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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI023042 | Chr10 | 12721141;12722002 | 12727012 | + | Protein TIFY 6B |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI023042.m1 | 205 | 236 | PF06200.17 | tify | Domain | 68.8 | 1.90E-19 |
LITCHI023042.m1 | 351 | 375 | PF09425.13 | Jas_motif | Motif | 50.8 | 1.10E-13 |
LITCHI023042.m2 | 205 | 236 | PF06200.17 | tify | Domain | 68.9 | 1.70E-19 |
LITCHI023042.m2 | 351 | 369 | PF09425.13 | Jas_motif | Motif | 40.5 | 2.00E-10 |
LITCHI023042.m3 | 205 | 236 | PF06200.17 | tify | Domain | 68.8 | 1.90E-19 |
LITCHI023042.m3 | 351 | 375 | PF09425.13 | Jas_motif | Motif | 50.8 | 1.10E-13 |
LITCHI023042.m4 | 175 | 206 | PF06200.17 | tify | Domain | 69.1 | 1.50E-19 |
LITCHI023042.m4 | 321 | 340 | PF09425.13 | Jas_motif | Motif | 38.7 | 6.90E-10 |
LITCHI023042.m5 | 205 | 236 | PF06200.17 | tify | Domain | 69 | 1.70E-19 |
LITCHI023042.m5 | 351 | 370 | PF09425.13 | Jas_motif | Motif | 38.6 | 7.60E-10 |
LITCHI023042.m6 | 175 | 206 | PF06200.17 | tify | Domain | 68.9 | 1.70E-19 |
LITCHI023042.m6 | 321 | 345 | PF09425.13 | Jas_motif | Motif | 51 | 1.00E-13 |
LITCHI023042.m7 | 189 | 220 | PF06200.17 | tify | Domain | 68.9 | 1.80E-19 |
LITCHI023042.m7 | 335 | 359 | PF09425.13 | Jas_motif | Motif | 50.9 | 1.10E-13 |
LITCHI023042.m8 | 175 | 206 | PF06200.17 | tify | Domain | 68.9 | 1.70E-19 |
LITCHI023042.m8 | 321 | 345 | PF09425.13 | Jas_motif | Motif | 51 | 1.00E-13 |
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>LITCHI023042.m1 ATGGAGAGAGATTTTCTCGGCTTAGGTTCCAAAGCCTCTCCGATTACTGTCAAAGAGGAG ACCTCTGATTCCTCCAAAGACTCAGCACCGATGAAGAGCTCAGTGATGCAATTGTCTTTT GGAAACAAGGTTTCGGCTATTCCTCAATTTCTGTCTTTCAAGGCTGCTCAAGAAGACAGG TCAAGAAAGCTTGTTCAGGATCCTCTAGTTTCGTCTGGGTTTATGTCTATGTCAACTGCT GATGCTTTTGATACCAGCCAGAAATCCTACTCTGGCATGATCCAGAAAAGTTCGAATCTC GATAAGCAAGGGGGAAACCACTATCCAATGACATCCTATACTCTGCAACACTTGGATGCA CACCAAGGTCATCGTCCCGAAGAAGCAAGGATGTTTCCAGTCTCCAACAAACCAAACCAA ACAATTATGGTGTCCATGAGTAATCCTCTTCTTCACTCCCAGCTTGGCTCCACTGGGCAG AATGTTATTGGTACTGCCATACACCCTCAACCTCTTGGAGGAGTTCCGGTCATATCTCCT CTTTCTGTCGTACCCTCTATAGGTTCTGTCATTGGTACTACTGATCTTAGGAATATTTCC AAACCTAATGGGGCACCTGCTCAGCTGACCATCTTCTATAATGGTTCTGTATGCGTTTAT GATGATGTGTCTCCTGAGAAGGCTCAGGCTATTATGTTATTGGCTGGGAATGGTTCCTCC GCAACTCAGAATAAGCCACTTCCCTCATCCATTCCCACGGCCATTCCCGCAGCCCAGATT CCTACATCAATCCATAGGCCATCTATAGGTGATGGTTATGTCAGGAACAATTCCCATACC ACATCACCATGCTCAGGCCTTTCAAGCCCCATTTCTGTGACATCCCATGTTGTTTCTCAA TCTGCTGTTGGACGTAGTTGCAGTAATGATTTAGCTAAAGTGAAACCTGCAGGAGCTTTG GCATCTTCTAATCCTCAAACGGAGCCTTCCAAAGCGATTGGCTCTGTAGGAGCTCCCGCT ACATCTCTGATTCCAGCAGTCGCTGCTGTGCCTCAAGCACGTAAAGCATCCTTGGCTCGC TTTTTGGAGAAGCGCAAAGAAAGGGTGATGACCACATCGCCGTACAATGTCAGCAAGAAA TCTCCAGACAGCAGCAGCACTGCTGAAGAAATAAGTTTTTCCATCAATTCTTCGGGCTCT TGTCTTCTTCCGGCTGTGAATTAG >LITCHI023042.m2 ATGGAGAGAGATTTTCTCGGCTTAGGTTCCAAAGCCTCTCCGATTACTGTCAAAGAGGAG ACCTCTGATTCCTCCAAAGACTCAGCACCGATGAAGAGCTCAGTGATGCAATTGTCTTTT GGAAACAAGGTTTCGGCTATTCCTCAATTTCTGTCTTTCAAGGCTGCTCAAGAAGACAGG TCAAGAAAGCTTGTTCAGGATCCTCTAGTTTCGTCTGGGTTTATGTCTATGTCAACTGCT GATGCTTTTGATACCAGCCAGAAATCCTACTCTGGCATGATCCAGAAAAGTTCGAATCTC GATAAGCAAGGGGGAAACCACTATCCAATGACATCCTATACTCTGCAACACTTGGATGCA CACCAAGGTCATCGTCCCGAAGAAGCAAGGATGTTTCCAGTCTCCAACAAACCAAACCAA ACAATTATGGTGTCCATGAGTAATCCTCTTCTTCACTCCCAGCTTGGCTCCACTGGGCAG AATGTTATTGGTACTGCCATACACCCTCAACCTCTTGGAGGAGTTCCGGTCATATCTCCT CTTTCTGTCGTACCCTCTATAGGTTCTGTCATTGGTACTACTGATCTTAGGAATATTTCC AAACCTAATGGGGCACCTGCTCAGCTGACCATCTTCTATAATGGTTCTGTATGCGTTTAT 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AATGTTATTGGTACTGCCATACACCCTCAACCTCTTGGAGGAGTTCCGGTCATATCTCCT CTTTCTGTCGTACCCTCTATAGGTTCTGTCATTGGTACTACTGATCTTAGGAATATTTCC AAACCTAATGGGGCACCTGCTCAGCTGACCATCTTCTATAATGGTTCTGTATGCGTTTAT GATGATGTGTCTCCTGAGAAGGCTCAGGCTATTATGTTATTGGCTGGGAATGGTTCCTCC GCAACTCAGAATAAGCCACTTCCCTCATCCATTCCCACGGCCATTCCCGCAGCCCAGATT CCTACATCAATCCATAGGCCATCTATAGGTGATGGTTATGTCAGGAACAATTCCCATACC ACATCACCATGCTCAGGCCTTTCAAGCCCCATTTCTGTGACATCCCATGTTGTTTCTCAA TCTGCTGTTGGACGTAGTTGCAGTAATGATTTAGCTAAAGTGAAACCTGCAGGAGCTTTG GCATCTTCTAATCCTCAAACGGAGCCTTCCAAAGCGATTGGCTCTGTAGGAGCTCCCGCT ACATCTCTGATTCCAGCAGTCGCTGCTGTGCCTCAAGCACGTAAAGCATCCTTGGCTCGC TTTTTGGAGAAGCGCAAAGAAAGGGTGATGACCACATCGCCGTACAATGTCAGCAAGAAA TCTCCAGACAGCAGCAGCACTGCTGAAGAAATAAGTTTTTCCATCAATTCTTCGGGCTCT TGTCTTCTTCCGGCTGTGAATTAG >LITCHI023042.m4 ATGAAGAGCTCAGTGATGCAATTGTCTTTTGGAAACAAGGTTTCGGCTATTCCTCAATTT CTGTCTTTCAAGGCTGCTCAAGAAGACAGGTCAAGAAAGCTTGTTCAGGATCCTCTAGTT TCGTCTGGGTTTATGTCTATGTCAACTGCTGATGCTTTTGATACCAGCCAGAAATCCTAC 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AATGGTTCCTCCGCAACTCAGAATAAGCCACTTCCCTCATCCATTCCCACGGCCATTCCC GCAGCCCAGATTCCTACATCAATCCATAGGCCATCTATAGGTGATGGTTATGTCAGGAAC AATTCCCATACCACATCACCATGCTCAGGCCTTTCAAGCCCCATTTCTGTGACATCCCAT GTTGTTTCTCAATCTGCTGTTGGACGTAGTTGCAGTAATGATTTAGCTAAAGTGAAACCT GCAGGAGCTTTGGCATCTTCTAATCCTCAAACGGAGCCTTCCAAAGCGATTGGCTCTGTA GGAGCTCCCGCTACATCTCTGATTCCAGCAGTCGCTGCTGTGCCTCAAGCACGTAAAGCA TCCTTGGCTCGCTTTTTGGAGAAGCGCAAAGAAAGGGTGATGACCACATCGCCGTACAAT GTCAGCAAGAAATCTCCAGACAGCAGCAGCACTGCTGAAGAAATAAGTTTTTCCATCAAT TCTTCGGGCTCTTGTCTTCTTCCGGCTGTGAATTAG >LITCHI023042.m8 ATGAAGAGCTCAGTGATGCAATTGTCTTTTGGAAACAAGGTTTCGGCTATTCCTCAATTT CTGTCTTTCAAGGCTGCTCAAGAAGACAGGTCAAGAAAGCTTGTTCAGGATCCTCTAGTT TCGTCTGGGTTTATGTCTATGTCAACTGCTGATGCTTTTGATACCAGCCAGAAATCCTAC TCTGGCATGATCCAGAAAAGTTCGAATCTCGATAAGCAAGGGGGAAACCACTATCCAATG ACATCCTATACTCTGCAACACTTGGATGCACACCAAGGTCATCGTCCCGAAGAAGCAAGG ATGTTTCCAGTCTCCAACAAACCAAACCAAACAATTATGGTGTCCATGAGTAATCCTCTT CTTCACTCCCAGCTTGGCTCCACTGGGCAGAATGTTATTGGTACTGCCATACACCCTCAA 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