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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI024452 | Chr13 | 15946627 | 15952119 | + | Transcription factor TGA9 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI024452.m1 | 45 | 88 | PF07716.18 | bZIP_2 | Coiled-coil | 28.8 | 1.10E-06 |
LITCHI024452.m1 | 46 | 87 | PF00170.24 | bZIP_1 | Coiled-coil | 32.1 | 9.60E-08 |
LITCHI024452.m1 | 128 | 203 | PF14144.9 | DOG1 | Family | 105.8 | 1.10E-30 |
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>LITCHI024452.m1 ATGCCACGAAATGATGATGCCTTTGCCTCTCCATATCATCTCCATGATTGCTTGTTCCAA CGACATCACACACATCTGCCTCAGAAATGTTTAATGAGAAAAGGAGCTGGTTCAACTTCA GAGAAACAACTTGATGCTAAGACATTGAGACGTTTAGCTCAAAACAGAGAAGCTGCAAGA AAGAGCCGTCTAAGAAAAAAGGCTTATGTGCAGCAGTTGGAATCTAGTAGAATAAAGCTC TCTCAGTTAGAACAAGAGCTACAAAGAGCACGCTCTCAGGGATTATTCTTAGGAGGCTGT GGTGGTGCAGGTGGTAACATCAGCTCTGGGGCTGCAATATTTGACATGGAATATGCAAGA TGGTTAGATGACGATCATCGACACATGTCAGAGCTCCGGACGGGATTGAATGCTCATTTA CCGGACAGTGATCTCAGGATCATCGTGGACGGCTACATTTCACATTATGATGAGATTTTC CGGCTCAAAGGTGTGGCAGCAAAATCAGATGTTTTCCACCTTATCAATGGCATGTGGACT ACTGCCACGGAACGTTGCTTCCTTTGGATGGGTGGTTTCAGGCCCTCTGAACTTATCAAG ATGTTGATAACGCAGTTAGACCCACTGACGGATCAGCAAGTGATGGGTATATGCAGCCTG CAACATTCATCACAGCAGGCAGAAGAGGCACTGAGCCAAGGCCTTGAACAACTCCAACAG TCTCTCGTCGAAACCATTGCTACTGGCCGATAA
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>LITCHI024452.m1 + Up_Stream_Len 2000 CACACACTGGTGAATCCTTTCAAGTGAAAATATATACAAGCTTGATTTTTATGTATGTGT TTTTGTTTGTTGAAGAGAGGTGATGAGAATGGTCTAAAGAGGGGGTCTTGCATGGCGAAC CACAGAATTGGAGAGACTGGTTTATCAGACTCGGCTCCTGCAAATCACCATCACCATGTT CCATATGCAGCTCTTCATGGGATCAACACACATGCAAGTTTCATGTATACTAGCTATAGC CACCTCATAGTCATAGATTTTTGGTCTTGATCAAGTCAATTAATATTTAATTTTTCACGA TGGATTGTGACTTGACTTCAGTTTCCTTTTGTGATTTTTGTTTTGTTTTGTATTAAATGT TATGTTAAAAGTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAGAAACTGACATGGTAATCATGAAAAA CTTGTGTCACAGCAATCAAGGAGGATCTGCTTTTGATTTTGGAGAGCTGGAAGAAGCAAT TGCGCTGCAAGGAGTTAAGCTTAGGAATGATGAAGCAAAAGCATGTATGTTTCTTTCTCT ACAACCATTCCAGCTAGCTTTTGTGACGTTTGATAAGAATAACAATTAACCACTCCCTCT CTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTACAGTGAGGAGAGTTACCATTTCCAATAGAG TAATGATTCTGAGGCAAGAGACTTGAATGGTGTGAGGATACAAATATAGAAAACCTGTGC TGTCACATGATACGATTTACTGACTCCATAACTGCATAGAGAGAAAAGGAAGATTAGGTT CCTTCTCCTTTTGAGATTTGTTTTGTAAGAAAGTCTGTTTCTTTTATATCTATATTTTTT GGTTGATCCTTTCTCTGAGTCTGAGATTTTACTTTTGTGATTCTTTGCAGATTTATTTAC AGCAGCAGTAGCAGGCAGACCAGCAGCAACCCTGGACATATTCCCTTCTTGGCCAATGAG ATTCCATCACACCCCAAGAGTAGTATTCTTGTTTTTAAACCTTTCTTTCTCTTTGTTTGA CCACTTCTTTTTAGTACTAGATAGACAAACCAAAAAAAAAAAAAATTGCTTAACAAGTAC AAACTCTAAATCTCTAAAGTGATATATATATATATTTTTCTTTTTTCTTCACTTTTGAAA ATGTGTTTATTAAGTTGATTTTGATTATTCTGGGATGATTCTATAGATACCCATTTGAAA ATCTTTGATAGGGTTTTTATTTTTATTCAGGGAAGTTCAAAGTCAGGAGGAGAAAGTACA GACTCAGGATCAGCTTTGAACACACTTTCAAGCAAAGTTGAAGGGCAACTAGAGCCAGAA TCTCCTATAAGTAAAAAGGCATCTTCATCAGATCGTCAGGCTGCTTTTGACCAGAAGCAC TTCCAGCTCCAGCAGAATCAACAACACATAGAGATGGCTAATAATGATAACTCAACAATA GGTCCATCACAGAATCAAGCCAAACCACCCCAAGAAATAAAGGTCCTTAAACTACTCTTT TGCTCAATAATTAGCCTCCCCGTAATCCAATAACTCAGGAAAAGTTGGTATCTTTATTGT TATTATCACTCTTTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCGCTC TCTATGTGTCCCACTTTGCATATCTTCAAAAATACAAAAGCACGGATCCCAACAATCCAC AAAATCAGATCTCCGTCAGTTTTTCTGATATTAAAGGATTTTCTGATCAGAATCTGACAT GAAGAGAGAAAGACAAAGAGGTACACATTAGAAAGCAAAGAGAGACAGACCCTTTAGTAC TTTTGTATGTGCTTGTGGGTGATTCTCATTATAATAAAAGACCCTCCTTTTATTTCAAAA ACAAAGACCCTTCTTTACTCAATCCCTATAACAAACAGATAAACTTCTCGTTTTTAAGCC TTGAAAATCAGTTTTGGAAGTACAGATAAACTTCTCGTTTTTAAGCCTTGAAAATCAGTT TTGGAAGTACACAAAGCACT
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>LITCHI024452.m1 GenomeSequence + ATGCCACGAAATGATGATGCCTTTGCCTCTCCATATCATCTCCATGATTGCTTGTTCCAA CGACATCACACACATCTGCCTCAGAAATGTTTAATGGTTTGAGATATTTCTAATCATTCT AATTTGTGTTTTTTAAATTACACATATGAAAACAAAACAACCCCTTTAAAATGCTCGCAA TGATTATCATATTTCTTTCTCTTTACCACATTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTT TTTTTTGGAAACTTCTCTACCACATTTTCTAACACCTACTTTTCTTGATCATTTTCTTCA CACATAAACTATTTAACTATATGTAGATATATATATATTTTTCTTATTGTTGCAGAGAAA AGGAGCTGGTTCAACTTCAGAGAAACAACTTGATGCTAAGGTCTAAAAATTTCCCATTTA TTGTACTATAAATTTCGGCATTGTTTGGACTCAAATATTTTGAGGTGATTATATATTTTT TCAGACATTGAGACGTTTAGCTCAAAACAGAGAAGCTGCAAGAAAGAGCCGTCTAAGAAA AAAGGTAAAATTTTGAAGAAATATATGTATGTATATGTGTATGTGTATGTGTGTTTTTAA CTTTTGTTATATTGGGTGTGGTCAACAACTTTATCAATGATTGTTTGTCTGTTCATAAAC AGGCTTATGTGCAGCAGTTGGAATCTAGTAGAATAAAGCTCTCTCAGTTAGAACAAGAGC TACAAAGAGCACGCTCTCAGGTTTTAACTCTTTCTTCATCTTTTTAAATCAAGTGATATA TGTTACTTAAAAAAAAACAACAAGTGATATATATATATATATATATAATCTATGAAAGTT ACAATTTGTTCTTTAATTAATTAATTATTACATGCGTTTCTGATTCTGGGGTTGTTTTGT 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