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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI025981 | Chr3 | 5498169 | 5502323;5502434 | - | Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI025981.m1 | 30 | 70 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 31.7 | 1.50E-07 |
LITCHI025981.m1 | 87 | 133 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28 | 1.50E-06 |
LITCHI025981.m1 | 100 | 121 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.9 | 0.31 |
LITCHI025981.m1 | 147 | 206 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 41.6 | 8.10E-11 |
LITCHI025981.m1 | 438 | 496 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.9 | 7.90E-07 |
LITCHI025981.m2 | 30 | 70 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 30.9 | 2.70E-07 |
LITCHI025981.m2 | 87 | 133 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.1 | 2.90E-06 |
LITCHI025981.m2 | 100 | 121 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.1 | 0.57 |
LITCHI025981.m2 | 147 | 206 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 40.7 | 1.60E-10 |
LITCHI025981.m2 | 438 | 496 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.9 | 1.60E-06 |
LITCHI025981.m2 | 681 | 737 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.2 | 1.40E-07 |
LITCHI025981.m2 | 681 | 700 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.8 | 1.5 |
LITCHI025981.m2 | 754 | 810 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 30 | 3.40E-07 |
LITCHI025981.m2 | 775 | 796 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.4 | 0.21 |
LITCHI025981.m2 | 929 | 1156 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 147.5 | 5.00E-43 |
LITCHI025981.m2 | 931 | 1199 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 136.2 | 1.30E-39 |
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>LITCHI025981.m1 ATGGCACCGACCAGAAACACTTCTCTGATTCTCTTCCATCTTCTCCTCATCTCATTACTT CCATTGAAGATCACATCATCACCAAGAACACAAGCAGAAGCTCTCATTAGATGGAAGAAC ACCTTCACTTCTTCACCACCAACTTCTCTTGCTTCGTGGTCACTCACCAACCTCAATAAC ATCTGCAACTGGACTTCTATCGTTTGCAACCCTTCTGGAGGTGTTTCACAAATAAAACTC TTTAATGCAAACATCAGTGGCTCACTCACAGACTTCAACTTCACTGAATTCTCAACTCTC ACTCACTTTGATCTCAGCAACAACAATCTTGAAGGACCCATACCATCCTCCATTGGTGGC CTCGCCAATCTTACTTTCTTAGACTTGAGCTCCAACCTTTTCGAAGGCGTTATCCCGGTA GAGGTAGCAGAGTTGACAGAGCTTCAGTATCTGAGTCTAAACAACAACAATCTGAATGGT ACCATCCCTCACCAACTTAGCAATCTTCAGAAGGTAAAATACTTGGACCTTGGATCAAAC TACTTGGAGACACCTGACTGGTCTAAATTTTCGAGTATGCATTTGTTGACACACCTCAAC CTTTCCTACAATGACCTTGCTTTTGAATTCCCTTCTTTTGTATTAAACTGCCTGAACTTG ACATCTCTTGACTTGTCATTAAACCAGTTGAGTGGTCAAATACCAGAATTGGTTTTTGCC AATCTGGGCAAGCTTGAATATCTTAATCTCACAGATAATCTGTTCCAGGGAATGTTTTCA TCGAATGTTTCCAAGCTTTCTAATCTCGTAGAAATTCGTATAGCAAATAACAACTTTAGT GGTACAATTCCTGAGGGCATAGGTTTGTTGTCTGATCTTCAAATCGTTGAATTATTTAAC AATTCGTTTGTAGGACAAATTCCATCTTCATTAGGCCAACTCAAGAAGCTTCAAAAACTT 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