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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI026357 | Chr3 | 8949428 | 8955686 | - | Auxin response factor 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI026357.m1 | 162 | 262 | PF02362.24 | B3 | Family | 68.6 | 3.70E-19 |
LITCHI026357.m1 | 288 | 369 | PF06507.16 | Auxin_resp | Family | 107.3 | 3.80E-31 |
LITCHI026357.m1 | 668 | 712 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 23.8 | 3.90E-05 |
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>LITCHI026357.m1 ATGGCTGGTGTGGGTGGAAATGGGAAAGGCCGTGCTGGTGGGGGTGATCAAAAAGGAAAA GCCCCAAGTACTGATCCTCATGTGCATGATGATCAGAGCAGAAAACGTACCAACATTAAC GATGCGTTGCCTACCAACAACACTGACCAATGTAGGCAAGATGGGCTATACAAAGCACTA TGGCGTGCGTGTGCGGGTCCACGTGTTTATGTTCCATGCGTTGGAGATTACGTCTACTAC TTCCTTCAAGGTCACTTGGAACAGATTGAGGCATATGCAAACCATGAAATTAGAGCGGAA ATGCCTGTTTATAATGTACCTTCTAAGGTTCTATGTGAGGTTGTCCATGTTCAACTAATG GCGGAAACTGGTACTGATGAGGTATTTGCACAGATTACTTTGCAACCGAAAACAAAGCAA GACATGCAAAATTTGGAAGATGGGAGTTCTGCACCTTTGCCACCAAAAACAAAGGTGTGC TCCTTTAGCAAGAAACTCACTCAATCTGACACCAGCACACATGGTGGATTCTCTGTTCCC AAACGAAAAGCCGATGAGTGTCTACCCCAACTGGACATGTCCAAGCAACCCCCAGCTCAG GAACTGATTGCAACTGATTTGCATGGATATGAATGGCGTTTTCGGCATATATTTCGTGGT CAGCCAAAGCGCCATTTGCTTACTAGTGGTTGGAGTATATTTGTGGCATCAAAAATGCTT AACAGTGGAGATTTATGTATCTTTCTCAGAGGAGAACATGGAGAACTTCGCATAGGGATT CGTCGTCTAATAAAAAGACAGAACTGTGCTTCAACAACAATCATATCTAGCCATAGCATG CAGCATGGTATACTTGCCGGTGCCTTCCATGCAATTTCTACAGGGACCACGTTTTCCGTC TACTACCATCCTTGGACCAGCCCTTCTGAATTTATCATACCTGTTGATCAATGCGATAAG TCGACTTCCATTGACTATTCTGTTGGGACAAGAATCAGAATGGCGTTTGAGACTGAAGAC TTTACGGAAAAGAGAATTGCTGGCACGGTTGTTGGTATCGAAGATGTTGATAGAATTAGG TGGCCTGGTTCAGAGTGGAGATGCCTCAGGGTGAAATGGGATGCCTTATCTGATAGAATA AGGTGTCCAGAAAGAGTCTCTCCATGGAATGTTGAACTGATAGAAGGTGCCAACAGGAAG CCTGCTTCATTTCTGCATCGACAAAAGAGGCCACGTCCAGATAATTTGTCATTTCCTGGG TGTAGCAATGGTCAGTATCTCTTACTCTTTTCTGTAACAAGGGTCTTGCAAGGTCAAAAA AACAATGTCACAGGTGTCAAGGAATCGGGTCCTCTTGAACCGCTGTCATTTCCATATTTG GTTCCCCAAAAGAGTTCTGATTGGGGCCATGTTTTAATGCATGATCCATTTTATCCATGT CACAATGGTAGAGTGTCAATTCCAAGTGGAATCATAGTGAGGAGTTCAGGTCTGCCTAAT TACTGGCCTGCGACATATGCAACAAATAGTGTTCGTAACAATGCTGTGTTAAGCAGAAAT ATTTCGGCTCCCAGTGGCAAGTCTCTTAATTCCAGCTCTAAGGAGCGGAGATCTTTGGAA TCGAAGAATGAAAATGAATCTCCTCTCTCGCAGTCTCATGGTGGCAAAAAATACATGCTT TTTGGAGTCAATTTAGCCAATACTAGTCCACCGGAGCTCCCTTTACTTCAACAAGCCACT TCCAATGAGCTCGAAAGTCGTTGTTCAGGCCCTCCAATGTCTCAGTCCAGCATTTCAGGA CCTTTTCAGGTTTCAGAGCCATCTAATAGTGTATCTGACATCCCTTCAGGAAAACAATGC AAGAATTGCCGTCTTCTCAAGAGTTGCACCAAGGTGATCAAGTATGGAACTGCTCTTGGA AGGTCAGTTGACCTCTCGCGATTTGACGGGTATGAAGAACTCGTTTATGAGCTTGACCAG ATGTTTGACTTTAATGGAACTTTGATTGATGGGAGCAGCGGGTGGGAGATAACCTTCATC GATGATGAAGGCGACATGTTGCTAACTGGAGACCACCCCTGGAAGGAATTCCTTTGCGCC GTGCGAAGAATGTTCATCTGTCCAAAGGAAGACATTGACAAACTGAATCCAAGCTCACCA AATCCAACTTCTGTTTGA
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>LITCHI026357.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTTCACATTGTGATCAAAAGTTGGGGACAAGACAGAAATCTCCCTTAAATAAATATTTTA AGGATGCTATCAATTATGATCATTTAATTCTTCTTATCTTGTTTTGGCAAATATTCCAAA ACCGGAAGTCACTTTTAGCATATTCCGAGCCGTTACAGTACTTCATTTATATCAAATTCT TAATCCTTTTTTTTTTTTTTGAAATAAATCAAATTGTTAATCCTGTTGCTTCATATTTAT AAATGATTTTTTATAGGTGTTATTTTGAAAAATTGACCATTGTTTTCTTTCTCCTAAATT AATTTGTAAAAGATAAATATATAAATAAATTAAAAGTCAATTTATGCATACACACTATCT TTTAATAGAAATGGTTGAATATCTCTCTTAATCCGAAAAGATTAGAGGTTTAAATCTTAC CATTGTCGAATATATGGATAATTTTCTATGAATTTAATCACCTATTCCCTCATCATTAAA AAAAAAAAAAAAAACTTGATTTATAAATGCACACATTTTGTACAATATTTGCTTGAAAAA TAATTTTTGCAACTTATTTATACTAAAATAGATTTTTCTATCGATAAAAATACTATAAAT TGTGCATTACAAAAATTTAACTATATAATATATTTTTTTATTGAGAATCTTGTTGGTTGT GACTTATGGTTGAATGTGAAAATGAAGTATATTTATTTCTTTTAATCTTTGATTATCAAA TTATCTTAGAATTAAAATCAAGTATTTAGTATTGTTTATTTTGATTGATAATAGATCTTT AGTTTATAATCTTGTAAAATTCTTGTGATTTAAATTATAATTATTGTATTTTTTTTTAAA AAAATAGATCTTTTTATGCTTTTAATGACCTAATTCTTAATATATCATTATATTAATAAT AATTCAAATAAAAATTATAATCCATAGTTTTATATATATGCATGCACGTGCACACGTGTG CATGGGTGAGCGTGTGTATATTTTTTTAGTGATTTATTTATTTTGAAATATATATTATGA GGGTTAAGATTTACTATAATCTTCATTATACATTTGATAAATTTAATCATAGATAGAGAT TTGATTAAAAGAAAATTTTCTTAATTCATCCCAACATTAAATCGCAACTATGTCCCTGGC CAAAGACAACATTTATTGCAATTGACCCATCTTAATTTTTTTACTTTCTTGGATGTCTAT ATAAAATAAAAACGACAAATTAGAGTAACCATCCAAAGAAGTCTGGTCCAAATGATAATA AAACTATACCATCTATGGAGTTTCAAAAAAAAAATTATACCATCTATAGACTCTTTGGAG TTGAAAAACAGCACCATGAGCACATAATAAATTGACGACCCATGTCCTGCCCCAGTATTC AGACGAAACGCTTGATAGAGGTTGAGTGAGAAGAAGTGGAGAGTGGTGAGAGTGACACTA TAGTTTTCGCACCAAACAGTACAAGAAATTAAGGATCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGG CGGAGAAGACCAGAGAGCGATGCATGTGCATGCATAGAACATATCGTGAAGGGTAGCAAA TATCGACAGCCACCGAGAGACAGACAAACGACAGAGACGGAAGAGTGGTATTTCAACAAG AGTGAAAAAAAAAAAGGGTTGGAAGGAGGAGATAGGAGCAACAAACGCAGTCACGAACAA ACACAATAAACGTTACAAACACCAAGGGAACAGGCATCAGCTGCATCACGCCAGCACGCA CACAAAACATACACTCATAATCTCCTTTTTGGTGGGTAAGTGAATTGAGGGAAAGAAAGA GAGAGAGAGAGAGATCATTGAATGGTGTAGAGTGACTTGGGGACGTTTGGTTCTCAAGGC GGTTTTTTTTTTTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTTGGGTATATATGTGATTTCTCTTCTTT TGAATTTTGCAGTTTTTTTGGGTGTGTTGTCTTCATCATCAGCTTCTCCACTTTCGTAAG TTTTGTTGAGGTTTAGAGAG
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>LITCHI026357.m1 GenomeSequence - AAGAAGTGGAGAGTGGTGAGAGTGACACTATAGTTTTCGCACCAAACAGTACAAGAAATT AAGGATCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCGGAGAAGACCAGAGAGCGATGCATGTGCA TGCATAGAACATATCGTGAAGGGTAGCAAATATCGACAGCCACCGAGAGACAGACAAACG ACAGAGACGGAAGAGTGGTATTTCAACAAGAGTGAAAAAAAAAAAGGGTTGGAAGGAGGA GATAGGAGCAACAAACGCAGTCACGAACAAACACAATAAACGTTACAAACACCAAGGGAA CAGGCATCAGCTGCATCACGCCAGCACGCACACAAAACATACACTCATAATCTCCTTTTT GGTGGGTAAGTGAATTGAGGGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGATCATTGAATGGTGTAG AGTGACTTGGGGACGTTTGGTTCTCAAGGCGGTTTTTTTTTTTTTCTCTTTCTCTTTCTC TTTTGGGTATATATGTGATTTCTCTTCTTTTGAATTTTGCAGTTTTTTTGGGTGTGTTGT CTTCATCATCAGCTTCTCCACTTTCGTAAGTTTTGTTGAGGTTTAGAGAGATGGCTGGTG TGGGTGGAAATGGGAAAGGCCGTGCTGGTGGGGGTGATCAAAAAGGAAAAGCCCCAAGTA CTGATCCTCATGTGCATGATGATCAGAGCAGAAAACGTACCAACATTAACGATGCGTTGC CTACCAACAACACTGACCAATGTAATATGTCTTTTTTTTCACTACTTGTTATTTACTCAA TGTCTTGCTACTGGTTGACGACTTTGTGTTTCGAGTTATGATATCATGGAAGCAAGTAGC CATCAGTGCTTCAATCTCTCTTTTTCTCGTGCCTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAGGTGAA 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