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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI025535 | Chr3 | 2219194 | 2222118 | + | Protein NSP-INTERACTING KINASE 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI025535.m1 | 24 | 64 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 33.8 | 3.30E-08 |
LITCHI025535.m1 | 140 | 199 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 35.1 | 9.30E-09 |
LITCHI025535.m1 | 212 | 231 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10 | 1.3 |
LITCHI025535.m1 | 407 | 665 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 97.2 | 1.10E-27 |
LITCHI025535.m1 | 410 | 667 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 132.8 | 1.40E-38 |
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>LITCHI025535.m1 ATGCCTCCCTTGCTCTACTTGCTTGCTCTTTTACTCTCTCTCTCTCACTGCTCCTTCTCT ACACCTACTACAGAGGTCGACCTCCTCATGCAAATTAAAGACTCGTTGGACCCACAAAAC CGGCTCTTGACTTCGTGGACTCCAAATGCCGACCCATGTAGCGGCGACTCCTTTGACGGT GTCGCGTGCAACGAGAATGGCCTGGTCGCTAACATATCTTTACAAGGGAAGGGTCTCTCC GGGAAGATACCGGCAGCTCTAGGTGGGCTCAAGAGCTTGACTGGGTTGTACCTCCACTTC AACGCCTTGTACGGAGAGATTCCAGTGGAGATTGCTAGCTTGAGTGAGCTCACTGACTTG TATCTTAACGTGAATAACCTCTCTGGAGAGATTCCTTCTCAGATTGGTAACATGACCAGT CTTCAAGTGGTACAGTTGTGTTACAACAAGTTGACTGGTAGCATACCGACACAGTTGGGA TCCCTAAACAAGCTTAGTGTCCTTGCTTTGCAATATAATCAATTGACTGGTGCAATTCCT GCGAGTTTGGGGGATTTGGGGTTGTTGACAAGGTTGGATTTGAGCTTCAATAAGCTTTTT GGTTCAGTTCCTGTTAAATTGGCCAATGCTTCTAATCTGGAAGTTCTAGACATCCGCAAC AATTCGCTCTCTGGCAACGTACCTTCAGTTCTTAAGAGACTGAACAGCGGATTTCAATAC GAAAACAATGCACAGTTATGTGGGGCTGGCTTTTCTAACTTGAAAAATTGCATAGCATCT GATCGGACAGATCCGAATAGACCTGAGCCATTCAGACCTAACAGTCTTCCTACTAAGGAT ATTCCTGAGTCTGCAAATTTGCCATCTGATTGTAGGCAAAACCGTTGCTCAAGTCCATCC AAAAGTCCACTTACTGGGGTTGTTTTGGGGGTAGTTGGATTGTTCATTGCTTTGACTGTC ACTGGACTCTTCACATTCACATGGTACCGTCGTCGGAAACAAAAAATTGGGAATGCTTTT GATAGCACAGATGGTCGTCTTAGCACTGATCAGGTGAAGGAAGTTTGCAGGAGAAGTGCC TCTCCTCTAATCAGTCTTGAATATTCAAATGGGTGGGATCCATTGGCTAAAGGTCAGATT GGAGATGGGTTTTCACAGGAAGTACTTGAGAGCTTTATGTTTAATTTAGAAGAGGTGGAG CGTGCAACGCAATGCTTCTCGGAGATGAATTTGTTGGGAAGGAGTAACTTCTCTGCCATC TACAAGGGGATCCTGAGAGATGGGTCGATTGTAGCTATAAAGTGCATTGCCAAGACAAGT TGCAAGTCTGATGAAGCAGAGTTTTTGAAGGGGTTGAAGATATTGACATCAGTGAAACAT GAAAATCTTGTGAGGTTGCGAGGTTTTTGCTGTTCAAAAGGCAGAGGCGAGTGCTTCCTC ATCTATGATTTTGTCCCCAATGGAAGCCTGTTGCAGTATCTAGATGTCAAGGATGGCAGT GAAAAGGTCCTGGAATGGTCTACCAGAATTTCTATCATAAATGGCATTGCCAAAGGTATT GGGTATTTACATGGAAGGAAACCTGGTTTAGTTCACCAGAATCTATCAGCGGAGAAGGTG CTCATTGACAGACGATATAACCCCTTTCTTTCAGATTCGGGCCTGCACAAACTTCTAGCA GATGACATTGTCTTCTCCATGCTCAAAGCCAGTGCTGCAATGGGATACCTAGCTCCCGAA TACACCACTACTGGCCGATTTACTGAAAAGAGCGATATATATGCATTTGGCATGATTGTA TTTCAGATTCTCAGTGGAAAGCGAAATGTCACCCACCTGACCCGCCTTGCAGCAGAGTCA TCCAAAGTTGAAGATCTTGTCGACACAAATCTAAAGGGAAAGTTTTCAGAATCTGAGGCA GCTAAACTTGGGCGAATTGCGCTGCTTTGCACCCATGAATCTTCTAGCTACAGACCATCC ATTGAAACCATAATGCTGGAACTGAGTGGTTTGGTTGGCAGTTCTTGA
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>LITCHI025535.m1 MPPLLYLLALLLSLSHCSFSTPTTEVDLLMQIKDSLDPQNRLLTSWTPNADPCSGDSFDG VACNENGLVANISLQGKGLSGKIPAALGGLKSLTGLYLHFNALYGEIPVEIASLSELTDL YLNVNNLSGEIPSQIGNMTSLQVVQLCYNKLTGSIPTQLGSLNKLSVLALQYNQLTGAIP ASLGDLGLLTRLDLSFNKLFGSVPVKLANASNLEVLDIRNNSLSGNVPSVLKRLNSGFQY ENNAQLCGAGFSNLKNCIASDRTDPNRPEPFRPNSLPTKDIPESANLPSDCRQNRCSSPS KSPLTGVVLGVVGLFIALTVTGLFTFTWYRRRKQKIGNAFDSTDGRLSTDQVKEVCRRSA SPLISLEYSNGWDPLAKGQIGDGFSQEVLESFMFNLEEVERATQCFSEMNLLGRSNFSAI YKGILRDGSIVAIKCIAKTSCKSDEAEFLKGLKILTSVKHENLVRLRGFCCSKGRGECFL IYDFVPNGSLLQYLDVKDGSEKVLEWSTRISIINGIAKGIGYLHGRKPGLVHQNLSAEKV LIDRRYNPFLSDSGLHKLLADDIVFSMLKASAAMGYLAPEYTTTGRFTEKSDIYAFGMIV FQILSGKRNVTHLTRLAAESSKVEDLVDTNLKGKFSESEAAKLGRIALLCTHESSSYRPS IETIMLELSGLVGSS.
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>LITCHI025535.m1 AAACCGTATAACTGCAAAGCACCGTAAAATTTTAACCGGATAGAGAAAGAGAGAGAGAGA GAGAATCTGGACACTGTACTTTGTATTTAATACTTTTAACAAGCACTAACTCAAACCCAG TTTCGAAGTCATTCACGATCAGAAGTTACACAACTTCAAATCTCAGACCAGACACATTTT CCCACAGTTTCTCTCTGAGTTTCCTTCAGTTTCTCGCCAGCCAAACATGCCTCCCTTGCT CTACTTGCTTGCTCTTTTACTCTCTCTCTCTCACTGCTCCTTCTCTACACCTACTACAGA GGTCGACCTCCTCATGCAAATTAAAGACTCGTTGGACCCACAAAACCGGCTCTTGACTTC GTGGACTCCAAATGCCGACCCATGTAGCGGCGACTCCTTTGACGGTGTCGCGTGCAACGA GAATGGCCTGGTCGCTAACATATCTTTACAAGGGAAGGGTCTCTCCGGGAAGATACCGGC AGCTCTAGGTGGGCTCAAGAGCTTGACTGGGTTGTACCTCCACTTCAACGCCTTGTACGG AGAGATTCCAGTGGAGATTGCTAGCTTGAGTGAGCTCACTGACTTGTATCTTAACGTGAA TAACCTCTCTGGAGAGATTCCTTCTCAGATTGGTAACATGACCAGTCTTCAAGTGGTACA GTTGTGTTACAACAAGTTGACTGGTAGCATACCGACACAGTTGGGATCCCTAAACAAGCT TAGTGTCCTTGCTTTGCAATATAATCAATTGACTGGTGCAATTCCTGCGAGTTTGGGGGA TTTGGGGTTGTTGACAAGGTTGGATTTGAGCTTCAATAAGCTTTTTGGTTCAGTTCCTGT TAAATTGGCCAATGCTTCTAATCTGGAAGTTCTAGACATCCGCAACAATTCGCTCTCTGG CAACGTACCTTCAGTTCTTAAGAGACTGAACAGCGGATTTCAATACGAAAACAATGCACA GTTATGTGGGGCTGGCTTTTCTAACTTGAAAAATTGCATAGCATCTGATCGGACAGATCC GAATAGACCTGAGCCATTCAGACCTAACAGTCTTCCTACTAAGGATATTCCTGAGTCTGC AAATTTGCCATCTGATTGTAGGCAAAACCGTTGCTCAAGTCCATCCAAAAGTCCACTTAC TGGGGTTGTTTTGGGGGTAGTTGGATTGTTCATTGCTTTGACTGTCACTGGACTCTTCAC ATTCACATGGTACCGTCGTCGGAAACAAAAAATTGGGAATGCTTTTGATAGCACAGATGG TCGTCTTAGCACTGATCAGGTGAAGGAAGTTTGCAGGAGAAGTGCCTCTCCTCTAATCAG TCTTGAATATTCAAATGGGTGGGATCCATTGGCTAAAGGTCAGATTGGAGATGGGTTTTC ACAGGAAGTACTTGAGAGCTTTATGTTTAATTTAGAAGAGGTGGAGCGTGCAACGCAATG CTTCTCGGAGATGAATTTGTTGGGAAGGAGTAACTTCTCTGCCATCTACAAGGGGATCCT GAGAGATGGGTCGATTGTAGCTATAAAGTGCATTGCCAAGACAAGTTGCAAGTCTGATGA AGCAGAGTTTTTGAAGGGGTTGAAGATATTGACATCAGTGAAACATGAAAATCTTGTGAG GTTGCGAGGTTTTTGCTGTTCAAAAGGCAGAGGCGAGTGCTTCCTCATCTATGATTTTGT CCCCAATGGAAGCCTGTTGCAGTATCTAGATGTCAAGGATGGCAGTGAAAAGGTCCTGGA ATGGTCTACCAGAATTTCTATCATAAATGGCATTGCCAAAGGTATTGGGTATTTACATGG AAGGAAACCTGGTTTAGTTCACCAGAATCTATCAGCGGAGAAGGTGCTCATTGACAGACG ATATAACCCCTTTCTTTCAGATTCGGGCCTGCACAAACTTCTAGCAGATGACATTGTCTT CTCCATGCTCAAAGCCAGTGCTGCAATGGGATACCTAGCTCCCGAATACACCACTACTGG CCGATTTACTGAAAAGAGCGATATATATGCATTTGGCATGATTGTATTTCAGATTCTCAG TGGAAAGCGAAATGTCACCCACCTGACCCGCCTTGCAGCAGAGTCATCCAAAGTTGAAGA TCTTGTCGACACAAATCTAAAGGGAAAGTTTTCAGAATCTGAGGCAGCTAAACTTGGGCG AATTGCGCTGCTTTGCACCCATGAATCTTCTAGCTACAGACCATCCATTGAAACCATAAT GCTGGAACTGAGTGGTTTGGTTGGCAGTTCTTGA
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>LITCHI025535.m1 + Up_Stream_Len 2000 TATTACAAGACAAACAATCATAAAAACTCAAGTTCACATGATGCCTAAAAATGGGTCCTT AATAATCATCATGGACAATCAGAGATTTCCAACGAATGGCACGAATTGATCGTGTCTGAT CAAAGTATTCAAAATAAAACCGATAAAAGGATGGTAAGATCACACTAGATATAAAGAAAA GTTCACATGTGCAACTGTTGACGGTAGTAGGGCACATTTGGGTACAAATCAGTGGATTTT TCAATTTTCAATCTCCCTTTCTTAGCTGGTTTGTTTGGTTTGGTTTTAAAGTCGCCAGTT GCTGTCAAGGCTGCGACCATATTTGACTAGTACAAAGCAGCCATAATTTCACTACTCTGC ATCATTCCCTATCAAAGAGGAATGATGCGAAAAAGCCCATCTTTATTTCTCGCATTCGAA GTATGGTATCATACTCTTTCTTGAAAGTGACAATCTCCTAACTCATTTCTGAATTTTTTA TTTTTATATATTTTTTTCATAAAGTAAACATAATGAAAGACTTGAAAATAACAATTTTAC ACCTGTAGTATACTATAAGAAAGGAGTTTCATGATGGCTTCGTTAAATGTCTAGTTATAG TTATTGTTTTTGAGATTTATGAGTTTGAACATAAATTATACACGTGAAAGTCAACATTGT ATATATCATGATTTGTTGTACAATTTATTAAATAGAATAATAAATTTACTAAAACGCATC AATTTTTTATTAAGAGAATGTATTCAATTTAAGATTTTATTAGAATGTAAAGGATTTTAA AAGTTTGGATATAATCAATCCAAATTTGAATGGATTTCATTGAAACTTAGGTGCATTTAA TCTAAATTTATATGAAAATCATTAAAATCAGGTTTATTAAATTCATATTTGTATGAAATC TTATAAAACATAGATATATTTAAAAAGTTATTGACTTCATATATTTTATTTCAAACGATG GATTTAAATGAATTTTGATAAAATTTAAAATAATTTTTACAAATAAAAGTTTATAACAAA CCTTACCATTCTCTTTAAGATTTTGTGAATTTTTTAAATAATTCCAACAAAACCAATATG AATTCCAGATTTTAGTGGATTTCTAATTCTAACAAAATCAATCAAGATTTTGCTGGATTT TTTAAAGAATTCTAATAAAATTAATATGAAGTTTATAAAATCTATAAATTTCATCCATAT CTATTATTTAAAAAAAAATCATAAAACTCAAAAAAAAGCTCTAAATTAAATATATATTTT TAAAGAATTTTATAATTTTACTAGGATTTGTAAAACAATTAAGTTTATCGTGAGATGCAT AAAATTAAACATAAAATTATAATATATATGCATATAAAATTCAACATCAACAATCAATAT ACATATTAACAATGGTCGATGTAACACATAATACTCATTGAATATTAAATTTATCTAAAA CAGGATCAAAACCCGCAAAACATGTGGGGAAATCCAAATAAAGAAAATTCAAATTTTGAA GCATGCTAGGTGTACTGACACTGTGAAACGCACATACTGTATCAATAATTGCAGCAGAGA TTTTCTCCTGTATTTTTTTTTTTTCTATTAAAAGTAATCAAATCAATCAAACACACCGCT TAAGATCCGCCAGCTTCCACAACAAACCCATCATCACGTGTTCGGACCCCCATACAAAAG TTGGGACCCCCCACCTTTGCAATGGTCATGATTTACTCTCTTTTAAACCATAGGGACCCA CCCATTTTTTCAAAAATCCCCTACCTAACCCAAAAAACCGTATAACTGCAAAGCACCGTA AAATTTTAACCGGATAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAATCTGGACACTGTACTTTGTAT TTAATACTTTTAACAAGCACTAACTCAAACCCAGTTTCGAAGTCATTCACGATCAGAAGT TACACAACTTCAAATCTCAGACCAGACACATTTTCCCACAGTTTCTCTCTGAGTTTCCTT CAGTTTCTCGCCAGCCAAAC
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>LITCHI025535.m1 GenomeSequence + AAACCGTATAACTGCAAAGCACCGTAAAATTTTAACCGGATAGAGAAAGAGAGAGAGAGA GAGAATCTGGACACTGTACTTTGTATTTAATACTTTTAACAAGCACTAACTCAAACCCAG TTTCGAAGTCATTCACGATCAGAAGTTACACAACTTCAAATCTCAGACCAGACACATTTT CCCACAGTTTCTCTCTGAGTTTCCTTCAGTTTCTCGCCAGCCAAACATGCCTCCCTTGCT CTACTTGCTTGCTCTTTTACTCTCTCTCTCTCACTGCTCCTTCTCTACACCTACTACAGA GGTCGACCTCCTCATGCAAATTAAAGACTCGTTGGACCCACAAAACCGGCTCTTGACTTC GTGGACTCCAAATGCCGACCCATGTAGCGGCGACTCCTTTGACGGTGTCGCGTGCAACGA GAATGGCCTGGTCGCTAACATATCTTTACAAGGGAAGGGTCTCTCCGGGAAGATACCGGC AGCTCTAGGTGGGCTCAAGAGCTTGACTGGGTTGTACCTCCACTTCAACGCCTTGTACGG AGAGATTCCAGTGGAGATTGCTAGCTTGAGTGAGCTCACTGACTTGTATCTTAACGTGAA TAACCTCTCTGGAGAGATTCCTTCTCAGATTGGTAACATGACCAGTCTTCAAGGTTGGTT CTCTTTTATTTATTTATTCATTTTGTTTTTTAACTGGTTGATTTGAAGTATAAGCACTCT AAGTTGAGCTTAGTGAAGTTAAAAATTAAATTTTTATATATTTCATGATTTATTTGATTT GATTTTACTAGGAATAAATATTGTACATTGATTTTATTTATCAACTCGTCACATATAGGG TTACTGGGCCATTTTTTATGGATTTAGTTAGGGACCGCAGCTGGTTTGGTCCTGTCTACA TAAACCAGTCAAAACCTTAGTTTAAATAAGTCAAAATCACAATCCAGTATGTTTTTTTTT TTTTTTGGCATTACAGTTTATGTAAATATTAGACAAGAAATTTAAACTCTGTACATTTCA AGTTTATTGGTGAATATAAGTTGTGAAATTGCACCGAGATTTAATGTGGTCTATTGTTTA CAGTGGTACAGTTGTGTTACAACAAGTTGACTGGTAGCATACCGACACAGTTGGGATCCC TAAACAAGCTTAGTGTCCTTGCTTTGCAATATAATCAATTGACTGGTGCAATTCCTGCGA GTTTGGGGGATTTGGGGTTGTTGACAAGGTTGGATTTGAGCTTCAATAAGCTTTTTGGTT CAGTTCCTGTTAAATTGGCCAATGCTTCTAATCTGGAAGTTCTAGACATCCGCAACAATT CGCTCTCTGGCAACGTACCTTCAGGTAATATGGTCTTCATTGATGTGATCCTTCCTTTAT ATTACTGGCTTTCTCATTTACAATTATAGTGAAATGATTAATATTATTTTCTTGCTTCCT GTTGAATGGCAATGTAGTTCTTAAGAGACTGAACAGCGGATTTCAATACGAAAACAATGC ACAGTTATGTGGGGCTGGCTTTTCTAACTTGAAAAATTGCATAGCATCTGATCGGACAGA TCCGAATAGACCTGAGCCATTCAGACCTAACAGTCTTCCTACTAAGGATATTCCTGAGTC TGCAAATTTGCCATCTGATTGTAGGCAAAACCGTTGCTCAAGTCCATCCAAAAGTCCACT TACTGGGGTTGTTTTGGGGGTAGTTGGATTGTTCATTGCTTTGACTGTCACTGGACTCTT CACATTCACATGGTACCGTCGTCGGAAACAAAAAATTGGGAATGCTTTTGATAGCACAGA TGGTCGTCTTAGCACTGATCAGGTGAAGGAAGTTTGCAGGAGAAGTGCCTCTCCTCTAAT CAGTCTTGAATATTCAAATGGGTGGGATCCATTGGCTAAAGGTCAGATTGGAGATGGGTT TTCACAGGAAGTACTTGAGAGCTTTATGTTTAATTTAGAAGAGGTGGAGCGTGCAACGCA ATGCTTCTCGGAGATGAATTTGTTGGGAAGGAGTAACTTCTCTGCCATCTACAAGGGGAT CCTGAGAGATGGGTCGATTGTAGCTATAAAGTGCATTGCCAAGACAAGTTGCAAGTCTGA TGAAGCAGAGTTTTTGAAGGGGTTGAAGATATTGACATCAGTGAAACATGAAAATCTTGT GAGGTTGCGAGGTTTTTGCTGTTCAAAAGGCAGAGGCGAGTGCTTCCTCATCTATGATTT TGTCCCCAATGGAAGCCTGTTGCAGTATCTAGATGTCAAGGATGGCAGTGAAAAGGTCCT GGAATGGTCTACCAGAATTTCTATCATAAATGGCATTGCCAAAGGTTCGTTTTTTTCTTG CTAATGGATGTTAAGGAAATTGTTCTATTTCATTTCTGTTTTGTCCTAAGAATTCCCCGT ATGCACTGATCTACTCTGTGTTTACTGAGGTTTTTGGTCTCTTTCTTATCAGGTATTGGG TATTTACATGGAAGGAAACCTGGTTTAGTTCACCAGAATCTATCAGCGGAGAAGGTGCTC ATTGACAGACGATATAACCCCTTTCTTTCAGATTCGGGCCTGCACAAACTTCTAGCAGAT GACATTGTCTTCTCCATGCTCAAAGCCAGTGCTGCAATGGGATACCTAGCTCCCGAATAC ACCACTACTGGCCGATTTACTGAAAAGAGCGATATATATGCATTTGGCATGATTGTATTT CAGATTCTCAGTGGAAAGCGAAATGTCACCCACCTGACCCGCCTTGCAGCAGAGTCATCC AAAGTTGAAGATCTTGTCGACACAAATCTAAAGGGAAAGTTTTCAGAATCTGAGGCAGCT AAACTTGGGCGAATTGCGCTGCTTTGCACCCATGAATCTTCTAGCTACAGACCATCCATT GAAACCATAATGCTGGAACTGAGTGGTTTGGTTGGCAGTTCTTGA