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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI022605Chr1073703017380988+Ribonuclease J

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI022605.m198241PF00753.30Lactamase_BDomain33.73.90E-08
LITCHI022605.m1107243PF12706.10Lactamase_B_2Domain41.61.10E-10
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LITCHI022605.m298241PF00753.30Lactamase_BDomain33.64.00E-08
LITCHI022605.m2107243PF12706.10Lactamase_B_2Domain41.61.00E-10
LITCHI022605.m2437482PF07521.15RMMBLMotif27.62.40E-06
LITCHI022605.m2788856PF13837.9Myb_DNA-bind_4Domain48.21.20E-12
LITCHI022605.m398241PF00753.30Lactamase_BDomain34.22.60E-08
LITCHI022605.m3107243PF12706.10Lactamase_B_2Domain427.70E-11
LITCHI022605.m3437482PF07521.15RMMBLMotif27.92.00E-06
LITCHI022605.m4260305PF07521.15RMMBLMotif27.91.90E-06
LITCHI022605.m4611695PF13837.9Myb_DNA-bind_4Domain65.93.40E-18
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>LITCHI022605.m1
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TTCTTCTGCAAACCAATCCACAGAAAGCATTACATTTCCTGCTCCACTCCCTCTCCTACC
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>LITCHI022605.m2
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AAAATTGAAGCAATTGTCATAACTCATGGCCATGAAGATCACATCGGTGCGTTGCCCTGG
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GCAGCTGCTGATTTAACTGGTAGAAAGTTGGTATTTGTTGGCATGTCCTTAAGGACATAT
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GAAGATATTGATGCCTATGCTCCAAAAGATTTGCTAATAGTTACAACTGGTTCACAAGCA
GAACCACGTGCTGCCCTCAATCTTGCTTCATATGGAGGTAGTCATTCCCTCAAACTTACC
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CTGCAGTTGATGTATAGTGATGGTGATAAAGCATTTGGCACATCAACTGAACTATGCGTT
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CCTCAAAATATAGATGGTCTAAATGGAACTAGCTTAAAAGGGAAGATAAGAATCACTACA
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CAGTTGAACCAAATGGAAGCAGAAGGAAGTGGCTATCAACAGAATTTGGAAGTTGGTGGG
ATTCAAGCTGAAGAACTACTACCAGAGGAAGATTCAAGTTCCAACTTTGGTGAAGGGCCT
TCTCTTGATTCTGAGGATTCAGATGATTTCTGGAAAACATTCATCTCATCATCTTCACCC
ATTGACAATTCAGTAAGTAAAAAGGAGAATTTGGCCATGCAAGAGAAACACAGGTCAGAG
GTTGATAGTGAAGATAACAAAAGCAGTGAAGATGATTCCCCAGAGAAAAGTTCACAGCCA
AAGTCTTCCAAGACTCACAAACGAAACAAATGGAAACCTGAGGAGGTGAAGAAACTCATT
AAAATGCGCAGGGAATTGCATAGCAAATTTCAGGTAGTAAAGGGGAGAATGGCCCTATGG
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TCACTATGGACATCTTTGCTTCAAAAATATGAGGTTTGTTCTTCTGCTTTCAGTATAATA
CCAAACATTTGGTGGCACTTTGAATCTCGGTAA
>LITCHI022605.m3
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TTCTTCTGCAAACCAATCCACAGAAAGCATTACATTTCCTGCTCCACTCCCTCTCCTACC
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CTTGTTGGGAATTATGATCGCTATATTCTAATTGACGCTGGTGTCATGTTTCCAGACTAT
GATGAACTTGGAGTCCAAAAAATTATACCTGATACCACATTTATCAAAAAATGGAGCCAC
AAAATTGAAGCAATTGTCATAACTCATGGCCATGAAGATCACATCGGTGCGTTGCCCTGG
GTGATCCCAGCTTTGGATTCTCATACACCAATATTCGCGTCTTCATTTACAATGGAGCTT
ATCAAAAAACGCTTGAAGGAGAATGGGATTTTTGTTCCATCTAGACTTAAAGTATTTAAA
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GACTGGAAGATTGATGAATCACCATTGGATGGGAAAGTTTTTGACCGTGAAACGTTGGAG
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AAAGGAAGGGTTATAACTACTCAGTTTGCATCAAATATACATCGCCTTGGAAGTGTAAAA
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CTTGATGCTGCTTGGAAGGATGGAAAGGCGCCAATAGATCCATCAACTCTGGTCAAAGTA
GAAGATATTGATGCCTATGCTCCAAAAGATTTGCTAATAGTTACAACTGGTTCACAAGCA
GAACCACGTGCTGCCCTCAATCTTGCTTCATATGGAGGTAGTCATTCCCTCAAACTTACC
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GGAAAATCAACTGGCATTCGGCATACTACTGTTATAAAGAATGGAGAGATGCTTGGGGTT
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CTGCAGTTGATGTATAGTGATGGTGATAAAGCATTTGGCACATCAACTGAACTATGCGTT
GATGAGAGACTAAGAATTGCGTCAGATGGTATTATTGTGATAAGTATGGAAATTCTACGC
CCTCAAAATATAGATGGTCTAAATGGAACTAGCTTAAAAGGGAAGATAAGAATCACTACA
CGTTGTCTATGGCTTGACAAAGGGAAGCTTTTAGATGCTCTGCACAAGGCTGCACATGCT
ACACTTTCAAGCTGCCCTGTGAAATGTCCTTTGGCCCACATGGAAAAGACGGTCTCTGAG
GTTTTGAGAAAGATGGTGAGGAAGTACAGTGGTAAAAGGCCAGAAGTTATTGCTATTGCT
ACAGAAAACCCAGTTGGAGTTATCTCTGATGAGCTCAATGCAAAGCTGGCTGGCAATTCT
GATATTGGTTTTGGGATGCCAACACTTAGAAAAGTGGTAGATGCACATCCCAAAAGAAGT
CAGTTGAACCAAATGGAAGCAGAAGGAAGTGGCTATCAACAGAATTTGGAAGGTCCTCAT
CCCTCCTTTCTCTTTCCCTCTTGTCTCTGTTTGCATTTGTGTCAGACCACTTGTGCATAT
GATTTGTGCATTTAG
>LITCHI022605.m4
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GTATTTAAAACAAGGATGAAATTTACGGCTGGTCCATTTGAAATCGAGCCAATCAGGGTG
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CATACGGGGGACTGGAAGATTGATGAATCACCATTGGATGGGAAAGTTTTTGACCGTGAA
ACGTTGGAGCAACTCTCAAAAGAAGGAGTAACTTTGATGATGAGTGACTCAACAAATATA
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AGGACATATCTTGATGCTGCTTGGAAGGATGGAAAGGCGCCAATAGATCCATCAACTCTG
GTCAAAGTAGAAGATATTGATGCCTATGCTCCAAAAGATTTGCTAATAGTTACAACTGGT
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GAATTGCTTGGAAAATCAACTGGCATTCGGCATACTACTGTTATAAAGAATGGAGAGATG
CTTGGGGTTTCTCACTTGCGGAGTCGAAGAGTTCTTTCCAATGGTTTTATTTCTCTTGGG
AAGGAAAATCTGCAGTTGATGTATAGTGATGGTGATAAAGCATTTGGCACATCAACTGAA
CTATGCGTTGATGAGAGACTAAGAATTGCGTCAGATGGTATTATTGTGATAAGTATGGAA
ATTCTACGCCCTCAAAATATAGATGGTCTAAATGGAACTAGCTTAAAAGGGAAGATAAGA
ATCACTACACGTTGTCTATGGCTTGACAAAGGGAAGCTTTTAGATGCTCTGCACAAGGCT
GCACATGCTACACTTTCAAGCTGCCCTGTGAAATGTCCTTTGGCCCACATGGAAAAGACG
GTCTCTGAGGTTTTGAGAAAGATGGTGAGGAAGTACAGTGGTAAAAGGCCAGAAGTTATT
GCTATTGCTACAGAAAACCCAGTTGGAGTTATCTCTGATGAGCTCAATGCAAAGCTGGCT
GGCAATTCTGATATTGGTTTTGGGATGCCAACACTTAGAAAAGTGGTAGATGCACATCCC
AAAAGAAGTCAGTTGAACCAAATGGAAGCAGAAGGAAGTGGCTATCAACAGAATTTGGAA
GTTGGTGGGATTCAAGCTGAAGAACTACTACCAGAGGAAGATTCAAGTTCCAACTTTGGT
GAAGGGCCTTCTCTTGATTCTGAGGATTCAGATGATTTCTGGAAAACATTCATCTCATCA
TCTTCACCCATTGACAATTCAGTAAGTAAAAAGGAGAATTTGGCCATGCAAGAGAAACAC
AGGTCAGAGGTTGATAGTGAAGATAACAAAAGCAGTGAAGATGATTCCCCAGAGAAAAGT
TCACAGCCAAAGTCTTCCAAGACTCACAAACGAAACAAATGGAAACCTGAGGAGGTGAAG
AAACTCATTAAAATGCGCAGGGAATTGCATAGCAAATTTCAGGTAGTAAAGGGGAGAATG
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CAGTGCAAATCACTATGGACATCTTTGCTTCAAAAATATGAGGAAAGCAAGAGCGATAAG
AAAAGCCAAAAAAGTTGGCCATACTACGAGGACTTGGATAACCTTTTATCTGATTCTGAT
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>LITCHI017378.m1
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YNEKCDVYSFGIILNELITGDHPYIETNYGPTKIAVEVGEGTLRPALPEDDGRLKELIDL
IRLLWDGDASTRPSFSIITSALRELQKKL.
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>LITCHI017378.m1
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AATCCGCCCAAAGTGTCTTTAAAAATTACGTACACGACAATTACTAGGCCAATATATAAG
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TCTCGAAAATCATCACCGGCACCGGCAAAACAGGGGAAGAAGCCCACCGGCACGGCACGT
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GACCTTAAATTGGAAGTGGAGAAGCAAAAAGAACAGCGGATCGTGTATAGGAAGAGAATG
GAACGAACACAGGACTATCTAAGACATTGTCTTCAAATAGCACAAGACAATGGATTCTTG
GAGCTAATGATCAACAACAATGACAACCAACATCAATCTCTTCTTCCTTCCAATCTTAAT
AGCATCAATGCCAGTCCTCAATTGCCCATCCGTAGCCCCCTGCACCAAAATTTGGATTTA
TCACTTACAATCGATCAAGCCAAGATGAATGGTTGGTATATCAATCCAAGCGAGATAGTA
TTGCAAGAAAAAATAGGTCAAGGAAGTACAGCAGAAATCTACAGAGGGATTTGGAGAGGA
CTTGACGTTGCAGTGAAGTGCATAAACCCGGACTTTTTCCTTACAAATGAGAATGGTGTA
AGTTTCTTCGCTCAAGAGCTGGACACATTGTGTAGGCAGCGCCACCGTTTTGTGCTACAA
CTGATGGGTGCGTGTCTGGACCCTCCTGATAATGGTTGGGTGGTGAGTGAGTTCTTGAGC
ACGACCCTGAAGGAATGGCTGCATGGACCAGGCAACAGACGAAAAGAGAGGACAGTAGCT
CTCCCTCCGTTTCGAGAGAGGTTGACTAGGGCATTGGAGATTGCTCAAGCAATGCAGTAC
CTACATGAACAGAGGCCTAAGGTAATTCATCGTGACTTGAAGCCTAGCAACATCTTTTTG
GACGATGCCAACCATGTAAGAGTGGCGGATTTTGGTCATGCTCGCTTCTTGACTGATGAA
GAAATGGCACTCACTGGTGAAACAGGAACTTATGTGTACATGGCACCTGAGGTGATTCGT
TATGAGCCATATAATGAGAAATGTGACGTGTATAGTTTTGGTATTATATTGAATGAGCTC
ATTACTGGAGATCATCCATATATTGAGACAAACTACGGCCCAACCAAGATTGCGGTGGAA
GTTGGAGAAGGTACACTGAGGCCTGCCCTTCCGGAGGATGATGGACGACTGAAAGAGCTG
ATCGACCTGATTCGCCTTTTATGGGATGGAGATGCTTCCACTAGACCTTCTTTTTCAATT
ATAACCTCTGCTTTAAGAGAACTTCAGAAAAAACTCTAA
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>LITCHI017378.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TGAACCAATATTATATTGTTCATACGTGACAAGCATGCACAAAGTTGTTTTTTTTTTTTT
TAAAATGTCCCACTCAAAAGAATCTCTCGCTAGTCAAATTCTAACATGATCATATGATTA
AAAAATGGAGAATAACTAGCCTAAACTAATATTAGTTTAAGCGGCGGTGGATTCGTAACT
AATTTTGAAGATGTTGATGCAAATTATTCCAAGTATTTTAATGGGATTGCTTTATAGATT
ATAGTTTCAAGTGTTTCAAACTAATTAACAAAGTTTTGGTGGAAATATAACGACGTAGTT
TTGGATTAAAAATTGAAGTTAAGGGATCATTCTTCTGGTTTCAACCTTTCTTTATGTTAA
AGATTTCGTACAGTTGGTAAGGTGGGGAAGTTGCCAGCAATTATGAGAAGAATTATGTTT
ATATGGATGGTGAAGAGAGTTAAAGACCCGAACCTAACTGCCTAGCTTAGTCGTTGACCG
TCTCACCATTCTGACTTAATCATCATCACATGTTCTTTGATAAAAAACTGCAAAAATTTT
TTAGAACGTCATCCATTCTAATATTGTTTTTCATTCAAACACTTTTAATAGGAGATGATA
GAAAAATTTCATCGGTGATAATGTCACTCAAAACATTGACCTCTACCACATCATTCCAAA
CTAAATTTTACCCCATAACATTTTTCTAGCTATTGCATTAGTAGTTAAATATTCTTAATT
GGTTGTTTGTTTGTTTCAATCTTTCATGTTTTCATTTTTGTCGGCAAGTTTTATTTTCAC
AAACAATTTCAAATCAAATTGCTTAAATGATTGGAGAAAATATTGTATTTTGTGCTCACA
ACCACGTTTGCATGACATCAACTTTGCAAGGCTTCGACGTTTGTCATACCAAAGCTTACT
AACAAACAAACGAACAAAACGACACCAGCTTTTAAGAGGGGAAATTAATTATTGGCATTT
TTTGGGACTTTGCCACCAACCCAATGTAGCGTCAACTTATTTTCTTTAAACAGTTTTTGT
TTGAACAAGAATACGATCATCCTAATATAAATTTGTACAAACTCTCTGTTAGGTGTAACA
CTAAGGGAGGCTTTTCAATTTTAGCAAAGCCGCGTGAAAGTTGGCAATAGAAATAGAACA
GGCAGGCTTCAGAGAAAGATGGTCCACTTCTAGCTCATTTGATCATATCTGCTTTTGCTT
TGCTTGCTAGCTAGCTAGTAAAAGAGACAAAGGTGTATGCTCTTCGATCCCTAGGCGAGT
TTCCAATACGATCACTAGCAGCTTTTACTTTCTCCTACAAAGTACAAAGCAACAAGTGAA
GTTGATATTTGATCTACAACGCACAGAATCTTATATCAAAGCAAAAGAGAGCAAAAAAAA
AAAAGAGCAACTGATGTTTTTCCTACAATTTTTGGTGTCACCACAATACATAAATTGGTG
ACCAAAATCGACTGAATTATTCAACCACCGTCTTCATTCTAAGACGAGCCTAACTCTTTA
AAATTTGCTTTGCACACACTGATGTCATATGCTTATCATGCATGCATTCACGCTCCGATT
TATATTTTACTTACTGCCGAAAGGACCACTAACAGAATTGTGGTCCAATCCAACCCATTT
TTGTACCCATGTTTAGTAAATCCCGCCCAATTATCTGTTTCATGATTGCCGAACTCCACT
GTAAACGTTAAATTGTTGCATTGACAATATCACCAACCTCTTACATCAAACTGTGCTGAT
CACTTTTATAAATAATTAAAAGAATGTCATAATCCCATTCTAAGTTAAATTTAATCCATT
GTTACTCGTTAAATCCGCCCAAAGTGTCTTTAAAAATTACGTACACGACAATTACTAGGC
CAATATATAAGCAAACCGATATTAAACTAAGTGATTCCCTAGTTTAGAATTACCGGTCTT
GATCAGGCAATAAACGTCTC
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>LITCHI008933.m1 GenomeSequence + 
CTTTAACACACGAGCATGTAAAACAAATAATTGAATGACCAGTAATATCTTTAATGTTTC
ATTTAAAAAGCTAAATAGTGGCTACAGAGGTCAACAAATTCAAACCGTTGCATAGCCACG
TTAGTCTGCCACCTCGAGAACACTAAACTATTCTCGTTTCCTTTGTGTTTCAATTTCAAA
TTCCTTCTACTCGTTCTCTTCAAACTGCAACTCCTGGTTGCATTCATGATCATAATCATG
ATAGTGAATGTGATCTAAAACCATCAATCAAAGTATGGAAACTCAAACACTTATTGTTGT
TCAAGTCTTGCTTGCTGTCTTGTTCTTTCGTGTCTCTTTCTCTCTCAACCAAGATGGCAT
GGCTCTCCTAGCACTCAAAGCCGCCATTTCAACAGACCCAACTCGGTCGCTGGAGTCTTG
GTCGGAGTCTGACTCGACCCCGTGTCACTGGCCGGGCATTCACTGTATTAGAAATCGAGT
AAGCTCGCTTTACCTCCCAAACAAGAACCTCACTGGCTACATCCCCTCTGAACTTGGATT
CTTGAACTCACTCACTCGACTCGACCTCGCTCACAACAACTTCTCCAAACCCATACCTGC
CCACCTCTTCAACGCCACCAACCTTGTCTCGATAGACCTCTCACATAACTCACTCTCTGG
TCCGATACCGAACCAAATCAAAACACTCAACAACTTGACCCACTTGGATTTGTCTTCGAA
TCTCCTTAATGGGTCCTTGCCCGAGTTCCTTCTCGACCTCAGAGGCCTCACCGGAACTCT
GAACTTGTCGCTTAATCAGTTCTCCGGCCAGATTCCGGCAATGTACGGTCGTTTTCCGGT
GATGGTGAGCTTGGATCTGAGGTACAATAATCTCAGCGGAGAGATACCTCAAGTGGGGTC
ATTGTTGAACCAGGGACCCACTGCGTTCTCAGGAAACCCTAGGCTTTGTGGGTTCCCATT
GCAAAGTCCATGCCCGCAAGCTGGAAACCCCAGAGCTTTGGCAAACCCTGAAGAAGAAGA
AGAAGCTCCACAAAACCCTAAAAACCCTAGCTCTGACTTTGGTGGTGAACAACAGAGAGA
GAAATATGAGAGAAGTGGGTCAGTGGCAGTTTCTGTAATTTCAGGCGTTTCGGTGGTCGT
AGGTGCCGTTTCGGTGTCTGTTTGGCTATTCCGGAGAAAACGACGGTCTCGGGAGGGCAA
AATGAGACAAGAAAAAAAGGCAGACAATAATCACCACGATATCGTGGTCGTCGACGAGGA
GAAAGGGCAAAATGGTAAATTCGTAATCATGGACGAGGGGTTAAATTTGGAATTAGAGGA
TCTGTTGAGGGCATCTGCTTACGTGGTTGGGAAGAGCAGGAGTGGGATTGTGTACAAGGT
GGTCGCCGGGGGAGGATCCGGTGTGGCTCCGACCACGGTAGTCGCGGTTAGAAGATTGAG
TGATGGTGATGCCACGTGGCGATATAAGGACTTTGAATCTGAGGTGGAGGCCATCGGGCG
GGTCCAACACCCCAACATCGTGCGGTTGAGAGCTTACTATTACGCGCACGATGAGAAGTT
ATTGGTCACTGATTTCGTCCGCAACGGTAGCCTGTACAATGCATTGCATGGTAACTTTTT
TTAATTTTTCTTGGGTCCCCTATCTTACCATGTTAGTGGTTTTTATTATTAGAAGTTGAA
ATTGGATTAACTAAATCACATGATGAAATTATTATGGTGTCACGTAAATGGGTTTGTTAA
TTATGTTTAATGATTTTTTTTTTTTATGGGTCCCGTATTGGTGGTCACGGGTCTAGTGAA
CTCAACTCGTGTGAAGTTTTTGGTCATATAGCAAATCTCTTTTTATTTACTGTTTAGGGA
CAACAAATGTTTTATTAAACTGTTGCAGGTGAAAAGTAGGGACCAAACCAAATTGTCTGT
TATTGCAAAGTGAAATTGAGTTCTCTATTTCTCAAATTTTTATGTGTCATTTAATAAATG
GTTTTGAAAATGGTTTCCCAACAAAATAATGATATTTCCAAAGTTCACAATGTTTTTTTT
TTTTTTAATTTCTTTTAATGAAATAAATTTAGATGGAAATGGGTAAATTAGGAGTACAAC
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