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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI023409 | Chr10 | 18373490;18373577 | 18377526;18378547 | + | Transcription factor PIF7 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI023409.m1 | 189 | 235 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.8 | 3.20E-14 |
LITCHI023409.m2 | 189 | 235 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.9 | 2.80E-14 |
LITCHI023409.m3 | 172 | 218 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.9 | 3.00E-14 |
LITCHI023409.m4 | 172 | 218 | PF00010.29 | HLH | Domain | 53 | 2.60E-14 |
LITCHI023409.m5 | 194 | 240 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.8 | 3.20E-14 |
LITCHI023409.m6 | 194 | 240 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.9 | 2.90E-14 |
LITCHI023409.m10 | 194 | 240 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.8 | 3.20E-14 |
LITCHI023409.m7 | 189 | 235 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.8 | 3.20E-14 |
LITCHI023409.m8 | 172 | 218 | PF00010.29 | HLH | Domain | 53 | 2.60E-14 |
LITCHI023409.m9 | 189 | 235 | PF00010.29 | HLH | Domain | 52.8 | 3.20E-14 |
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>LITCHI023409.m1 ATGTCTAATTATGAAGTAGCAGAACTAACATGGCAAAATGGCCAGCTAGCAATGCATGGG CTTGGTGGGCTCCTACCGACTGCTCCGACAAAGCCCACATGGGGAAGGTCCAATGATACA CTGGAGTCCATAGTACATCAAGCCACATACCACAAACAAGGTGATCAGCCTCTAAATCTA CTCCAACATCACCACAAAAACACCCCGCCTAATTTGCCTTCCATGGTTGCACCCTCCGCC AGCAAGTGGTCGGAGAGCTCCTCCGGCCGGGTACAAATCGTGCCGGGCCTGCTCAAGAAA CGAACGAGGGCCGATTCCGATCAATGCATGCATGATGATGGAGCAGACATGAGTGCTTGT GCTAGTGCTAGTGCAACATTTTGTAGGGATAGTGATACAACCATGGTGACTTGGGCTTCC TATGAATCTCCTAGGAGCTTGAAGACCAAAACCCTTGATGAGGACTCTGCTTGCCATGGT GGCTCGGAGAACCAAGATGAAGACCGTGAGACCAAAGCTGAAACAGGCCGATCACGTTCT TCGAGACGAAGTCGAGCAGCTGCTGTTCATAATCAGTCAGAGAGGAGAAGAAGAGATAGG ATAAATCAAAAGATGAAAGCACTTCAAAAGCTAGTCCCAAATGCAAGTAAGACAGATAAA GCTTCAATGCTAGATGAGGTGATAGAGTACTTGAAACAACTTCAAGCACAAGTGCAAATG ATGAGTGTGAGCAGAAGCATGCCCCAGATGATGATGCCATTGGGAATACAACAACACATT CAAATGTCTCTACTAGCACGTATGGGAATGGGAGTTGGGCTTGGAATGGGAATGGGAATG ATTGACATGAACGCTGCTGCTGCTATTAGTCGTGGTCCCCCATCCCAATCTCTGCCTTCT CTCATCCATCCTCCGCCTGCATCCGCCACCACTCCCACATTCGTTCCATCTCCGTTTCTA ATGCCTTCCATGATTCCAACTACTTGCCAGCCCCCGCCTCAACCAAATTCCGAGCCCGGT GACACCAGTTCATCTGTTCCTTTGCCTGATCCCTATTGTGCTTTTCTTGCGCAATCAATG AATATGGAGTTGTACAACAAGATGGCGGCACTCTACAGGCAACAAGTCAACCAAGCTACA CAGGCAACAAGCAGCCCATCGCAGTCTGGCCTTGTGCAATCTGATTGA >LITCHI023409.m2 ATGTCTAATTATGAAGTAGCAGAACTAACATGGCAAAATGGCCAGCTAGCAATGCATGGG CTTGGTGGGCTCCTACCGACTGCTCCGACAAAGCCCACATGGGGAAGGTCCAATGATACA CTGGAGTCCATAGTACATCAAGCCACATACCACAAACAAGGTGATCAGCCTCTAAATCTA CTCCAACATCACCACAAAAACACCCCGCCTAATTTGCCTTCCATGGTTGCACCCTCCGCC AGCAAGTGGTCGGAGAGCTCCTCCGGCCGGGTACAAATCGTGCCGGGCCTGCTCAAGAAA CGAACGAGGGCCGATTCCGATCAATGCATGCATGATGATGGAGCAGACATGAGTGCTTGT GCTAGTGCTAGTGCAACATTTTGTAGGGATAGTGATACAACCATGGTGACTTGGGCTTCC TATGAATCTCCTAGGAGCTTGAAGACCAAAACCCTTGATGAGGACTCTGCTTGCCATGGT GGCTCGGAGAACCAAGATGAAGACCGTGAGACCAAAGCTGAAACAGGCCGATCACGTTCT TCGAGACGAAGTCGAGCAGCTGCTGTTCATAATCAGTCAGAGAGGAGAAGAAGAGATAGG ATAAATCAAAAGATGAAAGCACTTCAAAAGCTAGTCCCAAATGCAAGTAAGACAGATAAA GCTTCAATGCTAGATGAGGTGATAGAGTACTTGAAACAACTTCAAGCACAAGTGCAAATG 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