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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI023822 | Chr13 | 6805359 | 6808726 | + | Transcription factor GAMYB |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI023822.m1 | 16 | 63 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 51.1 | 1.30E-13 |
LITCHI023822.m1 | 19 | 79 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 51.9 | 7.40E-14 |
LITCHI023822.m1 | 69 | 112 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 49.9 | 2.90E-13 |
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>LITCHI023822.m1 ATGTCTAAGAGGAGGGGGGATGAAGAAGGTAGGAATGGATTGAAAAAGGGTCCATGGACA TCAACGGAGGATGCCATTTTGGTCGAACATGTCAAGAGGTTTGGAGAGGGAAACTGGAAC GCTGTTCAAAAGCACTCTGGCCTTTCTCGCTGTGGAAAAAGCTGCCGTTTGAGGTGGACT AATCACCTCCGACCTGACTTGAAGAAGGGTGCTTTCACTCCCGAAGAGGAGCACCGCATC ATCCAACTCCATGCCCAGATGGGTAACAAGTGGGCTCGTATGGTTCCTGAGTTGCCTGGG CGTACAGATAATGAGATAAAGAACTATTGGAATACTAGAGTTAAGAGACTGCAACGTGCT GGCTTACCAATTTACCCTCCCGATGTGTGCCTGCAAGTACTGAATAGAAGTCCAGAAAGT CTGAACATGGGTGCATTACCAAATGGGGGCACAAACAATCCTGGTCTCCAGCAGACAGAA AATTTTGAGATTCCTGCGGTGGAATTCGAAAATTTAGAACTAAATCAAAGATTTTTATCT TATACACCAATGCTTCCAGAAATTCCTGTGAACAACATGGTTAAATTAGGTACAGATTTA TCCCATAGTAATAGCATTATGTTGCCACCAATGGATCTCGCAAAATGCGTTGGAGAGTCA GAGACCTTCTTCCCTTGTTTGAATGAGAGTGGTCTTACAGCTTTTAATGAATACCTGGGT TATGCTTGTGAGAAGATTGCTGAGCCTTTTCAGTTGTCTTCTTCTCATGATCAGTTCCTG CTGGATGTTTCTCCTGGCAGTCATGCCTTTATAAATGACAATTCTTCTTCTTCTGAGACC TCACCTGGGGCTCTGAAGTTGGAGCTCCCTTCACTCCAATATACAGACACTCATCGAGAT AGCTGGGGAACGCCTGAATCCCCGTTGCCTTCGCTTGAGTCTAGTGATACTCTGATCCAG TCTCCTCCAATGAGGCAGGCTCAGTCAGAATGCTGTTCACCTAGGAGCAGTGGCCTATTG GAAGCAGTAGTGTATGAATCACAGTCTTTGAGAAACTCAAAGAAAGATTCATCCCCGTGG ACTTCAGATCATTCTGTTATGCCTTGTGATTCAATGGACAGTTTATCCCCTAATCCCTGT GAGAAAGAATGGGAAGTGTGTGGTGATCCAAACTCTCCTTTAGGTCATTCTGCTGCATCA GTATTCAGTGAGTATACTCCCATGAGTGGTAGCTCTTTGGATGAACCCCAGTCTGTTGAA ACAATGATGGGTGAGGATATTTTGCATCTATTGGACTTTCTACAGTCAAGTTTGGAGCTA TTTTATTTAACTAAATTGTTTCCTGCAGAATGTGACATTAAACCTAAAACAGTTAGCCAG GTTTCAACCAAACAAGTTGAAAGGAAAGAAACTCCAAATCAGATCGATATTTTCAACCCA GATGCTTTATGCAGCTCCGGTTGGTTCGAGCATATCACCAGGCGTGTAAAGGATAAGTCC ATTTGCAAAGATCCAATTGCAGTGCTGCTTGGTGAGGACTCGTGCAGTGACTACTAG
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>LITCHI023822.m1 AAAATACCAAACCTCATACAACTCATAATTTATGCACACAACAATATGAATGTTGATCAA TTCAACATGGAGTCCACTTTTTTTTTTTTATTTAAAGAGAGTCCACTTTCTCTCTTTATG GCAAGTTTCGTTGTAATTCATTGAAGAAAAAGAAAAAGAAAGGTGACCGTTTTCTGCTCC TATTTTCTCTCATCTCTTGACATATTCTCATCTCCAGTTGGCTTCACATTCATCTTTTCA AAAATCAAAATCATTCGATTAAAACACGTCTCTATCTTAACCTTCAACATACATTCATTT ATCAACCACACATCTCCTTTCATGTCTTTGATTGGTTTTATAAATACAATGTCCACTGTA GAGCTTAAATGTTGATGGGGTCTTTTCTGTGATCACTAAATTTTGAGATTTGCAGCTGTT TAGCTTTCCCCATTTCATCAAATCCATTAGGGTTGAATTGGGGGGATGTCTAAGAGGAGG GGGGATGAAGAAGGTAGGAATGGATTGAAAAAGGGTCCATGGACATCAACGGAGGATGCC ATTTTGGTCGAACATGTCAAGAGGTTTGGAGAGGGAAACTGGAACGCTGTTCAAAAGCAC TCTGGCCTTTCTCGCTGTGGAAAAAGCTGCCGTTTGAGGTGGACTAATCACCTCCGACCT GACTTGAAGAAGGGTGCTTTCACTCCCGAAGAGGAGCACCGCATCATCCAACTCCATGCC CAGATGGGTAACAAGTGGGCTCGTATGGTTCCTGAGTTGCCTGGGCGTACAGATAATGAG ATAAAGAACTATTGGAATACTAGAGTTAAGAGACTGCAACGTGCTGGCTTACCAATTTAC CCTCCCGATGTGTGCCTGCAAGTACTGAATAGAAGTCCAGAAAGTCTGAACATGGGTGCA TTACCAAATGGGGGCACAAACAATCCTGGTCTCCAGCAGACAGAAAATTTTGAGATTCCT GCGGTGGAATTCGAAAATTTAGAACTAAATCAAAGATTTTTATCTTATACACCAATGCTT CCAGAAATTCCTGTGAACAACATGGTTAAATTAGGTACAGATTTATCCCATAGTAATAGC ATTATGTTGCCACCAATGGATCTCGCAAAATGCGTTGGAGAGTCAGAGACCTTCTTCCCT TGTTTGAATGAGAGTGGTCTTACAGCTTTTAATGAATACCTGGGTTATGCTTGTGAGAAG ATTGCTGAGCCTTTTCAGTTGTCTTCTTCTCATGATCAGTTCCTGCTGGATGTTTCTCCT GGCAGTCATGCCTTTATAAATGACAATTCTTCTTCTTCTGAGACCTCACCTGGGGCTCTG AAGTTGGAGCTCCCTTCACTCCAATATACAGACACTCATCGAGATAGCTGGGGAACGCCT GAATCCCCGTTGCCTTCGCTTGAGTCTAGTGATACTCTGATCCAGTCTCCTCCAATGAGG CAGGCTCAGTCAGAATGCTGTTCACCTAGGAGCAGTGGCCTATTGGAAGCAGTAGTGTAT GAATCACAGTCTTTGAGAAACTCAAAGAAAGATTCATCCCCGTGGACTTCAGATCATTCT GTTATGCCTTGTGATTCAATGGACAGTTTATCCCCTAATCCCTGTGAGAAAGAATGGGAA GTGTGTGGTGATCCAAACTCTCCTTTAGGTCATTCTGCTGCATCAGTATTCAGTGAGTAT ACTCCCATGAGTGGTAGCTCTTTGGATGAACCCCAGTCTGTTGAAACAATGATGGGTGAG GATATTTTGCATCTATTGGACTTTCTACAGTCAAGTTTGGAGCTATTTTATTTAACTAAA TTGTTTCCTGCAGAATGTGACATTAAACCTAAAACAGTTAGCCAGGTTTCAACCAAACAA GTTGAAAGGAAAGAAACTCCAAATCAGATCGATATTTTCAACCCAGATGCTTTATGCAGC TCCGGTTGGTTCGAGCATATCACCAGGCGTGTAAAGGATAAGTCCATTTGCAAAGATCCA ATTGCAGTGCTGCTTGGTGAGGACTCGTGCAGTGACTACTAG
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>LITCHI023822.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAAATTGTCCACTCACATAACAAATTTGCTCAAATCTAGACTTAAAATAGATTCCTATCT GATTTCTCATAATCTTGGATCTACCTTAAAATCATATAAACTCAATTTAGAACTTATTAT AAAATTTAGTAACTTCCTAGACTTCAAGATTTATTGAAATAAAAATTACTTATCTGAATA AATTGGATGTCCAAATATTTAGATTACCCATATAGAATTTTCTCTTCTTTTTCTTCTCTT TTCTTCTTCATTCTTTTCTTCTCATCATTTTCTTTCTTTTCTTATTGCAGAACTCATCCT CTATGTGATTGGTTCCATGAAAGCTTATATATATATGTGTATATATATATATATAATGCT AACCACCCCACTAATTCTCAATTTAAAAATCTTTTTTTTCAATAATACTATTTACTCATT TTAACGTTATATATTCCATTCTTTTTTAAAACAAAAACCACCTACCATTTCACCCTACGT CGGTCACCATATTTATCACAACATTTAACTTGTAAATTTGTATTTTGCATCCCACCGTTT GCTATGACATTTTTCTTTTTGCATCCCATTTTCTTGAGTTTTTTAAAGATGTCCACAAAA AAGGATATTTATTCATATACTCTTTTATTTCTAAAATTTGGGTAGAGCTAAATTAATAAC AATAAATTATATTTTAATTATTTTCTTGATTCCATTTGGATTGAGGCCTTATATTGAGAT TGCTCTCTCTCTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCATATGCTTCTTCCCTTTCTTCTT GACCAATAACATCTCCACGTTCTTTATCTGTTCTACTCTTATTTATGTGCTTCTTCTCTT TCTGCTTAGATCAATTCATATTCTTCTTTTTCTTCTTCAACCGGTTCACTCTTTTCTTCT TTTTTGATCTTCTTCTTTAATTTGGTTGTGGTTCCTCTTTTTTGTTCTCCAATTTCTTCT TTTTCTTTCTTCATTTATCAAGTTATTGTTATCTAGTCTACCGTTCTCACAACTCTTCTG GGTTCTTATTCAATTTTTAGATTTATTAATTTATTTAAATAACTCTTCTTATTATTTTAG AATAAGCTACTTAATTTGTTTAGATAATTTCTTTAAATTTTTTTTTTACATAATTCTTTT TATTCTAATAAACTAATTTTTTATATTAATTATAATATAAATATTATTTTATTTAAATTT AATAATAGATAGTTAAAATTAATTTAAAATATAAAATATATTTATTTTATTCTTTTTTAG TCCAATCCTAATCTTGACCAAATAAAAGCCAGCACTATTTTTATTTAATCATATACTGTA CTAAATATATCATAGTATTAATTTATCTAATCCAATCTTATCTTATCAAATCAAATCTAA TCTTAAAAAAATAATTTAATTTAATCTCACGTAGCAAAGGAGATTTAATAGTAGAGGCTT ATTTGTTACTAAAAGATAAAGTAGGTCATCAGCTAGGCGTCAGTTTGCAATAAATAAATA ATTTGTCAGTAAAACCAAATGTTGACTCTATTTACAAAATACCAAACCTCATACAACTCA TAATTTATGCACACAACAATATGAATGTTGATCAATTCAACATGGAGTCCACTTTTTTTT TTTTATTTAAAGAGAGTCCACTTTCTCTCTTTATGGCAAGTTTCGTTGTAATTCATTGAA GAAAAAGAAAAAGAAAGGTGACCGTTTTCTGCTCCTATTTTCTCTCATCTCTTGACATAT TCTCATCTCCAGTTGGCTTCACATTCATCTTTTCAAAAATCAAAATCATTCGATTAAAAC ACGTCTCTATCTTAACCTTCAACATACATTCATTTATCAACCACACATCTCCTTTCATGT CTTTGATTGGTTTTATAAATACAATGTCCACTGTAGAGCTTAAATGTTGATGGGGTCTTT TCTGTGATCACTAAATTTTGAGATTTGCAGCTGTTTAGCTTTCCCCATTTCATCAAATCC ATTAGGGTTGAATTGGGGGG
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>LITCHI023822.m1 GenomeSequence + AAAATACCAAACCTCATACAACTCATAATTTATGCACACAACAATATGAATGTTGATCAA TTCAACATGGAGTCCACTTTTTTTTTTTTATTTAAAGAGAGTCCACTTTCTCTCTTTATG GCAAGTTTCGTTGTAATTCATTGAAGAAAAAGAAAAAGAAAGGTGACCGTTTTCTGCTCC TATTTTCTCTCATCTCTTGACATATTCTCATCTCCAGTTGGCTTCACATTCATCTTTTCA AAAATCAAAATCATTCGATTAAAACACGTCTCTATCTTAACCTTCAACATACATTCATTT ATCAACCACACATCTCCTTTCATGTCTTTGATTGGTTTTATAAATACAATGTCCACTGTA GAGCTTAAATGTTGATGGGGTCTTTTCTGTGATCACTAAATTTTGAGATTTGCAGCTGTT TAGCTTTCCCCATTTCATCAAATCCATTAGGGTTGAATTGGGGGGATGTCTAAGAGGAGG GGGGATGAAGAAGGTAGGAATGGATTGAAAAAGGGTCCATGGACATCAACGGAGGATGCC ATTTTGGTCGAACATGTCAAGAGGTTTGGAGAGGGAAACTGGAACGCTGTTCAAAAGCAC TCTGGCCTTTCTCGCTGTGGAAAAAGCTGCCGTTTGAGGTGGACTAATCACCTCCGACCT GACTTGAAGAAGGGTGCTTTCACTCCCGAAGAGGAGCACCGCATCATCCAACTCCATGCC CAGATGGGTAACAAGTGGGCTCGTATGGTTCCTGAGGTTCTCTCTTCTTCTTTTTCCCCA TCTCTTCGTTTTCACTCACCACCAATGCTTTCTTGTTATTGCCTCATTTCGTCATGTTTA TAAATATTATTCACATATAAGATGACTAACTTATTATTCCCTTCTTTGATATGTTTGTGT ATTGCTTTTTAACTGATCTTGTTGTACTGTTTGATTTTTTACAAGATTCTAATTGTGTTG TGAAGTTAAATCAACTAGTTTTGCCTAGGCTGCTGAAGAAAACTTTTGTGCTGGATGTTG TTTAAAATAAACTGATCGGCAAGTTTCTTGCATAAGTCTACACAAAAACTCTGTTCAGTA TTGTAAGAAGCTGTTAAACATGCAATTGTCACCTTCATTGCAAAGTGAAGTTCTTTTTAG TATAGTAATACGATCCTTTGGTCCATGTCCATCATATATGATTGAGGTTGTCAGCTGTGG TTAACTTCGACTAGACTGAGGAAAATCATAAAATATTGACGTGGTATTATAGCCTTGTTT TATTAAGAGTGGCTGGGTTCGAGTCCTTGCAAGTTATTATATTTGAATTTGTTACTTGTA AGTGCTTTAGCCACAGGAGTCAGGACAAGCCTATTGTTCTTTGCAAGTGATGAAGTGTCG TAGAATACTTAAATCCATTGTTCAGCCTTTTCCTAACAACTTAGACTTTTGGGTTGAATG GTTATTAGTTTAAAATGCAGTGATGTTGTTCTTAGATGCCTAAATGAACTAAAACATTTC TTGGCTGTGAATTGTTGTACAGATTCTGTTTATGTACTCTGACTATGTAGTAAACTAGTA ATATGAACATTATGGTTGTCTGAATGTCAAAAATGATACACACTTATTCATCAGGCCTTT GATGATTTTGTTGTCCAAAGCTTCATTTTCTTTTGTAACAGATAGAGATGTGCCCTAACT CTCTTCAAAATTAAAGAGTCTCATTTGATTGTTGGAAGAAGGCATTCTTGATGTATTATA GCAAAACAGGGAGATAGGGTTCCATAATTTTAATGCATGAAGTTATTGCTCTTTGGAAAA GAACTTAAATTTCCAGATGATAAAAAGTTACTCCATTACTTGTCTAGCTGTCAATTACAT TTATGATTAAATATGTGATTCAGCTTTCAGTAAACTTGATTGAACAATGAACATGTAAAT TTCCCCATTCAATTTTAGCACAGTCTTCAAGAAGACACCTCTCTGTTATTACCTTCACTG TGACAGTGTGACGGACAGCTTGAGATTGTGTGACAACAATTCTTTCGCACCTTATTTTCT GTTAAAATTGTGAAGTGTCCCCTTTTGTTTGTTACTTAGTGATCCCTTTCTCTATTTCTC AGTTGCCTGGGCGTACAGATAATGAGATAAAGAACTATTGGAATACTAGAGTTAAGAGAC TGCAACGTGCTGGCTTACCAATTTACCCTCCCGATGTGTGCCTGCAAGTACTGAATAGAA GTCCAGAAAGTCTGAACATGGGTGCATTACCAAATGGGGGCACAAACAATCCTGGTCTCC AGCAGACAGAAAATTTTGAGATTCCTGCGGTGGAATTCGAAAATTTAGAACTAAATCAAA GATTTTTATCTTATACACCAATGCTTCCAGAAATTCCTGTGAACAACATGGTTAAATTAG GTACAGATTTATCCCATAGTAATAGCATTATGTTGCCACCAATGGATCTCGCAAAATGCG TTGGAGAGTCAGAGACCTTCTTCCCTTGTTTGAATGAGAGTGGTCTTACAGCTTTTAATG AATACCTGGGTTATGCTTGTGAGAAGATTGCTGAGCCTTTTCAGTTGTCTTCTTCTCATG ATCAGTTCCTGCTGGATGTTTCTCCTGGCAGTCATGCCTTTATAAATGACAATTCTTCTT CTTCTGAGACCTCACCTGGGGCTCTGAAGTTGGAGCTCCCTTCACTCCAATATACAGACA CTCATCGAGATAGCTGGGGAACGCCTGAATCCCCGTTGCCTTCGCTTGAGTCTAGTGATA CTCTGATCCAGTCTCCTCCAATGAGGCAGGCTCAGTCAGAATGCTGTTCACCTAGGAGCA GTGGCCTATTGGAAGCAGTAGTGTATGAATCACAGTCTTTGAGAAACTCAAAGAAAGATT CATCCCCGTGGACTTCAGATCATTCTGTTATGCCTTGTGATTCAATGGACAGTTTATCCC CTAATCCCTGTGAGAAAGAATGGGAAGTGTGTGGTGATCCAAACTCTCCTTTAGGTCATT CTGCTGCATCAGTATTCAGTGAGTATACTCCCATGAGTGGTAGCTCTTTGGATGAACCCC AGTCTGTTGAAACAATGATGGGTGAGGATATTTTGCATCTATTGGACTTTCTACAGTCAA GTTTGGAGCTATTTTATTTAACTAAATTGTTTCCTGCAGAATGTGACATTAAACCTAAAA CAGTTAGCCAGGTTTCAACCAAACAAGTTGAAAGGAAAGAAACTCCAAATCAGATCGATA TTTTCAACCCAGATGCTTTATGCAGCTCCGGTTGGTTCGAGCATATCACCAGGCGTGTAA AGGATAAGTCCATTTGCAAAGATCCAATTGCAGTGCTGCTTGGTGAGGACTCGTGCAGTG ACTACTAG