Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI025816 | Chr3 | 4248651 | 4250982 | + | Common plant regulatory factor 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI025816.m1 | 83 | 145 | PF00170.24 | bZIP_1 | Coiled-coil | 71.1 | 6.50E-20 |
LITCHI025816.m1 | 85 | 132 | PF07716.18 | bZIP_2 | Coiled-coil | 38.8 | 7.80E-10 |
Download Copy
>LITCHI025816.m1 ATGTTAGTGGGTGGAGATGGGAAAACTGAGACACGTTCAAGTCCAGTTTCTGCTGGGGAG GTCAATGCAGCTTCCAATAAGGTGTTGAGTGTTGCTCCTGGAAAATCTGTTGAGCCTGTA CTTTCTCCTGGCATGACCACAGCATTGGAACTTAGGAACCCTACTAGCACAAATGCTAAA ACAACTCCAATTACTACTCCTCCTCAACCTTGTTCGGTTTTGCCCCCTAAAGCCTGGTTG CAGAATGAACGGGAGTTGAAACGTGAGAGAAGGAAGCAATCTAATCGAGAATCTGCAAGA AGGTCTAGATTGAGGAAGCAGGCTGAGACTGAAGAACTTGCACATAAGGTTGACTCACTA GCTGCAGAGAATGTAGCACTTAAATCCGAAATCAATCTATTTACAGAGAAGTCAGAGAAA CTGAGGGTAGAAAATGTTTCATTAGTGGAGAAGCTGAAAAATGCACAGCTAGGACGTACG CATGATGTTGTTCTGAACAACATTGACGAAAAGAGGGTCACTCCAGTTAGTACTGAAAAC CTGCTGTCTAGAGTTAACAATTCAGGTTCTGTTGATAGAAATGTCGGAGAAGAAGGTCAC CGGTTTGAGAAAAACTCAAACAACGGTGCCAAGCTACATCAGCTATTGGATACGAGTCCC AGGGCAGATGCCGTGGCTGCCGGCTGA
Download Copy
>LITCHI025816.m1 ATGTTAGTGGGTGGAGATGGGAAAACTGAGACACGTTCAAGTCCAGTTTCTGCTGGGGAG GTCAATGCAGCTTCCAATAAGGTGTTGAGTGTTGCTCCTGGAAAATCTGTTGAGCCTGTA CTTTCTCCTGGCATGACCACAGCATTGGAACTTAGGAACCCTACTAGCACAAATGCTAAA ACAACTCCAATTACTACTCCTCCTCAACCTTGTTCGGTTTTGCCCCCTAAAGCCTGGTTG CAGAATGAACGGGAGTTGAAACGTGAGAGAAGGAAGCAATCTAATCGAGAATCTGCAAGA AGGTCTAGATTGAGGAAGCAGGCTGAGACTGAAGAACTTGCACATAAGGTTGACTCACTA GCTGCAGAGAATGTAGCACTTAAATCCGAAATCAATCTATTTACAGAGAAGTCAGAGAAA CTGAGGGTAGAAAATGTTTCATTAGTGGAGAAGCTGAAAAATGCACAGCTAGGACGTACG CATGATGTTGTTCTGAACAACATTGACGAAAAGAGGGTCACTCCAGTTAGTACTGAAAAC CTGCTGTCTAGAGTTAACAATTCAGGTTCTGTTGATAGAAATGTCGGAGAAGAAGGTCAC CGGTTTGAGAAAAACTCAAACAACGGTGCCAAGCTACATCAGCTATTGGATACGAGTCCC AGGGCAGATGCCGTGGCTGCCGGCTGACTAATACCTTAACTTGCAGCCTCTTTTGACGTT TTTGTTTGCAGTAGTCATCTAGCTTGTGCATGGTTACTGGTCCAAAATTTACTTCTAACT GTCAGCGGAGGATTTATACCAGAATATGATTGGTATCTACCATCTTAAGTTTTTACCCCT TTTTTAATCATTTTAAAGTTAGTTTTCTATCATGGCAGACCTGATGTATTTTTAAGAAAT ATCAGAGTGCTGGAATGGCCCTGAAAGGCCACTTAAGTTGATGTATATTGAAGATAAGTA GCGATTTAAGTTTAGAAAAAGGATTTGGAACCTTGTAATCGGTGTTTGGTTTGTTGTGAA CTACTAATGTAGAACCCCTGTAATATGTCAATGCTAAATGTGTGAACGTCTCAATAATTG TCGTCTTTTTCCGTTTTCTTTTATTTGTGTTGATTTTTATTTTCCGTTGCCCTAAGATTC TATGGTTTCGACTTTCAAAACCTTTTAATTGAACAGCCAGTTGACCACCACACGTTCTCT TTCTCCCAGTACAAGAGAACAAAGGGCAAGAAAAGATCTATGTAAAATAGACGAGGGAGA AGTTTCTGGATAGGCTGTGTGGTCACTCTTGGATTTATTCTACACCACGAGCACTCTGTA GCTTGAATTCTATTGGTTTAATGAATTTGCCTGTTGTAACTTTTGAAATTGACCAACTCT AGGACCCAACATGGTCTTTTTGTTGTACTTAATCAGAGAAATAGTGCATGGATAATAATA TAATACTATTACGTAGTTGGTTTCAAATGGATAACAAGGATCACACCAACCCTTTGAAAG GGAGTTTTGGTATTTTGAATTGGAATCATCACTTTCTATTAATTATTGTATTGTTTTATG ATAGAATTCAATTCTGTGCTCTAATCAAAGACGTCAGTACATGATATCTGTATTGTTTTT CGTTATTTTGTGTAATTGAAGCTTACAAAACCATCTGTTGCCATGTCAGTCCCCTTCATA TTCCTAACAAAGTGTTGTGGCTTTTAGACATTTATACATTCATAAAAGAGAGTTTCTTAC AATTCCACGATTGAGGCCTGTGTTACTTTGCTGAAGTCAATTGAAAAAGCAAACAAATTA AACTGGCTTTCTATCGCCTATCGATGTTTAACCCTTTTTGCTAATCTGTGCTGGAATTAC CGTTAATTTGCAAGTTTGGATTGAGCCAAGCAGCCCAAACCAGATCTATTCTTTCACGAC
Download Copy
>LITCHI025816.m1 + Up_Stream_Len 2000 TATTTTCCCTCTAAATTTAGAGGCCAAATGAGGAAGGAATTCAGTGATTTTGAGGGCTGG AATAACTTTTAACTTGTGAATTCTGCCAGCCTATGATGTCCCCTTATGGAGCACCTTATG CTGCGATTTACTCACCTGGAGGAGTTTATCCTGCAGTGCCTATGGTAAGTTACTTGTTAT CTTTGATTAAACTACAGTCTTTGCAATTATTGTGTAAGCTTTACTTGACATATTAGAGGA TAATTGGCTATTTTTTGTGTGCAAAATTTGATTTAATTGAATATTATAATCCTTATTTAT AATAATTGGGCGTTGTGAAACTTAGCTAAGTGCAATTTCCTTAGCTTGTTTTTGCATATT GATCAATAATTCCTTGAATGCAATGGACTGCTCGTTGTTGGCTGAAATTTTCTGACATAT ATTTCTTTGTTCTCACTTGAATCTAGGGATCACATCCACATGCTCATGTGGTTCCATCAT CACCTGCTGTAAGTGGCTTGGTTCTAAGATCTCCCTTTGAACTCTTGCTGGTGTATTTTT TCTACTCTTAATGTTGATGCAATTTTTTGAGTAGAATTAAATCAGGAATAAAAGACAGAT GCATCTGTTTTGTTGTATAGGCACCTATATTCAATGTTGGATGTAATCATAGCTCAATAA TGCAGGCTGGAATCCCTTTGAATACAGAAGGGCCTACAAAATCATCTGGGAACTCAGAGC GAGGTTTGATGAAGAAACTAAAAGGATTTGATGCTCTTGCAATGTCAATAGGCAATGGTA ATGCAGACAATGCAGAGGTCAGGGCTGAAGATAGGCCATCACAGAGGTTTGTTGAACAAA TATCTTGTCTTTCTATATATGTCATATACTATTTTTATTTGGTTGAGTGTTTCTTCCTAG CTTATCTCTTTTGCATAAGCTGATTTCGTGACTATTTGAACAGTGAAACTGAAGGTTCAA GTGAGGGAAGTGATGGAAATACTTCAGGGGTAACAACTTCTTTCTCCATTAGCATCTGTA CTATTTTTCTTTTTTGTCATTATATATATCTGTAATCAAGGGCAAAATTTCTAAATCTTA GTTGTCATCCCCACCCATCTTATGCCAGGCAGAACAGACTGGAAGGAAAAGAAGCTGGGA GGAAACACCAACCCTTGGTATGACTATTCTTCACCAAATACTAAATCTTGACAAGCAATA GGGTTTATTTGTGATTGCTGTCCGGCATATAGTGTATTCCCGATCATTAGCATGGCATGC ACGATATATATCCAGTGGTGCCATTAACTGTTTACATTATGATTCTATGTTGTCAGTTTT TACAGATGTTTGAATTATTTAACTTTAATTTCTAAATTAACTAATAAGAGTCCAATTATT CACTTGGGTGGAGAGGACAGTGACTTAAAAGAAATACGAGTAAAATGAGACCAAATATAT AACTGTTGTCTATCCTTCAGAGATTCCTATGATAAACTTTTGATGATGTAAGCCAATTCA TGAATTTATGTTCTGTATAGAGGTGGCATCATGAAATCCGGATTTTATTTCTAATGGCTG TCACTAAATTATGGTGTGGATGCTTGGATTGATTTGAAGAGGTGTCAGTCTAATTATTTG GTCAATCTGTTGAAAAGAAAATATTTCTGCATCTTTTTGCGGTTGTATGTGTTCTAGGCA AATAAATGTTCATCACTAGGTACTGGGTCATAATATCTACTGGGCATGCCAGTGTGGTAG TAATTTTTTCTTCTTGCTTATTTAGAAAGCATTATTCATCAAACTAGTGGTTTGTAGGCA ATAGTTATACTGTAGAATTTCTAATATGTTGTAGTTGGAGTTGTGGAATAAGATGATGTA TCGATATGATTACTATGTGAAAATGACGCAACCTATCAGGAAAATTATGAAAAGAAGGCG ATAATACAAACTAATAATTGGGCGTTGGAACTATAGAATTAAATTTCATGTGATGAGGAT TTTACATATGTTTAATCTCT
Download Copy
>LITCHI025816.m1 GenomeSequence + ATGTTAGTGGGTGGAGATGGGAAAACTGAGACACGTTCAAGTCCAGTTTCTGCTGGGGAG GTCAATGCAGCTTCCAATAAGGTGTTGAGTGTTGCTCCTGGAAAATCTGTTGAGCCTGTA CTTTCTCCTGGCATGACCACAGCATTGGAACTTAGGAACCCTACTAGCACAAATGCTAAA ACAACTCCAATTACTACTCCTCCTCAACCTTGTTCGGTTTTGCCCCCTAAAGCCTGGTTG CAGGTATTACTTGCAAATGTTTACTTTCTAATCTTCATTCTGTTATCATAAAATACTTAA ACCTCCTGTTCAATTTTATTTCATATCAAAATCTCCAATTAACTTGATTTTTGGTGGTAA AAGTGTTGTCTTAAGCAGTAGTTTTGATTAAGAACAATATTTGATGGTGTCTTATCCTTT TTACTTTAGAATGAACGGGAGTTGAAACGTGAGAGAAGGAAGCAATCTAATCGAGAATCT GCAAGAAGGTCTAGATTGAGGAAGCAGGTAAGGAAAAAAATTATGTGAAAATGCATTTTT GTCTTATAACCTTCTGTTGTTTGTCTCTTTGTGGTTCATCATAGTTTGATCTGGAGCTAA TTTTTGTCTCTTCTATAGGCTGAGACTGAAGAACTTGCACATAAGGTTGACTCACTAGCT GCAGAGAATGTAGCACTTAAATCCGAAATCAATCTATTTACAGAGAAGTCAGAGAAACTG AGGGTAGAAAATGTTTCATTAGTGGTATGATCTTGTGTTCCTTCTATAATTTTTCCTTTT TCCTAAGTCCACAAAAATATCTGTTTGCTTCTATGTCCAGAAGTCTTGTGGTAGCTTATG AAGTGGTTTTAATCTGCAGGAGAAGCTGAAAAATGCACAGCTAGGACGTACGCATGATGT TGTTCTGAACAACATTGACGAAAAGAGGGTCACTCCAGTTAGTACTGAAAACCTGCTGTC TAGAGTTAACAATTCAGGTTCTGTTGATAGAAATGTCGGAGAAGAAGGTCACCGGTTTGA GAAAAACTCAAACAACGGTGCCAAGCTACATCAGCTATTGGATACGAGTCCCAGGGCAGA TGCCGTGGCTGCCGGCTGACTAATACCTTAACTTGCAGCCTCTTTTGACGTTTTTGTTTG CAGTAGTCATCTAGCTTGTGCATGGTTACTGGTCCAAAATTTACTTCTAACTGTCAGCGG AGGATTTATACCAGAATATGATTGGTATCTACCATCTTAAGTTTTTACCCCTTTTTTAAT CATTTTAAAGTTAGTTTTCTATCATGGCAGACCTGATGTATTTTTAAGAAATATCAGAGT GCTGGAATGGCCCTGAAAGGCCACTTAAGTTGATGTATATTGAAGATAAGTAGCGATTTA AGTTTAGAAAAAGGATTTGGAACCTTGTAATCGGTGTTTGGTTTGTTGTGAACTACTAAT GTAGAACCCCTGTAATATGTCAATGCTAAATGTGTGAACGTCTCAATAATTGTCGTCTTT TTCCGTTTTCTTTTATTTGTGTTGATTTTTATTTTCCGTTGCCCTAAGATTCTATGGTTT CGACTTTCAAAACCTTTTAATTGAACAGCCAGTTGACCACCACACGTTCTCTTTCTCCCA GTACAAGAGAACAAAGGGCAAGAAAAGATCTATGTAAAATAGACGAGGGAGAAGTTTCTG GATAGGCTGTGTGGTCACTCTTGGATTTATTCTACACCACGAGCACTCTGTAGCTTGAAT TCTATTGGTTTAATGAATTTGCCTGTTGTAACTTTTGAAATTGACCAACTCTAGGACCCA ACATGGTCTTTTTGTTGTACTTAATCAGAGAAATAGTGCATGGATAATAATATAATACTA TTACGTAGTTGGTTTCAAATGGATAACAAGGATCACACCAACCCTTTGAAAGGGAGTTTT GGTATTTTGAATTGGAATCATCACTTTCTATTAATTATTGTATTGTTTTATGATAGAATT CAATTCTGTGCTCTAATCAAAGACGTCAGTACATGATATCTGTATTGTTTTTCGTTATTT TGTGTAATTGAAGCTTACAAAACCATCTGTTGCCATGTCAGTCCCCTTCATATTCCTAAC AAAGTGTTGTGGCTTTTAGACATTTATACATTCATAAAAGAGAGTTTCTTACAATTCCAC GATTGAGGCCTGTGTTACTTTGCTGAAGTCAATTGAAAAAGCAAACAAATTAAACTGGCT TTCTATCGCCTATCGATGTTTAACCCTTTTTGCTAATCTGTGCTGGAATTACCGTTAATT TGCAAGTTTGGATTGAGCCAAGCAGCCCAAACCAGATCTATTCTTTCACGAC