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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI025598 | Chr3 | 2748597;2749915 | 2757913 | - | MADS-box protein SOC1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI025598.m1 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93 | 6.10E-27 |
| LITCHI025598.m1 | 84 | 171 | PF01486.20 | K-box | Family | 93.3 | 8.50E-27 |
| LITCHI025598.m2 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93 | 6.10E-27 |
| LITCHI025598.m2 | 84 | 171 | PF01486.20 | K-box | Family | 93.3 | 8.50E-27 |
| LITCHI025598.m3 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93 | 6.10E-27 |
| LITCHI025598.m3 | 84 | 171 | PF01486.20 | K-box | Family | 93.3 | 8.50E-27 |
| LITCHI025598.m4 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93 | 6.10E-27 |
| LITCHI025598.m4 | 84 | 171 | PF01486.20 | K-box | Family | 93.3 | 8.50E-27 |
| LITCHI025598.m5 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93.7 | 3.70E-27 |
| LITCHI025598.m5 | 84 | 171 | PF01486.20 | K-box | Family | 92.5 | 1.50E-26 |
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>LITCHI025598.m1 ATGGTGAGGGGGAAAACCCAAATGAGAAGGATAGAGAATGCTACAAGCAGACAAGTCACC TTCTCTAAGCGGCGAAATGGGCTGCTGAAAAAGGCATTTGAGCTCTCGGTTCTTTGTGAT GCCGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTCCAAGAGGCAAGCTCTATGAATTTGCAAATTCC AGCATGCAGGAGACAATACAACGATATCTGAAGCATACAAAAGACACTCGAACCATTGAC AGGCCAACAGAACAAAGCATGCAGCAAATGAAGAATGAAGCAGCTAACATGATGAAGAAG ATAGAGCTTCTCGAAGTTGCAAAACGGAGACTATTAGGAGAAGGCCTAGGATCATGCTCC ATTGAAGAACTACAACAGATAGAACAACAGCTGGAGAGGAGCGTAACCTGCATTCGAGCA AGAAAGTCTCAAGTTTTCAAGGAACAAATTGAGCTGCTGAAAGAAAAGGAGAAGAACCTT ATAGCTGAAAATGCGAGACTCTCTGCAAAGTGTGGTGTACAACCATGGCTAGGATCAAAA GAGAAGGAGAAAGAGAAAGAGCAGCCAGAAAATTCACCCAGCAATGAAGACAGTAATCCA ACTTCTGATGTGGAGACTGAATTATTCATCGGACTGCCCCCAGCTAGAAGAACAAGGCAT TTGCCGCGGCCACCACCGCCACAACCTAACTAG >LITCHI025598.m2 ATGGTGAGGGGGAAAACCCAAATGAGAAGGATAGAGAATGCTACAAGCAGACAAGTCACC TTCTCTAAGCGGCGAAATGGGCTGCTGAAAAAGGCATTTGAGCTCTCGGTTCTTTGTGAT GCCGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTCCAAGAGGCAAGCTCTATGAATTTGCAAATTCC AGCATGCAGGAGACAATACAACGATATCTGAAGCATACAAAAGACACTCGAACCATTGAC AGGCCAACAGAACAAAGCATGCAGCAAATGAAGAATGAAGCAGCTAACATGATGAAGAAG ATAGAGCTTCTCGAAGTTGCAAAACGGAGACTATTAGGAGAAGGCCTAGGATCATGCTCC ATTGAAGAACTACAACAGATAGAACAACAGCTGGAGAGGAGCGTAACCTGCATTCGAGCA AGAAAGTCTCAAGTTTTCAAGGAACAAATTGAGCTGCTGAAAGAAAAGGAGAAGAACCTT ATAGCTGAAAATGCGAGACTCTCTGCAAAGTGTGGTGTACAACCATGGCTAGGATCAAAA GAGAAGGAGAAAGAGAAAGAGCAGCCAGAAAATTCACCCAGCAATGAAGACAGTAATCCA ACTTCTGATGTGGAGACTGAATTATTCATCGGACTGCCCCCAGCTAGAAGAACAAGGCAT TTGCCGCGGCCACCACCGCCACAACCTAACTAG >LITCHI025598.m3 ATGGTGAGGGGGAAAACCCAAATGAGAAGGATAGAGAATGCTACAAGCAGACAAGTCACC TTCTCTAAGCGGCGAAATGGGCTGCTGAAAAAGGCATTTGAGCTCTCGGTTCTTTGTGAT GCCGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTCCAAGAGGCAAGCTCTATGAATTTGCAAATTCC AGCATGCAGGAGACAATACAACGATATCTGAAGCATACAAAAGACACTCGAACCATTGAC AGGCCAACAGAACAAAGCATGCAGCAAATGAAGAATGAAGCAGCTAACATGATGAAGAAG ATAGAGCTTCTCGAAGTTGCAAAACGGAGACTATTAGGAGAAGGCCTAGGATCATGCTCC ATTGAAGAACTACAACAGATAGAACAACAGCTGGAGAGGAGCGTAACCTGCATTCGAGCA AGAAAGTCTCAAGTTTTCAAGGAACAAATTGAGCTGCTGAAAGAAAAGGAGAAGAACCTT ATAGCTGAAAATGCGAGACTCTCTGCAAAGTGTGGTGTACAACCATGGCTAGGATCAAAA GAGAAGGAGAAAGAGAAAGAGCAGCCAGAAAATTCACCCAGCAATGAAGACAGTAATCCA ACTTCTGATGTGGAGACTGAATTATTCATCGGACTGCCCCCAGCTAGAAGAACAAGGCAT TTGCCGCGGCCACCACCGCCACAACCTAACTAG >LITCHI025598.m4 ATGGTGAGGGGGAAAACCCAAATGAGAAGGATAGAGAATGCTACAAGCAGACAAGTCACC TTCTCTAAGCGGCGAAATGGGCTGCTGAAAAAGGCATTTGAGCTCTCGGTTCTTTGTGAT GCCGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTCCAAGAGGCAAGCTCTATGAATTTGCAAATTCC AGCATGCAGGAGACAATACAACGATATCTGAAGCATACAAAAGACACTCGAACCATTGAC AGGCCAACAGAACAAAGCATGCAGCAAATGAAGAATGAAGCAGCTAACATGATGAAGAAG ATAGAGCTTCTCGAAGTTGCAAAACGGAGACTATTAGGAGAAGGCCTAGGATCATGCTCC ATTGAAGAACTACAACAGATAGAACAACAGCTGGAGAGGAGCGTAACCTGCATTCGAGCA AGAAAGTCTCAAGTTTTCAAGGAACAAATTGAGCTGCTGAAAGAAAAGGAGAAGAACCTT ATAGCTGAAAATGCGAGACTCTCTGCAAAGTGTGGTGTACAACCATGGCTAGGATCAAAA GAGAAGGAGAAAGAGAAAGAGCAGCCAGAAAATTCACCCAGCAATGAAGACAGTAATCCA ACTTCTGATGTGGAGACTGAATTATTCATCGGACTGCCCCCAGCTAGAAGAACAAGGCAT TTGCCGCGGCCACCACCGCCACAACCTAACTAG >LITCHI025598.m5 ATGGTGAGGGGGAAAACCCAAATGAGAAGGATAGAGAATGCTACAAGCAGACAAGTCACC TTCTCTAAGCGGCGAAATGGGCTGCTGAAAAAGGCATTTGAGCTCTCGGTTCTTTGTGAT GCCGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCTCCAAGAGGCAAGCTCTATGAATTTGCAAATTCC AGCATGCAGGAGACAATACAACGATATCTGAAGCATACAAAAGACACTCGAACCATTGAC AGGCCAACAGAACAAAGCATGCAGCAAATGAAGAATGAAGCAGCTAACATGATGAAGAAG ATAGAGCTTCTCGAAGTTGCAAAACGGAGACTATTAGGAGAAGGCCTAGGATCATGCTCC ATTGAAGAACTACAACAGATAGAACAACAGCTGGAGAGGAGCGTAACCTGCATTCGAGCA AGAAAGTCTCAAGTTTTCAAGGAACAAATTGAGCTGCTGAAAGAAAAGGAGAAGAACCTT ATAGCTGAAAATGCGAGACTCTCTGCAAAGGTGCGTTTTGATATATAA
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