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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI024807 | Chr13 | 20308421 | 20311585 | + | Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI024807.m1 | 180 | 221 | PF06203.17 | CCT | Motif | 65.8 | 2.90E-18 |
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>LITCHI024807.m1 ATGTACTCCTTTGCACGCGCCTCCTCTGACTATTACTGCGCCTCCAACTCCACGTCATTC GACCACGTCATCACTCCGGTCGTTTTCCCTTCAACTGCTGCCCCGCCGTTACCATTACCG CTACCGTTACCGTCACATTTACTCGGCCCAGCCGATCACCAACTCGCTGCTGAGTTCGAC TGGGTGAACATGGCCCCTAGTAGTCAGAGTCACAGCAGTGGCAGCACCAGTGGTTGTAGC AGCTATAACTCTCCCACTTACGACACCACCACCACCACCACTCCGCGGCCGAGTATTATA CAGAGGAGTATCAGCAGCCACTCTCTCCAGAAGAACAATGAGGGGCTCCATTGTCATTTC CTTAACGAGTTTCTTGACATGGACACCAGCCCTGTCAGGAGGGTTTGTAGCACCGGTGAT TTGCATAGGATTAATAAGGGGCAAAATGGGCAGAGGTCAGAGAGTCCATTGGCAAGTGAG AGTAGTATTATAATTGAAGGCATGAGCAGAGCTTGTCGTTACAGTCCAGAGGAGAAAAAG GAGAGGATTGAGAGATATAGAAGCAAGAGAAATCAGAGGAACTTCACCAAGAAAATTAAG TATGCATGTAGGAAAACGTTGGCAGACAGCAGGCCGCGTATAAGAGGGCGGTTTGCGAGA AATGATGAACTCGAGAAGAATCCTCAAGTTCAATGGAAGCACATTGTCGGGGAGGAAGAG GATGAAGATGATGAGAATTGGATCAATTATCTTGAATCGGTCTCGACGAATCTGCTTTCT TAA
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>LITCHI024807.m1 CATGTCTCCAGTCTGATGGACTGACTGAAATGAGATGCGATAACAACAAGTCAACGCCCC CTTTGATTTCCCAATAACATATGACGTCATCGTCCACGTCAGCATCCAGCTCTCCAATTA AATCTTCCTCTTCTTTCTTCTACAGCCTTGTATGTTGATAAATACACTCCCTTCCCTCTC ACCTCCACTCAAAAATCTCTTCACTTCACTCTCAAAACACCAATTCTACACGCGTCCACA GCCATGTACTCCTTTGCACGCGCCTCCTCTGACTATTACTGCGCCTCCAACTCCACGTCA TTCGACCACGTCATCACTCCGGTCGTTTTCCCTTCAACTGCTGCCCCGCCGTTACCATTA CCGCTACCGTTACCGTCACATTTACTCGGCCCAGCCGATCACCAACTCGCTGCTGAGTTC GACTGGGTGAACATGGCCCCTAGTAGTCAGAGTCACAGCAGTGGCAGCACCAGTGGTTGT AGCAGCTATAACTCTCCCACTTACGACACCACCACCACCACCACTCCGCGGCCGAGTATT ATACAGAGGAGTATCAGCAGCCACTCTCTCCAGAAGAACAATGAGGGGCTCCATTGTCAT TTCCTTAACGAGTTTCTTGACATGGACACCAGCCCTGTCAGGAGGGTTTGTAGCACCGGT GATTTGCATAGGATTAATAAGGGGCAAAATGGGCAGAGGTCAGAGAGTCCATTGGCAAGT GAGAGTAGTATTATAATTGAAGGCATGAGCAGAGCTTGTCGTTACAGTCCAGAGGAGAAA AAGGAGAGGATTGAGAGATATAGAAGCAAGAGAAATCAGAGGAACTTCACCAAGAAAATT AAGTATGCATGTAGGAAAACGTTGGCAGACAGCAGGCCGCGTATAAGAGGGCGGTTTGCG AGAAATGATGAACTCGAGAAGAATCCTCAAGTTCAATGGAAGCACATTGTCGGGGAGGAA GAGGATGAAGATGATGAGAATTGGATCAATTATCTTGAATCGGTCTCGACGAATCTGCTT TCTTAATATGTATTAAAAAAAATTAGTATGTCTATTGTTGAACTATTTAGTTTCATGGTG TGGCAGTTTTAGAGTGTGCTTATTGTTAGTTTTCTCTTTTACTACTATGATGCAAATTTA AGTGTTCTTTAGCTTAAAACTAGGAGATGTAAATATAGTTAATTGCATTCTTATTACTAT GACAATGTGAACTTGTAAGGGTTTTAAATTTTATAAAATGTTTCCATTAATTTTAGGGAT TTGAAGTGTTGTGATTATAGTCAATCTTTTCAACATTCAAATAAAGGTGGT
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>LITCHI024807.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTTTTTAAATTTTTTTTTCTTTTGCTTCTTCTTTGTTTGACTGAATTTACTTGTGAACAA TTCTCAATTTTGGTTTCACAAAATGATTGAAGGGAATTAAAAAATGGTTTCTCATTGCAG GCCTTGTCTCCCCTAGTTCAGATTCTGATGGGAATCTCTTTCTTTTTTGTCTGATAATTA ATGGGATTATCACCCTCTAAAGACAATCACTTAATAATTAACTAACTTAAAATAACCGTG CTTTCATTACTTAATTAATTAATACCAAGTTCAGGACACTTTTATGTATAGTGGAACTTT TTTCACCACATGAATGTCTGATTCCAATTTTTAATTACTTTCATGAATCATTGTTTACTT TAAACTTTTTAATTACTTGTCTCTCTTCTTGATTATCAAATTTATAATAAATTTAAAAAA AAAATAATAATTTTTATTCTTAATATTATTTATACTTTATGTTCAAAAATCTATTTAATT TTTTTTTGAAGCAAAGTCTATTTAACATATTGGTATCTTTAAGTAAATACTCAATACTTG TTACAAAATACCTTCTAATTCCTTGACCTTTTCTGGATAGTAGTTTCATAAATTCCTACA ATTTCACCTGCGGTAACTATGTTCGAAAAAATCCTTTATATTGAGCAAAGGCCTAATGTC TTAGTAGAAAGACAAGCCATCTTCATGCACTAATATGCTAAGGTCGACTCACTTTAACCA CTTTTGTAGTGACCAGTTTTTCCCTCAACAAGTAGGGGTATCTTCCCTCTTTTAGAATTC ATTCTTCCGCTCTAAGGAGTTTCCTTTTCAGGGCCGCGTCTCAGTGGGTAAATCTAGAGT GTTTGGTTGTATATCTATTTGTGTAATAATATATATAATAAATATTAAAAAAAAAAATCC TTTATATTAGTAAGTTAAGTTTTAACAAATTTTGTAAGAGATATTTGTTAGATCAATTTT AGAAGATTTTTCTAACAAATTTCAACTAATTATTTAAAAGATATTTCTAATAGACAATAA GAAATTTTTCTTTAAAAAAAATTCTATATTATCTTGTAGAGAACATTACATTAATTTTCT TAGGCAGTAAATCAATTTTGTGAATAATAATAAAATAATCTACAAGTGACATTGAGTGTT TTCTATCAAAATCCATTTGTAATTAAAAATTTGCACACACCCCCCCAATTTCTGCCACTG ATTTTCTTATTAATTTTCTCTTATTTTTATTACAAAAAAGAAGTAATATTCCTTGAAATT AATATTACCTATTGCTACAATATTTGACTCTTGTTACATCATATTCAACTTCCTATGCCA ATATAGTATCTTTAAAATAATTCTAATTTCAATTATTTAATATATATGTTTTTTGATAAC TAATTTTGAGTCCAAAGAGTAGCCAAGATTAGTAGGTATATGACTCTGAGACGTGGTTTG AAAAACAATTCATATTGAGTTAGGGTGTAATTCACGTTACGTGGAGAAAAAGAATCAATA GGTGTAGAACCCACAACCTTTAGGGGTGGAAGTGGGTGGACAATATAATTCATCAGTATG TTGTTACCTGAGCTATTATTTAATAAAATAATTAGTTCATTAAAATAAATGTTTTGGCCG AACAAATACTATTTGATGGTTCAATATAAAAAGTAATTTTAAAATTATGTAGGAAAGAGG AAAAGTGGAAGTTATTATTTATTTATTTATTTTTGAAAGAAAGAAAAAGTGGAAGTGGAG TATGAAGAATTGAAGATCATGTCTCCAGTCTGATGGACTGACTGAAATGAGATGCGATAA CAACAAGTCAACGCCCCCTTTGATTTCCCAATAACATATGACGTCATCGTCCACGTCAGC ATCCAGCTCTCCAATTAAATCTTCCTCTTCTTTCTTCTACAGCCTTGTATGTTGATAAAT ACACTCCCTTCCCTCTCACCTCCACTCAAAAATCTCTTCACTTCACTCTCAAAACACCAA TTCTACACGCGTCCACAGCC
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>LITCHI004311.m19 GenomeSequence + ATTTCGTTGTCAAATGCTCCCCCACGCCGAGGGTATCTTCTTCTTTCTGTTAATTACCTT ATCAGACCGGCAACAAAACAAATATTTCACTCCCACACACTCTTTCCTTCTTTAATCTTT ACAAACAAACATCAGACTCTCTCTCGACTAATACAGGATCGTCACTTTAAGTTCTAAACA AACGGCTGGCGGAGATCCCTCCCAAAATAAAAGCCATTGGTTTCAATCCACACACCATTA CATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTCTTCTTCTTTTAATGGTCATGATCAAC AGCACTGCTTTCCATTACAAGTTTAGGTTGATCTAAACTCTGATTACATTTTCTTCTATC TGGTCTGCTATATATATGTTACTTTGCCATCGTGCGCGTGTGTGTGTATAAATATAGCTC AACCGGGAATACAAGGGAAAGAGAAAGGTAATAATTGAAATCCAGTTGTATATGAAATGC TATGAGCATATATCTATCTCTTTTCTGTGTTTTGGCAGTATGTATATAGTATTACAGAAT TGAAGGAGACATAGAAGAGAATACATAAATTCAGGAGGCTCAACACTATGGAATTAAGGG ATCAGGACTTGGCGCCAAAGTACATAATGAGGTAATCAATTTTGCTTTAACCAAGTTTAT TAGTATAAACTTGCTAGAGGTAGACCAACTAATCAACTTCAGTGCTCATAAATTAATTAA ATTGCCTTGGTGAATTACAACCCTTACAAATAGCATCCATATATAATAGATCATACATGA GGATAGCATAAATTATATATGAACCCACTTCGAACCAATGATAATTAACGTTCACAACCT TATTACATGACCTATCTATATTCGATTCTCATTTGTGAAAGTATATAAATTATGAAAAAA 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