Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI024807Chr132030842120311585+Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 3

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI024807.m1180221PF06203.17CCTMotif65.82.90E-18
Download   Copy
>LITCHI024807.m1
ATGTACTCCTTTGCACGCGCCTCCTCTGACTATTACTGCGCCTCCAACTCCACGTCATTC
GACCACGTCATCACTCCGGTCGTTTTCCCTTCAACTGCTGCCCCGCCGTTACCATTACCG
CTACCGTTACCGTCACATTTACTCGGCCCAGCCGATCACCAACTCGCTGCTGAGTTCGAC
TGGGTGAACATGGCCCCTAGTAGTCAGAGTCACAGCAGTGGCAGCACCAGTGGTTGTAGC
AGCTATAACTCTCCCACTTACGACACCACCACCACCACCACTCCGCGGCCGAGTATTATA
CAGAGGAGTATCAGCAGCCACTCTCTCCAGAAGAACAATGAGGGGCTCCATTGTCATTTC
CTTAACGAGTTTCTTGACATGGACACCAGCCCTGTCAGGAGGGTTTGTAGCACCGGTGAT
TTGCATAGGATTAATAAGGGGCAAAATGGGCAGAGGTCAGAGAGTCCATTGGCAAGTGAG
AGTAGTATTATAATTGAAGGCATGAGCAGAGCTTGTCGTTACAGTCCAGAGGAGAAAAAG
GAGAGGATTGAGAGATATAGAAGCAAGAGAAATCAGAGGAACTTCACCAAGAAAATTAAG
TATGCATGTAGGAAAACGTTGGCAGACAGCAGGCCGCGTATAAGAGGGCGGTTTGCGAGA
AATGATGAACTCGAGAAGAATCCTCAAGTTCAATGGAAGCACATTGTCGGGGAGGAAGAG
GATGAAGATGATGAGAATTGGATCAATTATCTTGAATCGGTCTCGACGAATCTGCTTTCT
TAA
Download   Copy
>LITCHI018793.m1
MHYSKATKSSSSGSSTGSNASSTSAPPGRHPTYRGVRRRSSGKWVSEIREPRKPTRIWLG
TFPTPEMAAIAYDVAALALKGQDAELNFPDLAPSFPVPASTSPRDIQTAAASAASALGAA
KDALSGVERDEPRANIIESERPMSQQFVDEDLIFDMPNLLVNMAEGMLMSPPRLDIAGDD
DAAADTTADDHNLWKFP.
Download   Copy
>LITCHI016563.m1
GTTCTTAGATATTTTTCATATACTCAGTCTTCTAAGGCCCAAGCACCAGTATAGTTTGAT
TATTTTTTTGCTGCAAATGAATTGATCAACCTTTGATACCCACTTGATATTTAAGAGGCT
GCACTTTTTGTTTCAAAAGTCTAGAATGCAATAAAGGGGGTTCCGATATAGAACTCTAAG
GACAAATAAAAGCATGTGCTGTGTAGGGTAGAACAACTTAAATGCTTGAAGTGATACAGA
TAGTTGATATTTTGCAGGGAGTGGTGAAAGAGTTGTCATAACTTTAACAAAGGAAAGACT
AAGAGTAGTAGCATTCTACACTGCATTTGTCTTGTATTAACTTGATTTATATTTGGTTGA
CAAGAAGTCACGTGAATGGCTTTCAGGCCTCTTCTCAACTTGATTTATAAGACCTTGAAA
ACGCTTTTATTTAGGTTCTTAATTTGCCCTATCCCATACTGTCCATCTTCGCTAGACTCA
TTGATCTCATCATCAATATGTCGAGTACTCCTGTTTTTCCGTATCCACCACCCAGCTCTC
ATTTTCAATTTGTGGATAAAAAGGATCATAATCATGATCTCCAACACTTTGATCATCACC
TCTTCCTTTCATCACATAATCGACCCCCTTATGATCCTACTTTCTTTAACACAACTCAGG
ATCAGGATCAAAGATCGATTCAACTTCAAGCTTCACAACAACATCAACTCAAGGTGGATC
AGCACTTATCTCATTATAGTTCAAGTGATGAACAAGTACTTTCTCCGTCCTCTTCATATC
ATCAACCTGATATATGCAATGGGTATAAATCAGTGCGTAAAAGAGAGGTCCTTGGAGATG
GAAGTAGTAAAAGCGAAAATGGGTCCGCAGCAACTACATGGATATCCTCCAAGATGAGGC
TAATGCGAAAAATGACCAAGTCAAATTGCACTGGAACAAATGAATCAAAGAAAATTATGC
AAAAACTTCAATATGATCAGTTTCAAGAAAGTAGTGAAATCATCAACTCAATCAATAACA
ACAAAAGCACTGTTAGAGTCTGCTCAGACTGTCATACAACCACTACACCCCTTTGGAGAA
GCGGCCCTCGTGGTCCCAAGTCACTTTGCAACGCATGCGGTATTCGACAACGAAAGGTGA
GAAGGGCAATGGAAGCCGAAGCCGGGAATAGCAGCACAACCGCGGTCACCACTGAAACGG
GGTTTACAAAGATTAAAATTCAACACAACAAGAAGGAAAAGAAATCACGTACAAGCCACG
TTGGAGGGCAGTACAAGAAACAGTGCAAGCCTCAAGATCATCCTCCAGCTGCTGGGATCA
CCGGAAGAAACTTTCGCTTCAAGGATTTTGCTCTAAGTTTGAGCAGGAATTCATCTGCTT
TTAAGCAGGTTTTTCCACAAGAAGTGGAAGATGCTGCAGTCCTGCTTATGGAACTATCTC
GTGGCTTCATTCAAAGATAGATTTTATTATTATTTTCTATTTGTAATCTTTGTTGATTTG
TCAAATCTGGAAAACTAAACTTGTTATATGTTATTTGGGTGCCTAAGAGTGAAAGACAAA
TCTTTTGAGAGGATCTTCGAACTAAAGTTAATGTGAGTTTGCTTAGGTATTGCTCATGTT
GTAGTAATTCAAAATAATAATGATAGTAATACATCTTGTTAGATAATTCCAC
Download   Copy
>LITCHI016563.m1 -  Up_Stream_Len 2000
GAGACATTGATGGTAGAAATATACTATATATATATATATATATACTATATATAATAATTC
TATCATTAATGTCTTTTAACTTTAAAAAGTTAGGATGAACTAGTTCATAACCCAGTCGAT
CCTATCCTACACACAATCATAAACCTTATTTCTTCTTTTTAACTTTTGATGTGAGAAGGA
TTTACTCCCTAGGCCTCTTACAGCAACTTCAAATCATAACTTAAACATTGGATTTTAATT
ATTTCCTTCACCTTTTTTATGTCACTTTAGTTTCAGAGAGTCATTGAGATCCGTACACCG
AACAATTAATCGAGCATACATGCATTATCCTTCTTTTTTTTTAATCTTATTTTCTTCAGA
GAGAAAGTTAGGATTGATTGAAAGTTCCCATGAGATGTAGCGATCACGTAATCGATTAAT
ATTGGCGATCTGAATCTGAACTTAAGATATCCTATCAATAAACGAATTGACATTACTTAA
GAGTACTAATTCTATCTACAAGGCTTGTTAAGCTTCTTCCACAAATGTCAAGTAAAAGTA
CATCATATAACTGATCATGTCAAACGTGGCTGTATGGAGACCTTTTGTTCAATTTGCTGC
TGGCTGAGCCTTTCTCTAAGCAAATATAGAGCAAGAAATTAAAATGACCGATCGTATATA
AAAGCAAATATAAATTAATTAAAGAGGCAGAATTTGAAATTTCTTTGCTTAAGTGAGGGC
ATTAATTGAAAGAAACGATCAGAAGAATGGCTGGTGGCAAAAGGTGTGGGGACTGAAAAG
ATGCTGTCAATGTCCTTAGTCTGCTCAAGTAATTGATGACTTTTGGCAAGATTAAGAACC
TAAGATGCTCCAGTGTCTGCAAATCTACATGCCGATCTCTCTTCACATCTCCATAGATAA
TCCTCTCAATTTCATCTGTTATCTTCCAAATTAATTAATCTCTTTCATTGGAAAAATTAG
ACCTTGCACCCGATACAAAAGTAAATAAGTATCATATATATATATATATATATATATATA
TATATATATATATATATAAGTTACCCAACTTGTGTGGTAATTTTAAATACATCAAAACCC
TTCTCTAATTTATAATAATGAATTATATATAATGATATCATACATGTAAATTGATAGTTA
TGTTAATCTAAAGATGGGATGGTTAATAATGTATTAGTTTAAGTCATTTGACTTTAAACA
AAAAATGTAGATAATTTAAATAATTTGACGTTACTTTTTAATTAATGTATTATCAAGTTC
TTTCTTAAAATTCATTAAAATAATATATCTTATGTTTTGTCAAATTCTTTTAGAAAATCT
TAATTTTGAGAAGTTAATTCTGATAAATAAATTAGAATATAGCAATTATTTCTTATGTAT
ATAAATGCAAAAAATCCAAATGGCTTGACATTTTTTTTTTTTTTTAATTTTGCATGAACC
GGAGTTTAAAATTTCCCTTAAGAAGAAAGAAAAAACATTGACCAACATAAAATTAAAGGA
TCGGTTCTTAGATATTTTTCATATACTCAGTCTTCTAAGGCCCAAGCACCAGTATAGTTT
GATTATTTTTTTGCTGCAAATGAATTGATCAACCTTTGATACCCACTTGATATTTAAGAG
GCTGCACTTTTTGTTTCAAAAGTCTAGAATGCAATAAAGGGGGTTCCGATATAGAACTCT
AAGGACAAATAAAAGCATGTGCTGTGTAGGGTAGAACAACTTAAATGCTTGAAGTGATAC
AGATAGTTGATATTTTGCAGGGAGTGGTGAAAGAGTTGTCATAACTTTAACAAAGGAAAG
ACTAAGAGTAGTAGCATTCTACACTGCATTTGTCTTGTATTAACTTGATTTATATTTGGT
TGACAAGAAGTCACGTGAATGGCTTTCAGGCCTCTTCTCAACTTGATTTATAAGACCTTG
AAAACGCTTTTATTTAGGTTCTTAATTTGCCCTATCCCATACTGTCCATCTTCGCTAGAC
TCATTGATCTCATCATCAAT
Download   Copy
>LITCHI016563.m1 GenomeSequence - 
GTTCTTAGATATTTTTCATATACTCAGTCTTCTAAGGCCCAAGCACCAGTATAGTTTGAT
TATTTTTTTGCTGCAAATGAATTGATCAACCTTTGATACCCACTTGATATTTAAGAGGCT
GCACTTTTTGTTTCAAAAGTCTAGAATGCAATAAAGGGGGTTCCGATATAGAACTCTAAG
GACAAATAAAAGCATGTGCTGTGTAGGGTAGAACAACTTAAATGCTTGAAGTGATACAGA
TAGTTGATATTTTGCAGGGAGTGGTGAAAGAGTTGTCATAACTTTAACAAAGGAAAGACT
AAGAGTAGTAGCATTCTACACTGCATTTGTCTTGTATTAACTTGATTTATATTTGGTTGA
CAAGAAGTCACGTGAATGGCTTTCAGGCCTCTTCTCAACTTGATTTATAAGACCTTGAAA
ACGCTTTTATTTAGGTTCTTAATTTGCCCTATCCCATACTGTCCATCTTCGCTAGACTCA
TTGATCTCATCATCAATATGTCGAGTACTCCTGTTTTTCCGTATCCACCACCCAGCTCTC
ATTTTCAATTTGTGGATAAAAAGGATCATAATCATGATCTCCAACACTTTGATCATCACC
TCTTCCTTTCATCACATAATCGACCCCCTTATGATCCTACTTTCTTTAACACAACTCAGG
ATCAGGATCAAAGATCGATTCAACTTCAAGCTTCACAACAACATCAACTCAAGGTAAGCT
AGCTATATCTCACGCACATGATCAATTTACTCCAATTAATTTACAAATATACCTACTTAA
ATTCTTTCTTCTTTCTTTCATGTTATGCTTGATCTTAATTTTAGTTACCCTTTTGAATTT
TTTGTTTAATGTATTCGAAGATCAGATCACAAATAGTTATATAAATAGTACATGAAAGTA
ACTAGTATTCATGTATCAGTATAAATATTCTTTTGATTTTGCTTGCTTGAGCCTTTGTTT
CTGATTTGGTTTCTTGGCAATATTAATTTCATGATGCTGATCAGCTGATTTTTATGTTGT
TTGTTTGATGAAATCGTTATTTTTTTTACCTCAATCTGATAATCTTGATCTCTTACTCGA
TCTTTAGGTGGATCAGCACTTATCTCATTATAGTTCAAGTGATGAACAAGTACTTTCTCC
GTCCTCTTCATATCATCAACCTGATATATGCAATGGGTATAAATCAGTGCGTAAAAGAGA
GGTCCTTGGAGATGGAAGTAGTAAAAGCGAAAATGGGTCCGCAGCAACTACATGGATATC
CTCCAAGATGAGGCTAATGCGAAAAATGACCAAGTCAAATTGCACTGGAACAAATGAATC
AAAGAAAATTATGCAAAAACTTCAATATGATCAGTTTCAAGAAAGTAGTGAAATCATCAA
CTCAATCAATAACAACAAAAGCACTGTTAGAGTCTGCTCAGACTGTCATACAACCACTAC
ACCCCTTTGGAGAAGCGGCCCTCGTGGTCCCAAGGTTGTTTTCCATCCATATATATTTGT
ATATTTATGGTAAAATTTATTTCTTCGAGAGACATCAACATCTTTAAATTTAAGTAACAA
TGTCTTTGGTGCAGTCACTTTGCAACGCATGCGGTATTCGACAACGAAAGGTGAGAAGGG
CAATGGAAGCCGAAGCCGGGAATAGCAGCACAACCGCGGTCACCACTGAAACGGGGTTTA
CAAAGATTAAAATTCAACACAACAAGAAGGAAAAGAAATCACGTACAAGCCACGTTGGAG
GGCAGTACAAGAAACAGTGCAAGCCTCAAGATCATCCTCCAGCTGCTGGGATCACCGGAA
GAAACTTTCGCTTCAAGGATTTTGCTCTAAGTTTGAGCAGGAATTCATCTGCTTTTAAGC
AGGTTTTTCCACAAGAAGTGGAAGATGCTGCAGTCCTGCTTATGGAACTATCTCGTGGCT
TCATTCAAAGATAGATTTTATTATTATTTTCTATTTGTAATCTTTGTTGATTTGTCAAAT
CTGGAAAACTAAACTTGTTATATGTTATTTGGGTGCCTAAGAGTGAAAGACAAATCTTTT
GAGAGGATCTTCGAACTAAAGTTAATGTGAGTTTGCTTAGGTATTGCTCATGTTGTAGTA
ATTCAAAATAATAATGATAGTAATACATCTTGTTAGATAATTCCAC