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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI023820 | Chr13 | 6741420 | 6746664 | + | Probable serine/threonine-protein kinase PBL18 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI023820.m1 | 78 | 354 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 164.9 | 2.50E-48 |
LITCHI023820.m1 | 79 | 355 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 167.9 | 2.70E-49 |
LITCHI023820.m2 | 1 | 194 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 111.4 | 5.00E-32 |
LITCHI023820.m2 | 1 | 195 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 104 | 8.70E-30 |
LITCHI023820.m3 | 1 | 194 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 111.4 | 5.00E-32 |
LITCHI023820.m3 | 1 | 195 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 104 | 8.70E-30 |
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>LITCHI023820.m1 ATGGGGAATTGCTTCAAGCCGCCTGCAAAGTGTGCTCATGCTTCTACCTCTCTCTTTAAT GCTACAGGAACTACAAAGCCTCACAATGATGACCCTGTTTCTGTGCGGCAAGCACCTTTG GAAAGCTTGAATAAATCTGTCATTGCATCTAAAGTTGATTCATCTGTCACTAGCAATCTC AAATCCTTTAGCTACAATGATCTTAAGAATGCCACCAAAAACTTCCGCCCAGAAAATCTT CTTGGAGAGGGAGGGTTTGGGTGTGTTTTCAAAGGATGGATTGATGAAAACACTTATGCT CCCACTAAACCAGGAACTGGAATTGTGGTAGCCATCAAGAGGCTCAAAGTGGAGAGTTTT CAAGGTCACAAGGAATGGCTTGCTGAAGTAAATTATTTAGGTCAGCTTCATCATGAAAAT CTTGTGAAACTCGTAGGCTATTGTTCAGAGTCAGACCACAAACTTCTAGTTTACGAGTTT ATGCCCAAGGGGAGTCTGGAGAATCATTTATTCAGAAAAGGTGTTCAACCAATTTCTTGG CCTACACGGATGAAAATTGCAGTTGATGTTGCACGAGGATTGTCCTTCTTACATGGTTTA GATGCCAAAGTCATCTACCGCGATTTAAAGGCTTCGAACATTCTACTAGATTCAGACTTC AATGCGAAGCTTTCAGACTTTGGTTTGGCAAGGGATGGTCCTACTGGTGATAACACTCAT GTTTCAACTAGAGTTGTGGGAACACAGGGTTATGCTGCTCCGGAATATGTTGCGACAGGT CACTTGAACCCAAAGAGTGATGTGTACAGCTTCGGTGTTGTCTTGTTAGAGTTGCTATCA GGAAGACGGGCATTGGATGAGGAAAGAAATGGGCTACCTGAAGAAAGCCTTGTAGAATGG GCACTCCCATTTTTGAAAGACAGCAAACGAGTTTTGAGAATCATGGATACTAGGTTAGGA GGTCAGTACTCCAAGAAAGCCGCTCAGGCAGCGGCTGCAGTCGCATTGCAATGCCTCCAT TCGGATCCTAAAAACAGGCCATCAATGGTTGATGTTTTAGCCACTTTGGAACAACTCCCC TCATCAAAGGACATCCCAAGGACACCTCCACAAGTTAAGCTGGATCATCCAGGAATCAAG CATACTAATCACCCTCGAAAGATGACCGCATCTCCAGGTACAAATTCAAAGTGA >LITCHI023820.m2 ATGCCCAAGGGGAGTCTGGAGAATCATTTATTCAGAAAAGGTGTTCAACCAATTTCTTGG CCTACACGGATGAAAATTGCAGTTGATGTTGCACGAGGATTGTCCTTCTTACATGGTTTA GATGCCAAAGTCATCTACCGCGATTTAAAGGCTTCGAACATTCTACTAGATTCAGACTTC AATGCGAAGCTTTCAGACTTTGGTTTGGCAAGGGATGGTCCTACTGGTGATAACACTCAT GTTTCAACTAGAGTTGTGGGAACACAGGGTTATGCTGCTCCGGAATATGTTGCGACAGGT CACTTGAACCCAAAGAGTGATGTGTACAGCTTCGGTGTTGTCTTGTTAGAGTTGCTATCA GGAAGACGGGCATTGGATGAGGAAAGAAATGGGCTACCTGAAGAAAGCCTTGTAGAATGG GCACTCCCATTTTTGAAAGACAGCAAACGAGTTTTGAGAATCATGGATACTAGGTTAGGA GGTCAGTACTCCAAGAAAGCCGCTCAGGCAGCGGCTGCAGTCGCATTGCAATGCCTCCAT TCGGATCCTAAAAACAGGCCATCAATGGTTGATGTTTTAGCCACTTTGGAACAACTCCCC TCATCAAAGGACATCCCAAGGACACCTCCACAAGTTAAGCTGGATCATCCAGGAATCAAG CATACTAATCACCCTCGAAAGATGACCGCATCTCCAGGTACAAATTCAAAGTGA >LITCHI023820.m3 ATGCCCAAGGGGAGTCTGGAGAATCATTTATTCAGAAAAGGTGTTCAACCAATTTCTTGG CCTACACGGATGAAAATTGCAGTTGATGTTGCACGAGGATTGTCCTTCTTACATGGTTTA GATGCCAAAGTCATCTACCGCGATTTAAAGGCTTCGAACATTCTACTAGATTCAGACTTC AATGCGAAGCTTTCAGACTTTGGTTTGGCAAGGGATGGTCCTACTGGTGATAACACTCAT GTTTCAACTAGAGTTGTGGGAACACAGGGTTATGCTGCTCCGGAATATGTTGCGACAGGT CACTTGAACCCAAAGAGTGATGTGTACAGCTTCGGTGTTGTCTTGTTAGAGTTGCTATCA GGAAGACGGGCATTGGATGAGGAAAGAAATGGGCTACCTGAAGAAAGCCTTGTAGAATGG GCACTCCCATTTTTGAAAGACAGCAAACGAGTTTTGAGAATCATGGATACTAGGTTAGGA GGTCAGTACTCCAAGAAAGCCGCTCAGGCAGCGGCTGCAGTCGCATTGCAATGCCTCCAT TCGGATCCTAAAAACAGGCCATCAATGGTTGATGTTTTAGCCACTTTGGAACAACTCCCC TCATCAAAGGACATCCCAAGGACACCTCCACAAGTTAAGCTGGATCATCCAGGAATCAAG CATACTAATCACCCTCGAAAGATGACCGCATCTCCAGGTACAAATTCAAAGTGA
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>LITCHI023820.m1 MGNCFKPPAKCAHASTSLFNATGTTKPHNDDPVSVRQAPLESLNKSVIASKVDSSVTSNL KSFSYNDLKNATKNFRPENLLGEGGFGCVFKGWIDENTYAPTKPGTGIVVAIKRLKVESF QGHKEWLAEVNYLGQLHHENLVKLVGYCSESDHKLLVYEFMPKGSLENHLFRKGVQPISW PTRMKIAVDVARGLSFLHGLDAKVIYRDLKASNILLDSDFNAKLSDFGLARDGPTGDNTH VSTRVVGTQGYAAPEYVATGHLNPKSDVYSFGVVLLELLSGRRALDEERNGLPEESLVEW ALPFLKDSKRVLRIMDTRLGGQYSKKAAQAAAAVALQCLHSDPKNRPSMVDVLATLEQLP SSKDIPRTPPQVKLDHPGIKHTNHPRKMTASPGTNSK. >LITCHI023820.m2 MPKGSLENHLFRKGVQPISWPTRMKIAVDVARGLSFLHGLDAKVIYRDLKASNILLDSDF NAKLSDFGLARDGPTGDNTHVSTRVVGTQGYAAPEYVATGHLNPKSDVYSFGVVLLELLS GRRALDEERNGLPEESLVEWALPFLKDSKRVLRIMDTRLGGQYSKKAAQAAAAVALQCLH SDPKNRPSMVDVLATLEQLPSSKDIPRTPPQVKLDHPGIKHTNHPRKMTASPGTNSK. >LITCHI023820.m3 MPKGSLENHLFRKGVQPISWPTRMKIAVDVARGLSFLHGLDAKVIYRDLKASNILLDSDF NAKLSDFGLARDGPTGDNTHVSTRVVGTQGYAAPEYVATGHLNPKSDVYSFGVVLLELLS GRRALDEERNGLPEESLVEWALPFLKDSKRVLRIMDTRLGGQYSKKAAQAAAAVALQCLH SDPKNRPSMVDVLATLEQLPSSKDIPRTPPQVKLDHPGIKHTNHPRKMTASPGTNSK.
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>LITCHI023820.m2 GGACCATCATGATCATGCAGCATGACTACTGAGCATGGCGTTGAATTTGAAAATTTCTTA AACTTATAATTTTGACCGGCTCTCCCCTACGGAATGGAACTTCTCTTTGTCTTCTTATTT GGTTCAAACAATTCCCTTCCCATTCATCATCATCTTCATCATCCATGGGGAATTGCTTCA AGCCGCCTGCAAAGTGTGCTCATGCTTCTACCTCTCTCTTTAATGCTACAGGAACTACAA AGCCTCACAATGATGACCCTGTTTCTGTGCGGCAAGCACCTTTGGAAAGCTTGAATAAAT CTGTCATTGCATCTAAAGTTGATTCATCTGTCACTAGCAATCTCAAATCCTTTAGCTACA ATGATCTTAAGAATGCCACCAAAAACTTCCGCCCAGAAAATCTTCTTGGAGAGGGAGGGT TTGGGTGTGTTTTCAAAGGATGGATTGATGAAAACACTTATGCTCCCACTAAACCAGGAA CTGGAATTGTGGTAGCCATCAAGAGGCTCAAAGTGGAGAGTTTTCAAGGTCACAAGGAAT GGCTTGTACGTGCGTTGGGGATTTTATAACCTTATTTCTTCTTAATATGACATTTCTGAT CTTATTCAAATTTAATTGTGTTTTAATCTATTGTCATGGCAGGCTGAAGTAAATTATTTA GGTCAGCTTCATCATGAAAATCTTGTGAAACTCGTAGGCTATTGTTCAGAGTCAGACCAC AAACTTCTAGTTTACGAGTTTATGCCCAAGGGGAGTCTGGAGAATCATTTATTCAGAAAA GGTGTTCAACCAATTTCTTGGCCTACACGGATGAAAATTGCAGTTGATGTTGCACGAGGA TTGTCCTTCTTACATGGTTTAGATGCCAAAGTCATCTACCGCGATTTAAAGGCTTCGAAC ATTCTACTAGATTCAGACTTCAATGCGAAGCTTTCAGACTTTGGTTTGGCAAGGGATGGT 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>LITCHI023820.m3 + Up_Stream_Len 2000 CGGAATGGAACTTCTCTTTGTCTTCTTATTTGGTTCAAACAATTCCCTTCCCATTCATCA TCATCTTCATCATCCATGGGGAATTGCTTCAAGCCGCCTGCAAAGTGTGCTCATGCTTCT ACCTCTCTCTTTAATGGTCAGTTTTACGCTTCTGTCTACAACCTGTTTGTTGAATTTTCT CACTCAACTATCATTAACATTGCTTCAATTTCCTTTTTTTTTTTTTCTACCTTTTATATC TGTGTTTGAGTCCATATATACACACACACGTAATGAATGACTGAGACTACTGATCCTAAC AATTTAAAATTTAGCACGCACCAACTATATATATATATATATGTATAAGTTTGTGATTGT ATAATCAACTTTTGACAAACATTTAGATTGAGCAAATTCATCTATGTTACAGACTGTGAT TGTATGTGCCATTCATAGCTGATTTTTTGTGATATAAGTTTCTGGGGTTGTGCCTGCATC TATAGGAAATAGAAAGCAATCAGAATTGGTTGTATTAAAACAAGTGAGAATGGATTTGGT CAATCGAATCCACAATATTCCTAGTTGGATTAGTTAAATCAGTCTCACTTGTTTTATGTT ATCAGTTGTGATTGTATATGCCATTTATTGCTGATTTTTGTAAAATAAGTTTCTGGGGTT GTGCCTGCAGCTAGAGCAAATACAAAGCGATCAAAATTGGTAGTAAGTGAGAATGAATTT GGCCAATTTAACTAGGAACTTTGTGTAGTTGGATTGACCAAATCGTTCTTGCTTGTTTTT ATGTTATCGTTTCTGATTGCATATGCCATTCTTGTTGCTGATTTTGGGTAATTTAAGCTT CTGGGGTTGTGCATGCAGCTATAGCAAATACAAAGCGATGAGAATTGGTAACACAAAATA 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>LITCHI023820.m3 GenomeSequence + GGACCATCATGATCATGCAGCATGACTACTGAGCATGGCGTTGAATTTGAAAATTTCTTA AACTTATAATTTTGACCGGCTCTCCCCTACGGAATGGAACTTCTCTTTGTCTTCTTATTT GGTTCAAACAATTCCCTTCCCATTCATCATCATCTTCATCATCCATGGGGAATTGCTTCA AGCCGCCTGCAAAGTGTGCTCATGCTTCTACCTCTCTCTTTAATGGTCAGTTTTACGCTT CTGTCTACAACCTGTTTGTTGAATTTTCTCACTCAACTATCATTAACATTGCTTCAATTT CCTTTTTTTTTTTTTCTACCTTTTATATCTGTGTTTGAGTCCATATATACACACACACGT AATGAATGACTGAGACTACTGATCCTAACAATTTAAAATTTAGCACGCACCAACTATATA TATATATATATGTATAAGTTTGTGATTGTATAATCAACTTTTGACAAACATTTAGATTGA GCAAATTCATCTATGTTACAGACTGTGATTGTATGTGCCATTCATAGCTGATTTTTTGTG ATATAAGTTTCTGGGGTTGTGCCTGCATCTATAGGAAATAGAAAGCAATCAGAATTGGTT GTATTAAAACAAGTGAGAATGGATTTGGTCAATCGAATCCACAATATTCCTAGTTGGATT AGTTAAATCAGTCTCACTTGTTTTATGTTATCAGTTGTGATTGTATATGCCATTTATTGC TGATTTTTGTAAAATAAGTTTCTGGGGTTGTGCCTGCAGCTAGAGCAAATACAAAGCGAT CAAAATTGGTAGTAAGTGAGAATGAATTTGGCCAATTTAACTAGGAACTTTGTGTAGTTG GATTGACCAAATCGTTCTTGCTTGTTTTTATGTTATCGTTTCTGATTGCATATGCCATTC 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