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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI026871 | Chr3 | 14012743 | 14016196 | - | RNA polymerase II transcriptional coactivator KELP |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI026871.m1 | 4 | 59 | PF08766.14 | DEK_C | Domain | 54.4 | 9.90E-15 |
LITCHI026871.m1 | 101 | 151 | PF02229.19 | PC4 | Domain | 61.1 | 5.90E-17 |
LITCHI026871.m1 | 250 | 384 | PF14223.9 | Retrotran_gag_2 | Family | 66.5 | 2.10E-18 |
LITCHI026871.m2 | 122 | 256 | PF14223.9 | Retrotran_gag_2 | Family | 67.4 | 1.10E-18 |
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>LITCHI026871.m1 ATGGAACCCCCTAGTCAACAGAAAATCGAGCAAACAGTGCTCGAGATACTCAAACAAGCG GACATGGAGGAGATGACGGAGTTCAAGGTTCGAACAATGGCCTCGGAGCGACTCGGAATC GAACTCTCCGATGTTGATCAAAAGAAGTTCATCAGAGGCGTGGTGGAGTCGTTCTTGCTC TCCACCGTGGCAGACACTGGCGCTGCTACTAAAGAAGCTGATGCGAATGTTCAAGGAGAA TCTAGTCACCAGCAAGTCGACATCAAGAGAGAAGTTAATTTTGACGGAGACCGCATCATT TGTCAGCTTTCGAAAAAGAGGAATGTGGCGGTTCAAGAATTCAAGGGTAGAACTATTTTG ACAATTAGGGATTACTATCGAAAAGATGGAAAGCTGTGTCCGTGTGCCAAAGGGATTAAT TTGCCGACTGATCAATGGGCTACCTTCAGGAAAAGTGTCCCTGTAATAGAGGCAGCCATT AAGAAGATGCAAGCAAAGATCAGATCTAAAGTAGTGGATGAAGAAAAGGGAGTTGTTTCA GATTCTGTGACTTCACCGACTGAACTTGTTCCTACTGAGCCCGATCGTTTCAATGGGAAG AACTACTCGTATTGGGCACCGCGAATGGAAAATTTCTTGAAGCAGCTAAAGATTGAATAC GTTCTTAGTGACCCGTGCCCTGGTGTTATACTAAGCCCACAAGCAAGCACTGAAGAAATC TCCAAAGTCAAGGTAGCTGAACGAAAGTGGGTGCATGATGACCACATATGTCGCCGCCAC ATTTTGAATTTTCTATCTGATCATCTTTATTATCAGTACTCAAAGAAAACCAAGAGTGCT AAAGAACTCTGGGATGAGCTAAAATTAGTTTACCTTTATGAGGAATTCGGAATGAAGAGG TCTCAGGTTAAAAAATATATTGAATTTCAGATGGTCGATGAAAAATCAATTCTCGAGCAA CTTCAAGAATTTAACAACATTGCTGATTCCATTGTTGCTGCTGGAATGATGATTGATGAG AATTTTCATGTTAGTGTCATCATTTCCAAGCTTCCTCCATCCTGGAAGGACTTCTGTGTC AAGTTGATGCGTGAAGAATATCTTACTTTTGGAATGTTGATGGATCATATACATGCTGAG GAAGAGTCTCGCCATCCAAACAAACAAGGGGAGCCTTCCAATTCTGTAGACTGGCGTCTG GCTAAAGGGTTTGGAACAAGAATGAGAGAGATTAGAAAACCAGATATGAGCTGGAAGAGG CGAGAATCAGAGATTGATGGTAAGACTGTTTTCTGCAACAATTGTGGGAAGAAGGGGCAC TTGTCCAAACATTGCGATAGTAGGAAGTTTGACAAGAAAACGAAGAGGCAGAATGTGAAC AATTCGAGTACACATACAGATACATAA >LITCHI026871.m2 ATGCAGCACTTCAGCTTAGGAACCTTTGGGATTAATTTGCCGACTGATCAATGGGCTACC TTCAGGAAAAGTGTCCCTGTAATAGAGGCAGCCATTAAGAAGATGCAAGCAAAGATCAGA TCTAAAGTAGTGGATGAAGAAAAGGGAGTTGTTTCAGATTCTGTGACTTCACCGACTGAA CTTGTTCCTACTGAGCCCGATCGTTTCAATGGGAAGAACTACTCGTATTGGGCACCGCGA ATGGAAAATTTCTTGAAGCAGCTAAAGATTGAATACGTTCTTAGTGACCCGTGCCCTGGT GTTATACTAAGCCCACAAGCAAGCACTGAAGAAATCTCCAAAGTCAAGGTAGCTGAACGA AAGTGGGTGCATGATGACCACATATGTCGCCGCCACATTTTGAATTTTCTATCTGATCAT CTTTATTATCAGTACTCAAAGAAAACCAAGAGTGCTAAAGAACTCTGGGATGAGCTAAAA TTAGTTTACCTTTATGAGGAATTCGGAATGAAGAGGTCTCAGGTTAAAAAATATATTGAA TTTCAGATGGTCGATGAAAAATCAATTCTCGAGCAACTTCAAGAATTTAACAACATTGCT GATTCCATTGTTGCTGCTGGAATGATGATTGATGAGAATTTTCATGTTAGTGTCATCATT TCCAAGCTTCCTCCATCCTGGAAGGACTTCTGTGTCAAGTTGATGCGTGAAGAATATCTT ACTTTTGGAATGTTGATGGATCATATACATGCTGAGGAAGAGTCTCGCCATCCAAACAAA CAAGGGGAGCCTTCCAATTCTGTAGACTGGCGTCTGGCTAAAGGGTTTGGAACAAGAATG AGAGAGATTAGAAAACCAGATATGAGCTGGAAGAGGCGAGAATCAGAGATTGATGGTAAG ACTGTTTTCTGCAACAATTGTGGGAAGAAGGGGCACTTGTCCAAACATTGCGATAGTAGG AAGTTTGACAAGAAAACGAAGAGGCAGAATGTGAACAATTCGAGTACACATACAGATACA TAA
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>LITCHI026871.m2 GAAAATAATGATCTATCAAAATATTGAAAGAAAGTTATGATGCCACAGGTCATTGCTTGG TTCCATGGTCTAGTGGTTAGGACATTGGACTCTGAATCCAGTAACCCGAGTTCAAATCTC GGTGGAACCTTTAAATTATTTTGTTTCTTTTTCTGTTTCTGTGCCAAAAAGGGCTATTTC TCTATTGTGGTACCACGCACTTCTCGCTCACGGGCGGGATTTATCTAAACCCTAAAAGGA GATGACAACCAACAGCTACTAGTCCAATAGACAAAATTCAAAATCCTAACTGGCTAATTA TCTTTTAAACAATTCCAAATCAAGTTTCTATCTTTCTCTAATTGTCAGGAAATGGAACCC CCTAGTCAACAGAAAATCGAGCAAACAGTGCTCGAGATACTCAAACAAGCGGACATGGAG GAGATGACGGAGTTCAAGGTTCGAACAATGGCCTCGGAGCGACTCGGAATCGAACTCTCC GATGTTGATCAAAAGAAGTTCATCAGAGGCGTGGTGGAGTCGTTCTTGCTCTCCACCGTG GCAGACACTGGCGCTGCTACTAAAGAAGCTGATGCGAATGTTCAAGGAGAATCTAGTCAC CAGCAAGTCGACATCAAGAGAGAAGTTAATTTTGACGGAGACCGCATCATTTGTCAGCTT TCGAAAAAGAGGAATGTGGCGGTTCAAGAATTCAAGGGTAGAACTATTTTGACAATTAGG GATTACTATCGAAAAGATGGAAAGCTGTGTCCGTGTGCCAAAGGTGATCAGATGAGTGTT TTCCCGATTCTATCTTTGGTTCCCTATTTCATGCAAATTTTTTTATTATGATGTTTCTTT ATAACACATTTGCTTTGGCTTACCATTTAATTTTTGGTTTGAATATGTTGCTGCTGAAAA CTTTGTCAAGTTGTCCGCTTTAAGCATGCAGCACTTCAGCTTAGGAACCTTTGGGATTAA TTTGCCGACTGATCAATGGGCTACCTTCAGGAAAAGTGTCCCTGTAATAGAGGCAGCCAT TAAGAAGATGCAAGCAAAGATCAGATCTAAAGTAGTGGATGAAGAAAAGGGAGTTGTTTC AGATTCTGTGACTTCACCGACTGAACTTGTTCCTACTGAGCCCGATCGTTTCAATGGGAA GAACTACTCGTATTGGGCACCGCGAATGGAAAATTTCTTGAAGCAGCTAAAGATTGAATA CGTTCTTAGTGACCCGTGCCCTGGTGTTATACTAAGCCCACAAGCAAGCACTGAAGAAAT CTCCAAAGTCAAGGTAGCTGAACGAAAGTGGGTGCATGATGACCACATATGTCGCCGCCA CATTTTGAATTTTCTATCTGATCATCTTTATTATCAGTACTCAAAGAAAACCAAGAGTGC TAAAGAACTCTGGGATGAGCTAAAATTAGTTTACCTTTATGAGGAATTCGGAATGAAGAG GTCTCAGGTTAAAAAATATATTGAATTTCAGATGGTCGATGAAAAATCAATTCTCGAGCA ACTTCAAGAATTTAACAACATTGCTGATTCCATTGTTGCTGCTGGAATGATGATTGATGA GAATTTTCATGTTAGTGTCATCATTTCCAAGCTTCCTCCATCCTGGAAGGACTTCTGTGT CAAGTTGATGCGTGAAGAATATCTTACTTTTGGAATGTTGATGGATCATATACATGCTGA GGAAGAGTCTCGCCATCCAAACAAACAAGGGGAGCCTTCCAATTCTGTAGACTGGCGTCT GGCTAAAGGGTTTGGAACAAGAATGAGAGAGATTAGAAAACCAGATATGAGCTGGAAGAG GCGAGAATCAGAGATTGATGGTAAGACTGTTTTCTGCAACAATTGTGGGAAGAAGGGGCA CTTGTCCAAACATTGCGATAGTAGGAAGTTTGACAAGAAAACGAAGAGGCAGAATGTGAA CAATTCGAGTACACATACAGATACATAAGTTTACACGGATAACAGCATTTTGAAGTAGCT GATAGCCGTGAAGAAGTGTAAGTATAAACTTAAAACCATCTAGCCTAGCTTTAATCAGCT TGAATTTTTGAGTAAGTGGGTAAAAACATCTGTTGTTTGATATTCATCTTGTGGAAGTAC AGTGTCTCTAGTTTGCTGTTATAATATGTCCTCATTCGAAGCCCCTGCAGGGCCTTTGAA TCTGATGTCTGTATTATTATGTATTTAAATGTCCCAGCCAATTATAAACTTGTAGCAAAT AATATCTATTTAAATCGATTTTGCTTCAAATGGCAATGATATTTAATTAGACATTCTTTC CCAAGCCCATATAAATGCCATATTGACTGGTC >LITCHI026871.m1 GAAAATAATGATCTATCAAAATATTGAAAGAAAGTTATGATGCCACAGGTCATTGCTTGG TTCCATGGTCTAGTGGTTAGGACATTGGACTCTGAATCCAGTAACCCGAGTTCAAATCTC GGTGGAACCTTTAAATTATTTTGTTTCTTTTTCTGTTTCTGTGCCAAAAAGGGCTATTTC TCTATTGTGGTACCACGCACTTCTCGCTCACGGGCGGGATTTATCTAAACCCTAAAAGGA GATGACAACCAACAGCTACTAGTCCAATAGACAAAATTCAAAATCCTAACTGGCTAATTA TCTTTTAAACAATTCCAAATCAAGTTTCTATCTTTCTCTAATTGTCAGGAAATGGAACCC CCTAGTCAACAGAAAATCGAGCAAACAGTGCTCGAGATACTCAAACAAGCGGACATGGAG GAGATGACGGAGTTCAAGGTTCGAACAATGGCCTCGGAGCGACTCGGAATCGAACTCTCC GATGTTGATCAAAAGAAGTTCATCAGAGGCGTGGTGGAGTCGTTCTTGCTCTCCACCGTG GCAGACACTGGCGCTGCTACTAAAGAAGCTGATGCGAATGTTCAAGGAGAATCTAGTCAC CAGCAAGTCGACATCAAGAGAGAAGTTAATTTTGACGGAGACCGCATCATTTGTCAGCTT TCGAAAAAGAGGAATGTGGCGGTTCAAGAATTCAAGGGTAGAACTATTTTGACAATTAGG GATTACTATCGAAAAGATGGAAAGCTGTGTCCGTGTGCCAAAGGGATTAATTTGCCGACT GATCAATGGGCTACCTTCAGGAAAAGTGTCCCTGTAATAGAGGCAGCCATTAAGAAGATG CAAGCAAAGATCAGATCTAAAGTAGTGGATGAAGAAAAGGGAGTTGTTTCAGATTCTGTG ACTTCACCGACTGAACTTGTTCCTACTGAGCCCGATCGTTTCAATGGGAAGAACTACTCG TATTGGGCACCGCGAATGGAAAATTTCTTGAAGCAGCTAAAGATTGAATACGTTCTTAGT GACCCGTGCCCTGGTGTTATACTAAGCCCACAAGCAAGCACTGAAGAAATCTCCAAAGTC AAGGTAGCTGAACGAAAGTGGGTGCATGATGACCACATATGTCGCCGCCACATTTTGAAT TTTCTATCTGATCATCTTTATTATCAGTACTCAAAGAAAACCAAGAGTGCTAAAGAACTC TGGGATGAGCTAAAATTAGTTTACCTTTATGAGGAATTCGGAATGAAGAGGTCTCAGGTT AAAAAATATATTGAATTTCAGATGGTCGATGAAAAATCAATTCTCGAGCAACTTCAAGAA TTTAACAACATTGCTGATTCCATTGTTGCTGCTGGAATGATGATTGATGAGAATTTTCAT GTTAGTGTCATCATTTCCAAGCTTCCTCCATCCTGGAAGGACTTCTGTGTCAAGTTGATG CGTGAAGAATATCTTACTTTTGGAATGTTGATGGATCATATACATGCTGAGGAAGAGTCT CGCCATCCAAACAAACAAGGGGAGCCTTCCAATTCTGTAGACTGGCGTCTGGCTAAAGGG TTTGGAACAAGAATGAGAGAGATTAGAAAACCAGATATGAGCTGGAAGAGGCGAGAATCA GAGATTGATGGTAAGACTGTTTTCTGCAACAATTGTGGGAAGAAGGGGCACTTGTCCAAA CATTGCGATAGTAGGAAGTTTGACAAGAAAACGAAGAGGCAGAATGTGAACAATTCGAGT ACACATACAGATACATAAGTTTACACGGATAACAGCATTTTGAAGTAGCTGATAGCCGTG AAGAAGTGTAAGTATAAACTTAAAACCATCTAGCCTAGCTTTAATCAGCTTGAATTTTTG AGTAAGTGGGTAAAAACATCTGTTGTTTGATATTCATCTTGTGGAAGTACAGTGTCTCTA GTTTGCTGTTATAATATGTCCTCATTCGAAGCCCCTGCAGGGCCTTTGAATCTGATGTCT GTATTATTATGTATTTAAATGTCCCAGCCAATTATAAACTTGTAGCAAATAATATCTATT TAAATCGATTTTGCTTCAAATGGCAATGATATTTAATTAGACATTCTTTCCCAAGCCCAT ATAAATGCCATATTGACTGGTC
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>LITCHI026871.m2 - Up_Stream_Len 2000 TGGTGGTGAGGGCATCCACGTTGCCTAGGCGGAGGTAGACCAACGGCCCATATTTATTGC ACAAAGAAGCTAGATCCCTGTGGGGGAGTTGGCCCAATTGGAGAAGGTTGCCGAAAATGG GCCATCTGGGTGGGCCTGGAGGAAGAGTTTTTGTCTTATGGGCAGTTTTTCGATTGAGGA AACGGTGTATGACATTGGCGATGAGAGATGCAAAGACAAGGATTGAAGCAATGGTGGCTA ATTCCATCAAAACTAATGAATTCCAGAGATAATATAGATACTTTATACATGTAGAAGCTT AAAGAATTGCATCTAAAAGGCTAACAGTGAAACCATGGGCTCAAAATTGTCTTGCCATGT GATTCTATTTGTATATTACGATTTATGCTTTTTTAAACCCTTTAGAAGGTAATAAAAACA TATTTTTTGATACCACATTCTTGACATGCAATTGAGATTGAATTGGATGCCTCAATTCTA CATAGATAAAAATAACAATCAGTTTAAAAAAAAAAAAAAGGATGAAACCCTCTTTGAACT TGTTTGGTTGGTGGAGCATGTTATGTGCGATTGTGTTTTGTGGTCTCCTACTCCAAGAAA TAGCATTCGCGTGTTTTTAAACACTCATGTGATCTGAGTTGATGCACGGTAGAAGGAAGA GAAGAGGCGCATGAGCCTCGTGATTTGGCGAGTAAGTCTGAGTAAGTAGTATTATATATT ATAGCTAATGGGCACGCATCAGAAAATAATGATCTATCAAAATATTGAAAGAAAGTTATG ATGCCACAGGTCATTGCTTGGTTCCATGGTCTAGTGGTTAGGACATTGGACTCTGAATCC AGTAACCCGAGTTCAAATCTCGGTGGAACCTTTAAATTATTTTGTTTCTTTTTCTGTTTC TGTGCCAAAAAGGGCTATTTCTCTATTGTGGTACCACGCACTTCTCGCTCACGGGCGGGA TTTATCTAAACCCTAAAAGGAGATGACAACCAACAGCTACTAGTCCAATAGACAAAATTC AAAATCCTAACTGGCTAATTATCTTTTAAACAATTCCAAATCAAGTTTCTATCTTTCTCT AATTGTCAGGAAATGGAACCCCCTAGTCAACAGAAAATCGAGCAAACAGTGCTCGAGATA CTCAAACAAGCGGACATGGAGGAGATGACGGAGTTCAAGGTTCGAACAATGGCCTCGGAG CGACTCGGAATCGAACTCTCCGATGTTGATCAAAAGAAGTTCATCAGAGGCGTGGTGGAG TCGTTCTTGCTCTCCACCGTGGCAGACACTGGCGCTGCTACTAAAGAAGCTGATGCGAAT GTTCAAGGAGAATCTAGTCACCAGCAAGTCGACATCAAGAGAGAAGTTAATTTTGACGGA GACCGCATCATTTGTCAGGTGAAACCTTAAACCAACAATTTCTTTGATCAAATTTCGATG ACTGCAAATGCTTTGTTTGTGTGAATTCTAGATAAGCATATCATGCTACATAGTTGAGAA TGAGATATTGAGATTGAGTTTGAATTTTGTTGTTATTGTGTAATTTTTGATAATGTAATT GGTATTTCTGCTTTTGAATTCCAAATTAGATCCTGTAGAATTGTAGCATTATGGGTTGAT ATTGCAGTCAATACCACGTAGAAGATTCGAGTAGGAACCACAGTGATAGAAAGCTTTTTT TTTTATCCTGTCTGGATTCTGCTTTTATTGAAGATTGTTCCTTTTGATTTAGCTTTCGAA AAAGAGGAATGTGGCGGTTCAAGAATTCAAGGGTAGAACTATTTTGACAATTAGGGATTA CTATCGAAAAGATGGAAAGCTGTGTCCGTGTGCCAAAGGTGATCAGATGAGTGTTTTCCC GATTCTATCTTTGGTTCCCTATTTCATGCAAATTTTTTTATTATGATGTTTCTTTATAAC ACATTTGCTTTGGCTTACCATTTAATTTTTGGTTTGAATATGTTGCTGCTGAAAACTTTG TCAAGTTGTCCGCTTTAAGC >LITCHI026871.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTGACCATCCGATTTGGACCCACCACAGAATCAAGCTCTTCTTGGATTTTGCGAAGAACA CGTGGATGTTTGATCACCTCTGCCATTGCCCATTCACTGGTCACAGCTGAAGTATCCGTT GCAGCAGCTATCATGTCCTAAAAACCCCCAAAAAAATCTAACTTATATTATCAATTAAAA TTGCAAGATAATACCATGAAAATATTTTGTTTTGTTGTAAGAGAAAATTACCTGAATTAG AGCTTTAATTTCAACATCATTCATGTGTTGTTTTCCATCTTCACCAGGCAAAGACAACAA AACATCAACAAAATCCATCTCTCCACCATCTTCATCTCTAACTAATAAATTTCTCTCTTT CTCCTTTGTTGCCTTTCTATGTTCTTCAATAATCATTGTGTGAAAATCATCCACTCTCTT CTCAATCTCCCTCATTTGCTTTTCACAACCATAAGGATCTACCCATCTCCAAATCGGCAA ATAATCACCTAAATATATCACACCCAAAAGCTGAAACAGCTCATGCGTGATGTGCATGAA CTCCATCGCTTCCTCTGAACCCCCACCAAAATACTGCTTCCCTAACAACATCCTCGTCAC GTTGTTCATTGAAAACGCGCCTAACACATCTCTCAAGTTGACGGGCTTCCCATTTTTGGC CCTAGCCCAAACATCTTGGATAAGGTGTTGGGCCTCATCGGCCCGATGCTTGGCAAACGA GTCTAGCCTCTTTGTTGTTAATAGATTCTCCATGCAAATTCTCCTCATCCTCTTCCAATG TGGGCTTAATGGGGCCAAGGCCACATCGCCACACCCGTAAGCTAGATGGACCGCAGCTAG TGTCCGTGGTCGAGAAGCGAATACTTCGTCTTGCCGGAGAAGTATTTCACGGATTATATC GGGGTCATTGGTGGTGAGGGCATCCACGTTGCCTAGGCGGAGGTAGACCAACGGCCCATA TTTATTGCACAAAGAAGCTAGATCCCTGTGGGGGAGTTGGCCCAATTGGAGAAGGTTGCC GAAAATGGGCCATCTGGGTGGGCCTGGAGGAAGAGTTTTTGTCTTATGGGCAGTTTTTCG ATTGAGGAAACGGTGTATGACATTGGCGATGAGAGATGCAAAGACAAGGATTGAAGCAAT GGTGGCTAATTCCATCAAAACTAATGAATTCCAGAGATAATATAGATACTTTATACATGT AGAAGCTTAAAGAATTGCATCTAAAAGGCTAACAGTGAAACCATGGGCTCAAAATTGTCT TGCCATGTGATTCTATTTGTATATTACGATTTATGCTTTTTTAAACCCTTTAGAAGGTAA TAAAAACATATTTTTTGATACCACATTCTTGACATGCAATTGAGATTGAATTGGATGCCT CAATTCTACATAGATAAAAATAACAATCAGTTTAAAAAAAAAAAAAAGGATGAAACCCTC TTTGAACTTGTTTGGTTGGTGGAGCATGTTATGTGCGATTGTGTTTTGTGGTCTCCTACT CCAAGAAATAGCATTCGCGTGTTTTTAAACACTCATGTGATCTGAGTTGATGCACGGTAG AAGGAAGAGAAGAGGCGCATGAGCCTCGTGATTTGGCGAGTAAGTCTGAGTAAGTAGTAT TATATATTATAGCTAATGGGCACGCATCAGAAAATAATGATCTATCAAAATATTGAAAGA AAGTTATGATGCCACAGGTCATTGCTTGGTTCCATGGTCTAGTGGTTAGGACATTGGACT CTGAATCCAGTAACCCGAGTTCAAATCTCGGTGGAACCTTTAAATTATTTTGTTTCTTTT TCTGTTTCTGTGCCAAAAAGGGCTATTTCTCTATTGTGGTACCACGCACTTCTCGCTCAC GGGCGGGATTTATCTAAACCCTAAAAGGAGATGACAACCAACAGCTACTAGTCCAATAGA CAAAATTCAAAATCCTAACTGGCTAATTATCTTTTAAACAATTCCAAATCAAGTTTCTAT CTTTCTCTAATTGTCAGGAA
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