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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI026769Chr31288792812899041+Serine/threonine-protein kinase ATG1a

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI026769.m114270PF00069.28PkinaseDomain244.21.50E-72
LITCHI026769.m116264PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain160.26.00E-47
LITCHI026769.m2193PF00069.28PkinaseDomain64.78.90E-18
LITCHI026769.m2187PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain33.52.80E-08
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>LITCHI026769.m1
ATGGATCCGAAAGAGGTCCGGTTGATCGGGGATTACATAGTGGGGCCAAGAATCGGGTCG
GGTTCGTTCGCGGTGGTGTGGAGGGCCACACACCGGCAATTGGGTGTTGAAGTTGCTGTC
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GCTTCAAATTCAGAAGAGAATAAAAATTTTAGCAACCCTTCTTCCGTTTCCATGTGGGCA
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TTGCAGTCTCGTCAGTCTCATTTTTTACTGTCACAGCCTGTTACTAAGCAATCCACAAAT
ACCGTCAGGAAGTAA
>LITCHI026769.m2
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GGGGCAATCTTGTTCCAACTGGTGACTGGGAAACCACCATTCGATGGCAACAATCACTTG
CAGCTTTTTCAGAATATTTTGAATTCCACTGAGCTGCAATTTCCACCAGGTGCATTAGAA
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GATGTTGAGCAGGCTTCTCTAGTTCCACAGACGGAGCCAGTGGTTGAGCAATTCAATTCT
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AATCCAAAATCACCTTGTTCTTCTGTACTTGACAAAGTAGTACCGAACATAATAGATCAT
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CAAGATACTTCGACTACCAAGGTTTCTATCAGCCCATCAGAGAAGAATGACCATTTAGCA
AATTCTGTGCAAACAGAGGAGGTGGCTGTTGGTGCTGCTAGTGGTGCAGGAAGTTCACAA
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GGACTTACCATATTACATCCATCTACCAGGCTCCAACTATTGCATCAGTATGTGCATGCT
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GAGCTGGTTGTGTTAGCCATATGGAAAAAGGCTTTTGAAATTTGTGACTCCTGGATGACT
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GCTGCATTGTACTCCAAAGCAATGCTTCTTCTTTCATTTATCACAGGAGAAGCAACATCT
CTGCCACTAAACCCTCCTTTTTCACTAACTCTTGCAAATAAGAAACGAATCCAAAGCTAC
ATTGACAATTTGCAGTCTCGTCAGTCTCATTTTTTACTGTCACAGCCTGTTACTAAGCAA
TCCACAAATACCGTCAGGAAGTAA
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>LITCHI021442.m1
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VTAGIKPQGLNNVKDPEVKAFIEKCIAQPRARPSASELLKDPFFSELNDSEANPDA.
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>LITCHI003693.m1
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ATAAGCAAAGTTCAGAGGAATGAACTCTACGTCGACCCTATTAGTTGGAGCTGCCATATT
CAGACATAAAGGTGTATGGATGAACCTAACCCTGCGTCCAAACAGGCCGATATAAGGTAG
GACCGAGTCCAAGTGCAACACGCAACAACTCGAAGGAGACCAAATCCTCGTGAACCATAA
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GGTTAAAACTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTAGATTTCTTTCCTCTCTTTCTCCGTGATGGC
ATCGCAGCAAGACGACACCGTTTTCGCCGAAGAAGACCAAGACCAAGACCTCGAAGAGGA
AGACGACGAGTCCTCCTCCTCCGACGACTTAGAAGAAAACGACGACGTCGACGACGAGGA
AAATGAAGATGACCTCAATTCCGCCTCTGCCATAACAGTCGCCTTCCCTTCCTCCTCCTC
GGCCTCGATGGCCTCCGCCTCCGTCTCCGCCGTCACCGTCGCCGTCCCTCCTTCCTTAGA
AGAGCCGGATCCGAAGCGAAACCGCCTGCAGGAAGAAGAGAAGAAACCGCCTCCACCTCC
GCCGCCGCCGCTGGACGAATCTCGACGGCTCTTCCAGCGGCTGTGGACGGACGAAGACGA
GATCGGGCTCCTACAAGGCTTCCTGGAGTACACGTCTCAGAGAGGCAACGCGCACCACCA
CGACACGGCTCTGTTCTACGACCAGATAAAGTCGAAGCTCCAGCTGGACTTCAACAAGAA
TCAGCTGGTGGAGAAGCTCCGGCGCCTGAAGAAGAAGTACCGTAACGTCCTCAACAAGAT
CGGCTCAGGTAAGGACTTCTCCTTCAAAACCGCTCACGATCAGGCCACCTTCGAAATCTC
AAGCAAGATCTGGTGCAACAACACCACTAATAACAACAACAACAGCAACAATAATACTCT
GCATAATAATAATGTTAGTGTATTAGATGAAGAAGACGCGAATCACAACAATTTCAATCC
TCATCATCATCATGTTAGTTTTAGTAACGAAGCGAAGATAAATAATCATAGTTATCATCA
TCAAAATGCTAATAATTATGAGGAGAAGGTGGTGATTACTCCGACTCCTCCGCGGTCTTC
TAGGAAGCGGTCGAGGTCGTCCAAGGCCGTGGTTGGAGGTAGTGAGAATGTGGTTTTGAT
GAATAATAGTGAGAATAATAATAATGTTAGTTTGAATGCTAATAATGTTGGGAATAATGG
GATTGTTGCGGTGGTGGAGGAGACGGTGAGGAGTTGTTTGTCGCCGGTGGTTAAGGAGTT
GTTGGGGAATGTTGTGGGTGGTGGGAGAGGGATTGGAGGGTTGGCGATGAATGCGGTGAT
GCCGTTGGGGGGGTTGGGGTTGGGATTGGGCGGTTTTGGAGGAGGGGAAGTGGTGGATGA
GAAGTGGAGGAAGCAGCAGATTTTGGAGTTGGAGGTGTATTCGAAGAGATTGGAGTTGGT
GCAGGATCAGATTAAGGTTGCGTTGGAGGAGTTGCGGTCCATGGGTGGGTGATTGATGAT
TGGGGAGAGGTTGGAGGGTGGGAGGTGTGGAGGAAGTGGCTCGTGGATTTTGGTTTCGTT
TGGTGAAATGTTCGTTTATCAATAGTTGGATGGATGGATGGATGGTTGGGTTGGTGAATA
GCGTAGGAACTCAACTAGCTGCGATTTAAGTTATTTTTACTTTGCCCTTTTTTTTTTACC
CTTTAATTTCATAGAACAGATGTTGAATAATGATTCCTAATTGTGACATCTTGTTACTTT
TCATGTTCCTTTTATAGGTGTAAATAATGGTTTATTTATACATAGATTGGAATGACAATG
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AACTTTTACATTATTGGGTTTAAGAGACTTCTACTTTGAAAATATTGTTATCGAAAATTA
TTACTGTTATTTGAATTGTATCTCATTATGCGCCTATTTTCGAGGGGCATTCATGGTGTT
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AAAACAGGCTCCTATTAACTTCCTAAGCCCCAAATGCAACTTATTTTGCTTGTGCTACAT
ATTTGTCTCAAATGAGGCAGGCCCCATTTCTTGTGTTGTGGATTTGGGTTAGCTAGAACA
TATTGTTTCTTTGGGTACTGTTATTTGTTTTATGCAGATTGTGATGTGAGTGCTAATGTT
GATGAAGAGATGCATTTAATAATATCTTGAAAGAACAAATGGTAACTTTATGAATGACTA
GTTCAACTAGTTCAACTGACTTCTTGTAAAAGTCTAGTTGTGATATTGAATAAGTAGTTG
ATCAAATTATACATGTAAAACTAGCTACTGGAGTTTGAACTAAGAGCGCAATGGCATGGC
AATATATCATTATTAGACTCTGTTGTAGTGTTTTTAATATGTTTTAAGTTGAGGGTTGCT
GCCTGGGATTACAATGTTTTGAACTCTAGAACCAAACTAGTGGATCCTCCACCAAGCAGC
AGTATCATTATTAAACAACTTTTAATGAAGTGCCGTGGTTTTAATTTCTTCGAGTTGGTA
GTTCCACCGAACTTTGTGCTCTCTTAATTTGTATGTGTGTGTTTTCTTTGACATGAGCTG
TGTGGTGAATATTACCTGTATATCCAAATAAAATCAAACCATGACCTCACAGTCCGCGCC
TTCTACTCTGTAATGGGTATTTTTCTTAAGCTTATACTGAAAGAGCTATTTAAATTTAGT
TTCGGGTATGTTGGTCCTTCATCTCTGAACTGTTTGTTTCACAACTTCGACATTGTGTTT
TCCTGAATCTTGTGTATATGCCTGGTCGGCTAGACATCTGAAGAACTATCTTGTTTGAAC
TTTTCAATGTGTGCTGTCCTGATATATAATTTACAGTAGTGTCAAGACAATGTCAGCTTA
TTACTGATCCATATTCATTGCATTGTATGTATGATGCCAGCTACGATTCAATGAATTAAC
AGCAGATCAAACTGTTTCTAATGACTAATGGGTGAGTCGATACTTTTGCCAATCCTGGAA
AAGTATCCTGGAAAAGAAAGGGCAACCGAAGCAGGTGCCTGCATTCACTGATGTCAAATA
ATTTTGAAATTTCCACCTCCTGCCAACGGGTGCTGGCAATAGTTTGTGCCTGTTTTGTGC
TATTTTGGTCCTGTGCTGTATTGTGCTGTTGGTGATTGGTTTGACTGATTCAGATCGGTA
GTATAATAGCTTTGGTCCGGTGTCCTAAAATTGCCTCTCTATATATATATATCAGATGAT
AAGGTTGATGAGTGGTTGATCATGGTAGCTAGAGAAGTGCAATGACATGACAAAAGGAAT
TGACTCCTTGAAAAGATTTGCCGTTACATGTTTTTTCTTTGGGTGCCAATAATAACATTT
GTACTAATAGATACTGGGCGTCCACGATAATGATAATCTTGGAAGATTTCAGACTTGC
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>LITCHI003693.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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TTCCAGCAATCTAATAATACTAGCATTTTTTATTTTTTTTTAAATATTTTGGGCTACATT
TTCACTGAAATAGTGAAAGCCATATAAATTTTCTTACTTCTATTTCAAGTTTACGAGAAA
TATTCAAGGGAGTAAATATTGTTATTGTTAATGATATATATGTCCGACGTTCTTTATGTT
CTAGGATGAATAATATTGAAAGAAGTAAATGTTGACATTATTCACGATGTACATCCAACA
GTTTTCGTATTTTGTGCTAACCAATATCAAGAGACTACTGTTAAGTTGCTAAAAAATTGT
CTAAATTCATTGATGACATTGTATATAAGTTGTTAGCATGTCATCGCTTTTATCGTACAT
ATGTTTTAGATATCTTATCATTTTATCATTTATATAGTGTGAATATTAACAACTCACATA
CTATATAACATAAATATTTGAATAATCTATTATTACTCATATAAAAGTATCTTAAAATAT
TTTTGATACTGTGGGATTATTGACGATATTTTAGATATTTCAACTGATATTATATACAAT
TTAATTATCTTAAAATTTTTGTCATACGTTATGATTTATATACGAGAATTGTAATTGTTT
TACAACACTATAGATTTCCTAGGTTGAAGAATTATACATTTAGCATATTGAAAATTTCAT
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TGAGAAATAAGGTGGGATTGAGATTTGTTTTTTCCCATCCTCTCACATTCCACATTTGGA
TCACGCTTAGGTGAGGGAAGCGAATGAATTTTTTCATTTTCGAACCCACATTCATTCCCA
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GAATCCTTTAAAAAAAAAAAATATTCCTCTCTTATCAAACAACCACCAATCATTCTCTTT
CCTTACACAACTCTTCGTCTCTCTCTCATCTCCACCACACCTACCCACCACTACAGCAAA
CCACTCTACGTCTCCCTTATCTCTCTCTCCATCTAGACGAACGAACAATGACAACACAAA
TCATCTTAATTTTTTTTTCATCTCATCTTCATTTTTTTATGAGTTTATTACGGGTTTCAT
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AAGTTCGTATTGTTATTCTTAATATTGACGATGTTTTTATTGTGGGAGATAATGATGTTG
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TTTTTTTCAGATTTTTTATAAAATTAATTTAAGTATATAATAAAGAATTTAAATTAATTT
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GTGTAAACCTCTAACCACCCACTCTGGTTAAAACTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTAGATTT
CTTTCCTCTCTTTCTCCGTG
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>LITCHI003693.m1 GenomeSequence - 
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ATAAGCAAAGTTCAGAGGAATGAACTCTACGTCGACCCTATTAGTTGGAGCTGCCATATT
CAGACATAAAGGTGTATGGATGAACCTAACCCTGCGTCCAAACAGGCCGATATAAGGTAG
GACCGAGTCCAAGTGCAACACGCAACAACTCGAAGGAGACCAAATCCTCGTGAACCATAA
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GATCGGGCTCCTACAAGGCTTCCTGGAGTACACGTCTCAGAGAGGCAACGCGCACCACCA
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TCAGCTGGTGGAGAAGCTCCGGCGCCTGAAGAAGAAGTACCGTAACGTCCTCAACAAGAT
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TAGGAAGCGGTCGAGGTCGTCCAAGGCCGTGGTTGGAGGTAGTGAGAATGTGGTTTTGAT
GAATAATAGTGAGAATAATAATAATGTTAGTTTGAATGCTAATAATGTTGGGAATAATGG
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GTTGGGGAATGTTGTGGGTGGTGGGAGAGGGATTGGAGGGTTGGCGATGAATGCGGTGAT
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GAAGTGGAGGAAGCAGCAGATTTTGGAGTTGGAGGTGTATTCGAAGAGATTGGAGTTGGT
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TGGGGAGAGGTTGGAGGGTGGGAGGTGTGGAGGAAGTGGCTCGTGGATTTTGGTTTCGTT
TGGTGAAATGTTCGTTTATCAATAGTTGGATGGATGGATGGATGGTTGGGTTGGTGAATA
GCGTAGGAACTCAACTAGCTGCGATTTAAGTTATTTTTACTTTGCCCTTTTTTTTTTACC
CTTTAATTTCATAGAACAGATGTTGAATAATGATTCCTAATTGTGACATCTTGTTACTTT
TCATGTTCCTTTTATAGGTGTAAATAATGGTTTATTTATACATAGATTGGAATGACAATG
ACTAGCATGGTGGATAAAGATATAGCTGTTTTACTGATACATATATCTCTTTTTCTGTGT
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TTACTGTTATTTGAATTGTATCTCATTATGCGCCTATTTTCGAGGGGCATTCATGGTGTT
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AAAACAGGCTCCTATTAACTTCCTAAGCCCCAAATGCAACTTATTTTGCTTGTGCTACAT
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TATTGTTTCTTTGGGTACTGTTATTTGTTTTATGCAGATTGTGATGTGAGTGCTAATGTT
GATGAAGAGATGCATTTAATAATATCTTGAAAGAACAAATGGTAACTTTATGAATGACTA
GTTCAACTAGTTCAACTGACTTCTTGTAAAAGTCTAGTTGTGATATTGAATAAGTAGTTG
ATCAAATTATACATGTAAAACTAGCTACTGGAGTTTGAACTAAGAGCGCAATGGCATGGC
AATATATCATTATTAGACTCTGTTGTAGTGTTTTTAATATGTTTTAAGTTGAGGGTTGCT
GCCTGGGATTACAATGTTTTGAACTCTAGAACCAAACTAGTGGATCCTCCACCAAGCAGC
AGTATCATTATTAAACAACTTTTAATGAAGTGCCGTGGTTTTAATTTCTTCGAGTTGGTA
GTTCCACCGAACTTTGTGCTCTCTTAATTTGTATGTGTGTGTTTTCTTTGACATGAGCTG
TGTGGTGAATATTACCTGTATATCCAAATAAAATCAAACCATGACCTCACAGTCCGCGCC
TTCTACTCTGTAATGGGTATTTTTCTTAAGCTTATACTGAAAGAGCTATTTAAATTTAGT
TTCGGGTATGTTGGTCCTTCATCTCTGAACTGTTTGTTTCACAACTTCGACATTGTGTTT
TCCTGAATCTTGTGTATATGCCTGGTCGGCTAGACATCTGAAGAACTATCTTGTTTGAAC
TTTTCAATGTGTGCTGTCCTGATATATAATTTACAGTAGTGTCAAGACAATGTCAGCTTA
TTACTGATCCATATTCATTGCATTGTATGTATGATGCCAGCTACGATTCAATGAATTAAC
AGCAGATCAAACTGTTTCTAATGACTAATGGGTGAGTCGATACTTTTGCCAATCCTGGAA
AAGTATCCTGGAAAAGAAAGGGCAACCGAAGCAGGTGCCTGCATTCACTGATGTCAAATA
ATTTTGAAATTTCCACCTCCTGCCAACGGGTGCTGGCAATAGTTTGTGCCTGTTTTGTGC
TATTTTGGTCCTGTGCTGTATTGTGCTGTTGGTGATTGGTTTGACTGATTCAGATCGGTA
GTATAATAGCTTTGGTCCGGTGTCCTAAAATTGCCTCTCTATATATATATATCAGATGAT
AAGGTTGATGAGTGGTTGATCATGGTAGCTAGAGAAGTGCAATGACATGACAAAAGGAAT
TGACTCCTTGAAAAGATTTGCCGTTACATGTTTTTTCTTTGGGTGCCAATAATAACATTT
GTACTAATAGATACTGGGCGTCCACGATAATGATAATCTTGGAAGATTTCAGACTTGC