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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI023346 | Chr10 | 17395897 | 17398480 | - | Transcription factor TCP5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI023346.m1 | 61 | 205 | PF03634.16 | TCP | Family | 91.8 | 6.60E-26 |
LITCHI023346.m2 | 51 | 195 | PF03634.16 | TCP | Family | 91.9 | 6.20E-26 |
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>LITCHI023346.m1 ATGACTTTCTGGTTGCAGACGAGGAATAAGATGATATCAATTTCAAGAGAAAAGGGTTAT CAAGCCAAGCAAGAGGGTGACACCAATGAGATCATCAAGTTCCCAAAAGCAGCATCCACT TCAAGGCAATGGTCCGGATTCCGAAATCCAAGAATTGTTCGTGTCTCGCGATCCTTTGGA GGAAAAGACAGGCACAGCAAGGTTTGCACAATAAGGGGCTTGAGGGACAGGCGGATTAGG CTCTCGGTGCCTACAGCGATTCAACTATACGATCTTCAAGAGAGGCTTGGAGTTAACCAG CCAAGCAAGGTAATAGACTGGTTGCTTGATGTCACTAAAACTGACATTGATAAGCTCCCT CCACTCCAAATGCCACAAGGATTTGGCCATCAATTCCATCAACAGATGCTACTATCTAGT GATCCAAACACCTCTCAATCTCCTCTCGCTCCGTTCTTTGAAGTGAATTCTACATTTCTA AAGGATGGGGGATTCCATTCCTTGCTGGCTAGCAAGGAAGGGGTTAAGATCAATGAAAAC GTCAATGGGGATGGTGATGATAGTCAAACGAAATCAAAGTACTGGGATGTGGATGCTTTG TCGAGGAGATCAAAAGGCAAGGAAGTTGTTTCTGAGAAAGGGAAGTGGATCAAAACAAAT GATCAGAAAAACCAAGATGGAAGCAGTGATTACATGGGACCGGCATCAACACAAAGGTTT TTTCCAGTAGCTAATCATTCTTCCTTAACAGGTTTGCTAAACAATGCCATGCCATTTAAC TCCTACTATCATTGGGAGCCTTCAAATTTATCTCTATCTCAATATGGAAGTCATGATTTT CTGTCCCAAAATGAGAATTCTCTCAACAGCAACACTCTACCATTGCAATCTTCGTTGGGT TTTCCATCCGGGTCTCATCACTTATTTTTCTGCCCACCGGCAACGGTGCCGTCGCTTTTT CCACCATATTCTCCCTATGTTTCAATCCCAGCTGAGAGTGACTCCAGACAGATGAATCAT CTCCAGTTGTTGAGCTCAGCTTCACAACATAACATTCTGCCAAATTCTCTCACAATCAAC TCACAAGCGAAACCCTTATTGTTGAATGTAAATCATCCGGGGCTAGCTCATACACAGACT GAGTCTGAAAGCCATCCAAATAAGGACAACACCTAG >LITCHI023346.m2 ATGATATCAATTTCAAGAGAAAAGGGTTATCAAGCCAAGCAAGAGGGTGACACCAATGAG ATCATCAAGTTCCCAAAAGCAGCATCCACTTCAAGGCAATGGTCCGGATTCCGAAATCCA AGAATTGTTCGTGTCTCGCGATCCTTTGGAGGAAAAGACAGGCACAGCAAGGTTTGCACA ATAAGGGGCTTGAGGGACAGGCGGATTAGGCTCTCGGTGCCTACAGCGATTCAACTATAC GATCTTCAAGAGAGGCTTGGAGTTAACCAGCCAAGCAAGGTAATAGACTGGTTGCTTGAT GTCACTAAAACTGACATTGATAAGCTCCCTCCACTCCAAATGCCACAAGGATTTGGCCAT CAATTCCATCAACAGATGCTACTATCTAGTGATCCAAACACCTCTCAATCTCCTCTCGCT CCGTTCTTTGAAGTGAATTCTACATTTCTAAAGGATGGGGGATTCCATTCCTTGCTGGCT AGCAAGGAAGGGGTTAAGATCAATGAAAACGTCAATGGGGATGGTGATGATAGTCAAACG AAATCAAAGTACTGGGATGTGGATGCTTTGTCGAGGAGATCAAAAGGCAAGGAAGTTGTT TCTGAGAAAGGGAAGTGGATCAAAACAAATGATCAGAAAAACCAAGATGGAAGCAGTGAT TACATGGGACCGGCATCAACACAAAGGTTTTTTCCAGTAGCTAATCATTCTTCCTTAACA GGTTTGCTAAACAATGCCATGCCATTTAACTCCTACTATCATTGGGAGCCTTCAAATTTA TCTCTATCTCAATATGGAAGTCATGATTTTCTGTCCCAAAATGAGAATTCTCTCAACAGC AACACTCTACCATTGCAATCTTCGTTGGGTTTTCCATCCGGGTCTCATCACTTATTTTTC TGCCCACCGGCAACGGTGCCGTCGCTTTTTCCACCATATTCTCCCTATGTTTCAATCCCA GCTGAGAGTGACTCCAGACAGATGAATCATCTCCAGTTGTTGAGCTCAGCTTCACAACAT AACATTCTGCCAAATTCTCTCACAATCAACTCACAAGCGAAACCCTTATTGTTGAATGTA AATCATCCGGGGCTAGCTCATACACAGACTGAGTCTGAAAGCCATCCAAATAAGGACAAC ACCTAG
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>LITCHI023346.m2 - Up_Stream_Len 2000 TTACAATATAAATCTCAGTTAGCTGTGCCTTGAAAAAACTCACTGCCATAGAGTGTGGTC CCTTTTCGACTGAGTGTGGATGCTTTAAAGAAGCGCTTCTCTAAGTTGGTCCCTCCTCTG TAAGGGTATGGATGGGTAGCTATCTGTCATCGATTCCTATTGATGGAAACTGTTGTTGCA TACACCACAACTTTGAAAGCCACATGACTAGGGCTTATCTCTATTTCTATTCCCATTCTA CATCTTTCTTACTCTCTGATTAGTCAAATATTCAATCAAACTGATCGTCACAGTACAATC AAGTCTAGGTCATCAGGAAATATAAAAAAGTTGAAATTGCATATATTTTCCAAACTATAA TTACTCTATAGTTGTAATTCAACTAACACACACTGACTTATATACATAGTCTGGGAATAA GAATTAGGTGCGGAATTTTACATTTTGTTTTCTTTAGAATTCAACTTCGCAACATTACAT AATCATAGAAAGCCACATCATAATGTTATAAGTCGTGATTTTGCTTGAAAATATGTGGTG TCCTGTACTTAATAATATATGCGTATATATAACATGCTTTTATAATTGTAAACTTGATTT TAAAATAAAATGACCAACCAATTAAATTCATCAATTGCATTCGAATTAAATAAAAGAGAT AATTTATTTTAGGAAAGAGAATACAATGAATGAATTTGATTGGTTGGTTCTTATTTTTTA AAATCAGATGTACCTGATTATAAAAGTTATATATATAGTTATTTTATCAACGGTGTAATT TTAAAAAGTTAGGATAAATTAATCAATGCATCCATTGTATTTAAATTAAATAAGAAATAT AATTTATTTTAAAGAAAGAATGCAATGAATATATTTAATTGATATGTTCTAACTTTAAAA AGTTATAAAATACTTATGGTAAAAGTACTATATATATAAAAAAACGCATATTTTCTAGCA TTAGGGTTTAAAAACATTTTGTTTCAGCTAGGCATGCATTTAAAGTTACTTATGGAAGTC ACCAAATTAATGCAATTTTTAAAAGAGAGAGGAAGGTCAACAAGAGTTGTTAATTGCTAA GCTAGTGATAATTGTGTGGTTAATGGTATGAACTGAAGAGACTTGAGGAACTTACAATTT ACTAGAGATAGCTTATCTGATTGATGTGTCAGCGGAGAGAGATGCCACATGGTTGTCGGT ATGCCACACCTTTTTCTTTTTCATTCCAATGCAACATGTTGCAGTGAAATTCCAGCATCT TTTCTTTACCAAAATTTGTAATTTTATTTAATTACTTGAACAAACCGCCATAACCTTTCA TTATAAAAACTAACCATTCTACACAACCCAGTTAAAGTGAGAAGCGTGTACTTACAAACT TCCATGGTGCTGTGACCTCCAAATACTCATCCTCTTCCTACACACCTCCCACCCTCAAAA GTACTCATGCTGGACAATCAATAAATATTCATCATCTGTGAACCGGAAAAGAAAAATTCT GCTTCATCCTGTGCATGGTCCTAAATCTCGGAATAGGTTAAGAGTACTCTATGACTTTCT GGTTGCAGACGAGGTTATTTTCATCTTCTTAGCTCCTTTTTAGATATGTCTATATATTCC TGATTGATTTTCAACAATACTTCCTGTTTAGATCCATTTCAATTACTCTTTTTATTGTCT TTTTAAGGTTCAAGAAAATAACCAGTTTTTTATTTGAAGCAAAACATATTTTTGTTCTCT CAAAAAAAAAAAAAAAAACATATTTTTGTTTTTCCATTATACTTTGTTAGATGATATTGA TATATATTTTTTCCAAGTATTTTTTGTAGTCAATGATGAGTCTATACACCCATCTCTTTT GAAATATTAATTATTTTTCTCTGACATTTAATTGACAAAAATCACAGATAACCTAGATAG AGGAAAGAATTTACACACACCAAGGATGATTTTTCATTGTTGCTTCAATTGATTTGCAAC CGAATGATGATAGGAATAAG >LITCHI023346.m1 - Up_Stream_Len 2000 GATTCTTTTCCGGGTGAGTATAGTTGATACAACGCTAGCTGTTTCCCGATGAACTCATCA TCATTAACATGTTGTTCATATAGGTAACACTGTTTGTTTTTGTTGGATCAAGTAGTGTAC AACTTTTTAGGGTTTCTTGTTTTCTTGCAGGCTTTGATGAACACTCACCCTTTATCCATT ATGTGTCTGTAGACAAAACAGTTTGCTGAGTTTCCAAGTCATGGCATGATCTCAGTATTT GAAGGCGACCATATATATCTTTTGTCTGTTGTAGGGGGATCTATATCGGGCATGCAAACT CCAGTTTCTTAGTCATAAATCGTAATCATATTGATGAGAAAGCTTGCACATATATGAAAA GTAATAAAAGATAAATCATGGTGATTGACAATTCCAATATTGTAAATAGAAGGGTTGATA TATCATGAAGATGAGATCATTTTTATTAATTTACAATATAAATCTCAGTTAGCTGTGCCT TGAAAAAACTCACTGCCATAGAGTGTGGTCCCTTTTCGACTGAGTGTGGATGCTTTAAAG AAGCGCTTCTCTAAGTTGGTCCCTCCTCTGTAAGGGTATGGATGGGTAGCTATCTGTCAT CGATTCCTATTGATGGAAACTGTTGTTGCATACACCACAACTTTGAAAGCCACATGACTA GGGCTTATCTCTATTTCTATTCCCATTCTACATCTTTCTTACTCTCTGATTAGTCAAATA TTCAATCAAACTGATCGTCACAGTACAATCAAGTCTAGGTCATCAGGAAATATAAAAAAG TTGAAATTGCATATATTTTCCAAACTATAATTACTCTATAGTTGTAATTCAACTAACACA CACTGACTTATATACATAGTCTGGGAATAAGAATTAGGTGCGGAATTTTACATTTTGTTT TCTTTAGAATTCAACTTCGCAACATTACATAATCATAGAAAGCCACATCATAATGTTATA AGTCGTGATTTTGCTTGAAAATATGTGGTGTCCTGTACTTAATAATATATGCGTATATAT AACATGCTTTTATAATTGTAAACTTGATTTTAAAATAAAATGACCAACCAATTAAATTCA TCAATTGCATTCGAATTAAATAAAAGAGATAATTTATTTTAGGAAAGAGAATACAATGAA TGAATTTGATTGGTTGGTTCTTATTTTTTAAAATCAGATGTACCTGATTATAAAAGTTAT ATATATAGTTATTTTATCAACGGTGTAATTTTAAAAAGTTAGGATAAATTAATCAATGCA TCCATTGTATTTAAATTAAATAAGAAATATAATTTATTTTAAAGAAAGAATGCAATGAAT ATATTTAATTGATATGTTCTAACTTTAAAAAGTTATAAAATACTTATGGTAAAAGTACTA TATATATAAAAAAACGCATATTTTCTAGCATTAGGGTTTAAAAACATTTTGTTTCAGCTA GGCATGCATTTAAAGTTACTTATGGAAGTCACCAAATTAATGCAATTTTTAAAAGAGAGA GGAAGGTCAACAAGAGTTGTTAATTGCTAAGCTAGTGATAATTGTGTGGTTAATGGTATG AACTGAAGAGACTTGAGGAACTTACAATTTACTAGAGATAGCTTATCTGATTGATGTGTC AGCGGAGAGAGATGCCACATGGTTGTCGGTATGCCACACCTTTTTCTTTTTCATTCCAAT GCAACATGTTGCAGTGAAATTCCAGCATCTTTTCTTTACCAAAATTTGTAATTTTATTTA ATTACTTGAACAAACCGCCATAACCTTTCATTATAAAAACTAACCATTCTACACAACCCA GTTAAAGTGAGAAGCGTGTACTTACAAACTTCCATGGTGCTGTGACCTCCAAATACTCAT CCTCTTCCTACACACCTCCCACCCTCAAAAGTACTCATGCTGGACAATCAATAAATATTC ATCATCTGTGAACCGGAAAAGAAAAATTCTGCTTCATCCTGTGCATGGTCCTAAATCTCG GAATAGGTTAAGAGTACTCT
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>LITCHI023346.m2 GenomeSequence - CTTTTCTTTACCAAAATTTGTAATTTTATTTAATTACTTGAACAAACCGCCATAACCTTT CATTATAAAAACTAACCATTCTACACAACCCAGTTAAAGTGAGAAGCGTGTACTTACAAA CTTCCATGGTGCTGTGACCTCCAAATACTCATCCTCTTCCTACACACCTCCCACCCTCAA AAGTACTCATGCTGGACAATCAATAAATATTCATCATCTGTGAACCGGAAAAGAAAAATT CTGCTTCATCCTGTGCATGGTCCTAAATCTCGGAATAGGTTAAGAGTACTCTATGACTTT CTGGTTGCAGACGAGGTTATTTTCATCTTCTTAGCTCCTTTTTAGATATGTCTATATATT CCTGATTGATTTTCAACAATACTTCCTGTTTAGATCCATTTCAATTACTCTTTTTATTGT CTTTTTAAGGTTCAAGAAAATAACCAGTTTTTTATTTGAAGCAAAACATATTTTTGTTCT CTCAAAAAAAAAAAAAAAAACATATTTTTGTTTTTCCATTATACTTTGTTAGATGATATT GATATATATTTTTTCCAAGTATTTTTTGTAGTCAATGATGAGTCTATACACCCATCTCTT TTGAAATATTAATTATTTTTCTCTGACATTTAATTGACAAAAATCACAGATAACCTAGAT AGAGGAAAGAATTTACACACACCAAGGATGATTTTTCATTGTTGCTTCAATTGATTTGCA ACCGAATGATGATAGGAATAAGATGATATCAATTTCAAGAGAAAAGGGTTATCAAGCCAA GCAAGAGGGTGACACCAATGAGATCATCAAGTTCCCAAAAGCAGCATCCACTTCAAGGCA ATGGTCCGGATTCCGAAATCCAAGAATTGTTCGTGTCTCGCGATCCTTTGGAGGAAAAGA CAGGCACAGCAAGGTTTGCACAATAAGGGGCTTGAGGGACAGGCGGATTAGGCTCTCGGT GCCTACAGCGATTCAACTATACGATCTTCAAGAGAGGCTTGGAGTTAACCAGCCAAGCAA GGTAATAGACTGGTTGCTTGATGTCACTAAAACTGACATTGATAAGCTCCCTCCACTCCA AATGCCACAAGGATTTGGCCATCAATTCCATCAACAGATGCTACTATCTAGTGATCCAAA CACCTCTCAATCTCCTCTCGCTCCGTTCTTTGAAGTGAATTCTACATTTCTAAAGGATGG GGGATTCCATTCCTTGCTGGCTAGCAAGGAAGGGGTTAAGATCAATGAAAACGTCAATGG GGATGGTGATGATAGTCAAACGAAATCAAAGTACTGGGATGTGGATGCTTTGTCGAGGAG ATCAAAAGGCAAGGAAGTTGTTTCTGAGAAAGGGAAGTGGATCAAAACAAATGATCAGAA AAACCAAGATGGAAGCAGTGATTACATGGGACCGGCATCAACACAAAGGTTTTTTCCAGT AGCTAATCATTCTTCCTTAACAGGTTTGCTAAACAATGCCATGCCATTTAACTCCTACTA TCATTGGGAGCCTTCAAATTTATCTCTATCTCAATATGGAAGTCATGATTTTCTGTCCCA AAATGAGAATTCTCTCAACAGCAACACTCTACCATTGCAATCTTCGTTGGGTTTTCCATC CGGGTCTCATCACTTATTTTTCTGCCCACCGGCAACGGTGCCGTCGCTTTTTCCACCATA TTCTCCCTATGTTTCAATCCCAGCTGAGAGTGACTCCAGACAGATGAATCATCTCCAGTT GTTGAGCTCAGCTTCACAACATAACATTCTGCCAAATTCTCTCACAATCAACTCACAAGC GAAACCCTTATTGTTGAATGTAAATCATCCGGGGCTAGCTCATACACAGACTGAGTCTGA AAGCCATCCAAATAAGGACAACACCTAGCTCTGAATCATCCAATGGCATGCATGTTTTCT TTCCCTCTTCATGGATTAATTACTTGAATTTGTACACTTTCAAGCATTGTGCCGGGTCTT TTATTAATGCGTCGTCTCCATATGGTCTATAACACTACCCTGAAGAAGCATCAAAGCAGG AATTATTATAGTCATATAATGGCCATATATATCATCAATGTCGTCTGGTTTAAATCTCAT CAACGCTTCATCGATCATCATGGAAAATTGCGATCAAGATTGGGACAAGAAACCTTGCAC CAAGAATTGTTTCCAGCTCCATGGCTGATTCCTGGATACAAGTAAGACATTTATGATACT TTTTCTTCTATCTAAATACAATTATCTGCAGACAGTGGTTTTAATAGGTGAAATTAAGTT TGTAATTTGCTAATATACAGTTTACTGTTCTTGGATGTCATGAGTTTTTAGTTGCAATAT GGAAACATCTTTGATCAAAGTTCATCAGTGTCAGTAATTGATTATTTGAATATTATGTGT TAGAAATTCAAATAGCGTTTGTTTGAAACAATGATCAAAACTGCAGAGTTTTACAGCCTG CTGACAATCTTCATATACATTATAGTGTTATTACATATTGGGTATTATTAATATGGTACA CGTTAGAGAAAATAGTTTATCATTAAGAATTTATTTAAGGGCAAACTGCAAAAGAAAAAA GGGA >LITCHI023346.m1 GenomeSequence - 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