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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI023785 | Chr13 | 5994537 | 5996419 | + | Transcription factor bHLH167 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI023785.m1 | 9 | 58 | PF00010.29 | HLH | Domain | 46.6 | 2.70E-12 |
LITCHI023785.m2 | 9 | 58 | PF00010.29 | HLH | Domain | 46.6 | 2.70E-12 |
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>LITCHI023785.m1 ATGGCGCGGCTCAGTAGGTCATCTAGAGCTGAGAGGAACATAAACGAGAAGAACAGAAGA ATTTACATGAAAAATCTCCTTGCAAGACTTGAGTCTCTACTCCCTCCTCATCCCTCCAAG TTGTCAGTAGCTCAGATATTGAATCAAGCCACCAGTTATATAAAGCTGCTGCAAATAAAT GGAGAACGACTTAAGAGAAAGAAAGCACTTGTGAGAGGAGACAAGACTATTGATCATAAT TTGATAAACAATGGCCCGTCCAAGTTACCAGTAATCGACATAAGAACTTTTGATTCCATT TTGGAAGTCAACTTGGTTTCTGGTTCCAATAAAAATTTCATGTTACATGAGATTATAAGT GTCCTCCAGGAACAAGGAGCTGAAGTTATAGATGCTGCGCACATGATTTCGGGTGATAAA ATCATTCATATTATCAAGTCCAAGGCTATCAGTCCTAGAATTGGTGTGGAAACTTCAATA GTAGAAGAAAGATTGAAAGAACTCGTCCTCTGA >LITCHI023785.m2 ATGGCGCGGCTCAGTAGGTCATCTAGAGCTGAGAGGAACATAAACGAGAAGAACAGAAGA ATTTACATGAAAAATCTCCTTGCAAGACTTGAGTCTCTACTCCCTCCTCATCCCTCCAAG TTGTCAGTAGCTCAGATATTGAATCAAGCCACCAGTTATATAAAGCTGCTGCAAATAAAT GGAGAACGACTTAAGAGAAAGAAAGCACTTGTGAGAGGAGACAAGACTATTGATCATAAT TTGATAAACAATGGCCCGTCCAAGTTACCAGTAATCGACATAAGAACTTTTGATTCCATT TTGGAAGTCAACTTGGTTTCTGGTTCCAATAAAAATTTCATGTTACATGAGATTATAAGT GTCCTCCAGGAACAAGGAGCTGAAGTTATAGATGCTGCGCACATGATTTCGGGTGATAAA ATCATTCATATTATCAAGTCCAAGGCTATCAGTCCTAGAATTGGTGTGGAAACTTCAATA GTAGAAGAAAGATTGAAAGAACTCGTCCTCTGA
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>LITCHI002976.m1 MAENLNLQNLFFVMFFIIFSGLLSASCASTEEASSLLKWKASFSTETQSRLPSWTLHSRN ASNSEPCTWFGILCNPVGSVVKINITSFGLNGTLHEFPFSSFPNLAYIDLAMNSLFGTIP PQISNLSKLIYLDLSTNQFSGEIPPEIGHLKDLQVLHLVKTQLNGSIPREIGFLRSLNDL ALCNNNLQGPIPKSLKNCISLIRVRLDGNQLSGNITEDFGVYPNLMYLDLSYNNLHGEIS SNWGKCPNLDTLRIARNNISGIIPPEIGNATKLEALDLSSNHLVGQIPKELGNLTKISKV LNLSNNQFSGGIPPEFGSLTNLEQLDLSRNNLSQSMQYLGNCIKLHYLNLSNNKFSQEIP SQLEKLVQLSQLDLSRNSLNGEIPSQINQMVSLELLDLSHNRLSGFLPDSFEGMRGLKHI DISYNDLEGPLPDSQAFKNASIEALQRNKGLCGNITGLPPCIPSIEYRHHKRNNQKLLAY TMKVTEKCDVYSFGVLTLEVIKGNHPGDLIPMLSSALTRENVSLKDVLDQRIPHPLPNVQ DDVRKILNIAIACLNGNPESRPSMNMIVTLLST.
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>LITCHI002976.m1 ATGGCAGAAAACTTAAACTTGCAAAACCTTTTCTTTGTAATGTTTTTTATCATATTTTCT GGGCTACTAAGCGCTTCTTGTGCTTCTACTGAAGAAGCAAGTTCTCTTCTCAAATGGAAA GCCAGCTTTTCAACGGAAACGCAGTCTCGGCTACCTTCATGGACTTTGCATTCTCGCAAT GCATCCAACTCAGAACCATGCACTTGGTTTGGAATTTTATGCAATCCTGTTGGCAGCGTT GTCAAAATAAACATCACCAGTTTCGGTTTGAATGGTACGCTTCACGAGTTTCCATTCTCA TCTTTTCCTAATCTTGCATACATTGATCTTGCTATGAATTCACTCTTTGGCACCATTCCA CCTCAAATTTCAAACCTTTCCAAACTCATTTACCTTGATTTATCAACTAATCAGTTCTCT GGAGAAATCCCACCTGAAATTGGTCATTTAAAAGATCTTCAAGTCCTCCACCTTGTCAAA ACTCAGTTAAATGGCTCAATTCCTAGGGAAATAGGCTTTTTAAGGTCTCTTAATGATCTT GCTTTGTGTAACAATAATTTACAAGGTCCAATCCCTAAAAGTTTGAAAAACTGCATAAGC TTGATCAGAGTCCGTCTAGATGGAAACCAACTAAGTGGGAATATAACAGAAGACTTTGGT GTCTACCCAAACCTGATGTATCTAGATCTGAGCTATAACAATTTGCATGGTGAAATATCA TCCAACTGGGGCAAATGTCCAAATTTGGACACCTTACGCATTGCAAGGAACAATATTTCT GGAATTATACCACCTGAAATTGGTAACGCTACCAAGCTAGAAGCCTTAGATCTCTCTTCC AATCATTTAGTTGGGCAGATTCCAAAGGAGTTGGGAAATCTGACCAAAATTTCTAAGGTG CTCAACTTGAGTAACAATCAATTTTCAGGTGGTATACCTCCAGAATTTGGGTCACTAACG AACCTTGAGCAGTTGGACTTGTCCAGAAATAATCTAAGCCAATCAATGCAATACTTGGGA AACTGTATCAAACTCCACTACCTAAATTTGAGCAACAACAAATTTAGCCAAGAAATTCCA AGCCAGTTGGAGAAGTTAGTTCAACTCTCCCAGTTAGATTTGAGTCGTAACTCTCTGAAC GGAGAGATACCATCACAAATCAATCAAATGGTTAGCTTGGAGCTGCTGGATCTTTCTCAC AACCGTCTTTCTGGCTTTCTTCCAGATAGTTTTGAAGGCATGCGTGGCCTGAAGCATATC GACATTTCTTACAATGATTTGGAAGGTCCTCTTCCTGATAGCCAAGCCTTTAAAAATGCT TCCATAGAAGCCTTACAAAGGAACAAAGGCTTGTGTGGAAATATTACAGGACTTCCACCA TGCATTCCTTCAATTGAATACAGGCATCACAAGCGAAACAATCAGAAACTACTTGCATAT ACAATGAAGGTAACAGAAAAATGTGATGTATATAGTTTTGGGGTATTGACATTGGAAGTG ATAAAAGGAAATCATCCAGGTGATCTCATCCCAATGTTGTCCTCTGCATTGACTAGAGAA AATGTGTCTCTGAAAGATGTTTTGGATCAACGCATCCCTCATCCTCTACCCAATGTTCAG GACGACGTGAGAAAAATTTTGAACATTGCAATTGCTTGCTTAAATGGCAATCCAGAATCT AGGCCAAGCATGAACATGATCGTTACACTGTTATCAACCTAGTCAACAATAATCTCTAAA CTATTATGAAGTACTAGTATGTCTTACTCTTTAGTGCGTAGTTATCGAAG
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>LITCHI002976.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTGTTTGAATGAAGTTTTTTAACACCAAGAAGCCTACACTTATATACAAAAACTTTTCAA TACTAAAAATTTCAGTTATGAGATACACTAACCATGTATTCAATGAATAATTTAAATGAA ATTTTTTACAATAAGAAGCTTACACTTGTATACAGCAAACTTCTTGGTATTAAAACAATA ATTAATTTAAAAGTTACAATTTTCCAACTAATTTCATTCTCGGATTTTGTTTCATTCTTC ATACTTCGCAATCAAATTGTATTCCTTAAAACCAATTTGATGTTTAAAAACAACATTTAG AGGAAAAGTTATATGATATTTCAATTAATAATTTATGGGTGTACTTACAAAATATTTATC CTTTTAATAATTTTAATCAAGGATAATATAAAATATTTTTAAAAAAATGCTAGTTCGGGG TGTGCATACAATTTTTTAAGGGTATAAATATTGCCACTGTGGATTTTTTGACATCCCTAT TCATTTCTAGAAAGCCTTGATGAAGAAATACTCACAATATTTAGTCAACAAATTTAAATT TCTTCTATGGTTGTGGACCACAACCTCATGACTGCTTTCTTAATGGTATTTGGTAATCAA GCATTACTTAATGGGCTTATTTTGATAATAAAAAATGTTTATTTTACTAATAAAAATGTT TAGTGGGAGAAATTGCTCCCACCCACATAACTTTGAACCCAGGGGAAATTGCTTTTACCC CCATCTTTTAACCTACCATTGATGGTATTGGAATCCACCACCACTAACATTTGTGCAACT TCATAGATTATTTATTTATCAATTTTAAGTTAACCAAAACACATTAGAAGTCAATTTATT ATTTTATTAAGATAAAATCATTCTTTAATATATTAAAATATCAAGTAATACTTTTTTTGT TTAAAAATACAAATTCTAAACATTCTAAACATATGTATTTAATTGAATTGAAAAATATAA ACACAAAGATACTTATGCATAATCATAGCAAGTTTAGGCATTTTTAATCAGATATTCTAA AACATTAAAAAAAATAATGTAACTGGTGGAAAGAACTAGTAATTTGTCTTTAGAAAGTAA GAATCTTTCAAAGTCGTCGTTAAAAACCGTTGATTGGGGTTTGTGGCACAACTTCCACAA TTATTCTAATGTTTGGACAGTGGAGTGTGGATTTTTCTAAGTCGGCAGAGAAAGAAATAA AAATTTATTCTGGTCTTTTACGCGTTTGCTCCATTTAAAGCTGGTCTTTATCCTTTTCAT TTTTTTTTTTTTTTCTTTTTGGTTGCAAATTGAGAGCAAGCTGGCGGAGCTTCCTACGAA AGAGCATTGGTTGGTATGTTCGCCTCTGATCATTACTACCATCATCATAGCGGAAGAAAC TTGGGCGCATGGGAGAATGTTTCGAGCATAGCCAGTGGCTGTGACAATGATTGTGCTTTG GATTAATTCTCACAATAAAAACCATTTATTTTTGAAATAGCATTTATATTTAAGATATAA ATTAATAATTAAAGAAACGAGTAAAAAATTATTTATTTTTTAAAACTGTAAGACTTTATA TATCATAAATACATTAAAAGAATAGATATAACATAATATTAATATGACCATCGTCTCATG TTTTAATGAAATTCTGATATCATACGCAGCGAAGCCCCCAACTAATCAAAAAAAAATTTC GGTGAGTATGAATTTCTTTTATGGCTCTCGGTCATTTCCTCATGATTACCATCTTTGATA CATTTTCCACAAAGTAAACAGTGGTAAAACTTCATTGGTTTTTAAATTTAGTCATATTAA AAAGGATAAAGTCATTCTTTATTAGTTTTTCTTTTTGGAAAAACAGTCATAATTTCATTG AATGGATGATGACAGTGGTGGAAGACTTTGACTCAAGTCAGCAGTCTCAAAAAAATTTCT TAAAAACCAGTAGGATGCTGGTTATATTAATATGCAAAACGTGGTTTGTAAATTATCATC CAATACACAACCAACAAAAT
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>LITCHI017839.m1 GenomeSequence - ATGGCTAGAATGTTCACTGATAATGATAGAACTTTCACACCTAAGGTAATTAATGAGTAC TTAATTCAATTTCAAGACTTTCCATCCACCCTGTGGCCATGATGGGTTCATAAGCGTTAT TGGCTCTCTCTAGCATGGGACATGTGCATATGGATCGCCTGAAGTTCTGCTAGGATCCTC CAATTATTCTACTACAACTGATGCCTGGTCAGTAGGATGCATATTTGCTGAGATGGTAAA CCTGGAGCCACTGTTTTCAGAGAAGTGTTCGATATTGCAAATGATGTTCAGGTATTTGCA ATTTGTATATGTGGAGCTTCCGAGTGCATGTGCCACTATTGTTTGTTTCCTTACTAACAT TCACTTTCTTTCTATGAAGTCTTTTTGGAACTCCAAATGAGCAAACTTGGCCAGGAGTTA CTTCTTTGCCTCATTTCATTGATTTTCCTGATCTCACTCGTAAGGTAAAACCATCTTCAG CTTGACATGGTATTTATATTTTTTTTTGTTATCAATCATGTTGGATAGTGTTAGACCCCC AATTGTTGTCACTTACCAAAGAAGAAAGAAAAGAGTCAAAGATCTTAAAGTTTATAAAAG GAAAGTAACTTATTAATGTGATTGCCTCTTATATGGAAAGTAATGATTTTGATAAGTTTT TAGGGAGAAGCTCATGGGATTTGCTTTAGGTTTCTGCTGTTATTTAAAGGGGGGAAAGAG GGGGGGTGGGGTTTGCTTTAGGAGTTTAGATTATCTTTGGTTTTAGTTTTTTAGCAGAGG AGCTCTGTGAAAGACAAGTGAAGCGCGAGTCTCATCCCTTCAGTATAGCATTGAGGGTTT TCTTTTGTATCTGTTTATTTTTAGTTTCAATAATAAAAGTTCCCATTATTTTGATTTTAT TTTTCTTTTGACTCTAATATTTTTTTATTAGCGAGATTCCCAACAAATAGAACCTATTCG TATGTACGGTGCACCTTTTTGTATTTCCAGGACCTGGCAACCATTGTTCCAAGCCTTGAA CCAAACGATCTTGATCTCCTCTCGGTAAGTTAGACTCTAAGTTGCAATTCTATAATGCCA AAACCAGCATACATGGTATAACGATCAGTTTTGAAAGCAGAAAAAGAAGCCCTCCTAGAG TTCGAGTTTTTACATTTCAATTACTAATGTATGTGGATGTGTATTTTGTTCCAGAAAATG CTGTGCTTGAACTCTATTGAATTACTGCCCAAGACGCTCTGGACCATGAATACTTGAAGA ATGAATGATGGACTTGTACCCTGAAAACACAAAGTGTTGTTACATAGATGTTGGCAGATG TGTACCTTAACAACACCTGTTTGTTAGATTTATGCTGCCAGAAATTTTCAATGATCAATA TGTGAAGTGGAAGGATTGCTTGGATTTAATGAAAAAAATCTGAATAATTTTCCTAGAAAG TAAGAGGGTGTCTCGGCGTCTCCAAATTAGAACATCTGCACTTTCTTAGTAGATTAGTAT CATTGCATTGGTCTCCCAACTCTTTCCATTTTAATGTCACTTCCCATTCCATGCCTTGGT TTTTGATATGGCTTCTTGTAACATTTATCACTGACTTTATTTTATAATCCATCTAAGAAA TGAAATGTTGCTCATGTCATACTTAACCTACTACTAAGAAACATTAACGCTATGGAACAA GAAGAACTGCAAAATTATAAGAATTTCAAATTACTAAAATTCAAAAGACAGCCAGAATGT CCTTTTG