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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI023190 | Chr10 | 14956702 | 14958949 | + | Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 16 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI023190.m1 | 17 | 59 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 31.8 | 1.30E-07 |
LITCHI023190.m1 | 384 | 426 | PF06203.17 | CCT | Motif | 63.9 | 1.20E-17 |
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>LITCHI023190.m1 ATGATCACTGAAATGAAAGCAGCGAATGCTATGGGAGGCAAGACGGCAAGAGCCTGCGAT GGCTGTTTGCGGAAGCGGGCACGCTGGTATTGCGTGGCGGATGATGCTTTTCTTTGCCAA GCTTGTGATTCATCGGTCCACTCGGCCAATCAGCTTGCAAGCCGCCACGAGAGGGTTCGG CTTGAAACTGCCTCATCTAAGGCGTTGAATGGTCCTCTAAACAATGTTAAAGATGGAGTT CCAGTATGGCACCAAGGGTTCACCCGAAAAGCCCGGACGCCAAGACCAAACAAGGCCATG TTGGCTCATCAACAAGAACAGGATCATCAGGAGAAAGTTTTCAATTCCAATGATCCTCTT GTTCCCGAGCTTGGCAGTGAAGAAGGGTCACTAGATCATGATGAGAACGTAGAGGAAAGC CTGCTTTGTCAGGTGCCTGTTTTCGATCCGTTCCAAGTAGAAATTAGCTGTGATATGATA GCAAGTGAAGAAATTGGGATGGTAAACAAAGAGGAAAATATAGTTGTTGATGATCATGGT TATGGACAAGAAGGAACGTGTGATTTGGATGATTTACATAGGTTCTTGCCTTCAGATATG GATCTTGCTGAGTTTGCTGCTGATGTTGAGAGCTTATTGGGAGGTGGTATTGGCCTTGAT GAAGATTCCAGCGATATCAAAGGATTGGATTTTTCAGATTGTAAAGAGGAAAACGATACT AGTGTTTGTTTTGGAGACACAACAGTGAAGATTAAGGATGAAGATGATCATCATCAGGAG GGTGTTACAGGTAATTTCCATTTAGATCCATCTTATAGCATGACAAAAGAGGCAATAGAT TGGAGTCTTGATTATGACGACTCGCCGCTGGTTGGACAAGACGAGGATGAGAAAGTGGTT CCTCTTGTTGACACAGCCATGGCTACTAGTACTACGTCTCAATGTAAGGTGGAGAGAACC GTATCTTTGAGACTAAATTATGAGGCTGTTATCAATGCTTGGTCAAGCCAAGGCTGTCCA TGGACAACCGGAAGTCGCCCTGAATTTAATCCCGATGACTGCTGGCCTAACTGCTCGGGT GCATGCCCTAAACATGTTCATCACCCTTATGGAAGAGTAGGGTGTCAGGTGGGGGGTGGA GACGGCGGCAGAGAAGCACGAGTATCGAGGTACAGAGAGAAGCGAAGAACTCGACTGTTT TCGAAGAAGATAAGATATGAAGTGCGGAAACTGAACGCGGAGAAGAGGCCTAGAATGAAA GGCCGGTTCGTTAAGAGGACTTCATTTGTGGGGACTGCAGCTTTTCCATACCTGAACCAG TGA
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>LITCHI023190.m1 + Up_Stream_Len 2000 CTTGTCAATGACCTTCATAGCCATTAGTTTCTTGCCATTCTCCACACGCAAGAGCAAAGG ATTGGGCTTTGGGATTCACGCTCACCTTATCGGAATTCAACCGATGGAACTCGACCAAAC CAAGTCCTTCAAATGGTATATATGATTTCGAATATTATTTCAACAAGCTCACACATGCTA TTTTTGCAGCTAAAGTCTAACATTATTCTATTCGAAGTAATTGGATTGCATGTATAAATG ATGTTTCTATTCTTGATAACAGCTCTTTGCTCTTGATATTGCATTACACGATGACATCTC GATTTTTCAAGCCACCATCATTCTTCTTTGCTTACAATATAGTGTCACTTGTCATATGGC AATCGAGTCAAGTCAAAAGAAAATTGATGCTGTAGCTTGAGGTGTATAATATAAGAATTA GTACACCCGTCGTTTTAATTTACTTCTAGTTACTCCTTGTGATTGGTCGTATATATGCAA GCATCAGCATTTTTGTTGACCTTTTCCGATAGTAATAATATCCGTTCATGTTATGACCAT GTGCCATAACTTCTCACAGTATGACAGTACACATTCCATTTTCAATTAATATGATAATAC TGTAGTGTTACAAAATCTTTATGAGTTTGAATGCAGATTAGCTAATTCTGTAAATACTTT CTATAGTCTCCTAAACAGAAAATGGCAGCTCCATGGAACGAAAAGGAAATTGAGATCAGA ATTGATGGCACAAATTTGAGTCACCAACATTCTAATTATAACCAGAAGTGTTTTTGTGAT GGATTCCAGTAAAAACAAATATTATGTACTACTATTTTGCCGCTGAAATTTATTGAATTT TTTATCCTTTTTTTATCAACATGGAAGTTTCTCCCAACCTGATCGCTGCTTATATTATGT CATTATTCTTGAAAATATTTAATTTGAAAATTATACAAAATGTATATATTTGGTGGTTAG CACTGATTCGAAGGAAGCAGTGGTTCTTATTGCTTATAAAAAGCTAGTGGAATGTTTGCT AAGCTGATTTGAAAGGCTTAGATTTACTTGAAACCTGAAAACGGTTAACAAAACCTGTCT ACGTTTTCTACAGGAAAATAACAAGTCAAGCAGAAGCTATATATGATACTGATAGTTCAT TTTCCACCCTGAACCAATAGAGGAAGATGCTGTTCGGACTAGAACATAGAAAATGGTTCC ACTAAAGTTATTTTTATATCCATTTTTTTATGTCCATTCAATACAATTCTATTATATATA TAATTAAATTTTAAAACAACATTATAATTGATAATTTTTTTATAAGATTATGATTTTGTT GGACAGACCTAGTATGTCAATATATAACATTAAAGCATTTCTGAGTGAGTGAGAGAGATG GAGGCAACCACAAAGGGAATTGAAAACAACCCTAGGGGACCGCAAACAACAGCTTTTAAA GTTGCAACAGGAATAATTGATATAGAGAGACAAAACAACAAAAAGGGTCTTACTCGAAAT TTTTGTCAGTCACTAATATGCCAATTTCCGGTTGGGCCCCACGAGGAATCCTTAATGAAG ACAGGTAGCCAATAAGAATTCAGGAATTAGGATGGATTCCAAAATTTTAGCCAATCAACA CCGAGATGAGACGAATTCATGGGTCCCATAAAAGCCATACAAAATTTTGGTAGCAAACCA CCGGAAGTGTGCATGGGACCAGTAGTGCTATGTTTGTGTTCAAAAGACACAATTAGGGCA CACCAACAAAACCCACCATAAATGTCATGGGGTCGTCATAAACACAGCGACGGGTTCTCA AGTCTCAACTTTCAATAATTGAACCACTAGTAGGTGTCCCAAGCTAAACACATCAAGCCA CCCCAATATACCTTCTAATAGGCAGTGTTACCCTTTTAGCTTCATTTCAATATTCACTAG AACTGCAACAACTTTTTTCTCTTTCCGTTTTGAGATTTGCTAAAAACCACAAAAAAAGTT TAATTAGTTTGTTTGTTTTG
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>LITCHI023190.m1 GenomeSequence + GGGGTCGTCATAAACACAGCGACGGGTTCTCAAGTCTCAACTTTCAATAATTGAACCACT AGTAGGTGTCCCAAGCTAAACACATCAAGCCACCCCAATATACCTTCTAATAGGCAGTGT TACCCTTTTAGCTTCATTTCAATATTCACTAGAACTGCAACAACTTTTTTCTCTTTCCGT TTTGAGATTTGCTAAAAACCACAAAAAAAGTTTAATTAGTTTGTTTGTTTTGATGATCAC TGAAATGAAAGCAGCGAATGCTATGGGAGGCAAGACGGCAAGAGCCTGCGATGGCTGTTT GCGGAAGCGGGCACGCTGGTATTGCGTGGCGGATGATGCTTTTCTTTGCCAAGCTTGTGA TTCATCGGTCCACTCGGCCAATCAGCTTGCAAGCCGCCACGAGAGGGTTCGGCTTGAAAC TGCCTCATCTAAGGCGTTGAATGGTCCTCTAAACAATGTTAAAGATGGAGTTCCAGTATG GCACCAAGGGTTCACCCGAAAAGCCCGGACGCCAAGACCAAACAAGGCCATGTTGGCTCA TCAACAAGAACAGGATCATCAGGAGAAAGTTTTCAATTCCAATGATCCTCTTGTTCCCGA GCTTGGCAGTGAAGAAGGGTCACTAGATCATGATGAGAACGTAGAGGAAAGCCTGCTTTG TCAGGTGCCTGTTTTCGATCCGTTCCAAGTAGAAATTAGCTGTGATATGATAGCAAGTGA AGAAATTGGGATGGTAAACAAAGAGGAAAATATAGTTGTTGATGATCATGGTTATGGACA AGAAGGAACGTGTGATTTGGATGATTTACATAGGTTCTTGCCTTCAGATATGGATCTTGC TGAGTTTGCTGCTGATGTTGAGAGCTTATTGGGAGGTGGTATTGGCCTTGATGAAGATTC CAGCGATATCAAAGGATTGGATTTTTCAGATTGTAAAGAGGAAAACGATACTAGTGTTTG TTTTGGAGACACAACAGTGAAGATTAAGGATGAAGATGATCATCATCAGGAGGGTGTTAC AGGTAATTTCCATTTAGATCCATCTTATAGCATGACAAAAGAGGCAATAGATTGGAGTCT TGATTATGACGACTCGCCGCTGGTTGGACAAGACGAGGATGAGAAAGTGGTTCCTCTTGT TGACACAGCCATGGCTACTAGTACTACGTCTCAATGTAAGGTGGAGAGAACCGTATCTTT GAGACTAAATTATGAGGCTGTTATCAATGCTTGGTCAAGCCAAGGCTGTCCATGGACAAC CGGAAGTCGCCCTGAATTTAATCCCGATGACTGCTGGCCTAACTGCTCGGTATGTATCCT CTACTTATCTGAACTTTTATTTTAAAATTTAGTTAGATTTTTATAACCTCGGACTAATTA ATCCTATATGAAATTACTCAAAAGAAGTTAATTAATCACTATCTAACGATACTTTGTGTG CATTCAATATTCCAGGGTGCATGCCCTAAACATGTTCATCACCCTTATGGAAGAGTAGGG TGTCAGGTGGGGGGTGGAGACGGCGGCAGAGAAGCACGAGTATCGAGGTACAGAGAGAAG CGAAGAACTCGACTGTTTTCGAAGAAGATAAGATATGAAGTGCGGAAACTGAACGCGGAG AAGAGGCCTAGAATGAAAGGCCGGTTCGTTAAGAGGACTTCATTTGTGGGGACTGCAGCT TTTCCATACCTGAACCAGTGATGATTGACCATTAACAGCCAGACACGGCCAAATAAAGAG CTGCTGGTTAGGGCTACCTATATATTAATAGCTAATTTTACTATTAGAAGAAGCTATTGG ACATCTCTCTAACAGGATGATTAGTATAATAACTTCTTGACAATCGAAGCACCACGTCTG CGAGTTAATTGCTTCTCATGTTGTCAAGATAATTAATCGATTTCAGTGAATTTCTGATCT GAAATCTTTTGGTTCGTGCATGAAATCGTTGCCTATAAACAGGTTTTCGTGCTTGTATAT CTAACTCAGGTAGATTTGCTGGTTCGTGCTGCGTGCATGAAATTTCTGCTTGTTAACATG TTTATATATAGTTATTAATTGAATGTAAAATTTGTAAGTATTAATCGTATAGAAGAAGAG GAAAGCTATGGTGCCTTCTATATATTCATCCTTTTCTTGTCTTCCAAAAAATGAAGCATT CTTTTTGTAATTTTTTTGCTTCATCTAGCTCAATTGATCAACAAATGCACAAAGAGGATA TCTTTAATTGTTTTGCAATTAAATGGAG