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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI026596 | Chr3 | 11116314 | 11120327 | + | Histidine kinase CKI1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI026596.m1 | 477 | 628 | PF02518.29 | HATPase_c | Domain | 92.3 | 3.00E-26 |
LITCHI026596.m1 | 932 | 1058 | PF00072.27 | Response_reg | Domain | 69.2 | 3.40E-19 |
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>LITCHI026596.m1 ATGGAGCAGAAGGTAGACTTGAACTCCCATAGTTTGCGCTCTATGATGATATCTGAAATT GATATCACAGCTAGGTTACTGCATCCACTGAGCTCGTCTGCAACGGTTTTAGCCAGACTT ATGAATTCATCTTTAGACAGAAACAAACTTTCCTTCTTCGACATTGAAACTTGGGTTGCA GCTTCACTGTTTCAAACACTCTCTACAATTCCTCTCATATCACAAATCTCATTTATTGGG TTGGATGGTTTGTTTTTCTCTTACTATATTAACAATAATCAAATCCTAGCAATGTACTGT AACTCTTCATTATCAAGTGTTGGTGGTAATAGAAGAAAGCAGACATGGTACACACAATCT GTGGATCGCGATACAGGAATTCTTTATGGAGAACCGATGATATCTACTCCTTTGAATATA AACTTAACTTTGCTTGAAGAAGTTTTACATAGCACAGATGCAATTGCTTCTAAAGGGTCT GGCTGGATCCAGACTCGTGAGTCTCTATTTCTCAACACAGCTAATATTAATGGAAGAGCA GCTGTCTCTATAGGGTGTCCAGTTGAATCAATAACTAACTTCTTCACTAGTATGAATTTG AGTCTCCATGGTGCGACTTTGTCCGTGGCTACAATTGATGGGGAAGTGTTGCTTGAAGGA CTTCCAAATGCTCATATGAAGTTCGCCAATAACTTAATTTCCTTCCAATCGAAGAAGATA GTTGGTCGTAACATGCATACAAGTGACACTACATATATTACATGCGTGTCAGCTGGTGCT GACTCATATTCTATTCTCAACATAGAGGACATAGAATATATTGTTTATTGTTCACCACTT GAACTTGTGGGCATGAAATCGGTTTATGCATTGGCGTTGCCGCGCAAAGGAGTGACAAGC TTTGTGCATAGGACTAGCAAATTGGCACTCCAGCTCCTAATTCTATTAATGGTCATTGAA GGAATCACTGTGTTCATCTCTGTACATTTGATGGTTAGATCGGCCAAAAGGGAGGCGCAT TTGTGTGCTGCACTCATCAAACAAATGGAAACAACGCAACAAGCGGAGAGAAAAAGCATG AACAAGAGTACCGCCTACGCTAGTGCTAGTCACGATGTTCGTGCCTTTGTAGCAGCCATT ACTGGTCTCATTGAGATTTCCTATCCTGACGCTCCTCCTGGTTCAGAATTGGAGACAAAT TTGAGGCAAATGGAAGGCATTGTAAAGGACCTTATCTCTTTATTGAATACTGTTCTTGAT CAAAGCAAAATCGATGCGGGCAAGATGCAGCTAGAGGAAGAACCATTTGATCTAGGCCAA CTATTGGAGGACGTGGTTGATTCATTTCATGCTCGTGCTGTGAGTAAAGGAGTAGAAGTG ATGTTGGATCTTTTTGACGGCTCAGTTAACAAGTTTTCACATGTTAAAGGAGATGAAGGA AAACTCAAACAAGTTTTGATCAACTTACTGAGCAATGCCATTAAATTTACATCTAAAGGC CATGTAACTGTCAGAGCATGGGTTCAGAAGTCTAGTTTACAAACTTCCATTATCGCTTCG AATCGAGATGGATTTTTACAGCATCTGTCCTGCTTGTTTTACAAAAACAAGAAAGCAGAA ACTGACCTTGCAGCCGTGAATTCCCTTAAAAACAATCCTAACTGCATGGAATATGTTTTT GAAGTGGATGATACAGGTAAAGGAATCCCCAAGGAGAAACAAGAATCGGTGTTTGAGAAT TACGTGCAGGTCAAAGATGGGGAAGGAGGCACAGGCTTAGGACTTGGCATTGTTCAATCT CTGGTTCGACTCATGGGTGGTGACATCAAAATTGCGGATAAACCAATAGGGGAGAAGGGA ACATGCTTTAGGTTCAACATTTTCCTGACAGTAGAAGAAGCCCGGCCTAACCTGACCATG ATCAGGACCAATAGTCCCAGGCTCACCAGTCTTCTCAGTCCCAAGGTCGAAAGCTCCCTT GTAGTCCTGATAGGCAACCAAGAGCGCCGCCGTATTTCCCAGAAGTATCTGGAGCATCTG GGGATCGGGGCGATGATCGTTGACGGTTCTCAAAGTCTTCAGGCCACACTCAGGAAGATA AAGAACAGGCTTGGCCATTCTCCTCGTGGCTCCTTGGCGAAATTGGAAATGAGTTTTAGG AGTGACAGTGCGAGGACGAAAGATGTCCCTTTAAGTGCCATGGAAGGTACCGACCAAAGG GTCCAATCATGTCGAAGGAGAGGAGGAGGAGGCCCAAACTTTGTGCTTCTTGTCATTGAT GCAACTGCTGGACCAATTTTAGAGCTTCTAAGGGTTGTCAATGAGTTTAGAAGAGACATT CACGGCCGCTGCAAGGTGGTTTGGTTGGACAGTCCGACTTCAAGAAGAATCAACGTCAAG GACCCTGAACAGGAAGAGATGATTGATCCTAGTGACGAGATTGTAACCAAGCCATTACAT GGATCTCGTTTGACTCAAATTATAAGATATTTGCCTGAATATGGAGGCACTTACTCACCA AATGTTTCCACTAGACCAAGAAGAGAAAAAGGTCCCAGCTGCTCCCCTTGTGCTAAGCAA TCTCAACGAAGACAACTGAGTCAACAACAATCAGAGTCACAAGAAGAAGACATTTCTGGG AGTGGGAACTACTCTGGGAAGGATGTTTATTCAACTGCTCCAGTCCAGACCCATGGCAGG TCACCTAGCTGTGGATACAAAACCAGACAGACAGAAATTGAAGAAGTGTTTGATGAACCA AAGGATGAAAAGCCTTTGACTGGCAAGAGATTCCTGGTGGCCGAGGACAATCATGTGCTG CGCAAAGTGGCCAGCATCACTCTAACCAACCTTGGTGCAACTGTCCAACTTTGTGAAAAT GGAGAGGAAGCTCTGCTACTGGTCCTCAATCGTCTCAAAGAATATATAAAACATGGTGGT CCTCCCATTATGCCCTATGATTACATATTAATGGACTGCGAGATGCCGATAATGAATGGG TTCGATGCAACGAAGCAGATCAGGGAGGAAGAGAAGTATTATGGAGTTCAGATTCCAATT ATTGCATTGACTGCTTATGACTCAGGCGAACAAGTAGAGAATGCCATTTTGGCTGGTATG GATATGCATCTCGCAAAACCCCTGAAGAAGGAGAATCTATTGGAGGCCATCAGATACATA GACCGTAAATACAGATATGTTTGA
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>LITCHI008251.m1 ATTAGACTCGTATTCCAAAAATAAAAAACACATTGTTTTCTGATTTCAAGTACTTTTTGG TTTTTACTTTCGAAAAAAAAAAAAGTACATTTTGGTTTTTGACCTACTCACAGACTCACC TAACCAAAATAATAAATCGCTGTCTAAACTACCATTCCAAGTCAAATTTCAAACATCCTC CTCTTCTCTCTCTATATGATCTAACTCATGTTCACTTCCTCTTCTTGATCTCTTCTTCTT TGCTCTCCTTCTCCTCCTCCACTATATATTCTTCCCTCATTGATTTTTATAATATAGTTT AATTTAAGAATGAGAAGGCCTTGTTGTGACAAGGAAGGAACCAACAAGGGGCCTTGGACC AGGAAGGAAGACCAAAAGCTTATTGATTATATTCGAGTTCATGGTGAGGGTTGCTGGCAT TCTCTCACCAAAGCAGCAGGTTTGGATCGTTGCGGTAAGAGTTGCAGACTAAGATGGATA AACTATCTTAGGCCAGATATCAAACGTGGTAATTTCGCCCCAGATGAAGAAGATCTCATC ATCAAGCTCCATGCCCTCCTTGGCAACCGATGGTCACTGATCGCTGGAAGGTTACCAGGT CGAACAGACAATGAGGTGAAGAACTATTGGAATACTCATTTGAGGAAGAAGCTAATAAAG ATGGGAATTGATCCAAACAACCATAAATTGAAATCAATGCCTCAACATCACTATCATCAT GAGCCTCAGCAGTGCAATTCTGCTTCAACCAACATGATATTCAAGCCCAAAGAGACCATT AGTGGAGATAATAACGATATTGTTTCGGATGCTGGAAGTTGTTTGGAAGGTGATGGACTA TCAGCAGGCTCCTCTCATGACTTCAATCTTGATCTCAACGTCACGTTTTCTTCTAAGAAG ATGGAAAATAATACTGTTCCAATACCTAATGGTGAAGTAGAAAGCGATGAGAACCCTACA CTTCTTCTGTTTAATTAGTTGGTAGGGAACGTTCACGTAATTTAGCTCAGATCAGGACAG AATCTGAAGTTCCAGAAATTAATTACTGAAGCTACAAACATATTATATGTGGTATGAATA CTCATGAAATCACACGCCAAACAAATCAGAGCATCTGAGCATTGTTGTTCCAAGTTAGGG CCAAATTAATTAAAGCTAATGTAAGAAGATGACTAGAAGTGTTATCCTTTAATTTGTTAT TTGCTGCCATGATTGATTTCTCATTGGAAGATGTTAAATTTATTTATTTCGGGTCAATTT CATTTCTCTTTTTTTCAATCAAATAAATTAAATTGAATTATTTATGGAAGCTT
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>LITCHI008251.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATCCAAAAGAATTCACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTACCGAGTATTGCTCAAAG AACACTTCATCTTGTGTGTCCAAAACAATATTATTACTAATTATTTAAAACACTATTTTT TCCTTATAGGCCAACTCCAATGGAGCACCAAATTAGTGTTTTACACCAATTTGGTGCAAT TTTAGTCTCCAATGGAGACACCAAAATGCAAGTTCCAAGGTAAATATTTAGTATTAATTA ACAGTACAACACCAAATTTGATGTTATACTATTCATCAATACCAAATATTTTTATTCACA ATAAATTAATTTATTTAAAAATATATAATAAATTATTATAAAAAATATATATCATTTGAA ATATTTTATTGAAATCTTTAAAATGAGTATAATATTGAATATATTTTAATGTATTTTTAA ATTTTTAATAATATTAATTAAAAAATTATGTATAGAATATTCTTTGAAGATGTCATTTAC ACTAATTTGGTGTCAAATACATTGGAGTGTAAAAGAATTTGGTGTAAAAAAATTTGATGT TAACACCAAAATGGTGTAAAATTTGGTGTTATACATTGGAGATGACCTTAATTATTATTG TTTAAGATTTTTTTATTTCGAATACATTATTGTTTAAGATTTAAGGAATTAATGGGACAT AAGTTGAGATCACAACCTTATTAATGGACATATAATTTGTATGTATAATATGTGAGAAAT ATATCATATATTAAACTAACTTTGTATCTCCTCAATTACTTAAAAATAATTTTAACAAAA ACAAAACTATTGACAGTCTAACTACATATAAAATAATACAACATGGTTTTTGTCTACTGT CTAGCACACAAAGAAGCTTAGTCCCACAAAGCTAGCAGCAAATTAAGGAGAACATGTTTT TGTTGCGATCAGTTGTTAAACTTCATATATAAAACCCTACTTACCTACCAGCCTCAAAGA TATGTAGATAGAGGACTAGTAGTAGAGCCCATATATAAAAATACATACACGTAAACAAAC TATAACCTAATAATAAAAAAAAACAACCAAACTGTGTAGATGAGGAAAGAGACATCTATT TAAATTTAAGATAAAATTCTAATAGAATGATAAACTAAATTAATTCTTAAAAATAACATT AAAGTTAATATTCAAATTAACACCAAATTTTAACGTGAATTTTTAAACTAGCATCAAACT TTATAAATGAGTTTTTTATTTTTCTTTTTTTTTTTTATCCACCACTTATAAACTATAAGA CATAAATTATGATCTTTTACGGTTTTTTGTTTTAAAATTATGCTATTTATTTACGAATCA TAATTCATAAACACTAATAATGTCATGAAAAGGGAAAGGTAGTCTGGTTGGGTGACTTCC TTGTCTTAAGGTCGTGAGTTTTACTCTCACTTGCTCCATTTTATAAGCACTTTCTTCCTT ATTTGTTGTGGATTGTTCCCTCTTTCGATGTTGGTTGTTCTCTTCGACTTTTAAAAGTAA ATCCTCGACCCATGCCTCGAAATCTGATTGCAGTTGGTCTCGATAATACCTTTAGCAATG TATAAATACGTAAAAAAAATAAAAATAAAAATATTGTTATGATCAAAACACATTAAAAAT TTGATATAAATTAAAAATTCATATTTATTTTAATGATATGATAAAAAAATACTATAAATA GATAAAAATATATTAGACTCGTATTCCAAAAATAAAAAACACATTGTTTTCTGATTTCAA GTACTTTTTGGTTTTTACTTTCGAAAAAAAAAAAAGTACATTTTGGTTTTTGACCTACTC ACAGACTCACCTAACCAAAATAATAAATCGCTGTCTAAACTACCATTCCAAGTCAAATTT CAAACATCCTCCTCTTCTCTCTCTATATGATCTAACTCATGTTCACTTCCTCTTCTTGAT CTCTTCTTCTTTGCTCTCCTTCTCCTCCTCCACTATATATTCTTCCCTCATTGATTTTTA TAATATAGTTTAATTTAAGA
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>LITCHI008251.m1 GenomeSequence - ATTAGACTCGTATTCCAAAAATAAAAAACACATTGTTTTCTGATTTCAAGTACTTTTTGG TTTTTACTTTCGAAAAAAAAAAAAGTACATTTTGGTTTTTGACCTACTCACAGACTCACC TAACCAAAATAATAAATCGCTGTCTAAACTACCATTCCAAGTCAAATTTCAAACATCCTC CTCTTCTCTCTCTATATGATCTAACTCATGTTCACTTCCTCTTCTTGATCTCTTCTTCTT TGCTCTCCTTCTCCTCCTCCACTATATATTCTTCCCTCATTGATTTTTATAATATAGTTT AATTTAAGAATGAGAAGGCCTTGTTGTGACAAGGAAGGAACCAACAAGGGGCCTTGGACC AGGAAGGAAGACCAAAAGCTTATTGATTATATTCGAGTTCATGGTGAGGGTTGCTGGCAT TCTCTCACCAAAGCAGCAGGTTGTATGTGTTGATAATACTAATTACATTATGAGTTATAT ATATATATATAGTTTGTGTAATTATTTGTTTGTATATTTTTGTTCCATGCATGCATGCAA TGTATGTCTTGTTTGTATGTTCTGCCACAATTAATTTTGCATTTATGCATTTATAAGGTT TGGATCGTTGCGGTAAGAGTTGCAGACTAAGATGGATAAACTATCTTAGGCCAGATATCA AACGTGGTAATTTCGCCCCAGATGAAGAAGATCTCATCATCAAGCTCCATGCCCTCCTTG GCAACCGGTACGCTCCAGATCTGTCCTTATATATGATGTTATTTCATTTCTCCAGTTAAA ATGTTCTGATTTTAATTTCAATTTAATTGTTTACACCATTAGCATAATTATCAAGAACTA CAAGAAAAATGGGTATCTATTATAGAGTATCCATATAGATCGAGTATCCATAGCAGGCGC TTTGAGGCTCACCTTAAAAACATATATTCATCACGGGGCACATCATACATTTGATGCCCG TTTCAGACAAATTTTTAGACCATTGGCATAGTTATCAAGTTTGTATATATAAAACGGAGT TAACATCATTAAATCCACTTATTATTATTATGGATAATAAATGAGGTTTCTCAACCTCAA ATTGATGTTTGCTTCTTTTTTCAGTTGTCTATGAGTTAATTACTAGTAGGACAGACATAC TCATCATCATAAAAATTAAATTCATTTGTGACATATTTCTACTACATATATAAGAGGTAA CATGATATACCTAGTACATTAAATACTCACGCCCTCTCAAATTAATTAATCACAAACAAG TGTCTCTACAATAATGTTGTAGTTAGAGTCCAATCATTGTAAGTGATATTATCAAAATAC TCTTGAAAGTGGAACTAATATGAAATAACCCGTTCTCATGTTCGAAAATGAGATTCATTA CTGATATTATTTTTCATTTTAAAGAGGTTTTTAGATTGTTTCCTTATTTACAAACAATGC TTGTGATATTTATGGGGTCTCAGATGGTCACTGATCGCTGGAAGGTTACCAGGTCGAACA GACAATGAGGTGAAGAACTATTGGAATACTCATTTGAGGAAGAAGCTAATAAAGATGGGA ATTGATCCAAACAACCATAAATTGAAATCAATGCCTCAACATCACTATCATCATGAGCCT CAGCAGTGCAATTCTGCTTCAACCAACATGATATTCAAGCCCAAAGAGACCATTAGTGGA GATAATAACGATATTGTTTCGGATGCTGGAAGTTGTTTGGAAGGTGATGGACTATCAGCA GGCTCCTCTCATGACTTCAATCTTGATCTCAACGTCACGTTTTCTTCTAAGAAGATGGAA AATAATACTGTTCCAATACCTAATGGTGAAGTAGAAAGCGATGAGAACCCTACACTTCTT CTGTTTAATTAGTTGGTAGGGAACGTTCACGTAATTTAGCTCAGATCAGGACAGAATCTG AAGTTCCAGAAATTAATTACTGAAGCTACAAACATATTATATGTGGTATGAATACTCATG AAATCACACGCCAAACAAATCAGAGCATCTGAGCATTGTTGTTCCAAGTTAGGGCCAAAT TAATTAAAGCTAATGTAAGAAGATGACTAGAAGTGTTATCCTTTAATTTGTTATTTGCTG CCATGATTGATTTCTCATTGGAAGATGTTAAATTTATTTATTTCGGGTCAATTTCATTTC TCTTTTTTTCAATCAAATAAATTAAATTGAATTATTTATGGAAGCTT