Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI025535Chr322191942222118+Protein NSP-INTERACTING KINASE 2

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI025535.m12464PF08263.15LRRNT_2Family33.83.30E-08
LITCHI025535.m1140199PF13855.9LRR_8Repeat35.19.30E-09
LITCHI025535.m1212231PF00560.36LRR_1Repeat101.3
LITCHI025535.m1407665PF00069.28PkinaseDomain97.21.10E-27
LITCHI025535.m1410667PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain132.81.40E-38
Download   Copy
>LITCHI025535.m1
ATGCCTCCCTTGCTCTACTTGCTTGCTCTTTTACTCTCTCTCTCTCACTGCTCCTTCTCT
ACACCTACTACAGAGGTCGACCTCCTCATGCAAATTAAAGACTCGTTGGACCCACAAAAC
CGGCTCTTGACTTCGTGGACTCCAAATGCCGACCCATGTAGCGGCGACTCCTTTGACGGT
GTCGCGTGCAACGAGAATGGCCTGGTCGCTAACATATCTTTACAAGGGAAGGGTCTCTCC
GGGAAGATACCGGCAGCTCTAGGTGGGCTCAAGAGCTTGACTGGGTTGTACCTCCACTTC
AACGCCTTGTACGGAGAGATTCCAGTGGAGATTGCTAGCTTGAGTGAGCTCACTGACTTG
TATCTTAACGTGAATAACCTCTCTGGAGAGATTCCTTCTCAGATTGGTAACATGACCAGT
CTTCAAGTGGTACAGTTGTGTTACAACAAGTTGACTGGTAGCATACCGACACAGTTGGGA
TCCCTAAACAAGCTTAGTGTCCTTGCTTTGCAATATAATCAATTGACTGGTGCAATTCCT
GCGAGTTTGGGGGATTTGGGGTTGTTGACAAGGTTGGATTTGAGCTTCAATAAGCTTTTT
GGTTCAGTTCCTGTTAAATTGGCCAATGCTTCTAATCTGGAAGTTCTAGACATCCGCAAC
AATTCGCTCTCTGGCAACGTACCTTCAGTTCTTAAGAGACTGAACAGCGGATTTCAATAC
GAAAACAATGCACAGTTATGTGGGGCTGGCTTTTCTAACTTGAAAAATTGCATAGCATCT
GATCGGACAGATCCGAATAGACCTGAGCCATTCAGACCTAACAGTCTTCCTACTAAGGAT
ATTCCTGAGTCTGCAAATTTGCCATCTGATTGTAGGCAAAACCGTTGCTCAAGTCCATCC
AAAAGTCCACTTACTGGGGTTGTTTTGGGGGTAGTTGGATTGTTCATTGCTTTGACTGTC
ACTGGACTCTTCACATTCACATGGTACCGTCGTCGGAAACAAAAAATTGGGAATGCTTTT
GATAGCACAGATGGTCGTCTTAGCACTGATCAGGTGAAGGAAGTTTGCAGGAGAAGTGCC
TCTCCTCTAATCAGTCTTGAATATTCAAATGGGTGGGATCCATTGGCTAAAGGTCAGATT
GGAGATGGGTTTTCACAGGAAGTACTTGAGAGCTTTATGTTTAATTTAGAAGAGGTGGAG
CGTGCAACGCAATGCTTCTCGGAGATGAATTTGTTGGGAAGGAGTAACTTCTCTGCCATC
TACAAGGGGATCCTGAGAGATGGGTCGATTGTAGCTATAAAGTGCATTGCCAAGACAAGT
TGCAAGTCTGATGAAGCAGAGTTTTTGAAGGGGTTGAAGATATTGACATCAGTGAAACAT
GAAAATCTTGTGAGGTTGCGAGGTTTTTGCTGTTCAAAAGGCAGAGGCGAGTGCTTCCTC
ATCTATGATTTTGTCCCCAATGGAAGCCTGTTGCAGTATCTAGATGTCAAGGATGGCAGT
GAAAAGGTCCTGGAATGGTCTACCAGAATTTCTATCATAAATGGCATTGCCAAAGGTATT
GGGTATTTACATGGAAGGAAACCTGGTTTAGTTCACCAGAATCTATCAGCGGAGAAGGTG
CTCATTGACAGACGATATAACCCCTTTCTTTCAGATTCGGGCCTGCACAAACTTCTAGCA
GATGACATTGTCTTCTCCATGCTCAAAGCCAGTGCTGCAATGGGATACCTAGCTCCCGAA
TACACCACTACTGGCCGATTTACTGAAAAGAGCGATATATATGCATTTGGCATGATTGTA
TTTCAGATTCTCAGTGGAAAGCGAAATGTCACCCACCTGACCCGCCTTGCAGCAGAGTCA
TCCAAAGTTGAAGATCTTGTCGACACAAATCTAAAGGGAAAGTTTTCAGAATCTGAGGCA
GCTAAACTTGGGCGAATTGCGCTGCTTTGCACCCATGAATCTTCTAGCTACAGACCATCC
ATTGAAACCATAATGCTGGAACTGAGTGGTTTGGTTGGCAGTTCTTGA
Download   Copy
>LITCHI025535.m1
MPPLLYLLALLLSLSHCSFSTPTTEVDLLMQIKDSLDPQNRLLTSWTPNADPCSGDSFDG
VACNENGLVANISLQGKGLSGKIPAALGGLKSLTGLYLHFNALYGEIPVEIASLSELTDL
YLNVNNLSGEIPSQIGNMTSLQVVQLCYNKLTGSIPTQLGSLNKLSVLALQYNQLTGAIP
ASLGDLGLLTRLDLSFNKLFGSVPVKLANASNLEVLDIRNNSLSGNVPSVLKRLNSGFQY
ENNAQLCGAGFSNLKNCIASDRTDPNRPEPFRPNSLPTKDIPESANLPSDCRQNRCSSPS
KSPLTGVVLGVVGLFIALTVTGLFTFTWYRRRKQKIGNAFDSTDGRLSTDQVKEVCRRSA
SPLISLEYSNGWDPLAKGQIGDGFSQEVLESFMFNLEEVERATQCFSEMNLLGRSNFSAI
YKGILRDGSIVAIKCIAKTSCKSDEAEFLKGLKILTSVKHENLVRLRGFCCSKGRGECFL
IYDFVPNGSLLQYLDVKDGSEKVLEWSTRISIINGIAKGIGYLHGRKPGLVHQNLSAEKV
LIDRRYNPFLSDSGLHKLLADDIVFSMLKASAAMGYLAPEYTTTGRFTEKSDIYAFGMIV
FQILSGKRNVTHLTRLAAESSKVEDLVDTNLKGKFSESEAAKLGRIALLCTHESSSYRPS
IETIMLELSGLVGSS.
Download   Copy
>LITCHI025535.m1
AAACCGTATAACTGCAAAGCACCGTAAAATTTTAACCGGATAGAGAAAGAGAGAGAGAGA
GAGAATCTGGACACTGTACTTTGTATTTAATACTTTTAACAAGCACTAACTCAAACCCAG
TTTCGAAGTCATTCACGATCAGAAGTTACACAACTTCAAATCTCAGACCAGACACATTTT
CCCACAGTTTCTCTCTGAGTTTCCTTCAGTTTCTCGCCAGCCAAACATGCCTCCCTTGCT
CTACTTGCTTGCTCTTTTACTCTCTCTCTCTCACTGCTCCTTCTCTACACCTACTACAGA
GGTCGACCTCCTCATGCAAATTAAAGACTCGTTGGACCCACAAAACCGGCTCTTGACTTC
GTGGACTCCAAATGCCGACCCATGTAGCGGCGACTCCTTTGACGGTGTCGCGTGCAACGA
GAATGGCCTGGTCGCTAACATATCTTTACAAGGGAAGGGTCTCTCCGGGAAGATACCGGC
AGCTCTAGGTGGGCTCAAGAGCTTGACTGGGTTGTACCTCCACTTCAACGCCTTGTACGG
AGAGATTCCAGTGGAGATTGCTAGCTTGAGTGAGCTCACTGACTTGTATCTTAACGTGAA
TAACCTCTCTGGAGAGATTCCTTCTCAGATTGGTAACATGACCAGTCTTCAAGTGGTACA
GTTGTGTTACAACAAGTTGACTGGTAGCATACCGACACAGTTGGGATCCCTAAACAAGCT
TAGTGTCCTTGCTTTGCAATATAATCAATTGACTGGTGCAATTCCTGCGAGTTTGGGGGA
TTTGGGGTTGTTGACAAGGTTGGATTTGAGCTTCAATAAGCTTTTTGGTTCAGTTCCTGT
TAAATTGGCCAATGCTTCTAATCTGGAAGTTCTAGACATCCGCAACAATTCGCTCTCTGG
CAACGTACCTTCAGTTCTTAAGAGACTGAACAGCGGATTTCAATACGAAAACAATGCACA
GTTATGTGGGGCTGGCTTTTCTAACTTGAAAAATTGCATAGCATCTGATCGGACAGATCC
GAATAGACCTGAGCCATTCAGACCTAACAGTCTTCCTACTAAGGATATTCCTGAGTCTGC
AAATTTGCCATCTGATTGTAGGCAAAACCGTTGCTCAAGTCCATCCAAAAGTCCACTTAC
TGGGGTTGTTTTGGGGGTAGTTGGATTGTTCATTGCTTTGACTGTCACTGGACTCTTCAC
ATTCACATGGTACCGTCGTCGGAAACAAAAAATTGGGAATGCTTTTGATAGCACAGATGG
TCGTCTTAGCACTGATCAGGTGAAGGAAGTTTGCAGGAGAAGTGCCTCTCCTCTAATCAG
TCTTGAATATTCAAATGGGTGGGATCCATTGGCTAAAGGTCAGATTGGAGATGGGTTTTC
ACAGGAAGTACTTGAGAGCTTTATGTTTAATTTAGAAGAGGTGGAGCGTGCAACGCAATG
CTTCTCGGAGATGAATTTGTTGGGAAGGAGTAACTTCTCTGCCATCTACAAGGGGATCCT
GAGAGATGGGTCGATTGTAGCTATAAAGTGCATTGCCAAGACAAGTTGCAAGTCTGATGA
AGCAGAGTTTTTGAAGGGGTTGAAGATATTGACATCAGTGAAACATGAAAATCTTGTGAG
GTTGCGAGGTTTTTGCTGTTCAAAAGGCAGAGGCGAGTGCTTCCTCATCTATGATTTTGT
CCCCAATGGAAGCCTGTTGCAGTATCTAGATGTCAAGGATGGCAGTGAAAAGGTCCTGGA
ATGGTCTACCAGAATTTCTATCATAAATGGCATTGCCAAAGGTATTGGGTATTTACATGG
AAGGAAACCTGGTTTAGTTCACCAGAATCTATCAGCGGAGAAGGTGCTCATTGACAGACG
ATATAACCCCTTTCTTTCAGATTCGGGCCTGCACAAACTTCTAGCAGATGACATTGTCTT
CTCCATGCTCAAAGCCAGTGCTGCAATGGGATACCTAGCTCCCGAATACACCACTACTGG
CCGATTTACTGAAAAGAGCGATATATATGCATTTGGCATGATTGTATTTCAGATTCTCAG
TGGAAAGCGAAATGTCACCCACCTGACCCGCCTTGCAGCAGAGTCATCCAAAGTTGAAGA
TCTTGTCGACACAAATCTAAAGGGAAAGTTTTCAGAATCTGAGGCAGCTAAACTTGGGCG
AATTGCGCTGCTTTGCACCCATGAATCTTCTAGCTACAGACCATCCATTGAAACCATAAT
GCTGGAACTGAGTGGTTTGGTTGGCAGTTCTTGA
Download   Copy
>LITCHI025535.m1 +  Up_Stream_Len 2000
TATTACAAGACAAACAATCATAAAAACTCAAGTTCACATGATGCCTAAAAATGGGTCCTT
AATAATCATCATGGACAATCAGAGATTTCCAACGAATGGCACGAATTGATCGTGTCTGAT
CAAAGTATTCAAAATAAAACCGATAAAAGGATGGTAAGATCACACTAGATATAAAGAAAA
GTTCACATGTGCAACTGTTGACGGTAGTAGGGCACATTTGGGTACAAATCAGTGGATTTT
TCAATTTTCAATCTCCCTTTCTTAGCTGGTTTGTTTGGTTTGGTTTTAAAGTCGCCAGTT
GCTGTCAAGGCTGCGACCATATTTGACTAGTACAAAGCAGCCATAATTTCACTACTCTGC
ATCATTCCCTATCAAAGAGGAATGATGCGAAAAAGCCCATCTTTATTTCTCGCATTCGAA
GTATGGTATCATACTCTTTCTTGAAAGTGACAATCTCCTAACTCATTTCTGAATTTTTTA
TTTTTATATATTTTTTTCATAAAGTAAACATAATGAAAGACTTGAAAATAACAATTTTAC
ACCTGTAGTATACTATAAGAAAGGAGTTTCATGATGGCTTCGTTAAATGTCTAGTTATAG
TTATTGTTTTTGAGATTTATGAGTTTGAACATAAATTATACACGTGAAAGTCAACATTGT
ATATATCATGATTTGTTGTACAATTTATTAAATAGAATAATAAATTTACTAAAACGCATC
AATTTTTTATTAAGAGAATGTATTCAATTTAAGATTTTATTAGAATGTAAAGGATTTTAA
AAGTTTGGATATAATCAATCCAAATTTGAATGGATTTCATTGAAACTTAGGTGCATTTAA
TCTAAATTTATATGAAAATCATTAAAATCAGGTTTATTAAATTCATATTTGTATGAAATC
TTATAAAACATAGATATATTTAAAAAGTTATTGACTTCATATATTTTATTTCAAACGATG
GATTTAAATGAATTTTGATAAAATTTAAAATAATTTTTACAAATAAAAGTTTATAACAAA
CCTTACCATTCTCTTTAAGATTTTGTGAATTTTTTAAATAATTCCAACAAAACCAATATG
AATTCCAGATTTTAGTGGATTTCTAATTCTAACAAAATCAATCAAGATTTTGCTGGATTT
TTTAAAGAATTCTAATAAAATTAATATGAAGTTTATAAAATCTATAAATTTCATCCATAT
CTATTATTTAAAAAAAAATCATAAAACTCAAAAAAAAGCTCTAAATTAAATATATATTTT
TAAAGAATTTTATAATTTTACTAGGATTTGTAAAACAATTAAGTTTATCGTGAGATGCAT
AAAATTAAACATAAAATTATAATATATATGCATATAAAATTCAACATCAACAATCAATAT
ACATATTAACAATGGTCGATGTAACACATAATACTCATTGAATATTAAATTTATCTAAAA
CAGGATCAAAACCCGCAAAACATGTGGGGAAATCCAAATAAAGAAAATTCAAATTTTGAA
GCATGCTAGGTGTACTGACACTGTGAAACGCACATACTGTATCAATAATTGCAGCAGAGA
TTTTCTCCTGTATTTTTTTTTTTTCTATTAAAAGTAATCAAATCAATCAAACACACCGCT
TAAGATCCGCCAGCTTCCACAACAAACCCATCATCACGTGTTCGGACCCCCATACAAAAG
TTGGGACCCCCCACCTTTGCAATGGTCATGATTTACTCTCTTTTAAACCATAGGGACCCA
CCCATTTTTTCAAAAATCCCCTACCTAACCCAAAAAACCGTATAACTGCAAAGCACCGTA
AAATTTTAACCGGATAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAATCTGGACACTGTACTTTGTAT
TTAATACTTTTAACAAGCACTAACTCAAACCCAGTTTCGAAGTCATTCACGATCAGAAGT
TACACAACTTCAAATCTCAGACCAGACACATTTTCCCACAGTTTCTCTCTGAGTTTCCTT
CAGTTTCTCGCCAGCCAAAC
Download   Copy
>LITCHI025535.m1 GenomeSequence + 
AAACCGTATAACTGCAAAGCACCGTAAAATTTTAACCGGATAGAGAAAGAGAGAGAGAGA
GAGAATCTGGACACTGTACTTTGTATTTAATACTTTTAACAAGCACTAACTCAAACCCAG
TTTCGAAGTCATTCACGATCAGAAGTTACACAACTTCAAATCTCAGACCAGACACATTTT
CCCACAGTTTCTCTCTGAGTTTCCTTCAGTTTCTCGCCAGCCAAACATGCCTCCCTTGCT
CTACTTGCTTGCTCTTTTACTCTCTCTCTCTCACTGCTCCTTCTCTACACCTACTACAGA
GGTCGACCTCCTCATGCAAATTAAAGACTCGTTGGACCCACAAAACCGGCTCTTGACTTC
GTGGACTCCAAATGCCGACCCATGTAGCGGCGACTCCTTTGACGGTGTCGCGTGCAACGA
GAATGGCCTGGTCGCTAACATATCTTTACAAGGGAAGGGTCTCTCCGGGAAGATACCGGC
AGCTCTAGGTGGGCTCAAGAGCTTGACTGGGTTGTACCTCCACTTCAACGCCTTGTACGG
AGAGATTCCAGTGGAGATTGCTAGCTTGAGTGAGCTCACTGACTTGTATCTTAACGTGAA
TAACCTCTCTGGAGAGATTCCTTCTCAGATTGGTAACATGACCAGTCTTCAAGGTTGGTT
CTCTTTTATTTATTTATTCATTTTGTTTTTTAACTGGTTGATTTGAAGTATAAGCACTCT
AAGTTGAGCTTAGTGAAGTTAAAAATTAAATTTTTATATATTTCATGATTTATTTGATTT
GATTTTACTAGGAATAAATATTGTACATTGATTTTATTTATCAACTCGTCACATATAGGG
TTACTGGGCCATTTTTTATGGATTTAGTTAGGGACCGCAGCTGGTTTGGTCCTGTCTACA
TAAACCAGTCAAAACCTTAGTTTAAATAAGTCAAAATCACAATCCAGTATGTTTTTTTTT
TTTTTTGGCATTACAGTTTATGTAAATATTAGACAAGAAATTTAAACTCTGTACATTTCA
AGTTTATTGGTGAATATAAGTTGTGAAATTGCACCGAGATTTAATGTGGTCTATTGTTTA
CAGTGGTACAGTTGTGTTACAACAAGTTGACTGGTAGCATACCGACACAGTTGGGATCCC
TAAACAAGCTTAGTGTCCTTGCTTTGCAATATAATCAATTGACTGGTGCAATTCCTGCGA
GTTTGGGGGATTTGGGGTTGTTGACAAGGTTGGATTTGAGCTTCAATAAGCTTTTTGGTT
CAGTTCCTGTTAAATTGGCCAATGCTTCTAATCTGGAAGTTCTAGACATCCGCAACAATT
CGCTCTCTGGCAACGTACCTTCAGGTAATATGGTCTTCATTGATGTGATCCTTCCTTTAT
ATTACTGGCTTTCTCATTTACAATTATAGTGAAATGATTAATATTATTTTCTTGCTTCCT
GTTGAATGGCAATGTAGTTCTTAAGAGACTGAACAGCGGATTTCAATACGAAAACAATGC
ACAGTTATGTGGGGCTGGCTTTTCTAACTTGAAAAATTGCATAGCATCTGATCGGACAGA
TCCGAATAGACCTGAGCCATTCAGACCTAACAGTCTTCCTACTAAGGATATTCCTGAGTC
TGCAAATTTGCCATCTGATTGTAGGCAAAACCGTTGCTCAAGTCCATCCAAAAGTCCACT
TACTGGGGTTGTTTTGGGGGTAGTTGGATTGTTCATTGCTTTGACTGTCACTGGACTCTT
CACATTCACATGGTACCGTCGTCGGAAACAAAAAATTGGGAATGCTTTTGATAGCACAGA
TGGTCGTCTTAGCACTGATCAGGTGAAGGAAGTTTGCAGGAGAAGTGCCTCTCCTCTAAT
CAGTCTTGAATATTCAAATGGGTGGGATCCATTGGCTAAAGGTCAGATTGGAGATGGGTT
TTCACAGGAAGTACTTGAGAGCTTTATGTTTAATTTAGAAGAGGTGGAGCGTGCAACGCA
ATGCTTCTCGGAGATGAATTTGTTGGGAAGGAGTAACTTCTCTGCCATCTACAAGGGGAT
CCTGAGAGATGGGTCGATTGTAGCTATAAAGTGCATTGCCAAGACAAGTTGCAAGTCTGA
TGAAGCAGAGTTTTTGAAGGGGTTGAAGATATTGACATCAGTGAAACATGAAAATCTTGT
GAGGTTGCGAGGTTTTTGCTGTTCAAAAGGCAGAGGCGAGTGCTTCCTCATCTATGATTT
TGTCCCCAATGGAAGCCTGTTGCAGTATCTAGATGTCAAGGATGGCAGTGAAAAGGTCCT
GGAATGGTCTACCAGAATTTCTATCATAAATGGCATTGCCAAAGGTTCGTTTTTTTCTTG
CTAATGGATGTTAAGGAAATTGTTCTATTTCATTTCTGTTTTGTCCTAAGAATTCCCCGT
ATGCACTGATCTACTCTGTGTTTACTGAGGTTTTTGGTCTCTTTCTTATCAGGTATTGGG
TATTTACATGGAAGGAAACCTGGTTTAGTTCACCAGAATCTATCAGCGGAGAAGGTGCTC
ATTGACAGACGATATAACCCCTTTCTTTCAGATTCGGGCCTGCACAAACTTCTAGCAGAT
GACATTGTCTTCTCCATGCTCAAAGCCAGTGCTGCAATGGGATACCTAGCTCCCGAATAC
ACCACTACTGGCCGATTTACTGAAAAGAGCGATATATATGCATTTGGCATGATTGTATTT
CAGATTCTCAGTGGAAAGCGAAATGTCACCCACCTGACCCGCCTTGCAGCAGAGTCATCC
AAAGTTGAAGATCTTGTCGACACAAATCTAAAGGGAAAGTTTTCAGAATCTGAGGCAGCT
AAACTTGGGCGAATTGCGCTGCTTTGCACCCATGAATCTTCTAGCTACAGACCATCCATT
GAAACCATAATGCTGGAACTGAGTGGTTTGGTTGGCAGTTCTTGA