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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI025957 | Chr3 | 5346783 | 5354375 | + | MDIS1-interacting receptor like kinase 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI025957.m1 | 29 | 70 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 33.7 | 3.60E-08 |
LITCHI025957.m1 | 170 | 228 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.2 | 1.30E-06 |
LITCHI025957.m1 | 170 | 192 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.6 | 0.8 |
LITCHI025957.m1 | 482 | 541 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 30.3 | 2.90E-07 |
LITCHI025957.m1 | 530 | 589 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.5 | 5.10E-07 |
LITCHI025957.m1 | 708 | 979 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 167.2 | 4.80E-49 |
LITCHI025957.m1 | 708 | 981 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 144.4 | 4.10E-42 |
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>LITCHI025957.m1 ATGAAGTACCTGAAAGTTCAGTTTTTTTTGCTGATCTTCTCTTACCGTTACATTGGTTGT TCTTGTCTGACGACTGCCTCCAATGGTGATGAAGTGTCAGCTTTGTTATCCATAAAAGCT GGTCTCATTGATCCATTGGACAGTCTTCAAGATTGGAAGTGGCCTGGGAAGCATTCAAGT CACTGCAACTGGAGAGGAGTGTGGTGCAACTCCAAGGGAGTTGTTGAAAAGCTGGATCTC TCCCACAAGAATCTCAGTGGCAGGATATCTGATGACATCCAACGCCTGCAAAGCCTCACT TCTCTCAACTTGTGTTGTAATTGGTTCTCTTTATCACTGCCAAAAGCTGTGTCCAATCTC ACTGCACTGAAGAGCGTTGATGTCAGCCAGAACTTCCTTGTAGGTAGCTTTCCAGCCGGT TTTGGAGCAGCAGCTGGACTTACTTTCCTGAATGCTTCAAGCAACAACTTCTCAGGATTT CTTCCTGAGGATCTTGGAAATGCAACTTCACTGGAGACTTTGGATCTCAGGGGAAGCTTC TTTGAAGGCTCAATTCCAGTGTCTTTCAAGAACTTGAACAAGTTGAAGTTCCTTGGCCTT TCTGGGAACAATCTCACTGGCCAGATACCGAGAGAGCTTGGCCAGCTTTCTTCCCTGGAG ATTATGATTCTTGGTTACAATGAGTTTGAAGGTAAAATCCCTGCAGAGTTTGGAAATCTT ACCAGTCTGAGGTATCTTGATTCGGCGGTTGGCAATCTTGGTGGGGAGATTCCAGCTGAA TTGGGGAGGCTTAAGCTTCTGGAGACATTGTTCTTGTTTAAGAACAATTTTGAAGGAAAG ATTCCACCAGAAATCGGCAACATTGACTCCTTACAATTTCTGGATCTATCAGACAACATG TTATCTCAGGAAATTCCAGCTGAGATTGCTAAGCTGAAGAATTTACAGCTCTTGAATCTG ATGTGCAACCAGCTTTCAGGCCAAGTCCCTGCTGGAATAGGATGGTTGACTCAATTGGAG GTGCTTGAGCTGTGGAACAATTCTTTATCAGGTCCACTGCCTGGTGACCTTGGCAAGAAT TCACCATTGCAGTGGTTGGATGTGTCGTCCAATTCATTCTCTGGAGAGATCCCAGCGAGT TTGTGCAATGGAGCCAATCTCACCAAACTCATTATGTTCAACAACGCCTTCTCAGGACCA ATCCCGGTTACCTTATCCAGTTGTCTCTCACTAGTCCGAGTCAGAATGCAAAACAATGAG CTTTCCGGGACAATTCCAGTTGGGCTTGGCAAACTTGGGAAGCTTCAGAGGTTAGAATTG GCAAATAATAGCCTCACTGGTGAGATCCCAGATGATATTGCTTCCTCTTCATCGCTTTCA TTTATTGACATCTCTAGGAATCACCTTACATCTTCACTACCTTCCACTATTTTTTCCATT TCAAACCTGCAAACATTTATAGCCTCAAACAATAACTTAGTAGGAGAAATCCCTGACCAG TTTCAGGACTGTCCTTCACTTTCTGTTCTTGATCTCTCATCAAACCATTTTTATGGTAGC ATTCCGGCTAGCATTGCTTCATGTGAAAAGTTGGTTAATTTGAATCTTAGGAACAACCAA TTGGCTGGAGAGATCCCGAAATCCTTAGCTATGATGCCTACATTGGCTATTCTTGATCTG TCCAATAACACTTTAAGTGGTGGAATACCTGAAAATTTTGGTACCTCTCCTGCCTTAGAA GTACTCAACGTTTCCTACAATAGGTTAGAGGGTCCTGTTCCTTCAAATGGTGTGCTGAGA ACGATCAACCCAGATGATCTAATTGGTAATGCTGGTCTCTGTGGGGGTGTCCTCCCTCCA TGCAGTCCATATTCGCAAACTGCGTTGGGGCAGAGGAGCTTGCGTGCCAAGCACATTGTT GCTGGATGGATCATTGGGCTTTTGTCTGTTTTGGCAGTTGTAATTGGCCTCTTTGGTGCT AGATCTCTATACAAAAGATGGTATTCGAATGGAAGCTGCTTTGAGGAAAGATTAGAAATG GGCAACGGAGAGTGGCCCTGGAGACTAATGGTATTCCAGAGGCTTGGTTTCAAAAGTGCT GACATTCTAGCCTGCATTAAGGAATCGAACGTGATTGGAATGGGAGCAACTGGGATTGTT TACAAGGCTGAGATGTCGCTATTGAACACAGTTGTGGCTGTCAAAAAGTTATGGAGATCA AGAGCTGATACTGAAGCTGGAGGCAGTGGTGATTTTGTTGGAGAGGTCAATGTCCTGGGA AAGCTAAGACACCGAAACATAGTTCGATTACTTGGATTTCTTCACAATGATACCAACATG ATGATAGTCTACGAGTTCATGAACAATGGCAGCCTTGGAGAAGCTTTGCACGGGAAACAA GCAGCTAGGCTTCTGGTTGACTGGGTTTCACGGTATAACATAGCACTTGGAGTTGCACAA GGGCTTGCATACCTCCACCATGATTGTCACCCACCAATTATTCATCGAGATATCAAATCA AACAACATATTGCTTGATGCAAATCTAGAGCCTAAAATTGCTGATTTCGGATTGGCAAGG ATGATGGTTCGAAAGAATGAGACAGTTTCCATGGTGGCTGGATCCTATGGATACATTGCT CCTGAGTATGGATACACCTTGAAGGTCGATGAAAAGATCGATATATACAGCTTTGGTGTG GTTCTGTTGGAGCTTCTGACAGGAAAGAAGCCTTTAGATCCTGAGTTTGGAGAATCCGTT GACATCGTGGAATGGATTCGAAGGAAGATTAGTGAAAATAGAAATTTAGAAGAGGCATTA GACCCCAATGTAGGAAATTGTAAGCATGTTCAGGAGGAGATGCTTTTAGTCCTTAGAATA GCACTTCTGTGCACTGCTAAACTCCCCAAGGACAGACCATCCATGAGGGATGTCATAACA ATGCTTGGAGAGGCAAAGCCTCGAAGAAAAAGCAGTAGCATCAACAATGACGGCAAAGAA AAGCCAGTATTTAGCACATCACCTGTAAATGGCCTTCTGTAG
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>LITCHI025957.m1 MKYLKVQFFLLIFSYRYIGCSCLTTASNGDEVSALLSIKAGLIDPLDSLQDWKWPGKHSS HCNWRGVWCNSKGVVEKLDLSHKNLSGRISDDIQRLQSLTSLNLCCNWFSLSLPKAVSNL TALKSVDVSQNFLVGSFPAGFGAAAGLTFLNASSNNFSGFLPEDLGNATSLETLDLRGSF FEGSIPVSFKNLNKLKFLGLSGNNLTGQIPRELGQLSSLEIMILGYNEFEGKIPAEFGNL TSLRYLDSAVGNLGGEIPAELGRLKLLETLFLFKNNFEGKIPPEIGNIDSLQFLDLSDNM LSQEIPAEIAKLKNLQLLNLMCNQLSGQVPAGIGWLTQLEVLELWNNSLSGPLPGDLGKN SPLQWLDVSSNSFSGEIPASLCNGANLTKLIMFNNAFSGPIPVTLSSCLSLVRVRMQNNE LSGTIPVGLGKLGKLQRLELANNSLTGEIPDDIASSSSLSFIDISRNHLTSSLPSTIFSI SNLQTFIASNNNLVGEIPDQFQDCPSLSVLDLSSNHFYGSIPASIASCEKLVNLNLRNNQ LAGEIPKSLAMMPTLAILDLSNNTLSGGIPENFGTSPALEVLNVSYNRLEGPVPSNGVLR TINPDDLIGNAGLCGGVLPPCSPYSQTALGQRSLRAKHIVAGWIIGLLSVLAVVIGLFGA RSLYKRWYSNGSCFEERLEMGNGEWPWRLMVFQRLGFKSADILACIKESNVIGMGATGIV YKAEMSLLNTVVAVKKLWRSRADTEAGGSGDFVGEVNVLGKLRHRNIVRLLGFLHNDTNM MIVYEFMNNGSLGEALHGKQAARLLVDWVSRYNIALGVAQGLAYLHHDCHPPIIHRDIKS NNILLDANLEPKIADFGLARMMVRKNETVSMVAGSYGYIAPEYGYTLKVDEKIDIYSFGV VLLELLTGKKPLDPEFGESVDIVEWIRRKISENRNLEEALDPNVGNCKHVQEEMLLVLRI ALLCTAKLPKDRPSMRDVITMLGEAKPRRKSSSINNDGKEKPVFSTSPVNGLL.
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>LITCHI025957.m1 ATGAAGTACCTGAAAGTTCAGTTTTTTTTGCTGATCTTCTCTTACCGTTACATTGGTTGT TCTTGTCTGACGACTGCCTCCAATGGTGATGAAGTGTCAGCTTTGTTATCCATAAAAGCT GGTCTCATTGATCCATTGGACAGTCTTCAAGATTGGAAGTGGCCTGGGAAGCATTCAAGT CACTGCAACTGGAGAGGAGTGTGGTGCAACTCCAAGGGAGTTGTTGAAAAGCTGGATCTC TCCCACAAGAATCTCAGTGGCAGGATATCTGATGACATCCAACGCCTGCAAAGCCTCACT TCTCTCAACTTGTGTTGTAATTGGTTCTCTTTATCACTGCCAAAAGCTGTGTCCAATCTC ACTGCACTGAAGAGCGTTGATGTCAGCCAGAACTTCCTTGTAGGTAGCTTTCCAGCCGGT TTTGGAGCAGCAGCTGGACTTACTTTCCTGAATGCTTCAAGCAACAACTTCTCAGGATTT CTTCCTGAGGATCTTGGAAATGCAACTTCACTGGAGACTTTGGATCTCAGGGGAAGCTTC TTTGAAGGCTCAATTCCAGTGTCTTTCAAGAACTTGAACAAGTTGAAGTTCCTTGGCCTT TCTGGGAACAATCTCACTGGCCAGATACCGAGAGAGCTTGGCCAGCTTTCTTCCCTGGAG ATTATGATTCTTGGTTACAATGAGTTTGAAGGTAAAATCCCTGCAGAGTTTGGAAATCTT ACCAGTCTGAGGTATCTTGATTCGGCGGTTGGCAATCTTGGTGGGGAGATTCCAGCTGAA TTGGGGAGGCTTAAGCTTCTGGAGACATTGTTCTTGTTTAAGAACAATTTTGAAGGAAAG ATTCCACCAGAAATCGGCAACATTGACTCCTTACAATTTCTGGATCTATCAGACAACATG TTATCTCAGGAAATTCCAGCTGAGATTGCTAAGCTGAAGAATTTACAGCTCTTGAATCTG 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