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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI026357 | Chr3 | 8949428 | 8955686 | - | Auxin response factor 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI026357.m1 | 162 | 262 | PF02362.24 | B3 | Family | 68.6 | 3.70E-19 |
| LITCHI026357.m1 | 288 | 369 | PF06507.16 | Auxin_resp | Family | 107.3 | 3.80E-31 |
| LITCHI026357.m1 | 668 | 712 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 23.8 | 3.90E-05 |
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>LITCHI026357.m1 ATGGCTGGTGTGGGTGGAAATGGGAAAGGCCGTGCTGGTGGGGGTGATCAAAAAGGAAAA GCCCCAAGTACTGATCCTCATGTGCATGATGATCAGAGCAGAAAACGTACCAACATTAAC GATGCGTTGCCTACCAACAACACTGACCAATGTAGGCAAGATGGGCTATACAAAGCACTA TGGCGTGCGTGTGCGGGTCCACGTGTTTATGTTCCATGCGTTGGAGATTACGTCTACTAC TTCCTTCAAGGTCACTTGGAACAGATTGAGGCATATGCAAACCATGAAATTAGAGCGGAA ATGCCTGTTTATAATGTACCTTCTAAGGTTCTATGTGAGGTTGTCCATGTTCAACTAATG GCGGAAACTGGTACTGATGAGGTATTTGCACAGATTACTTTGCAACCGAAAACAAAGCAA GACATGCAAAATTTGGAAGATGGGAGTTCTGCACCTTTGCCACCAAAAACAAAGGTGTGC TCCTTTAGCAAGAAACTCACTCAATCTGACACCAGCACACATGGTGGATTCTCTGTTCCC AAACGAAAAGCCGATGAGTGTCTACCCCAACTGGACATGTCCAAGCAACCCCCAGCTCAG GAACTGATTGCAACTGATTTGCATGGATATGAATGGCGTTTTCGGCATATATTTCGTGGT CAGCCAAAGCGCCATTTGCTTACTAGTGGTTGGAGTATATTTGTGGCATCAAAAATGCTT AACAGTGGAGATTTATGTATCTTTCTCAGAGGAGAACATGGAGAACTTCGCATAGGGATT CGTCGTCTAATAAAAAGACAGAACTGTGCTTCAACAACAATCATATCTAGCCATAGCATG CAGCATGGTATACTTGCCGGTGCCTTCCATGCAATTTCTACAGGGACCACGTTTTCCGTC TACTACCATCCTTGGACCAGCCCTTCTGAATTTATCATACCTGTTGATCAATGCGATAAG TCGACTTCCATTGACTATTCTGTTGGGACAAGAATCAGAATGGCGTTTGAGACTGAAGAC TTTACGGAAAAGAGAATTGCTGGCACGGTTGTTGGTATCGAAGATGTTGATAGAATTAGG TGGCCTGGTTCAGAGTGGAGATGCCTCAGGGTGAAATGGGATGCCTTATCTGATAGAATA AGGTGTCCAGAAAGAGTCTCTCCATGGAATGTTGAACTGATAGAAGGTGCCAACAGGAAG CCTGCTTCATTTCTGCATCGACAAAAGAGGCCACGTCCAGATAATTTGTCATTTCCTGGG TGTAGCAATGGTCAGTATCTCTTACTCTTTTCTGTAACAAGGGTCTTGCAAGGTCAAAAA AACAATGTCACAGGTGTCAAGGAATCGGGTCCTCTTGAACCGCTGTCATTTCCATATTTG GTTCCCCAAAAGAGTTCTGATTGGGGCCATGTTTTAATGCATGATCCATTTTATCCATGT CACAATGGTAGAGTGTCAATTCCAAGTGGAATCATAGTGAGGAGTTCAGGTCTGCCTAAT TACTGGCCTGCGACATATGCAACAAATAGTGTTCGTAACAATGCTGTGTTAAGCAGAAAT ATTTCGGCTCCCAGTGGCAAGTCTCTTAATTCCAGCTCTAAGGAGCGGAGATCTTTGGAA TCGAAGAATGAAAATGAATCTCCTCTCTCGCAGTCTCATGGTGGCAAAAAATACATGCTT TTTGGAGTCAATTTAGCCAATACTAGTCCACCGGAGCTCCCTTTACTTCAACAAGCCACT TCCAATGAGCTCGAAAGTCGTTGTTCAGGCCCTCCAATGTCTCAGTCCAGCATTTCAGGA CCTTTTCAGGTTTCAGAGCCATCTAATAGTGTATCTGACATCCCTTCAGGAAAACAATGC AAGAATTGCCGTCTTCTCAAGAGTTGCACCAAGGTGATCAAGTATGGAACTGCTCTTGGA AGGTCAGTTGACCTCTCGCGATTTGACGGGTATGAAGAACTCGTTTATGAGCTTGACCAG ATGTTTGACTTTAATGGAACTTTGATTGATGGGAGCAGCGGGTGGGAGATAACCTTCATC GATGATGAAGGCGACATGTTGCTAACTGGAGACCACCCCTGGAAGGAATTCCTTTGCGCC GTGCGAAGAATGTTCATCTGTCCAAAGGAAGACATTGACAAACTGAATCCAAGCTCACCA AATCCAACTTCTGTTTGA
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>LITCHI026357.m1 AAGAAGTGGAGAGTGGTGAGAGTGACACTATAGTTTTCGCACCAAACAGTACAAGAAATT AAGGATCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCGGAGAAGACCAGAGAGCGATGCATGTGCA TGCATAGAACATATCGTGAAGGGTAGCAAATATCGACAGCCACCGAGAGACAGACAAACG ACAGAGACGGAAGAGTGGTATTTCAACAAGAGTGAAAAAAAAAAAGGGTTGGAAGGAGGA GATAGGAGCAACAAACGCAGTCACGAACAAACACAATAAACGTTACAAACACCAAGGGAA CAGGCATCAGCTGCATCACGCCAGCACGCACACAAAACATACACTCATAATCTCCTTTTT GGTGGTTTTTTTGGGTGTGTTGTCTTCATCATCAGCTTCTCCACTTTCGTAAGTTTTGTT GAGGTTTAGAGAGATGGCTGGTGTGGGTGGAAATGGGAAAGGCCGTGCTGGTGGGGGTGA TCAAAAAGGAAAAGCCCCAAGTACTGATCCTCATGTGCATGATGATCAGAGCAGAAAACG TACCAACATTAACGATGCGTTGCCTACCAACAACACTGACCAATGTAGGCAAGATGGGCT ATACAAAGCACTATGGCGTGCGTGTGCGGGTCCACGTGTTTATGTTCCATGCGTTGGAGA TTACGTCTACTACTTCCTTCAAGGTCACTTGGAACAGATTGAGGCATATGCAAACCATGA AATTAGAGCGGAAATGCCTGTTTATAATGTACCTTCTAAGGTTCTATGTGAGGTTGTCCA TGTTCAACTAATGGCGGAAACTGGTACTGATGAGGTATTTGCACAGATTACTTTGCAACC GAAAACAAAGCAAGACATGCAAAATTTGGAAGATGGGAGTTCTGCACCTTTGCCACCAAA AACAAAGGTGTGCTCCTTTAGCAAGAAACTCACTCAATCTGACACCAGCACACATGGTGG ATTCTCTGTTCCCAAACGAAAAGCCGATGAGTGTCTACCCCAACTGGACATGTCCAAGCA ACCCCCAGCTCAGGAACTGATTGCAACTGATTTGCATGGATATGAATGGCGTTTTCGGCA TATATTTCGTGGTCAGCCAAAGCGCCATTTGCTTACTAGTGGTTGGAGTATATTTGTGGC ATCAAAAATGCTTAACAGTGGAGATTTATGTATCTTTCTCAGAGGAGAACATGGAGAACT TCGCATAGGGATTCGTCGTCTAATAAAAAGACAGAACTGTGCTTCAACAACAATCATATC TAGCCATAGCATGCAGCATGGTATACTTGCCGGTGCCTTCCATGCAATTTCTACAGGGAC CACGTTTTCCGTCTACTACCATCCTTGGACCAGCCCTTCTGAATTTATCATACCTGTTGA TCAATGCGATAAGTCGACTTCCATTGACTATTCTGTTGGGACAAGAATCAGAATGGCGTT TGAGACTGAAGACTTTACGGAAAAGAGAATTGCTGGCACGGTTGTTGGTATCGAAGATGT TGATAGAATTAGGTGGCCTGGTTCAGAGTGGAGATGCCTCAGGGTGAAATGGGATGCCTT ATCTGATAGAATAAGGTGTCCAGAAAGAGTCTCTCCATGGAATGTTGAACTGATAGAAGG TGCCAACAGGAAGCCTGCTTCATTTCTGCATCGACAAAAGAGGCCACGTCCAGATAATTT GTCATTTCCTGGGTGTAGCAATGGTCAGTATCTCTTACTCTTTTCTGTAACAAGGGTCTT GCAAGGTCAAAAAAACAATGTCACAGGTGTCAAGGAATCGGGTCCTCTTGAACCGCTGTC ATTTCCATATTTGGTTCCCCAAAAGAGTTCTGATTGGGGCCATGTTTTAATGCATGATCC ATTTTATCCATGTCACAATGGTAGAGTGTCAATTCCAAGTGGAATCATAGTGAGGAGTTC AGGTCTGCCTAATTACTGGCCTGCGACATATGCAACAAATAGTGTTCGTAACAATGCTGT GTTAAGCAGAAATATTTCGGCTCCCAGTGGCAAGTCTCTTAATTCCAGCTCTAAGGAGCG GAGATCTTTGGAATCGAAGAATGAAAATGAATCTCCTCTCTCGCAGTCTCATGGTGGCAA AAAATACATGCTTTTTGGAGTCAATTTAGCCAATACTAGTCCACCGGAGCTCCCTTTACT TCAACAAGCCACTTCCAATGAGCTCGAAAGTCGTTGTTCAGGCCCTCCAATGTCTCAGTC CAGCATTTCAGGACCTTTTCAGGTTTCAGAGCCATCTAATAGTGTATCTGACATCCCTTC AGGAAAACAATGCAAGAATTGCCGTCTTCTCAAGAGTTGCACCAAGGTGATCAAGTATGG AACTGCTCTTGGAAGGTCAGTTGACCTCTCGCGATTTGACGGGTATGAAGAACTCGTTTA TGAGCTTGACCAGATGTTTGACTTTAATGGAACTTTGATTGATGGGAGCAGCGGGTGGGA GATAACCTTCATCGATGATGAAGGCGACATGTTGCTAACTGGAGACCACCCCTGGAAGGA ATTCCTTTGCGCCGTGCGAAGAATGTTCATCTGTCCAAAGGAAGACATTGACAAACTGAA TCCAAGCTCACCAAATCCAACTTCTGTTTGA
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>LITCHI026357.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTTCACATTGTGATCAAAAGTTGGGGACAAGACAGAAATCTCCCTTAAATAAATATTTTA AGGATGCTATCAATTATGATCATTTAATTCTTCTTATCTTGTTTTGGCAAATATTCCAAA ACCGGAAGTCACTTTTAGCATATTCCGAGCCGTTACAGTACTTCATTTATATCAAATTCT TAATCCTTTTTTTTTTTTTTGAAATAAATCAAATTGTTAATCCTGTTGCTTCATATTTAT AAATGATTTTTTATAGGTGTTATTTTGAAAAATTGACCATTGTTTTCTTTCTCCTAAATT AATTTGTAAAAGATAAATATATAAATAAATTAAAAGTCAATTTATGCATACACACTATCT TTTAATAGAAATGGTTGAATATCTCTCTTAATCCGAAAAGATTAGAGGTTTAAATCTTAC CATTGTCGAATATATGGATAATTTTCTATGAATTTAATCACCTATTCCCTCATCATTAAA AAAAAAAAAAAAAACTTGATTTATAAATGCACACATTTTGTACAATATTTGCTTGAAAAA TAATTTTTGCAACTTATTTATACTAAAATAGATTTTTCTATCGATAAAAATACTATAAAT TGTGCATTACAAAAATTTAACTATATAATATATTTTTTTATTGAGAATCTTGTTGGTTGT GACTTATGGTTGAATGTGAAAATGAAGTATATTTATTTCTTTTAATCTTTGATTATCAAA TTATCTTAGAATTAAAATCAAGTATTTAGTATTGTTTATTTTGATTGATAATAGATCTTT AGTTTATAATCTTGTAAAATTCTTGTGATTTAAATTATAATTATTGTATTTTTTTTTAAA AAAATAGATCTTTTTATGCTTTTAATGACCTAATTCTTAATATATCATTATATTAATAAT AATTCAAATAAAAATTATAATCCATAGTTTTATATATATGCATGCACGTGCACACGTGTG CATGGGTGAGCGTGTGTATATTTTTTTAGTGATTTATTTATTTTGAAATATATATTATGA GGGTTAAGATTTACTATAATCTTCATTATACATTTGATAAATTTAATCATAGATAGAGAT TTGATTAAAAGAAAATTTTCTTAATTCATCCCAACATTAAATCGCAACTATGTCCCTGGC CAAAGACAACATTTATTGCAATTGACCCATCTTAATTTTTTTACTTTCTTGGATGTCTAT ATAAAATAAAAACGACAAATTAGAGTAACCATCCAAAGAAGTCTGGTCCAAATGATAATA AAACTATACCATCTATGGAGTTTCAAAAAAAAAATTATACCATCTATAGACTCTTTGGAG TTGAAAAACAGCACCATGAGCACATAATAAATTGACGACCCATGTCCTGCCCCAGTATTC AGACGAAACGCTTGATAGAGGTTGAGTGAGAAGAAGTGGAGAGTGGTGAGAGTGACACTA TAGTTTTCGCACCAAACAGTACAAGAAATTAAGGATCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGG CGGAGAAGACCAGAGAGCGATGCATGTGCATGCATAGAACATATCGTGAAGGGTAGCAAA TATCGACAGCCACCGAGAGACAGACAAACGACAGAGACGGAAGAGTGGTATTTCAACAAG AGTGAAAAAAAAAAAGGGTTGGAAGGAGGAGATAGGAGCAACAAACGCAGTCACGAACAA ACACAATAAACGTTACAAACACCAAGGGAACAGGCATCAGCTGCATCACGCCAGCACGCA CACAAAACATACACTCATAATCTCCTTTTTGGTGGGTAAGTGAATTGAGGGAAAGAAAGA GAGAGAGAGAGAGATCATTGAATGGTGTAGAGTGACTTGGGGACGTTTGGTTCTCAAGGC GGTTTTTTTTTTTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTTGGGTATATATGTGATTTCTCTTCTTT TGAATTTTGCAGTTTTTTTGGGTGTGTTGTCTTCATCATCAGCTTCTCCACTTTCGTAAG TTTTGTTGAGGTTTAGAGAG
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>LITCHI029637.m4 GenomeSequence - GAATCGCATTTAACAAACCAAAAACTTTCTGATATTGCCTCTTAGAAGTGAGAATAAAAA ACGATCATAGAACATTTGTTTGTACCATCAAAAATAAATGAAACACGATGGTTGCTTAAA ATGGAAAAAAAGAAAGTTAAAGGACAAAAATTAAATTTAGTTGGTACACTCCACAATGTA CCAGTTTCAATACTTGGAAACATTTATCGCAATAAATAACATAATATAATACAAGCAGAC ACAGTTTTTTCTCCCTAAATTCAGCAAAAAAAGATAGAAACTTTGAGTTGCTTTCTGCTG AAATATCCCAACTAAGCACACGGTTTTGTTTGTCAACATTCAACTTTTCTCTATCTACCT CTCTCTAACCCAAAGTTTTCAACTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTAAATAATTATCAGATTC ATTCGCTGGAAGGACTTTTGACCCCAAAGTTTGAAGCTTTTTGGGTTGTGGTTCTTATAT GATTTCTATTTTAGTTGTTTGGATATCCTGATCACTAAAATGGGTTGTTGTAGTAGTAGG GAAGCAGCTTTACAATCAGATGTTAATGGTTATAGATCAGGCACTGGTGGAACGGGACAA GCTCATCAAACTTATCATCAACAACATCATCATCATCATCAGCGGCAGCAGCAGCAGCAG CATGTTGTTCCACAACCAAAAGGGTCTGTCCCTCAAAGTCAAACCACCCCACAAGCAAGG CAACAGCAGCCTGCTGTTGCTGCTGCAAGACAGACCGGGCCAGAAACTATACTGGGGAAG TCATTTGAGGACATTAGAGAGCACTACACACTAGGGAAGGAACTAGGGAGAGGGCAGTTT GGGATAACATACTTGTGCACTCAGAATTCAACAGGCCACACATATGCTTGCAAGTCTATA 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