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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI026381 | Chr3 | 9180758 | 9186014 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 32 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI026381.m1 | 51 | 76 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 33.8 | 2.40E-08 |
LITCHI026381.m1 | 54 | 75 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13 | 0.13 |
LITCHI026381.m1 | 96 | 121 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 42.7 | 3.80E-11 |
LITCHI026381.m1 | 100 | 120 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 20.5 | 0.00057 |
LITCHI026381.m1 | 143 | 167 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 34.2 | 1.80E-08 |
LITCHI026381.m1 | 146 | 166 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.8 | 0.036 |
LITCHI026381.m1 | 296 | 321 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 37.4 | 1.80E-09 |
LITCHI026381.m1 | 300 | 320 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 22 | 0.00019 |
LITCHI026381.m1 | 342 | 367 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 30.9 | 2.00E-07 |
LITCHI026381.m1 | 345 | 366 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.3 | 0.1 |
LITCHI026381.m2 | 17 | 42 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 33.9 | 2.20E-08 |
LITCHI026381.m2 | 20 | 41 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.1 | 0.12 |
LITCHI026381.m2 | 62 | 87 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 42.8 | 3.50E-11 |
LITCHI026381.m2 | 66 | 86 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 20.6 | 0.00053 |
LITCHI026381.m2 | 109 | 133 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 34.3 | 1.60E-08 |
LITCHI026381.m2 | 112 | 132 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.9 | 0.033 |
LITCHI026381.m2 | 262 | 287 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 37.5 | 1.60E-09 |
LITCHI026381.m2 | 266 | 286 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 22.1 | 0.00017 |
LITCHI026381.m2 | 308 | 333 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 31 | 1.80E-07 |
LITCHI026381.m2 | 311 | 332 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.4 | 0.096 |
LITCHI026381.m3 | 51 | 76 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 34.4 | 1.60E-08 |
LITCHI026381.m3 | 54 | 75 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.6 | 0.086 |
LITCHI026381.m3 | 96 | 121 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 43.3 | 2.50E-11 |
LITCHI026381.m3 | 100 | 120 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 21 | 0.00039 |
LITCHI026381.m3 | 143 | 167 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 34.8 | 1.20E-08 |
LITCHI026381.m3 | 146 | 166 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 15.3 | 0.024 |
LITCHI026381.m3 | 296 | 321 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38 | 1.20E-09 |
LITCHI026381.m3 | 300 | 320 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 22.6 | 0.00013 |
LITCHI026381.m4 | 17 | 42 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 34.6 | 1.40E-08 |
LITCHI026381.m4 | 20 | 41 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.8 | 0.075 |
LITCHI026381.m4 | 62 | 87 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 43.5 | 2.20E-11 |
LITCHI026381.m4 | 66 | 86 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 21.2 | 0.00034 |
LITCHI026381.m4 | 109 | 133 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35 | 1.00E-08 |
LITCHI026381.m4 | 112 | 132 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 15.5 | 0.021 |
LITCHI026381.m4 | 262 | 287 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.1 | 1.00E-09 |
LITCHI026381.m4 | 266 | 286 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 22.7 | 0.00011 |
LITCHI026381.m5 | 17 | 41 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 34.7 | 1.20E-08 |
LITCHI026381.m5 | 20 | 40 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 15.3 | 0.024 |
LITCHI026381.m5 | 170 | 195 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 37.9 | 1.20E-09 |
LITCHI026381.m5 | 174 | 194 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 22.5 | 0.00013 |
LITCHI026381.m5 | 216 | 241 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 31.4 | 1.40E-07 |
LITCHI026381.m5 | 219 | 240 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13.8 | 0.072 |
LITCHI026381.m6 | 124 | 149 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.2 | 1.00E-09 |
LITCHI026381.m6 | 128 | 148 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 22.8 | 0.00011 |
LITCHI026381.m6 | 170 | 195 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 31.6 | 1.20E-07 |
LITCHI026381.m6 | 173 | 194 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.1 | 0.06 |
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>LITCHI026381.m1 ATGGAGTTGTACGGACGCAACAACGCGGCCAGGAACGGGTCGCAACCGGGTCACCCGACC AAATGGAGCACCGCCGGTCCGGCGACCGCCCTCGAAGAATCGATGTGGCAATTGGACTTG AGGGTGTCTGAATCGTATCCGGAGCGACCCGGAGTGCCTGACTGCGTTTACTATATGCGG ACGGGGGTTTGTGGATACGGTAACAGGTGCCGTTATAATCATCCTCGCAATCGTGCTGCG GTTGAGGCAGCTGTAAGAGCTACAGGGGAGTACCCAGATCGACCGGGGGAGCCCTTGTGT CAGTTTTACTTGAAAACTGGAACCTGTAAATTTGGCGCATCCTGCAAGTTCCACCACCCA AAACATTCAGGTGGATCCATGAGTCATGTTCCACTGAATATATATGGATACCCGCTACGA CTGGGTGAGAAAGAATGCTCCTACTATTTGAAAACGGGGCAGTGCAAATTTGGTAGAACT TGTAAATTCCATCATCCTCAAACAGCTGGCACGTCAATGCCGGCATCTGCACCTCAATTT TATCCGCCGGTGCAGTCTCCTTCAGTTCCAATGCCAGAACAGTATGCAGGGCCATCCACC AACTTGAGGGTGCCAAGGCCTCCACTTTTAGCTGGTTCTTATGTGCAAGGGGCATATGGT CCTGTGCTGTTTTCTCCTGGAGTAGTTCCCTTTTCTGGTTGGAGTCCTTATTCGGCGCCT GTAAGTCCCGTGTTATCTCCTGGTGCACAACCTGCTGTTGGAGCTACTAATCTTTATGGG GTAACGCAGCTATCTTCCTCGATTCAAGGACCTTATCCCCCATTGCCATCTTCTGCTGGT CTTTCAAGTAGTAGCCAGAAGGAACAATCATTCCCAGAGAGACCTGGTGAACCTGAATGC CAATACTATTTGAAAACTGGGAACTGTAAATTTGGGTCATCTTGTAGGTATCATCATCCT CAGGATAGGGCGGCAGCAAGAACAAATTGTGTCCTCAGTCCACTTGGTCTCCCTCTGCGG CCGGGAGTGCAGCCTTGTGCTTTCTACTTGCAAAATGGGCGTTGCAAGTTTGGGTCCATG TGCAAATTTGATCATCCAATGGGAACAATGAGATACAGTCCATCAGCTTCATCACTCATT GAAATGCCTGTTACTCCATACCCAGTTGGGTCGTTGTTGTCTACCCTAGCTCCTTCATCA TCATCTTCTTCTGAGATGCGGCCAGAACTTATTTCAGGATCCAAAAAGGATTCTTTATTG AACAGAATGCCTTCTTCTGGAAGTACCTCTAGTAGTTCAGTTGGGTTGATTTTCTCTCAG ACTGGGTCAGTTCCACTTTCTGACTTGCAGCTTTCAGGTCAGAGTTCTGTTTCTTTAGGT AGTAGCAGAAGCTCCAGGCAAGGTGTCGAAGTCCGTCGCTCGAGTTGA >LITCHI026381.m2 ATGTGGCAATTGGACTTGAGGGTGTCTGAATCGTATCCGGAGCGACCCGGAGTGCCTGAC TGCGTTTACTATATGCGGACGGGGGTTTGTGGATACGGTAACAGGTGCCGTTATAATCAT CCTCGCAATCGTGCTGCGGTTGAGGCAGCTGTAAGAGCTACAGGGGAGTACCCAGATCGA CCGGGGGAGCCCTTGTGTCAGTTTTACTTGAAAACTGGAACCTGTAAATTTGGCGCATCC TGCAAGTTCCACCACCCAAAACATTCAGGTGGATCCATGAGTCATGTTCCACTGAATATA TATGGATACCCGCTACGACTGGGTGAGAAAGAATGCTCCTACTATTTGAAAACGGGGCAG TGCAAATTTGGTAGAACTTGTAAATTCCATCATCCTCAAACAGCTGGCACGTCAATGCCG GCATCTGCACCTCAATTTTATCCGCCGGTGCAGTCTCCTTCAGTTCCAATGCCAGAACAG TATGCAGGGCCATCCACCAACTTGAGGGTGCCAAGGCCTCCACTTTTAGCTGGTTCTTAT GTGCAAGGGGCATATGGTCCTGTGCTGTTTTCTCCTGGAGTAGTTCCCTTTTCTGGTTGG AGTCCTTATTCGGCGCCTGTAAGTCCCGTGTTATCTCCTGGTGCACAACCTGCTGTTGGA GCTACTAATCTTTATGGGGTAACGCAGCTATCTTCCTCGATTCAAGGACCTTATCCCCCA TTGCCATCTTCTGCTGGTCTTTCAAGTAGTAGCCAGAAGGAACAATCATTCCCAGAGAGA CCTGGTGAACCTGAATGCCAATACTATTTGAAAACTGGGAACTGTAAATTTGGGTCATCT TGTAGGTATCATCATCCTCAGGATAGGGCGGCAGCAAGAACAAATTGTGTCCTCAGTCCA CTTGGTCTCCCTCTGCGGCCGGGAGTGCAGCCTTGTGCTTTCTACTTGCAAAATGGGCGT TGCAAGTTTGGGTCCATGTGCAAATTTGATCATCCAATGGGAACAATGAGATACAGTCCA TCAGCTTCATCACTCATTGAAATGCCTGTTACTCCATACCCAGTTGGGTCGTTGTTGTCT ACCCTAGCTCCTTCATCATCATCTTCTTCTGAGATGCGGCCAGAACTTATTTCAGGATCC AAAAAGGATTCTTTATTGAACAGAATGCCTTCTTCTGGAAGTACCTCTAGTAGTTCAGTT GGGTTGATTTTCTCTCAGACTGGGTCAGTTCCACTTTCTGACTTGCAGCTTTCAGGTCAG AGTTCTGTTTCTTTAGGTAGTAGCAGAAGCTCCAGGCAAGGTGTCGAAGTCCGTCGCTCG AGTTGA >LITCHI026381.m3 ATGGAGTTGTACGGACGCAACAACGCGGCCAGGAACGGGTCGCAACCGGGTCACCCGACC AAATGGAGCACCGCCGGTCCGGCGACCGCCCTCGAAGAATCGATGTGGCAATTGGACTTG AGGGTGTCTGAATCGTATCCGGAGCGACCCGGAGTGCCTGACTGCGTTTACTATATGCGG ACGGGGGTTTGTGGATACGGTAACAGGTGCCGTTATAATCATCCTCGCAATCGTGCTGCG GTTGAGGCAGCTGTAAGAGCTACAGGGGAGTACCCAGATCGACCGGGGGAGCCCTTGTGT CAGTTTTACTTGAAAACTGGAACCTGTAAATTTGGCGCATCCTGCAAGTTCCACCACCCA AAACATTCAGGTGGATCCATGAGTCATGTTCCACTGAATATATATGGATACCCGCTACGA CTGGGTGAGAAAGAATGCTCCTACTATTTGAAAACGGGGCAGTGCAAATTTGGTAGAACT TGTAAATTCCATCATCCTCAAACAGCTGGCACGTCAATGCCGGCATCTGCACCTCAATTT TATCCGCCGGTGCAGTCTCCTTCAGTTCCAATGCCAGAACAGTATGCAGGGCCATCCACC AACTTGAGGGTGCCAAGGCCTCCACTTTTAGCTGGTTCTTATGTGCAAGGGGCATATGGT CCTGTGCTGTTTTCTCCTGGAGTAGTTCCCTTTTCTGGTTGGAGTCCTTATTCGGCGCCT GTAAGTCCCGTGTTATCTCCTGGTGCACAACCTGCTGTTGGAGCTACTAATCTTTATGGG GTAACGCAGCTATCTTCCTCGATTCAAGGACCTTATCCCCCATTGCCATCTTCTGCTGGT CTTTCAAGTAGTAGCCAGAAGGAACAATCATTCCCAGAGAGACCTGGTGAACCTGAATGC CAATACTATTTGAAAACTGGGAACTGTAAATTTGGGTCATCTTGTAGGTATCATCATCCT CAGGATAGGGCGGCAGCAAGAACAAATTGTGTCCTCAGTCCACTTGGTCTCCCTCTGCGG CCGGTATGA >LITCHI026381.m4 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TCTGACTTGCAGCTTTCAGGTCAGAGTTCTGTTTCTTTAGGTAGTAGCAGAAGCTCCAGG CAAGGTGTCGAAGTCCGTCGCTCGAGTTGA >LITCHI026381.m6 ATGCCGGCATCTGCACCTCAATTTTATCCGCCGGTGCAGTCTCCTTCAGTTCCAATGCCA GAACAGTATGCAGGGCCATCCACCAACTTGAGGGTGCCAAGGCCTCCACTTTTAGCTGGT TCTTATGTGCAAGGGGCATATGGTCCTGTGCTGTTTTCTCCTGGAGTAGTTCCCTTTTCT GGTTGGAGTCCTTATTCGGCGCCTGTAAGTCCCGTGTTATCTCCTGGTGCACAACCTGCT GTTGGAGCTACTAATCTTTATGGGGTAACGCAGCTATCTTCCTCGATTCAAGGACCTTAT CCCCCATTGCCATCTTCTGCTGGTCTTTCAAGTAGTAGCCAGAAGGAACAATCATTCCCA GAGAGACCTGGTGAACCTGAATGCCAATACTATTTGAAAACTGGGAACTGTAAATTTGGG TCATCTTGTAGGTATCATCATCCTCAGGATAGGGCGGCAGCAAGAACAAATTGTGTCCTC AGTCCACTTGGTCTCCCTCTGCGGCCGGGAGTGCAGCCTTGTGCTTTCTACTTGCAAAAT GGGCGTTGCAAGTTTGGGTCCATGTGCAAATTTGATCATCCAATGGGAACAATGAGATAC AGTCCATCAGCTTCATCACTCATTGAAATGCCTGTTACTCCATACCCAGTTGGGTCGTTG TTGTCTACCCTAGCTCCTTCATCATCATCTTCTTCTGAGATGCGGCCAGAACTTATTTCA GGATCCAAAAAGGATTCTTTATTGAACAGAATGCCTTCTTCTGGAAGTACCTCTAGTAGT TCAGTTGGGTTGATTTTCTCTCAGACTGGGTCAGTTCCACTTTCTGACTTGCAGCTTTCA 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>LITCHI026381.m4 GenomeSequence - CACATACCACCCTCCTAATTTACAATTCTGTCCCCTTTCGTACCCCTTAACCCATTCAAA CCTCACAAAGGGCCACTCACCACCAGCTACTCTCAAGGACAGTCTGGTAATTCCAACCCA AGTCAGTGTCGGTTACCTGTTTAATGTCCAAAGTCCATTTTTAAACTATTCCGCGAAAAT TACCCTTTCCGGTTTGTTTATTTGGCGGGGACGGGAACTAACAGACAAAACTAATTAAAA ATAAGGATAATAAATAAATAAATAAAAAGAGTATAATTAAAATTACAAAATAGAAAAAAA CCAAAAAAATTAAAAAAAAAAAGACGGAAGCCAGACCGTACGGTTTGAAGAGAGAGAAAA ACAAAAAAGCTCCATTACAGTGAAGGCATCTATCTCTATCTCTCTACTTACTACTTGCTC CTTCTTCTACTAGTTCTTATTCTTCGAAGCAACTCCACACACACTCTCGGATCCAAGTCG CCCGATCCTTCTAGAACATTCGAGAACCTTTTCTAGGTGTAGTAGTAGTGGTTAAAGGCA CTTTACATACAGGAAACAAAACCCTCTCCCCTCTTTTTATATTTTCCCTCCCTCCAGTGG AACCATTGGATGGAGTTGTACGGACGCAACAACGCGGCCAGGAACGGGTCGCAACCGGGT CACCCGACCAAATGGAGCACCGCCGGTCCGGCGACCGCCCTCGAAGGTCCGTTCATTTCA CTTGCATTTTCGTTTGTCGATTTTGGAATATGCTGGCTTTGTTTTGTGTGGAATTTCTAG GGTTTTGTTTGTGGTTGATGTAGAATCGATGTGGCAATTGGACTTGAGGGTGTCTGAATC GTATCCGGAGCGACCCGGAGTGCCTGACTGCGTTTACTATATGCGGACGGGGGTTTGTGG 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CAGGCTATTCTTTTTTTCCCCCCCTCTAAACACGGGC >LITCHI026381.m6 GenomeSequence - CACATACCACCCTCCTAATTTACAATTCTGTCCCCTTTCGTACCCCTTAACCCATTCAAA CCTCACAAAGGGCCACTCACCACCAGCTACTCTCAAGGACAGTCTGGTAATTCCAACCCA AGTCAGTGTCGGTTACCTGTTTAATGTCCAAAGTCCATTTTTAAACTATTCCGCGAAAAT TACCCTTTCCGGTTTGTTTATTTGGCGGGGACGGGAACTAACAGACAAAACTAATTAAAA ATAAGGATAATAAATAAATAAATAAAAAGAGTATAATTAAAATTACAAAATAGAAAAAAA CCAAAAAAATTAAAAAAAAAAAGACGGAAGCCAGACCGTACGGTTTGAAGAGAGAGAAAA ACAAAAAAGCTCCATTACAGTGAAGGCATCTATCTCTATCTCTCTACTTACTACTTGCTC CTTCTTCTACTAGTTCTTATTCTTCGAAGCAACTCCACACACACTCTCGGATCCAAGTCG CCCGATCCTTCTAGAACATTCGAGAACCTTTTCTAGGTGTAGTAGTAGTGGTTAAAGGCA CTTTACATACAGGAAACAAAACCCTCTCCCCTCTTTTTATATTTTCCCTCCCTCCAGTGG AACCATTGGATGGAGTTGTACGGACGCAACAACGCGGCCAGGAACGGGTCGCAACCGGGT CACCCGACCAAATGGAGCACCGCCGGTCCGGCGACCGCCCTCGAAGGTCCGTTCATTTCA CTTGCATTTTCGTTTGTCGATTTTGGAATATGCTGGCTTTGTTTTGTGTGGAATTTCTAG GGTTTTGTTTGTGGTTGATGTAGAATCGATGTGGCAATTGGACTTGAGGGTGTCTGAATC GTATCCGGAGCGACCCGGAGTGCCTGACTGCGTTTACTATATGCGGACGGGGGTTTGTGG 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