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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI025239 | Chr13 | 24211752 | 24217729 | - | Protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 5 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI025239.m1 | 53 | 90 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 32 | 1.20E-07 |
| LITCHI025239.m1 | 138 | 198 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.5 | 1.20E-07 |
| LITCHI025239.m1 | 406 | 672 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 133 | 1.20E-38 |
| LITCHI025239.m1 | 406 | 670 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 126.8 | 1.00E-36 |
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>LITCHI025239.m1 ATGAAGCATAATATTGTTGTGGCATTCTTCTGTTGGATCCTCATTACTAGTGTCCATTCA AAGACTGATTCCTCAGATGGAAATACAAAAGAATCAGCCAGATCCTTCTTGTCCCGGTTC AAGATTCTGATGCATGCCAATTATCTGAATTTTGCAGTTTCTGCCCTCAATGTCATGTTT ACCAGCTTAAATTCTCCTTCACAACTGAAAGGATGGAAATCAAGTGGTGGTGATCCTTGT GGTGATTCCTGGAAAGGAATTACATGCTCAGGCTCATCCGTAACTCAAATACGATTATCT GGCATCGGAGTCAGTGGATCATTGGGTTACCAGCTTGGAAACTTGAAATCTGTCACCTAC CTTGATTTGAGCTCAAACAATATCAACAACAATATACCATATCAACTTCCTCCTAAGCTT CAACAGCTGGACCTTTCTAAGAATGGCTTATCGGGGAATCTACCTTATTCAATGTCTCAA ATGACTGATCTCAAGTCCCTAAAACTTGGGCAGAATTCGCTTAATGGACAATTGACTGAT ATGTTTCAGAAACTTTTGAAACTTGAATATTTGTACTTGCAAAACAATCAATTAACCGGT TCAATAAATGTCCTTGCAGCACTTCCCCTTGATGAATTGAATGTTGAAAACAACCAATTT ACTGGCTGGGTCCCTGATTCATTGAAGGATATTGCTAAAACTGGAGGAAATTCTTGGTCA TCAGGGGCAGCTCCTCCTCCACCCCCTGGTACCAAACCCATTTCTAAGAGACACAAATCC TCATCCGAAAGTAAACAGTCTAGTGTGAATGGAATCATTATTGGGGCAGCAGTTTTGGGT GCATTGGCAGTACTTGCGATTGCAATTGGTCTATTTTCAAAGAGGAAAAGGTCTTCTCCA TCTAGTCATTTTCTTGATGAAGAGAGAGCTGCTGAGCGTAGACAATTTACCCCCCTTGCA TCACAAGAGTTAACCAATGACATGCGCTCTGAAAGAAAAGATTATAAAGAAAACAATTCT TTCAATTCAAATGCTTCACTTGATAAAAATCCTTTTCAGAGATCCACTTCCATTGGTCTA AAGGATTCACCCACTGATCGCATAAGATCCTTCCATGACAATGAGTTTGCAAACCGTCTC AAATCTCAAAGAAATTCTACTTGTGCTATACCTTATACTTTGGCGGAATTGCAAGCTGCT ACTGCTAATTTCGCGACAGGACGCCTTCTTGGCCAGGGAACAATTGGACGTGTTTATAGA GCTAAATATCCGGATGGGAAGGTGTTAACTGTGAAAAAGATAGATTCCAACCTTTTCAGA GTGGAGAACCCAGAGAACTTTTCAGAAATCGTGACAAACATCTCAAGGATTCGCCATACG AACATTGCTGAACTTATTGCTTATTGTGCAGAACAGGGCCATCACGTATTAATTTACGAT TATTACAGGAATGGCTCGATCCATGATTTTCTACACATGTCAGATGACTTTAGCAAACCA TTGACTTGGAACACAAGAATTAGAATTGCTTTGGGAACAGCCCGCGCTGTTGAGTACCTT CATGAAGGATGTTCGCCATCATTAATCCACAAGAACATTAAGTCATCTAATATATTGCTT GACCTTGAACTCAATCCTCATCTCTCTGATTATGGATTGGCAAACTTCCATCAGCGTACA AGCCAAAATCTTGGAGTTGGATACAATGCTCCAGAGTGCACTAAGCCTTCAGCATATACA CTGAAGAGTGATGTATACAGTTTCGGAGTGGTGATGTTGGAGTTGTTAACAGGAAGGATG CCTTTTGACAGTAAAAGGCCAAAATCTGAGCGATGCCTGGTTCGTTGGGCTGCACCACAG CTGCATGACATTGATGCATTGGCAAAAATGGTGGATCCTGCATTGCGCGGGCTGTACCCT CCCAAGTCCCTCTCTAGATTTGCTGATGTTATTGCCCTATGTGTACAGCCGGAGCCTGAA TTCCGGCCACCTATGTCAGAGGTGGTTGAGGCATTGGTGCGTTTAGTTCAACGTTCAACA ATGAATATGAGGGATGATCTTGCAGCTTCTCGCCGGACAGATGACTCTGACTACTAA
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>LITCHI025239.m1 MKHNIVVAFFCWILITSVHSKTDSSDGNTKESARSFLSRFKILMHANYLNFAVSALNVMF TSLNSPSQLKGWKSSGGDPCGDSWKGITCSGSSVTQIRLSGIGVSGSLGYQLGNLKSVTY LDLSSNNINNNIPYQLPPKLQQLDLSKNGLSGNLPYSMSQMTDLKSLKLGQNSLNGQLTD MFQKLLKLEYLYLQNNQLTGSINVLAALPLDELNVENNQFTGWVPDSLKDIAKTGGNSWS SGAAPPPPPGTKPISKRHKSSSESKQSSVNGIIIGAAVLGALAVLAIAIGLFSKRKRSSP SSHFLDEERAAERRQFTPLASQELTNDMRSERKDYKENNSFNSNASLDKNPFQRSTSIGL KDSPTDRIRSFHDNEFANRLKSQRNSTCAIPYTLAELQAATANFATGRLLGQGTIGRVYR AKYPDGKVLTVKKIDSNLFRVENPENFSEIVTNISRIRHTNIAELIAYCAEQGHHVLIYD YYRNGSIHDFLHMSDDFSKPLTWNTRIRIALGTARAVEYLHEGCSPSLIHKNIKSSNILL DLELNPHLSDYGLANFHQRTSQNLGVGYNAPECTKPSAYTLKSDVYSFGVVMLELLTGRM PFDSKRPKSERCLVRWAAPQLHDIDALAKMVDPALRGLYPPKSLSRFADVIALCVQPEPE FRPPMSEVVEALVRLVQRSTMNMRDDLAASRRTDDSDY.
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>LITCHI024783.m1 CTCTCATTAAATGTGAAAACGCGTAGGTTATCAAGTGGGTCCCGCGACTGTAAAATACGT AAATCGGGGGATGGGTCCCACAACCGAAGTTTCGTTCTTTAACAGCGTTGACCTTTCTTT CGGGCTTCAAATCGGACGGTCGGCGAATGGTGTCTGCGTCGCGTACGTCACGGGCGGGTA ATACGAGACAAACTAGAAGGAAACAAAAAAAATCCAAAAACAAGACAAGAAAATTAAATA AATAAAGTTAGCTGCTAGTCTTCCACACTGAAAAAACACAAAAATCACAAAACAAAAAGG ACAAAGATCTGTTGCTGGGACGACCTCGCCAGCAAATCTCGGTTGAAAAATCACCATGTG CCACATCAACGCCGGAGTTGGTTTTCAACTGATAAAGACAAAACGCTCTTGCAAACCGCT GAACCCGATATGACCACACCCCATTTCCACCTGGCAACATTTTGGTGGCTGAGTATACGA GTCTGGAAAGCGCGTCACAGCAGATTAAACCTGAAAAAAAAATAAAAACGACAGAAAATA ACCCCAGAATATAAAAATGGTGTTTTGCTTGGCTCGCTAGGCCTAGCTCTCTCTCTTCTC CCTCCCTGTCTCTCTCTCTTTTTAATTTCTCGTTTTCTTTTGGTTGCTGTTGGTTTGTGT ACTGGGTTGTTGTCCATTCTTCTTCTGTGTAGTTGAGAAAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAA AAAAGATTTTTTATTTTTATTTTGAACTCATTAGTATGGGTTGTTTTAGCTTCACTGGAA AATCAAACAAGAAATCAAACGACGGCAACACCTCCAAGAAACATGGCTCTGATCCCGGTC CAGGCATTGCCGATGGTGTTATTGGGAAGCAGGGGATAGACTTGAATTTGGTGTTGTTGT CTCTGTTGCAGGATGTTGCTATCAAGCAACTTAATCCTCATGGAGCTCAAGGAACAAGGG AATTTGTTGTTGAAGTATTGACATTAAGCTTAGCTGACCATCCTAATCTTGTCAAACTGA TCGGCTTTTGTGCTGACGGTGATCAGAGACTATTGGTTTATGAATACATGCCGTTAGGAT CGTTGGAAAACCATTTACATGATTACGCAATGACTGGTCAACTGACATTTAAATCAGATG TTTACAGCTTTGGGGTCGTGCTTTTGGAGCTCATCACTGGCAGAAAGGCAATTGATCAAA CAAGAGATCGTAATGAGCAAAATCTGGTTGCTTGGGCACGACCAATGTTCAAGGATCGGA GCAACTTCCCCCGAATGGTTGACCCATTGCTTGATGGCCAATATCCCAAGAGGGGTTTAT ACCAAGCCCTTGCCATTGCTGCTATGTGTGTCCAGGAGGATCCTAACATGCGGCCTGCCA CATCCGATGTTGTTATGGCTCTGAATTACCTTGCTACTCAGAACTTTGAATACCAAAACC CTCCTGTCCAAAAATCCCGAAGGAACCCACCATCACCTCGTTCAGGAGCGTATAGATATG ACACTAGCAGACAGACTGCTGGCAGTGGGTCTGAGTGA
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>LITCHI024783.m1 + Up_Stream_Len 2000 AATATCTCATGTTCAAGTTGTTGCACATGAAAGTGTGTATATATATTTAAAAAAAAGAAT TATATTGAAAACTAAATCAATATATATAATTCCATAACAGAGTTATTATTTATTTTTAGC TCCTTAGATTTTACTGTTCAAGTAGTTGCACATAAATATATATTTTTTAATGATAATAAT GGAAACAAATCGGTGTGTAAAAACGTTTAAAAAAAAATAAAAAAAAATCAGTGTGTAAAA GCTACGTACCAGAGTTATTATTTATTTTTAACCTCTTAAGGGTTTACTTTACAAACTATT TATTTAAGGACAAGCTAACTAATTGAAAATCACTGGAGAAGAGAATTTTATAATTTCATA CAACTTGATGTTGTGCGATCTTTATTCCTAGGTGATAAACGAGATCTACTCACATTATGC TTGCCATAACAGTAAAGCATGCCTAGTGACATTTTCTCTAAAGGCAAATACCACGTTCGA GTAATGACATCCACAAATATAAATAATTTTAGTTTAACCTCTTATATGTAAAGGTAAAAT TACGTTTAAGTCTCGTTAGTTAAAGGGTAATTTTTCACTAAATATGAATCTCTTTTTCTT GATTGTTAGTCAATAGAGTTAGAAATTATGTTATGTATAAATGATTCCTTAGAATCATTT TTAAGAGATTTCACGTTGATATAAAAGAGATCTTATTATTGATAAACGTGATTTATATTT TAGGGTTGGAAATCGAATTAACCCAACTTAGTGTTCAATAATTACAACTTACAAATGGCA TTACTCATGTAGCCTGTTTTTTGGCATATTTGGTTAAAAGCCACTGTCCCTATCCACTTT AAGTGGATTTTATATTCGATAGCATCGTCCCCTATCAATTTGTGTGAAGATCTCTTATTT ATATATAGATCACTTCTCCAATTTCATATGAATCGATTATTCCCATATAAAAACTATTCT CTAGATAATATTATTAATATCTTATTTCAATTAGTTCCAATAGATTTACGAATCAACCCC GTAAATAAAAAAAAAAAAATGAGGCATTACTCATTAATAACACCACGAGAACAACTGATA TTACCGCGTTCGTTCAAACATTCAACACGGTAATTAATTCTGGAGCGGCAATCGCCTGGT GAATCGTACACCAGTGGGGCGACAAACGTCCGTCCCTGATAGGTCCAGCTTTAATTAAAC AAGAAATGGTGGCGGAGTCAGTAACGCCTGGATCACCGTTCGCACCTCTCATTAAATGTG AAAACGCGTAGGTTATCAAGTGGGTCCCGCGACTGTAAAATACGTAAATCGGGGGATGGG TCCCACAACCGAAGTTTCGTTCTTTAACAGCGTTGACCTTTCTTTCGGGCTTCAAATCGG ACGGTCGGCGAATGGTGTCTGCGTCGCGTACGTCACGGGCGGGTAATACGAGACAAACTA GAAGGAAACAAAAAAAATCCAAAAACAAGACAAGAAAATTAAATAAATAAAGTTAGCTGC TAGTCTTCCACACTGAAAAAACACAAAAATCACAAAACAAAAAGGACAAAGATCTGTTGC TGGGACGACCTCGCCAGCAAATCTCGGTTGAAAAATCACCATGTGCCACATCAACGCCGG AGTTGGTTTTCAACTGATAAAGACAAAACGCTCTTGCAAACCGCTGAACCCGATATGACC ACACCCCATTTCCACCTGGCAACATTTTGGTGGCTGAGTATACGAGTCTGGAAAGCGCGT CACAGCAGATTAAACCTGAAAAAAAAATAAAAACGACAGAAAATAACCCCAGAATATAAA AATGGTGTTTTGCTTGGCTCGCTAGGCCTAGCTCTCTCTCTTCTCCCTCCCTGTCTCTCT CTCTTTTTAATTTCTCGTTTTCTTTTGGTTGCTGTTGGTTTGTGTACTGGGTTGTTGTCC ATTCTTCTTCTGTGTAGTTGAGAAAGAGAGAGAGAGAAAAAAAAAAAAAGATTTTTTATT TTTATTTTGAACTCATTAGT
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>LITCHI016604.m1 GenomeSequence + GTCCGCTGTGGTGTGGCAGAGGGGAAGAAGAGAGTGGTCACATTCAATTGATTATAAAAT GGACCTATAAAAAAACAAAATAAATTGATGCAGAGAATGGTAATGGCAATGCTGCCAAAA TCTCTCCTCTTCTCTCTCTTCAAACCCTAAACCTGTTATCAGGCTAATAAGCTACCTGAA CCTGAACCTGAATCTGAATCTGAACCTGGACCGCTCTCCAACTCAAAACCCGGCTTTCCA TAAAATCCACTCAAACCTATCTATTTCTCTTTTCTTCCCCCATTCACAGGCCCCAGCATT TGCTGCCTGCCGTGGGCACACTACTAAACCCACCTTTTTTCATATTTTAATTTTATTAAT CACATTTGCTTATTATTACCCTACTCTCATTCTCTCTCTCTCTAACTCTTTGGATCCTAT GCCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTGGATGTATTCCT ACATATAAAGGGCTTGTTGTTTTACTGTTGTGATACATAGCCCGGTTTCAAAGCAAAAAA GCCTTTTCTCTCGGCCTTAGCTTGGCCTTGTTGTGTTATTGCTTTCTTTTGTTTGTTTGT TTGATTTTTTTTTTTGCAAAAAAAAAAAAAATCTTCTTGGTGTTTCTTGGTTCCTTTGCA AGTGTGTTTGATCTCTCTCTCTCGCTGCTCTTATCTCGTTGGGTTAGAGAGCTTTTTATT GATAAATTAGTTGGCTGAACGACATGTCGAGCTGCATCGATGTTGCGCCTGAGCAACTCT GCTACATCCCCTGCAACTTTTGCAACATAGTTCTTGCGGTATCTAAACCTGAGACCTCTT TCTTTAATGGGATCTGCTTTTTTCACATACCTAGCTCATGTATTTTTCTGTATGTTGTTC 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