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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI025723 | Chr3 | 3535144 | 3535657 | + | U-box domain-containing protein 33 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI025723.m1 | 7 | 109 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 45.2 | 7.60E-12 |
LITCHI025723.m1 | 7 | 109 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 33.2 | 3.70E-08 |
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>LITCHI025723.m1 ATGATAACAACTTTTCAGGTTGATGTTTTGAGTAAGTTTAAACATCCAAACCTCATCACT CCAATTGGAGTCTGCCCAGAAACATGTGGTCTCATTTATGAATATCTTCCCAATGGAAGC CTTGAAGACGGACTCAGTTGCAAGAACAACATCCCTCCTTCACCGTCATGGCAAACTCTG ATATGCATAGCTACAGACACATGCTCTGCCCTTATATTTCTTCATTTCAGTAAGCCTCAC AGCATAGTCTATGGATATTTAAAAGCTGAAAATATTCTCCTTGATGCTGGTTTTGTATGC AAACTCAGTGGCTCTGGCGTCAGTAACCATCCTCCATTCCTTCAAATGGGAGAACTATCT CCCAAAAAGCCAAGTCACACATTTACTCATTCGGAATTATTGACAAATCTTCAGCTTTCA AATAACAATCTTATCCCCAACCATGCACTACGTTCTGCAATCCTAGAATGGTTGCGACAT CTTTAA
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>LITCHI025723.m1 ATGATAACAACTTTTCAGGTTGATGTTTTGAGTAAGTTTAAACATCCAAACCTCATCACT CCAATTGGAGTCTGCCCAGAAACATGTGGTCTCATTTATGAATATCTTCCCAATGGAAGC CTTGAAGACGGACTCAGTTGCAAGAACAACATCCCTCCTTCACCGTCATGGCAAACTCTG ATATGCATAGCTACAGACACATGCTCTGCCCTTATATTTCTTCATTTCAGTAAGCCTCAC AGCATAGTCTATGGATATTTAAAAGCTGAAAATATTCTCCTTGATGCTGGTTTTGTATGC AAACTCAGTGGCTCTGGCGTCAGTAACCATCCTCCATTCCTTCAAATGGGAGAACTATCT CCCAAAAAGCCAAGTCACACATTTACTCATTCGGAATTATTGACAAATCTTCAGCTTTCA AATAACAATCTTATCCCCAACCATGCACTACGTTCTGCAATCCTAGAATGGTTGCGACAT CTTTAA
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>LITCHI025723.m1 + Up_Stream_Len 2000 GTTGGACAGTCGTGGACGTAGACCTATTATTACCGAACCACGTAAAAAGCTTAGTGTTCC TCGTTTGATCTTCTGTTCTTGTCTTTGTCTTTTCTTGGTATTTGTGCTTTCTCACATTGA TTGCAGGTATTGGGCATTGATTACTCGTCGACTGAATTCCAACGTCGACATTTTGTAAGA AAAATATAATCTTTTTCTTTTGAATTGACAGTTTTAGTTTGTTTTAGTTGTTTTGTAACA AAGATATGATCATTATTGTTTTGTCTTTTTAGTATCCAATAATCTCATTATTGAATGTGT CATTCATGTGTTTTCTCGACATTATTTCACTTGGGTTAATTGTTTAAAAACGCAACTCTT ATGCTTTTCCTTCAACTGCATCTTTATCCGTTTTCCATTATTATTCTCTCTTCATTCACT TTTCAAGGTAATTTGAGGATTTTGTTTTCTGCATACTCAGCAACTTGTTTACAACCAAAC ACAAAATCTGCTCCTAAGGTAATTTGAGTACTGTACTTTCAATTTATAAAAAGTTATATT GTTCCTGGTGTTCATTTATTTACTTTTAAATAATTTACTTTTCATTGTATTGAAGTTTTA TAATTTTTCATATAGTTCATCTGTGTATTATATTCATTTTTTGAACTGATATTATATTTA TATTTATATTTATACCTTTTAGTTAGTAGATATTATATGATTTTTAAAACAAAATGTGTT TTTTTTTTTTAATAAACAAATGATTATTTTAACATTTTTTTTAATTTTCATTAAAAATAT TATGTTTTTAACTAAACATCCGTACTTTTTTTAAGTTTTACTTTAATTTTCATAAATATC AATATTTTTTAATTGATATTTTCGATAAGTCATAATATCGATATTTTTGCCGATGTCAAT ATTTTCAACATTATAAGCATTAATTGTACTTAGAAGCTTGAAAACTTCACCTCACGAAAA TTGCTGATTACTGCCATCAATTTACAGGCCAGAGCATTGGAAGGGTCATATCATACGTTG ATCAGAAATTGAGGAAGTATTAGCAAAAGAAAATGGAAACTTAAAAAATGCGAAAAATAA ATGGGAAGAAGAGCGGATGATTGCCCTGGATCAGAAAGTTTTACTGGAACGTCAAGTTTC CATCTATGAATGTAGGTGAAAGAGTTGGATGCTAAGATATAGAGTCTGCAGTGGAATTGT CTCATACTTGCGAGATAACTTCCGCGCAAAGCGTGATCACAATGCACGCAATATAACTAA AGATCTTTTCACAAGACAGGTCGAAACTTGCTCAAGCATAAATTCACGACAGTTTTTCTC TGTGTTCTGTTTATCGAGGACCGAGATTCATGAAGCAACTTCCAATTTCGATCCATCCTT GAAGATTTGGGAACAAGGATAAGCTGACATTTACAAAGGTTTACTTCGTCACATTCTGGT CGCCATCAAGGTGCTGAACCCATACAGTTTTCAATGCAACGCAGTATTTCAAGAGGACGT AAACAAACAGTATGTTTATATATATATATATATATTCCACTCACCACCTGTTTGGCAGGT CTTGGTGAGTGAAAGGACCCCTTGATTTTAGCACTCTTTAATGCGTGTGTCTCCATCCAA TCAAAGATACTCAACTCTATTCGTCGTCTTTTACCTACGCTTTAAGACACGCTACTTATT TAGAAATAATAAGTTCTGTCTTCTTTATAATAAAAAAAAAAAGCTAATATATATATAGAT AATAGATATATATATGACGCCCATCAATTTAAGTTCCATATCTTCTGATATATCATGATG CATGAGTTGAATATTTGAAATATTTTGTCGCCCTATGAAGACCGAAGTTATGCCTTTTTG GTGCCACCTTGCTCTTTCTAGAATCTTGTCTGAATGTTCAGAAATAAAGTAGTACTAATC TAATTATCGTTCAAACATTAGTAGACTCAGAAAAAAAGAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAC AATCCACATCGATTGCAGAG
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>LITCHI025741.m2 GenomeSequence - AAAAAAAAAAACACTAAGAACTATTATTTTTTTACTCAGAAAATAAGAAAAACCTTCAAA TCTAATTATATAAATTGAGGACATCAAGAAAAGTATAATTTTGAATCTCAAAGTGGGTGA TTTGTTTTCAAAAGACATCAAAAAAATTTTTAATTTCCAAAAGTATCCCTATCCTAATCA AGCCCCAAAACCAAACCCAACCCAACCCACAAGTCAAAAATTAACTGTGGTTAGCAAATC ACTATAAATAAAGAAGTGGAGTACTACTCATTGAAAACCCTATATTCTACTTTCTCCCAA AAGAAGGAAAAAAAAAAAAAAACCAAACTTAGGTTCTATTTATTCTAGTGTTTTGTTTTA CAAAACAAAAGGCCAAAGGTGACTTACAAAACACAACTTGGCAAAGAAAGAGAAAAAAGC CAAAGTCCAAGGAGGTCGCTGCGAAGGTCTCATTCATCAAACCAGCCCCCACTCTCTCCA ATTCCAAATTTTCTACACATAAAAATACTGGTACGTTTTTTTTTTTTTTCCCCTTTTTTT CACTTCAAAACCTAAAAAGCAATTATTAAAGTCTATGGATATTTGAAGGAATAGTAGTGT CTGTATCTGTTCAAAAAACTTGAAATATAGCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT AGCAATATATCTGCAATTAAGAGAGAAGAGTGTGTGAGTGAGCCAGAACGCGGGACCTTA AAACAAACATAAAAAACTTTAATGGGCTCTTCAAAACCCTAGATCAATCTTTTCCCGCCA AAACCCACATGTTTTTTGGACGACCCAGATGATTAAACGGTACTAATACATAATTTGAAT CTCTGTATAATCATGTAAACTCTAATATTTTATATATTTTTTTAAAAGGTTTTTTTTTGG 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