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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI022932 | Chr10 | 11263129;11263557 | 11272095;11272256 | - | Agamous-like MADS-box protein AGL19 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI022932.m1 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93.2 | 5.10E-27 |
LITCHI022932.m1 | 86 | 172 | PF01486.20 | K-box | Family | 95.7 | 1.60E-27 |
LITCHI022932.m2 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93.2 | 5.10E-27 |
LITCHI022932.m2 | 86 | 172 | PF01486.20 | K-box | Family | 95.7 | 1.60E-27 |
LITCHI022932.m3 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93.2 | 5.10E-27 |
LITCHI022932.m3 | 86 | 172 | PF01486.20 | K-box | Family | 95.7 | 1.60E-27 |
LITCHI022932.m4 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93.2 | 5.10E-27 |
LITCHI022932.m4 | 86 | 172 | PF01486.20 | K-box | Family | 95.7 | 1.60E-27 |
LITCHI022932.m5 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 94.3 | 2.40E-27 |
LITCHI022932.m6 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 94.3 | 2.40E-27 |
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AGATAAGGAGAAAATACTACTTGAAGAAAACACAAAGTTGCGGGAGAAGTGTGGAATGCC CCCACGGAATCAATTGCTGGAGGAAGAAGAGGTTCATGTAGAAAATATGGATGTAGAAAC TGAATTGTTCATAGGGCCACCTGAGAGACGAAGTGCTTGACATGCAAATAGCTAACTGGA GACATTCATATCCTTCTACACAACTTGCATGAATTACAGGAACTGAGCCAACATAATTGA GCCAACTGCTATTATCTTAATTTCACGTATGAAGAGTGTATATTTTTAGAAGATTGTCTC AATATACGATGCCTGATAAAAATGCGGACAAGTCACTGCAAGCATTAGAAGCCATGGGAA ACATGTTGTCTTCATGGCTCTTACGATGGCAAATGAAGTGCTTAGACAGTTGCCGGGCTT TGTTCGATCAATTGTATTTCTCTGTTTGAATCAAGGATCTGCATTCCAACGAGAGTTGGT GTTATATGTCTTTGTCCTACAAATGTTACTTTTACATGAGAACATTTTGTCCGTAATTCA CCCTTAATCAATAATTTAAGGAAGGGTAACAATTGCAGATGTGTAGGGTATGCATCCCAC CAAGTGTATTAATTTCTTTATACAATAAACCATTCTAAACACCC >LITCHI022932.m1 CTAGGGTTATAGGCTGGAGAGACCGCTCTAGAAAACTAAAGTAAAAACAAAATAAGAGAG AAAATAGGACAATCAATATTCTTTAAATCTATATATGTTTTTAAATCTAGGGTTTGTGTG GTTTAAATTGTCGGGGAGGGCAGAACTAGCAAGTTTCGTAAATCAACTTTTTCATTATCT GCTTCATTTACTGAAGCTTTGGAACTGTTTTCTCAGTCTTTTCCCAATTCGTTACATTTT CGGTTATTCCTGTTTCTATTTTTGGAAACCTTCTCTTTGTTTGGTTATCACTGATTAGGA 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AATGAAGTGCTTAGACAGTTGCCGGGCTTTGTTCGATCAATTGTATTTCTCTGTTTGAAT CAAGGATCTGCATTCCAACGAGAGTTGGTGTTATATGTCTTTGTCCTACAAATGTTACTT TTACATGAGAACATTTTGTCCGTAATTCACCCTTAATCAATAATTTAAGGAAGGGTAACA ATTGCAGATGTGTAGGGTATGCATCCCACCAAGTGTATTAATTTCTTTATACAATAAACC ATTCTAAACACCC >LITCHI022932.m6 CTGATTTTCTTTTCTGAGGAGGTGACTGTTTTTTTCCTCTCAAGTTACCAAAAGAAGAAA GAGATAAGGAGCGAAAATGGTGAGGGGAAAAACTCAGATGAAGAGAATAGAAAATGCAAC CAGCAGGCAGGTGACCTTCTCAAAGCGAAGAAATGGACTCCTCAAAAAGGCTTTTGAGTT ATCAGTTCTTTGCGATGCTGAAGTTGCACTTATTATCTTCTCTCCGAGAGGCAAGCTTTA TGAGTTCTCTAGTTGCAGTATGAACAAGACTATAGAACGCTATCAGAGGAGAGCCAAAGA CAATGGAATCGGCCACAAAACACTCGTAGAAGAAGATATGCAGGAGAAAATACTACTTGA AGAAAACACAAAGTTGCGGGAGAAGTGTGGAATGCCCCCACGGAATCAATTGCTGGAGGA AGAAGAGGTTCATGTAGAAAATATGGATGTAGAAACTGAATTGTTCATAGGGCCACCTGA GAGACGAAGTGCTTGACATGCAAATAGCTAACTGGAGACATTCATATCCTTCTACACAAC TTGCATGAATTACAGGCTGGCTTTATTTTGCTTTTGATTTGGTGATTTTTATTTTGCTTC TTGTAATAATAGTAAAGCTCTAATAAATTTCACACATACATGCTATAATGG >LITCHI022932.m5 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>LITCHI022932.m4 CTGATTTTCTTTTCTGAGGAGGTGACTGTTTTTTTCCTCTCAAGTTACCAAAAGAAGAAA GAGATAAGGAGCGAAAATGGTGAGGGGAAAAACTCAGATGAAGAGAATAGAAAATGCAAC CAGCAGGCAGGTGACCTTCTCAAAGCGAAGAAATGGACTCCTCAAAAAGGCTTTTGAGTT ATCAGTTCTTTGCGATGCTGAAGTTGCACTTATTATCTTCTCTCCGAGAGGCAAGCTTTA TGAGTTCTCTAGTTGCAGTATGAACAAGACTATAGAACGCTATCAGAGGAGAGCCAAAGA CAATGGAATCGGCCACAAAACACTCGTAGAAGAAGATATGCAGCATGTGAAGGAAGAAAG TTTTACCATGTCAAAGAAGATTGAGCTTCTTGAAGTTACCAAAAGAAAACTCCTAGGAGA GGGACTGGAACCATGTTCAATAGACGAGCTACAACAGTTAGAGAACCAGTTGGATCGAAG CTTAAGCCGAATTAGGGCAAGAAAGAACCAACTGTTCAGGGAGCAGATTGAGAAACTAAA AGATAAGGAGAAAATACTACTTGAAGAAAACACAAAGTTGCGGGAGAAGTGTGGAATGCC CCCACGGAATCAATTGCTGGAGGAAGAAGAGGTTCATGTAGAAAATATGGATGTAGAAAC TGAATTGTTCATAGGGCCACCTGAGAGACGAAGTGCTTGACATGCAAATAGCTAACTGGA GACATTCATATCCTTCTACACAACTTGCATGAATTACAGGCTGGCTTTATTTTGCTTTTG ATTTGGTGATTTTTATTTTGCTTCTTGTAATAATAGTAAAGCTCTAATAAATTTCACACA TACATGCTATAATGGCAGGAACTGAGCCAACATAATTGAGCCAACTGCTATTATCTTAAT TTCACGTATGAAGAGTGTATATTTTTAGAAGATTGTCTCAATATACGATGCCTGATAAAA 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