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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI025254 | Chr13 | 24332193 | 24343702 | + | Histone acetyltransferase HAC12 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI025254.m1 | 686 | 754 | PF02135.19 | zf-TAZ | Family | 55 | 8.80E-15 |
LITCHI025254.m1 | 1069 | 1111 | PF00628.32 | PHD | Domain | 29.7 | 4.70E-07 |
LITCHI025254.m1 | 1168 | 1384 | PF08214.14 | HAT_KAT11 | Domain | 111.3 | 6.60E-32 |
LITCHI025254.m1 | 1568 | 1607 | PF00569.20 | ZZ | Domain | 30.4 | 2.70E-07 |
LITCHI025254.m1 | 1636 | 1706 | PF02135.19 | zf-TAZ | Family | 49.9 | 3.70E-13 |
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>LITCHI025254.m1 ATGAATGTACAGGCACATATGACGGGTGGCCAGGTTCCTAATCCCCAGCAGAATGGAAAT GCATTGCCCCCCAACCAATTGCATAATTTAGTAGGTGGTGTTGCTCCTCCTGCTGCTCCC CCTCCTGTTCTGCAGCATAATATGCCTAATATGGACAATGACTTGATCAGAGCTCGCACT TTGATGCGCGAGAGAATCTATCAAATGTTATTACACCGACAAACTCAGCCAGCTGATGAA GCAACAAGGATGAAGTTCAGAGATATTTCGAAACGCTTAGAGGAGGGTCTTTTTAAAACT GCCCATACAAAGGAGGATTATATGAATATGGATACCTTAGAGCCCCGTTTGAGTAGTCTG ATCAAAGGCAGATCTGGGAATAACCATAACCAACGTCATCAGCAGCTTGTAAATTCTACC TCTGCTGTTGGTACAATGATACCGACACCTGGCATGACACACAGTGGGAATTCACCCATG ATGGTTGCATCATCCATGGACAGTTCAATGATCGCTACAGGTGGAGGCAATACCATAGCT CCTGCAACTGTCAACACAGGAAGCTTGTTATCGACTGGTGGCATACAAAGTGGTTCCTTT AATAGATCTGATGGATCCTTGCCTAATGGATATCAACAATCAGCTGCCAATTATTCCATT GGTTCTGGTGGAAATATGTCATCAATGGGTGCCCAAAGAGTTACAAGTCAAATGATTCCA ACTCCCGGGTTTAACAATAATAATACTAGTAGCGATAGTAATCAGCCTTACATGAATTTG GAATCATCTAATAACAGTGGTGGGTTTTCAACTGTTGAATCCACTATGGTATCACAGCCA CAGCAGCAAAAGCAGCATGTCGGTGGTCAAAACAGCCGCATATTGCATAACCTTGGAAGC CACGTGGGTATAAGGTCCGGCTTGCAGCATAAATATGGGTTCTCTAATGGGGCTTTAAAT 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>LITCHI025254.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATAATAATAAAAAAGAGAATTTAGATTACCTTCTGACGTTAAGAGGACCTTCACCAGGGG AACCTTCGCCTCCGCGAATGCAAGTACCGACACATTTGATAGTGCAGGACTCGGCTTTCC TAGACTTGGGTCGTTGAATCCTAGGCTTGGTGCAATCCTTGGGCGATGCACACTCTCCGG AAAGTTGCTGGGGTATGTTAGATAGTGTCTCGGCTTCTTGGGGGGCTGCAGCTGAGGCTG AGGCTGAGGCTATAACTACTGCTGCTGCTAACAAGCCTGTGGTTGTTGTTGCTTTGCTGC CTTTACTTGGAAGATATTGACAACTAGTGCTCTTGTTGGTGTTGAGACATGCAAGGTTAA AAAGAGCAGGGGTTGGGACATGCATCATGTTTCTCAACATTCAGTTTTGCTTTGGGACTT CATTTTCAAACCATCATTTCTTTTCCTTATCTCTTATGATAGCCTTTGTTTTGTGTTGGT GGTCCTAGCGTTCCAACCTCTCAGATCTAGTGGCCTAGAGACAAGACAAAAAGAGTTTGC ATCTTTAACTCATGACTCTAAGTATCACTTACACGTCCATTTTATAGATACATTCCTATC TAACTCAATCTAATGTTAATTATACCCATATTAATTCAAAATTTACATACTTTTACCTAT TTAGTTGTAAATATCTTAAATTGCTAATGGACGAAATTTGGGAGTCCTCATGTCATGGTG GTGTCTCTTTGTGGTTCTTGGGAGAATACACTCTTTTGGGCTAGCTCTCCTCGTTCTCAT TCTCGTATTTGCGATTGTTGGCTGCCCGCGAGAGGGTACATTAAGGGGCTTGAATGCTTT TCCTAAACTCACCCAAGAATACACCACAACTTAATAATTTGTTTACTGCTCATATCTGTC CTCCTCCCTCATGTTTTATTCCTTTTTCTAATTGCAAGTATTCGATTGCCAGATTGGAGA AAGGATTGAACACTTGAGAAGTTGGAGGCTTCAATTTTAGAGAAGAGAATACAGTGGAGG AAGGAAGACTATTTTGGACGAGAAGCCCAAGTGCTTGGATAATGGGCCATCTTTGTTTAA GAATGGGCCCAACCCCGTCCACCACTGCATTTAGATTTAGAATAAGAAAATCGCTAATAA TAAGAAAACACCTCTTAATTTTATTTATTACTCCAATTTTTATAAAATAATTTTCTTTGT TTGATGTGCATAAGAATATGATGACAAGTTAAGTAATTGATTATGTATATTAATTTGAAG AGTTGGGCATTTCCGTAAATTCGTTTATCATTTCTTAACTTTTTGTTTCATTTGGTAATA AGAAAATAAATCCATAAATATATATAAAATAGGCTAGGGCTAGGACGGAGAAATAATTAA TAAATAATCGAAAAAGAAAAAGAAATTGAATCGAAAATCGAAGGCGTTAATTGGAGTTTG GTTATGAATTATGGTGTTGGTGTGGATTGGATAGTGGTGGCTGGAATTGGAATCCGAAAT CGAAATCATATAAGCTTGTAATGGTAAGGTTCGTGTGAGTTCAGTTGGCACGTGCGGTTG AAGCGGTGACTTAATCGTTTTCCATACCCTTTTTCACACCTTTTCCCCAATTTCAATTTC AATCCCAAATCGTCGATCATCCTCCCTCCCTCTCATCTCGGCTCCCTTACCTCCGATCGT TACTGCTCCCGATTCTACTATTCCCAATTGAGGTTCGTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCT TTTAATTTCTCAACCTAGGGTTTCTTCAATTTTCAATTAATTGCCATACGATCCGCTTTC CAATTTCATAGTTTCCTAACCCTAATTAAATTTAATCCAATTACTTAGTGCAATTCTTCT ATTCTCTGCTAATTCGATTTATGTCAACTGCAGGTACCTGCGCATTTTAGATTTTGTGCT GCACTAGAGAGTGAATGCTTTGATCGAGTTATTATGCTGTATAATGTGTTGCTAGTTATT AAAACAAGAAGAAGAATAAG
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>LITCHI025254.m1 GenomeSequence + ATTAATTTGAAGAGTTGGGCATTTCCGTAAATTCGTTTATCATTTCTTAACTTTTTGTTT CATTTGGTAATAAGAAAATAAATCCATAAATATATATAAAATAGGCTAGGGCTAGGACGG AGAAATAATTAATAAATAATCGAAAAAGAAAAAGAAATTGAATCGAAAATCGAAGGCGTT AATTGGAGTTTGGTTATGAATTATGGTGTTGGTGTGGATTGGATAGTGGTGGCTGGAATT GGAATCCGAAATCGAAATCATATAAGCTTGTAATGGTAAGGTTCGTGTGAGTTCAGTTGG CACGTGCGGTTGAAGCGGTGACTTAATCGTTTTCCATACCCTTTTTCACACCTTTTCCCC AATTTCAATTTCAATCCCAAATCGTCGATCATCCTCCCTCCCTCTCATCTCGGCTCCCTT ACCTCCGATCGTTACTGCTCCCGATTCTACTATTCCCAATTGAGGTTCGTCTTTTCTTTT CTTTTCTTTTCTTTTAATTTCTCAACCTAGGGTTTCTTCAATTTTCAATTAATTGCCATA CGATCCGCTTTCCAATTTCATAGTTTCCTAACCCTAATTAAATTTAATCCAATTACTTAG TGCAATTCTTCTATTCTCTGCTAATTCGATTTATGTCAACTGCAGGTACCTGCGCATTTT AGATTTTGTGCTGCACTAGAGAGTGAATGCTTTGATCGAGTTATTATGCTGTATAATGTG TTGCTAGTTATTAAAACAAGAAGAAGAATAAGATGAATGTACAGGCACATATGACGGGTG GCCAGGTTCCTAATCCCCAGCAGAATGGAAATGCATTGCCCCCCAACCAATTGCATAATT TAGTAGGTGGTGTTGCTCCTCCTGCTGCTCCCCCTCCTGTTCTGCAGCATAATATGCCTA 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