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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI022552 | Chr10 | 6961370 | 6965934 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 43 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI022552.m1 | 117 | 139 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 41.9 | 6.80E-11 |
| LITCHI022552.m1 | 118 | 139 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.9 | 0.0037 |
| LITCHI022552.m1 | 173 | 193 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 29.2 | 6.70E-07 |
| LITCHI022552.m1 | 174 | 193 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 12.3 | 0.22 |
| LITCHI022552.m1 | 230 | 254 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.9 | 1.50E-10 |
| LITCHI022552.m1 | 234 | 254 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 28.8 | 8.00E-07 |
| LITCHI022552.m1 | 234 | 254 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 15.9 | 0.016 |
| LITCHI022552.m1 | 366 | 391 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 26.3 | 5.40E-06 |
| LITCHI022552.m1 | 370 | 390 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19 | 0.0017 |
| LITCHI022552.m1 | 413 | 436 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.2 | 7.90E-08 |
| LITCHI022552.m1 | 419 | 436 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 9.3 | 1.9 |
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>LITCHI022552.m1 ATGGAACTCTCTGAGCCAGTTTCTCTCCCAAATCTCGATCACCAACTCACCCACTCTCAA TTAGGGTTAGAACAGCCCTCTCCTCCTTCGCCCGATCTCGATCCTCCGCCGTCTGATCTC AATCACCTCCACGAAGACCTCAAGAATCTTGATTTGGGTGACACGGCGGCGCCGGAGCTT GAAGTGGAAGTAGAAGAGAAGGTCTCGAACAAAGATGATGAAGAGAGTGACAGTGATGAT ACTGTCAACAATAAAAATGAGAATGAGATTGAGAACGAGAACGAGAACGAGAACGAGAAC GGAAACGGAAACAGAAAACGGTACCCGTTTCCGGTGAGACCGGACGCAGAAGATTGCGCT TATTATATGAAGACTGGGACCTGCAAGTTTGGGTCCAATTGCAAGTTTAACCATCCTGTT CGTAGAAAAAACCAGGCTGCTAAAGAGAAGGTGAAGGACAGGGAAGACTCGCAAGAGAGG CAGGGCCAGAGCCAGAGCCAGAGCCAGAACCAAATAGAATGCAAGTATTACCTGAGGACA GGAGGATGTAAGTTTGGAAAGGCATGCCGATACAATCACACCAGAGCAAAATCAGCTGTC ATCCCAATTTTAGAGCTCAATTTTCTTGGTCTCCCTATTCGACCGGTAGGATTTAAATCA TTATATGAAGCTTTTGATGGATCTATGGGAGAGAAAGAGTGCCCCTATTACATGCGTAAT GGTTCCTGCAAGTATGGAGCTAACTGCAAGTTTAATCATCCTGATCCTACAGCTGTAGGT AGTTCTGACCCTCCTTCAGGATACGGTAATGGTGGATCTGTCTCATCACAAGCTGCATCA CAAACTAGTTTGGGATCATGGTCATCCCCGAGGGCTTTAAACGAGACTGCCTCCTTTGTG CCGATGATGTTTCCACAAACTCAAGGGGTTACGGTTCAAAATTCAGAATGGAATGGTTAT CAGGCTTCTATATATCCACCAGAAAGAAGTATGCATCCAGCTCCAGCATATGTCATGAAT AATCCTTCAATGGAAACCACTCTGTACTCACATAATCAGCCACAGATTCTTGCTGATGAA TTCCCAGAACGACCTGGCCAACCTGAATGCAGTTATTTCCTAAAAACTGGAGACTGCAAG TTTAGATCTAACTGCAAATATCATCATCCAAAGAACCAGATCTCAAAGACACAGCCATGT GCCCTCAGTGACAAGGGCCTGCCATTAAGACCTGATCAGAATGTCTGTTTACATTACAGA CGCTATGGAATTTGCAAGTTTGGGCCTGCTTGTAAATTTCACCATCCAATAGACCTAAAT GCTTTGTCAACTGAGTCTGGAATAGATCCATTGCCGCCCTTTGGCAACTCGGCATCTACA GAAGAGGCTGGAGTGGCTGGAACTGGAAATGGAAGTGATAATAAAATTCAGCAACCTGTG TAA
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>LITCHI021284.m1 - Up_Stream_Len 2000 AGGGTCCAATGTTGTTGGTGAGTCATCTTTTCTAGCCATTTGAGTAACTGGCAGTTTTGC GTTGTCAAGGTGCCCATACTGTGTCCTCTTTTACTAACATTTTGGTTATAACAGGGAGTT AAAGCAGTGATTGCCAAAAGTTTTGAGAGAATTCACCGCAGCAACTTGGTGGGAATGGGC ATTATTCCTCTCTGCTTCAAGGCCGGTGAGGATGCTGACACACTAGGATTGACTGGTCAT GAGCGTTATACCATTGATCTTCCTAATAGCATCAGCGAGATCAGACCTGGCCAGGACGTG ACTGTCACAACTGATACAGGAAAATCTTTCACCTGCACAGTTCGCTTTGACACTGAGGTA CTCCCCACTCAATTTCATCTCTCTGTAAATTCTTATATATCAGCCAACAACTTCTAGCTC GTGGTTCATTAGAATACTGGCAGGAGGCCTTCAATATCAAAGTTGTCTCATAGTTGGTTT CATGTTTTAACGTCTGTTTCATTTTGCAGGTGGAATTGGAATATTTCAACCATGGAGGAA TTCTTCCATATGTCATCCGGAACCTGATTGAGCAATAGAGTAATTGCATCATTTATCAGA CATCTTTGTTTCATCCAAGGAAACTTTGGATTTGTATAATGTGAGAAGTGAATAAAGTCT CAAAATAATAGAGAAAAATATATCCCTTTCAGGGACAAGAGGCAATTTTTTTTTTTTTTT GAAGCACTTCCAGGTCGACAAATGACTATTTTCAGTAATTTTTTTTTCTTTTTTCATGTT CAATAGTTGCTTCGATGTGCTGTAAAATCGTCCGAATTCAACATAGAAATAAATTAATAT GGGTGTGTTTTGTTGGCTCATACGTGTTTATATAGCCCATGTAGTTTTCTCAATTAATTG AGGTGAGACTATTACCACCGAAAAAGTAATCCCAAATTTTATATTATATCTATTCTCAAA AATGTCTGTAAGTAATATTACCTATATAAAGTACGTTAACAAAAATATGTTTTCTCGTAA CAAAAACATTTCAGCGTAAACAACCAACTATAAAGTGAACTATTAGACAACGTTGGACAA AGAACTTTTCGAAGTGTGCAATTGCCATCGTATCTACTGCGCCCACAACTAATTGGTGAC TTGACATTGGATATGCATTTCCCTGCAAGTATCAATAATGGGAACAAAAATGTTACACAT TCGGGCATTTTTTACTATTCCGTTTAAATAAATTATGGTTATTTATTTCAACAATTTCAA ACTTTCGAAAACCTAACTTTACTGTACCCTCGTCATACATGTATTTTTATTGTACAAATT ATAAGACAATGTTATGGAACCACTATAAATATTTGAAAAAGAAAGATTGTTAATTCAATA TGCATCCATAATTGATTCAGCTACCAAATCCAGTGCGTTGGACTATTGGTTCACTAATTT AGAGGTCCTAATAAAGAAAAATAAAAAATTGACAGAATAATCATATTTCTTATTTCTCGC TAGGCAAAATTTGATAGTTTAGAAGTGAAAAAACATAAAATTTCTCCTGAGGTGGGTTCT CAAAACGTTCTTGTTCTACATTACCCCATCCTAATATTTCCATTTTGCTAGTATTAGAAA TTTAAATTTCTAATTCTAGATAAAAGAAAAAATGACAATTTCTATTTCTCAAAAAGATCA AAATGGGTTATTAATCGTAAACTTTTGATCCCACATTCCTCCTCTAATATTTCCACTTCA GTCATATTAGAAATTTATAATTCTAAAGAGAACATAATGAATTATTTCCCAAAAACTGCT CTCTTCAAAAAATAAAATTTCCAAAAAACTGCTTACACTACAATAGGCTAATACAATAAC TACTATTTCAGAAGTACAATGCAAACATGGCAAATTCATTCATTTTTTTCACTGCGTGTG TGTATATATATATATTGCGCTATGATACTCACACAGCCAGTTGAGAAAGCAAAACAACCA ACAAAGGCGAGAAGCGAAAA
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>LITCHI005661.m3 GenomeSequence + ACAGGCGGGTCCCACAAAGCTTACCACGTGTTCCCTTCCACGTTTGCAAAAAGTTCACGC TGAGGACTCACACGTCAGCCCAAAAAAGGTTAAACGCACTTGCATACACATAAAGAAGAA GCAGAAGAAGAAGAAGCTGTTCAATCTCAGACACCTTTAAGAGCTGACCCCTTTCTTCTT TTCTAAGCTTTTCTCTCAGATTCTTTTAGTTTCTTGGACTTGAGTTTCTGTTTTCTCGGG AAACAAACACAGGTGGGTTGGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCA ATTTATTATATGTATGTATATGTGTATATGTGTAGTGTTCATGTGTCATCTTTTGAGTTG TTATTCTTGATCTTTTGAGGTTTTGAATTTCACAATTGAGATCTTCTGTGGGATGAGTTT AGATTATTTTGTAACAATTTTTGTTGTTCATCTTCTTTTTTCTTTTTTAATTATATATCT GTTTTTGTTTGTGACAATTTATAATTTAATTTCACTTCTGGTTTGTTGAAGAAGTCTTGG TGAATTTTAAGAATCTGAATTTTTTTTACAAACAATTTCTGATTTTGCTGGTGCTACATG GCTTGATTAACTGTGTGCCTCAATTTTTTTTTTATTTATTTTTAAGTGAAACTCAATATC TGGTTAATTATGTTATTTAACAGAGCTACCACCTTACTCTTTTGAATATTAAAAGACTTT TAGGAAGCTGAAATATTAATTTTTCGTTTTAGATATTGATAAAATTTGTTTCATTTTTTA TGATATTTTTCAATTGTGTCACACCCTCTATGATGTTATTTATACACACACTTAGTTTGA GATGGCACTTGGTTTTGTGCTCGTATCTTGGGGCTGGATGAGAAATTTTTTTAACAAAAT 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