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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI025720 | Chr3 | 3506722 | 3519901 | + | U-box domain-containing protein 33 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI025720.m1 | 539 | 791 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 127.9 | 4.50E-37 |
LITCHI025720.m1 | 539 | 789 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 136.8 | 8.90E-40 |
LITCHI025720.m1 | 823 | 882 | PF04564.18 | U-box | Domain | 50.7 | 1.60E-13 |
LITCHI025720.m1 | 1138 | 1266 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 87.4 | 1.00E-24 |
LITCHI025720.m1 | 1138 | 1267 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 75.4 | 4.80E-21 |
LITCHI025720.m1 | 1384 | 1454 | PF04564.18 | U-box | Domain | 66.1 | 2.60E-18 |
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>LITCHI025720.m1 ATGGCTGTGGTGAGTCATGTGCCGTCAATTCCACAACAGGTCGACCCAATAAGGTTTGCC GGCTTCGGGTTGCCGGGAATTATGTCCACCAGAAAAGAGATAGTGGAGCAACCCGTGGCG CGTGTGATTGAAGACAAGATATATGTTGCTGTTGGATTAAAAAAGAGCAAATCTGTTCTG TTATGGGCATTGCAGAACTCTGGAGGGAAGCGAATTTGTATAATTTCTGTCTACCAACCC GCGCAAATGATTCCAGTTATGGGTACTAAGTTTCCGGCTAGTTCGCTTGAACCGGAGGAA GTTAGAGCATACAGGGAGCTGGAAAGGCAAGATATGCAGAAGGTGCTGGATAAGTACCTT GCTATTTGTCGACACATGGGGGTACAGGCGGAGAAACAATACATTGAGATGGAATCTATT GAGAAGGGGATTTTGGAGTTGATTTCACAATGTGGGATCACGAAGCTTGTTATGGGAGCA GCAGCGGATAAGTACTATACAAGGAGAATGACGGACATCAAGTCAAAGAAGGCTATTTCG GTGCGGTTACAAGCACCTGCTTCATGTCACATATCGTTTGTCTGCAAAGGGAACCTTATT TACACAAGGGGGGTTGATTCTGATGGAGCTCATATAGAGGTTCTATCTCCTTTGCAACAA GCAAGTCAGAACACTGAAACTGGGCATGTGAATCGCATGAGATCACAATCTCTTACATTG GGACCTAATAATCATGTAAAACTCACCAATCCAGTCCAAAATTTTTTCCAGAGAGTAAGA TCTGGGAATTTTGACAGAAATGGGAAGGGTGTAAAGGCTCTTAATTCCCCAGATAGTACT GGAGAGCCATCAACTCCACAGAGCAGTTCAGATGAATCAGATGGGTTATCAACAAGGAGT CCTTCCCCAGGCTCAGTTCTCTCATCATGTTCTTCCACGGGAGGAGTTGAAGTTACCCCG ATTTCAATTATAAATACTGAAGGGATAAAAAATGGTTTAGAGTCAGGCACACTGCCTCAG TCCAATGAGGACCTTAATCATTTATCTCCTCCCAGTGTCTTGGACGTAAGTATTGATGAT ACTCTCTATGATCAACTTGCACAAGCAATGGCAGAGGCTCAAAATTCAAGGCGGGAAGCA TATGAAGAGGCATCCAGGCGTGGGAAGGCTGAAAAAGATGCCATTGACTCCATTCGCAAG GCTAAAGCTTCGGAAAGCTTGTATGCTGAGGAGTTAAAACGAAGAAAAGAAATTGAGGAA GCACTGGCAAAAGAAAAGGAGGAACTTGAAGAGATAAAAAAGCAGCACAATGAAGTCATG GGAAGACTTCGAAGTGCCATAGATCAGAAATCATCGCTGGAGATCCAAATTGCAGAATCT GATGAGATGGTAAAGGAGTTGGAGCAGAAAATTATATCTGCTGTTGACTTGTTGCAAAAT TACAAGAAAGAACGAGATGAGTTGGAGATGGAGCGTGATCATGCTCTCAAAGAAGCCGAG GAGCTAAGGGAAAGTCGAAAAGAGGCATCAAGCAGCATGCACACTCCTCAATTCTTCTCC GAGTTCACTTTCTCAGAGATCAAGGAAGCAACTCGTAATTTTGATCCATCTCTGAAGATT GGGGAAGGAGGATATGGGAGCATATATAAAGGACTTCTATGCCACACGCAGGTGGCCATA AAGATGTTGAACTCTCATAGCTTGCAAGGCCCATCAGAATTTCAACAGGAGGTTGACGTT TTGAGTAAACTCCGGCACCCGAATCTTGTAATGCTTATTGGTGCCTGTCCAGAAGTGTGG ACACTCGTCTATGAGTATCTACCCAATGGAAGCCTTGAAGACAGGCTCAGCTGCAAGGAC AATTCTCCTCCTTTATCCTGGCAAACTCGAATACGCATTGCCACTGAGTTATGCTCTGTC CTTATCTTTCTCCATTCTTGTAAACCTCACAGCATCGTCCACGGTGATCTAAAACCTGCC AATCTTCTCCTTGATGCTAACTTTGTTAGCAAACTAAGTGACTTTGGAATCTGTCGTTTA CTTTCTCAAAACGATCTTTCTAGCGACAACACGTCACTTTGTTGCAGAACGGACCCTAAA GGCACTTTTGCGTACATGGATCCTGAGTTTCTTGCGACAGGAGAACTTACACCGAAGTCA GATGTGTATTCATTTGGGATTATTTTATTGCGTTTGTTGACTGGGAGACCTGCTTTGGGA ATAACGAAGGAAGTGAAATATGCATTAGATACAGGAAGATTGAATACCCTTTTGGATCCT TTGGCTGGAGACTGGCCATTTGTCCAAGCTGAGCAGTTGGCTAACTTGGCATTGAGGTGT TGTGAGATGAACCGAAGGAGCAGACCAGACCTTGGAACAGATGTCTGGAGGGTACTTGAA CCAATGAGGGCTTCTTGTGGAGGTTCAACAGCATTCCGACTGGGCTCTGAAGAGCGCTGC CGACCCCCTTCGTATTTTATCTGTCCCATATTCCAGGAAGTCATGCAAGACCCGCATGTA GCAGCAGACGGATATACTTACGAAGGAGAGGCTTTGAGAGGATGGTTGGATAGCGGCCAT GACACTTCACCCATGACCAACCTTGCGCTTGCACACAAAAATCTTGTCCCCAACCTTGCA CTTCGGGATATCCAGAAGAACAAGTTGACTCTTTCATGGGCTTTGAACCATTTCCACGAC AAGAAATTTTGCATTCTTCATGTTCATCTCCCCAAAGTGTATGCAGAGAAGCTACATGTT GAGATGGAAGATATCGGAGAAGGGATTGTGGAACTCGTGTATCAGCACTCTATTAAGAAG CTTGTTATTGGAGCGGCAGCGGACAAGCATTATTCAGAGGATAATCAACTTTTTAATCAG CTTGAACAGGCTGTAGCAGAGATTGAAAATTTGAAAAGAGAAGCATTTGAAGAATCAATG AGGCGAGTGAAAGCCGAAAAAACTGCTATTGAGGCCGCTCGTAAGGCTGCAGCATTAGAA GGGTCATATATTGAGGAGTTGAGACAGCGGAAGGAAATTGAGGACACATTTGCGAAGGAG AAAGCAAACTTTGAAAATGCGAAAAAGAAATGGGAAGAAGAGCGGATAATTGCCATGGAT CAGAAAGTTTTACTGGAAAGTCAAGTTTCCAGCTATGAATATAGGGTGAACGAGTTGGAT GCTAAAAGACAATCAGCTGTGGAACAGTCACAAACTTATGAGAAAGAGCGAAATGAATTC CGGGTAGAGCCCCACAATGCACCCAGTGTAACTGAAGATCTTTTGACAAAACAGTTCGAA CCTTCCTCAAGCATAAATACACAACAATTTTGCTCTGTGTTCTCTTTGCCCGAGATTCAT GAAGCAACTTCTTTTTTTGATCCATCTTTGAAGGTTTCGGAACGAGGATGTGGTGATATT TACAAAGGTTTACTTCGTCACACACCAGTGGCCATAAAGGTGCTGGATCCAGATAGTTTT CGAGGCACCTCATTATTTCAAGAAGAGGTTGATGTTTTGAGTAAGTGTAGACATCCAAAC CTCATCACTCTAATGGGAGTCTGCCCAGAAGCTTTTGGTCTTGTTTATGAATATCTTCCC AATGGAAGCCTTGAAGACCGACTCAGCTGCAAGGACAACACTCCTCCATTGTCATGGCAA ACTCGGATATGCATAGCTACAGACATATGCTCTGCCCTTATGTTTCTTCATTCCAGCAGC ATAGTCCATAGAGACTTAAAAGCTGAAAATATTTTCCTTGATACTGGTTTTGTATGCAAA CTCAGTGGCTTTGGTGTCGGTAACCATCCTCAATTTCTTCAAACGGGAGAATTATCTCCC CAATCAGACATTTACTCGTTTGGAATTATAATTATACAATTGTTGACTGGGAGATCACCC TTGGGTATAGTGGATGAAATGCCAGAAATACTAGATATGGGAAATCTGGCAGCTTGGTTG GATTCCTCAGCTGGAGAGTGGCCATTTGTGCAAGCAACACAATTGGCTCACTTGGCTTTG AGGTGCTGTGACAATGATCCAGGCCAACGTCCAGACCTTGTATCGGAGATATGGAGAGTT CTTAAACCAATGAGAGCTTCCTGTGGAGCCTCATCATCATTTCGGATGGGTTCTGAAGAG CATAATCAGGCTCCATCATATTTTATTTGTCCCATCGTACAGGAAGTGATGCAAAATCCA ATTGTGGCAGCAGATGGTTATACATATGAAGCAGAGGCTTTAAGAGGATGGCTGGATAGT GGACATTACACCTCTCCCATGACAAACCTCCCGCTTTCACATAACAATCTTGTCCCCAAC CATGCCCTTCGTTCTGCAATTCAAGAATGGTTGCAACACCACTGA
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>LITCHI025720.m1 MAVVSHVPSIPQQVDPIRFAGFGLPGIMSTRKEIVEQPVARVIEDKIYVAVGLKKSKSVL LWALQNSGGKRICIISVYQPAQMIPVMGTKFPASSLEPEEVRAYRELERQDMQKVLDKYL AICRHMGVQAEKQYIEMESIEKGILELISQCGITKLVMGAAADKYYTRRMTDIKSKKAIS VRLQAPASCHISFVCKGNLIYTRGVDSDGAHIEVLSPLQQASQNTETGHVNRMRSQSLTL GPNNHVKLTNPVQNFFQRVRSGNFDRNGKGVKALNSPDSTGEPSTPQSSSDESDGLSTRS PSPGSVLSSCSSTGGVEVTPISIINTEGIKNGLESGTLPQSNEDLNHLSPPSVLDVSIDD TLYDQLAQAMAEAQNSRREAYEEASRRGKAEKDAIDSIRKAKASESLYAEELKRRKEIEE ALAKEKEELEEIKKQHNEVMGRLRSAIDQKSSLEIQIAESDEMVKELEQKIISAVDLLQN YKKERDELEMERDHALKEAEELRESRKEASSSMHTPQFFSEFTFSEIKEATRNFDPSLKI GEGGYGSIYKGLLCHTQVAIKMLNSHSLQGPSEFQQEVDVLSKLRHPNLVMLIGACPEVW TLVYEYLPNGSLEDRLSCKDNSPPLSWQTRIRIATELCSVLIFLHSCKPHSIVHGDLKPA NLLLDANFVSKLSDFGICRLLSQNDLSSDNTSLCCRTDPKGTFAYMDPEFLATGELTPKS DVYSFGIILLRLLTGRPALGITKEVKYALDTGRLNTLLDPLAGDWPFVQAEQLANLALRC CEMNRRSRPDLGTDVWRVLEPMRASCGGSTAFRLGSEERCRPPSYFICPIFQEVMQDPHV AADGYTYEGEALRGWLDSGHDTSPMTNLALAHKNLVPNLALRDIQKNKLTLSWALNHFHD KKFCILHVHLPKVYAEKLHVEMEDIGEGIVELVYQHSIKKLVIGAAADKHYSEDNQLFNQ LEQAVAEIENLKREAFEESMRRVKAEKTAIEAARKAAALEGSYIEELRQRKEIEDTFAKE KANFENAKKKWEEERIIAMDQKVLLESQVSSYEYRVNELDAKRQSAVEQSQTYEKERNEF RVEPHNAPSVTEDLLTKQFEPSSSINTQQFCSVFSLPEIHEATSFFDPSLKVSERGCGDI YKGLLRHTPVAIKVLDPDSFRGTSLFQEEVDVLSKCRHPNLITLMGVCPEAFGLVYEYLP NGSLEDRLSCKDNTPPLSWQTRICIATDICSALMFLHSSSIVHRDLKAENIFLDTGFVCK LSGFGVGNHPQFLQTGELSPQSDIYSFGIIIIQLLTGRSPLGIVDEMPEILDMGNLAAWL DSSAGEWPFVQATQLAHLALRCCDNDPGQRPDLVSEIWRVLKPMRASCGASSSFRMGSEE HNQAPSYFICPIVQEVMQNPIVAADGYTYEAEALRGWLDSGHYTSPMTNLPLSHNNLVPN HALRSAIQEWLQHH.
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>LITCHI025720.m1 GGAGCCCATTGGTAATTTAATAGAAGCTTCGCGTCGAAGCAATTAGGATAGACCATTACT CTCCTCTCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACGAAGACTGGTCGACTCTGTCTATGGAG ATTAGATAGACGGAGTCCAAGCTGTATTTTGTTGGAAGTTACTTCACTACGCTTTCACGT TGCAGTCTTTCAATTTCCTTCCAATTGTATAATATTTTCGTTTTACCATAAGACAGCCAA TACCTATGACCCCACCACATACCATCCCCACAACAAAAAATCTCTCCTCTCTTTCAAATC CTAAACATTATCGGATTTGGTTGAATCCTGATGAGCTTTTTCAAATATTGAGTTTGTTTA ATTTTTTACTATTATTGTCTTATGAATGGCTGTGGTGAGTCATGTGCCGTCAATTCCACA ACAGGTCGACCCAATAAGGTTTGCCGGCTTCGGGTTGCCGGGAATTATGTCCACCAGAAA AGAGATAGTGGAGCAACCCGTGGCGCGTGTGATTGAAGACAAGATATATGTTGCTGTTGG ATTAAAAAAGAGCAAATCTGTTCTGTTATGGGCATTGCAGAACTCTGGAGGGAAGCGAAT TTGTATAATTTCTGTCTACCAACCCGCGCAAATGATTCCAGTTATGGGTACTAAGTTTCC GGCTAGTTCGCTTGAACCGGAGGAAGTTAGAGCATACAGGGAGCTGGAAAGGCAAGATAT GCAGAAGGTGCTGGATAAGTACCTTGCTATTTGTCGACACATGGGGGTACAGGCGGAGAA ACAATACATTGAGATGGAATCTATTGAGAAGGGGATTTTGGAGTTGATTTCACAATGTGG GATCACGAAGCTTGTTATGGGAGCAGCAGCGGATAAGTACTATACAAGGAGAATGACGGA CATCAAGTCAAAGAAGGCTATTTCGGTGCGGTTACAAGCACCTGCTTCATGTCACATATC 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>LITCHI025720.m1 + Up_Stream_Len 2000 TATTGACTATATCTGTATAATACAGTAACATGTCCTAAACACTACGGACATTTTGTTTTG GAGATTTTAGTTTATTCCATTAGTACTGAAAACAGTGATGATAGAAAACAAATCACTACC AAATGGTGCTGCTCAGTGCTGGTCTCGACATTTTAGGGGTCAATGCAAAAAACTAAAGTG AGCCCTTATATATATATTATTTTATCACATTTTAATATGTAAATAATAATTTCATCAAGG AAAAAATATAATATCACATGACAAATATATTCATATAAGACAAATAGATTTATATAATGA TAAAAAAAAATTCATCACAACTCACAAACAAAATTTATCTATACAAAATTTTGGAATTCC ACTTTCTTCACTTTAAATTGTTGATGAAATTTATAAATTTTAACCAATAAAAACAAAAAA AAAAAACCAATAATTTAGAGTTCAATTTTGTGTGACTACTAACAATGTAAAGAGAAAAAT AATTTAGGATTGAAAATGATGGAATGAGTTTGTTATATATGGGTGGAATGTGTCAGCTTT GAGACTCTTTATATGTTAGAAATATATTTTGAGTTAAATTGAGTCAATAAAAATTAGCTG GCATGGTGGGTTAACAACTGCATGAACGTGTTTCAATGTCTAAGGTTCAAATATTAGTGG TAAAAGGAAAAAAATATAATAACACTGATGATTATCATGTGAAACATAAAATATATATTG ACTTTACAAATTAACTATAGAAAAAAAATGGAAATTTGTAAAATTCGAGATCCAAAATTC GAAAGTTCGGGACAACCGCACCTTCCATAGGTGCTCAGATATTACTGTAGCAATTGGCCT TGAAACCGGCTCTATTTTCGTACTATTATACGCCTTTATACGCATAGCTACACTAACCGA CGACAAGGGACGGTGAAAACAATGATAAGTGAATCCACTGAACGGTAAGATCAAGTCAAA TTATGTTTTTTATGACGGTCATGTAGAGACTAGAGAGGGATCAAAAGCGTCTAAAGTAGG TGTATTCTCTGCTGTTTGGCCCTACCCACTCCGTACAAGCTTTCACAAAATCCCCAACAG CATGTAACCATCAATCCCCATATTCATTGAATGTAAACAATGTATAAAGTAATCCATAGT CAACTCTTCTTAACCTTTATGGCGGTTCTTTTAATATAAAATCCCCTCTTTTAGTTGACG TATCCGTTCATGGTACACCTCTCGTTGTTTAGTGAGTTTGATTTGAGTTCGGCTCCACTC TAAACCCGTAACATATGAGATAATTTTTTGTGTTTGATCTAGTAAGTTTAGGAATATCAT CATGATTTGAAGTTAAATTTTATATAACAAAAAAGGAAGATTGTATTGTTACACTAACTT TAAACTATAATATTTAATGTCAACTAATTAAATTCGAATTTAAAAGTTATATATACTTTA AAAAGTTTGTTAATTTGCATCACTGGTGAAAAAGGTAATGAGCAGGAAAAAAAAGTTTTA ATTTTAGTAAATAGTAATAATATTAACAAAGTAAGTAGAGGGCTTTTAAGACAGCTCATC ATGGAAAATGACTTGGTAGAAAAACGGGAAGATAATTGAAGACAAACAAGTAAGTGGAGC CCATTGGTAATTTAATAGAAGCTTCGCGTCGAAGCAATTAGGATAGACCATTACTCTCCT CTCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACGAAGACTGGTCGACTCTGTCTATGGAGATTAG ATAGACGGAGTCCAAGCTGTATTTTGTTGGAAGTTACTTCACTACGCTTTCACGTTGCAG TCTTTCAATTTCCTTCCAATTGTATAATATTTTCGTTTTACCATAAGACAGCCAATACCT ATGACCCCACCACATACCATCCCCACAACAAAAAATCTCTCCTCTCTTTCAAATCCTAAA CATTATCGGATTTGGTTGAATCCTGATGAGCTTTTTCAAATATTGAGTTTGTTTAATTTT TTACTATTATTGTCTTATGA
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