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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI025239Chr132421175224217729-Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 5

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI025239.m15390PF08263.15LRRNT_2Family321.20E-07
LITCHI025239.m1138198PF13855.9LRR_8Repeat31.51.20E-07
LITCHI025239.m1406672PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain1331.20E-38
LITCHI025239.m1406670PF00069.28PkinaseDomain126.81.00E-36
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>LITCHI025239.m1
ATGAAGCATAATATTGTTGTGGCATTCTTCTGTTGGATCCTCATTACTAGTGTCCATTCA
AAGACTGATTCCTCAGATGGAAATACAAAAGAATCAGCCAGATCCTTCTTGTCCCGGTTC
AAGATTCTGATGCATGCCAATTATCTGAATTTTGCAGTTTCTGCCCTCAATGTCATGTTT
ACCAGCTTAAATTCTCCTTCACAACTGAAAGGATGGAAATCAAGTGGTGGTGATCCTTGT
GGTGATTCCTGGAAAGGAATTACATGCTCAGGCTCATCCGTAACTCAAATACGATTATCT
GGCATCGGAGTCAGTGGATCATTGGGTTACCAGCTTGGAAACTTGAAATCTGTCACCTAC
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ATGACTGATCTCAAGTCCCTAAAACTTGGGCAGAATTCGCTTAATGGACAATTGACTGAT
ATGTTTCAGAAACTTTTGAAACTTGAATATTTGTACTTGCAAAACAATCAATTAACCGGT
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TCAGGGGCAGCTCCTCCTCCACCCCCTGGTACCAAACCCATTTCTAAGAGACACAAATCC
TCATCCGAAAGTAAACAGTCTAGTGTGAATGGAATCATTATTGGGGCAGCAGTTTTGGGT
GCATTGGCAGTACTTGCGATTGCAATTGGTCTATTTTCAAAGAGGAAAAGGTCTTCTCCA
TCTAGTCATTTTCTTGATGAAGAGAGAGCTGCTGAGCGTAGACAATTTACCCCCCTTGCA
TCACAAGAGTTAACCAATGACATGCGCTCTGAAAGAAAAGATTATAAAGAAAACAATTCT
TTCAATTCAAATGCTTCACTTGATAAAAATCCTTTTCAGAGATCCACTTCCATTGGTCTA
AAGGATTCACCCACTGATCGCATAAGATCCTTCCATGACAATGAGTTTGCAAACCGTCTC
AAATCTCAAAGAAATTCTACTTGTGCTATACCTTATACTTTGGCGGAATTGCAAGCTGCT
ACTGCTAATTTCGCGACAGGACGCCTTCTTGGCCAGGGAACAATTGGACGTGTTTATAGA
GCTAAATATCCGGATGGGAAGGTGTTAACTGTGAAAAAGATAGATTCCAACCTTTTCAGA
GTGGAGAACCCAGAGAACTTTTCAGAAATCGTGACAAACATCTCAAGGATTCGCCATACG
AACATTGCTGAACTTATTGCTTATTGTGCAGAACAGGGCCATCACGTATTAATTTACGAT
TATTACAGGAATGGCTCGATCCATGATTTTCTACACATGTCAGATGACTTTAGCAAACCA
TTGACTTGGAACACAAGAATTAGAATTGCTTTGGGAACAGCCCGCGCTGTTGAGTACCTT
CATGAAGGATGTTCGCCATCATTAATCCACAAGAACATTAAGTCATCTAATATATTGCTT
GACCTTGAACTCAATCCTCATCTCTCTGATTATGGATTGGCAAACTTCCATCAGCGTACA
AGCCAAAATCTTGGAGTTGGATACAATGCTCCAGAGTGCACTAAGCCTTCAGCATATACA
CTGAAGAGTGATGTATACAGTTTCGGAGTGGTGATGTTGGAGTTGTTAACAGGAAGGATG
CCTTTTGACAGTAAAAGGCCAAAATCTGAGCGATGCCTGGTTCGTTGGGCTGCACCACAG
CTGCATGACATTGATGCATTGGCAAAAATGGTGGATCCTGCATTGCGCGGGCTGTACCCT
CCCAAGTCCCTCTCTAGATTTGCTGATGTTATTGCCCTATGTGTACAGCCGGAGCCTGAA
TTCCGGCCACCTATGTCAGAGGTGGTTGAGGCATTGGTGCGTTTAGTTCAACGTTCAACA
ATGAATATGAGGGATGATCTTGCAGCTTCTCGCCGGACAGATGACTCTGACTACTAA
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>LITCHI025239.m1
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TSLNSPSQLKGWKSSGGDPCGDSWKGITCSGSSVTQIRLSGIGVSGSLGYQLGNLKSVTY
LDLSSNNINNNIPYQLPPKLQQLDLSKNGLSGNLPYSMSQMTDLKSLKLGQNSLNGQLTD
MFQKLLKLEYLYLQNNQLTGSINVLAALPLDELNVENNQFTGWVPDSLKDIAKTGGNSWS
SGAAPPPPPGTKPISKRHKSSSESKQSSVNGIIIGAAVLGALAVLAIAIGLFSKRKRSSP
SSHFLDEERAAERRQFTPLASQELTNDMRSERKDYKENNSFNSNASLDKNPFQRSTSIGL
KDSPTDRIRSFHDNEFANRLKSQRNSTCAIPYTLAELQAATANFATGRLLGQGTIGRVYR
AKYPDGKVLTVKKIDSNLFRVENPENFSEIVTNISRIRHTNIAELIAYCAEQGHHVLIYD
YYRNGSIHDFLHMSDDFSKPLTWNTRIRIALGTARAVEYLHEGCSPSLIHKNIKSSNILL
DLELNPHLSDYGLANFHQRTSQNLGVGYNAPECTKPSAYTLKSDVYSFGVVMLELLTGRM
PFDSKRPKSERCLVRWAAPQLHDIDALAKMVDPALRGLYPPKSLSRFADVIALCVQPEPE
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>LITCHI025239.m1
ATGAAGCATAATATTGTTGTGGCATTCTTCTGTTGGATCCTCATTACTAGTGTCCATTCA
AAGACTGATTCCTCAGATGGAAATACAAAAGAATCAGCCAGATCCTTCTTGTCCCGGTTC
AAGATTCTGATGCATGCCAATTATCTGAATTTTGCAGTTTCTGCCCTCAATGTCATGTTT
ACCAGCTTAAATTCTCCTTCACAACTGAAAGGATGGAAATCAAGTGGTGGTGATCCTTGT
GGTGATTCCTGGAAAGGAATTACATGCTCAGGCTCATCCGTAACTCAAATACGATTATCT
GGCATCGGAGTCAGTGGATCATTGGGTTACCAGCTTGGAAACTTGAAATCTGTCACCTAC
CTTGATTTGAGCTCAAACAATATCAACAACAATATACCATATCAACTTCCTCCTAAGCTT
CAACAGCTGGACCTTTCTAAGAATGGCTTATCGGGGAATCTACCTTATTCAATGTCTCAA
ATGACTGATCTCAAGTCCCTAAAACTTGGGCAGAATTCGCTTAATGGACAATTGACTGAT
ATGTTTCAGAAACTTTTGAAACTTGAATATTTGTACTTGCAAAACAATCAATTAACCGGT
TCAATAAATGTCCTTGCAGCACTTCCCCTTGATGAATTGAATGTTGAAAACAACCAATTT
ACTGGCTGGGTCCCTGATTCATTGAAGGATATTGCTAAAACTGGAGGAAATTCTTGGTCA
TCAGGGGCAGCTCCTCCTCCACCCCCTGGTACCAAACCCATTTCTAAGAGACACAAATCC
TCATCCGAAAGTAAACAGTCTAGTGTGAATGGAATCATTATTGGGGCAGCAGTTTTGGGT
GCATTGGCAGTACTTGCGATTGCAATTGGTCTATTTTCAAAGAGGAAAAGGTCTTCTCCA
TCTAGTCATTTTCTTGATGAAGAGAGAGCTGCTGAGCGTAGACAATTTACCCCCCTTGCA
TCACAAGAGTTAACCAATGACATGCGCTCTGAAAGAAAAGATTATAAAGAAAACAATTCT
TTCAATTCAAATGCTTCACTTGATAAAAATCCTTTTCAGAGATCCACTTCCATTGGTCTA
AAGGATTCACCCACTGATCGCATAAGATCCTTCCATGACAATGAGTTTGCAAACCGTCTC
AAATCTCAAAGAAATTCTACTTGTGCTATACCTTATACTTTGGCGGAATTGCAAGCTGCT
ACTGCTAATTTCGCGACAGGACGCCTTCTTGGCCAGGGAACAATTGGACGTGTTTATAGA
GCTAAATATCCGGATGGGAAGGTGTTAACTGTGAAAAAGATAGATTCCAACCTTTTCAGA
GTGGAGAACCCAGAGAACTTTTCAGAAATCGTGACAAACATCTCAAGGATTCGCCATACG
AACATTGCTGAACTTATTGCTTATTGTGCAGAACAGGGCCATCACGTATTAATTTACGAT
TATTACAGGAATGGCTCGATCCATGATTTTCTACACATGTCAGATGACTTTAGCAAACCA
TTGACTTGGAACACAAGAATTAGAATTGCTTTGGGAACAGCCCGCGCTGTTGAGTACCTT
CATGAAGGATGTTCGCCATCATTAATCCACAAGAACATTAAGTCATCTAATATATTGCTT
GACCTTGAACTCAATCCTCATCTCTCTGATTATGGATTGGCAAACTTCCATCAGCGTACA
AGCCAAAATCTTGGAGTTGGATACAATGCTCCAGAGTGCACTAAGCCTTCAGCATATACA
CTGAAGAGTGATGTATACAGTTTCGGAGTGGTGATGTTGGAGTTGTTAACAGGAAGGATG
CCTTTTGACAGTAAAAGGCCAAAATCTGAGCGATGCCTGGTTCGTTGGGCTGCACCACAG
CTGCATGACATTGATGCATTGGCAAAAATGGTGGATCCTGCATTGCGCGGGCTGTACCCT
CCCAAGTCCCTCTCTAGATTTGCTGATGTTATTGCCCTATGTGTACAGCCGGAGCCTGAA
TTCCGGCCACCTATGTCAGAGGTGGTTGAGGCATTGGTGCGTTTAGTTCAACGTTCAACA
ATGAATATGAGGGATGATCTTGCAGCTTCTCGCCGGACAGATGACTCTGACTACTAATTT
TATTTGTCCTCCCTTAAAAGCAAGAACTGTTTTGTACATGTGATAAAGGTCCAGTTGAGA
TTATTATTTTATTCAGTAATTTGCCAAATTCAGAAATATGTTCACTGATAGAATTGCCTT
CTTAGAAACTTTTGCTACATTTTATAAGTTCAAACTTCAAAGGTTGTTTCTCAATTTTGT
TATTGGAAAGAAAGAAATGAGAAATGCAATGTCAAGCACAGCCTAA
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>LITCHI025239.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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CTTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTACTCGTAAACTTTTGGGGGTAAACC
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CATGATTTCTTTATGCTTGGTGTAGCGGTTGAAGGGAAATTGTCTGTCTAGTTTGATTGG
TTCATGGGTTAACGATTTTATATCACAGTTCCTGGTAGGAATGCCTGTGAGATCAAAATG
TTTCACCAAGAAGATGCTGGTCTGAATGTGGAGATGGCGAAACTGGCTTTTGCTAAGGGA
ATATGGAGTTATGTGTGTAAGATGGATAACGCACTGCGCAAATATTCTGTGAACAGTCAT
CTTCAGACAGGTGAAGCTGTTTCTGCAGTCACTCTTATTCGAAAGGTCAGGTTTTAACAA
TATAATTTTGAATACCAGTAGATCTTGATTTCTGAAGGCAGTCAGATTAGTTGTCTTATT
GTGACCATGTGCAATCATTTATTGTTGGGGAACTGTGGGTGGAAACTGTCTAGACACAGA
TTAGCAATGTGGTATCAAATTACCACCTAGATGTAGTCATTGGTTGAGTCAATATAAAGG
TCTTCAATCACATCTTATTAAGGTCTTATATCTGGTAGTTGAATTTGATTCTTTGACAAC
GAAACATATGGGAATTACTACATCTTGGGAGCAGATAGAATTGCTAGATTTTATTAGTCC
AGAATGAATTTGCTTTACCTTTCATCTGTGTCCTTTTGGTATTTTTGCTCACATTCTTAT
TCACCTGAACGTATAGGTTCCACTCGGATTGGAGACTGTTAACAGCACAAGTTCTCCAGC
AAGTCCCACGGCAACCATTAATGGACTATATACTGGTGAAGCCAAAGAGAAGAAATTATA
TAGAAGGCCATCAAAAAAAGTGGTAGCGAAAGGTTTGCTGCTTCTTGGTGGTGCGATCTG
CCTTTCTCGAGGTCACTCTGCCCTGGGTGCTAAAGTTGCTATGGCTTATATCTTAACAAA
GCTGCATAGGCGCGGTGCCTCAACAAGCCAAAGTGGGCAAGGTCCGAGGTGAAAGACCTT
ATTTTATCACAGCAAATTCTGGTGGTACTGATATGGCTGGCTTGCTGTGTATATCTATTT
GCTGTAACTCAAGTAGTCTGAAAAGAGTTGGAAACTGCGGCGAACTTTATATCATATATA
CTTGTAATTTTCTATTTTTTTTCCTTTGTGTAAATAAAATTAACAGTAGTTGTAAAAGGC
TGAATGGAAAATCAGTAGCTCCAGATGAAAATAAGAAGAGTTTTGAGGTGGAGATTGAAA
TATTAGATTGATGCATGTTGAAAGGCATTGCAGCCAGGCCTACCACATAATTCACGATGT
TTTGACCATTATCATCATAAAAATAAGAAAAATGGTAGAGAAAATGGATATTGGTTGAAG
TTGAATACCAAATATAAAGCAAAGAAATGAAAATGGGAAGAGGCAAGAAAAGGAGTAAAG
TTGGAGTTCGTTAAAATTCAAGAAGAAATTCTTTGTCAAAGTGTAGGAAAGGAATTTAAA
ACGCGCGGGTAAGGAAGTTGAGGGTTGAGACCGGAAAATGTTGACAACTCTGATCTCTCC
TCACCTCTCGCTCTCTCTTTCTCATTTTTAGCTGTATTACTCCTCTCTTGTCCATATTTA
GCCACCACCAAAACCCCCCAAACCAGAAAGCTTTTATGAAAAAAAGTGAAACCCCCCTCC
ATTTTTTTTTCCTGGAGGTTGTTTTTGTTCCTAGTTGAACAACTCCTCCCTTTTGTTTCT
TCACTGCATAGGTTCCTTAACCCATCTTCAATTTTTGGATTTTATATCTATCTTTCATTT
TTTTGGCCTTTGAAGGAAAA
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>LITCHI024783.m1 GenomeSequence + 
CTCTCATTAAATGTGAAAACGCGTAGGTTATCAAGTGGGTCCCGCGACTGTAAAATACGT
AAATCGGGGGATGGGTCCCACAACCGAAGTTTCGTTCTTTAACAGCGTTGACCTTTCTTT
CGGGCTTCAAATCGGACGGTCGGCGAATGGTGTCTGCGTCGCGTACGTCACGGGCGGGTA
ATACGAGACAAACTAGAAGGAAACAAAAAAAATCCAAAAACAAGACAAGAAAATTAAATA
AATAAAGTTAGCTGCTAGTCTTCCACACTGAAAAAACACAAAAATCACAAAACAAAAAGG
ACAAAGATCTGTTGCTGGGACGACCTCGCCAGCAAATCTCGGTTGAAAAATCACCATGTG
CCACATCAACGCCGGAGTTGGTTTTCAACTGATAAAGACAAAACGCTCTTGCAAACCGCT
GAACCCGATATGACCACACCCCATTTCCACCTGGCAACATTTTGGTGGCTGAGTATACGA
GTCTGGAAAGCGCGTCACAGCAGATTAAACCTGAAAAAAAAATAAAAACGACAGAAAATA
ACCCCAGAATATAAAAATGGTGTTTTGCTTGGCTCGCTAGGCCTAGCTCTCTCTCTTCTC
CCTCCCTGTCTCTCTCTCTTTTTAATTTCTCGTTTTCTTTTGGTTGCTGTTGGTTTGTGT
ACTGGGTTGTTGTCCATTCTTCTTCTGTGTAGTTGAGAAAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAA
AAAAGATTTTTTATTTTTATTTTGAACTCATTAGTATGGGTTGTTTTAGCTTCACTGGAA
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ATCGTCACGATCTCCATTTGTTTTTTGGGGTGGGATTGTGTTTTAAATTGTAGGCATTGC
CGATGGTGTTATTGGGTTGGTTTTTAAACTGACAAAATATTGATTCTTGATTTTCAAAAT
ATGTTCTTTTTTTGTCGATCATGGTTGGTCTATGAATTTTAATTTTTTAAAAAAATATAT
ATATGTGTTTTGCATATTTTTGTTCTCTTATGTATATTAATTTTTATGTGTATCATCTTT
CTTGTTGCATTTTGATTGCCCAAAATTGTCTAATTCTTAGCAAGTGCGTGTATAGTCTAT
TTATCTACAGTACACGAATCCTGTTATGTACTCGAATTTGTCCTTGTGGGTTCTTTTTTC
TGATTACTGTTGTTTTTTTACAAGAGATCCTTTATGTGAAGAATCGTATTAAAATTACTT
TTTTTTTTTGTTTTCACTTCAAGCTGTTGTTTTTCTAATATATATTTTTTCCCTGCTGTC
TCATAATTTTGGTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTTTTTTAATGTTTTTTTGTAGGTACTCA
CGTGAATGTACAGGACCAATTTTCTTTAGATGTAAATAACTTAGACTTGAATGATGATAC
CAAAACAAGTGGCACGAGAGCACAAACGTTTAAATTCGATGAACTGGCGGCTGCTACCGA
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CTTAGAGAATACCAACCAGGTTTATTATTCATGTGATTTTTAAAATGTGATTGAATAGCG
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GAATTTGTTGTTGAAGTATTGACATTAAGCTTAGCTGACCATCCTAATCTTGTCAAACTG
ATCGGCTTTTGTGCTGACGGTGATCAGAGACTATTGGTTTATGAATACATGCCGTTAGGA
TCGTTGGAAAACCATTTACATGGTAAGAAGGTCTCTCAGTTAATCTTGTTTTTTCATTTG
TCTAATGGTTTCGTTTGTTTGACAGTCGGCTTTTTGTTGACAGATTTGCAATTCATGGTT
TTTTCCCTCCTTAGCTGTAGTTTTAACTAGTCTGTTAAATTATTTTAACAGATCTTCCTC
AAGGTAGAAGACCACTTGATTGGAATACAAGGATGAAAATCGCAGCTGGTGCAGTAAGAG
GCTTGGAGTATTTGCATGAAAAGATGAAGACTCCTGTTATATACCGTGATTTGAAATGCT
CGAATATATTGCTTGATGAAGGGTATCATCCCAAGTTATCTGATTTTGGCTTGGCCAAAG
TGGGCCCTAGTGGAGATAAGACGCATGTTTCCACCAGGGTTATGGGCACATATGGGTACT
GTGCACCAGATTACGCAATGACTGGTCAACTGACATTTAAATCAGATGTTTACAGCTTTG
GGGTCGTGCTTTTGGAGCTCATCACTGGCAGAAAGGCAATTGATCAAACAAGAGATCGTA
ATGAGCAAAATCTGGTTGCTTGGGTAAGATATTTCTTATTTTGCTCTTTCCAGTTTATAT
CTGCTCATTAATTTGATTTAGTTCTAGGTTTGCATTGTCATCATTGAACTTACGAAAATA
AGAATTCAGAAATCATCCTTGGAACTCCCTTGCAATTTTATGTTGACAGTCTACCAAAGG
CTACCGTTTTAGTTTTACTTTTTCTGCTGTCCAGAATTATCATACCAAGAGGATTTCGTA
GATAGATTAATCTATTACTGAATGATGCTATCTAAGTTTTACAATTAGAGTGTGTCTACT
TGTTAAATGGGTTTGTTTTTTATTTACTATTGTACATGCAGTGCTTCATTATTCCTGTCC
AATGCTGTGAAATAATTTTGGAAACCTTTGTTTATACAATTAAGGTTTGCAAAGCTGCAA
GTAGTGTGGCAGCAGACAACGTTTGTTCATAGGAAGTATTTTTGAAAATAAGTGTTTTCA
ATGAGACAAAGACTATTTGGTTTGCAACAGAGTTATGGAATGCAAGACTTGGGTCAAATC
ACAATGGGGTTCTTGCCCTCATAATAAGTGGGTCAAGGAATAGAAAGGCATTTAAAGTGC
CAGTTTAGTCTGTTTTCGGCTGATTAAATGACTCTGTGAATTCATGAAAAATGTGCATGG
AAAAGGAAAACTTTTATCCAAAGCATTGTCCTCCTTTTGCTATATCAATTATCATAGGTT
ATAACTGGTGAAGAATGGTAAATTAGATTCAATCAGTCCACTTTACCTCTTTTTGGTGAA
AAAGTTAATTACCATCTTGCTCGTGGACCCTATTGCCATAGTTGGCAATGCTCTCAGATG
TACTTGCCATCTGCAGTATGTTGCTTTGGCTTACACCGTTTATTTCACTCTCTAATTGAT
TTTACATTGGAATCAGAAACTGCTTTAAATTGTAATTAAAACTTAAGTAGAATTTTCTTT
TCTGAGTCTAGCGTGAAGTGTCTTCTAGTTTCCTATTTCACTAGCAGCTAGTTATTGGCT
GGTAGTTTTCTTGGGAGCAAAATGTTTGTCATCATAATACTACTTTTCCTAACAATTGAC
ATTTTTTTAAATGAGAGTAGGTCCAGGTGAAATAATAATCCAAAGTGTACCAAGAATTCT
TATCCATTTTCACTTGACGTGTTTGCAGGCACGACCAATGTTCAAGGATCGGAGCAACTT
CCCCCGAATGGTTGACCCATTGCTTGATGGCCAATATCCCAAGAGGGGTTTATACCAAGC
CCTTGCCATTGCTGCTATGTGTGTCCAGGAGGATCCTAACATGCGGCCTGCCACATCCGA
TGTTGTTATGGCTCTGAATTACCTTGCTACTCAGAACTTTGAATACCAAAACCCTCCTGT
CCAAAAATCCCGAAGGAACCCACCATCACCTCGTTCAGGAGCGTATAGATATGACACTAG
CAGACAGACTGCTGGCAGTGGGTCTGAGTGA