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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI025642 | Chr3 | 3072890 | 3083313 | + | Shaggy-related protein kinase theta |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI025642.m1 | 139 | 423 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 222 | 9.30E-66 |
| LITCHI025642.m1 | 142 | 343 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 91.5 | 5.60E-26 |
| LITCHI025642.m2 | 139 | 416 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 212.1 | 9.80E-63 |
| LITCHI025642.m2 | 142 | 343 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 91.9 | 4.30E-26 |
| LITCHI025642.m3 | 3 | 284 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 222.6 | 6.20E-66 |
| LITCHI025642.m3 | 3 | 204 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 92.8 | 2.30E-26 |
| LITCHI025642.m4 | 139 | 337 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 182 | 1.40E-53 |
| LITCHI025642.m4 | 142 | 335 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 90.2 | 1.40E-25 |
| LITCHI025642.m5 | 84 | 368 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 222.5 | 6.40E-66 |
| LITCHI025642.m5 | 87 | 288 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 92 | 4.00E-26 |
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>LITCHI025642.m1 ATGAATGTGATGCGTCGACTTAAAAGCATTGCTTCTGGTCGCACTTCTATTTCCTCGGAT CCTGGTTGCGATTTAGGCATAAAGAGGGCGAAAGTTGACAAAGAAACAGAGGTAAATGAA GGAGTGGGTTCAGTTGGGAGAACTGCTACCAGTTTAGAGCAGCATATGGCTTCCACTTCG CTAGAGCCTGTTGCAAGCACATCTGATGTATCTGCAAATGCTAGAACGGAAAGTTCTGGT TATGATCAGCTGCCTAAAGAAATGAATGAGATGAGAATTAGAGATGATAAAACTGTGAAC ACTGATGATAAGGATGTGGAACCCTCTTTTGTGAAAGGTAATGGAACAGAAGCAGGTCAG ATAATTGCAACTACAGTAGGTGGTCGAAATGGACAGCCAAAACAGACAATCTCTTATATG GCAGAGCGTGTGGTTGGTACTGGTTCCTTCGGTGTTGTCTTTCAGGCTAAGTGTCTGGAA ACGGGGGATTCAGTTGCAATAAAAAAGGTCCTGCAAGATAAGAGATACAAAAATAGGGAA CTTCAGATAATGCGTGTACTTGATCATCCTAATGTTGTTCGACTGAAGCACTGCTTTTTT TCTACAACTGACAAAGATGAGCTGTATTTAAACCTTGTCTTGGAGTATATATCTGAAACT GTCTACCGAGTTTCAAAGCACTATAGCAGAATGAACCAACATATGCCTATGATTTATGTG CAGCTGTATACATACCAGATTTGTCGTGCACTGAATTACATGCATCATGTTGTTGGGGTG TGCCATCGTGACATTAAGCCTCAGAACTTACTGGTCAATCCCCACACTCACCAGCTAAAG ATATGTGATTTTGGAAGTGCAAAGATGCTGATGCCAGGTGAACCCAACATATCATATATA TGCTCAAGATACTACAGAGCCCCAGAACTCATATTTGGGGCTACGGAGTACACCACTGCT ATTGATATGTGGTCAGTTGGTTGTGTCATGGCTGAACTTCTACTTGGACAGCCTCTGTTT CCTGGGGAAAGTGGAGTTGATCAGTTGGTAGAAATCATTAAGATTCTGGGGACCCCAACG AGAGAAGAAATTAAGTGCATGAACCCAAATTACACCGAATTTAAATTTCCTCAGATTAAA GCTCATCCATGGCACAAGATATTTCACAAGCGAATGCCCCCTGAAGCAGTGGATCTTGTC TCAAGATTGCTGCAGTATTCACCAAACCTGCGATGTACCGCTTTGGAGGCATGTGCGCAT CCCTTCTTTGATGATTTGAGAGACCCAAATGTATCATTGCCTAATGGGCGATCTCTTCCT TCTCTTTTGAATTTCACAGCTCAAGAATTAGCTGGTGCATCTGCTGAACTGCGTCAGCGT CTCATTCCGGAGCATGCAAGGATATGA >LITCHI025642.m2 ATGAATGTGATGCGTCGACTTAAAAGCATTGCTTCTGGTCGCACTTCTATTTCCTCGGAT CCTGGTTGCGATTTAGGCATAAAGAGGGCGAAAGTTGACAAAGAAACAGAGGTAAATGAA GGAGTGGGTTCAGTTGGGAGAACTGCTACCAGTTTAGAGCAGCATATGGCTTCCACTTCG CTAGAGCCTGTTGCAAGCACATCTGATGTATCTGCAAATGCTAGAACGGAAAGTTCTGGT TATGATCAGCTGCCTAAAGAAATGAATGAGATGAGAATTAGAGATGATAAAACTGTGAAC ACTGATGATAAGGATGTGGAACCCTCTTTTGTGAAAGGTAATGGAACAGAAGCAGGTCAG ATAATTGCAACTACAGTAGGTGGTCGAAATGGACAGCCAAAACAGACAATCTCTTATATG GCAGAGCGTGTGGTTGGTACTGGTTCCTTCGGTGTTGTCTTTCAGGCTAAGTGTCTGGAA 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CTGGGGACCCCAACGAGAGAAGAAATTAAGTGCATGAACCCAAATTACACCGAATTTAAA TTTCCTCAGATTAAAGCTCATCCATGGCACAAGATATTTCACAAGCGAATGCCCCCTGAA GCAGTGGATCTTGTCTCAAGATTGCTGCAGTATTCACCAAACCTGCGATGTACCGCTTTG GAGGCATGTGCGCATCCCTTCTTTGATGATTTGAGAGACCCAAATGTATCATTGCCTAAT GGGCGATCTCTTCCTTCTCTTTTGAATTTCACAGCTCAAGAATTAGCTGGTGCATCTGCT GAACTGCGTCAGCGTCTCATTCCGGAGCATGCAAGGATATGA
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>LITCHI026110.m1 CACTTTGAGAAATTGGAAAGTACCAAACCAGTGAGCTGGAGAAAGGAAGACTCAAAAAAC TGGAGAGCATTTTAAAGTAAAAGCAGTCCAGTTGAGCTGGTGTAATTATGCTTAGTGACA GTTTATAGTATATAAACAGAATGAAATCCAAACCAGGTCAGTCAGTTGTAAAACAGCAAA CCCAAGTTTAGTAGTTGAAGTGAAACTAGACACAGAGATACAAATATGCATATCTGGAGT CTGGACTGGAAACAGTAAGACTGAAGCCGAATACCAAAAAAGAATAATAAATAAATAATA TAATAGCCTTTATTAAAACAATAGAGTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAATAACC AAGGTCTTTGGTGTGGTCCCAGTCTCAAATCTGTGACAGAGACGGCAGTTTCATTTCTCT CTCTCTCCTCTTCTCTGCTACATATACCCTTTATTTAAACACATTTCTCTCTTGTCTCTC TCTATTTCTAGTTTTTCTTTGTGGAGTTATGTTTTTATTTTTCTGCTTATAATAATAATT ATTGTAGAAACAGAAGAAATAAAGAAATGGGAGTTTTGTAGTCTTATGGAGGTGTGAATT CTCAAGCGAAGCAAAAGTCTTCTCTTCACACCTCTCTCAATCTCTATTGCAGGTGAAGAA TCTAGGGTTTGACAGCAACAACTCCTACAAAGAGACTACCCAGTTGAATCTGATCTTCTC AGCCTTATTTCATTTCGACAATTTTGGCTTTTGACAACTGCTGTTTCTTTAAATTCTGTT TGGGCGTTGGAGTTTTGCTTTGTTTAAAACTTGAAATTTGAGTTTGTGGCCTTTTCATGA AGATCTGTTCTGCTGTTAAATTTAAGATCGTTTAGAGTTATTTTATGGCTTGTGTCTGAT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTTAGGTTTTTTTTTTTTAATTATTATTATTATTATTTT GTGGGTGGGTGTTGTGGTTAAGAAAGATGGAGGCGGTCGAAGAAGCTAACAAGGTAGCTG TAGAGAGCTGTCATAGAGTCCTTAGTATGTTGTCTCAGCCTCAAGATCAGGTTCAGTATA GGAATTTGATGGTGGAAACTGGAGAAGCTGTCTTTAGGTTCAAAAGAGTTGTGTCTCTTC TCAATACTGGTTTGGGTCATGCAAGAGTGAGAAAGCTCAAGCAGTTACCAACTCCTTGTA ACCAATCCATCCTCTTAGATAAGGCTGACATTCCATCCAAGAATCTGCAGTTTCTCCACC CTGGTTACCATGAAACCCACCCAATTCAAGGAATGGGGTCTCTTGCTAAAAGTTCGTTAT CTCTAGGGAACCCATCATTGGAGTTGCTCTCTAATGGTAAAAACCATCTCCAACTCAACC AGCAAACACCTTCGTCGCACTATAATTTCCTTCAGCATCAGCAGCAGCAGCAGCTACAAC AGAGGTTTCAACTCCAGCAACAGCAAATGAAACTTCAAGCTGAAATGATGCTTAGGAAGA GCAACAGTGGCGTCAACCTGAATTTCGATAGCTCTAGCTGTACGCCGACTATGTCGTCCA CTAGATCTTTCATGTCCTCCTTGAGTATAGATGGTAGTGTGGCGAATTTGGATGCAAACG CCTTCCATTTGATTGGGGCGCCTCGCTCTTCGGATCAGAGCTCGCAGCAACACAAGAGGA AGTGCTCAGGGAAGGGGGATGATGGGAGTGTCAAATGTGGAAGTAGCAGTCGATGTCACT GCTCGAAGAAGAGGAAACATAGGGTGAAGAGGTCAATCAAGGTGCCTGCTATCAGCAACA AGCTTGCGGACATCCCTCCTGATGATTATTCATGGAGGAAGTATGGGCAGAAGCCAATCA AGGGTTCTCCGCACCCTAGGGGATATTACAAATGTAGCAGCATGAGAGGTTGTCCTGCAA GGAAGCATGTCGAGAGGTGCTTGGAAGACCCATCGATGCTTATTGTTACGTATGAAGGCG AGCATAACCACCAAAGGTTACCATCACAATCTGCAAATGCATAA
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>LITCHI004773.m4 + Up_Stream_Len 2000 TGTCTCAATATATGTTTGTTTTATATGGTCGGACAGTAGAAGCACAATATATGTTTCAAA GTTGAAATCTTTTTCACTTTAAAGCTTGCGATGATGTCACACACTTCTTTTCCGAAGGTG GAACCCCTGAAATCTTTTGATTTTCTTGGGAAGATAAAGAATCCAAAAAAACAAAAGCAC AAATCAACGTGAATGAACATTGCCAAACCATCAATCAATAAAAGTTAAAGGTAAGTAGTG GAGGAAAAATGGTTAAAGAAAGATGAGGACCATCAGCAATGAGATGCTGATGCTCAAGTT AACAAAACAATTTTTCTTTTTATTTTTTTTTTTCCTTTTTTGTTCTCTCTCACTAAATTC TAAACCCTGAAAAGATAAAAATAAAAAATAAAGGGTTGGTTGGTTTTGTCTTCTTGATCT AATTCAATGGTTTTATTTTCTCAGTTCCTGGTTGTATATCTTCTCCTTATATCATCTGTT TTGTGCCAAGTTACAGGTATGTTCTTGGTTTTAATGCTATTTAATGTGGTTATATATGTA AGAACATGATATTGTTTAGACTCAGAAATATTGTTGTGGCATGTTATTATATGAATTGAC ATACAAGTTTCAAATTCCAAACATGGTTTCTAGGAAAAGAATTGCAAAGAAGTTGGCTTC AATGTGTTTTGTGTTTGTATATTTTTGTCAGTGAAAAAGGACTGTATAGCAATCTGATGT TTAGTGTGTGATTAAATTCAACATGCAGAGTTTGTAAGTATAGATTGTGGAGGAACAAGT AATTACACTGATCCAAGGACTGGATTAGCATGGATATCAGACGTGGGGATGATGAACTAT GGCAAATCAGTGCAAGTAGAGAGCCCAAATGGAGGCTGGATGCGGTATCAAAGACGGAGA 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