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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI025478 | Chr3 | 1826068 | 1829498 | - | Scarecrow-like protein 6 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI025478.m1 | 201 | 341 | PF03514.17 | GRAS | Family | 142.1 | 2.30E-41 |
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>LITCHI025478.m1 ATGGCAACAGCTGCAATTGTGAAAGCAAATTCACTGCTTTTGTCGAAGCGGAATGAAAGC CCTCATATCAACCTTTTTTACAATAACTCTGTCAAATTTAGCAGATGCTTTGATGGTAGG CTGAATACTTGGACTTTAGGTGCAACAAGCAAGAATAAGATTGTTGCTCCTTTAATAAAA ATAGGGAACGAGATTGCTGCTCTCACTAGTTCAGAACAAAATCTAAAGGCAGAGATGTCG GATTCTCTCCATTCTAGGAGTGATTGTATCCTTACTAGGTGTGATTGTTTTTACTGTGCA CATGCAAAGTCGAAAATTAAGACGGATGCTGTAGGAACGGCATTCGTAGCTACTTTGTTG ACTGCTGTGGCTGTGCTATACATAGTGCATAAGATAGTGGAAGGGACAAAAGCATGCCTC TTCAAGATCAAGCGGCTTTTTTATCATCTCGTGATGAAATTAAAGCAGTTATGCGGGATT GTTCCACCTGTTGATGAAACTCTTAAGGAAACTATAGAGACTATTCCAGAACGCCATGTT GAAAATAACTCCAACGAAGAGGATAATTATCGTAAAGCAGAACTGGAGCAGTCCAATGAT TTGATACATAAGCTTGGTCAGCAAATCAAAAATCATAACCAGCTCTCACCTATTGGTAAG CCTTTTCAAAGGGCTGCTTTTTACTTCAAGGAGGCCTTGCAGTCACTTCTCCCCATCAAC ACCACTAATTCTGCTAGTGCAGCTTTCTCTAGTTTCAGTGTTATTTTCAAGATTGGTGCT TATAAGTCTTTCTCTGAAATATCGCCTATACTTCAATTTGCTAATTTCACTTGTAACCAA GCACTTCTTGAGGCATTTGAAGGGTGTGATAGAATTCACATTATAGATTTCGATATTGGT TATGGAGGGCAGTGGGCTTCTCTTATGCAAGAGCTTGTTTTGAGGAACGAGGGTCCTCCT TCGCTTAGGATCACAGCATTTGCTTCCCCGTCCACACATGACGAGCTCGAGCTCTTTACA CAGGAGAATCTTAAACACTAG
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>LITCHI025478.m1 MATAAIVKANSLLLSKRNESPHINLFYNNSVKFSRCFDGRLNTWTLGATSKNKIVAPLIK IGNEIAALTSSEQNLKAEMSDSLHSRSDCILTRCDCFYCAHAKSKIKTDAVGTAFVATLL TAVAVLYIVHKIVEGTKACLFKIKRLFYHLVMKLKQLCGIVPPVDETLKETIETIPERHV ENNSNEEDNYRKAELEQSNDLIHKLGQQIKNHNQLSPIGKPFQRAAFYFKEALQSLLPIN TTNSASAAFSSFSVIFKIGAYKSFSEISPILQFANFTCNQALLEAFEGCDRIHIIDFDIG YGGQWASLMQELVLRNEGPPSLRITAFASPSTHDELELFTQENLKH.
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>LITCHI025478.m1 AGCCGACACAACAGACCCCCACACCCCACCACACCCAACTCAGCTGCACCACTCACTCCG CCTAGACGCTCGCCCTCGCCGTTCGTCGTTCTTGTCTCCGTTGACCGTTCGATTACGGAA TAATTTTCTGGTAGCTGGAACCACCCTGAAGTTTTGGTGTAGTTCATCTGCAAACCGAAT CGATTATGTCGGACCTAGTTGGTTTTTCATAGTCAAAATCGACCCGACCTGTATGCACCC CTAGTTGTATGTGCGAGGGTTCTAATATTATATTAATCATCAGACTTGACAATCTAGCCC CACATAACCAAATTCCCTATATCTGACCTAGTTACAATTATCTAATTCTTGTCATGGCAA CAGCTGCAATTGTGAAAGCAAATTCACTGCTTTTGTCGAAGCGGAATGAAAGCCCTCATA TCAACCTTTTTTACAATAACTCTGTCAAATTTAGCAGATGCTTTGATGGTAGGCTGAATA CTTGGACTTTAGGTGCAACAAGCAAGAATAAGATTGTTGCTCCTTTAATAAAAATAGGGA ACGAGATTGCTGCTCTCACTAGTTCAGAACAAAATCTAAAGGCAGAGATGTCGGATTCTC TCCATTCTAGGAGTGATTGTATCCTTACTAGGTGTGATTGTTTTTACTGTGCACATGCAA AGTCGAAAATTAAGACGGATGCTGTAGGAACGGCATTCGTAGCTACTTTGTTGACTGCTG TGGCTGTGCTATACATAGTGCATAAGATAGTGGAAGGGACAAAAGCATGCCTCTTCAAGA TCAAGCGGCTTTTTTATCATCTCGTGATGAAATTAAAGCAGTTATGCGGGATTGTTCCAC CTGTTGATGAAACTCTTAAGGAAACTATAGAGACTATTCCAGAACGCCATGTTGAAAATA ACTCCAACGAAGAGGATAATTATCGTAAAGCAGAACTGGAGCAGTCCAATGATTTGATAC ATAAGCTTGGTCAGCAAATCAAAAATCATAACCAGCTCTCACCTATTGGTAAGCCTTTTC AAAGGGCTGCTTTTTACTTCAAGGAGGCCTTGCAGTCACTTCTCCCCATCAACACCACTA ATTCTGCTAGTGCAGCTTTCTCTAGTTTCAGTGTTATTTTCAAGATTGGTGCTTATAAGT CTTTCTCTGAAATATCGCCTATACTTCAATTTGCTAATTTCACTTGTAACCAAGCACTTC TTGAGGCATTTGAAGGGTGTGATAGAATTCACATTATAGATTTCGATATTGGTTATGGAG GGCAGTGGGCTTCTCTTATGCAAGAGCTTGTTTTGAGGAACGAGGGTCCTCCTTCGCTTA GGATCACAGCATTTGCTTCCCCGTCCACACATGACGAGCTCGAGCTCTTTACACAGGAGA ATCTTAAACACTAG
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>LITCHI025478.m1 - Up_Stream_Len 2000 ACGTAAAAGTATTTGTTTTAATATGTATTTCTCTTAAAAAAAACAAACAATCAATATGTA TATTAAGATATTAGAAGGAAAAAAAAAAAACATGTTTTTCAAATTTCAAATTTCAGTTAT TATTCAGTCTTCAAATAAAAAAGCAAACAACCTTTTATGCTCCGCAGATAGATCTTTGCC TCTGTAAGACTTAGTCACGTTGTTTTGGTTGTTTTCCTAAGTACTACATGCTTATTTAAT AATATAATCCCCTTTTGTATAAATTTAAAACTCATTCATATATCCATTGGTATAAAGTTT ACTAAGTCGATCTTCAGGTTTGACAATGCATGGGATCTTTTGATATTCTTCACGCTTTTT GGTTTTCATTTGAATTTGTCAAACAATGCATGGGTACTTAGTATGACTTATTAATGGTTG TCTCAGGGAAAAACTATATGTTAGTAGGAAGTAGTTTGATCAATGCTTAATCAAGTGTTG TGTTTTCTGTTTGTTGCTTTAATTTTGGTAGTTCTTTGTGTAATTTTCCGGATGGATATG GAAAGAAAGAAGCATGGAGAAACAATTAAAGTAAAGAAACATCTCTATCTAATAGTGAAT GCACTATGTATTGTTAAAGATCTAGATGAATTTTTACAATTTATGTAGAGGTCGAAGTGA AACCCTACCACCTTCATGGCCTTTGTCGGGATGTCTTGCTAACTTGTGTTGATGCCACAA ACATCAAAATCATTTTTTAATGCACAATTCTTAATGTCTTACAAGAAAAGTTATGTAATG AAATTCACTACTATCAAATAGAGAAGAATAAACACAAGATGAGTTACATAATGAAATTAT CATGCTTATATGTATAAGTAAAAAAATATCTTTAGTGTGGATGTACAATTTAAAATTTGA AGTTACTTATTTGCGTATTCTTGATTGGCAAAAGATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCGAA ATCAATTTAACACGAGCTAAACCAAACCAGAAAACTGGTTTTGATTTTTAAAATTTCGGA GGGATCAAATTATGATCAAATGTTTAAATCACTTTAGGTCAATGAATATGACAACGGGAC AAAAACTAATTATTGAAAAAAGATAAATGAGTATTATAAGGATGATCTTATTTTCTCCTC TATAATTTGACATAATGTCAAAATCCCACAGAATTTTATAAATCTAATATCCCTTTATTG GTTTATGATATAAATCAAATACTTATGTAATTTATGAAAACGTTCAAAAAACCCTTAGTC ATCAAAGTTGACACTGAACATCAAAGTTTGACCGTTAATGTGGAAGAAAAAAAATTATAT GGATATTTTGGTCATTTTGATCATTTCAGTAATTATACCAATGGTAGGGGTATAATGGAA TTCCCAAAAACTATAGGGGTAAATCAGTGATTATGTCAAATAGAGGGGTACAGTGGGATT ATCGCAGTATTATAAACTCATTTTTCTAACCCTAACAGCCGACACAACAGACCCCCACAC CCCACCACACCCAACTCAGCTGCACCACTCACTCCGCCTAGACGCTCGCCCTCGCCGTTC GTCGTTCTTGTCTCCGTTGACCGTTCGATTACGGAAGTGTGTAATATCTGACTTTTTATT TTTGTTTTATCTTGTTATTTGAACTTGATTTTCTATGATTGAACTGATTAATCTCAATAA CTAATTTGATTTGTTTTTTGGTTTTCGTTTTTTTTTTTTTTGTCTTCTTTTTGGCTGTGT GAACGTGATTTTATTGATTTTCGGCAGTAATTTTCTGGTAGCTGGAACCACCCTGAAGTT TTGGTGTAGTTCATCTGCAAACCGAATCGATTATGTCGGACCTAGTTGGTTTTTCATAGT CAAAATCGACCCGACCTGTATGCACCCCTAGTTGTATGTGCGAGGGTTCTAATATTATAT TAATCATCAGACTTGACAATCTAGCCCCACATAACCAAATTCCCTATATCTGACCTAGTT ACAATTATCTAATTCTTGTC
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>LITCHI024289.m1 GenomeSequence + ATGCCGTCGCTTTCCCAGAGCACTGGTAATGCTGATGCTGCTGATGGAGGTTGCAAAAGT CCGTTAGACGCTCCTAATAACTTCTGTTGTTTAAGTACATCCGATGTTATGGGAAAAGAA TTCATTTCTGTTGATGATGCAGAAGCATTTTACCATAAATATTCAGTTGTGGTTGGTTTT AGTGTGCGTAAGGACATGCTACGAAAGGATGCAAATGGGTTAATAACATGTCGACGTTGG GTTTGCTCCAAGGAGGGGTTCATACAGAAAAAGTACTTGGAGCGACGAGATAGGCAGCGC GAGTCAAAAGGCATAACTCGGGAAGGTTGTCGAGCTGCTATGCGAATAAAATTCAACCGT GAAAAAAGTATGTGGGTTGTGAACGAGTTCGTAACGGAACATTGTCATCCCTTAGCGACT CCAAACCAGGCGCAGTTTCTTCGTTCGCATCGTCATGTTCCGCCTGCCAACATTGCACAA GCTGAATCGTGGAAATATATTGGGGTTCGCACCTCTCAAGTGATGAAGCATATGGTCCAC CAAGCAGGCAGTCATGCAGCTGTTGGTCACACTCGTAAAGACTTACAAAATGGGTTGGAT TCCAAACATAGGTGTACCTCAACCAATGGGGATGCAGACGCAGTTATTGCGTACATGACA GGAAAACAACAAATGGATGGTAATTTTTTTTTCAAGTTTACTATAACTGAAGATGGGTCA TTAGGGAACATTTTTTGGGCCGACTCGCAGTCTCGTATTGATTACCATTATTTCGGCGAT GTTGTATCTTTCGATTCGACGTACAAGACGAATGCGTACAACCGACCTCTTGTTATATTT GTCGGCGTGAATAACCATAACAAAACAACAATTTTTGGATTCTGTTTGGTGGTGGATGAG ACAATAGCCACATATACATGGGTCCTCAAAACATTTCTGGAAGCAATGCAACATAAGCAT CCTGTAGCTGTTGTGACGGATGGCGATATTGCGATGCATAAAGCACTAAAGACAGTAATG CCTGGGGCAACTAGGCGATTATGTGCATGGCATCTGGAACGAAATGTGCAGACAAATATC TGCAATGTTGCCTTCACTAGGGAGTTCACGACCTGCATGCTTACGTACATGACCGAGCTT GACTTTCAACAGTATTGGTCGATGATGGTTGCAACGTATAAATTAGAGGATAACGCTTGG GTTAGAAAGTTGTTTGGCAGACGAAAGCAATGGGCAGAAACGTTTTTGAGAACCACTTTC TTTGGGGGCATGCGAAGCACGCAACGTTCTGAGAGTATAAACCGTTTATTTAATAAATAT TTGAACCGTCGTCTGAAGTTATTCGAGTTCGTCAGCCAAACACATAGGGTGATGGAAAGA CTTCGCCACAATGAGGCAAGAGACAACTTTGAGAACATTAATTCGCAACCAATGCTGGAA ACCCACTTGTTGCAAATAGAGACACATGCATCAGAAGTTTATACTCGCAACTTATTCTTA AAAGTAAGGGATGAAATCAATTCAGAAGCAACGCTAAGCATCGTAAACTGTGCCACTGAT ATGACACAACAGATATTTACATTTAAAAAGTTTGCGTGTGGTGAGACAACTTGGGATGTG GTATACAACCCAACTGAAAATAGCTTCCTATGCTCATGCAAATTGTTTCAGACACTTGGT ATCCCTTGTTGCCATATATTCAGTGCAATGAAAGCAATGAACATTGACTGTTTACCAGAG TCATTGATATTGCGTCGGTGGACAAAGAATGCAAAGGCCGACGACGACGTTGATAAGGTG GTGCACAAAGGTGAAGCAAATGTTGTTCACATGGCACGGTAAACTTCATTTTCTATTTCC TTTATATTATGTAAACATCTTTTTTATATTAATATCATTCATGTATTGTATAGGAAGGCT ACGCGGCCACGTTCTAGTGATAGTGAGGGTGTGCACGAACAATGCATCAAACGTCGCCGG CTGCACCGTGATGTGAGGCCGGTCACCACCACATGAGGAGTGCATACATTCCCATTGCAC TCCCTCATGGGTGCGCAGCCGCTCTCGATTGCGTGCGCAGCTGCGCTATTAATCCAGTGT TTCGACGCAGCCGCACTACCATGCTGGCGTGCCCGCGCACCTGTCTTGTGGACGGCCAGT GAAGCTGTTCATCAGTGCGAGGCCGCACCACTGCAGAGGTGCAGCCGCACAGTAGCACTG CCGTAACTGCGAGGCCGCACCATTGCAGAGGTGCAGCCGCGCACTAGCACTGCCATAAGT GTGCGACCGCACCACAAGACTGGTGTAGCTGCGCACCAACACTGTCCTAACTGCGCGACT GCACCACATTGTGAGGGCGGCCGCGCACCCATACTGAAGACATGTATGTGAGTACTAATG CGTGCGCGGCCGCACCACAATGACAGCGTGCCCGCTTGGCCAAAGCAATGGATGACCTAT CATGTTGTTCATACGTGCACTCCGTCACCACCATGCCTTCATACTCCTTTTGGTTATAGA ATTGTATATAACTATATATATTATGTATATATATATATATATATGTACCTATTTAATAAA GGGATAACTGTTTGAAGTTGTGTAATAGGAGTAAGAATGCAATGTCTTTCTATATTTTGG TAACAAAAATCAATTTACATTATGATGATGATGGTTGAACATGTTAGGTATGGAGCATTA ACCAGTCAGTGTACAAAGTTATGCTACTTGGCTTCTCAAACAGCAGAAGGATTTACAGAG ACAAAAAGCAATATCCATCGTCTAACTGAGAGAATTGAAGGAATCTTGGTAAAGGAAAAG GCAGCAATGAATAATGGTGAGGGGCAGGATAAAACGCCTAACATTGAACATGTAAAAGAT CCACTGAAAGCTACAACCAAAGGGGGGGGGGGTAAGAAAACCGAAGAAAACCTCCCCAAA GATACGCCATTGTGGAAAATGTCGACAAGTTGGGCACACGGTGAAGACATGTCCACATAT TCAACTAGAAGATATAAGTAG