Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI025705Chr334314573433814+LIM domain-containing protein PLIM2b

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI025705.m11065PF00412.25LIMDomain45.85.90E-12
LITCHI025705.m1105160PF00412.25LIMDomain43.43.10E-11
Download   Copy
>LITCHI025705.m1
ATGGCATTCACTGGAACTCTGGACAAGTGCAAGGCTTGTGATAAGACTGTTTATGTGGTA
GATATGTTATCTCTTGAGGGAATGCCTTACCATAAATCGTGCTTCAAATGCAGTCACTGC
AAAGGGACTCTTGTGATGAGCAACTATTCCTCCATGGATGGAGTCCTTTACTGCAAGCAT
CATTTTGAGCAACTTTTCAAGGAATCTGGCAATTTCAGCAAGAATTTCCAAACCTCCAAG
TCCGAGAAGCAATCTGAATTGTCCAGGACTCCAAGCAAAGTCTCTTCCATGTTCAGTGGA
ACTCAAGACAAATGTGCAGCTTGTGACAAGACAGTGTATCCTCTAGAAAAGGTGACCATG
GAAGGTGAATGTTTCCACAAAACATGCTTCAGGTGTGCCCATGGAGGGTGTCCTCTGACA
CACTCATCTTATGCTGCTCTTGATGGGGTTCTCTACTGTAAGCACCACTTTGCTCAGCTG
TTCATGGAGAAAGGAAACTACAGTCATGTCCTCCAGGCTGCTTCTCACAAGAGAACTGCT
TCCACTTCATCCACTCCACCACCTGAGCCAGCTGATGGCAACCCTGATGATGAGCCCCCG
AATACGACCCAAGACCAGACACAGGACCAATCCTAA
Download   Copy
>LITCHI018807.m1
MGSFPGTCEIVEAGEEVNSFQHSRRTYRPNSGSGMADKDRKLPKLKLGYKDSLEDDINQL
FESVSLRNSFKSLGPLHEASTSSSPLRKNALKKPISVPHSPRVGVSESISLKQAFRELSI
SKASEMAAMKRLAKPTGSPGALEAIRIKSLYNAKVIDPASGSGQFVDEGKGSMVEISLVP
EESPSTSSVKMPQAPQMPKIKSANPNSHSPQFTIPTVQNATRTNHASHSSTQLAVPTVQN
ATATDQSSHSSPCFDVPAMLNSRGANRGAHTQTTVPTTQNVVGTSQSIHSSPPSAVSNQS
GSKNTLMHDEIVRMTKEVEALAIKTELAQKEKDVPAPSPSSNPTDIPELGKNSHAVTRSA
SRAAAFKSGRKARLHIVPSSGSVNGGRVSKLTRNTPRIAKPVLRNKNSLKKKIKQDSPSA
VSSSNTYNDVRSNLGPSTTQLVCQRCRCALKNATNLSNQDSPKSSIIGVSVDVSSVNVNS
CTDGPDYSDNSCNRSQAAVTKAKKNPKSSEKGEFSQSSKSSLGEYSSSTSNSDDSNLSGS
SCGNRPHMSKDVRWEAIRHVRMRHGALGLRHFNLLQKLGCGDIGTVYLAELIGTNCLFAI
KVMDNDFLARRKKMPRAQTEREILRMLDHPFLPTLYAQFTADNLSCLVMEYCPGGDLHVL
RQKQLGRCFPEPAARFYVAEVLLALEYLHMLGVIYRDLKPENILVREDGHIMLTDFDLSL
RCSVSPTLLKLSSSNLDPARLSGPCTESNCIQPFCIEPTCQVPCFSPRFLPANAKTRKSK
ADPVAQLRSLPLLVAEPTDARSNSFVGTHEYLAPEIIKGEGHGAAVDWWTFGVFLYELLY
GRTPFKGSGNEETLTNVVLQNLRFPDSPLVSFQARDLISGLLVKEPEHRLGSEKGAAEIK
QHPFFEGLNWALIRCAIPPELPEFYDFGVPEVASQQSPKYLECKATGEHLEFELF.
Download   Copy
>LITCHI018807.m1
ATGGGTTCATTTCCCGGTACTTGTGAAATTGTGGAAGCAGGGGAAGAGGTGAATTCATTT
CAACATTCTCGAAGAACTTACCGGCCAAATTCCGGGTCAGGTATGGCTGACAAGGATCGC
AAGCTTCCTAAGCTGAAGTTGGGATACAAGGATTCTCTAGAAGATGATATCAATCAGCTT
TTTGAATCTGTAAGTCTTAGAAATTCATTCAAAAGTCTGGGACCTTTGCATGAAGCTAGC
ACCAGTTCAAGCCCATTAAGAAAAAATGCTTTGAAAAAGCCTATCAGCGTGCCCCATTCA
CCACGTGTTGGAGTTTCTGAGTCAATCTCTCTGAAGCAGGCATTCAGGGAACTTTCTATC
AGTAAGGCATCAGAAATGGCTGCTATGAAACGATTAGCAAAGCCGACAGGTTCTCCAGGG
GCTTTGGAAGCTATTAGGATAAAGAGTTTATACAATGCAAAGGTGATTGATCCTGCTAGT
GGATCTGGCCAGTTTGTAGATGAAGGTAAAGGGAGTATGGTTGAAATATCTCTGGTGCCG
GAAGAAAGCCCATCAACTTCTTCTGTAAAGATGCCCCAAGCGCCTCAAATGCCAAAAATA
AAATCAGCAAACCCAAACTCTCATTCTCCTCAATTTACCATTCCAACAGTGCAAAATGCT
ACAAGAACCAACCATGCCTCCCATTCATCTACTCAATTAGCCGTCCCAACAGTGCAAAAT
GCTACTGCAACCGACCAAAGTTCTCATTCTTCTCCTTGTTTTGATGTTCCTGCCATGCTT
AATTCTAGGGGAGCCAACCGAGGTGCTCATACTCAGACCACTGTACCAACAACACAAAAT
GTTGTTGGAACCAGCCAAAGTATTCATTCTTCTCCTCCATCAGCTGTTTCAAACCAAAGT
GGTTCTAAGAACACATTGATGCATGATGAAATTGTTCGAATGACAAAAGAGGTAGAAGCT
CTTGCAATAAAAACAGAGCTGGCACAAAAGGAGAAGGATGTACCTGCACCTTCACCATCT
TCAAATCCTACTGACATACCAGAATTGGGGAAAAATTCTCATGCTGTGACCAGATCAGCA
AGCAGAGCAGCAGCTTTTAAGTCAGGACGGAAAGCCAGGTTGCATATAGTACCTTCTTCT
GGTTCAGTCAATGGCGGCAGGGTAAGCAAGCTAACTAGAAATACCCCACGTATTGCCAAA
CCAGTCCTCAGGAACAAGAATTCTTTGAAGAAGAAAATAAAACAGGATTCACCTTCTGCT
GTCAGTTCTTCTAATACATACAATGACGTTCGAAGCAATTTGGGCCCTAGTACCACTCAG
CTGGTTTGCCAGAGATGCCGCTGTGCTTTGAAGAATGCAACTAATTTATCAAATCAGGAT
TCACCAAAGTCTAGCATTATTGGTGTTAGTGTTGACGTTAGCTCTGTAAATGTGAATTCT
TGTACAGATGGACCGGACTATAGTGACAATAGCTGTAACAGAAGCCAAGCTGCTGTTACA
AAAGCGAAAAAGAACCCAAAATCAAGTGAAAAGGGGGAATTTTCCCAAAGCTCAAAAAGT
AGCCTTGGTGAATATAGTAGTAGTACAAGTAACAGTGATGACAGTAATTTGAGTGGGTCT
AGTTGTGGCAACAGGCCTCACATGTCAAAGGATGTGAGATGGGAAGCTATCCGGCATGTT
AGGATGCGGCATGGAGCCTTGGGGTTGAGACATTTTAATCTTTTGCAAAAGCTTGGTTGT
GGAGATATAGGAACTGTGTATCTTGCTGAGCTGATTGGCACCAATTGCCTCTTTGCTATA
AAGGTCATGGACAATGATTTTTTGGCAAGAAGGAAGAAGATGCCAAGGGCGCAAACTGAA
AGAGAGATACTGAGAATGCTAGATCATCCTTTCCTCCCTACATTATATGCCCAATTCACG
GCAGATAACTTATCATGTTTGGTTATGGAGTATTGTCCTGGTGGAGACCTGCATGTCCTT
CGGCAGAAGCAGCTCGGCAGGTGTTTCCCTGAACCAGCTGCAAGGTTCTATGTTGCTGAA
GTCCTCCTTGCCTTGGAGTACTTGCACATGCTTGGGGTTATTTACCGGGATCTGAAACCA
GAAAACATTCTTGTTCGAGAAGACGGCCACATTATGCTGACAGATTTTGACCTGTCCCTA
AGATGTTCTGTAAGTCCAACTCTGCTGAAATTGTCTTCATCCAATCTAGATCCCGCAAGG
CTATCTGGTCCATGCACGGAATCTAACTGCATTCAGCCTTTCTGTATTGAACCCACCTGT
CAAGTTCCATGCTTCAGTCCTAGGTTTTTACCTGCCAATGCAAAAACAAGGAAATCAAAA
GCTGACCCTGTAGCCCAGTTAAGATCATTGCCACTGCTCGTGGCTGAGCCGACTGATGCA
CGATCCAATTCATTTGTTGGGACGCATGAATACTTGGCTCCTGAGATTATCAAAGGTGAG
GGTCATGGAGCTGCAGTTGATTGGTGGACTTTTGGAGTCTTCCTCTACGAACTTCTATAT
GGAAGAACACCGTTTAAAGGATCTGGGAATGAAGAAACATTAACCAATGTGGTACTGCAA
AACCTAAGGTTCCCAGATAGCCCTCTTGTTAGTTTTCAGGCGAGGGATCTCATCAGTGGT
CTGTTGGTGAAAGAGCCTGAGCATCGATTAGGATCGGAGAAAGGGGCTGCTGAGATCAAG
CAGCATCCATTTTTTGAGGGGTTGAATTGGGCACTTATACGGTGTGCCATTCCACCAGAG
CTACCTGAGTTCTATGATTTTGGAGTTCCAGAAGTGGCGTCTCAACAAAGCCCCAAGTAT
TTGGAGTGTAAAGCCACAGGAGAACACCTTGAGTTTGAGTTGTTTTAGCGGAAAACGTCT
ATTTTTAAGTAACTGGGGGCTGCGTTTGTCTCCCAGCTGTTGTAATTGTACGTAGCCACT
AGTCTGTAGTGTATATCTGATTAAGAATGTTTTAGCAAATCTCAAAGCTATCACCAGAAT
TTTGCAATGTCAGACATCAAAATCCCCTGTTTAGCAATTACTCACTCATATATTTCAACG
TGGATTGGAGCTACAATTGCTCCTAATAATTGACATTTTGAGATCATTCATCAGAGGAAA
AATATATTTATTTGAGTTTAAAATTTGATGATAAATTAGAAAACGTATTCTAAATTCTTC
TTGGCTTAAAATTCGGTAATGAACTAGGTACAAAAGTAAATCAATAA
Download   Copy
>LITCHI018807.m1 -  Up_Stream_Len 2000
TTAAATTATAAATACTATTTTTTTTTAAAGTTGATCATGATGAATTATTTATTTATTTTT
AAAATTAATATATATTGATGTAAAATTATGCATAAATCAAATTTATTTATATAATCTAGT
ATGCGAATTTCATAATTAATAGATATCCATTATAAGATAACAAATAAACTCTGATATAAT
AATAAGATATTTACTTTTATAATAATATATCAAAGCTTATAATTTAAAGTATATACAGTT
CTAAAATTATAATAATATTATATTATGCATTATAATTTATAAGTGTATTTCAGGTTTTTT
TTTTTTTTGTGAAGTGGTATTCCCTTTTTTTTTTTTTTGAAAACAGGGTTGTTAAAAAGA
TAACAATGTCACTTCAAAAATAAAAAACATAAAAATGTTTACGTAAACCTTTTTTATGAA
ATGACTGATGCTCACGTTTTGTTAAAAATTATATGGATGTCGTTTTCTGGTGATTAATTA
TTCTATCACAAACAATCTCACTCCTTGCCATATTAAATTTAATTTAATTTGTATGGGGCG
AAACGTAATTTAGAAAAAAGTTGCCGACACGTCGATTGTCTATGTGAGACCCACAACATA
TACCGTGGGCCCTCCATCTTCAAAATAATCAGAGCCAGGATGGAAAAAAGAGAAACACTG
TGTTTCTTTGTAATCTTCCTCTTTCTCTTTCTCTCTCAATTCTCCAACACGTTTTCTCTC
TCTTAAAATTCTAGGGTTTTTCAATGCTGAATCTGATTCATTACACTTTTCCCGTCCCGC
AAATCTGCCCTCTACCTGCCTCAGGTAATCTCTGTTTCCGATCTCATTTCACTTTCTGCA
CTTTATGTATTTCTGCCATTTTATGCTTTACCACTCTCTTGCACGCATTTGTCTATAACT
TTGCATATCTTTGCCGGGATTTGGATGCTCTATTTTGGGTTCATGTCATTTTTTGCTACT
TTTGTCTCATTTATCTAAAGTTTTTATTTTATTTTATTTTTTATTTTTGGTTTGTGATTT
GAAGTGATGGAGATGTTTTGTTAGTTTTTTTCAATTATTGTATACTTGCGGCTGGCTTGA
TAAATCAGTAATTTTTTTTTTTTTTGTTTAGTGAGATTAATCATGGTTTAGGTCCAACTT
AGACAAAAGATACCAGTTAGGTTCTGGTAAACATCTTCTTATGTTGCACTATTTTTTATT
AAGAAAGGTGTGTATGTGGTTAGGTTTGTTCACCAAAGTTGCTGTTTTTGTTATATTTGA
ATCTGGAGGCTTGAGTCAAAGAAATAGTTGGTGGTGCTGTGAGTTTATAGTGCCCTCTGG
GACATGTTGATATTGTGCTGGGGTTAATTGGAGATTGGGATTTAAAATCTGTAATGTTGT
TTCTACTAAAGATCACTCTTATTCTCGTGTTTTTCATGTGACGGTTTATGTTAAGATTAA
TTAGATTCAAGACGTGCGGTAAAGATTGTTGCAATGTGTCACGCTGTTATTTATTGTTGG
ACACTTGTGAGCGTACGGTTTGAGACATTCGAGCACATGCACGATCGAGTGATGGATAGA
ATTTGCTGTACGTGTGCGTGGGATTCTGGAAGTGCTGACGTGTAATGCTGGCGAATATAA
CATTTAACATTTTGAAGGCATTCTATTGCTTGCAACGTTCTCGAGACTGTCCTGCGCTGA
ACATCATCAATGAATCAAATTTGACTTGCATTTAACAGTTTTTTCATTAATGTTACTGAT
GCTCTTGAATCTTTGCAATCATGTCAGGTTCAGGTGTTGCGATTTTGGTGTGCATGAACA
GACTTGACGGACATTAGGAGCTTTGGAGTTTCTATAATCATAGGAGATCTTGAGAACATG
TGTCCTCCACTCAGATATCTGAAATCTGTAAATATGAATTTTCCAAAAAATGGATTAGTT
TAAACTGGCACTGCATATCCAACAGTTTCTCCTGTTCTACATCTTAGTGAATTCAGCAGC
GTGTGTGACTAATTGCAGTA
Download   Copy
>LITCHI001091.m1 GenomeSequence - 
GTACTTACTAGTATGCTCCAGATTTGTCTCAAATGAAATTACAAAATATTGTGCAATTAA
TTATTCAACTTGCACCTTCTCATCACTTTACACCAGGGACCACCAAACACCACTCTCTTT
CTCCGAACCACCCTTCCATCATCAATTCACTATCATCCACACCATATAACACCCTACTGA
CCTCTGTCTTCCTCCAAAACTCAACAATGGTTGAGGCGTAATCGAATCGTTCGCGGACCT
CCCTTTGTAAAGTTTTTTTCTTCACCTCCAAAACTCAGCAATTCGAATCCCAATCACCAC
CAACAACAGGTCCCTCCTCCTCCTCCACCTACGCCTATGCCTCCTTCACCTGAGTTTGAT
GCTGAGAATTCGGCGGAGCTTGGGTCCGGTGCTGGCAGCGATAAGCCTGCCAGGAGGTCC
AGGACGATGACAATTCCGAGGGTTAGATGGACTTCACAGCTGCATAAGAGGTTTGTTGAT
GCGGTAGCTCATTTGGGCATCAAGAATGCTGCTCCCAAGGCCATATGGCAACTGATGAGA
GTTCCTGAATTGACTATAGCTCATGTTAAAAGTCATTTGCAGATGTACCGTTCTGTGAAG
ATACAGCAACGGTTGTCTGGTGGAGCTGCTGGTGGTGGTGGTGATGACGACAACAATGGT
GGTGGTGATCATGACGATGGCAACAATGGCAGTGGTGGTGGGAAAAATGGGAAGAAAGAC
GGCGATGATGGTAGTGGTAATGGCAATAATGATAAAGGGGAAGGCAGCGGTAGTGGTAGT
GGCAACAATGGGAACTTGACGCGAAAACAAATGAAACCTATGTTTGGTTGCAAATTCGGG
TATCATGCTGGAAATGAAAATTGGTGTCCAGTTGGACAATTGCAATGCGTTAAAAGGGTT
AAGTATTGTATTGACAATCCGAGTAGTTATTCCATCGTGCAGTTGACGGGGTTAGTCTAG
GAATAGATTTAGTGGTTAAATTGTAAGTTTATATCATGATTAATGGAGAGAAAGTTGTTA
ATCATGAAAGTGGATGAATTACAATTATGATTAGAGAATTGGAGTATTTGATTCATTGGT
TTGGGTGTAGGAATATGCTAAATTGTATCTTGAATGACTTCATTGTCAACTTATGTTTTT
AATTTATGAATTTTTTTGCTTATTTTTAATTCGTCACCTCCAAGGCTGTGTTTTGCTTTT
GTAGTGTGCCTAATGCTACTTTCACTTTTATAGTGCGTTCAATTTATAATGGTGCGTTGT
TGTTCGCATTTTTTATTATTATGGTTACATTGTAAACAACCGGTAGTTATGTAAAAGTAA
ATTTTCTTAGAATAGAGAAACTTCATTTGGAGTTTGAATTATTTCTCCCCTTCTTAATTT
TTAAAGTTAAGATAGTTAAAAAAAGAAAAAAGATGAAAAGGTAATATTATATTTG