471498PF13405.9EF-hand_6Domain22.95.00E-05
LITCHI027028.m1471497PF00036.35EF-hand_1Domain31.11.00E-07
LITCHI027028.m1471497PF13833.9EF-hand_8Domain21.90.00012
LITCHI027028.m1472494PF13202.9EF-hand_5Domain23.33.30E-05
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LITCHI027028.m217291PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain115.92.00E-33
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LITCHI027028.m2398413PF13202.9EF-hand_5Domain13.50.042
LITCHI027028.m2428497PF13499.9EF-hand_7Domain53.13.60E-14
LITCHI027028.m2430456PF13405.9EF-hand_6Domain24.51.50E-05
LITCHI027028.m2432450PF13202.9EF-hand_5Domain16.40.005
LITCHI027028.m2471498PF13405.9EF-hand_6Domain22.95.00E-05
LITCHI027028.m2471497PF00036.35EF-hand_1Domain31.11.00E-07
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LITCHI027028.m2472494PF13202.9EF-hand_5Domain23.33.30E-05
LITCHI027028.m312295PF00069.28PkinaseDomain206.16.50E-61
LITCHI027028.m317291PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain1161.80E-33
LITCHI027028.m3397477PF13499.9EF-hand_7Domain39.84.90E-10
LITCHI027028.m3398413PF13202.9EF-hand_5Domain13.50.04
LITCHI027028.m3451477PF00036.35EF-hand_1Domain31.11.00E-07
LITCHI027028.m3451478PF13405.9EF-hand_6Domain234.70E-05
LITCHI027028.m3451477PF13833.9EF-hand_8Domain21.90.00012
LITCHI027028.m3452474PF13202.9EF-hand_5Domain23.43.20E-05
LITCHI027028.m412295PF00069.28PkinaseDomain206.35.90E-61
LITCHI027028.m417291PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain116.21.70E-33
LITCHI027028.m4397453PF13499.9EF-hand_7Domain34.52.30E-08
LITCHI027028.m4398413PF13202.9EF-hand_5Domain13.60.039
LITCHI027028.m4430455PF13405.9EF-hand_6Domain24.41.70E-05
LITCHI027028.m4432450PF13202.9EF-hand_5Domain16.50.0046
LITCHI027028.m512295PF00069.28PkinaseDomain206.45.30E-61
LITCHI027028.m517291PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain116.31.50E-33
LITCHI027028.m612295PF00069.28PkinaseDomain206.45.30E-61
LITCHI027028.m617291PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain116.31.50E-33
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>LITCHI027028.m1
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GGAGAACTGTTTGATCGGATTGTGCAGGAAAGGTACTCGGAGGTCGAAGCTGCAGCCGTG
GTTAGGCAGATTGCACAAGGCTTAGCTGCTCTTCATCGGGCAGATATTGTGCATAGGGAC
TTGAAGCCGGAGAATTGCTTGTTCCTGAATTCAACAAAGGATTCTCCTTTGAAGATCATG
GATTTTGGATTGAGTTCTGTTGAGGGGTATACTGATCCTGTTGTTGGTTTGTTCGGTTCC
ATTGATTATGTCTCACCAGAAGCACTTTCTCAGGATAGAATTACTACCAAGAGCGATATG
TGGTCCTTGGGAGTAATCTTGTATGTCTTACTTTCCGGGTATCCACCTTTCATTGCTCAG
TCAAACCGGCAAAAGCAACAGATGATAATGGCTGGAGACTTCAGTTTTTATGAGAAGACA
TGGAAAAACATTTCTTCATCAGCAAAGCAGTTGATTTCAAGTCTTCTGGCAGTTGATCCT
CACAAAAGACCTAGTGCTCAAGAGCTCCTTAACCATCCATGGGTGAATGGTGATTCTGCC
AAGGAAGATCAAATGGATGCAGAAGTTGTCTCAAGACTGCAGAGTTTTAATGCCCGTCGC
AAGCTTCGAGCTGCAGCCTTAGCTAGCATCTGTTGCAGCACAGTTTTCTTGCGAACAAAG
AAGCTTAAAACTTTATTAGGCTCCTATGATCTGACTGAGGAGGAAATTGAGAACCTCAGA
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CGATCCGGATGCATCAGTAAGGAAGAAGTAGCTTCCATGCTTAGAGCTCTGCCAGACAAT
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>LITCHI027028.m2
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GCTTCCATGTTGTTTCCAACCAGGAAACAGGTTTCAATCTCTGATGCATTGCTAACAAAT
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GATTTTGGATTGAGTTCTGTTGAGGGGTATACTGATCCTGTTGTTGGTTTGTTCGGTTCC
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TGGTCCTTGGGAGTAATCTTGTATGTCTTACTTTCCGGGTATCCACCTTTCATTGCTCAG
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CACAAAAGACCTAGTGCTCAAGAGCTCCTTAACCATCCATGGGTGAATGGTGATTCTGCC
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AAGCTTCGAGCTGCAGCCTTAGCTAGCATCTGTTGCAGCACAGTTTTCTTGCGAACAAAG
AAGCTTAAAACTTTATTAGGCTCCTATGATCTGACTGAGGAGGAAATTGAGAACCTCAGA
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CGATCCGGATGCATCAGTAAGGAAGAAGTAGCTTCCATGCTTAGAGCTCTGCCAGACAAT
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>LITCHI027028.m3
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GATTTTGGATTGAGTTCTGTTGAGGGGTATACTGATCCTGTTGTTGGTTTGTTCGGTTCC
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TGGTCCTTGGGAGTAATCTTGTATGTCTTACTTTCCGGGTATCCACCTTTCATTGCTCAG
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TGGAAAAACATTTCTTCATCAGCAAAGCAGTTGATTTCAAGTCTTCTGGCAGTTGATCCT
CACAAAAGACCTAGTGCTCAAGAGCTCCTTAACCATCCATGGGTGAATGGTGATTCTGCC
AAGGAAGATCAAATGGATGCAGAAGTTGTCTCAAGACTGCAGAGTTTTAATGCCCGTCGC
AAGCTTCGAGCTGCAGCCTTAGCTAGCATCTGTTGCAGCACAGTTTTCTTGCGAACAAAG
AAGCTTAAAACTTTATTAGGCTCCTATGATCTGACTGAGGAGGAAATTGAGAACCTCAGA
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GCCAATAGTGATGGAAAAGTCACCTTTGAGGAGTTCAAAGCTGCTATGCAGACAGATAGC
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>LITCHI027028.m4
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GATTTTGGATTGAGTTCTGTTGAGGGGTATACTGATCCTGTTGTTGGTTTGTTCGGTTCC
ATTGATTATGTCTCACCAGAAGCACTTTCTCAGGATAGAATTACTACCAAGAGCGATATG
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AAGGAAGATCAAATGGATGCAGAAGTTGTCTCAAGACTGCAGAGTTTTAATGCCCGTCGC
AAGCTTCGAGCTGCAGCCTTAGCTAGCATCTGTTGCAGCACAGTTTTCTTGCGAACAAAG
AAGCTTAAAACTTTATTAGGCTCCTATGATCTGACTGAGGAGGAAATTGAGAACCTCAGA
ATACATTTCAAGAAAATATGTGCAAACGGTGACAATGCCAGTCTATCTGAATTTGAGGAG
GTCCTCAAAGCAATGAATATGTCTTCACTGGTTCCTCTAGCACCCCGTATATTTGACCTC
TTCGACAATAATCGCGATGGGACAGTTGATATGAGAGAGATACTCTGTGGATTTTCCAGC
CTCAGAAATTCTCAAGGAGAGGATGCTCTCCGGCTCTGCTTCCAGATGTATGATACAGAT
CGATCCGGATGCATCAGTAAGGAAGAAGTAGCTTCCATGCTTAGAGTAAAATCACCTCCC
ATATCTTTCATATTATTCAATCAATATAATATTTGTTTGTTATTGCTGTAA
>LITCHI027028.m5
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GCTTCCATGTTGTTTCCAACCAGGAAACAGGTTTCAATCTCTGATGCATTGCTAACAAAT
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GGAGAACTGTTTGATCGGATTGTGCAGGAAAGGTACTCGGAGGTCGAAGCTGCAGCCGTG
GTTAGGCAGATTGCACAAGGCTTAGCTGCTCTTCATCGGGCAGATATTGTGCATAGGGAC
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GATTTTGGATTGAGTTCTGTTGAGGGGTATACTGATCCTGTTGTTGGTTTGTTCGGTTCC
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TAG
>LITCHI027028.m6
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GATTTTGGATTGAGTTCTGTTGAGGGGTATACTGATCCTGTTGTTGGTTTGTTCGGTTCC
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CTCAGAAATTCTCAAGGAGAGGATGCTCTCCGGCTCTGCTTCCAGGTGCACTCTCGTCTT
CTGTCCTCAAAATCTAGATGCAAACACAATATAACTAGGTTGTTGTGTATACATATTCTT
TAG
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>LITCHI000959.m1
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SRIFVCSKEDNEQQITNIFWADAKMIIDYGQFGDVVSFDTTYKINKENRPFAVFVGFNHH
RETIVFGASLMYDETFDSFTWLFETFLQAMSGKTPKTIFTDQDAAMAKAILHVMPNTYHR
LCIWHIMQNALKHVHSIFNGGGGVKSVLSTSMFDIEEEHEFLNAWNNMLNKYDLHNNYWL
KTMFDLKEKWAYAYVRRAWSAGMSSTQLSESFNASLKDYLKSDLNVAQFFMHFDRILNDK
RYKEPEAEYVCVIGWLV.
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>LITCHI000959.m1
CTCTCTTGTGAAGCTTTTCCACAATTTCAAGTGTATTGATTTGTTTGGTTGTTTTCCTTG
ATTTTTAAAAATGTATGGAACTAAAAGTGTTATTGAATGCTTAAATGATTGTGATTGGAA
ACCTAGATATGGTATGGAGTTTGAGTCGGAACAATCAGCATATGATTTTTATAATGCATA
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TGAAATCACTTCTAGGATATTTGTTTGTTCTAAAGAGGACAATGAACAGCAAATCACAAA
CATATTTTGGGCTGATGCTAAAATGATTATTGATTATGGTCAATTTGGGGATGTTGTAAG
TTTTGATACAACTTACAAAATAAATAAAGAAAATCGACCATTTGCGGTGTTTGTAGGATT
TAATCATCATCGAGAGACTATTGTATTTGGAGCATCTTTAATGTATGATGAAACATTTGA
TTCCTTTACATGGTTGTTTGAAACATTTTTGCAAGCTATGTCAGGAAAGACTCCAAAAAC
AATTTTTACAGATCAAGATGCTGCAATGGCCAAAGCCATTTTACATGTGATGCCTAACAC
ATATCACAGACTTTGTATATGGCATATTATGCAAAATGCCTTAAAACATGTGCATAGTAT
ATTTAATGGGGGTGGTGGAGTGAAAAGTGTCTTATCAACCTCTATGTTTGATATTGAGGA
AGAACATGAGTTCTTAAATGCTTGGAATAATATGCTTAATAAGTATGATTTGCATAATAA
TTATTGGTTGAAAACCATGTTTGATTTGAAAGAAAAATGGGCTTATGCATATGTTAGGCG
TGCATGGTCTGCTGGAATGAGTAGCACACAACTTAGTGAAAGTTTCAATGCTTCTTTAAA
AGATTATTTGAAGTCTGACCTCAATGTGGCACAATTTTTCATGCACTTTGATAGAATACT
TAATGATAAAAGATACAAAGAGCCAGAGGCAGAATATGTTTGTGTTATAGGTTGGTTAGT
CTAA
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>LITCHI000959.m1 -  Up_Stream_Len 2000
ATACGTAAAAGTGTTCTAATATTTATTAAATAATTTATTATAATTGTTTTTATTATATTA
AATAAAGTTATAAAACAACTAATAGTAAAATGATATAAATGTCAAATTATTAATTTTTAG
ATAATTTTAACTTTAAAAAACAAATAAAATTATTATACATTCAGAGATAAGTGAAAAAAA
AAAATACATATCATTCAGATTTCAGGTTTTAATTTTTATTCAGTCTTCAAATAAAAAAAA
AGCAAATGACTCTTAAACTTTTACAATATATTTATAAAATCATAAAATGTGAATAAATCA
ATCCCCTATAGTTGCAGTTGCTTTAGGCTTGTGCTATTAATAGTTAATCTTGCTAAGCTT
CAATAGATTCCTAACTCAATCATTAATATGAGACTTGAAAAAAGAAAGAAAGAAATGAAT
ATACAGGCATAAGAGGAGAAAAAGATGGTTTCGTATAGTTGTGTATGGATCCAGATTCTT
TGTCCATTTCATTTTTACTAATCTTTTAGTTTGATCACGACATGTGGCAGGTGCAAAAAT
GAGTGGTGCAAATCTCATTTTTTTCTTTTACCGAAAGCAAACACTATGGAGTCCATATTT
TCATCCCTGTCAACAATACGAAGGCAAAGGTTTTTTCTTTGCATCATTTTCTTAGACCAC
CATCATCCACTCTATCTCTCCCTCCCTATAACTGCTGCTTCAAGCCAAACCACCATCATC
GACAGTGCTACTCTTGTCCATAGCAGTATTTGTGTGTATGGGTATTCATCGATAGCATAT
TGACAGCACCACTTTGTCTCTCTCCCCCCATAGCCACTCTGTTTCCCTTTCCCCATAACC
ATTTTTTCTATCCATATCATTTTCTCCCATTAACAAGAGGAGCCCTATCATTTTTTTCTT
CCATTATAAAACATTGTCATTGAAGCACAGAACAAACACACGTCCATTAACAAAATGCCA
ATCCTGCCATCCCTGTCATTCAAGCAAGGAGCCAAAATCTTCAATTAATTGCCCGCCACC
TGTTCGACCAAAGTCTAACACTAGTAAGAATCTGAAATTTTGCCTTTTGGATTGTTAATG
TTATTCCATATAAGATGGAACTTTTGATTGCTATAGTGCAACATTTATCTGGGACACAAA
AAAAGCCTGATGCTTCTCCAAAAAAAAAAATGATATTGTACTGAGTGTAGATACTTGTAC
ATTGTAGTTCAATGGTGCTAGCTTTTATATACATTCAATGAGATAGTTTGTCACTATAGT
AATCGTGAGGGGTACTATTCATGTCAATATTATGTTGGAAGGAAATTGCATTTACAAGGG
GTTATTTGATGCAAAGTCTACTTGTCTTTGTCATTTTTATCATTAACGAAGTTTTATGTG
TATATTTTGATCGATTGGTTCTCTTTTTTAAATGTTTTCAGATTCTTGAACTATTGTTCT
GTTTATTGAATTAGGTGGTTTAGGTGATTTGTATGGAGATTTATGATATGTCAACTTGGG
GTTAATGTTTATTGAATTGGTTTTTTGCTCTACTCTGTTTTAGGTGAATTGGGGGTTAAT
GTTTATTGATTTACTGCTGTGTTTATTGAATTGGTGTTATTTTAACAATAACACCAATTC
TGGTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTTCATTGAAGTTTTTGTATAGTTGAGTCATG
ATGTGGTTAAAGACATTGATTATATATTCAAGGACTTGTAACTTTTTGAAATAAAAAAGA
ACTTACTATTGCTTTAATACTTAGAGAATCAAAAAGTTTGCTTAAAAAATAAATTTTTTA
CTTTTATTTTTCCCAAAACCCATGTTGTATGAATTATTTAATTTACCTCTGTGTTTTGAC
TTACAGGTTCATTAACAAATAAAAATAGTGTGGGTTGACAAGAAAGATAAGTTTTCGATT
TTGATTAGGCCTCTCTTGTGAAGCTTTTCCACAATTTCAAGTGTATTGATTTGTTTGGTT
GTTTTCCTTGATTTTTAAAA
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>LITCHI000959.m1 GenomeSequence - 
CTCTCTTGTGAAGCTTTTCCACAATTTCAAGTGTATTGATTTGTTTGGTTGTTTTCCTTG
ATTTTTAAAAATGTATGGAACTAAAAGTGTTATTGAATGCTTAAATGATTGTGATTGGAA
ACCTAGATATGGTATGGAGTTTGAGTCGGAACAATCAGCATATGATTTTTATAATGCATA
TGGAAGGAGAGTGGGATTTAGTATTAGAAGAGGTTCATGTGCGAGAAACAAGCACACTAG
TGAAATCACTTCTAGGATATTTGTTTGTTCTAAAGAGGGTTTGTGATCAAAAGATAAACG
TGATGTTCTTACTAAAAACCCTAGAACAATAACAAGAACTAGTTGTGGTGCCCAATTAAA
TATTAAGTTAAATAGATCTAATAATAATTTTTTGGTCATTCATTTTGTGGAAGAGCATAA
CCACCCTTTAGTAATGCAAGATTGTGTGCATGTTACCTTTACAACGAAAATTGACTGTTT
CACAAGCAATTGAAATGGAATTGGTAGAAGGATTTGGAATTCTAATTAGATCTTCATATG
AGTTGATGGGTAGACATGTGGGTGGTAGAGAGTCTCTTGGGTATACAAAGGTAGATCAGA
AAAATTACTTGAGATCAAGAAGGCAAAAGAATTTAGCATATGGGGAAGCTGGATGTTTGT
TAAATTATTTTTCTAAACAAATACTAAAAAACCCTTCATTTTTTTTTATTCTGTGCAATT
AGACAATGAACAGCAAATCACAAACATATTTTGGGCTGATGCTAAAATGATTATTGATTA
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