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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI023475 | Chr10 | 20426728 | 20429371 | + | Transcription factor MYB52 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI023475.m1 | 4 | 50 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 59.4 | 3.10E-16 |
LITCHI023475.m1 | 7 | 67 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 61.1 | 9.50E-17 |
LITCHI023475.m1 | 56 | 99 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 55.8 | 4.20E-15 |
LITCHI023475.m1 | 59 | 100 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 26.6 | 5.80E-06 |
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>LITCHI023475.m1 ATGTGCACCAGAGGACATTGGAGGCCTGCTGAAGATGAGAAGCTTCGAGAGCTTGTCGAA CGATATGGCCCACATAACTGGAACGCCATAGCCGAAAAGCTCCAAGGAAGATCAGGAAAA AGTTGTAGGTTGAGATGGTTTAATCAGTTGGATCCAAGAATCAATAGAAGTCCTTTTACA GAGGAGGAAGAAGAGAGGCTTCTGGCATCTCACCGGATCCATGGAAATAGATGGGCTGTG ATTGCTAGGCTTTTCCCAGGACGCACCGATAACGCAGTGAAGAACCATTGGCATGTGATC ATGGCTCGAAGATGCAGAGAAAGGTCGAGGCTCTACGCGAAAAGGGCTGCTCAAACGTTG CTAAATGAGCAGAAATCGTGCTTGAAAACCGACGGCCAAACGCAGCCCATGATCGGCTGT GAGATGACTAAGATTAATAGTAATAGTAATATTGCTTTGTTTGTTGAAGGCTATCGTGGG AAATATGAATATGGTTTGGCTCAGAATCATCCACACTTGTATGCTCAAAATACAAGTCAT TGTATGACACTGAAACAAGATAAAAATCAGCCTGTGGAGTTCTATGATTTTCTTCAAGTA AACACCGATTCAACCAAAAGCGAAGTGATAGATACTGCAAGAAGAGATGATGAAGAGGTT GATCAAGAAGCGAGAGAGCAACAGAACGCTCCAGCTGGTGTTAGATTTATCGATTTCCTA TCGGTAGCAAATTCTTCATCATCATCATAA
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>LITCHI023475.m1 + Up_Stream_Len 2000 CTGAAATTGACACCGGCTTCATATTAAGGATTTATCGAAATCAAAATAAATAAACTAGTG TGTGGGATTGCTAATCCCATAACATAAGGAAGAGAGCTTCCCATAACTATTAGTATTATT ATTATTTTGTGGACAGGGTGTATTTTGAAGTTGGAACTCTCATCACAAATATAAAGAGAG GATGACACCATTAACCAAGATTTAATATCATTTTTAATGTACATATTTTTGTTACTACAA CGTGTTGTTATCATACTATTAGTAATTTATTAGAAGTCTAGCGGGTTTTTGACTAACTAA ATTATTAAACTTCTGTTAAAAAATAATAATAATAATAAGGGACATGCACTTTTAGACAAG CCATGATTGGAGTTTTTCATTAGGATAATATTGTAATTTGAGTTTAATAACCATTTTAAC AGAAACCACAACTAGGAAGGTAGGGACAAAGACTACATGTTTGACTCAAAAAAAAGCAGT TAAATGATGACGGGGCCTAGTCTCCACGTGCACTTCTGAGGTTTCTTAATTACCTAAATC GTTGGTTAGGTCTGAAAAGCTCATCAAAAACCTAAAATTTAACCCCCCCTCATACGTCTA TGTATACATCAGATACCTAAATCCATATATATAAATAACCCTACAACAATAATTATTAAT AACATATCATCTGTATTAATTAATAGTTTAATTCATTAATTAATTATTATATATGTATAC CTTTGCCTATATACATCGCATGAGAACAATTCTTAGATAAGCGTTGTATTAATTAATTAT ATTAATTAAGGTTATCAATTAAATAAAGTCAAGCTTTTTGTTTACTTACTTAGGCCAATC TGTATTAACAACTTGGGTTGGACGTTGATTCATGATTCTATAATTTCTTTGGAAACAATT ATATTTATTTGAATAGAAAACATATACTTTTAAAAGCTGAACTTTTTTTAGACATGTTTA AAACTTGAACTCCATGCTTTCCTAATGCAACGAAAGTATAATTTACGTTTTTTTCAAAGT TTTGAGGTGGGTGTAATTTGATCTTAAAATATTTTACATATTATGAAAGATTTATCTACT AAGTTATATGGTACCCAATTTTTTCTTTAAAAAAAAAAGTTTGATTATTATATCATGAAC TCTCTCTAGATTGACAAAAAATCATCCATAAGATCATTTCATAGTTGATGCGGTAAGATA AACCAATGAGATAAATAAGAGAAAAAAAAAAAGCCAATGAAAATGGTAAGAGAAAAAAAA ATAACGTAATTTTATTGGTTCATCTCACCACATCAATTATGAGATAAATTCATGAAAAAT TTTCTTTATTAATTGATCATAAAGTCATCATAAGACAAACGAAGAGACTCATTAATGAAA GCCTACTTAAAAGTAGTTATTGTTATGTAGAAACAAACATAAAATAAACTGAAAAAAAAA AAAAAAAATAATAAAATATATATGATAGCTAGGTGGGTTATAAGTAGACGTTGTAGGTTA GAAACTTGTAAAGACGTTGAAAGCAGAACGAAATTCACCCCACCAAGCAACCCCCCCCCG CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCATATGTGTGTATGTGATGCATTTATTTGATTAA CTTATAAAGCGTTTGTTAGCCTATACCTTTTCAATCCATCCATCGCTCGTTGCCTCTCCA AACACCCTCCCCACCTCTTCTCTAACGGAAAAATATTCACTTCTCTCTCACCCTTTTATA TATACTTCTCTCCTTTTTTTCTCTTGTTTGCCCCACCTACACTTATCTAATCATTTGTAC TTTCTTCTCTCTTTCAGTTTTTCTTAGTTTCTAATTAGTTGATCAGGACAAAGCATATAC TTGAATTAGGGTTTCCTGCAGAACCAGGAAGCTTATCACAGAGTTTGCTATAGTGTTTTT TTTTTTTATATAATTATTATTATCAGCTTCCTTTTGTTATTTTAATTATTTGAAGATCAG ATCGTATCAGATCAGATCAG
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>LITCHI023475.m1 GenomeSequence + GTTAGAAACTTGTAAAGACGTTGAAAGCAGAACGAAATTCACCCCACCAAGCAACCCCCC CCCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCATATGTGTGTATGTGATGCATTTATTTGA TTAACTTATAAAGCGTTTGTTAGCCTATACCTTTTCAATCCATCCATCGCTCGTTGCCTC TCCAAACACCCTCCCCACCTCTTCTCTAACGGAAAAATATTCACTTCTCTCTCACCCTTT TATATATACTTCTCTCCTTTTTTTCTCTTGTTTGCCCCACCTACACTTATCTAATCATTT GTACTTTCTTCTCTCTTTCAGTTTTTCTTAGTTTCTAATTAGTTGATCAGGACAAAGCAT ATACTTGAATTAGGGTTTCCTGCAGAACCAGGAAGCTTATCACAGAGTTTGCTATAGTGT TTTTTTTTTTTATATAATTATTATTATCAGCTTCCTTTTGTTATTTTAATTATTTGAAGA TCAGATCGTATCAGATCAGATCAGATGTGCACCAGAGGACATTGGAGGCCTGCTGAAGAT GAGAAGCTTCGAGAGCTTGTCGAACGATATGGCCCACATAACTGGAACGCCATAGCCGAA AAGCTCCAAGGAAGATCAGGTTAATACACACACATATGATCTCTTAATTAATTTCTGTCA TATATATATATATGTATATATATATTGTGACTATACTAGGGTTTGATAATTTATTTCAAC AGTTACATAAAAATCGTATAAAATCCATATGTGGCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TAAAGTAAGTAAAGGATAATTGGTACGTACTAGCTAGCGGATATAATTCGATTTAGGTTT AATGAAATATAGAGTTTAATAAATTAAAGAAAAAAAAAAAAATATTTATAGACATACAAA ATTAGAAAATCATATATCCATGTTGTGACATGCAAACCTGGATGATAAACAAAATTAGCA AGATCTTGAATTTAACTAAACAATTATTATTATTTATTTATTGTGTAATTTTTTTTTTTT TTTTTAATCAGGAAAAAGTTGTAGGTTGAGATGGTTTAATCAGTTGGATCCAAGAATCAA TAGAAGTCCTTTTACAGAGGAGGAAGAAGAGAGGCTTCTGGCATCTCACCGGATCCATGG AAATAGATGGGCTGTGATTGCTAGGCTTTTCCCAGGACGCACCGATAACGCAGTGAAGAA CCATTGGCATGTGATCATGGCTCGAAGATGCAGAGAAAGGTCGAGGCTCTACGCGAAAAG GGCTGCTCAAACGTTGCTAAATGAGCAGAAATCGTGCTTGAAAACCGACGGCCAAACGCA GCCCATGATCGGCTGTGAGATGACTAAGATTAATAGTAATAGTAATATTGCTTTGTTTGT TGAAGGCTATCGTGGGAAATATGAATATGGTTTGGCTCAGAATCATCCACACTTGTATGC TCAAAATACAAGTCATTGTATGACACTGAAACAAGGTGATTATCGTTTATTCATTGTTGA ATTCCAAACTTAATTTAATGTGTTTATTTATCGTTGAGATACTATGTTTTGATCAACCGC ACCCCTTCACTTAAACTTAAATTCTTTTCATAAAAATATTAGTACAAACAAAAAATTGAT AATGAATGCTTACTTATCAATTTTAGGCTTCATATGCGATTCACATCTATGAGTGAGTTT GCCAATAGTTAGAGAAATTTCAATATTAAGAAATATGCTCCTCTCAATGGATTTTGACCT TGAATGATTGTTCTAATAGTTCTTGCAAAATCATCAACAGCTACTAAAGCTTAACTTGTT AATTAATATTTTAGTTAAAAAAAGATTAAAAAAAAAAATCATCTAGCAAGTAGATGAATT TGTGTATTTTGTTTTATGGTTTTTCAAAACCATATACATGTATTAATCAAGCAACGATAT CTATTTGTTTAGACATGCTTATGTATGTTCAACTAATTGCTTTTTCTGTTTTTCAGATAA AAATCAGCCTGTGGAGTTCTATGATTTTCTTCAAGTAAACACCGATTCAACCAAAAGCGA AGTGATAGATACTGCAAGAAGAGATGATGAAGAGGTTGATCAAGAAGCGAGAGAGCAACA GAACGCTCCAGCTGGTGTTAGATTTATCGATTTCCTATCGGTAGCAAATTCTTCATCATC ATCATAACAATATGTATTAAATGTATTTTTTGTTCTTGATGAACATGACATTCGATCCAC TGGAAATTAAAGAATCACTTGGACACACGCACACGCACGAAGTATATAACTAACTAATTA ATTAAAAGGTTTTACTTAATTAGTTTGTTATTTTTGCAAGAAAAAAAAAAGGTACTATTT AAGAAGATAATATATACACACGTATCATGTATGTTGCATGTAGGTTTTATACGCAGAAAA ATGTAAGAATCGTTGTGTTATGTATCCGTCAGAGCTCAGGCTTTGTCCAAGATCAATGTT AATTTGGTGTGTAAACACCACAGGAAATGAGAAATAGTTTGTGATTCGATGAAACCCTAA TTAGTGTTTGGATTTATGAAAATATATATGTAGTTTGTGAGTCGATTCGATAGTGTTTTG ACACACACACACACACACATACACATATATATATATATATATATCTGTGCAATTTCAATG GGGG