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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI027028 | Chr3 | 16195697;16199282;16199726 | 16204228 | + | Calcium and calcium/calmodulin-dependent serine/threonine-protein kinase |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI027028.m1 | 12 | 295 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 206 | 7.20E-61 |
LITCHI027028.m1 | 17 | 291 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 115.9 | 2.00E-33 |
LITCHI027028.m1 | 397 | 453 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 34.2 | 2.80E-08 |
LITCHI027028.m1 | 398 | 413 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 13.5 | 0.042 |
LITCHI027028.m1 | 428 | 497 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 53.1 | 3.60E-14 |
LITCHI027028.m1 | 430 | 456 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 24.5 | 1.50E-05 |
LITCHI027028.m1 | 432 | 450 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 16.4 | 0.005 |
LITCHI027028.m1 | 471 | 498 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 22.9 | 5.00E-05 |
LITCHI027028.m1 | 471 | 497 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 31.1 | 1.00E-07 |
LITCHI027028.m1 | 471 | 497 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 21.9 | 0.00012 |
LITCHI027028.m1 | 472 | 494 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 23.3 | 3.30E-05 |
LITCHI027028.m2 | 12 | 295 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 206 | 7.20E-61 |
LITCHI027028.m2 | 17 | 291 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 115.9 | 2.00E-33 |
LITCHI027028.m2 | 397 | 453 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 34.2 | 2.80E-08 |
LITCHI027028.m2 | 398 | 413 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 13.5 | 0.042 |
LITCHI027028.m2 | 428 | 497 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 53.1 | 3.60E-14 |
LITCHI027028.m2 | 430 | 456 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 24.5 | 1.50E-05 |
LITCHI027028.m2 | 432 | 450 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 16.4 | 0.005 |
LITCHI027028.m2 | 471 | 498 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 22.9 | 5.00E-05 |
LITCHI027028.m2 | 471 | 497 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 31.1 | 1.00E-07 |
LITCHI027028.m2 | 471 | 497 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 21.9 | 0.00012 |
LITCHI027028.m2 | 472 | 494 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 23.3 | 3.30E-05 |
LITCHI027028.m3 | 12 | 295 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 206.1 | 6.50E-61 |
LITCHI027028.m3 | 17 | 291 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 116 | 1.80E-33 |
LITCHI027028.m3 | 397 | 477 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 39.8 | 4.90E-10 |
LITCHI027028.m3 | 398 | 413 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 13.5 | 0.04 |
LITCHI027028.m3 | 451 | 477 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 31.1 | 1.00E-07 |
LITCHI027028.m3 | 451 | 478 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 23 | 4.70E-05 |
LITCHI027028.m3 | 451 | 477 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 21.9 | 0.00012 |
LITCHI027028.m3 | 452 | 474 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 23.4 | 3.20E-05 |
LITCHI027028.m4 | 12 | 295 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 206.3 | 5.90E-61 |
LITCHI027028.m4 | 17 | 291 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 116.2 | 1.70E-33 |
LITCHI027028.m4 | 397 | 453 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 34.5 | 2.30E-08 |
LITCHI027028.m4 | 398 | 413 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 13.6 | 0.039 |
LITCHI027028.m4 | 430 | 455 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 24.4 | 1.70E-05 |
LITCHI027028.m4 | 432 | 450 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 16.5 | 0.0046 |
LITCHI027028.m5 | 12 | 295 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 206.4 | 5.30E-61 |
LITCHI027028.m5 | 17 | 291 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 116.3 | 1.50E-33 |
LITCHI027028.m6 | 12 | 295 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 206.4 | 5.30E-61 |
LITCHI027028.m6 | 17 | 291 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 116.3 | 1.50E-33 |
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>LITCHI027028.m1 ATGGGGCAGGAAACTAAGAAACTTTTAGATGAATATGAAATACTAGGCATTTTAGGAAGG GGAGGATTTTCAGTTGTAAGAAAAGGTAAAAGAAGGAGAGCAAGTGGTGATCATGTAGCC ATCAAAACACTTAAAAGGATTGGTCCAACAACCCCACTTGGCAAGAGCAGCAGCAACACA GCTTCCATGTTGTTTCCAACCAGGAAACAGGTTTCAATCTCTGATGCATTGCTAACAAAT GAGATATTGGTTATGAGGAAGATCGTTGAAAATGTATCCCCCCATCCGAACGTCGTTGAC CTTTACGATGTGTGTGAGGATCAAACAGGGGTGCACTTGGTGTTGGAGTTGTGCTCCGGG GGAGAACTGTTTGATCGGATTGTGCAGGAAAGGTACTCGGAGGTCGAAGCTGCAGCCGTG GTTAGGCAGATTGCACAAGGCTTAGCTGCTCTTCATCGGGCAGATATTGTGCATAGGGAC TTGAAGCCGGAGAATTGCTTGTTCCTGAATTCAACAAAGGATTCTCCTTTGAAGATCATG GATTTTGGATTGAGTTCTGTTGAGGGGTATACTGATCCTGTTGTTGGTTTGTTCGGTTCC ATTGATTATGTCTCACCAGAAGCACTTTCTCAGGATAGAATTACTACCAAGAGCGATATG TGGTCCTTGGGAGTAATCTTGTATGTCTTACTTTCCGGGTATCCACCTTTCATTGCTCAG TCAAACCGGCAAAAGCAACAGATGATAATGGCTGGAGACTTCAGTTTTTATGAGAAGACA TGGAAAAACATTTCTTCATCAGCAAAGCAGTTGATTTCAAGTCTTCTGGCAGTTGATCCT CACAAAAGACCTAGTGCTCAAGAGCTCCTTAACCATCCATGGGTGAATGGTGATTCTGCC AAGGAAGATCAAATGGATGCAGAAGTTGTCTCAAGACTGCAGAGTTTTAATGCCCGTCGC 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