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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI023219 | Chr10 | 15495100 | 15498320 | + | Transcription factor SRM1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI023219.m1 | 40 | 86 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 28.2 | 1.70E-06 |
LITCHI023219.m1 | 164 | 209 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 40.9 | 1.90E-10 |
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>LITCHI023219.m1 ATGCCCATTTTCACACTAGACCAACATTGCATAATAAACCCCACTCAAAATAAAAAACAT TTGCAGAACCCCAGAAGGCAGAAGAAAACTATGTCCAGTACTGCTGCAACTTCAGTGACT TGGACCAGAGAAGAAGACAAAGCTTTTGAAAATGCCATAGCTATGCATTGGACTGAAGAA GACACAAATGAGCAATGGCAAAAGATTGCTTCGATGGTTCCTAGTAAAACTGTTGAACAA ATGAAGCAACACCACCAATTGTTGCTGGAGGATGTGCAGGCAATAGAGGCTGGAAATATA CCAATCCCAAAGTATGTAGGAGAGGAAGCTGCTGCAACTTCTCCTTCAACCAAGGATGTC CATGACCTTAATGGGAGATCAAATGGTAGTTATGGAAGTGGGTTCTCAGGGTTGAGTCAT CATGAGTCCAGTGGACATGGAGGTAAAGGAAGCAGCTCCAGGTCAGACCAAGAAAGAAGA AAAGGCATTCCATGGACAGAAGAAGAACATAGGTTATTTCTACTGGGTCTGGATAAATTT GGCAAAGGGGATTGGAGGAGCATATCAAGGAACTTTGTGATATCAAGAACTCCAACACAA GTAGCTAGCCATGCACAAAAGTACTTCATTAGGTTAAACTCAATGAACAGAGACAGGAGG AGGTCTAGCATTCATGATATCACAAGTATTAATAATGGGGAAATGTCCTCTCATCAACCA CCAATTACTGGTCAACAGGCTAATGCAAACAACACAGGTGGCAGTGGGGGCAGTGGCAGT GGAGTGAAGCACAGGGCAGCTCAGCCAGCAGCTATGGCTCCTGGTATAGGCATGTATGGT GCAACTGTTGGTCACCCAATTGTGGCCCCACCTCATATTGGTTCTGCTGTTGGTACTCCT GTCATGCTTCCTCCTCCTCATCCTTCCTATGTTCTCCCAGTTGCCTACCCCATGGCACCG CCTCCCACAATGCACCAATAG
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>LITCHI003498.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATTTATGTATATATAATTTTTTTTTAAAAATTCTTTACTATAATAATTAATCATATTTCA ATTATGAATAAAAATATTATTAATATATATAAATATTTGCTAAATAATTTATTATAATTG TTGTTATTATATTAAACGAAATCACATGGCAACTAATAGTGAAAAGATATAAATATCAAA TTACTAGTTTTCAAACAGTTCTAATTTTAAAAAATAAACAAGATTACTATATATTTAGAG ATAAGAGGAAAAAAAATTATGTTATTCAGATTTTAGATTTTAGTCATTATTTAGTCTTCA GTGTTCAGTAACACTATTCAATCTTCAGATAAAAAAACAAACGACCCCTTAGTTAGAAAG TTTTATGTCATATTTATTATATTTCATACTTATAAAATAAGTAGAGAGTTAATTTAATTC TCTAAAGTAGTTTTTTCCTGATCAATTAATCATCACTCATTATGTAAATTTGATCCTACT CCAATCTTTTTTCTTTTTTTTTAAAAATTCAAACAAAGAGAAATAAAACATATATTAAAT TGAAAAAATGAAAGAAAAAACATAAATATACTTTGGACACATTAATTAGTATTGGACTAC TAAGAGATTTGAACACATTTATTAATTAATTTGTGCCCTTCTGAAATATTTTTATATCTC CAAAATGTAAACAACAAAGTTTATGTTTTCTACTTTCTAGTTTCCTCTTATCAAATCTTG AGTTTTTGCTTTAAGTACATCTAAAACTCAAAATCACAACTCCCCATTCTACAAGCAAGA AAATTATGTTTACATGGGAGTGTTTGACACTAATTAATCTTTTGGTATTCTATAATATTG TTAATGTGGTAAATAATCTATAAGGTAAATTATGGTGTTTTGTATTAGTTGATTAACTAA ATAGTGATTTTAAACTATGAATCAGACCTTTAATTTTCTCGAATGAAAATGCATTACCAA TTAACACAACTACATTACATTTATAGCAACTTTTTGGGGTTCAAATTTATGAAATACCTA AAGTGTAAATAGAATGTGAATTTGATTTTGTTCATAGTGAGAAAATTATTTACATAATAC CATTCTTAAAATATACAAAACTCCAAGCTACTAGCCATATACACGTCTGTATATATATAT ATATATATATGTATGTATCTTATGTATTTTACTATGTTTTCTCAAGCTTATAAGGAAAAT AGTTTTAGTTTCCTTACACCACCCTTTAATAAAGGGTAATTGAGTATTTTTCTTGATCCT AATAAATCAAGAATTCAAGTCTTATTCTTATTCTAAAACTCTAGTGTGGGTAGTTTTCTT TGAATTTAATTTCACTTCTCCACTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTAGGATTTTT TACTTAATGACCAACATATGTTGTTTTGTACTCATTGATAGATAAATGATAGAAGTCAAT ATTGGCGTAAACAATAGCATAGAACCTAGGTTTCCTCAAACAACGGCGCCGTATGTATCA CTGATGCACACAGTTTTATTACTTAGCAATGCCTTAATGAATGCCTCAAATCTATCAACT AGACTATTTATATATGAAACTATGATGTGATTTCAATTCCATATCTGGTAATTAAATTAT TCTAACATTAATATCAAACTTCTATAAAAATGAGATTTTCTAACATCTCAGTGCAAATCT GAAAAGGAAAAAAATCCAAACACCAGATTACAATCTTAAACCTTGCAACATTGTGTTATC TCATTGTTGACATGCTTTGGCAAATGCTTGACCAAGGCTACTATCTTTCTACTGAGTGTA AAACCATGACTAAATTGGGAGGCATTCTCATAACAAATATTTAATATTTCTTAGATTCTC GTATCCACAAGTAGCAATTTGGCAAGGTATTTCAAACTATGTGTAATTAGTTTTTCGTAA TTTCTTAGGTTCTCATAAGAGGGTGTCGATAGAATAGCCATTATTTAATTCATTATTTAT AAGATTTGAAGAGGATATCA
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>LITCHI003498.m1 GenomeSequence - ATTCTCGTATCCACAAGTAGCAATTTGGCAAGGTATTTCAAACTATGTGTAATTAGTTTT TCGTAATTTCTTAGGTTCTCATAAGAGGGTGTCGATAGAATAGCCATTATTTAATTCATT ATTTATAAGATTTGAAGAGGATATCAATGTGTTTCAATGTTATAGGAAATTTGACCACAA ACAGGATGCAAGGTGAGGATGGGTCTAGCTCTAACAAGATGCAAACCATTAAACAATTAT CTGCTCTCGTAGTGGATGATGAGCCTCTCATTCGAAAGCTCCACCAGAGAATTTTGATGT CATTTAGGAATGTGAATATCACAACCCAAGAAGCTGCCGATGGACTAGCAGCTGTCTATC TTTTCGATTCTAGAGACAAGTTTGATATTGTGCTTATGGATAGAGATATGACTGTCATGA ATGGAATTCAGGTATATGGTTAAGAGTTTTTCAATTGATTTTAACGTTGTTTGACGCAAT TAAATTCCAATTTAATTTGTTTGTTTTTTAACAAATTGATTATTGCAGGAATCTAACTAC AAAGAAATTATTCCTAACGATATTTATATTGATTTTATATATCCGAGCTACAACTCACAA TACTTTTAAAATTCTTTTATAATATAGTTTTTAGATAAAAATATGTTAAAATTACATTTA CAATACATAATAATGTGTACTTCTACGACAGCTGTTCTTGAGTATTCAAAATTAAAAATT TTACATCATTACACATACGTGTACGTAGTAGTGTGTGCATTCGATAGTAGATTATTAAAT TCCTCGATCATGATATCATTTTGTATAATTAAATTTTACTATACTAATATATCAATCATA TATATTTTCATATTATACAGGCAACAAAAAAATTGCGAGCCATGGGTGTGTTATCCAAGA 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