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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI026906 | Chr3 | 14317040;14317042 | 14321103;14328407 | + | Probable WRKY transcription factor 46 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI026906.m1 | 13 | 54 | PF03106.18 | WRKY | Domain | 52.7 | 4.20E-14 |
LITCHI026906.m2 | 124 | 184 | PF03106.18 | WRKY | Domain | 91.4 | 3.50E-26 |
LITCHI026906.m3 | 21 | 81 | PF03106.18 | WRKY | Domain | 92.2 | 2.00E-26 |
LITCHI026906.m4 | 13 | 54 | PF03106.18 | WRKY | Domain | 52.7 | 4.20E-14 |
LITCHI026906.m5 | 13 | 54 | PF03106.18 | WRKY | Domain | 52.7 | 4.20E-14 |
LITCHI026906.m6 | 13 | 54 | PF03106.18 | WRKY | Domain | 52.7 | 4.20E-14 |
LITCHI026906.m7 | 124 | 184 | PF03106.18 | WRKY | Domain | 91.4 | 3.50E-26 |
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>LITCHI026906.m1 ATGTTGACACGTTCTCTAATCCTAGTTATTGCAATTTGCAGAGGATATTATAGGTGCACC CATCGTCACGCACAAGGTTGTTTGGCCACGAAACAAGTTCAAAGATCGGATGAGGACCCA TCAATCCTTGAAGTGACCTATCGGGGGAGACACACATGTAACCAGAACTCTAATCCAGCT GCCGTGGCATCACCATCAGTGTCCAAAGAGGAAAAGAATCATTATCTTCAAAAACAGGAA CATGAACAAAATCCAAAACAAGAAGAAGTGATTTTCAACTTTGGAGCTGGTTGCAAAGTT AAAACAGAGGAGCTGGACAATGGGGAAGATATATTTCCTTCGTTTCCTTTTCCACCAACA TCAATTGAAGCTGAATATGTGGGAGAGAATATCTTCCAGGAGGCCATGATGGAAAACAAT ATTATGGGCAGTTTTTCTCAGGCATTTGTATCTCCTACAACATCTGAGTCCAATTATTTT CCTGTGTCTCCAAGTCACATGAACAACTTTGGATTAGGCCACGGTGTGCAAACTTCTGAT TCTGATCTCACTGAGATAATCTCAGCCCCTACTTCGGTCACCAATTCGCCTATTGGGGAG GAGTTTGATTTCACTAAGGTGGATTTCGATCAGAATTTCATATTTGACAACTTGGAATTC TTCGCTTGA >LITCHI026906.m2 ATGGATAGAGAGCTGATGGTTCTGAAAAACGAGCTAACTCAAGGGAAGGAGCTAGCAGAG CAGCTTAGAAACTATCTCAACCCTTCTTCCTCCAACGAAACTCGAGATTGTTTGATCCAA AAAATTCTGGGTTCTTATGAGAAAGCACTTTCACTGCTGAATTGTGGTGCTTCTGTGGTG GAGCCTAAGATCGACATTAGCATGTTGGAGACACCCTCTTCTTTTGCCAACATTAGTCCA 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>LITCHI026906.m1 MLTRSLILVIAICRGYYRCTHRHAQGCLATKQVQRSDEDPSILEVTYRGRHTCNQNSNPA AVASPSVSKEEKNHYLQKQEHEQNPKQEEVIFNFGAGCKVKTEELDNGEDIFPSFPFPPT SIEAEYVGENIFQEAMMENNIMGSFSQAFVSPTTSESNYFPVSPSHMNNFGLGHGVQTSD SDLTEIISAPTSVTNSPIGEEFDFTKVDFDQNFIFDNLEFFA. >LITCHI026906.m2 MDRELMVLKNELTQGKELAEQLRNYLNPSSSNETRDCLIQKILGSYEKALSLLNCGASVV EPKIDISMLETPSSFANISPRSEASNLDCKDQCHRDVFKKRKTMPRWTEQVKAYSGTGLE GHPDDGYCWRKYGQKDILGANFPRGYYRCTHRHAQGCLATKQVQRSDEDPSILEVTYRGR HTCNQNSNPAAVASPSVSKEEKNHYLQKQEHEQNPKQEEVIFNFGAGCKVKTEELDNGED IFPSFPFPPTSIEAEYVGENIFQEAMMENNIMGSFSQAFVSPTTSESNYFPVSPSHMNNF GLGHGVQTSDSDLTEIISAPTSVTNSPIGEEFDFTKVDFDQNFIFDNLEFFA. >LITCHI026906.m3 MPRWTEQVKAYSGTGLEGHPDDGYCWRKYGQKDILGANFPRGYYRCTHRHAQGCLATKQV QRSDEDPSILEVTYRGRHTCNQNSNPAAVASPSVSKEEKNHYLQKQEHEQNPKQEEVIFN FGAGCKVKTEELDNGEDIFPSFPFPPTSIEAEYVGENIFQEAMMENNIMGSFSQAFVSPT TSESNYFPVSPSHMNNFGLGHGVQTSDSDLTEIISAPTSVTNSPIGEEFDFTKVDFDQNF IFDNLEFFA. >LITCHI026906.m4 MLTRSLILVIAICRGYYRCTHRHAQGCLATKQVQRSDEDPSILEVTYRGRHTCNQNSNPA AVASPSVSKEEKNHYLQKQEHEQNPKQEEVIFNFGAGCKVKTEELDNGEDIFPSFPFPPT SIEAEYVGENIFQEAMMENNIMGSFSQAFVSPTTSESNYFPVSPSHMNNFGLGHGVQTSD SDLTEIISAPTSVTNSPIGEEFDFTKVDFDQNFIFDNLEFFA. >LITCHI026906.m5 MLTRSLILVIAICRGYYRCTHRHAQGCLATKQVQRSDEDPSILEVTYRGRHTCNQNSNPA AVASPSVSKEEKNHYLQKQEHEQNPKQEEVIFNFGAGCKVKTEELDNGEDIFPSFPFPPT SIEAEYVGENIFQEAMMENNIMGSFSQAFVSPTTSESNYFPVSPSHMNNFGLGHGVQTSD SDLTEIISAPTSVTNSPIGEEFDFTKVDFDQNFIFDNLEFFA. >LITCHI026906.m6 MLTRSLILVIAICRGYYRCTHRHAQGCLATKQVQRSDEDPSILEVTYRGRHTCNQNSNPA AVASPSVSKEEKNHYLQKQEHEQNPKQEEVIFNFGAGCKVKTEELDNGEDIFPSFPFPPT SIEAEYVGENIFQEAMMENNIMGSFSQAFVSPTTSESNYFPVSPSHMNNFGLGHGVQTSD SDLTEIISAPTSVTNSPIGEEFDFTKVDFDQNFIFDNLEFFA. >LITCHI026906.m7 MDRELMVLKNELTQGKELAEQLRNYLNPSSSNETRDCLIQKILGSYEKALSLLNCGASVV EPKIDISMLETPSSFANISPRSEASNLDCKDQCHRDVFKKRKTMPRWTEQVKAYSGTGLE GHPDDGYCWRKYGQKDILGANFPRGYYRCTHRHAQGCLATKQVQRSDEDPSILEVTYRGR HTCNQNSNPAAVASPSVSKEEKNHYLQKQEHEQNPKQEEVIFNFGAGCKVKTEELDNGED IFPSFPFPPTSIEAEYVGENIFQEAMMENNIMGSFSQAFVSPTTSESNYFPVSPSHMNNF GLGHGVQTSDSDLTEIISAPTSVTNSPIGEEFDFTKVDFDQNFIFDNLEFFA.
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