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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI023733Chr1351949655198136+Calcium-dependent protein kinase 17

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI023733.m180338PF00069.28PkinaseDomain2511.30E-74
LITCHI023733.m182333PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain101.26.30E-29
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LITCHI023733.m1386446PF13499.9EF-hand_7Domain47.22.50E-12
LITCHI023733.m1386412PF13405.9EF-hand_6Domain25.66.90E-06
LITCHI023733.m1386408PF13202.9EF-hand_5Domain20.40.00028
LITCHI023733.m1387411PF13833.9EF-hand_8Domain19.20.00087
LITCHI023733.m1399444PF13833.9EF-hand_8Domain34.61.30E-08
LITCHI023733.m1421448PF00036.35EF-hand_1Domain26.52.90E-06
LITCHI023733.m1424444PF13202.9EF-hand_5Domain17.40.0025
LITCHI023733.m1449478PF13833.9EF-hand_8Domain14.70.021
LITCHI023733.m1455518PF13499.9EF-hand_7Domain54.61.20E-14
LITCHI023733.m1458485PF13405.9EF-hand_6Domain31.58.90E-08
LITCHI023733.m1460484PF00036.35EF-hand_1Domain28.75.90E-07
LITCHI023733.m1461480PF13202.9EF-hand_5Domain18.60.00098
LITCHI023733.m1470519PF13833.9EF-hand_8Domain32.36.70E-08
LITCHI023733.m1493519PF00036.35EF-hand_1Domain33.22.10E-08
LITCHI023733.m1494517PF13202.9EF-hand_5Domain13.90.031
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>LITCHI023733.m1
ATGGGCAACTGTTGTTCTCAAGGCAAGGCTGGGGAAGACAAGGGAGAAACCGCGGCCGCT
GAGAATGGTGGTGGTGGTGCTAGTAATGGAAATAACATTAATAATAATAATGGAGGGTTT
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GAATTCATCACTGCAACTATGCATATGAACCGAATGGACAAAGAAGAACATCTTTACACA
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>LITCHI023733.m1
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>LITCHI010282.m1
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TGAAATGCGCCGCCTGTGAATGCCACCGGAACTTCCACCGTAAAGAGGTCGACGGAGAGA
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CACCATTACCATCTTCAACACTGATTCACCACCAGAAGTACTCCTCACTAAGTATGCATA
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GTGGAGGAACCGAGTCATCAAGCGAGGATCTTAATGTGTTCCAATCCAATGCTGATGGAG
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TTTTCAAGGTTTGGATGCACAATAACAAGCATGTGAAGAACAAACAACAAGATCCAGTTT
AAGGTTCCATTGTTGGTGTGTGAAGAGTACTGAGGCCTTGATCAAGTGATTTTGTATAAT
TAAATCCATGTTCTTCTCTTTTGAGAGATAACATTGATATTGTTCTCCAGACAAAATCTT
TTGTTTTATTTATTATTATTTTTTTTTTACCTTTTGAGTTTATGTTAAATCTCCCTCACA
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GAGGGTCTGTTTATCAGCTGTGCAAAGAACTGCTCTCGGTGGA
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>LITCHI005187.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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TGGAGAGAAAATTTCTTTTCTTCAGTTGAGCTTGGATATGGATCACAGACTTAAAGCTAA
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TTCTCTCCTTTTAAGAACCCAAATTGAACTGTGTTTGCTTTCTCTGTTTTTGCTGCATCA
TAGATTCTCTTCACCTCTTTCAAGTCAAAGAAGAAAGAAGAGAAATTTAAAAAATATATT
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CCACTTATGTTTCCAGATATGGAGTGACAACATAGGACAGCCCACCTACTCCTCCAAAAT
TATAAAGACAACTACAGCTGCCACTTATTCAACCTTCCATAACATAATATATATGTGTTT
TACTCTTCCATTTACCTTAA
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>LITCHI019798.m5 GenomeSequence + 
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TTAAGATTGTCATCTATATTAAATAAATAATGTCCAAGTAATCCCAGCGGTTATTTTATT
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ATTGATAACAGCAGGACGACGCCAATGGGTTACGAGGACGATCCGTAAGCCTTGTTTTTT
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TTTGTTGTTGTAGGTACCGTGACGAGGATGGAGAGGCGTTGATGGACTACGACGACTTCA
AATCGGACGGGGAGCAGTCACCGCCGCTGGAAGAAGATCTGGAGGATGATATCGGTGAGG
TGGCGAGCCACCGCGAGCCGGCTTACGGGAAGCCGAGGAAAAGATTGGTTAAAAAGGGAG
GAGGAGCGATAAGTAAAGAAGAAGATGAAGAAGAGGAGGAGGATAACATAATAGGTGATG
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AAATGCTTAATGAGATGTGGAATGCTGTTGCCCCACCTGGCGATTCTGAGGACGATCAAG
ACGTTGCGAGGACGGTAGACGACGATAACTTCATCGATGACAGCGGTGTCGACCCTCGTG
ATGTGTATGGAAGCGACGAACCGCGGTTCGCTCATGATGCTCCTCAGGCTGATGAAGGGG
ATGAGGATGACGAGGACGAAGAAATTAAGCAACTCTTCAAGATGGGTAAAAAGAAGAAAA
AGAACGAGAAAAGTCCGGCTGAGATTGCGTTACTTGTTGAGAACGTGATGGCTGAGCTTG
AGGTCACTGCTGAAGAAGATGCTGAACTTAATAGGCAGGGTAAACCTGCTATCAATAAAC
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TTATATATGTATGTATGTTACTCATTTTCTCCATTTTTTGGCAGGTCATTATGTTTTTAT
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GGGTAATCTCATGCTTTGATGATGAGGCATTGCTTTTCAAAATTTTTTTGAAAGATCCAT
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CCTATATGTTTTGGGAAAATCCTTGAAACATCTCAATTACCCTTACTTTCTCTATAGTTA
CTTGTGTATGTCCTTATATTCTGACAGTATTTAAGTTCCATTTCTGTCGTGTATTTCTAA
GTCGTTAATTTGTTTGATCTGGACAACATATTTTCTTCTGGAACTCCTTTTACTTTTTGT
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GGCCGATATTCAATAAGAGCACAAGGTTTGAAGACATGAAGAATGTTGAAGATGACAGGA
TTCCCTTTAGGAGGCCCTTTGTGAAAAAGTATACTCTCTGTAACTGCCATCTTTTTGATA
TCATGTGTGAGCATCTGCTATTACATTATAGCTTTGCCATATATTTTGTGTTGTCATTGT
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GGTGATTTTGATGATTTGGTTGCTTCTCGGTAAGATGGGATGTTGGATTTTATCTTCTTG
TTTCTGGCCTTTTTATGCTGAATGATAATACTGCAGCTCCATATGTTTCCCATGTTACTA
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TTGTGGTACGTCCACAATCTAAAATTGACCCTGACGAAGTTAGAGCTCGTGCTAAACAAG
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ATCGGTCGATTAGGAGCTGAGGTAGAGAGGGAGAGGCTGTCAGGTAGGGCAAAAAACGGG
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CCGGGCGCCGGAGCTGCACCCACCGCGCCTGGTGCCTGGGCGCGCGCCCAGGCGCGCCTT
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ATGCCTTTCTGATTCCATTGAAGTTTCACCTTTGTTTATGTTGATGGTTCAGTCTCTGTA
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GTACGGATTGCTTCTTCAAAAGGCCTTATATACATAAGATTGTACTTTTAAGTCTGGATT
GGGCTGGGTTTTTTAAGCCATATTGCTGTAACTACTCCTGCTGAGTCACAAGCCCTGAAA
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TGGAGCCTGATAGCTTCATTTGAGCAGTATTTGATTTTGTTTGTTGGATGGATCAATTTG
CTATGCAACAGTCGTTGGTTACGGTGGCTAGTAAAGTTTGAAGTGTGGGTGCTGTGTTGG
CTCGATATTCTGCTCTTTTTACCCATTTTCTTAAACCACATTCATACAAAGCTTTTTAGG
TTAAGCTTGTTGACAACTTCCTTGCGCTTATATCTTAGCAGTTGTAAGTTCATGGGATCA
TCTATAATGTACCTGGATGTCGATGCTCCTGAACTAATTATGTTTTAAAATTATTGATTG
TATTTTATTATATATTATTATATATAATTATAATTAAAAGAATCACATCAC
>LITCHI019798.m3 GenomeSequence + 
ATTAAAAATCTACATTTGATAAAAGTTTATACTAATTATTATATATCTATAAAATATCCA
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TTAAGATTGTCATCTATATTAAATAAATAATGTCCAAGTAATCCCAGCGGTTATTTTATT
CGGTGAGGAGACTCTGGAACGCCCAATCTCCCTTGTCTGGTAACTCAATCCAGTGCTTCG
ATTGATAACAGCAGGACGACGCCAATGGGTTACGAGGACGATCCGTAAGCCTTGTTTTTT
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AAATGCTTAATGAGATGTGGAATGCTGTTGCCCCACCTGGCGATTCTGAGGACGATCAAG
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ATGTGTATGGAAGCGACGAACCGCGGTTCGCTCATGATGCTCCTCAGGCTGATGAAGGGG
ATGAGGATGACGAGGACGAAGAAATTAAGCAACTCTTCAAGATGGGTAAAAAGAAGAAAA
AGAACGAGAAAAGTCCGGCTGAGATTGCGTTACTTGTTGAGAACGTGATGGCTGAGCTTG
AGGTCACTGCTGAAGAAGATGCTGAACTTAATAGGCAGGGTAAACCTGCTATCAATAAAC
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TTATATATGTATGTATGTTACTCATTTTCTCCATTTTTTGGCAGGTCATTATGTTTTTAT
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ACCACGTTTATCTTACAGAAATTATCTGGAAAATGATAGTGATATGAAGGCTTGGTTTCT
CCTATATGTTTTGGGAAAATCCTTGAAACATCTCAATTACCCTTACTTTCTCTATAGTTA
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TTCTTTTGAAAATTGTTCTATAGGCCTATGAACAAAGCTGCAGCAATGGAATCTAGAGAT
GGTGATTTTGATGATTTGGTTGCTTCTCGGTAAGATGGGATGTTGGATTTTATCTTCTTG
TTTCTGGCCTTTTTATGCTGAATGATAATACTGCAGCTCCATATGTTTCCCATGTTACTA
TTTTACCTTGACAATGCAGAGAACGCAAATCTGGTCAATCATCTTCCGCACAACATGCTT
CAAGGCCAGGTTCATCCTCCAGGCAACATGCTTCGAGGCCAGAAGCAACTCCATTGGATT
TTGTGGTACGTCCACAATCTAAAATTGACCCTGACGAAGTTAGAGCTCGTGCTAAACAAG
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TCTCTGTCAAAATCATAGTTTTAAAAGGCGCAAGGCGCAAAGGGGCTGTGGAGCCCAAGG
CGCAAGGCGAGGCGCACTTAAAAAAAAAAAAACCTTAAAATATTATAAATTCATAAACAA
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CGAAGTTCAATTAAAAACTAAGTCAATAACTAAGTATCCTACCCTAGGCAAACAACAAAA
GTCATAAGTCATTATCTAAATGCAATTATGTAAACAAGAACGAGTGACTAACACTAGTCA
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GCGACCGGACGGCGTAGGGAAGGCGGCTGGAAGACAAACTCGGCTGCTGGGCGGGTCGGG
TAGAGAGAGAGAGTGTCGAACAGGCTGAAACTGAAGAGATCTGTTACAGAAGACACTCAC
CGGCGGCGGAATGAGGCAGATCGACGACCGGACGGCGGCTGGAAGACGGCTGGATGACAG
ATCGGTCGATTAGGAGCTGAGGTAGAGAGGGAGAGGCTGTCAGGTAGGGCAAAAAACGGG
TGGGAAAGAAAAAAAAAAAAAGAACCTGATATAAATATCAGGTGCCATTTTGCCCAGGCA
CGCCTAGGCGCGCCTGGGTCTTCTGCTCCTGGGCCCGCCAGGCGCGCGCCTGGCCGGCGT
CCGGGCGCCGGAGCTGCACCCACCGCGCCTGGTGCCTGGGCGCGCGCCCAGGCGCGCCTT
TTAATACTATGGTCAAAATTTTGATTAACATCAAGGAAATGCTGGCTTTTATTTCTGGTC
ATGCCTTTCTGATTCCATTGAAGTTTCACCTTTGTTTATGTTGATGGTTCAGTCTCTGTA
AAAAAAAATATATGTACTGAGCTTCTGTACAAACAATAAATTGAGACTCAGTGGTTCAAT
GTGAACTTACATCATTGACCAGTGGGATTTAGTACAGATTATTTTTGCTCAACCTCTGAG
CAATAGGTTTAAAAATGGGCTATTTATGTTATTCAACAGATGGCATTAGCTTAGTGACTC
GTGGGAGAAGTACTTTTGTTCTCATTAAGAAGTTTTTTTTATACATAAATATTAACTCTG
GAGATTTAACTGTTAATAATGGCAGATGAACAAGAAGTTGCAGCAGTTGAAGGCACCGAA
AAAGAAGCAGCTACAAGCTACAAAACTTAGTGTGGAGGGTCGAGGTATGGTCAAATACTT
GTGAGGTAATATACCTCATTGCTAGGCCGAGAGAAGGGTGCATTTCGGAAGGTCGATAGA
ATGTGTCAATATGCATGTGGCATTGGCCTGATTAAAAGTGGTTGCAAAGAATATTCTAGC
GTACGGATTGCTTCTTCAAAAGGCCTTATATACATAAGATTGTACTTTTAAGTCTGGATT
GGGCTGGGTTTTTTAAGCCATATTGCTGTAACTACTCCTGCTGAGTCACAAGCCCTGAAA
GATAAATCCCATGCACTCAGTCTGCCCGAAATTTTTATGTTAAATTTGAATGTTCTAGCC
TCAATAAATTTTAAATTCTTACTTTGATTGAGGATAATATGGTCGTTGTCTACTTGTCTG
TGGAGCCTGATAGCTTCATTTGAGCAGTATTTGATTTTGTTTGTTGGATGGATCAATTTG
CTATGCAACAGTCGTTGGTTACGGTGGCTAGTAAAGTTTGAAGTGTGGGTGCTGTGTTGG
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TCTATAATGTACCTGGATGTCGATGCTCCTGAACTAATTATGTTTTAAAATTATTGATTG
TATTTTATTATATATTATTATATATAATTATAATTAAAAGAATCACATCAC
>LITCHI019798.m4 GenomeSequence + 
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TCTATAATGTACCTGGATGTCGATGCTCCTGAACTAATTATGTTTTAAAATTATTGATTG
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>LITCHI019798.m1 GenomeSequence + 
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CTATGCAACAGTCGTTGGTTACGGTGGCTAGTAAAGTTTGAAGTGTGGGTGCTGTGTTGG
CTCGATATTCTGCTCTTTTTACCCATTTTCTTAAACCACATTCATACAAAGCTTTTTAGG
TTAAGCTTGTTGACAACTTCCTTGCGCTTATATCTTAGCAGTTGTAAGTTCATGGGATCA
TCTATAATGTACCTGGATGTCGATGCTCCTGAACTAATTATGTTTTAAAATTATTGATTG
TATTTTATTATATATTATTATATATAATTATAATTAAAAGAATCACATCAC
>LITCHI019798.m2 GenomeSequence + 
ATTAAAAATCTACATTTGATAAAAGTTTATACTAATTATTATATATCTATAAAATATCCA
AAATAAATATAAATATGAAATTATTTCATTTTTATTTGGCTTAAATTAATTAAGATTGAA
AATGAAATTTATTAAAATTAATAAGAATATTTGATCATTTAAAAACCAATTAAACACTTG
TTAAGATTGTCATCTATATTAAATAAATAATGTCCAAGTAATCCCAGCGGTTATTTTATT
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TAGACCATGGAGTTCTGACCCTTTTGAAGAATTGGCTTGAACCCCTTCCGGATGGCAGTT
TACCCAATATTAACATCCGTGCTGCTATTCTCAAGATTTTGACTGATGTATCTATCTATC
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GTGGGAGAAGTACTTTTGTTCTCATTAAGAAGTTTTTTTTATACATAAATATTAACTCTG
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GTGAGGTAATATACCTCATTGCTAGGCCGAGAGAAGGGTGCATTTCGGAAGGTCGATAGA
ATGTGTCAATATGCATGTGGCATTGGCCTGATTAAAAGTGGTTGCAAAGAATATTCTAGC
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TCAATAAATTTTAAATTCTTACTTTGATTGAGGATAATATGGTCGTTGTCTACTTGTCTG
TGGAGCCTGATAGCTTCATTTGAGCAGTATTTGATTTTGTTTGTTGGATGGATCAATTTG
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TATTTTATTATATATTATTATATATAATTATAATTAAAAGAATCACATCAC