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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI026700 | Chr3 | 12280912 | 12284596 | + | Transcription factor PIF3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI026700.m1 | 352 | 399 | PF00010.29 | HLH | Domain | 51.5 | 8.30E-14 |
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>LITCHI026700.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCCTTATCACGAGAGAATCTTGGATGAATTTCCACGCACATATATTTTCTATTGTGATCA TGTTATGTAACCAAATTGGATTGTATCGGGAGATTTATGGTGCAATATGCATCATTTTAG ATTTGTCCCACTTATCAAATTGAACACTTATCGCATGAAAAACTCTAATGCTGTGGGCAG TGGGCTATGTGTTAGTCCAGTCGTAGTTTGCCATGTGGCAAGTTTCATATTAAATGGGCT TTTCTCGTGATGCTAGGTTATTTTTATTTTTTATTAATAGTTAAATCAGCTTATAGTAAA AAATGAATGATAATTCAACAATATTAGATTAAACACAAATAGATTGTTACAGATTAAAGT AACAAAGAAATTAAGTTGATATAGGTACAAACTATTGTATATTTTTTTTTCTTAGTTACG ATCATAAATTTAGGAGTTGTGAGAATGGTTCAATATGTTTATAAATATAGGCCCAACTAA TTTAAATCATGTCATTTGGTATTGATTATTCATATCACATGCATAATTTTGAGCGATTGG ATGTATACACTGAACGCATCAAAATATTTTTGATGAATATGATTTGAATCCAAAATCTCA TTAATGTTGTTGACAGAAAACCTTTCGTTGGGCCTTCTCAATTTAATTGCCTTTCTATAT ATAATTAAAAGTTAGAAATTTATGCCACAATGGTTATAAATTTATTGGGATCAATTGAGA TGAATTATATAAGGGTTTGAAAATCTACCCTTATATCATATGGAGACATGAATTCTCATA AGAGAAAAATTCTTCACAGATATTGATAAATACTTATGTTTTTATTATAAATGAGAAGAG CAAATAACTGATTAAACTTTGCATATGGTAAAAATCTGATCTTCTATGAAAATGAAAAAG ACAAATTTTAATTGTTTTGAATGCTGGTTGAAATGTCACGTGCATCGTACACCTAAGGGT GGCAAGGAAAGGTAAAAATAGTCTAGGTCAGTAGAATTTCGATGACCACCTGGCGGTCCT ACCACTTTGTATGTTCCCTTTGATTTATCTTAAAAGATCAAAAGTGCCATGTGAATAGAT AACTAGACATCAAGATGTTGCATCGCATAAATAAATGAAATTAGATAGGAGATATTTATT TTTGCCGTGTAAGTTGAGGCATAGAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGCACAATGGGCAAAT GGCCCAACTCTTGTGTGAATTCTATTATTTATCATACATTTATACAAAGGTACGCAGGCA ATGTGTCGAGCGTAGGGACACAGCAGAGCAGCCAGCGAAGGTCCCAAAAGTCTTTACCCT CACACGCAACAAATTATTAGGACACCATCATGGGCCACGTGGAATCAAGTGGGTCCACCA GGCAGTCGTGGACATCTTCACCTCCATATATACCTCAAAAATTATTGCAGACTATGAATA GACGTGCTCTAATTTTGTGCACTAGTTCGTGTGGATATGGGCGCATTCCTCCAACCAAGG TTCTTTTCATGTTTTTTGCAATAAGCTGCTGCGTACCAGTTAATTTAATGTTATCTGGGA GCTGTCTCAACAAATTCGTAGATATCTAGGGTACGATTTGCCAAGGTATAGATTACTTGT AACTATAAATTTGCTCATGGGCACCTTTCTTTTTACTTATTATTAATTTCTTGCACAGAA CATATCCTATCTGGCTACCTGTCTGCTCATCATCTTCTGCTTCTTGTCTTTCTTCTTTGT CTTCTTATATCTTTCTTTTTATCTTTTAGACCCCAAACAACACCAGATTTGATTTATTGT ACTCGATTTTACACACATTGCTCGTTTGATAAGCAAGTTTTAGCGGTGCTATTTTGCTGG AATTTCTGAGTTCAGTAATTGTTCATTCTTCAGCTTGCTGCGTTGAGCTGTGCGAGCATC GTGGTAGCTTCAAAAAGCCTTACTCTTGAGTTTCTAGTTGCCGAATAAACAGCTTTGTGA AGCATTCTGGACTGTATTCG
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>LITCHI026700.m1 GenomeSequence + ATGACAAAAGAGAATCTTGAATCAACCAAAATGATGAAGATCGCTGGCCAGAGAGCCAAT TCATTTCCCATGTAAGGTTTTCTTAACTAACTATTCTTTCATACTACTCTTTCTTTTTCA TGCATATATTGATGGACTTTTTATGCAGAGATAATCATGAATTTTCCGAGCTGGTATGGG AAAATGGTCAAGTTTATGTGCAAAGTCTGCCAAGAAAATCTCAGGAGAGCCCCTCCTTCG CTAATGTTAATATCATGAAGAAAAGGTTTGGGACCTTGGATGAGTTTCTTCATGATAAGA AGAGTACTGATTCTCTTCAAGAGAATAAACTTCTTGAATCATTGTATCAAACTCATCTTA ATATGTTCGTGGAACACAATGAAAGCAACACTTGTGATACTAATCTCACGGACTCTCAGA TTGTTCCAGTAAATGAAGATGCGAATACGCAACTGGGTGGTTCATGTAATTTAAGAGAAA CCCCTCAGTTTAATTCAACAAGGGATAACCAACCTCATGATCAATCCTCACTGCAGCAAT ATTGTTACCAAGCTTCAGCTCCATTCAAGAGGCCAAGAGTACTAGATTCAAGCATGAATC AAGTCTTAGATAACTCAAAGTCGCAGGAGCAAGACTTGGAATATGATGGCAAAAGAGAGA AAGTGAACTTCTCTCTCTTTTTAAGATCTCCACTACTTCGTAACAGTAGTACTCAGAGAA ATGATGTTACAGTGCCTACAAACGGTACTTCAAGCTCATCAAGATCTAAGAAGCTGAAAA ACAATATTGGTTGTGGAGATACCAATGTGGAGGTGGCACCACTAAGCGCTCAGCCTCTGA AAAAGTCAGTCCCAGATGACCAATCCGAAGCTGTTCGTCCTAAATATACAGCAAAAGAAA AGCTGATCAACAGTGAAAAATCTATGGAGCAACGCCCAGTTGCATCTTCTTCATTTTGCT CACGTGGGGCTTCAAACAATCCTATATATAATAATAATTTGAAGAGGAGATATCATGACA CCGAGGGGTCTGCTGATCTTAGCGATCAAGTATGTACATAAAATTAATTTCTCAATTCAC TTATTTTATTTTATTTTTTATCAGCTTAGTTAATTTTCACATGATTCTAAGAACATGAGT TTTGTTGCAGAATGTTCAGGAAAAGTTAGAGAATGCGAGAAAACAAGTGCCTGCTAGGCG CAGTGCAGGTTCCAAAAGAAAACGAATAGCGGAATCACATAATCAATCTGAAAGAGTAAG CAAATATTGCTCATTAAAGGGAAACCAATATTTGAAGAGAATACAGAAAAATATAAGTAT TATTGAAAATGTATATTTGGCATACAGAAGCGAAGAGATAAAATCAACAAGAAGATGCGC GCATTACAGGAGCTAATACCCAATTGCAATAAAGTGGACAAAGCTTCGATGCTTGATGAG GCCATTGAGTACTTAAAAACCCTTCAGCTTCAAGTTCAGGTACATATATATGCATACATA TTTGTATAGTTATATATTTTCTAATGTTTTTCACTATGATTATCTTGAACTTTAGAATTC CAATGGTGTTAATTTGATTCAGATGATGTCGATGGGAACTGGGGTTTGTATGCCACAAGT GATGATACCAACAGGAATGCAACAAATACATGCACCACAAATGGCTCATTACTCGCCAAT GGGTGTTGGGATGGGTATGAGAATGCACATGGGTGGTGCTCTTGGTTGCAGCCCTCATCA GTTCCTCACTTCACCTATTGCAGCAGCCACAGCTATGGCTGGAATCACCCAAAATAGAAT GCAGATACCGGGGTTCGCTCCTCAACCGTTACCACCCATGTCATTTTTTCGTTCACCACT AGGCCTTTTTCACAAAACAGTCCCCGTAGCTGCTGCTCCCGTGGAACTTATGGGTGCTTT TAAGCCTTCAGATCCCAATGATCCAAACCAGAAGATTAATTGTGTACAAGAGGGAAACAA TGCAAAGGCTGAGTGCTCCTAGAATCAACCATCTATTTAGGTTTGTGCTTATGTTTTTAC TAAGAAATGTCACTGTGGACAGAAGACATAGAAGGGTCATGAGTATTTATAACTTAAATC TTTGTCAAAAATGAAGTATCAAAAGAAATGATTTATAAACATAACCATGAATAGACGATA GTCATTTAAAAAAAAAAAATCATTGTAGGGTGTAGGATTCTTGTAAAATAACTATATAGC ATTGCTTTAATTACTCTAGCCAACTGTGTTTAATAAATTTCATTTGTTTCCAGGTTCTTT TGACCAGGCCAATTATTCCCTACATGCTGTGTCTGTGAGAATCTAAACTGAACCCTAGTT GTCGCTGAAAAATGGATCTCACAAGGAAATTGAAGTTATCAGTTGCGACCATCACATATA AATGATAAGTAAGTTGTTATATATGCTTGCACTTCATACATTTTCATTCGTTTGAGTGCA TATTTCTTTTCTTTTTAAACAGAAAATCTTGGCTGACATTGGGTTATTCAATGCAGATTA CAACTTACAAATCACAAACAGTTGACTAAAATCTGGCTATTGAACAAGAAAATGCAAGGT AGAAAAGAACCCAGATGCATGCTTTGTCATGTTAATTATCTGGTTCGTGGCCTGAATTCA CTCACAGCATATGGGGCATGAAGATGATAGAACAGTATTTTCACCAATGCAGGATGCTAA GAGAAATTAATGACAACATTTTGAAATGTAGATACGATTGCTTTTGATCCAACAGCTTGT CGCTCTCAAACATCTGTATCGGTGTGTTGTTGTGTGCCCTCGAAAATGATCAAATTGAAC TATAATTTTTTTTTTTTTTAATAGTTTTCAAAATTTTTTGAGAAGCTGGTTTAAATTGAT TGAAGTTCTTGCAAAAACTTTTTTCTCTTGTAGTATCCAACAATATACTTCAACTTATGG TTAATTACAACTAAATAATAAATAGCTAGCTTTTTGGTAATACGTCGATCTGTAAACTTT CTGCCTCTAAAACCCTATTTGAAACCGGTGTAACAGATAGTTGTAGGAACAGCCTTCATT GAGCAACAACGAAGGATGTGTCCACACAAGTAATACCTGCACATGATTAGAGCTTTTGGA ATGAAACATATATTAATAGTTCTTATCTAGTCGCAGATCGTAATTTTAATTTAATTTGTA TTGTAATTTCAATCAATTTAATTGTTGTTAATGTGCTATTTTTTTTTCAATAATTCAATT CACTAAAAACAAAATCTCATATTTATAATTTATGGATAGCACTCACAACTCACTAATAAT TTAGATGTGTGTGTGTATATATATATAAACCTTGAGGCCTTGTTCGATGTGCGGTATAGA ATTGAATAATTTATGTGGAATTACATGGAATGGGATGAGATTGGATTGGATGTTATTCTA TGCTTGGTGAAAGTAGGATATAATTAAAAATAGTAGATATAAAATTGGATTTTAAAAAAA ATTTCAAAGACTTTTCACAAATTTCACAAATTCCACCAATATTCGGATTAAAAATAATGG TTGCACCACCGTCTCTTACCTCCTCCACCACCACCCTCCTCCATTTGCTATCCATGAAGT CGAAGAAGATGGCGATCGACAGTGATGAAGATGTCGAAGAACTTGGTGATCAGTGGTGGT GAAGAAGATCTGAAGAAGCTGGATG