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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI026696 | Chr3 | 12257703;12258828 | 12259957 | - | Auxin-responsive protein IAA30 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI026696.m1 | 74 | 141 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 50 | 3.70E-13 |
LITCHI026696.m2 | 65 | 187 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 111 | 8.80E-32 |
LITCHI026696.m3 | 79 | 189 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 110.1 | 1.70E-31 |
LITCHI026696.m4 | 122 | 183 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 47.9 | 1.70E-12 |
LITCHI026696.m5 | 122 | 231 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 108.7 | 4.40E-31 |
LITCHI026696.m6 | 79 | 176 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 82.7 | 3.80E-23 |
LITCHI026696.m7 | 122 | 218 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 80.8 | 1.50E-22 |
LITCHI026696.m8 | 122 | 183 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 47.9 | 1.70E-12 |
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>LITCHI026696.m1 ATGCTTCCACATACATTGCCTTCGTCTATTTATTTAAAGCTCAAGGGTGGCGGCTTCTTT GTCTTCACATCTCTCAAAATGGGCAGAACTACTAGTTGTTCTTCTTCTTCTATTGAGAGC AGCACAGAGCTGAGAAAAGACCTCAGCACAGATCTCAGACTTGGACTTAGCATTTCAAGT TCCTCTCAACATGACAACTCTTCTTCTTTCTCAACAATCAGGGATCAACCATCTGATTGG CCACCAATCAAGCCACTTCTGAGAAAAGCACTTGAAGCAGAAGAAGATGAGAGCAATAGT GCCACTTTCTATGTGAAAGTTTACATGGAAGGCATTCCAATTGGAAGGAAACTTGATTTA TTAGCACATGATGGTTACCACGACTTGATTAGAACTCTTGACCACATGTTCAACACTAGT ATTCTCTTTCGAAAATCCATTTTCAATGTCATTATATTAAATCAAGTATTGGCACATGAA AGCAGGGTCTGA >LITCHI026696.m2 ATGCTTCCACATACATTGCCTTCGTCTATTTATTTAAAGCTCAAGGGTGGCGGCTTCTTT GTCTTCACATCTCTCAAAATGGGCAGAACTACTAGTTGTTCTTCTTCTTCTATTGAGAGC AGCACAGAGCTGAGAAAAGACCTCAGCACAGATCTCAGACTTGGACTTAGCATTTCAAGT TCCTCTCAACATGACAACTCTTCTTCTTTCTCAACGGATCAACCATCTGATTGGCCACCA ATCAAGCCACTTCTGAGAAAAGCACTTGAAGCAGAAGAAGATGAGAGCAATAGTGCCACT TTCTATGTGAAAGTTTACATGGAAGGCATTCCAATTGGAAGGAAACTTGATTTATTAGCA CATGATGGTTACCACGACTTGATTAGAACTCTTGACCACATGTTCAACACTAGTATTCTC TGGTCTGATGTGGATGGATCATATTCAGATCAGAAATACCATGTTTTAACGTATGAAGAC AAAGAAGGAGATTGGATGATGGTTGGGGATGTTCCTTGGGAGATGTTCTTATCAACTGTG AGAAGATTGAAGATTACAAGGGCATAG >LITCHI026696.m3 ATGCTTCCACATACATTGCCTTCGTCTATTTATTTAAAGCTCAAGGGTGGCGGCTTCTTT GTCTTCACATCTCTCAAAATGGGCAGAACTACTAGTTGTTCTTCTTCTTCTATTGAGAGC AGCACAGAGCTGAGAAAAGACCTCAGCACAGATCTCAGACTTGGACTTAGCATTTCAAGT TCCTCTCAACATGACAACTCTTCTTCTTTCTCAACAATCAGGGATCAACCATCTGATTGG CCACCAATCAAGCCACTTCTGAGAAAAGCACTTGAAGCAGAAGAAGATGAGAGCAATAGT GCCACTTTCTATGTGAAAGTTTACATGGAAGGCATTCCAATTGGAAGGAAACTTGATTTA TTAGCACATGATGGTTACCACGACTTGATTAGAACTCTTGACCACATGTTCAACACTAGT ATTCTCTGGTCTGATGTGGATGGATCATATTCAGATCAGAAATACCATGTTTTAACGTAT GAAGACAAAGAAGGAGATTGGATGATGGTTGGGGATGTTCCTTGGGAGATGTTCTTATCA ACTGTGAGAAGATTGAAGATTACAAGGGCATAG >LITCHI026696.m4 ATGCTTCCACATACATTGCCTTCGTCTATTTATTTAAAGCTCAAGGGTGGCGGCTTCTTT GTCTTCACATCTCTCAAAATGGGCAGAACTACTAGTTGTTCTTCTTCTTCTATTGAGAGC AGCACAGAGCTGAGAAAAGACCTCAGCACAGATCTCAGACTTGGACTTAGCATTTCAAGT TCCTCTCAACATGACAACTCTTCTTCTTTCTCAACGTATACATCCATATATATATATATA TATATATATAGCTCAAATAATGCAAACTCAATTAACATGTTAGTCCATTTTATTGATTTT TTTTTTTTTTTTTCACTTAATAATATTGTCTTTCATGTTAGAATCAGGGATCAACCATCT GATTGGCCACCAATCAAGCCACTTCTGAGAAAAGCACTTGAAGCAGAAGAAGATGAGAGC AATAGTGCCACTTTCTATGTGAAAGTTTACATGGAAGGCATTCCAATTGGAAGGAAACTT GATTTATTAGCACATGATGGTTACCACGACTTGATTAGAACTCTTGACCACATGTTCAAC ACTAGTATTCTCTTTCGAAAATCCATTTTCAATGTCATTATATTAAATCAAGTATTGGCA CATGAAAGCAGGGTCTGA >LITCHI026696.m5 ATGCTTCCACATACATTGCCTTCGTCTATTTATTTAAAGCTCAAGGGTGGCGGCTTCTTT GTCTTCACATCTCTCAAAATGGGCAGAACTACTAGTTGTTCTTCTTCTTCTATTGAGAGC AGCACAGAGCTGAGAAAAGACCTCAGCACAGATCTCAGACTTGGACTTAGCATTTCAAGT TCCTCTCAACATGACAACTCTTCTTCTTTCTCAACGTATACATCCATATATATATATATA TATATATATAGCTCAAATAATGCAAACTCAATTAACATGTTAGTCCATTTTATTGATTTT TTTTTTTTTTTTTCACTTAATAATATTGTCTTTCATGTTAGAATCAGGGATCAACCATCT GATTGGCCACCAATCAAGCCACTTCTGAGAAAAGCACTTGAAGCAGAAGAAGATGAGAGC AATAGTGCCACTTTCTATGTGAAAGTTTACATGGAAGGCATTCCAATTGGAAGGAAACTT GATTTATTAGCACATGATGGTTACCACGACTTGATTAGAACTCTTGACCACATGTTCAAC ACTAGTATTCTCTGGTCTGATGTGGATGGATCATATTCAGATCAGAAATACCATGTTTTA ACGTATGAAGACAAAGAAGGAGATTGGATGATGGTTGGGGATGTTCCTTGGGAGATGTTC TTATCAACTGTGAGAAGATTGAAGATTACAAGGGCATAG >LITCHI026696.m6 ATGCTTCCACATACATTGCCTTCGTCTATTTATTTAAAGCTCAAGGGTGGCGGCTTCTTT GTCTTCACATCTCTCAAAATGGGCAGAACTACTAGTTGTTCTTCTTCTTCTATTGAGAGC AGCACAGAGCTGAGAAAAGACCTCAGCACAGATCTCAGACTTGGACTTAGCATTTCAAGT TCCTCTCAACATGACAACTCTTCTTCTTTCTCAACAATCAGGGATCAACCATCTGATTGG CCACCAATCAAGCCACTTCTGAGAAAAGCACTTGAAGCAGAAGAAGATGAGAGCAATAGT GCCACTTTCTATGTGAAAGTTTACATGGAAGGCATTCCAATTGGAAGGAAACTTGATTTA TTAGCACATGATGGTTACCACGACTTGATTAGAACTCTTGACCACATGTTCAACACTAGT ATTCTCTGGTCTGATGTGGATGGATCATATTCAGATCAGAAATACCATGTTTTAACGTAT GAAGACAAAGAAGGAGATTGGATGATGGTTGGGGATGTTCCTTGGGAGTAA >LITCHI026696.m7 ATGCTTCCACATACATTGCCTTCGTCTATTTATTTAAAGCTCAAGGGTGGCGGCTTCTTT GTCTTCACATCTCTCAAAATGGGCAGAACTACTAGTTGTTCTTCTTCTTCTATTGAGAGC AGCACAGAGCTGAGAAAAGACCTCAGCACAGATCTCAGACTTGGACTTAGCATTTCAAGT TCCTCTCAACATGACAACTCTTCTTCTTTCTCAACGTATACATCCATATATATATATATA TATATATATAGCTCAAATAATGCAAACTCAATTAACATGTTAGTCCATTTTATTGATTTT TTTTTTTTTTTTTCACTTAATAATATTGTCTTTCATGTTAGAATCAGGGATCAACCATCT GATTGGCCACCAATCAAGCCACTTCTGAGAAAAGCACTTGAAGCAGAAGAAGATGAGAGC AATAGTGCCACTTTCTATGTGAAAGTTTACATGGAAGGCATTCCAATTGGAAGGAAACTT GATTTATTAGCACATGATGGTTACCACGACTTGATTAGAACTCTTGACCACATGTTCAAC ACTAGTATTCTCTGGTCTGATGTGGATGGATCATATTCAGATCAGAAATACCATGTTTTA ACGTATGAAGACAAAGAAGGAGATTGGATGATGGTTGGGGATGTTCCTTGGGAGTAA >LITCHI026696.m8 ATGCTTCCACATACATTGCCTTCGTCTATTTATTTAAAGCTCAAGGGTGGCGGCTTCTTT GTCTTCACATCTCTCAAAATGGGCAGAACTACTAGTTGTTCTTCTTCTTCTATTGAGAGC AGCACAGAGCTGAGAAAAGACCTCAGCACAGATCTCAGACTTGGACTTAGCATTTCAAGT TCCTCTCAACATGACAACTCTTCTTCTTTCTCAACGTATACATCCATATATATATATATA TATATATATAGCTCAAATAATGCAAACTCAATTAACATGTTAGTCCATTTTATTGATTTT TTTTTTTTTTTTTCACTTAATAATATTGTCTTTCATGTTAGAATCAGGGATCAACCATCT GATTGGCCACCAATCAAGCCACTTCTGAGAAAAGCACTTGAAGCAGAAGAAGATGAGAGC AATAGTGCCACTTTCTATGTGAAAGTTTACATGGAAGGCATTCCAATTGGAAGGAAACTT GATTTATTAGCACATGATGGTTACCACGACTTGATTAGAACTCTTGACCACATGTTCAAC ACTAGTATTCTCTTTCGAAAATCCATTTTCAATGTCATTATATTAAATCAAGTATTGGCA CATGAAAGCAGGGTCTGA
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