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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI025541 | Chr3 | 2248337 | 2254190 | + | Protein NSP-INTERACTING KINASE 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI025541.m1 | 24 | 64 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 33.8 | 3.30E-08 |
LITCHI025541.m1 | 140 | 199 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 35.1 | 9.30E-09 |
LITCHI025541.m1 | 212 | 231 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10 | 1.3 |
LITCHI025541.m1 | 409 | 665 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 96.6 | 1.70E-27 |
LITCHI025541.m1 | 410 | 667 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 132.5 | 1.80E-38 |
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>LITCHI025541.m1 ATGCCTCCCTTGCTCTACTTGCTTGCTCTTTTACTCTCTCTCTCTCACTGCTCCTTCTCT ACACCTACTACAGAGGTCGACCTCCTCATGCAAATTAAAGACTCGTTGGACCCACAAAAC CGGCTCTTGACTTCGTGGACTCCAAATGCCGACCCATGTAGCGGCGACTCCTTTGACGGT GTCGCGTGCAACGAGAATGGCCTGGTCGCTAACATATCTTTACAAGGGAAGGGTCTCTCC GGGAAGATACCGGCAGCTCTAGGTGGGCTCAAGAGCTTGACTGGGTTGTACCTCCACTTC AACGCCTTGTACGGAGAGATTCCAGTGGAGATTGCTAGCTTGAGTGAGCTCACTGACTTG TATCTTAACGTGAATAACCTCTCTGGAGAGATTCCTTCTCAGATTGGTAACATGACCAGT CTTCAAGTGGTACAGTTGTGTTACAACAAGTTGACTGGTAGCATACCGACACAGTTGGGA TCCCTAAACAAGCTTAGTGTCCTTGCTTTGCAATATAATCAATTGACTGGTGCAATTCCT GCGAGTTTGGGGGATTTGGGGTTGTTGACAAGGTTGGATTTGAGCTTCAATAAGCTTTTT GGTTCAGTTCCTGTTAAATTGGCCAATGCTTCTAATCTGGAAGTTCTAGACATCCGCAAC AATTCGCTCTCTGGCAACGTACCTTCAGTTCTTAAGAGACTGAACAGCGGATTTCAATAC GAAAACAATGCACAGTTATGTGGGGCTGGCTTTTCTAACTTGAAAAATTGCATAGCATCT GATCGGACAGATCCGAATAGACCTGAGCCATTCAGACCTAACAGTCTTCCTACTAAGGAT ATTCCTGAGTCTGCAAATTTGCCATCTGATTGTAGGCAAAACCGTTGCTCAAGTCCATCC AAAAGTCCACTTACTGGGGTTGTTTTGGGGGTAGTTGGATTGTTCATTGCTTTGACTGTC ACTGGACTCTTCACATTCACATGGTACCGTCGTCGGAAACAAAAAATTGGGAATGCTTTT GATAGCACAGATGGTCGTCTTAGCACTGATCAGGTGAAGGAAGTTTGCAGGAGAAGTGCC TCTCCTCTAATCAGTCTTGAATATTCAAATGGGTGGGATCCATTGGCTAAAGGTCAGATT GGAGATGGGTTTTCACAGGAAGTACTTGAGAGCTTTATGTTTAATTTAGAAGAGGTGGAG CGTGCAACGCAATGCTTCTTGGAGATGAATTTGTTGGGAAGGAGTAACTTCTCTGCCATC TACAAGGGGATCCTGAGAGATGGGTCGATTGTAGCTATAAAGTGCATTGCCAAGACAAGT TGCAAGTCTGATGAAGCAGAGTTTTTGAAGGGGTTGAAGATATTGACATCGGTGAAACAT GAAAATCTTGTGAGGTTGCGAGGTTTTTGCTGTTCAAAAGGCAGAGGCGAGTGCTTCCTC ATCTATGATTTTGTCCCCAATGGAAGCCTGTTGCAGTATCTAGATGTCAAGGATGGCAGT GAAAAGGTCCTGGAATGGTCTACCAGAATTTCTATCATAAATGGCATTGCCAAAGGTATT GGGTATTTACATGGAAGGAAACCTGGTTTAGTTCACCAGAATCTATCAGCGGAGAAGGTG CTCATTGACAGACGATATAACCCCTTTCTTTCAGATTCGGGCCTGCACAAACTTCTAGCA GATGACATTGTCTTCTCCATGCTCAAAGCCAGTGCTGCAATGGGATACCTAGCTCCCGAA TACACCACTACTGGCCGATTTACTGAAAAGAGCGATATATATGCATTTGGCATGATTGTA TTTCAGATTCTCAGTGGAAAGCGAAATGTCACCCACCTGACCCGCCTTGCAGCAGAGTCA TCCAAAGTTGAAGATCTTGTCGACACAAATCTAAAGGGAAAGTTTTCAGAATCTGAGGCA GCTAAACTTGGGCGAATTGCGCTGCTTTGCACCCATGAATCTTCTAGCTACAGACCATCC ATTGAAACCATAATGCTGGAACTGAGTGGTTTGGTTGGCAGTTCTTGA
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>LITCHI025541.m1 AAACCGTATAACTGCAAAGCACCGTAAAATTTTAACCGGATAGAGAAAGAGAGAGAGAGA GAGAATCTGGACACTGTACTTTGTATTTAATACTTTTAACAAGCACTAACTCAAACCCAG TTTCGAAGTCATTCACGATCAGAAGTTACACAACTTCAAATCTCAGACCAGACACATTTT CCCACAGTTTCTCTCTGAGTTTCCTTCAGTTTCTCGCCAGCCAAACATGCCTCCCTTGCT CTACTTGCTTGCTCTTTTACTCTCTCTCTCTCACTGCTCCTTCTCTACACCTACTACAGA GGTCGACCTCCTCATGCAAATTAAAGACTCGTTGGACCCACAAAACCGGCTCTTGACTTC GTGGACTCCAAATGCCGACCCATGTAGCGGCGACTCCTTTGACGGTGTCGCGTGCAACGA GAATGGCCTGGTCGCTAACATATCTTTACAAGGGAAGGGTCTCTCCGGGAAGATACCGGC AGCTCTAGGTGGGCTCAAGAGCTTGACTGGGTTGTACCTCCACTTCAACGCCTTGTACGG AGAGATTCCAGTGGAGATTGCTAGCTTGAGTGAGCTCACTGACTTGTATCTTAACGTGAA TAACCTCTCTGGAGAGATTCCTTCTCAGATTGGTAACATGACCAGTCTTCAAGTGGTACA GTTGTGTTACAACAAGTTGACTGGTAGCATACCGACACAGTTGGGATCCCTAAACAAGCT TAGTGTCCTTGCTTTGCAATATAATCAATTGACTGGTGCAATTCCTGCGAGTTTGGGGGA TTTGGGGTTGTTGACAAGGTTGGATTTGAGCTTCAATAAGCTTTTTGGTTCAGTTCCTGT TAAATTGGCCAATGCTTCTAATCTGGAAGTTCTAGACATCCGCAACAATTCGCTCTCTGG CAACGTACCTTCAGTTCTTAAGAGACTGAACAGCGGATTTCAATACGAAAACAATGCACA 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>LITCHI025541.m1 + Up_Stream_Len 2000 AATGCCTATTACAAGACAAACAATCATAAAAACTCAAGTTCACATGATGCCTAAAAATGG GTCCTTAATAATCATCATGGACAATCAGAGATTTCCAACGAATGGCACGAATTGATCGTG TCTGATCAAAGTATTCAAAATAAAACCGATAAAAGGATGGTAAGATCACACTAGATATAA AGAAAAGTTCACATGTGCAACTGTTGACGGTAGTAGGGCACATTTGGGTACAAATCAGTG GATTTTTCAATTTTCAATCTCCCTTTCTTAGCTGGTTTGTTTGGTTTGGTTTTAAAGTCG CCAGTTGCTGTCAAGGCTGAGACCATATTTGACTAGTACAAAGCAGCCATAATTTCACTA CTCTGCATCATTCCCTATCAAAGAGGAATGATGCGAAAAAGCCCATCTTTATTTCTCGCA TTCGAAGTATGGTATCATACTCTTTCTTGAAAGTGACAATCTCCTAACTCATTTCTGAAT TTTTTATTTTTATATATTTTTTTTCATAAAGTAAACATAATGAAAGACTTGAAAATAACA ATTTTACACCTGTAGTATACTATAAGAAAGGAGTTTCATGATGGCTTCGTTAAATGTCTA GTTATAGTTATTGTTTTTGAGATTTATGAGTTTGAACATAAATTATACACGTGAAAGTCA ACATTGTATATATCATGATTTGTTGTACAATTTATTAAATAGAATAATAAATTTACTAAA ACGCATCAATTTTTTATTAAGAGAATGTATTCAATTTAAGATTTTATTAGAATGTAAAGG ATTTTAAAAGTTTGGATATAATCAATCCAAATTTGAATGGATTTCATTGAAACTTAGGTG CATTTAATCTAAATTTATATGAAAATCATTAAAATCAGGTTTATTAAATTCAGATTTGTA TGAAATCTTATAAAACATAGATATATTTAAAAAGTTATTGAATTCATATATTTTATTTCA AACGATGGATTTAAATGAATTTGGATAAAATTTAAAAATAATTTTTACAAATAAAAGTTT ATAACAAACCTTACCATTCTCTTTAAGATTTTGTGATTTTTTAAATAATTCCAACAAAAC CAATATGAATTCCAGATTTTAGTGGATTTCTAATTCTAACAAAATCAATCAAGATTTTGC TGGATTTTTTAAAGAATTCTAATAAAATTAATATGAAGTTTAATCTATAAATTTCATCCA TATCTATTATTTAAAAAAAAATCATAAAACTCAAAAAAAAGCTCTAAATTAAATATATAT TTTTAAAGAATTTTATAATTTACTAGGATTTGTAAAACAATTAAGTTTATCGTGAGATGC ATAAAATTAAACATAAAATTATAATATATATGCATATAAAATTCAACATCAACAATCAAT ATACATATTAACAATGGTCGATGTAACACATAATACTCATTGAATATTAAATTTATCTAA AACAGGATCAAAACCCGCAAAACATGTGGGGAAATCCAAATAAAGAAAATTCAAATTTTG AAGCATGCTAGGTGTACTGACACTGTGAAACGCACATACTGTATCAATAATTGCAGCAGA GATTTTCTCCTGTATTTTTTTTTTTCTATTAAAAGTAATCAAATCAATCAAACACACCGC TTAAGATCCGCCAGCTTCCACAACAAACCCATCATCACGTGTTCGGACCCCCATACAAAA GTTGGGACCCCCCACCTTTGCAATGGTCATGATTTACTCTCTTTTAAACCATAGGGACCC ACCCATTTTTTCAAAAATCCCCTACCTAACCCAAAAACCGTATAACTGCAAAGCACCGTA AAATTTTAACCGGATAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAATCTGGACACTGTACTTTGTAT TTAATACTTTTAACAAGCACTAACTCAAACCCAGTTTCGAAGTCATTCACGATCAGAAGT TACACAACTTCAAATCTCAGACCAGACACATTTTCCCACAGTTTCTCTCTGAGTTTCCTT CAGTTTCTCGCCAGCCAAAC
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>LITCHI025541.m1 GenomeSequence + AAACCGTATAACTGCAAAGCACCGTAAAATTTTAACCGGATAGAGAAAGAGAGAGAGAGA GAGAATCTGGACACTGTACTTTGTATTTAATACTTTTAACAAGCACTAACTCAAACCCAG TTTCGAAGTCATTCACGATCAGAAGTTACACAACTTCAAATCTCAGACCAGACACATTTT CCCACAGTTTCTCTCTGAGTTTCCTTCAGTTTCTCGCCAGCCAAACATGCCTCCCTTGCT CTACTTGCTTGCTCTTTTACTCTCTCTCTCTCACTGCTCCTTCTCTACACCTACTACAGA GGTCGACCTCCTCATGCAAATTAAAGACTCGTTGGACCCACAAAACCGGCTCTTGACTTC GTGGACTCCAAATGCCGACCCATGTAGCGGCGACTCCTTTGACGGTGTCGCGTGCAACGA GAATGGCCTGGTCGCTAACATATCTTTACAAGGGAAGGGTCTCTCCGGGAAGATACCGGC AGCTCTAGGTGGGCTCAAGAGCTTGACTGGGTTGTACCTCCACTTCAACGCCTTGTACGG AGAGATTCCAGTGGAGATTGCTAGCTTGAGTGAGCTCACTGACTTGTATCTTAACGTGAA TAACCTCTCTGGAGAGATTCCTTCTCAGATTGGTAACATGACCAGTCTTCAAGGTTGGTT CTCTTTTATTTATTTATTCATTTTGTTTTTTAACTGGTTGATTTGAAGTATAAGCACTCT AAGTTGAGCTTAGTGAAGTTAAAAATTAAATTTTTATATATTTCATGATTTATTTGATTT GATTTTACTAGGAATAAATATTGTACATTGATTTTATTTATCAACTCGTCACATATAGGG TTACTGGGCCATTTTTTATGGATTTAGTTAGGGACCGCAGCTGGTTTGGTCCTGTCTACA 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