Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI024630Chr131837260118374004+Transcription factor PCF1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI024630.m13593PF03634.16TCPFamily62.66.60E-17
Download   Copy
>LITCHI024630.m1
ATGAATTTCAGTACTGTCAGTGGATCATCTTCAGAAGTTGGCAAAGGAGCCACTGCCACA
CCCAGACCCTCAAACCCAGTCAAGGTCCCTACAACCAACGGCAAGAGGGGCCACCACACA
AAGGTGGAAGGCCGAGAACGCCGTGTCACCTTAAAACCTGCATGTGCTGCCCAAATCTTC
AAGCTCACTCATGATCTGGGCTTCAAGTATGCTGGTGAGACCATAGCGTGGCTCCTGTGC
CAAGCAGAGCATTCTATTATTGAGAAAACTGGAAATGGGGTTCCCTTCAAAGTGGAAGGT
GTGCAGCCAAATCAAGCGAACCCTCTTCCGCCTGGAATAAGTAACAGGTTCTCCAGTACC
ACATTGATTCCTCCGGGTGTCTCAGGTGATGCGGAGAAGAACTCGATGGCTGAACAACCA
GCTGTGCATGTGCCACCTCCGGAGGATCAGCTGTCAACTTTTGATGATTTGGATGATTTT
ATTTCAACCTTTGATGCGAATTATCTCTCTTCGCTTTAG
Download   Copy
>LITCHI024630.m1
MNFSTVSGSSSEVGKGATATPRPSNPVKVPTTNGKRGHHTKVEGRERRVTLKPACAAQIF
KLTHDLGFKYAGETIAWLLCQAEHSIIEKTGNGVPFKVEGVQPNQANPLPPGISNRFSST
TLIPPGVSGDAEKNSMAEQPAVHVPPPEDQLSTFDDLDDFISTFDANYLSSL.
Download   Copy
>LITCHI024630.m1
CTCTCAATCTCACTTTTTTTTTTATTTTTTGGTCTCACTTGACAGCCTTTGTTTGGTTCA
CCGTGATCAATCTGATACAGAAAATGAATTTCAGTACTGTCAGTGGATCATCTTCAGAAG
TTGGCAAAGGAGCCACTGCCACACCCAGACCCTCAAACCCAGTCAAGGTCCCTACAACCA
ACGGCAAGAGGGGCCACCACACAAAGGTGGAAGGCCGAGAACGCCGTGTCACCTTAAAAC
CTGCATGTGCTGCCCAAATCTTCAAGCTCACTCATGATCTGGGCTTCAAGTATGCTGGTG
AGACCATAGCGTGGCTCCTGTGCCAAGCAGAGCATTCTATTATTGAGAAAACTGGAAATG
GGGTTCCCTTCAAAGTGGAAGGTGTGCAGCCAAATCAAGCGAACCCTCTTCCGCCTGGAA
TAAGTAACAGGTTCTCCAGTACCACATTGATTCCTCCGGGTGTCTCAGGTGATGCGGAGA
AGAACTCGATGGCTGAACAACCAGCTGTGCATGTGCCACCTCCGGAGGATCAGCTGTCAA
CTTTTGATGATTTGGATGATTTTATTTCAACCTTTGATGCGAATTATCTCTCTTCGCTTT
AGTGATCAACTTCTAATAGATGTTTCAAAGAAAGTATATAGTGGTGATGAAGCATGAAGA
GCGGAACTGATCTGTTTAAAATCAATCAATCCGATGTTTAACAACTTTTTATGCTTCTCT
CTTGAGTGCTAGAGGCAGTGAATGTTTGAGAATTTATCTTAAGCATATATATTATATCAT
GAGTTTCTTATATATAGATGATTTTACTGTGTTGGGCAAAGAAGCTGCACCATTTCTCTG
CTAAGAACAAAAGAAGAGAAAAAGATAACGGAAGGAGAAGAAAAAGCAATAATTGAGTCG
GTGATGGTGGTATCTGTTTTTAACTTAGGTAATGATAAATTCTGGTATTTTCCCCATGTC
TGGAGATAAAAGTTGAGGTTTTAGGCAAGGACGTAGCATTAATGGTGGGCTACAAATTTA
TGAAAGGGTGAGTTGCAAAATAGTGCTTATAGAAGGGTTAACTTTTATAAAAATAGTGCT
AGCTAGCGAATCAGCTACACGTTGCTGCCATTTATGCTGCAGCTTGTTAATCAATATGAC
TCAGATTTTGACGGCACCCCTAACAGCGTAACTGGCTTTTTTTCCTTTTTTAAAGAACCT
GCCTAACTAGTTTATTACCAGCAAATTTAGTCACCTGCTAATTATCCTGGCTAGGATTAA
TTAGGTATCAATTTTGGCGTCGAAAACTGTTTTGTTGTTTGCTTTCTTGCTTAACGCGAG
ATTTTTCCTTTCTTCTTTTTTCTAGCATAGAAAAAAGGAGTAAGTTTTATAAATATCATC
AAAGAAATTCAAATGTTTTCTCGA
Download   Copy
>LITCHI024630.m1 +  Up_Stream_Len 2000
ATTTAAAAATAAAAATTAGTAAATAAATTAAAAAATAAAAAGATTGACTGACAGGCCAGG
ACTCAACCTAAAGGGAGCCCGAGCCCCAAGGCCCAAGGCCCATCTTTTGATATATATTAT
ATGTATGTGGGGAGCTCCAACAAGGCCCATATAAGTCTTGTTGGTCATTCAACAACTTAA
CCATGTTATCTTTCTTATATACTTAAAATGTAGAATGTTTCTTTTCCATATGGGATTGTA
ACTTTCCATTTCAAACTTCTTTTAAAAAACTCAACAGAGTCAACGCCAATCTTGGACAGC
TAGTGGATCATCTATGTCCTTCAATTCAATTGATATTTATATTTCCAGGAAACAAAATAT
TTTTAAGTAGCTAGGCTCCACCTGTATTTCTATAAAATAGTTAATGGTCCATTCATTTTC
TTGCATGACTCTTTGCTAAATACAATATTTAATAAAAGAGTAATGTTTAGTATCGAATCA
CAATTTTATCCTAATATCATTTAGCTTTCTTAGGCTGACACAAGGTGGGGTGACGGCCTT
TTTTTTTTTAATAATTAATGATCAACCTATCAACCTTGATCAAATACTACAACAGTGAGT
ACAGTCTTGCCATCAACTTTCACAAATGAGGAGAATATTTCTCAAACTTGCACTTTTGTA
CAAATATATATAGGAGGTACATAACGAATAATATCAAAATTCAAAATTGGTGTAATATTA
CATCAAAATACTCTATATCCTTCTTTTATGTGTTTTTAGTAATACATAAAATAGAGGTCA
TGGACTAACTTAAAATGCCGACTATGCATTTTAACCTTATTCTATACTTTTAATAGCATA
GAACTAATTCTAAGTTTTAAAAATCTTTTCTAGAGGATGATCGAAATATATTAAAGGATA
TGCGAAATTTGCTAGTCTTTCACCTGTCGGGTAGAATAGATTTCTAACGGATTTTACGTT
GGATAGAGTATCACTTTTTTCAAAAGGTAAAAGACGATCTATATATTACTAATGATTTTG
AAATCACATAGTTTTTCCTCATGTTGTATTGTAATCTTGAGTACGGTGATGAAATTCATT
ATGAAGATTTTAGTCTCAAAAAGTGTCTTATCACTTTTTATAATTCATAAAACTCTATCT
CTACTCTTTATTTGGACTAATGTAAGATTGAAATATTAAACTATGCAAATTAATACGTAA
ATAATGTGTCATGAAAGCTATAATGATTATTTTAATTTTGAGACAATGATATGTTAAGTG
AACAATTCATATGCACAATATTTGAGTATAAATACAGGTTTGATTATTTTACTGATTGGA
TAACCGTATCCATCAATTAGAACTATTTGACCGGTTATAAGAATGGTTACTAAAATCAAT
TTAATGGTTTTAATCGATAAGTAAATATTATTCAACCAATAAAATAACTAAATCTTTTAG
GTATATAATTAAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAGGTAAAATTGGACGTTACTTCATTAAATT
AAGCAAACATAATTACAAAAATGGCCTAACAAGGCACATTCAATTTTGAATTGAGTAAAA
TAAGTAATATAATTAATGTGTTTTTTAAAAAAAAAAATAACACAACTCACGTTCACAGTT
AAAATGAAATAAAAGCACAATGGACAACTTTTAAAAATAACTGACAAATGAATCACATGT
CTATGTTGATTTACTGAACGTTGGATTTTGTCATGATGACATCAGCTTCAATCCAACGGT
TACTCACTCGGATTACAATGAAGAAAACCTTCAATGTTCATTGCATATTTGTACAATTTA
TAAGTAGCAGCAACCCCAACCAGCACAGATATGCAGGTTAGGCTAAATACTTTTTATGGG
TTGAATTCTACACTGACTGATAGTTTTTAGAATTAGAAGTCACACCATACTGACTCTCTC
TCAATCTCACTTTTTTTTTTATTTTTTGGTCTCACTTGACAGCCTTTGTTTGGTTCACCG
TGATCAATCTGATACAGAAA
Download   Copy
>LITCHI024630.m1 GenomeSequence + 
CTCTCAATCTCACTTTTTTTTTTATTTTTTGGTCTCACTTGACAGCCTTTGTTTGGTTCA
CCGTGATCAATCTGATACAGAAAATGAATTTCAGTACTGTCAGTGGATCATCTTCAGAAG
TTGGCAAAGGAGCCACTGCCACACCCAGACCCTCAAACCCAGTCAAGGTCCCTACAACCA
ACGGCAAGAGGGGCCACCACACAAAGGTGGAAGGCCGAGAACGCCGTGTCACCTTAAAAC
CTGCATGTGCTGCCCAAATCTTCAAGCTCACTCATGATCTGGGCTTCAAGTATGCTGGTG
AGACCATAGCGTGGCTCCTGTGCCAAGCAGAGCATTCTATTATTGAGAAAACTGGAAATG
GGGTTCCCTTCAAAGTGGAAGGTGTGCAGCCAAATCAAGCGAACCCTCTTCCGCCTGGAA
TAAGTAACAGGTTCTCCAGTACCACATTGATTCCTCCGGGTGTCTCAGGTGATGCGGAGA
AGAACTCGATGGCTGAACAACCAGCTGTGCATGTGCCACCTCCGGAGGATCAGCTGTCAA
CTTTTGATGATTTGGATGATTTTATTTCAACCTTTGATGCGAATTATCTCTCTTCGCTTT
AGTGATCAACTTCTAATAGATGTTTCAAAGAAAGTATATAGTGGTGATGAAGCATGAAGA
GCGGAACTGATCTGTTTAAAATCAATCAATCCGATGTTTAACAACTTTTTATGCTTCTCT
CTTGAGTGCTAGAGGCAGTGAATGTTTGAGAATTTATCTTAAGCATATATATTATATCAT
GAGTTTCTTATATATAGATGATTTTACTGTGTTGGGCAAAGAAGCTGCACCATTTCTCTG
CTAAGAACAAAAGAAGAGAAAAAGATAACGGAAGGAGAAGAAAAAGCAATAATTGAGTCG
GTGATGGTGGTATCTGTTTTTAACTTAGGTAATGATAAATTCTGGTATTTTCCCCATGTC
TGGAGATAAAAGTTGAGGTTTTAGGCAAGGACGTAGCATTAATGGTGGGCTACAAATTTA
TGAAAGGGTGAGTTGCAAAATAGTGCTTATAGAAGGGTTAACTTTTATAAAAATAGTGCT
AGCTAGCGAATCAGCTACACGTTGCTGCCATTTATGCTGCAGCTTGTTAATCAATATGAC
TCAGATTTTGACGGCACCCCTAACAGCGTAACTGGCTTTTTTTCCTTTTTTAAAGAACCT
GCCTAACTAGTTTATTACCAGCAAATTTAGTCACCTGCTAATTATCCTGGCTAGGATTAA
TTAGGTATCAATTTTGGCGTCGAAAACTGTTTTGTTGTTTGCTTTCTTGCTTAACGCGAG
ATTTTTCCTTTCTTCTTTTTTCTAGCATAGAAAAAAGGAGTAAGTTTTATAAATATCATC
AAAGAAATTCAAATGTTTTCTCGA