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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI025477 | Chr3 | 1825479 | 1826000 | - | Scarecrow-like protein 6 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI025477.m1 | 7 | 172 | PF03514.17 | GRAS | Family | 119.5 | 1.70E-34 |
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>LITCHI025477.m1 ATGCCTCCCCGCGAATTGGAAAATGAGGTGCTTGCTGTGAATCTCCCTGTTGGGGCGTTT TCGAATTACCCACCAACCCTTCCTTTGGTTCTTCGGTTTGTAAAGCAACTCTCGCCCAAG ATCATTGTTTCATTGGATAGAGGATGTGATCGTGCTGATCTTTCGTTTCCTCACCACATG ATTCAAGCCCTGTTATCTTACTCAGGTCTGCTTGAATCGCTGGATGCTGTGAATGTGAAT TTGGATGCCCTGCAAAAGATTGAGAGGTTCCTGATTCATCCTTCCATTGAAAAGATTGTT TTGGGTCGCCATCGGACTCCTGAAAGATTGCCTCCTTGGAAGAGTCTATTTATGCAAGCC GGGTTCTCTCCATTGACATTTAGTAACTTCACCGAGTCTCAAGCTGATTGTCTGGTGCAG CGTACGCCGGTTAGGGGTTTACGCGCAGAAAAGAGACAGTCCTCGCTTGTTCTCTGCTGG CAGCGAAAAGACCTTATCTCGGCTTCAGCTTGGAGGTGCTAA
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>LITCHI010183.m1 MSFDFLMIEKWKNDDSVQDLNNAELGLGKSTYQSVLKPRSKVRTMDGEEKKFEFKKQVKM FGVGFDSDDDEPIGSLFKLRKRRNLKKGKLVLESNREQKVEVREELVVEEEDLGGMDDTL ASFKKKLKGPKKDSGSGNVRERGLALDGMVNDGGVSDVKSEEGNVEKGQGIGEDGSDVNM AKGFKTPSNRRVRTKIDSKIRKIGGASSCDDDSEGLGSGGGSMEDLKEEELGHGEGSKYS SDEKLEDSLSASFQKTSGLFRKSSTNSSLKWNNRDRNWDDGSNASCRGGGSGLSNSIKRS QNASDAKVSCGNKKNGDSLDVVCDMSTLEPASEQFKSVEPVVETCGSSYQEEPILDPCYL NQVFERDGNGHTCLQFKGNHSMAVESTLVADVAEMVDPVSLQKHTKELHGIEGEPNRDFT DVPGISSSSIGKEVSEPCAEDELTNTTCKTTSKEIHKLASEQTLHVSSKFVSETSSEAAK SETEKVFDKCLKGTHQIAHVVSNLSSNSMEMTKTCGDCDDPDTIEEEPDIVAVSSEKIDA VVSSGSLPSRTEIACGLQESGFAIRKCNSGFNHNQTSDASKGTYPPGHGSLSVNEIANGD SPSSVNSDESGGSPEDSVSMPDSENRGTKLSAAQRAVRNAKKRRHGDMAYEGDADWDILI SEQGFLGSHQVAEYDRSLRTRDRFDSSSSILLEAETCGAAAVSAGLKARAAGPLEKIKFK EVLKRRGGLQEYLECRNQILSLWSRDVSRILPLSECGVSDTPSEDELPRASLIREIYTFL DQSGYINVGVASKKEKTDHSAKHSYKLFKDEKLEGSSGGSLADSEDGVAFILGQVKGSEA SMETKDGVVFNDTTQTSEAKVCSVTSELHDLMEHKVCPADDCQQNASSDASSPNRLFSVD AMSADASCRMVDGGTVPVMFEARNDSHGVQSISFDDAGDHHLQCDSEVRKKIIVIGAGPA GLTAARHLQRQGFSVTVLEARNRIGGRVYTDHTSLSVPVDLGASIITGVEADVATERRPD PSSLVCAQLGLELTVLNSDCPLYDIISAQKVPADLDEALEAEFNSLLDDMVLLVAQKGEH AMRMSLEDGFEYALKRRRGARLGGDFEENELHNSMDTSRASNIDSKIPHKNCSNEEILSP LERRVMDWHFANLEYGCAALLKQVSLPFWNQDDVYGGFGGAHCMIKGGYSTVVESLGEEL LIHYNHVVTDISYGSKDSEMSDNWCKVKVSTSNGSEFSGDAVLITVPLGCLKAESIKFSP PLPQWKYSAIQRLGFGVLNKVVLEFPEVFWDDTVDYFGATAEETDWRGECFMFWNVRKTV GAPVLIALVVGKAAIDGQNMSSCDHVNHAVMVLRKIFGEASVPDPVASVVTDWGRDPFSY GAYSYVALGASGEDYDILGRPVENCLFFAGEATCKEHPDTVGGAMLSGLREAVRIIDIFT TGNDYTAEIEAMEAVQGQSESEGDEVRDITRRLEAVELSNVLYKNSLDRALILTRESLLQ DMFFHAKTTAGRLHLAKELLNLPLATLKSFAGTKQALTTLNSWILDSMGKDGTQLLRHCV RLLVRVSTDLLAVRVSGIGKTVKEKVCVHTSRDIRAIASQLVSVWLEVFRKEKASSGGLK SRQSTGVDFSKRKPFKDTASGKPPLHSYGGLENKGSAGSHLSSIPNIKKENGKPVKLETM SHNLMGRLDTKVEDHNFAMSEEEKAAFAAAEAARAAAEAAAQAAAEATAKAFASSGPQLP KIPSFHKFARREQYGQTDECDLRRKWSGGVLGRQDCVSEIDSRNCRVREWSVDFSAACPN LESSRMSVDNLSQQSHSNEIACHLNLREHSGESAATDSSIFTKAWVDTAGSVGIKDYHAI ERWQSQAAAADPDFFHPAMHIKDEEDSNTSSKPHTWKHDRRANESSVSQVTINKETLENR LRGADRIKQAVVDYVASLLMPLYKARKIDKDGYKSIMKKSATKVMEQATDAEKAMAVSEF LDFKRRNKIRSFVDKLIERHMAAKPIIMILKVPQMEGDYGSSFLIRSYLADVDEIAQFFM PPFGCDGDWFWSVGKGDQLLNVESTFCIMNGLDTSLLAHLTGWWTSEGLKITSDCV.
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>LITCHI010183.m1 ATAAATATATTCCTGATACACCTTGCAAACTTGCAAGATATTCTCCATAACAAGCCTCTC GTCCTTTTCTAGTCCAAACTTACCATTTTGCTTCCTTTTTTCCTTGTACCTGTTAACTAT TAATCACAAATATTAAATCTTTCCGTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTTATTTTTCACT GTTCTCATCGCGGGGGCGCAATATAAAGGACCAGGCCTCCATTTTCCAGAAACCGTAACG CTAACGTGCGCCTTTTATTTTTAAGTCTTCGTCGAATCCATTAACGAGACTGTGTCTCAG ACACACAGCTTTGTCTGCTCATTCAGGTCTGCTCTCTCCAAACCTCTCTCTCTCTCTCTC TCTCTATCTCCTTATTGTTTTAAAATTTCGTGGTTCACTAGCTCTATTACAAACCCTAGG CTGTAATTTTTTGTTTTCGTTTAATGTTTGTTGAACTCTAGAGAGAGAAGGCATTGAGAA TTGCTTTACGCGCGAGCTGAGTGATTGAGAGGACCATTTGATTGAGTGTTTTCTGTGAAA TTTTGATGTACAATTGGTTTTTTGTGTGTGTTATGTGGTTTTTGTTGTTTAATTGGCGGG TGTGGTTGTGGAAATCATGAATTGTTGAGGCAGGCAAGATATGAGTTTTGATTTTTTGAT GATAGAGAAATGGAAAAATGATGATTCGGTTCAGGACTTGAATAATGCTGAGTTAGGGTT AGGGAAGAGTACATATCAGAGTGTTTTGAAACCTAGGTCTAAGGTGAGGACGATGGACGG TGAAGAGAAGAAGTTTGAGTTCAAGAAACAGGTGAAAATGTTTGGGGTTGGATTTGATTC TGATGATGATGAGCCCATTGGGTCGTTGTTCAAGTTGAGGAAACGTAGGAATCTGAAGAA GGGGAAGCTGGTTTTGGAGAGCAATAGGGAGCAAAAGGTTGAGGTTAGAGAGGAATTGGT 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>LITCHI010183.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATCAAAATATTTTTAAATCTAAGCATACACTTAAGTTCAAATACACGCTTAAAGTTTAAC ACAAATTTAATTCATTCACAGACTAAAATTTAATTGGACACCATCTAAAGCTAATAAATC TTCAATCAAACATGTAGTACAAATATTAAAATAATAAAAAAAATTCATTAAACTTTATAC AATAGTATCCATCTATGAAAAAATTATCCAAATTCTAATCAACTATCTCAATTATCTAAG AACACAGTGCATTTCAAGTACATTTAAGAATGAAATTAAAAGAATAAAATAGTAGTGCAC AACATTTAAAAATGAATAATAATGATGATGATAATGATGGCAATGGCAACGATGATGATA AAAAACAACATTAATCTGTCAAAAATAATAATAATAGAACTGATAACTAGGTTAAGCAGG TTAAGAGTGTTTACTCTCAATTCGAACCGGTTATAAATTGGATAAAATTTTTTGAATTGA GTCAAATCAAACGACGAGTTTCAATGCTCCAAATCTATCCTAAAATGGCTGATCTTGGGA AGTTTGCTTTTCAAGTCATGCAAGTAATGGTTTGGAGTTGATCTTGTTAGGGTTACTTTT TGAACCATGCTAGTAATAATAAGTCATTTTAGATGTTGATGGTTGTGATTTAATCATAAA AATTGCTTTTTAGACTATGTTGTTGATGATTAGGAGTTGTACTATTAATAATTTATTTTT TACGTCTTGATAAATACTTAATCCGATTAGAAGATTTGCTTTTCAGACTATTCTATTAAT GGTTCGAAATTGATATTGCTAGGGTTACTCTTCAAAGCCTATCATTATTGATTAATCTCT TTTAAGTCCTGACAAATTGATTATTCTCTTTTAAGTCCCGACAAATTCTTGATTTGATCA TTAGATTTGGAGATTCTAAGCCCCTTCCTAATTTGATCACTAGATTTGCTTTTCAGACTG TGTTTGGGAGTTGTGCTATTAATGATTGGTCTCTTTATGTCCCGACAAATACTTGATCTA ATCACTAGATTTTTTTTTCAGACTATGCTATTAATGGTTACAATATTATAATTTATGCCC CGACAAATATATGATCTACTCACAAGATTTTGCCATACTTTTTAGGTTGAGCTCACAAAG TTTCAATTCTAAACCATGCTATTTATACTCAATCTCCGACTATGCTATTAATAGTTGCGA GTTGATATTTTACGTCTTGACAAATATATGATTCACATATAAGATTCCACTATACTCTTT AGGTTGAACTCGCAAAGTTTATATTTTGAACCATGCTATTCATATTCAATCTTATTAAAA CTTGTCAGATTCCTAATCAGTTCGACGTATTAGACTTAAAATAAATATATTCCTGATACA CCTTGCAAACTTGCAAGATATTCTCCATAACAAGCCTCTCGTCCTTTTCTAGTCCAAACT TACCATTTTGCTTCCTTTTTTCCTTGTACCTGTTAACTATTAATCACAAATATTAAATCT TTCCGTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTTATTTTTCACTGTTCTCATCGCGGGGGCGCA ATATAAAGGACCAGGCCTCCATTTTCCAGAAACCGTAACGCTAACGTGCGCCTTTTATTT TTAAGTCTTCGTCGAATCCATTAACGAGACTGTGTCTCAGACACACAGCTTTGTCTGCTC ATTCAGGTCTGCTCTCTCCAAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCCTTATTGTTT TAAAATTTCGTGGTTCACTAGCTCTATTACAAACCCTAGGCTGTAATTTTTTGTTTTCGT TTAATGTTTGTTGAACTCTAGAGAGAGAAGGCATTGAGAATTGCTTTACGCGCGAGCTGA GTGATTGAGAGGACCATTTGATTGAGTGTTTTCTGTGAAATTTTGATGTACAATTGGTTT TTTGTGTGTGTTATGTGGTTTTTGTTGTTTAATTGGCGGGTGTGGTTGTGGAAATCATGA ATTGTTGAGGCAGGCAAGAT
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>LITCHI010930.m5 GenomeSequence + AAATTTCAAATCAATCAGCCATCTCTATCTCCAATTTAAACACTTAAGTTTAACATCTAA CGGATTGATGACAATTAATGAAAAGAAGGTTGTTCATTGAAAACAGGTTACAAAAGTAAA ACCACACACAATTGCCATTCAAATTCAACACGGGATTGCACAAGATTTCTAGAATCACCC AAGCTGACCTTCATCGACAATCCAAAAACGTGTTAACAAATTTCAAACATCAATCTCTCT CCCAACTAGCTGTTTCCATTTGTTCTAGAGTTTCCCCAAATATTCCAATCAACTTCAATA ATTTTTCTTGCTTGCTACACCAATTTGTTGATCTTCTTCAGGTTCATTGTCATTCCCTCG CTGCAAACAGGTACTACTTGAAAACTTTACGACTTTTGTTCAAATTTGAATCATAGATTT ACTTTGTTATTGGTTTTTGTCTTTGGTTATGAAGAAAGTCTAACGATATATTAGACTTTG ATCACTATAGTGGGTTCGGGTTTAGTGTGTAAAAGATTGTGGTTTTGACTACAAAGATGA AAATGTTGATCTAGTCAAGACATTGAAAATGATCAAAAGAATGAAAACAACATTAATGAT TACAGTGAGCATCTTTGTTGCCGTTTTATGTTTTTAGTGCTTTATTATATCATGTTAAAG AATTTAGATTTGCGAGGTTTCACGTCATCTTTTGCATTTTTCACTTTTGCTTTCTCACCG GACCATATGCACTTGATCTACCCACATGCATTTCTCTATGTTTTTGTCCGGATCGAGATT GAAACATGGAATGCGACGAAGATAGACAATACGATTTTGTTTTTTAGTAACCAAACTTTC TTTCAATTTTGAAAAATAATCCTGAAATGAATTTAAGGGACATATTCAATTTAAAATTTT 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