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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI026012 | Chr3 | 5753978 | 5760685 | + | Protein CHROMATIN REMODELING 8 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI026012.m1 | 407 | 729 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 225.5 | 7.90E-67 |
LITCHI026012.m1 | 753 | 861 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 65.6 | 5.10E-18 |
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>LITCHI026012.m1 ATGGAGGAAGATGAGGATAGGGTTTTGCTGAGTGGTTTGGGTGTGACATCAGCCAATCCT GAAGACATCGAACGTGATGTTTTAGCTGCGGTGAAAAATGTTGCTGGAAATAGTAATGAA GATGGAGGGAACAATGAAGATGAGGAACCTAATGATAAGTTTGAAAGCAGTGATCCCACC TCCACTAGTCAAGCTAAACTTTATAAAAAGTTAAGGGCTATAAGATTTGAAATTGATGCT GTTGCATCTACTGTTGATCACGTGAGAAGGGTTACGAGTAAAGAAGACCGTGATACTGAT GTTGATGATAATGTGGAACGAAGGGATGAAGAGGATGATAGAAGTGCTGTTGAGGCATTT TCAAATGATTTGACTCTTCAGCATGCCCTAGCTGCTGATCGACTAAAAAGCTTAAAGAAA ACAGAGGCTCAACTTGAGAAAGAACTTTCAAATTATCAAGATGAAAAGACTTTAAAGGGT ATTGAGCATGAAAAGCTTATACAGGATCTGGTGAAGGAAGAACATAGACCTAAGAGAAAG TCAAACGATAAGAAACCATGCAAAAATATCTCAAAACGACAGAAAGCAGTTTCAGTTGAT GATGATATTGACTTTGATTTGGTGTTGGATGCAGCATCTGCAGGATTTGTTGAAACAAAA AGGGATGAATTGATTCGGAAAGGGATTTTAACTCCTTTTCACAAGCTTAAGGGCTTTGAG CGCTGCCTTCAACAACCAGGATCGTCTGGTATGCACAATGTACCTCTGGAAGAAGAAGAC AAGAGTAATGATCTGTTCTCTGCCAGTGTTGACAGAGCAGTTCGATCAATGTCAGAGGCT GCACAAGCTCGCCCGGCAACCAAGCTACTTGATCCAGAGGCTGCACCAAAACTTGATGCA CCCACTCGTCCTTTTCGGAGGCTAAAAAAACCTCTTAAACTTCCTGACTCATCAGATAGT GAGGCGGAAAAGAAAAAAAAGTCAACTAGGAAAAAGAAAAGGCCTTTACCTGGTAAGAAG TGGAGAAAGCGCATTTCTCGCGAGGAAATTCAATTGGAAGAAAGTGTTGCAGTAGATGCA AAGGGTAATTCGATCACTTCTAGTTTTGAGGAAGAAATACAAGAAGATCTTGAAGATGCA GATGATGGTGAACCTCCTTTTGTAACACTTGAAGGGGGTTTGAAAATCCCAGAATCAATC TTTAGCAATCTTTTCGACTATCAAAAGGTGGGAGTGCAATGGCTGTGGGAATTGCATTGC CAAAGAGCAGGAGGAATTATTGGGGATGAGATGGGTCTTGGTAAGACCATCCAGATCTTA TCTTTTCTTGGAGCATTGCATTTCAGTAATATGTACAAACCAAGCATTGTTGTCTGCCCA GTTACACTGTTACGACAGTGGAGAAGGGAAGCACTAAAATGGTATCCAAGCTTTCATGTG GAAATATTACATGATTCTGCTCAGGATCTTGGTGGTAGGAAGAAACAGGCCAAATCTTGT GAAAGTGATTATGACAGTGAAGGTTCACTAGACAGTGATTATGAGGTAAATTTATCAACA AAAAACAACAAAAAGTGGGATTTCTTGATAAAACGAGTTTTGAGATCGGAATCTGGTCTG CTTATTACTACTTACGAACAACTACGCTTGCTAGGTGAAAAGTTGCTTGACATTGAATGG GGTTATGCAGTTTTGGATGAAGGGCACCGGATACGAAATCCAAATGCTGAGATTACTCTG GTTTGCAAACAGCTACAGACTGTTCACCGCATAATTATGACTGGTGCACCAATTCAGAAT AAGCTTACAGAATTGTGGTCCTTGTTTGATTTTGTTTTCCCTGGAAAGTTGGGGGTTTTG CCTGTGTTTGAGGCAGAATTTGCAGTTCCCATAGCTGTTGGTGGTTATTCTAATGCTTCA CCCTTACAAGTATCTACGGCCTACAGGTGTGCTGTGGTCTTACGGGACTTGATCATGCCT TATCTCCTTCGGCGTATGAAAGTGGATGTGAATGCCCAGCTTCCCAGAAAGACTGAGCAT GTGCTATTCTGCAGCCTCACTGCAGAACAAAGATCTGTGTATAGAGCATTTCTTGCCAGC TCTGAGGTAGAACAGATATTTGATGGGAGAAAAAACTCTCTGTATGGAATTGATGTGATG CGTAAGATATGCAACCACCCCGATCTTCTTGAGAGAGAACATTCCTTGCAGAATCCTGAT TATGGCAATCCTGAACGCAGTGGAAAGATGAAAGTTGTAGCCCAAGTGCTCAAGGTTTGG AAGGAGCAGGGTCATCGTGTTCTTCTTTTCGCTCAAACTCAGCAGATGCTTGATATTCTT GAGAGTTTCTTAATTGCTGCTGGTTATGAGTATAGGAGAATGGATGGTGTTACTCCCGTC AAGCAGAGAATGGCCTTAATAGATGAGTTCAATAACACGAGTGATGTGTATGTATTCATT CTAACTACAAAAGTTGGTGGTTTGGGGACAAACTTGACTGGTGCAAACAGGGTGATCATT TTTGACCCTGATTGGAACCCATCGATTGACATGCAGGCCAGGGAGCGTGCATGGCGTATT GGTCAGCAACGGGATGTTACTGTATATAGATTGATTACGCGTGGAACTATTGAGGAGAAG GTGTACCACCGGCAGATATACAAACATTTCCTCACTAATAAGATATTGAAGAACCCACAA CAGAGAAGGTTTTTCAAAGCTCGCGATATGAAGGATCTGTTCACCCTGAATGATGATGGC GATGGTGGGTCAACTGAAACATCTTATATTTTCAGCCAGCTGTCTGAAGATGTGAATGTT GTTGGAATTCAGCAAGATACAAAGCAGGATAAGCAGAAACATCGAAAATCAGCTGCGCCA AATCTGGATGATGCTGCAGGTGAGAAAGGAAACAACTTAGGGGTTGGATCTTCTAGTGAG AAAGGTAAAGAAAAAGCTGAAAATGGTGATGATGAAGTAGACGAAGAAACCAATATCTTA AAGAGCCTTTTTGATGCCCATGGGATACATAGTGCTGTGAACCATGATGTAATTATGAAT GCACATGATGAAGAGAAGATGAAGCTAGAGGAGCAAGCTTCTAAAGTTGCTCAAAAGGCA GCAGAAGCGTTACGCCAGTCAAGGATGCTCCGCAGCCATGACAGTGTGTCAGTTCCGACT TGGACTGGGAAATCTGGAGCTGCTGGTGCACCATCGTCTGTCCGCCAGAGATTTGGTTCG ACTGTGAACTCTCAGTTGATCAAGAACTTGGATGAATCATCCAGCAATAAAACAAGCAAA TTGAATGGCTTTGCAGCTGGGGCATCTGCAGGGAAGGCATTATCTTCAGCTGAATTACTG ACTAAAATTCGAGGAAACCAAGAAAGAGCAGTAGGTGCTGGACTTGAGCATCATTTTGGG ATGACTTCAAGTGCTGTGGATGGAACAAAGTCTCGACATGTTGGAGCTTCAAGGTCATCT CGTAATTTATCTGGTGTGCAACCTGAAGTATTAATTCGACAGATCTGTACATTTATACAA CAAAGAGGTGGAAGCTGCAATTCGGCCAGCATAGTGGAACATTTCAAGGACAGGGTACCC CAAAAGGATCTCCCTTTATTCAAGAATCTTTTGAAGGAAATTGCTACCCTTGAGAAAGAC CCAAGTGGATCTCGTTGGGTGCTAAAGCCCGAGTACCTACAACAGTAA
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>LITCHI026012.m1 MEEDEDRVLLSGLGVTSANPEDIERDVLAAVKNVAGNSNEDGGNNEDEEPNDKFESSDPT STSQAKLYKKLRAIRFEIDAVASTVDHVRRVTSKEDRDTDVDDNVERRDEEDDRSAVEAF SNDLTLQHALAADRLKSLKKTEAQLEKELSNYQDEKTLKGIEHEKLIQDLVKEEHRPKRK SNDKKPCKNISKRQKAVSVDDDIDFDLVLDAASAGFVETKRDELIRKGILTPFHKLKGFE RCLQQPGSSGMHNVPLEEEDKSNDLFSASVDRAVRSMSEAAQARPATKLLDPEAAPKLDA PTRPFRRLKKPLKLPDSSDSEAEKKKKSTRKKKRPLPGKKWRKRISREEIQLEESVAVDA KGNSITSSFEEEIQEDLEDADDGEPPFVTLEGGLKIPESIFSNLFDYQKVGVQWLWELHC QRAGGIIGDEMGLGKTIQILSFLGALHFSNMYKPSIVVCPVTLLRQWRREALKWYPSFHV EILHDSAQDLGGRKKQAKSCESDYDSEGSLDSDYEVNLSTKNNKKWDFLIKRVLRSESGL LITTYEQLRLLGEKLLDIEWGYAVLDEGHRIRNPNAEITLVCKQLQTVHRIIMTGAPIQN KLTELWSLFDFVFPGKLGVLPVFEAEFAVPIAVGGYSNASPLQVSTAYRCAVVLRDLIMP YLLRRMKVDVNAQLPRKTEHVLFCSLTAEQRSVYRAFLASSEVEQIFDGRKNSLYGIDVM RKICNHPDLLEREHSLQNPDYGNPERSGKMKVVAQVLKVWKEQGHRVLLFAQTQQMLDIL ESFLIAAGYEYRRMDGVTPVKQRMALIDEFNNTSDVYVFILTTKVGGLGTNLTGANRVII FDPDWNPSIDMQARERAWRIGQQRDVTVYRLITRGTIEEKVYHRQIYKHFLTNKILKNPQ QRRFFKARDMKDLFTLNDDGDGGSTETSYIFSQLSEDVNVVGIQQDTKQDKQKHRKSAAP NLDDAAGEKGNNLGVGSSSEKGKEKAENGDDEVDEETNILKSLFDAHGIHSAVNHDVIMN AHDEEKMKLEEQASKVAQKAAEALRQSRMLRSHDSVSVPTWTGKSGAAGAPSSVRQRFGS TVNSQLIKNLDESSSNKTSKLNGFAAGASAGKALSSAELLTKIRGNQERAVGAGLEHHFG MTSSAVDGTKSRHVGASRSSRNLSGVQPEVLIRQICTFIQQRGGSCNSASIVEHFKDRVP QKDLPLFKNLLKEIATLEKDPSGSRWVLKPEYLQQ.
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>LITCHI026012.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAGCTTCAATATTCACTTCTATTGGCTTTTGAAATTGAAATACAATGGTCACATCATATT CAGGGCCAACCACAAACCCCAACCCGAAATAGAGAGAATAAGAAGAAAAGGGAATAGTGA CTTCACCTCCAAATATCATATGTTCTGCAGAGAAGTCTCCCTGGAGTGGAACCTCTCCCT GAATATTCGAATTACATACTTTAACTCATCAGAACAAATATATTAAAAAATATAGAACAC AGAAGACAAGAAATTAACAATTATGATATGCCAACGACAATGTGTGCGTCAGTGGCTCCA AGCAAGCCAAAAACTTCCGAATCCGCATGAGTCCACTCATATAAACAGAATTCACATTGC TTGCAGTCTAGCCTCTAAAACCATGTACAAGTATACTATATTAAAAGTCCGACTATCAAT TATGACAACATTGCAGTATAAGATTAAATAAAGAAAAGGGAAGCTAATAACTCACAGCAG AGCCAACAGTTTTACTCCAAGATCCTCCAAGATAGGCCAAGTCACCACTACAAACCAGTT GGGTGTCATGAAAAGCTGACCGACTCAGCACTTGCACAACATCCCTTCCTCCCACCATAT GCTTCCCTGCCATTATTTTCAATAAAGTCGTCTTCCCTGCATAATACACACAGCAACCTC CATTTCTCAGCACAACAACAACAATTAAACAACGCAAAAACCTATGCTTGAATTCACAAG TAAAAGCATGCTACTATTTTAAAAACATTCAAATCTTCAGGAGAGTCAATGAGACCAAGA TGTTACCAGATCCATTGGCGCCGACGAGAAGGCAACGAGACCCAGGCGATATATCGAGAT TGAAATCGTAAAAAAGAGGATTATGCTCCTCGTAAGAGAATTGCATGCCGCATACTTTTA TGCTGCTCGAATTCGATGCCATTTTCGCTCTCCTTCATTGCGACAGACGAATCTAGCTGA TTCCATTTTATACGCATCTCTGCAACTCGACCCACCAATTATATTATAACACGTGTCTCC CTGTTTGGCGGGTCTCACACTGCCTGTCGCTTCTTTATTAGTTAGGTTTATACGAAAAAC GACGTCGTTTCGAAATCTCATTCACGTCACCAGTCACGTCCGCTTACGTGGAAAAGAAGC CACTCGTATTCCTATATATATACACTCTAAATTCTAACCACGACCACCGTTCAACAAATG GAAAGCTGAATAAAAAATCCCTGAAGGAAGAAAGGTACGAGAAAAATTATCATAAAATTA CCAATCCTCGAATCTAGGGTTTTTCGGTTTTCGAATTACTGATTAGGTTTCTCTACAAAT GATTTGCCGATCGATAATATCTTTAATATCTACAATCTTTTTGGTGGAAAATTACAAAAT TCCTAAAATTTCAATTGTGTTTTCTGTTCGTTCTGCATTTAGTCTTTGTATTAATGCAAT TCAACTTTGTTATCGTCTTATAGTTTCCTAACTGTGAGTGGCTTCATATGGTTAATGTCA AATAGAATGTGAAATGTTTAAAATTATTTTGCAGAAATGTTGTAAATAAAAGTTGTAATG TTAGGTTATTGGAGTATGAATTGATAATGCTGATGAAAATTGAATGTGATTGTCATGTGT CAACTTTAAGTCTTAAATACTATAGTTGACCCATTTTCTATCAACTTAAACTTTTAGGTC TGATGATAACTAATATGATATCAAAGCTTGGGGGTCCCTGGTTCAAACACTTTCTCCCTT TTTATTTGAAAATCTTCTCATTACACATGTTAGACGTTAGTGAGCATTTAACATGTATCT GTCATATGTCATCTGTCCACGTTGTACGTGAGGAAGCGTGTCATGTGTCAATCTTGAGTC TTAAGTACTATGGTTGGTCTCTTTTCTATCAGTTTAAGTTTTTCGGCTAATAGTAACTAG TTTGTTTTGGCAGGTGGCTCTACCTGGCTGTATATATTATGATAAATATGTTGGAGTGAG TGGTTTGTTACTATGATTTG
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>LITCHI026012.m1 GenomeSequence + GTCACGTCCGCTTACGTGGAAAAGAAGCCACTCGTATTCCTATATATATACACTCTAAAT TCTAACCACGACCACCGTTCAACAAATGGAAAGCTGAATAAAAAATCCCTGAAGGAAGAA AGGTACGAGAAAAATTATCATAAAATTACCAATCCTCGAATCTAGGGTTTTTCGGTTTTC GAATTACTGATTAGGTTTCTCTACAAATGATTTGCCGATCGATAATATCTTTAATATCTA CAATCTTTTTGGTGGAAAATTACAAAATTCCTAAAATTTCAATTGTGTTTTCTGTTCGTT CTGCATTTAGTCTTTGTATTAATGCAATTCAACTTTGTTATCGTCTTATAGTTTCCTAAC TGTGAGTGGCTTCATATGGTTAATGTCAAATAGAATGTGAAATGTTTAAAATTATTTTGC AGAAATGTTGTAAATAAAAGTTGTAATGTTAGGTTATTGGAGTATGAATTGATAATGCTG ATGAAAATTGAATGTGATTGTCATGTGTCAACTTTAAGTCTTAAATACTATAGTTGACCC ATTTTCTATCAACTTAAACTTTTAGGTCTGATGATAACTAATATGATATCAAAGCTTGGG GGTCCCTGGTTCAAACACTTTCTCCCTTTTTATTTGAAAATCTTCTCATTACACATGTTA GACGTTAGTGAGCATTTAACATGTATCTGTCATATGTCATCTGTCCACGTTGTACGTGAG GAAGCGTGTCATGTGTCAATCTTGAGTCTTAAGTACTATGGTTGGTCTCTTTTCTATCAG TTTAAGTTTTTCGGCTAATAGTAACTAGTTTGTTTTGGCAGGTGGCTCTACCTGGCTGTA TATATTATGATAAATATGTTGGAGTGAGTGGTTTGTTACTATGATTTGATGGAGGAAGAT 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CCAAGTGGATCTCGTTGGGTGCTAAAGCCCGAGTACCTACAACAGTAA