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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI025478 | Chr3 | 1826068 | 1829498 | - | Scarecrow-like protein 6 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI025478.m1 | 201 | 341 | PF03514.17 | GRAS | Family | 142.1 | 2.30E-41 |
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>LITCHI025478.m1 ATGGCAACAGCTGCAATTGTGAAAGCAAATTCACTGCTTTTGTCGAAGCGGAATGAAAGC CCTCATATCAACCTTTTTTACAATAACTCTGTCAAATTTAGCAGATGCTTTGATGGTAGG CTGAATACTTGGACTTTAGGTGCAACAAGCAAGAATAAGATTGTTGCTCCTTTAATAAAA ATAGGGAACGAGATTGCTGCTCTCACTAGTTCAGAACAAAATCTAAAGGCAGAGATGTCG GATTCTCTCCATTCTAGGAGTGATTGTATCCTTACTAGGTGTGATTGTTTTTACTGTGCA CATGCAAAGTCGAAAATTAAGACGGATGCTGTAGGAACGGCATTCGTAGCTACTTTGTTG ACTGCTGTGGCTGTGCTATACATAGTGCATAAGATAGTGGAAGGGACAAAAGCATGCCTC TTCAAGATCAAGCGGCTTTTTTATCATCTCGTGATGAAATTAAAGCAGTTATGCGGGATT GTTCCACCTGTTGATGAAACTCTTAAGGAAACTATAGAGACTATTCCAGAACGCCATGTT GAAAATAACTCCAACGAAGAGGATAATTATCGTAAAGCAGAACTGGAGCAGTCCAATGAT TTGATACATAAGCTTGGTCAGCAAATCAAAAATCATAACCAGCTCTCACCTATTGGTAAG CCTTTTCAAAGGGCTGCTTTTTACTTCAAGGAGGCCTTGCAGTCACTTCTCCCCATCAAC ACCACTAATTCTGCTAGTGCAGCTTTCTCTAGTTTCAGTGTTATTTTCAAGATTGGTGCT TATAAGTCTTTCTCTGAAATATCGCCTATACTTCAATTTGCTAATTTCACTTGTAACCAA GCACTTCTTGAGGCATTTGAAGGGTGTGATAGAATTCACATTATAGATTTCGATATTGGT TATGGAGGGCAGTGGGCTTCTCTTATGCAAGAGCTTGTTTTGAGGAACGAGGGTCCTCCT TCGCTTAGGATCACAGCATTTGCTTCCCCGTCCACACATGACGAGCTCGAGCTCTTTACA CAGGAGAATCTTAAACACTAG
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>LITCHI025478.m1 MATAAIVKANSLLLSKRNESPHINLFYNNSVKFSRCFDGRLNTWTLGATSKNKIVAPLIK IGNEIAALTSSEQNLKAEMSDSLHSRSDCILTRCDCFYCAHAKSKIKTDAVGTAFVATLL TAVAVLYIVHKIVEGTKACLFKIKRLFYHLVMKLKQLCGIVPPVDETLKETIETIPERHV ENNSNEEDNYRKAELEQSNDLIHKLGQQIKNHNQLSPIGKPFQRAAFYFKEALQSLLPIN TTNSASAAFSSFSVIFKIGAYKSFSEISPILQFANFTCNQALLEAFEGCDRIHIIDFDIG YGGQWASLMQELVLRNEGPPSLRITAFASPSTHDELELFTQENLKH.
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>LITCHI025478.m1 AGCCGACACAACAGACCCCCACACCCCACCACACCCAACTCAGCTGCACCACTCACTCCG CCTAGACGCTCGCCCTCGCCGTTCGTCGTTCTTGTCTCCGTTGACCGTTCGATTACGGAA TAATTTTCTGGTAGCTGGAACCACCCTGAAGTTTTGGTGTAGTTCATCTGCAAACCGAAT CGATTATGTCGGACCTAGTTGGTTTTTCATAGTCAAAATCGACCCGACCTGTATGCACCC CTAGTTGTATGTGCGAGGGTTCTAATATTATATTAATCATCAGACTTGACAATCTAGCCC CACATAACCAAATTCCCTATATCTGACCTAGTTACAATTATCTAATTCTTGTCATGGCAA CAGCTGCAATTGTGAAAGCAAATTCACTGCTTTTGTCGAAGCGGAATGAAAGCCCTCATA TCAACCTTTTTTACAATAACTCTGTCAAATTTAGCAGATGCTTTGATGGTAGGCTGAATA CTTGGACTTTAGGTGCAACAAGCAAGAATAAGATTGTTGCTCCTTTAATAAAAATAGGGA ACGAGATTGCTGCTCTCACTAGTTCAGAACAAAATCTAAAGGCAGAGATGTCGGATTCTC TCCATTCTAGGAGTGATTGTATCCTTACTAGGTGTGATTGTTTTTACTGTGCACATGCAA AGTCGAAAATTAAGACGGATGCTGTAGGAACGGCATTCGTAGCTACTTTGTTGACTGCTG TGGCTGTGCTATACATAGTGCATAAGATAGTGGAAGGGACAAAAGCATGCCTCTTCAAGA TCAAGCGGCTTTTTTATCATCTCGTGATGAAATTAAAGCAGTTATGCGGGATTGTTCCAC CTGTTGATGAAACTCTTAAGGAAACTATAGAGACTATTCCAGAACGCCATGTTGAAAATA ACTCCAACGAAGAGGATAATTATCGTAAAGCAGAACTGGAGCAGTCCAATGATTTGATAC ATAAGCTTGGTCAGCAAATCAAAAATCATAACCAGCTCTCACCTATTGGTAAGCCTTTTC AAAGGGCTGCTTTTTACTTCAAGGAGGCCTTGCAGTCACTTCTCCCCATCAACACCACTA ATTCTGCTAGTGCAGCTTTCTCTAGTTTCAGTGTTATTTTCAAGATTGGTGCTTATAAGT CTTTCTCTGAAATATCGCCTATACTTCAATTTGCTAATTTCACTTGTAACCAAGCACTTC TTGAGGCATTTGAAGGGTGTGATAGAATTCACATTATAGATTTCGATATTGGTTATGGAG GGCAGTGGGCTTCTCTTATGCAAGAGCTTGTTTTGAGGAACGAGGGTCCTCCTTCGCTTA GGATCACAGCATTTGCTTCCCCGTCCACACATGACGAGCTCGAGCTCTTTACACAGGAGA ATCTTAAACACTAG
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>LITCHI004487.m5 - Up_Stream_Len 2000 GTTAACAATGAAAATAAAATAAATTTAATGTTGAAAATATAAAATGTAAGGATATTTATA TCCATAGAAGCGATAATTCAATAGACTAGTTTCTTTAGTTGTAATATTATCAAACCATCA AATTTAACTAAAAATGATCTAAAATAAAAATTATATTGTAATAAATTTATAAAAGCAGCT GCACGTACATATTTTTTTATTTATTTTTATATTAAAAATTTTAAAATTAGTGAATTTATA TGAAAAGCAAAAGGAAAGGATATATATAAGTAATATAAATGATAACATTAAAAATCTATT ACATTCCTGTTGATAATGCACAAGAACTAAATTTGGATATGTTATCTACAAAAGAAAATC TTTATACAATTTTAAAAATATATTAAATTACAAAATTATTCCTCTAAAATTACTAAAGTA ACTCACTAAATCATTTAATCCAAAAGTACCAAACTAACTTATAACTTGTAAGTTTGGTCA TGATAATAATATAAACAAATGTTTTGCTTGGCAATTTCTATTGCTGTTTGATTCTCAAAA TGTGTACCAACACGGCAACACCACTATCTTTTGTCTTTAAATCTCTTTTTTATTTTTATT TTTTGAAGAGTTTTGTCTTTAAATCTTGTTTTCGAAAAGGTTTTTCTTTTTCTTTTTTTT TTTAAATAAATTAATGCTTTCTCCAGAGAACATTATAATAAGGGTTAAAGTTACATCAAC TTAAATTTCAACTAATGAAGAAGCTTCCTGCATATAATTTTCTATTAGGAGAATAACTAT GAGCAACAAAGAGCACAAAAGCATCCACAGCATAAACATTTTCTTGAATAAGAGGTCTTA ATGTTTAGATTTTGCTTCCATGGCGTAATTTTGTACGGGCAGTGATTGAAAAATCAATTC TGTTATAGAATCTGCCATGAAACCTGTGGCACGACCAACTTCCTCTTTCTGAACCTGCAA CGGTCACAGCCCTCTACGGAATTTCTGTTAAGCTAGAAGTTGAAAATGAGGGCATTCCTT TATATGATAGTTCAAATTTTTTATGTATGACAGTTATTAATACTGTATCTAAGCACTTTT GACAATTAATTTAGTGGTGCCAATACAGTCTCAACAATCAAGCCTTGTACATCACAAGTG TTAGAACATGATATGTTCATTCCAGTTGAAACCTTCTAAATCAAACAGAGATGCATTCTG TAATGACTGAATAGATGCTTTCATGATACAGCCATCACTTCAGAAATTGGCAGTTAGTTT CCTATAAGATTCCAAGTCTCGGAAAAAATTGTGTACCTGTCAGAAACTTTTAATTGGAAG CCTGAGAAGTGAACGGAATAGCGATGGTGAAGGACTATAACCCCTCCAGGATTTTAAATT TGTAAATACTACCCATAAAATTATCCTGAACTTAAATTCCGATGAATATTTCACGGTCCT GTGGATCCCCTCGCCATGGATAGGATAATCGATGACTGGGTCATTTCTACACTTGGTTGT TAACAAAATTTTCTAGGAATGACCACACAGGGACCACAGCCAACTCCAATGTCAGAAACA TTTTAACATCTGCATTATGCCAAATTACAGGTTGTCAATCTTTAACGCAAATGATTTTCA AAGGCAACAGGACAACTGGTATTTGTCATCGTAAAAATGATTAATGTTGTCAACCAACTA GCAGGGCGGAACAGAAAAACCAATTTACAAAAACTCACATGTATCTATATGTAATATTTT TGGGACACCCCGCCCCCCACCAAAATTCGTGCTTTATAGATCAGTATGTGAAGGAAAAGC AAAGCTATCTTTTAAAGCAAAGCAGTTTGAACCATGGTCTCATAGCACAAGAGAAGCGGA CACACACCAAAGGGTGGGCACCACCGCACCACACACCAATAAAAAGTACCTATAAATATA AAAGTGAAGCCATTTTTTATGTAGAGAACACCAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAACCCTCAA TTGCTGTCCATGTTTGTTTC >LITCHI004487.m4 - Up_Stream_Len 2000 GTTAACAATGAAAATAAAATAAATTTAATGTTGAAAATATAAAATGTAAGGATATTTATA TCCATAGAAGCGATAATTCAATAGACTAGTTTCTTTAGTTGTAATATTATCAAACCATCA AATTTAACTAAAAATGATCTAAAATAAAAATTATATTGTAATAAATTTATAAAAGCAGCT GCACGTACATATTTTTTTATTTATTTTTATATTAAAAATTTTAAAATTAGTGAATTTATA TGAAAAGCAAAAGGAAAGGATATATATAAGTAATATAAATGATAACATTAAAAATCTATT ACATTCCTGTTGATAATGCACAAGAACTAAATTTGGATATGTTATCTACAAAAGAAAATC TTTATACAATTTTAAAAATATATTAAATTACAAAATTATTCCTCTAAAATTACTAAAGTA ACTCACTAAATCATTTAATCCAAAAGTACCAAACTAACTTATAACTTGTAAGTTTGGTCA TGATAATAATATAAACAAATGTTTTGCTTGGCAATTTCTATTGCTGTTTGATTCTCAAAA TGTGTACCAACACGGCAACACCACTATCTTTTGTCTTTAAATCTCTTTTTTATTTTTATT TTTTGAAGAGTTTTGTCTTTAAATCTTGTTTTCGAAAAGGTTTTTCTTTTTCTTTTTTTT TTTAAATAAATTAATGCTTTCTCCAGAGAACATTATAATAAGGGTTAAAGTTACATCAAC TTAAATTTCAACTAATGAAGAAGCTTCCTGCATATAATTTTCTATTAGGAGAATAACTAT GAGCAACAAAGAGCACAAAAGCATCCACAGCATAAACATTTTCTTGAATAAGAGGTCTTA ATGTTTAGATTTTGCTTCCATGGCGTAATTTTGTACGGGCAGTGATTGAAAAATCAATTC TGTTATAGAATCTGCCATGAAACCTGTGGCACGACCAACTTCCTCTTTCTGAACCTGCAA CGGTCACAGCCCTCTACGGAATTTCTGTTAAGCTAGAAGTTGAAAATGAGGGCATTCCTT TATATGATAGTTCAAATTTTTTATGTATGACAGTTATTAATACTGTATCTAAGCACTTTT GACAATTAATTTAGTGGTGCCAATACAGTCTCAACAATCAAGCCTTGTACATCACAAGTG TTAGAACATGATATGTTCATTCCAGTTGAAACCTTCTAAATCAAACAGAGATGCATTCTG TAATGACTGAATAGATGCTTTCATGATACAGCCATCACTTCAGAAATTGGCAGTTAGTTT CCTATAAGATTCCAAGTCTCGGAAAAAATTGTGTACCTGTCAGAAACTTTTAATTGGAAG CCTGAGAAGTGAACGGAATAGCGATGGTGAAGGACTATAACCCCTCCAGGATTTTAAATT TGTAAATACTACCCATAAAATTATCCTGAACTTAAATTCCGATGAATATTTCACGGTCCT GTGGATCCCCTCGCCATGGATAGGATAATCGATGACTGGGTCATTTCTACACTTGGTTGT TAACAAAATTTTCTAGGAATGACCACACAGGGACCACAGCCAACTCCAATGTCAGAAACA TTTTAACATCTGCATTATGCCAAATTACAGGTTGTCAATCTTTAACGCAAATGATTTTCA AAGGCAACAGGACAACTGGTATTTGTCATCGTAAAAATGATTAATGTTGTCAACCAACTA GCAGGGCGGAACAGAAAAACCAATTTACAAAAACTCACATGTATCTATATGTAATATTTT TGGGACACCCCGCCCCCCACCAAAATTCGTGCTTTATAGATCAGTATGTGAAGGAAAAGC AAAGCTATCTTTTAAAGCAAAGCAGTTTGAACCATGGTCTCATAGCACAAGAGAAGCGGA CACACACCAAAGGGTGGGCACCACCGCACCACACACCAATAAAAAGTACCTATAAATATA AAAGTGAAGCCATTTTTTATGTAGAGAACACCAAAAAAGGAAAAAAAAAAAAACCCTCAA TTGCTGTCCATGTTTGTTTC >LITCHI004487.m6 - 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>LITCHI004487.m5 GenomeSequence - AAAAAAGGAAAAAAAAAAAAACCCTCAATTGCTGTCCATGTTTGTTTCATGTTTCTTTTG TCACAGACTGACCCTAGAACATTTTCTCTCTTCTCTGCAGATCCATTTTTGTGTCTGCCT CTCTCTATCTGTCTCTGGCTAGTAAGTTTATTTGACTATCTTTACTTGTTTTGCTTATAT CTTATGTGGGCATGGATTATGTGTATGTTTTGCGTAATAGTTTTTGATGATGCTGTTGAA GTTTTTATAAACTGGGTTGTTCTTAATTCGATTGATTAACTTATGGAAACATTATTTTTC TGTTGTTTTTGTTGTTGTTGCAGATTATGGAATTTGAAAAAGGTGTACTGCTCTTTTCAC CCATTGGTTAAATTCAGTTACTTTAAATTTAACTCTATGAAAAAAGTCATGCATTGTGAT ATATGTGTAGTGTTGACAATTGAGACCATGTAATGATACTTGGAAGAATATGGTATATTC AATTTATTTCAGTCTTAATAACAACTCCCATTTGGAATGATATATGCTCTTGATTTTGTA GTTTTCTGATTATTTAATATTCTATCATAGTCACAAACACAAATTTATATATTACCTATT AAAGGTAAATTTTTGAGTCCATATTATAGAAGATTGTAACTGGACACATTGGAGGCTTGA TGTATTGGATGTGGGTTCATTTTGAAGCATGAAATTAGTTTCATATTTAGTTACATTATA TATATTATTGGTAACTACTAATTTAATTTTCTGTTTTCAATTTGATTTTTAGTTTGTCTT TACTGTTTTGAAGATAATTTGATTGTATTATATTGGTTTAATTTTGATAGACTTTCTATT TATTAAACTTGGAAGGAATTGATTCTGATATAAGTAAAAATTAGATTAATTAATTCATTT 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