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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI025239 | Chr13 | 24211752 | 24217729 | - | Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI025239.m1 | 53 | 90 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 32 | 1.20E-07 |
LITCHI025239.m1 | 138 | 198 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.5 | 1.20E-07 |
LITCHI025239.m1 | 406 | 672 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 133 | 1.20E-38 |
LITCHI025239.m1 | 406 | 670 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 126.8 | 1.00E-36 |
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>LITCHI025239.m1 ATGAAGCATAATATTGTTGTGGCATTCTTCTGTTGGATCCTCATTACTAGTGTCCATTCA AAGACTGATTCCTCAGATGGAAATACAAAAGAATCAGCCAGATCCTTCTTGTCCCGGTTC AAGATTCTGATGCATGCCAATTATCTGAATTTTGCAGTTTCTGCCCTCAATGTCATGTTT ACCAGCTTAAATTCTCCTTCACAACTGAAAGGATGGAAATCAAGTGGTGGTGATCCTTGT GGTGATTCCTGGAAAGGAATTACATGCTCAGGCTCATCCGTAACTCAAATACGATTATCT GGCATCGGAGTCAGTGGATCATTGGGTTACCAGCTTGGAAACTTGAAATCTGTCACCTAC CTTGATTTGAGCTCAAACAATATCAACAACAATATACCATATCAACTTCCTCCTAAGCTT CAACAGCTGGACCTTTCTAAGAATGGCTTATCGGGGAATCTACCTTATTCAATGTCTCAA ATGACTGATCTCAAGTCCCTAAAACTTGGGCAGAATTCGCTTAATGGACAATTGACTGAT ATGTTTCAGAAACTTTTGAAACTTGAATATTTGTACTTGCAAAACAATCAATTAACCGGT TCAATAAATGTCCTTGCAGCACTTCCCCTTGATGAATTGAATGTTGAAAACAACCAATTT ACTGGCTGGGTCCCTGATTCATTGAAGGATATTGCTAAAACTGGAGGAAATTCTTGGTCA TCAGGGGCAGCTCCTCCTCCACCCCCTGGTACCAAACCCATTTCTAAGAGACACAAATCC TCATCCGAAAGTAAACAGTCTAGTGTGAATGGAATCATTATTGGGGCAGCAGTTTTGGGT GCATTGGCAGTACTTGCGATTGCAATTGGTCTATTTTCAAAGAGGAAAAGGTCTTCTCCA TCTAGTCATTTTCTTGATGAAGAGAGAGCTGCTGAGCGTAGACAATTTACCCCCCTTGCA TCACAAGAGTTAACCAATGACATGCGCTCTGAAAGAAAAGATTATAAAGAAAACAATTCT TTCAATTCAAATGCTTCACTTGATAAAAATCCTTTTCAGAGATCCACTTCCATTGGTCTA AAGGATTCACCCACTGATCGCATAAGATCCTTCCATGACAATGAGTTTGCAAACCGTCTC AAATCTCAAAGAAATTCTACTTGTGCTATACCTTATACTTTGGCGGAATTGCAAGCTGCT ACTGCTAATTTCGCGACAGGACGCCTTCTTGGCCAGGGAACAATTGGACGTGTTTATAGA GCTAAATATCCGGATGGGAAGGTGTTAACTGTGAAAAAGATAGATTCCAACCTTTTCAGA GTGGAGAACCCAGAGAACTTTTCAGAAATCGTGACAAACATCTCAAGGATTCGCCATACG AACATTGCTGAACTTATTGCTTATTGTGCAGAACAGGGCCATCACGTATTAATTTACGAT TATTACAGGAATGGCTCGATCCATGATTTTCTACACATGTCAGATGACTTTAGCAAACCA TTGACTTGGAACACAAGAATTAGAATTGCTTTGGGAACAGCCCGCGCTGTTGAGTACCTT CATGAAGGATGTTCGCCATCATTAATCCACAAGAACATTAAGTCATCTAATATATTGCTT GACCTTGAACTCAATCCTCATCTCTCTGATTATGGATTGGCAAACTTCCATCAGCGTACA AGCCAAAATCTTGGAGTTGGATACAATGCTCCAGAGTGCACTAAGCCTTCAGCATATACA CTGAAGAGTGATGTATACAGTTTCGGAGTGGTGATGTTGGAGTTGTTAACAGGAAGGATG CCTTTTGACAGTAAAAGGCCAAAATCTGAGCGATGCCTGGTTCGTTGGGCTGCACCACAG CTGCATGACATTGATGCATTGGCAAAAATGGTGGATCCTGCATTGCGCGGGCTGTACCCT CCCAAGTCCCTCTCTAGATTTGCTGATGTTATTGCCCTATGTGTACAGCCGGAGCCTGAA TTCCGGCCACCTATGTCAGAGGTGGTTGAGGCATTGGTGCGTTTAGTTCAACGTTCAACA ATGAATATGAGGGATGATCTTGCAGCTTCTCGCCGGACAGATGACTCTGACTACTAA
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>LITCHI025239.m1 MKHNIVVAFFCWILITSVHSKTDSSDGNTKESARSFLSRFKILMHANYLNFAVSALNVMF TSLNSPSQLKGWKSSGGDPCGDSWKGITCSGSSVTQIRLSGIGVSGSLGYQLGNLKSVTY LDLSSNNINNNIPYQLPPKLQQLDLSKNGLSGNLPYSMSQMTDLKSLKLGQNSLNGQLTD MFQKLLKLEYLYLQNNQLTGSINVLAALPLDELNVENNQFTGWVPDSLKDIAKTGGNSWS SGAAPPPPPGTKPISKRHKSSSESKQSSVNGIIIGAAVLGALAVLAIAIGLFSKRKRSSP SSHFLDEERAAERRQFTPLASQELTNDMRSERKDYKENNSFNSNASLDKNPFQRSTSIGL KDSPTDRIRSFHDNEFANRLKSQRNSTCAIPYTLAELQAATANFATGRLLGQGTIGRVYR AKYPDGKVLTVKKIDSNLFRVENPENFSEIVTNISRIRHTNIAELIAYCAEQGHHVLIYD YYRNGSIHDFLHMSDDFSKPLTWNTRIRIALGTARAVEYLHEGCSPSLIHKNIKSSNILL DLELNPHLSDYGLANFHQRTSQNLGVGYNAPECTKPSAYTLKSDVYSFGVVMLELLTGRM PFDSKRPKSERCLVRWAAPQLHDIDALAKMVDPALRGLYPPKSLSRFADVIALCVQPEPE FRPPMSEVVEALVRLVQRSTMNMRDDLAASRRTDDSDY.
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>LITCHI025239.m1 ATGAAGCATAATATTGTTGTGGCATTCTTCTGTTGGATCCTCATTACTAGTGTCCATTCA AAGACTGATTCCTCAGATGGAAATACAAAAGAATCAGCCAGATCCTTCTTGTCCCGGTTC AAGATTCTGATGCATGCCAATTATCTGAATTTTGCAGTTTCTGCCCTCAATGTCATGTTT ACCAGCTTAAATTCTCCTTCACAACTGAAAGGATGGAAATCAAGTGGTGGTGATCCTTGT GGTGATTCCTGGAAAGGAATTACATGCTCAGGCTCATCCGTAACTCAAATACGATTATCT GGCATCGGAGTCAGTGGATCATTGGGTTACCAGCTTGGAAACTTGAAATCTGTCACCTAC CTTGATTTGAGCTCAAACAATATCAACAACAATATACCATATCAACTTCCTCCTAAGCTT CAACAGCTGGACCTTTCTAAGAATGGCTTATCGGGGAATCTACCTTATTCAATGTCTCAA ATGACTGATCTCAAGTCCCTAAAACTTGGGCAGAATTCGCTTAATGGACAATTGACTGAT ATGTTTCAGAAACTTTTGAAACTTGAATATTTGTACTTGCAAAACAATCAATTAACCGGT TCAATAAATGTCCTTGCAGCACTTCCCCTTGATGAATTGAATGTTGAAAACAACCAATTT ACTGGCTGGGTCCCTGATTCATTGAAGGATATTGCTAAAACTGGAGGAAATTCTTGGTCA TCAGGGGCAGCTCCTCCTCCACCCCCTGGTACCAAACCCATTTCTAAGAGACACAAATCC TCATCCGAAAGTAAACAGTCTAGTGTGAATGGAATCATTATTGGGGCAGCAGTTTTGGGT GCATTGGCAGTACTTGCGATTGCAATTGGTCTATTTTCAAAGAGGAAAAGGTCTTCTCCA TCTAGTCATTTTCTTGATGAAGAGAGAGCTGCTGAGCGTAGACAATTTACCCCCCTTGCA TCACAAGAGTTAACCAATGACATGCGCTCTGAAAGAAAAGATTATAAAGAAAACAATTCT TTCAATTCAAATGCTTCACTTGATAAAAATCCTTTTCAGAGATCCACTTCCATTGGTCTA AAGGATTCACCCACTGATCGCATAAGATCCTTCCATGACAATGAGTTTGCAAACCGTCTC AAATCTCAAAGAAATTCTACTTGTGCTATACCTTATACTTTGGCGGAATTGCAAGCTGCT ACTGCTAATTTCGCGACAGGACGCCTTCTTGGCCAGGGAACAATTGGACGTGTTTATAGA GCTAAATATCCGGATGGGAAGGTGTTAACTGTGAAAAAGATAGATTCCAACCTTTTCAGA GTGGAGAACCCAGAGAACTTTTCAGAAATCGTGACAAACATCTCAAGGATTCGCCATACG AACATTGCTGAACTTATTGCTTATTGTGCAGAACAGGGCCATCACGTATTAATTTACGAT TATTACAGGAATGGCTCGATCCATGATTTTCTACACATGTCAGATGACTTTAGCAAACCA TTGACTTGGAACACAAGAATTAGAATTGCTTTGGGAACAGCCCGCGCTGTTGAGTACCTT CATGAAGGATGTTCGCCATCATTAATCCACAAGAACATTAAGTCATCTAATATATTGCTT GACCTTGAACTCAATCCTCATCTCTCTGATTATGGATTGGCAAACTTCCATCAGCGTACA AGCCAAAATCTTGGAGTTGGATACAATGCTCCAGAGTGCACTAAGCCTTCAGCATATACA CTGAAGAGTGATGTATACAGTTTCGGAGTGGTGATGTTGGAGTTGTTAACAGGAAGGATG CCTTTTGACAGTAAAAGGCCAAAATCTGAGCGATGCCTGGTTCGTTGGGCTGCACCACAG CTGCATGACATTGATGCATTGGCAAAAATGGTGGATCCTGCATTGCGCGGGCTGTACCCT CCCAAGTCCCTCTCTAGATTTGCTGATGTTATTGCCCTATGTGTACAGCCGGAGCCTGAA TTCCGGCCACCTATGTCAGAGGTGGTTGAGGCATTGGTGCGTTTAGTTCAACGTTCAACA ATGAATATGAGGGATGATCTTGCAGCTTCTCGCCGGACAGATGACTCTGACTACTAATTT TATTTGTCCTCCCTTAAAAGCAAGAACTGTTTTGTACATGTGATAAAGGTCCAGTTGAGA TTATTATTTTATTCAGTAATTTGCCAAATTCAGAAATATGTTCACTGATAGAATTGCCTT CTTAGAAACTTTTGCTACATTTTATAAGTTCAAACTTCAAAGGTTGTTTCTCAATTTTGT TATTGGAAAGAAAGAAATGAGAAATGCAATGTCAAGCACAGCCTAA
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>LITCHI025239.m1 - Up_Stream_Len 2000 GAGGAAGTATGTACGTGTCTCATATTTTAGATCTGGATGGCTTATCCAGAAAGGCAAGTG CTTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTACTCGTAAACTTTTGGGGGTAAACC TATAAATGTTCAATGTTTGTTTGATGATCCTTTTGATGTGTATGAAAAGATTTATCTTTG CTGCTTAAACTTCACAATACAAATGGAAGATTTTTGGGCAGTGTTGTGGTGAACAAAGTC CATGATTTCTTTATGCTTGGTGTAGCGGTTGAAGGGAAATTGTCTGTCTAGTTTGATTGG TTCATGGGTTAACGATTTTATATCACAGTTCCTGGTAGGAATGCCTGTGAGATCAAAATG TTTCACCAAGAAGATGCTGGTCTGAATGTGGAGATGGCGAAACTGGCTTTTGCTAAGGGA ATATGGAGTTATGTGTGTAAGATGGATAACGCACTGCGCAAATATTCTGTGAACAGTCAT CTTCAGACAGGTGAAGCTGTTTCTGCAGTCACTCTTATTCGAAAGGTCAGGTTTTAACAA TATAATTTTGAATACCAGTAGATCTTGATTTCTGAAGGCAGTCAGATTAGTTGTCTTATT GTGACCATGTGCAATCATTTATTGTTGGGGAACTGTGGGTGGAAACTGTCTAGACACAGA TTAGCAATGTGGTATCAAATTACCACCTAGATGTAGTCATTGGTTGAGTCAATATAAAGG TCTTCAATCACATCTTATTAAGGTCTTATATCTGGTAGTTGAATTTGATTCTTTGACAAC GAAACATATGGGAATTACTACATCTTGGGAGCAGATAGAATTGCTAGATTTTATTAGTCC AGAATGAATTTGCTTTACCTTTCATCTGTGTCCTTTTGGTATTTTTGCTCACATTCTTAT TCACCTGAACGTATAGGTTCCACTCGGATTGGAGACTGTTAACAGCACAAGTTCTCCAGC AAGTCCCACGGCAACCATTAATGGACTATATACTGGTGAAGCCAAAGAGAAGAAATTATA TAGAAGGCCATCAAAAAAAGTGGTAGCGAAAGGTTTGCTGCTTCTTGGTGGTGCGATCTG CCTTTCTCGAGGTCACTCTGCCCTGGGTGCTAAAGTTGCTATGGCTTATATCTTAACAAA GCTGCATAGGCGCGGTGCCTCAACAAGCCAAAGTGGGCAAGGTCCGAGGTGAAAGACCTT ATTTTATCACAGCAAATTCTGGTGGTACTGATATGGCTGGCTTGCTGTGTATATCTATTT GCTGTAACTCAAGTAGTCTGAAAAGAGTTGGAAACTGCGGCGAACTTTATATCATATATA CTTGTAATTTTCTATTTTTTTTCCTTTGTGTAAATAAAATTAACAGTAGTTGTAAAAGGC TGAATGGAAAATCAGTAGCTCCAGATGAAAATAAGAAGAGTTTTGAGGTGGAGATTGAAA TATTAGATTGATGCATGTTGAAAGGCATTGCAGCCAGGCCTACCACATAATTCACGATGT TTTGACCATTATCATCATAAAAATAAGAAAAATGGTAGAGAAAATGGATATTGGTTGAAG TTGAATACCAAATATAAAGCAAAGAAATGAAAATGGGAAGAGGCAAGAAAAGGAGTAAAG TTGGAGTTCGTTAAAATTCAAGAAGAAATTCTTTGTCAAAGTGTAGGAAAGGAATTTAAA ACGCGCGGGTAAGGAAGTTGAGGGTTGAGACCGGAAAATGTTGACAACTCTGATCTCTCC TCACCTCTCGCTCTCTCTTTCTCATTTTTAGCTGTATTACTCCTCTCTTGTCCATATTTA GCCACCACCAAAACCCCCCAAACCAGAAAGCTTTTATGAAAAAAAGTGAAACCCCCCTCC ATTTTTTTTTCCTGGAGGTTGTTTTTGTTCCTAGTTGAACAACTCCTCCCTTTTGTTTCT TCACTGCATAGGTTCCTTAACCCATCTTCAATTTTTGGATTTTATATCTATCTTTCATTT TTTTGGCCTTTGAAGGAAAA
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>LITCHI025239.m1 GenomeSequence - ATGAAGCATAATATTGTTGTGGCATTCTTCTGTTGGATCCTCATTACTAGTGTCCATTCA AAGACTGATTCCTCAGATGGTATTCACTTTTGATTTTTATTGTTTTCATTTCATGTCTGT TTAATGCACTTAATCTTGGTTTACTCATATTGATATGCAATGCATTGTTTTGAGTGTGGT GTTGACGAACGTGTTTATCATAATGGTTGTTTCATTTCTATTCAATTTAGTCTGATCAAA AGCTGCAAAATGGTGCATGCATGCTGAATGTTAGAAGGGACAATTAGTAGCAAATTGGGA TACACATTCTAGGCTTCCTTGGTAGCTATTGATGTTTATTGATTATAGCCGTTTACCAAT AGGGAAAATTTTTGAAAAATTCAGTGTTGTGGTTTTTAATATTGGTTGCATAACTTATTG GAATGTTGAGTTCTATTTATAAATTGTATAGATGAGGGTCCATCATTGTATTCACTACTT AGATATGCATTTCAAGAAATCATGTGTCTAGATACTTGATATGAGATAATCATAGGAAAT ACAAAAGAATCAGCCAGATCCTTCTTGTCCCGGTTCAAGATTCTGATGCATGCCAATTAT CTGAATTTTGCAGTTTCTGCCCTCAATGTCATGTTTACCAGCTTAAATTCTCCTTCACAA CTGAAAGGATGGAAATCAAGTGGTGGTGATCCTTGTGGTGATTCCTGGAAAGGAATTACA TGCTCAGGCTCATCCGTAACTCAAATGTAGCCAACTTCATCCTATATATACATATATATA TTCTAATATCTTGATTTATATAAATTTCTATGACACAGAGAATATAAAGTTTGTGTGTCT GAAAATTCTGAATAGTGGATTCTTTCTGCTTTGCAGACGATTATCTGGCATCGGAGTCAG 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