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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI024528 | Chr13 | 17067347 | 17077018 | - | DNA repair protein RAD5A |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI024528.m1 | 103 | 210 | PF08797.14 | HIRAN | Domain | 63.1 | 1.90E-17 |
LITCHI024528.m1 | 337 | 726 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 282 | 5.10E-84 |
LITCHI024528.m1 | 406 | 569 | PF00270.32 | DEAD | Domain | 25.2 | 1.30E-05 |
LITCHI024528.m1 | 778 | 825 | PF13920.9 | zf-C3HC4_3 | Domain | 38.6 | 7.40E-10 |
LITCHI024528.m1 | 780 | 821 | PF13639.9 | zf-RING_2 | Domain | 33.1 | 5.80E-08 |
LITCHI024528.m1 | 780 | 820 | PF13923.9 | zf-C3HC4_2 | Domain | 33 | 4.20E-08 |
LITCHI024528.m1 | 781 | 820 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 34.2 | 1.80E-08 |
LITCHI024528.m1 | 781 | 818 | PF13445.9 | zf-RING_UBOX | Domain | 32.8 | 5.80E-08 |
LITCHI024528.m1 | 781 | 828 | PF14447.9 | Prok-RING_4 | Family | 28.9 | 8.20E-07 |
LITCHI024528.m1 | 851 | 963 | PF00271.34 | Helicase_C | Domain | 60 | 2.70E-16 |
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>LITCHI024528.m1 ATGGGAACTAAGGTCACTGACGAACTCTTGTCCACCGTCCGATCAATCGTCGGCACAGAC TTCTCCGACATGGACATAATCAGAGCCCTACACTTGGCCAACCACGATCCCAATGCTGCC ATCAACATCATTTTCGACACTCCCAATTTCAAAAACCCCGACCCGAGACCGATAGCGAGG ATGCCACGGAGGCCGGTCGTCGATAATGTAACCGTGATCGAAAACCGTAATGTGAGTGGT GGAGACGTAGATGTTGTCGAAGTTTTGAGCGAAAACGGAAACAGTGGAGGTGAGTGGTGG TTTGTGGGTTCGGGTGACGTGACGGGAATGTCGACGAGTAAGGGCAGGAAGCTGAGGCGC GGTGAAGAAGTAATGTTCACGTTCCCGAAGAGTTGTCAATTGAATTCTCCTTTTCCTAGT AAGGGTTTCGGGAGGGCGAGGCAGGCGGTGGTGGCCTGTTCCGAGATTGTGAGGTTTTCC ACCAAGAGCGGTGGAGAGATTGGTCGAATACCTAACGAGTGGTCTCGGTGTCTCATACCG CTGATGAGAGAGAAGAAGATTAGGATAGAGGGGTGTTGCAAGTCTGCTCCGGATGTGTTG AGCATAATGGATACCATTGTTTTGTCAATAAGAGTGTATATCAATAATTCTGTACTCCAA AAGCACCACCAGACCTCTCTTAAGGCAGGGGGCAGTTTATCTGACGACTCACTTTTTCAT CCTCTCCCGAATCTGTTCCGGTTGCTTGGCATGACTCCTTTCAAGAAGGCAGAATTTACT CCAAGTGATTTTTACTCGAGGAAGAGACCTTTGGACTCAAAGGATGGTTCTCATATCCGT GTGTCATTGCTACGTGTCAATAAGTGTAAGAGTCAATCTGAAAATGCTAATGAAGAAAAT GTTGAGTGCATTTCAGACACCGATCTTGATAACATTGTTGGCACTGGGGACAGCTCCAAA ATAGAGGAAATGGAGCCTGCTAGTTCTTTACTGTGTGAACTGCGTCCCTACCAGAAGCAG GCCCTTCACTGGATGATGCAGCTGGAGAAAGAACGATGTGTGGATGAGGCACCAACAACC CTTCACCCATGTTGGGAGGCATATCGCCTGGCAGACGAGAGAGAACTTTTTATCTATTTG AATTCATTTTCTGGTGATGCTACGACAGAATTTCCAAGTGCACTGGAAATGGCCAGAGGA GGAATTCTTGCAGACGCTATGGGGCTTGGAAAGACTGTTATGACCATATCCCTCCTACTC ACTCATTCAGAAAAAGGTGGATCTTCATGTAGTCGGTGCATAAGTCAGCCTTCTGGTGAA AGTATTGAAAAATGTGATATTTCTGAGCAATCACCAAATCATAGGACGAAAGAACCCAAA TTTTCAGGCTTTGATAAGTGGACCAAGCAAACAAATACGCTTGCAAATGGTGGCAATCTA ATTATATGTCCTATGACTCTTCTAGCCCAGTGGAAGGCAGAGATTGAAACTCATGCACTG CCAGGTTCTTTGTCCCTGCATCTTCATTATGGACCAAGCAGACGAAAGGACGCAGAATTT TTAGCTCAGTGTGATGTGGTAATTACTACATATGGAATACTGGCTTCAGAATTTTCATCA GAGAATGCTGATGACAATGGGGGACTTTTCTCAGTTCGGTGGTTTAGAGTAGTTCTTGAT GAGGCACATACCATAAAATCGTCTAAAAGCCATGTATCCCAAGCTGCTGCTGCTCTTGTT GCTGATCGCCGGTGGTGTCTCACTGGCACTCCTATCCAGAACAATCTGGAGGATGTATAC AGTCTTCTGCGGTTTCTGAGGGTTGAACCATGGGGAAATTGGGCTTGGTGGAATAAACTT ATCCAGAAGCCGTATGAGGAAGGTGATGAGAGAGGGCTGAAGTTGGTTCAGTCCATTTTA AAGCCGATCATGTTAAGAAGAACAAAGTCCAGTACTGATCGAGAAGGAAGGCCAATTCTA GTTCTTCCTCCAGCTGATACACAGGTAATTTACTGTGAACTGACGGAAGCTGAAAAAGAC TTTTATGATGCCCTATTTAAAAGATCTAAGGTTAAGTTCGATCAATTTGTTGAGCAAGGA CGGGTCCTTCATAATTATGCTTCTATATTGGAGTTACTTCTGCGTCTTCGGCAATGTTGT GATCATCCATATCTTGTAATGAGTCGAGGTGATACACAACAGTACTCAGATCTGAATAAG CTAGCTGAACGTTTTCTGAAAGGCAGCGATAGGATTCCTGAAGGGGAATCCATAGATGTG CCTTCACGGGCTTACATACAAGAAGTTGTAGAGGAGCTGCGTAAGGGAGAGCAAGGAGAG TGTCCAATATGTCTTGAATCATTTGAAGATGCAGTATTGACACCATGTGCTCACCGCTTA TGCCGAGAATGTCTTTTGGCAAGTTGGAGAACTCCTACTTCTGGTTTATGTCCTGTTTGT AGGAAAGCCATCAATAGGCAAGATCTTATTACAGCACCGACTGATTGTCGGTTCCAGGTT GATATTAAGAAAAATTGGGTCGAATCATCTAAAATTACTGTTCTATTGAAAGAGCTTGAA CATCTTCGCTCATCAGGTTCCAAGAGCATTCTGTTTAGCCAGTGGACTGCCTTTCTGGAC CTCTTGCAGATTCCTCTTTCTCGTAATAACATTTCATTTGTTCGACTGGATGGGACTCTG ACTCAGCGGCAGCGTGAAAAAGTAATAAAACAATTTTCTGAAGACAAAAGCATCATGGTG TTACTGATGTCACTTAAGGCTGGTGGGGTTGGAATAAATCTAACAGCAGCTTCCAATGCT TTTGTCTTGGATCCATGGTGGAATCCAGCTGTAGAGGAGCAAGCCGTCATGCGTATTCAT CGAATTGGACAAACTAAGAGAGTGATGATTAAACGGTTCATTGTGAAGGGAACAGTTGAG GAAAGAATGGAGGCAGTGCAAGCACGGAAGCAGCGGATGATTGCTGGTGCATTGACTGAT CAAGAAGTTAGAAGTGCTCGGATTGAAGAACTGAAGATGCTTTTTACTTGA
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>LITCHI024528.m1 ACAGGCCTCGCCCACGCTTCTCTTATATCTCCAACAGCCCCCGCCTTTTACAAAACTTCC TTCCTTCACACTCAAGCCCCATCGCTAACATGCACCTCTGCGCACGTTAGCAACCGGGCC CCGCCATCTCCGAGCTTTTTCGTCGCCCTCCCTCTCTAAATCTTTTAAGTTCTTTTAAAA AATCCACGCACGAAGTCGGATTAGGGTTAGGGTTTTTCTGTTTTTTAAATAATATTTTAT TTTATTTTATTTTTTATCGGATGGGAACTAAGGTCACTGACGAACTCTTGTCCACCGTCC GATCAATCGTCGGCACAGACTTCTCCGACATGGACATAATCAGAGCCCTACACTTGGCCA ACCACGATCCCAATGCTGCCATCAACATCATTTTCGACACTCCCAATTTCAAAAACCCCG ACCCGAGACCGATAGCGAGGATGCCACGGAGGCCGGTCGTCGATAATGTAACCGTGATCG AAAACCGTAATGTGAGTGGTGGAGACGTAGATGTTGTCGAAGTTTTGAGCGAAAACGGAA ACAGTGGAGGTGAGTGGTGGTTTGTGGGTTCGGGTGACGTGACGGGAATGTCGACGAGTA AGGGCAGGAAGCTGAGGCGCGGTGAAGAAGTAATGTTCACGTTCCCGAAGAGTTGTCAAT TGAATTCTCCTTTTCCTAGTAAGGGTTTCGGGAGGGCGAGGCAGGCGGTGGTGGCCTGTT CCGAGATTGTGAGGTTTTCCACCAAGAGCGGTGGAGAGATTGGTCGAATACCTAACGAGT GGTCTCGGTGTCTCATACCGCTGATGAGAGAGAAGAAGATTAGGATAGAGGGGTGTTGCA AGTCTGCTCCGGATGTGTTGAGCATAATGGATACCATTGTTTTGTCAATAAGAGTGTATA TCAATAATTCTGTACTCCAAAAGCACCACCAGACCTCTCTTAAGGCAGGGGGCAGTTTAT CTGACGACTCACTTTTTCATCCTCTCCCGAATCTGTTCCGGTTGCTTGGCATGACTCCTT TCAAGAAGGCAGAATTTACTCCAAGTGATTTTTACTCGAGGAAGAGACCTTTGGACTCAA AGGATGGTTCTCATATCCGTGTGTCATTGCTACGTGTCAATAAGTGTAAGAGTCAATCTG AAAATGCTAATGAAGAAAATGTTGAGTGCATTTCAGACACCGATCTTGATAACATTGTTG GCACTGGGGACAGCTCCAAAATAGAGGAAATGGAGCCTGCTAGTTCTTTACTGTGTGAAC TGCGTCCCTACCAGAAGCAGGCCCTTCACTGGATGATGCAGCTGGAGAAAGAACGATGTG TGGATGAGGCACCAACAACCCTTCACCCATGTTGGGAGGCATATCGCCTGGCAGACGAGA GAGAACTTTTTATCTATTTGAATTCATTTTCTGGTGATGCTACGACAGAATTTCCAAGTG CACTGGAAATGGCCAGAGGAGGAATTCTTGCAGACGCTATGGGGCTTGGAAAGACTGTTA TGACCATATCCCTCCTACTCACTCATTCAGAAAAAGGTGGATCTTCATGTAGTCGGTGCA TAAGTCAGCCTTCTGGTGAAAGTATTGAAAAATGTGATATTTCTGAGCAATCACCAAATC ATAGGACGAAAGAACCCAAATTTTCAGGCTTTGATAAGTGGACCAAGCAAACAAATACGC TTGCAAATGGTGGCAATCTAATTATATGTCCTATGACTCTTCTAGCCCAGTGGAAGGCAG AGATTGAAACTCATGCACTGCCAGGTTCTTTGTCCCTGCATCTTCATTATGGACCAAGCA GACGAAAGGACGCAGAATTTTTAGCTCAGTGTGATGTGGTAATTACTACATATGGAATAC TGGCTTCAGAATTTTCATCAGAGAATGCTGATGACAATGGGGGACTTTTCTCAGTTCGGT GGTTTAGAGTAGTTCTTGATGAGGCACATACCATAAAATCGTCTAAAAGCCATGTATCCC AAGCTGCTGCTGCTCTTGTTGCTGATCGCCGGTGGTGTCTCACTGGCACTCCTATCCAGA ACAATCTGGAGGATGTATACAGTCTTCTGCGGTTTCTGAGGGTTGAACCATGGGGAAATT GGGCTTGGTGGAATAAACTTATCCAGAAGCCGTATGAGGAAGGTGATGAGAGAGGGCTGA AGTTGGTTCAGTCCATTTTAAAGCCGATCATGTTAAGAAGAACAAAGTCCAGTACTGATC GAGAAGGAAGGCCAATTCTAGTTCTTCCTCCAGCTGATACACAGGTAATTTACTGTGAAC TGACGGAAGCTGAAAAAGACTTTTATGATGCCCTATTTAAAAGATCTAAGGTTAAGTTCG ATCAATTTGTTGAGCAAGGACGGGTCCTTCATAATTATGCTTCTATATTGGAGTTACTTC TGCGTCTTCGGCAATGTTGTGATCATCCATATCTTGTAATGAGTCGAGGTGATACACAAC AGTACTCAGATCTGAATAAGCTAGCTGAACGTTTTCTGAAAGGCAGCGATAGGATTCCTG AAGGGGAATCCATAGATGTGCCTTCACGGGCTTACATACAAGAAGTTGTAGAGGAGCTGC GTAAGGGAGAGCAAGGAGAGTGTCCAATATGTCTTGAATCATTTGAAGATGCAGTATTGA CACCATGTGCTCACCGCTTATGCCGAGAATGTCTTTTGGCAAGTTGGAGAACTCCTACTT CTGGTTTATGTCCTGTTTGTAGGAAAGCCATCAATAGGCAAGATCTTATTACAGCACCGA CTGATTGTCGGTTCCAGGTTGATATTAAGAAAAATTGGGTCGAATCATCTAAAATTACTG TTCTATTGAAAGAGCTTGAACATCTTCGCTCATCAGGTTCCAAGAGCATTCTGTTTAGCC AGTGGACTGCCTTTCTGGACCTCTTGCAGATTCCTCTTTCTCGTAATAACATTTCATTTG TTCGACTGGATGGGACTCTGACTCAGCGGCAGCGTGAAAAAGTAATAAAACAATTTTCTG AAGACAAAAGCATCATGGTGTTACTGATGTCACTTAAGGCTGGTGGGGTTGGAATAAATC TAACAGCAGCTTCCAATGCTTTTGTCTTGGATCCATGGTGGAATCCAGCTGTAGAGGAGC AAGCCGTCATGCGTATTCATCGAATTGGACAAACTAAGAGAGTGATGATTAAACGGTTCA TTGTGAAGGGAACAGTTGAGGAAAGAATGGAGGCAGTGCAAGCACGGAAGCAGCGGATGA TTGCTGGTGCATTGACTGATCAAGAAGTTAGAAGTGCTCGGATTGAAGAACTGAAGATGC TTTTTACTTGAACCAGAAAAGAAAATGGAATTTTTTTGTCTACATCTCTTATCATGGGAT GGTCTCCCTCTTAGATCAACAAGTTTGTAATTGACAAACAAAGAAGATAGGGTTGAAGTT TCATTTCAATCAAACAAGCATCTACTTGATAGTTTCAGAGCAAAGGAGCTATTCAGAAGT TAGTGTATGTATTTGCTTAACCATGTTAATGGGTATGTGTATAGTCAGGAAGGAAATGTA ATTTGTTCAGGATGGAGAATTAGAAGGGAATTTGTATTTATCTTTATTCTGCTGAGATGA TGTGATTCAACGTGACCGTTTCCTATAGCTAACTAAGTTCTCTTTAATTTGCTCCAAAAG GATTTTAAAAATATTAAAGTTTTAAAAAAAAAATCTCGACCTTATCATCTAATTCACTAT TTACCCTAATTTAAGTGTCGTAATCTCCTGTTTGAATCATAACCTCTTAATTTAATTAAA ATATTGTTTTAATTTAACCATATAAATTATTAGGGTAATACTGGATTGTCTAAA
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>LITCHI024528.m1 - Up_Stream_Len 2000 TGATAGAGGCTTGCAGGATTGCAATGTCCTTAGACAGAAATTTCTCCCATTTTCACTGCT TGAAGGACCAATAGAGTCTGTCTCAGGATACAACTATTGTTCCTCTGTATCAAAGCAGAT GATACAGAAGCCAAGTGAACTCTGAAACTTTTTTCCCCCAGTTCTGGATGTATGATATGA ACAAAAGAATTTAGATTTTATTGTAAATTTTTTTTTTTCTCTATAAAACTCTAAAATCAA TTATGTATTTATAGACTAAGAAGAGGCATGTTGAAGAGATATGTCTGTTCTTAAAAGAAC GATGCTTATTTTCAATTTGTTTTAAAATCAAATTTAAATTAAATTTAAATTCAAGTTTAA AACAAACACTTTAACGGATAAATAAATGGATTTGGGCTCAAGTCAACTCCAAAGCCCAAA CTTAGACAAGCCCAACTTCTTAGCCCAATGTGGGATTTCTTGTTTCAAACACTTCTAATA TTTCTAACACCTTCAACGCAGGATGCGACAGGTTATTGTACTTCAAATTCACTTTCAACC TCCCAAAAATTCCTGAGTCGTGTAACATCTGTATCATAGGTTGATTTTTGAGGAAACATC ACTGAGGCATGCATTATTTTCGCTATCTCAAGGCTATACTACTCATATTGCAGCCCCGCA CCATGCTCGTAGGACCATTTTAGTACTTAATTGGTTTCTATAAAATATATTAATTGAAAT GGTTCATGATTAGTCTAGTTATTATCAGTCATACATTATACAAATTATTGATAAATTATT TTTCATTTGATTAATCCTATTACAAGGAATCTTTTCAATCGAATATTGAAATTTCTCAAT TTGTTAACATTCAAGTGAATATTTAGTTATGTAATCTACACATGATACAATTATCATTAT TTTAATAGAATTTATTACTCAAATGTTTTAAGGAATTTAATAAAAGTTAAAATTTTAAGT TAATTTCGAAAACTGTTTATTATGTACGATATAACCTTATGATAGGTATTAGTCCATTCT ATTTTTAATTTAATATAATCCCATGACCTGGCTTATAAATATTTAATATGTTCATTGAAT ATAATTTTGCCAATAGAGTGCTTGACCACTCCTTGAAAGTTAATATATAACTAGTTGATC TACATATCGTTTATGACATTGGCAATAATTTACTGTTTATATTCTGTGCATGCAAATAAA TTTTGTTTTATAACTATCTACAATGCAATAATTTAAATTCACATAAAAAACTTAGTTTTA TTTAATTATTCATAATAATATAAAATTTTGTAAGACTGATATAATTTAAAAACAAGCAAA TACATTTTCATTTTATGGGATCATGTCCAATTTATACATTTAAAATTGAAATTTCATAAC AAGATAACAAAAATCCGTATCAATTCATAACTGTGTGTAAATTTAATAACTTAAAAACAC CTATTTAATTTAAACCAAATAAATGAAAATACTACACTAGAATAATAAAGTTTTAAGAGG TTTATATATTGGTTGATATTGATAAATCTTGTTAGACTTTTAACCTATTATATGTCTTGT TAGACGGCAAGAATTTTTTTTTTTCCAAAGATTACTGTAATAAATCCTCTCAATTAAATC ACAACTCACCTATATGACTTACAATTTTGATTTTGGAAATCGAAAAAAAAAAAAAAAAAA GAGCAGGGAAAGTAAAATAAAGTGAAAATAAGCAAGAAATGGCGGGAAAGATTAGGCGCC ACAGGCCTCGCCCACGCTTCTCTTATATCTCCAACAGCCCCCGCCTTTTACAAAACTTCC TTCCTTCACACTCAAGCCCCATCGCTAACATGCACCTCTGCGCACGTTAGCAACCGGGCC CCGCCATCTCCGAGCTTTTTCGTCGCCCTCCCTCTCTAAATCTTTTAAGTTCTTTTAAAA AATCCACGCACGAAGTCGGATTAGGGTTAGGGTTTTTCTGTTTTTTAAATAATATTTTAT TTTATTTTATTTTTTATCGG
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>LITCHI024528.m1 GenomeSequence - ACAGGCCTCGCCCACGCTTCTCTTATATCTCCAACAGCCCCCGCCTTTTACAAAACTTCC TTCCTTCACACTCAAGCCCCATCGCTAACATGCACCTCTGCGCACGTTAGCAACCGGGCC CCGCCATCTCCGAGCTTTTTCGTCGCCCTCCCTCTCTAAATCTTTTAAGTTCTTTTAAAA AATCCACGCACGAAGTCGGATTAGGGTTAGGGTTTTTCTGTTTTTTAAATAATATTTTAT TTTATTTTATTTTTTATCGGATGGGAACTAAGGTCACTGACGAACTCTTGTCCACCGTCC GATCAATCGTCGGCACAGACTTCTCCGACATGGACATAATCAGAGCCCTACACTTGGCCA ACCACGATCCCAATGCTGCCATCAACATCATTTTCGACACTCCCAATTTCAAAAACCCCG ACCCGAGACCGATAGCGAGGATGCCACGGAGGCCGGTCGTCGATAATGTAACCGTGATCG AAAACCGTAATGTGAGTGGTGGAGACGTAGATGTTGTCGAAGTTTTGAGCGAAAACGGAA ACAGTGGAGGTGAGTGGTGGTTTGTGGGTTCGGGTGACGTGACGGGAATGTCGACGAGTA AGGGCAGGAAGCTGAGGCGCGGTGAAGAAGTAATGTTCACGTTCCCGAAGAGTTGTCAAT TGAATTCTCCTTTTCCTAGTAAGGGTTTCGGGAGGGCGAGGCAGGCGGTGGTGGCCTGTT CCGAGATTGTGAGGTTTTCCACCAAGAGCGGTGGAGAGGTAATTCAATGTTATTCACTTG TTTTGGTTATTTGAATAAGATATTTTGTTTTGAATGGGGTTATTTGTGAATTTTGATGTA ACTTAAACATCTTTTTTTTTTGTTTGGGTGAATTTATAACGGTTATGGGTTTGTGACAGA 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