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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI023219 | Chr10 | 15495100 | 15498320 | + | Transcription factor SRM1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI023219.m1 | 40 | 86 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 28.2 | 1.70E-06 |
LITCHI023219.m1 | 164 | 209 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 40.9 | 1.90E-10 |
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>LITCHI023219.m1 ATGCCCATTTTCACACTAGACCAACATTGCATAATAAACCCCACTCAAAATAAAAAACAT TTGCAGAACCCCAGAAGGCAGAAGAAAACTATGTCCAGTACTGCTGCAACTTCAGTGACT TGGACCAGAGAAGAAGACAAAGCTTTTGAAAATGCCATAGCTATGCATTGGACTGAAGAA GACACAAATGAGCAATGGCAAAAGATTGCTTCGATGGTTCCTAGTAAAACTGTTGAACAA ATGAAGCAACACCACCAATTGTTGCTGGAGGATGTGCAGGCAATAGAGGCTGGAAATATA CCAATCCCAAAGTATGTAGGAGAGGAAGCTGCTGCAACTTCTCCTTCAACCAAGGATGTC CATGACCTTAATGGGAGATCAAATGGTAGTTATGGAAGTGGGTTCTCAGGGTTGAGTCAT CATGAGTCCAGTGGACATGGAGGTAAAGGAAGCAGCTCCAGGTCAGACCAAGAAAGAAGA AAAGGCATTCCATGGACAGAAGAAGAACATAGGTTATTTCTACTGGGTCTGGATAAATTT GGCAAAGGGGATTGGAGGAGCATATCAAGGAACTTTGTGATATCAAGAACTCCAACACAA GTAGCTAGCCATGCACAAAAGTACTTCATTAGGTTAAACTCAATGAACAGAGACAGGAGG AGGTCTAGCATTCATGATATCACAAGTATTAATAATGGGGAAATGTCCTCTCATCAACCA CCAATTACTGGTCAACAGGCTAATGCAAACAACACAGGTGGCAGTGGGGGCAGTGGCAGT GGAGTGAAGCACAGGGCAGCTCAGCCAGCAGCTATGGCTCCTGGTATAGGCATGTATGGT GCAACTGTTGGTCACCCAATTGTGGCCCCACCTCATATTGGTTCTGCTGTTGGTACTCCT GTCATGCTTCCTCCTCCTCATCCTTCCTATGTTCTCCCAGTTGCCTACCCCATGGCACCG CCTCCCACAATGCACCAATAG
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>LITCHI023219.m1 + Up_Stream_Len 2000 AATGTTTCCCTAATCAATACTTTTTGGAAAAAAAAAAAAAAATCTAATATTAAATGGATC GAATGTATATCGAAATCTACCAAAATCATTAGTAGTTTACACCATTTAGATATCTACTCT CATACAATAAGGAGAGTTACTACCCACACAAAATTTATAAATTACTTTTGATAGTACTTG AATATTTAGAAAAATGGATGTGAAGATACACAATTATTAATGCTTAAAGGATATGCACAT TAAGTTGGCAGAATTTTATCTTTATTACATTTACACTTCTTTTTAAGTAATTCAAATCTA GGTTATTATTAACTCTTATTATTATATTTGTATTGTTAATCCTCAATGCTTATATCAAAT GAATTTACCGATCATCATTAATGCTTTCCTCAAAATATTTGTTAGTAGAAAAACGGCTCG GTTAGGTGATAAGACCAAAACCCACTCTCTTTTTAGTTTAAGGCTATAGGTTTAATCTTA TAAAGTCTTATTATTTGTGAGTAATTTTTTTTATTTGATATAGATTGTTCTTTTTTACTT TTTGAAAGAAGATTCCTGGATCGTATCTTAAAGTTATATCTCAATTGATCTTATTAGCAT TTAGAAGGAGATTCTTAGACTGTGCCTCAAAATCATATCTTAATTAGACCTGATAATACC ATGTATAAGGTAACCGTAATGTATATATTTGTTATCCAATATTTAATGTAGGAAACAGTC AATTATAAATTTTAAGGGAACCTCTGCCCTTGCGAGTGAAAAATAGGAAGGAAAAGGGGC GTGAGGTAGACTAAAAATAAGAGAGTAAAGAGAGTGGGCATGTGACAAAGGTGGTTTGAA AGATTCTCTCTGGGCCTCCGTTCTTTCTTTCTTCCACACTTGCATTGATTGCAATTGTTG TTCTACTCTTCTAGAAAACACAAGTACGACTGCTAACAAATTTCAGAAACTATTATTTTA AAATTTGTAAAAGCGGATCATACTGAGCTCATTCATATCCTTTGAAATAGCTTAGTACAT GTTTACTAACCAAAAATAAAAATGAAAGATAATTCAATTTCATTATATAAAGGAAATCGA GAAAGAAAGTTTAATTCCTTATGTGGGAGGAGAAAAGCAAGTTTCCTTTTCAGCATAAAC CATTGTTGATTTCCAATAATTGTTTTTTTTTTTAAATATAAAAATCATAAATCAATAATT AAATTTTCTTTCATTTGCTAGGATGTCTTTTAATAAATTATAAATGTATGGCCCTACAAT TATAGTCTTTGTTCATTAGCAAACTCTAAGACAAAAGTTTAAAAAATATATATATGACAA TTTTAGATTTTTCCATTTTAGCTCTCAACTTGGCAATGAGTTGTTTGACAGATGGATGTA TACATTGAAAATGATTTATGTCACTCGTTGTTCGCCATATAAATTAGATTGTTACATTAT AAATTGGTGTGTAAATAAAAATAAGAATTGAGATATTTACTACCAAAAATTTCAAAAAAT AATCTAAGTATTTTTGTTAATGAAAATTTAATGGTAACTAAAAGACTCAAATATCTCTAT GTATGAATATTGTAAATATGATGCTTACAAGTAGAGTGGTACAGTGACTTAACACTCATT TATCTAGCTTTCTAAAATAAACAGAGAGGAAATATTCAAGCATCATAGTTCACAAAGTGT GAGTAATTTTCTCATTTAATATGAAGATTTCTCCCATCTTCTAAGAGTAGCATTTTAGGC TACATTAGAATCTTATATCAATTAGATTTCGATAATTGTATGAAGGAAAAAGAAAAAAGA AAATTGATTGTAAATATGATGTGAAAATGACATATTACCCATCTCCTTCCAAAACACAAA GTGGTCCTTTCAATTGATAGTTTGATACCCACCGCACCGCTTATCCTACACTCATCTCAT GAAGTCACACCCGTTATCCTACGCACCCCCTCAAGGCGCACAAAGCCCCACATAACAGAA TTCAGAGACTGAACGCATTC
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>LITCHI023219.m1 GenomeSequence + CCCATCTCCTTCCAAAACACAAAGTGGTCCTTTCAATTGATAGTTTGATACCCACCGCAC CGCTTATCCTACACTCATCTCATGAAGTCACACCCGTTATCCTACGCACCCCCTCAAGGC GCACAAAGCCCCACATAACAGAATTCAGAGACTGAACGCATTCATGCCCATTTTCACACT AGACCAACATTGCATAATAAACCCCACTCAAAATAAAAAACATTTGCAGAACCCCAGAAG GCAGAAGAAAACTATGTCCAGTACTGCTGCAACTTCAGTGACTTGGACCAGAGAAGAAGA CAAAGCTTTTGAAAATGCCATAGCTATGCATTGGACTGAAGAAGACACAAATGAGCAATG GCAAAAGATTGCTTCGATGGTTCCTAGTAAAACTGTTGAACAAATGAAGCAACACCACCA ATTGTTGCTGGAGGATGTGCAGGCAATAGAGGCTGGAAATATACCAATCCCAAAGTATGT AGGAGAGGAAGCTGCTGCAACTTCTCCTTCAACCAAGGATGTCCATGACCTTAATGGGAG ATCAAATGGTAGTTATGGAAGTGGGTTCTCAGGGTTGAGTCATCATGAGTCCAGTGGACA TGGAGGTAAAGGAAGCAGCTCCAGGTCAGACCAAGAAAGAAGAAAAGGCATTCCATGGAC AGAAGAAGAACATAGGTACAGTTTTTATTCATTTTATGAACTGACACTGGCTTTATGTGG TATCTACTATATATGCTTGGAATAGGTAGGTTTCTGTTACTAAACTATACCAAAGTACAA AAATTTGAAGCTCTAAATTAATGCTCATGTTTGGTTATATTCGTTGCTCTGGCAAATAAA AGTTGATTCAGAACATATATGCATTATTGGAAGTAGAACTCATGCCAATTGGAATAATAC TATTCTGTGTGCTTGCTTTCAAGAGAATTGTTAATTTATGTTGTGAGTGCAACAGTCATT ATTGGCTGGCTTGTGGCAAGTATGTTGATAATGTAATATTTAACCATATAAGGGTTCTCT AGCTTAACATGTGTGTCGGACATGCTAAGTAAATTATATAACACTTGATTTTAAATACAA ATAAGATCAAGTTTTACTAACTTTGTATCTTGAATTTGATTAAATAGACACAAAATTAAT TTAACGTGTAATCTAAAAGAATATGTTAAAATGATTCACGGTAAAGTGGTATCACCATTG AATATTCTAATTGTGTAAACTAATATGATAATCGATGTTGTAAACTATTAACAGTAAGAT ATATCAAGTGCAAAATAGCAATGCGTTAGAAATGCTATATCTGTGATGATTTCAGCCTAC TCATTTTTTTTTCCTTTTTGCAGGTTATTTCTACTGGGTCTGGATAAATTTGGCAAAGGG GATTGGAGGAGCATATCAAGGAACTTTGTGATATCAAGAACTCCAACACAAGTAGCTAGC CATGCACAAAAGTACTTCATTAGGTTAAACTCAATGAACAGAGACAGGAGGAGGTCTAGC ATTCATGATATCACAAGTATTAATAATGGGGAAATGTCCTCTCATCAACCACCAATTACT GGTCAACAGGCTAATGCAAACAACACAGGTGGCAGTGGGGGCAGTGGCAGTGGAGTGAAG CACAGGGCAGCTCAGCCAGCAGCTATGGCTCCTGGTATAGGCATGTATGGTGCAACTGTT GGTCACCCAATTGTGGCCCCACCTCATATTGGTTCTGCTGTTGGTACTCCTGTCATGCTT CCTCCTCCTCATCCTTCCTATGTTCTCCCAGTTGCCTACCCCATGGCACCGCCTCCCACA ATGCACCAATAGCTTTCTCTTTCTCCTGTAAATTATTATGAATATGATGCACCTTTCCCT TATTTGAGTGAGTTTTGTGACCATTATCTTTCATGTATGGTCATGAATCATCATCTATTT CTTTAAAAAATATATGTATCAATACTAAGCTTTGTCGTTATCAAGATACAAGTTCAAACA AGTGTATACATAGGTTTGAAGAGAAACTGGGTGGTGAAAATATTGTACAGAAGATTCATT TGAAATGCTAAACTTTGTAACATTCAAATAATTGTACTTTAAACATTACCAGCTCTTCAA CTTTATTTGATATGTACTCATTAAATGCATTTATGCTGGATATCCACATCACAGAATCTG AAACATGAAAGCAAACCCTCCTCTGCCCCTGAGGCGCCAACATGTATTTCTTCCACAATT TAATGAAACTCCTTTTCATTTAGGTTCTTTTTATAATTTCACATCACATTTTAATTGTTA TACATTTTCTTTTGTTTTTTTAATGCTTTTTTTTTTTATTATAAACCAAATGCCACCTAA AAGATTCTGGTATACATCAACATTACTCAATTGAGAAAGACCGAGCTATGATAGCAGGAG CTCATTAACATGAAGGGGTCCCTTCAAAGTGTGAGCAGCAAAATGAGGATTCCGAACCTT TTTCCTCGTAGGCAACATTAGAAAATATAAACGATCAAAGCATCTGCTCCCTAAGACATA ATATGAAAAGCCTAACCGACTTACAAAATGCACAAAATTACAGCATAAATGGAATGCTGC CTGATGATCACTTAACATCCCTTCGGTTTTAGACGAAGATGGCCTTTAAGAATATAATAC AGCAACCTTTTCCTTCCCCACTTCCACCATATCGGTGCATCAGCCCGCCGTACCTTCTTA ATTTGTTTTTCTGCAAGGCAGGGTGATAAATATGAGGGAGCATTTATGTAGTATGTTGGA AATACATGTCATTCCTGCCCTGACAGAGACTCTAAATACTACAAGGAAAATACAAACAAA ACCATGTCTTTCACTCCTATTTATATCAAGACTGCCCACCCTCTGTACAACTATGTATTT CCTAAAATTTGCAGGTACTAACAGAAAATTAACAGGACTTGAACAATCAAATATTTAAAC CGAGAGAGAGGCTGGCAAACAACAGGAAACAGACATAATTTTATTGCGAACAGAGCAAAT ACAAGAATATCCTATAAGAAAACAGAGGTGATAGTAACAAATTGCTCACTTTTGTATTCA GAAATGTATATTTCCCACTGGGACTGCAATTTTGTATAATGGGATTCTAAAGAAGGCCAG TACTTTGTCTGAATCTTCAACACTTCAAGAACAGTTTGGAGACCAGCTCTAGAAGGAACA CAGTGGTCCAACTCGCATCCAGGATTTTCACCCAGCAGAAC