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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI022605 | Chr10 | 7370301 | 7380988 | + | Ribonuclease J |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI022605.m1 | 98 | 241 | PF00753.30 | Lactamase_B | Domain | 33.7 | 3.90E-08 |
LITCHI022605.m1 | 107 | 243 | PF12706.10 | Lactamase_B_2 | Domain | 41.6 | 1.10E-10 |
LITCHI022605.m1 | 437 | 482 | PF07521.15 | RMMBL | Motif | 27.6 | 2.50E-06 |
LITCHI022605.m1 | 788 | 872 | PF13837.9 | Myb_DNA-bind_4 | Domain | 65.5 | 4.70E-18 |
LITCHI022605.m2 | 98 | 241 | PF00753.30 | Lactamase_B | Domain | 33.6 | 4.00E-08 |
LITCHI022605.m2 | 107 | 243 | PF12706.10 | Lactamase_B_2 | Domain | 41.6 | 1.00E-10 |
LITCHI022605.m2 | 437 | 482 | PF07521.15 | RMMBL | Motif | 27.6 | 2.40E-06 |
LITCHI022605.m2 | 788 | 856 | PF13837.9 | Myb_DNA-bind_4 | Domain | 48.2 | 1.20E-12 |
LITCHI022605.m3 | 98 | 241 | PF00753.30 | Lactamase_B | Domain | 34.2 | 2.60E-08 |
LITCHI022605.m3 | 107 | 243 | PF12706.10 | Lactamase_B_2 | Domain | 42 | 7.70E-11 |
LITCHI022605.m3 | 437 | 482 | PF07521.15 | RMMBL | Motif | 27.9 | 2.00E-06 |
LITCHI022605.m4 | 260 | 305 | PF07521.15 | RMMBL | Motif | 27.9 | 1.90E-06 |
LITCHI022605.m4 | 611 | 695 | PF13837.9 | Myb_DNA-bind_4 | Domain | 65.9 | 3.40E-18 |
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>LITCHI022605.m1 ATGCAGTTAGGTTTCTCATATCCACTAAAAATGGCTGCTCTCTCTCCCTCTCCCAACACT TTCTTCTGCAAACCAATCCACAGAAAGCATTACATTTCCTGCTCCACTCCCTCTCCTACC ACCATTGGAACAGGAGGAGCTAAAGTACCGCGTAAAAGGTCAAGAAGAACAGAAGGGCCA AGAAAAAGTATGGAAGATTCTGTTCAACGCAAGATGGAACAGTTTTATGAAGGTTTGAGT GGACCACCTTTGCGTGTGCTTCCGATAGGTGGTCTTGGTGAAATTGGGATGAATTGCATG CTTGTTGGGAATTATGATCGCTATATTCTAATTGACGCTGGTGTCATGTTTCCAGACTAT GATGAACTTGGAGTCCAAAAAATTATACCTGATACCACATTTATCAAAAAATGGAGCCAC AAAATTGAAGCAATTGTCATAACTCATGGCCATGAAGATCACATCGGTGCGTTGCCCTGG GTGATCCCAGCTTTGGATTCTCATACACCAATATTCGCGTCTTCATTTACAATGGAGCTT ATCAAAAAACGCTTGAAGGAGAATGGGATTTTTGTTCCATCTAGACTTAAAGTATTTAAA ACAAGGATGAAATTTACGGCTGGTCCATTTGAAATCGAGCCAATCAGGGTGACTCATTCT ATTCCTGATTGTTGTGGATTGATTCTCCGCTGCTCTGATGGCACAATTCTTCATACGGGG GACTGGAAGATTGATGAATCACCATTGGATGGGAAAGTTTTTGACCGTGAAACGTTGGAG CAACTCTCAAAAGAAGGAGTAACTTTGATGATGAGTGACTCAACAAATATACTGTCACCT GGAAGGACAATTAGTGAAAGCGTTGTAAAGGATGCATTAATAAAGCATATTTCAGCTGCT AAAGGAAGGGTTATAACTACTCAGTTTGCATCAAATATACATCGCCTTGGAAGTGTAAAA 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AGAAAAAGTATGGAAGATTCTGTTCAACGCAAGATGGAACAGTTTTATGAAGGTTTGAGT GGACCACCTTTGCGTGTGCTTCCGATAGGTGGTCTTGGTGAAATTGGGATGAATTGCATG CTTGTTGGGAATTATGATCGCTATATTCTAATTGACGCTGGTGTCATGTTTCCAGACTAT GATGAACTTGGAGTCCAAAAAATTATACCTGATACCACATTTATCAAAAAATGGAGCCAC AAAATTGAAGCAATTGTCATAACTCATGGCCATGAAGATCACATCGGTGCGTTGCCCTGG GTGATCCCAGCTTTGGATTCTCATACACCAATATTCGCGTCTTCATTTACAATGGAGCTT ATCAAAAAACGCTTGAAGGAGAATGGGATTTTTGTTCCATCTAGACTTAAAGTATTTAAA ACAAGGATGAAATTTACGGCTGGTCCATTTGAAATCGAGCCAATCAGGGTGACTCATTCT ATTCCTGATTGTTGTGGATTGATTCTCCGCTGCTCTGATGGCACAATTCTTCATACGGGG GACTGGAAGATTGATGAATCACCATTGGATGGGAAAGTTTTTGACCGTGAAACGTTGGAG CAACTCTCAAAAGAAGGAGTAACTTTGATGATGAGTGACTCAACAAATATACTGTCACCT GGAAGGACAATTAGTGAAAGCGTTGTAAAGGATGCATTAATAAAGCATATTTCAGCTGCT AAAGGAAGGGTTATAACTACTCAGTTTGCATCAAATATACATCGCCTTGGAAGTGTAAAA GCAGCTGCTGATTTAACTGGTAGAAAGTTGGTATTTGTTGGCATGTCCTTAAGGACATAT CTTGATGCTGCTTGGAAGGATGGAAAGGCGCCAATAGATCCATCAACTCTGGTCAAAGTA GAAGATATTGATGCCTATGCTCCAAAAGATTTGCTAATAGTTACAACTGGTTCACAAGCA 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AAAAGCCAAAAAAGTTGGCCATACTACGAGGACTTGGATAACCTTTTATCTGATTCTGAT ATGTTGGCGACAAAATGA
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>LITCHI017378.m1 ATAATTAAAAGAATGTCATAATCCCATTCTAAGTTAAATTTAATCCATTGTTACTCGTTA AATCCGCCCAAAGTGTCTTTAAAAATTACGTACACGACAATTACTAGGCCAATATATAAG CAAACCGATATTAAACTAAGTGATTCCCTAGTTTAGAATTACCGGTCTTGATCAGGCAAT AAACGTCTCATGATCGTTGCAGGAACTCCCCAACATAAAAAGGCCGCTCTATTTGGTGGG TCTCGAAAATCATCACCGGCACCGGCAAAACAGGGGAAGAAGCCCACCGGCACGGCACGT TCTCGAGGATGCTGTCGTGGAATTAATGATTGCATAAACATGGGGTCTATAGTTTCAACA AGCCAACAACAGCACCACCACCACCAGCTGTCTACATCCAAATTGGAGCAACAGGTGGAA GACCTTAAATTGGAAGTGGAGAAGCAAAAAGAACAGCGGATCGTGTATAGGAAGAGAATG GAACGAACACAGGACTATCTAAGACATTGTCTTCAAATAGCACAAGACAATGGATTCTTG GAGCTAATGATCAACAACAATGACAACCAACATCAATCTCTTCTTCCTTCCAATCTTAAT AGCATCAATGCCAGTCCTCAATTGCCCATCCGTAGCCCCCTGCACCAAAATTTGGATTTA TCACTTACAATCGATCAAGCCAAGATGAATGGTTGGTATATCAATCCAAGCGAGATAGTA TTGCAAGAAAAAATAGGTCAAGGAAGTACAGCAGAAATCTACAGAGGGATTTGGAGAGGA CTTGACGTTGCAGTGAAGTGCATAAACCCGGACTTTTTCCTTACAAATGAGAATGGTGTA AGTTTCTTCGCTCAAGAGCTGGACACATTGTGTAGGCAGCGCCACCGTTTTGTGCTACAA CTGATGGGTGCGTGTCTGGACCCTCCTGATAATGGTTGGGTGGTGAGTGAGTTCTTGAGC ACGACCCTGAAGGAATGGCTGCATGGACCAGGCAACAGACGAAAAGAGAGGACAGTAGCT CTCCCTCCGTTTCGAGAGAGGTTGACTAGGGCATTGGAGATTGCTCAAGCAATGCAGTAC CTACATGAACAGAGGCCTAAGGTAATTCATCGTGACTTGAAGCCTAGCAACATCTTTTTG GACGATGCCAACCATGTAAGAGTGGCGGATTTTGGTCATGCTCGCTTCTTGACTGATGAA GAAATGGCACTCACTGGTGAAACAGGAACTTATGTGTACATGGCACCTGAGGTGATTCGT TATGAGCCATATAATGAGAAATGTGACGTGTATAGTTTTGGTATTATATTGAATGAGCTC ATTACTGGAGATCATCCATATATTGAGACAAACTACGGCCCAACCAAGATTGCGGTGGAA GTTGGAGAAGGTACACTGAGGCCTGCCCTTCCGGAGGATGATGGACGACTGAAAGAGCTG ATCGACCTGATTCGCCTTTTATGGGATGGAGATGCTTCCACTAGACCTTCTTTTTCAATT ATAACCTCTGCTTTAAGAGAACTTCAGAAAAAACTCTAA
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>LITCHI017378.m1 + Up_Stream_Len 2000 TGAAGCATAAATTATATTATAATTAAAGGATATATTGTTAGTAGCTAGACCTAATAATTA TGAACCAATATTATATTGTTCATACGTGACAAGCATGCACAAAGTTGTTTTTTTTTTTTT TAAAATGTCCCACTCAAAAGAATCTCTCGCTAGTCAAATTCTAACATGATCATATGATTA AAAAATGGAGAATAACTAGCCTAAACTAATATTAGTTTAAGCGGCGGTGGATTCGTAACT AATTTTGAAGATGTTGATGCAAATTATTCCAAGTATTTTAATGGGATTGCTTTATAGATT ATAGTTTCAAGTGTTTCAAACTAATTAACAAAGTTTTGGTGGAAATATAACGACGTAGTT TTGGATTAAAAATTGAAGTTAAGGGATCATTCTTCTGGTTTCAACCTTTCTTTATGTTAA AGATTTCGTACAGTTGGTAAGGTGGGGAAGTTGCCAGCAATTATGAGAAGAATTATGTTT ATATGGATGGTGAAGAGAGTTAAAGACCCGAACCTAACTGCCTAGCTTAGTCGTTGACCG TCTCACCATTCTGACTTAATCATCATCACATGTTCTTTGATAAAAAACTGCAAAAATTTT TTAGAACGTCATCCATTCTAATATTGTTTTTCATTCAAACACTTTTAATAGGAGATGATA GAAAAATTTCATCGGTGATAATGTCACTCAAAACATTGACCTCTACCACATCATTCCAAA CTAAATTTTACCCCATAACATTTTTCTAGCTATTGCATTAGTAGTTAAATATTCTTAATT GGTTGTTTGTTTGTTTCAATCTTTCATGTTTTCATTTTTGTCGGCAAGTTTTATTTTCAC AAACAATTTCAAATCAAATTGCTTAAATGATTGGAGAAAATATTGTATTTTGTGCTCACA ACCACGTTTGCATGACATCAACTTTGCAAGGCTTCGACGTTTGTCATACCAAAGCTTACT AACAAACAAACGAACAAAACGACACCAGCTTTTAAGAGGGGAAATTAATTATTGGCATTT TTTGGGACTTTGCCACCAACCCAATGTAGCGTCAACTTATTTTCTTTAAACAGTTTTTGT TTGAACAAGAATACGATCATCCTAATATAAATTTGTACAAACTCTCTGTTAGGTGTAACA CTAAGGGAGGCTTTTCAATTTTAGCAAAGCCGCGTGAAAGTTGGCAATAGAAATAGAACA GGCAGGCTTCAGAGAAAGATGGTCCACTTCTAGCTCATTTGATCATATCTGCTTTTGCTT TGCTTGCTAGCTAGCTAGTAAAAGAGACAAAGGTGTATGCTCTTCGATCCCTAGGCGAGT TTCCAATACGATCACTAGCAGCTTTTACTTTCTCCTACAAAGTACAAAGCAACAAGTGAA GTTGATATTTGATCTACAACGCACAGAATCTTATATCAAAGCAAAAGAGAGCAAAAAAAA AAAAGAGCAACTGATGTTTTTCCTACAATTTTTGGTGTCACCACAATACATAAATTGGTG ACCAAAATCGACTGAATTATTCAACCACCGTCTTCATTCTAAGACGAGCCTAACTCTTTA AAATTTGCTTTGCACACACTGATGTCATATGCTTATCATGCATGCATTCACGCTCCGATT TATATTTTACTTACTGCCGAAAGGACCACTAACAGAATTGTGGTCCAATCCAACCCATTT TTGTACCCATGTTTAGTAAATCCCGCCCAATTATCTGTTTCATGATTGCCGAACTCCACT GTAAACGTTAAATTGTTGCATTGACAATATCACCAACCTCTTACATCAAACTGTGCTGAT CACTTTTATAAATAATTAAAAGAATGTCATAATCCCATTCTAAGTTAAATTTAATCCATT GTTACTCGTTAAATCCGCCCAAAGTGTCTTTAAAAATTACGTACACGACAATTACTAGGC CAATATATAAGCAAACCGATATTAAACTAAGTGATTCCCTAGTTTAGAATTACCGGTCTT GATCAGGCAATAAACGTCTC
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>LITCHI008933.m1 GenomeSequence + CTTTAACACACGAGCATGTAAAACAAATAATTGAATGACCAGTAATATCTTTAATGTTTC ATTTAAAAAGCTAAATAGTGGCTACAGAGGTCAACAAATTCAAACCGTTGCATAGCCACG TTAGTCTGCCACCTCGAGAACACTAAACTATTCTCGTTTCCTTTGTGTTTCAATTTCAAA TTCCTTCTACTCGTTCTCTTCAAACTGCAACTCCTGGTTGCATTCATGATCATAATCATG ATAGTGAATGTGATCTAAAACCATCAATCAAAGTATGGAAACTCAAACACTTATTGTTGT TCAAGTCTTGCTTGCTGTCTTGTTCTTTCGTGTCTCTTTCTCTCTCAACCAAGATGGCAT GGCTCTCCTAGCACTCAAAGCCGCCATTTCAACAGACCCAACTCGGTCGCTGGAGTCTTG GTCGGAGTCTGACTCGACCCCGTGTCACTGGCCGGGCATTCACTGTATTAGAAATCGAGT AAGCTCGCTTTACCTCCCAAACAAGAACCTCACTGGCTACATCCCCTCTGAACTTGGATT CTTGAACTCACTCACTCGACTCGACCTCGCTCACAACAACTTCTCCAAACCCATACCTGC CCACCTCTTCAACGCCACCAACCTTGTCTCGATAGACCTCTCACATAACTCACTCTCTGG TCCGATACCGAACCAAATCAAAACACTCAACAACTTGACCCACTTGGATTTGTCTTCGAA TCTCCTTAATGGGTCCTTGCCCGAGTTCCTTCTCGACCTCAGAGGCCTCACCGGAACTCT GAACTTGTCGCTTAATCAGTTCTCCGGCCAGATTCCGGCAATGTACGGTCGTTTTCCGGT GATGGTGAGCTTGGATCTGAGGTACAATAATCTCAGCGGAGAGATACCTCAAGTGGGGTC 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